11 - NUCLETIDOS

Nucletidos e nuclesidos: Estrutura, composio geral, ligao fosfodister, tipos mais

comuns; Funes especficas dos nucletidos (com exemplos): informao, transporte,
cofactores/coenzimas, regulao metablica)
Cada nucletido constitudo por 3 componentes: uma pentose, uma base azotada e
um grupo fosfato. Uma molcula que no tenha o grupo fosfato, isto , que seja constituda
apenas pelo acar e pela base azotada, chamada nuclesido.
As pentoses so acares com 5 carbonos, convencionalmente numerados de 1 a 5.
H 2 tipos de pentoses: a desoxirribose (em que o carbono 2 se encontra ligado a 2
tomos de hidrognio) e a ribose (no mesmo carbono um dos tomos H substitudo por um
grupo hidroxilo). a ocorrncia destas que d o nome ao nucletido, respectivamente,
desoxirribonucletido ou ribonucletido. Ambos os tipos de pentose esto na sua forma furanose, um anel aromtico resultante de 5 carbonos, fechado, em que o grupo hidroxilo da
ligao hemiacetal aponta para cima.
As bases azotadas esto organizadas em 2 grupos: as purinas, formadas por um anel
aromtico duplo, e as pirimidinas, formadas por um anel simples. As purinas principais so a
adenina (A) e a guanina (G). E as pirimidinas mais conhecidas e frequentes so a citosina (C), a
timina (T) (exclusiva dos desoxirribonucletidos) e o uracilo (U) (exclusivo dos ribonucletidos).
Apesar disso, podem ocorrer ocasionalmente outras bases azotadas minoritrias ou mesmo
trocas entre desoxi e ribonucletidos a nvel da timina e do uracilo.
A ligao que se estabelece entre o acar e a base azotada chama-se ligao N-glicosdica e estabelecida pela remoo de um grupo hidroxilo da pentose e um hidrognio da
base, libertando-se uma molcula de gua e formando-se uma ligao covalente. Esta ligao
tem a designao de N--glicosdica, porque a conexo de um tomo de azoto, N, com um
glcido na forma . O grupo fosfato, por sua vez, est ligado ao carbono 5 da pentose (por vezes
ao 3) atravs de uma ligao O-glicsida (entre um tomo de oxignio e o glcido).
Os nucletidos podem, para alm disso, estabelecer ligaes entre si. Quando so at
cerca de 50 unidades bsicas formam uma cadeia que se designa oligonucletido. Quando a
cadeia maior, polinucletidos. As ligaes fosfodister so as responsveis pela formao de
tais cadeias, nas quais o grupo fosfato ligado ao carbono 5 se liga ao grupo hidroxilo do carbono
3 do nucletido seguinte. A sequncia tem sempre a direco de crescimento 5-3. A cadeia
assim formada dotada de uma polaridade especfica e de 2 fins distintos: um 5 e outro 3.

Esta sequncia nucleotdica constitui, ento, uma cadeia cujo esqueleto uma
alternncia de grupos fosfatos e pentoses, ao qual se ligam grupos laterais, as bases azotadas.
Como o acar tem grupos hidroxilos livres, estes vo criar pontes de hidrognio com molculas
de gua. Tambm o grupo fosfato, como se apresenta ionizado e negativamente carregado em
pH perto de 7, estabelece interaces inicas com outras molculas. Estes factos tornam o
esqueleto da cadeia hidroflico.
As bases azotadas constituintes dos nucletidos so, tambm elas, dotadas de
propriedades qumicas que consequentemente lhes conferem algumas caractersticas
especificas a nvel estrutural e funcional. Como so hidrofbicas a pH neutro, aumentando a
afinidade com a gua em pH mais cido ou bsico, as bases de um nucletido tm tendncia a
estabelecer ligaes de Van der Waals ou interaces dipolo-dipolo entre si, para se protegerem
da gua do meio circundante. Para alm disso, os tomos de azoto, bastante electronegativos,
formam entre bases, pontes de hidrognio, estabelecendo-se uma grande complementaridade
entre certos pares de bases (C-G e A-T(U)).
So estas caractersticas dos nucletidos que vo levar formao dos cidos nucleicos
como os conhecemos e lhes vo permitir desempenhas as funes a que esto destinados.

Funes especficas dos nucletidos:

Subunidades dos cidos nucleicos;

Informao gentica;

Transporte de energia qumica;

Nucletidos de adenina so constituintes de cofactores;

Alguns so reguladores metablicos;

Informao gentica.

