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Recebido em 04/2012. Aceito para publicao em 08/2012.

TRATAMENTO MATEMTICO DOS MODOS VIBRACIONAIS DA MOLCULA DE


CLOROFRMIO
MATHEMATICAL TREATMENT OF VIBRATIONAL MODES OF THE CHLOROFORM
MOLECULE
Maria Helena Rodrigues Mesquita1
Adeslaine Negrini Reche1
Patrcia Marcondes dos Santos2
Yoshiyuki Hase3
Mituo Uehara4*
Kumiko Koibuchi Sakane4
RESUMO: As frequncias dos modos vibracionais da molcula de clorofrmio foram determinadas teoricamente.
Os clculos exigiram um conhecimento de foras interatmicas, comprimentos de ligao e seus ngulos a fim
de obter a sua configurao. A molcula pertence ao grupo de ponto C3v com nove vibraes fundamentais. As
coordenadas cartesianas, internas, e de simetria e o campo de fora serviram de entrada para um pacote de
programas NCT (Tratamento de Coordenadas Normais), para obter frequncias vibracionais, distribuio de
energia potencial (DEP) e constantes de fora de ligao. As atribuies das bandas dos espectros
infravermelhos foram feitas baseadas na distribuio de energia potencial calculada.
Palavras-chave: espectroscopia no infravermelho; anlise de coordenadas normais; molcula de clorofrmio.
ABSTRACT: The normal vibrational modes of the chloroform molecule were determined theoretically. The
calculations required previous knowledge of the force constants, bond lengths, and angles in order to estimate the
configuration of chloroform. The molecule belongs to the C3v point group with nine fundamental vibrational modes.
The Cartesian, internal, and symmetry coordinates, along with the force field were used and inputted into the
normal coordinate analysis package (NCT) in order to obtain the frequencies, the distribution of the potential
energy (DEP), and force constants. The assignment of bands of the infrared spectrum of chloroform was based in
the calculated distribution of the potential energy.
Keywords: infrared spectroscopy; normal coordinate analysis; chloroform molecule.

Mestranda em Bioengenharia - Universidade do Vale do Paraba - Univap. E-mail: mhrmesquita@hotmail.com;


lainereche@hotmail.com.
2
Doutoranda em Engenharia Biomdica - Univap. E-mail: patriciams@univap.br.
3
Doutor em Qumica (Fsico-Qumica) - Universidade de So Paulo - USP e Professor da Universidade Estadual de Campinas
- Unicamp. E-mail: hase@iqm.unicamp.br.
4
Doutor(a) em Fsica - Instituto Tecnolgico de Aeronutica - ITA e Professor(a) Titular da Univap. E-mail: kumiko@univap.br.
* In memoriam.

Revista Univap, So Jos dos Campos-SP, v. 18, n. 32, dez.2012. ISSN 2237-1753

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1. INTRODUO
Nos estudos da espectroscopia
vibracional, um dos problemas principais o
melhor entendimento dos modos normais da
vibrao de molcula e a atribuio dos
dados experimentais observados nos
espectros infravermelhos.
Uma das tcnicas matemticas mais
simples a anlise de coordenadas normais
para
obter
frequncias
vibracionais
fundamentais e suas atribuies por meio da
distribuio de energia potencial. Comparando
as
frequncias
calculadas
e
experimentais, pode-se obter os valores de
constantes de fora de ligao qumica,
fornecendo as indicaes das naturezas das
ligaes qumicas e conformaes moleculares (COLTHUP; DALY; WIBERLEY, 1990;
SALA, 1995).
O mtodo matemtico usado para
definir estruturas moleculares baseado na
anlise dos espectros vibracionais exige
uma formulao de hipteses sobre
estruturas provveis. Estas, em geral, so
baseadas
nos
valores
experimentais
existentes na literatura ou no conhecimento
do
pesquisador
(BARBOSA,
2007;
SILVERSTEIN; WEBSTER; KIEMLE, 2007).
Antes de recorrer para a qualquer anlise
matemtica, recomenda-se fazer uma
tentativa de atribuio das frequncias aos
modos
vibracionais,
geralmente,
comparando com molculas semelhantes. O
objetivo deste trabalho procurar mostrar
que a aplicao das propriedades de
simetria e da teoria de grupo permite que as
atribuies das frequncias vibracionais no
sejam puramente empricas, mas que
tenham uma base matemtica. Para
molculas pequenas, esses tratamentos so
indispensveis para identificar as suas
estruturas.

