Universidade Federal do Rio Grande

Centro de Cincias Computacionais

10 Mostra de Produo Universitria-MPU

Inferncia de estrutura de redes biolgicas com

a combinao de mtricas Bayesianas.
Aluno: Khaoma Duarte
Orientador: Adriano Werhli

Sumrio
1. Introduo
2.Diferena entre as redes
3. Redes utilizadas
4. Gerao de dados
5. Mtodo de inferncia
6. Comparao das redes
7. Resultados
8. Concluso
9. Trabalhos futuros
10. Referncias bibliogrficas

1. Introduo

Objetivo: inferir redes.

1. Introduo
Rede conhecida

2.Diferena entre as redes

Rede Bayesiana

2.Diferena entre as redes

Rede booleana

3.Redes utilizadas

4. Gerao de dados

Entramos com as matrizes de dados das

redes;
Aumentamos as matrizes;
Inserimos os rudos 2,5,10,30 e 50%;
Para cada rudo foram gerados cinco
conjuntos de dados;

5.Mtodo de inferncia

Mtodo score and search;

Mtodo de amostragem Markov Chain Monte

Carlo;

Como verificar se a rede encontrada a mesma

rede inicial?

6. Comparao das redes

Utilizamos a matriz de adjacncia da rede verdadeira;

Utilizamos a matriz de pontuaes;

Definimos um limite ;

Comparamos cada valor com esse limite;

Geramos uma matriz de adjacncia para as

pontuaes;
Verificamos os VP e os FP;

6. Comparao das redes

Geramos um grfico ROC;

A partir desse grfico calculamos a rea sob a curva
(AUC);
Verificamos se os valores so aceitveis;

AUC 0,5 inferncia ruim;

AUC > 0,5 inferncia aceitvel;

7. Resultados
Rede 1

7. Resultados
Rede 2

8.Concluso

Verificamos quando utilizamos mtodos de

inferncia de redes Bayesianas para inferir
redes Booleanas, obtemos resultados
satisfatrios.

9.Trabalhos futuros

Testar redes maiores;

Inferir as interaes booleanas entre as
variveis.

10.Referncias bibliogrficas

Statistical Applications in Genetics and Molecular

Biology.
Reconstructing Gene Regulatory Networks with
Bayesian Networks by Combining Expression Data
With Multiple Sources of Prior Knowledge.

Adriano V. Werhli and Dirk Husmeier.

Obrigado pela ateno!