Transporte de energia qumica:

Os nuclesidos podem ser mono-, di- ou trifosfato, de acordo com o nmero de grupos
fosfato que esto ligados. Cada um desses grupos so designados por , , e , comeando no
fosfato que se encontra ligado pentose.
UTP, GTP e CTP so fontes de energia para diversas reaces, mas o nucletido mais utilizado
pela clula para fornecer energia qumica o ATP. A fosfohidrlise do ATP tem um papel muito
importante para diversas biossnteses com variao da energia livre de Gibbs positiva, uma vez
que, como a hidrlise de ligaes fosfoanidrido (ligaes entre os grupos fosfato , e , )
liberta cerca de 30 kJ/mol , o equilbrio final dessas reaces alterado, favorecendo a formao
dos produtos.
Nucletidos de adenina so constituintes de cofactores:
Os nucletidos de adenina fazem parte da estrutura de uma grande variedade de cofactores com
diversas funes e, embora no participem directamente na funo primria do cofactor, a sua
remoo diminui consideravelmente a aco deste. Tendo como exemplo a acetoacetilCoA
(coenzima A derivada do acetoacetato), a remoo do nucletido de adenina desta coenzima
reduz na ordem de 106 a reactividade dessa coenzima como substrato de uma enzima do
metabolismo dos lpidos, a -cetoacil-CoA transferase. Outros exemplos so o NAD e FAD.
Regulao metablica:
Os nucletidos podem tambm ser produzidos como mensageiros secundrios nas
clulas, provocando alteraes no interior destas, em resposta a sinais qumicos externos
(mensageiros primrios). O mais comum o AMPcclico (cAMP), que tem funes reguladoras
em todas as clulas, excepto nas vegetais. Outros nucletidos reguladores so: o cGMP e o
ppGpp (produzido em bactrias, inibe a sntese de tRNA e rRNA, como resposta a uma
diminuio de sntese proteica provocada pela falta de aminocidos disponveis).
Informao gentica:

informao

gentica

est

codificada

na

sequncia

linear

de

quatro

desoxirribonucletidos no ADN. A informao est agrupada em unidades codificantes (h

zonas no codificantes no ADN), denominadas de codes. Cada codo uma sequncia de trs
nucletidos que codifica um aminocido. O RNA o responsvel pela expresso da informao
gentica, actuando como intermedirio, uma vez que usa a informao codificada no ADN de
forma a especificar a sequncia de aminocidos de uma determinada protena. Portanto a
estrutura de cada protena, e consequentemente de todas as biomolculas e componentes
celulares, produto da informao contida na sequncia de nucletidos dos cidos nucleicos. A
capacidade de armazenar e transmitir a informao gentica aos descendentes uma condio
fundamental da vida.
1. cidos Nucleicos
DNA
Um importante trabalho para a descoberta da estrutura do DNA foi o de Erwin Chargaff (dcada de 40).
Descobriu que os 4 tipos de nucletidos de DNA ocorrem em percentagens diferentes em molculas de DNA
de organismos diferentes.
Atravs disto foi possvel concluir que:
1) A composio em bases de DNA geralmente varia de uma espcie para outra.
2) Amostras de DNA isoladas de diferentes tecidos de um dado organismo tm a mesma composio
de nucletidos.
3) A composio de bases do DNA numa espcie no muda com a idade, estado nutricional ou
ambiente de um dado organismo.
4) Em todas as molculas de DNA celular, independentemente da espcie, o nmero de resduos de
adenina igual ao nmero de resduos de timina e o n de resduos de citosina igual ao nmero de resduos
de guanina. Assim, o nmero de resduos de purinas igual ao nmero de resduos de pirimidinas: A + T = G
+ C.
Estas relaes quantitativas, tambm chamadas as leis de Chargaff, foram a chave para o
estabelecimento da estrutura tridimensional do DNA e abriram portas para o conhecimento de como a
informao gentica est codificada no DNA (e como processado essa informao).
Rosalind Franklin e Maurice Wilkins utilizaram difraco de raios-X para analisar fibras de DNA. Eles
mostraram (dcada de 50) que o DNA produz um padro caracterstico de difraco de raios-X. A partir deste
padro sups-se que as molculas de DNA seriam helicoidais com duas periodicidades ao longo do seu eixo,
uma primria de 3,4 e uma secundria de 34 .
Em 1953 Watson e Crick propuseram um modelo tridimensional da estrutura do DNA, que tinha em
conta todos os dados recolhidos at altura (relao A-T e C-G). Este modelo consistia numa dupla hlice, de
mo direita, de cadeias pulinucleotdicas. As partes hidroflicas das desoxirriboses e grupos fosfato esto