Muitas vezes as molculas maiores


podem ser divididas, hipoteticamente, em
vrias partes com simetrias localmente
definidas, tais com C2v ou C3v. As vibraes
caractersticas dos grupos CH2 e CH3
possuem essas simetrias. Esses fragmentos
so analisados, separadamente, como se
fossem molculas menores. Tais anlises
so, muitas vezes, teis para caracterizar as
frequncias vibracionais de biomolculas
(lipdios, protenas, polissacardeos, cidos
nucleicos)
presentes
em
sistemas
biolgicos. Pode-se reconhecer a presena
dessas vibraes muitas vezes alteradas e
at distorcidas, devido influncia dos
fatores externos, tais como algumas toxinas,
medicamentos
ou
alteraes
nas
conformaes
moleculares
(DIEM;
GRIFFITHS; CHALMERS, 2008; MANTSCH;
CHAPMAN,
1996;
STUART,
1997).
Variaes, na geometria molecular, refletem,
geralmente, nas constantes de ligao entre
dois tomos. Essas informaes estruturais
contribuem para o melhor entendimento da
complexidade de um sistema biolgico.
O presente trabalho consiste em
construir um modelo matemtico, formado
por
um
conjunto
de
coordenadas
cartesianas, internas, de simetria e campo
de fora que servem de dados de entrada
para um pacote de programas NCT. Estes
calculam as frequncias vibracionais da
molcula e constante de fora de ligao
qumica,
comparando
os
valores
experimentais e calculados (HASE, 2004).
A molcula de clorofrmio foi escolhida
como exemplo para anlise vibracional, pois
pertence ao grupo de ponto C3V, mesma
propriedade de simetria do grupo CH3 ,
muitas vezes encontrado em biomolculas.
O tratamento de anlise de coordenadas
normais prev nove vibraes fundamentais,
sendo trs modos A1 e trs duplamente

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degenerados
E.
(COLTHUP;
DALY;
WIBERLEY, 1990). E o seu espectro
infravermelho possui as bandas definidas
que permitem uma boa comparao entre as
frequncias calculadas e experimentais.
A frmula estrutural da molcula de
clorofrmio mostrada na Fig. 1.

Fig. 2 - Espectro infravermelho de


clorofrmio.
3. ANLISE TERICA DAS VIBRAES
DE MOLCULAS
Fig. 1 - Frmula estrutural da molcula de
clorofrmio
Fonte: LOPES (2012).

2.
OBTENO
DOS
INFRAVERMELHOS

ESPECTROS

O espectro de clorofrmio no estado


lquido foi obtido utilizando cela de cristais
de KBr de um caminho tico de 0,114 mm,
na faixa de 4000 a 600 cm-1, com resoluo
de 4 cm-1, no modo de transmisso, com 32
varreduras a uma temperatura controlada de
20oC.
O espectrofotmetro utilizado foi o
Spectrum GX FT-IR da PerkinElmer. Os
espectros foram pr-processados com o
software Spectrum 5.3 (PerkinElmer), em
que foram feitas suavizao espectral por
meio do algoritmo Savistzky Golay (9
pontos).
A Fig. 2 mostra o espectro
infravermelho de clorofrmio na regio de
3500 a 500 cm-1.

3.1
Determinao
de
coordenadas
internas e construo de coordenadas de
simetria
Para este trabalho, o clculo do
nmero de frequncias feito para estrutura
possvel da molcula livre do clorofrmio
usando os recursos da teoria de grupos de
ponto.
A teoria de grupos aplicada s
vibraes
moleculares
acha-se
minuciosamente desenvolvida num grande
nmero de livros de espectroscopia (BALL,
2005; COLTHUP; DALY; WIBERLEY, 1990;
SALA, 1995).
Aplicamos a simetria
molcula livre do clorofrmio.

