O princpio da isomerizao consiste em transformar uma cadeia n-parafnica em uma cadeia iso-parafnica , mantendo o sua massa molecular.

Esse principio ocorre por meio da utilizao de catalisadores. As n-parafinas mais adequadas para a isomerizao esto na faixa de C5-C8. Porm, devido restrio de presso de vapor, os compostos mais leves so menos utilizados. Dessa forma, compostos como o n-heptano e o n-octano so bastante utilizados no processo de isomerizao. As reaes de isomerizao ocorrem em temperaturas na faixa de 90 200C,na presena de um catalisador que usualmente consiste em platina sobre algum material de suporte. Ambos os tipos de catalisadores requerem uma atmosfera de hidrognio, a fim de minimizar a formao e deposio de coque; entretanto o consumo de hidrognio desprezvel.

Em uma isomerizao C5/C6, a carga entra no reator, normalmente um CSTR, j dessulfurizada e seca e misturada a uma pequena quantidade de cloreto orgnico e hidrognio reciclado e depois aquecido at a temperatura de reao. Depois disso, a corrente passada em um catalisador de metal suportado no primeiro reator, onde o benzeno e olefinas so hidrogenados. A corrente segue para o reator onde ocorre de fato a isomerizao e as nparafinas so cataliticamente isomerizadas para isoparafinas. Os produtos leves que saem na corrente que deixa o reator so retificados, e ento enviados a uma unidade de tratamento de cidos.

O produto lavado com soluo aquosa de soda, retirado excesso de cido e finalmente estabilizado antes de ser estocado. O efluente do reator dividido em dois: o produto lquido j isomerizado e o vapor de hidrognio, que enviado para reciclo. Os efluentes lquidos gerados na isomerizao incluem guas cidas e as correntes provenientes da lavagem custica.