23/11/2011

Ao realizar um experimento, em geral, diversas variveis so avaliadas simultaneamente na mesma unidade experimental ou amostral, de modo que as variveis podem apresentar uma dependncia linear ou correlaes

Anlise dados de DNA

A anlise dessas variveis isoladamente poder no ser suficiente para modelar o fenmeno, porque perdem-se valiosas informaes ao se desconsiderarem as correlaes existentes entre as variveis envolvidas

A anlise multivariada consiste em um conjunto de mtodos estatsticos utilizados em situaes nas quais vrias variveis so medidas e analisadas simultaneamente

PRINCIPAIS TCNICAS

Anlise de Varincia Multivariada - MANAVA Componentes Principais - PCA Variveis Cannicas Anlise de Agrupamento - Cluster Analysis Anlise de Fatores Anlise Discriminante A escolha do melhor mtodo de anlise uma tarefa difcil O pesquisador tem que se deter sobre quais questes os mtodos podem ajudar a solucionar

Divergncia ou Diversidade Gentica Fornece informaes sobre genitores potenciais para serem utilizados em programas de melhoramento Importncia no contexto da evoluo das espcies, provendo informaes sobre recursos disponveis e auxiliando na localizao e no intercmbio dos mesmos Permite a caracterizao de acessos facilitando a identificao de duplicatas Conhecimento da variabilidade das espcies

DIVERSIDADE GENTICA

23/11/2011

As medidas de distncia gentica representam a diversidade existente no conjunto de gentipos estudados Variveis Quantitativas Variveis Binrias Estudos moleculares (0 e 1) Variveis Categricas Forma, cor da pelagem, presena ou ausncia de chifre

Medidas de dissimilaridade Quanto menor o valor mais similares sero os gentipos Matriz de dissimilaridade

Matriz de dissimilaridade
0.40

0.35

0.30

59% 44%

88% 62% 100%

Linkage Distance

0.25

47%

Estratgia de agrupamento (UPGMA)

45%

73% 68%

0.20

0.15

86%
Caipira Bucaneiro Garantida Prata Grada Pacovan Ken Thap Maeo Preciosa FHIA-21 FHIA-02 FHIA-01 PA42-44 FHIA-18 Tropical Nam

0.10

Dendrograma

DISTNCIAS GENTICAS Variveis Quantitativas: - Mdias Distncia euclidiana - Mdias oriundas de experimento com repetio Distncia Generalizada de Mahalanobis Variveis Multicategricas: - Classes - ndice de Similaridade - Binrias Cole-Rodgers Marcadores co-dominantes: - ndices Ponderados, No-Ponderados, Smouse e Peakall Marcadores dominantes: - Jaccard

23/11/2011

No ponderado de Agrupamento aos Pares (Unweighted PairGroup Method using arithmetic Averages - UPGMA) - neste mtodo, a distncia entre dois grupos definida como a mdia das distncias entre todos os pares de valores de um grupo com o outro

Matriz de dissimilaridade

3.0

Estratgia de agrupamento
Distncia de ligao

2.5

Matriz de dissimilaridade

2.0

UPGMA

1.5

1.0

0.5 5 4 6 3 2 1

Menor distncia em (4,5)

Menor distncia em (1,2)