C3v

para

Os seguintes valores dos comprimentos e de ngulo de ligao foram utilizados


(COLTHUP; DALY; WIBERLEY, 1990): C H
0

1.093 A ; C Cl 1.770 A ; Cl C Cl
112o.
Os pesos atmicos em u.m.a. foram
usados (COLTHUP; DALY; WIBERLEY,
1990): C = 12.00000; H = 1.007825; Cl =
35.45300.

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As coordenadas cartesianas, de todos


os tomos constituintes da molcula, so

apresentadas na Tabela
DALY; WIBERLEY, 1990).

1 (COLTHUP;

Tabela 1 - Coordenadas cartesianas e massas atmicas da molcula de clorofrmio


x
y
z
Massa atmica
1.H
0
0
1.093
1.007825
2.C
0
0
0
12.01115
3.Cl
1.467
0.847
-0.512
35.45300
4.Cl
0
-1.694
-0.512
35.45300
5.Cl
1.467
0.847
-0.512
35.45300

O nmero de frequncias, em cada


espcie de simetria, obtido, para a
molcula de clorofrmio, com a simetria C3v
(COLTHUP; DALY; WIBERLEY, 1990).
v = 3A1 + 3E,

(1)

em que A1 e E so espcies de simetria.


Portanto, a teoria dos grupos prev trs
modos normais para espcie A1 e trs
modos degenerados, para espcie E.
A Fig. 3 ilustra nove modos normais
para a molcula de clorofrmio.

As coordenadas internas
apresentadas na Fig. 4 e so:

esto

R1 = r
R2 = t1
R3 = t2
R4 = t3
R5 = 1
R6 = 2
R7 = 3
R8 = 1
R9 = 2
R10 = 3
r
ti i =1 at 3
i i =1 at 3
i i =1 at 3

ligao de valncia: C H
ligao de valncia: C Cl
ngulo de valncia: Cl C Cl
ngulo de valncia: H C Cl

Fig. 4 - Coordenadas internas da


molcula de clorofrmio.
Fonte: COLTHUP; DALY; WIBERLEY
(1990).
Fig. 3 - Nove modos normais para a
molcula de clorofrmio.
Fonte: COLTHUP; DALY; WIBERLEY
(1990).

A energia potencial de uma molcula


uma funo da distoro da molcula a

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partir da posio de equilbrio.

1990).

Assim, pode-se escrever nossa funo


potencial com as provveis interaes em
coordenadas internas (COLTHUP; DALY;
WIBERLEY, 1990).

Espcie de simetria A1
S1 = R1
S2 =

As constantes de estiramento so:


k1
k2

kr

S3 =

kti i = 1 at 3

S1 =

k3

k i i = 1 at 3

k4

k i i = 1 at 3

S2 =

As constantes de interao so:


S3 =
k5

k rti i = 1 at 3

k6

k titj i = 1 at 3, j = 1 at 3 e i j

k7

S4 =

k ri i = 1 at 3
S5 =

k8

k ri i = 1 at 3

k9

k tij i = 1 at 3, j=1 at 3 e i j

k10

k tij

i =1 at 3, j = 1 at 3 e i = j

k11

k tij

i =1 at 3, j = 1 at 3 e i = j

k12

k tij

i = 1 at 3, j=1 at 3 e i j

k13

k i j

i = 1 at 3, j = 1 at 3, i j

k14

k ij

i = 1 at 3, j = 1 at 3, i j

k15

k i j

i =1 at 3, j = 1 at 3 e i = j

k16

k i j

i = 1 at 3, j = 1 at 3, i j

As coordenadas de simetria para a


molcula de clorofrmio, so apresentadas a
seguir: (COLTHUP; DALY; WIBERLEY,

3
1
6

(R 2 + R 3 + R 4 )

