O relatório constitui-se na forma pela qual os resultados dos trabalhos
são levados ao conhecimento dos usuários com a finalidade de apontar possibilidades de correção de falhas, fornecer dados para a tomada de decisão e atender interesses específicos, transmitindo assim constatações de forma completa, clara, concisa, correta e imparcial, de modo a possibilitar que os interessados compreendam o objetivo da auditoria e seus resultados possam aceitar a validade das conclusões. O relatório de auditoria deve ser composto, quanto à estrutura, pela capa, o índice, o sumário executivo, informações relacionadas ao processo, à entidade e ao gestor da mesma, Introdução e objetivo do trabalho, Alcance, fonte de critério, procedimentos, resultado da auditoria e por fim a conclusão. São requisitos mínimos para elaboração do relatório de auditoria: Importância do conteúdo, utilidade e oportunidade, cuidado e adequação das provas, convencimento, objetividade, conteúdo, clareza e simplicidade, empatia, efeitos visuais e uma boa apresentação. Por mais que seja obvio, é necessário deixar bem claro que os auditores que estão realizando a auditoria operacional são responsáveis pela elaboração do relatório de auditoria. Pelo fato da auditoria operacional tratar dos processos da determinada entidade, os controles internos - que é o conjunto de normas e procedimentos existentes na empresa - são essenciais, já que é por meio desses que a auditoria operacional irá verificar como estão sendo executados cada processo interno na empresa. Os processos nas entidades normalmente estão ligados entre si, logo, um influencia o outro, por esse motivo, é de suma importância que o auditor operacional esteja inteirado sobre toda organização, entendendo cada processo e a influência dos mesmos na entidade, bem como conhecer o setor de atividade da entidade auditada, as leis que regem esse setor e seguir de perto como se dá os processos de determinada entidade são fundamentos importantes para que o auditor operacional possa executar um bom trabalho de auditoria. Por meio da auditoria operacional pode ser verificado processos que prejudicam o crescimento da entidade, seja atrasando as atividades ou até gerando desperdícios. Além de identificar processos que possam prejudicar a entidade, a auditoria operacional pode ajudar a melhorar processos que já são bons, porém, que podem ser ainda melhores.