(3)

(R 5 + R 6 + R 7 R 8 R 9 R 10 ) (4)

Espcie de simetria E

As constantes de deformao angular


so:

(2)

S6 =

1
6
1
6

1
6
1
2
1
2

1
2

( 2R 2 R 3 R 4 )

(5)

( 2R 5 R 6 R 7 )

(6)

(2R 8 R 9 R 10 )

(7)

(R 3 R 4 )

(8)

(R 6 R 7 )

(9)

(R 9 R 10 )

(10)

3.2 Vibraes moleculares e coordenadas


normais
Uma molcula de clorofrmio pode ser
pensada como um conjunto de osciladores
acoplados.
Faz-se
desacoplar
esses
osciladores em osciladores harmnicos
simples, descritos como coordenadas
normais com o uso de propriedades de
simetria da molcula e da teoria do grupo
(COLTHUP; DALY; WIBERLEY, 1990;
HASE, 2004; SALA, 1995).
Espera-se
uma
equao
de
movimento de nono grau 3N-6=9 (em que N

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igual a nove e representa o nmero de


tomos da molcula de clorofrmio: CHCl3)
para a molcula em estudo e suas razes
estariam relacionadas s frequncias
vibracionais. Utilizando propriedades de
simetria e teoria de grupo C3v, pode-se
fatorar as equaes em equaes de menor
grau, mais fceis de serem resolvidas
(COLTHUP; DALY; WIBERLEY, 1990;
HASE, 2004; SALA, 1995).
Deve-se efetuar transformaes de
coordenadas aplicando as operaes de
simetria do grupo ao qual a molcula
pertence para se chegar s coordenadas
normais, que descrevem vibraes da
molcula. A cada operao associada uma
matriz de transformao e um dos objetivos
determinar essas matrizes (COLTHUP;
DALY; WIBERLEY, 1990; HASE, 2004;
SALA, 1995).

coordenada interna.
A energia cintica mais facilmente
expressa na forma matricial:

& + MX
&
2T = X

(13)

onde

m1

m2

M=
m3

m4

m
5

(14)

Os elementos fora da diagonal so


nulos.
Seja BR uma matriz de transformao
de
coordenadas
cartesianas
de
deslocamento em coordenadas internas:
R=BRX

(15)

Em
algumas
etapas,
essas
transformaes
envolvem
processos
numricos bastante complexos e o
tratamento utilizado o mtodo de matriz
GF de Wilson (WILSON; DECIUS; CROSS,
1955).

X= B R1 R

(16)

2T = R + B R1 M B R1 R

(17)

A energia cintica da molcula


expressa em coordenadas cartesianas de
deslocamento:

2T = R + G R1 R

(18)

2T =

(m i x& i2 + m i y& i2 + m i z& i2 )

(11)

A sua energia potencial descrita em


coordenadas internas que permitiro melhor
visualizao
de
campo
de
foras
moleculares:
2V =

k i, j (R i R j )

A expresso da energia cintica em


coordenadas internas ser:

( ) ( )

onde

G R1 = (B R1 )MB R1

(19)

A energia potencial em geral


expressa em coordenadas internas, pois o
significado fsico das constantes de fora se
torna imediato.
2V = R + FR R

(20)

(12)

i, j

em que m massa atmica, x, y e z so


coordenadas cartesianas de deslocamento,
k constante de fora de ligao e R

As coordenadas de simetria so
introduzidas para ter o fatoramento das
matrizes de energias cintica e potencial.
As

coordenadas

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de

simetria

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relacionam-se com as coordenadas internas


por matriz de transformao U.
S = UR

(21)

em que

U 1 = U +

(22)

A expresso da energia cintica em


coordenadas de simetria ser escrita por:
+

1
R

2T = S UG U S

(23)

2T = S + G S1S

(24)

em que

G S1 = UG R1 U +

(25)

A expresso da energia potencial em


coordenadas de simetria ser:
+

(30)

As expresses de energias cintica e


potencial, em termos de coordenadas
normais, podem ser escritas:
2T = Q + L+S G S1 L S Q

(31)

2T = Q + IQ

(32)

em que

L+S G S1L S = I

(33)

L+S = LS1G S
2V = Q + L+S FS L S Q

(34)

2V = Q + Q

(35)

em que

= L+S FS L S

2V = S UFR U S

(26)

2V = S + FSS

(27)

em que

FS = UFR U +

S = LSQ

(28)

(36)

As energias cintica e potencial


podem ser expressas em termos de
coordenadas normais Qi:
2T =

2
i

(37)

2V =

Q
i

2
i

(38)

G e F so as matrizes introduzidas por


Wilson.
Como as matrizes j esto fatoradas,
temos
uma
equao
secular

GF I = 0 para cada espcie de simetria


A1 e E. O seu grau dado pelo nmero de
modos normais para espcies A1 e E e as

As equaes de movimento podem ser


obtidas a partir das equaes de Lagrange
independentemente para cada coordenada
Qi.

d T

dt Q i

V
+
=0
Q i

i = 1,2,3...

(39)

razes, i relacionam-se com as frequncias


vibracionais, i pela relao:

i = 4 2 i2

(29)

As coordenadas normais e as de
simetria relacionam-se por meio da matriz
de transformao LS:

Os programas chamados BEL, GEL,


FEL e NCA, constituintes do pacote NCT
(tratamento de coordenadas normais),
permitem calcular os elementos das
matrizes B, G-1, F e, finalmente, as
frequncias vibracionais, distribuio de

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energia potencial e constantes de fora de


ligao. A energia potencial escrita em
funo de coordenadas internas, conforme a
equao (12) e qualquer variao das
ligaes qumicas e das deformaes
angulares refletem na alterao de
distribuio de energia potencial da
molcula. A percentagem de cada modo
vibracional calculada em relao ao
nmero total de modos presentes em cada
banda. O programa NCA fornece esses
resultados em percentagem, na forma de
DEP (distribuio de energia potencial para

cada modo de vibrao).


A parte final do programa consiste em
refinar os valores de constantes de fora,
comparando as frequncias calculadas e
experimentais observadas nos espectros
infravermelhos.

4. RESULTADOS
As
frequncias
observadas, calculadas
apresentadas na Tabela 2.

vibracionais
DEP so

Tabela 2 - Nmeros de onda observados, calculados e distribuio de energia


potencial
Espcie de simetria A1
Numerao
Observados (cm -1)

1
2
3

3021.0

3021.0

657.0

657.0

366.0

366.0

Espcie de simetria E
Numerao
Observados (cm -1)

Nota:

Calculados (cm-1)

1212.0

1212.0

759.0

759.0

261.0

261.0

C H
CCl
C H
ClC H
CCl2
4 , 5 e 6

C H (95%)
C Cl (100%)
CCl2 (11%), ClC H (79%)

Calculados (cm-1)

4
5

DEP

DEP (%)

DEP (%)

C H (100%)
C Cl (30%), ClC H (66%)
CCl2 (96%)

distribuio de energia potencial


estiramento da ligao C-H
estiramento da ligao C-Cl
deformao da ligao C-H
deformao angular Cl-C-H
deformao angular Cl-C-Cl
so modos degenerados (espcie E)

Os modos normais vibracionais, para o


clorofrmio, so mostrados na Fig. 3.

de constantes de fora de ligao e as de


interao refinadas.

Na Tabela 3, so apresentados valores

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Tabela 3 - Constantes de fora para a molcula de clorofrmio


Constante de estiramento
o

Numerao

Constante de estiramento

k1

kr

Valor (md / A )
4.795

k2

kti

6.311

Numerao

Constante de deformao

k3

k i

Valor (md / A )
1.316

k4

k i

0.265

Numerao

Constante de interao

k5

k rti
k titj

Valor (md / A )
-1.099

Constante de deformao
o

Constante de interao

k6

-0.046
0.293

k8

k ri
k ri

k9

k tij

0.357

k10

k tij

0.151

k11

k tij

-0.101

k12

k tij

-0.108

k13

k ij

0.240

k14

k ij

0.004

k15

k ij

-0.020

k16

k ij

0.050

k7

0.300

Os termos kr e kti indicam variao nos


comprimentos
de
ligao
r
e
ti,
respectivamente.
Os

termos

variaes
de
respectivamente.

k i

indicam

ngulos

k i

i,

Os termos k rti , k ri e k ij indicam


interaes entre r e ti; r e i; i e j,
respectivamente. Observamos que os
valores de constantes de estiramento so
sempre maiores em relao aos outros.

Muitas vezes, as constantes de


interao no so disponveis e somente as
constantes de interao das frequncias
prximas dentro da matriz da funo
potencial so consideradas.
As frequncias calculadas a partir das
constantes de fora encontradas na
literatura (COLTHUP; DALY; WIBERLEY,
1990) foram comparadas s experimentais,
ajustando valores de constantes de fora de
ligao. Os clculos so repetidos at que
os valores calculados se tornem iguais aos
experimen-tais. As constantes de fora,
assim obtidas, foram apresentadas na
Tabela 2.

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Os resultados de distribuio de
energia potencial mostram que os modos,
3021; 1217; 657 e 261 cm-1 so
praticamente genunos.
No entanto, os
-1
modos em 759 e 366 cm representam uma
mistura de vrios modos de vibrao.

5. CONCLUSO
Os espectros infravermelhos em geral
trazem informaes completas da estrutura
da molcula. No entanto, muitos efeitos
surgem ao mesmo tempo; por exemplo: o
aspecto das bandas devido alterao na
distribuio eletrnica, mudana na
conformao, e ao acoplamento dos modos,
entre outros.

REFERNCIAS BIBLIOGRFICAS
BALL, D. W. Fsico-Qumica. So Paulo:
Thomson, 2005.
BARBOSA, L. C. A. Espectroscopia no
Infravermelho
na
caracterizao
de
compostos orgnicos. Viosa: UFV, 2007.
COLTHUP, N. B.; DALY, L. H.; WIBERLEY,
S. E. Introduction to Infrared and Raman
Spectroscopy. 3.ed. New York: Academic
Press, 1997.
DIEM, M., GRIFFITHS, P. R.; CHALMERS,
J. M. Vibrational Spectroscopy for Medical
Diagnosis. Chichester: Wiley, 2008.
HASE, Y. NCT: Pacote de Tratamento de
Coordenadas Normais (Verso 7). Qumica
Nova, v. 27, n. 4, p.664-67, 2004.

O
tratamento
matemtico
das
coordenadas normais, para o clorofrmio
com a simetria C3v, foi feito com o uso do
pacote de programas chamado NCT.

LOPES,

Muitas vezes, as atribuies das


frequncias dos espectros infravermelhos
so feitas a partir dos compostos
semelhantes que existem na literatura.
Neste
trabalho,
as
atribuies
de
frequncias foram feitas baseadas na
distribuio de energia potencial que uma
funo da distoro de suas coordenadas
internas. Os resultados mostraram que as
bandas em 3021; 1217; 657 e 261 cm-1
representam, praticamente, modos genunos
ao passo que aquelas em 759 e 356 cm-1,
uma mistura de vrios modos de vibraes.

MANTSCH, H. H.; CHAPMAN, D. Infrared


Spectroscopy of Biomolecules. New York:
Wiley-Liss, 1996.

AGRADECIMENTOS
Patrcia Marcondes dos Santos
agradece a bolsa de estudo concedida pela
Fundao Valeparaibana de Ensino - FVE.

P.

Clorofrmio.

Brasil

Escola.

Disponvel
em:
http://www.brasilescola.com/drogas/clorofor
mio.htm. Acesso em: 13 jun. 2012.

SALA, O. Fundamentos da espectroscopia


Raman e no Infravermelho. So Paulo:
Editora UNESP, 1995.
SILVERSTEIN, R. M.; WEBSTER, F. X.;
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