voltados para fora, enquanto que as bases azotadas encontram-se no interior da hlice, com os seus anis
hidrofbicos de estrutura quase planar, numa posio perpendicular ao eixo. de referir que as desoxirriboses
esto na conformao endo C-2. Cada base do nucletido emparelha no mesmo plano com a base
complementar na cadeia oposta, estabelecendo ligaes de hidrognio: dupla entre adenina e timina e tripla
entre citosina e guanina, da que seja tanto mais difcil separar cadeias de DNA, quanto maior for a %GC.
Trabalhos com DNA polimerases mostraram que as duas cadeias so anti-paralelas, isto , tm
orientaes opostas.
Para ter em conta as periodicidades encontradas nos padres de difraco de fibras de DNA, Watson e
Crick observaram que as bases empilhadas verticalmente no interior da dupla hlice esto a 3,4 de
distncia. A periodicidade secundria encontrada anteriormente (de 34 ) foi explicada pela presena de cerca
de 10 pares de bases em cada volta completa da dupla hlice. Nota: em soluo aquosa, a estrutura altera-se
ligeiramente, havendo 10,5 pares de bases, por cada volta da hlice, aumentando a distncia para 36 .
A dupla hlice mantida por dois tipos de foras: as ligaes de hidrognio, entre bases
complementares, e interaces hidrofbicas entre bases sobrepostas. A complementaridade entre as cadeias de
DNA atribui-se ligao de hidrognio entre os pares de bases. As outras interaces, muito menos
especficas do que as ligaes de hidrognio, fazem a maior contribuio para a estabilidade da molcula.
uma molcula bastante flexvel, podendo haver rotao considervel volta de algumas ligaes
pentose-fosfato. Podem ocorrer flutuaes trmicas que causam dobras, estiramentos e desemparelhamento
das cadeias complementares.
Ao nvel do DNA celular encontramos alguns desvios em relao ao modelo de Watson e Crick, que
desempenham importantes funes no metabolismo do DNA. Estas variaes estruturais geralmente no
afectam as propriedades chave definidas por Watson e Crick: complementaridade entre cadeias antiparalelas e
as requeridas ligaes A-T e G-C.
As variaes na estrutura do DNA so o reflexo de trs factores:
1) Diferentes conformaes possveis da desoxiribose.
2) Rotao livre em volta da ligao C-1- N glicosdica.
3) Rotaes nas ligaes da desoxirribose com o grupo fosfato.
A estrutura de Watson e Crick tambm chamada DNA forma B (ou B-DNA) e a forma mais estvel
existente para a molcula de DNA. Existem no entanto duas variantes bem caracterizadas em estruturas
cristalinas, denominadas formas A e Z. A forma A ainda tem a conformao de hlice de mo direita, mas
mais larga e tem maior nmero de pares de bases por volta da hlice do que da forma B e as bases azotadas
emparelham num plano com cerca de 20 de inclinao. A forma Z tem j a conformao de hlice de mo
esquerda, sendo mais estreita do que a forma B e tendo maior nmero de pares de bases por volta da hlice.
No se sabe ao certo se a forma A ocorre ou no nas clulas, mas existem provas da existncia da forma Z em
tanto procariotas como eucariotas, e pensa-se que pode ter um papel importante na regulao da expresso de
alguns genes, ou na recombinao gentica.

J foram tambm detectadas variaes de estrutura dependentes da sequncia nucleotdica, que podem
afectar a funo e o metabolismo de segmentos de DNA na sua vizinhana. Por exemplo, ocorrem dobras na
hlice de DNA, sempre que 4 ou mais resduos adenosina aparecem seguidos numa cadeia.
Outro tipo de sequncias so as sequncias palindrmicas. Palindroma , basicamente, uma palavra ou
frase que se l da mesma maneira da esquerda para a direita ou vice-versa. O termo aplica-se a regies no
DNA com sequncias repetidas na ordem inversa na cadeia complementar. Desta forma, surgem sequncias
auto-complementares, dentro de cada cadeia, e portanto tm a capacidade de gerar formas de gancho de
cabelo (quando o DNA est sob a forma de cadeia simples) ou forma cruciforme. Quando a repetio
invertida ocorre na mm cadeia individual de DNA, a sequncia tem o nome de repetio espelhada, no dando
origem a nenhuma conformao especifica.
Outro aspecto a focar que o DNA pode ocorrer em cadeias triplas ou qudruplas. Quanto a cadeias
triplas, refere-se que nucletidos ligados segundo uma ligao normal de Watson e Crick, podem formar
ligaes de hidrognio adicionais, sendo que os tomos que participam nessas ligaes adicionais tm o nome
de posies de Hoogsteen. O par adicional chamado emparelhamento de Hoogsteen. Assim, forma-se um
triplex de DNA. Este tipo de estrutura mais estveis a pH baixo, pois envolve muitas vezes a ligao de
resduos de nucletidos protonados. Quanto a cadeias qudruplas, ocorrem apenas para molculas de DNA
com uma percentagem muito elevada de nucletidos de guanina.
Uma estrutura rara que ocorre no DNA chamada a H-DNA e encontrada apenas em longas
sequncias polipricas ou polipirimidicas, causando uma dobra acentuada na estrutura, fazendo com que uma
poro da cadeia exista sob cadeia tripla, em que duas das trs cadeias contm apenas purinas (ou pirimidinas)
e a outra contem apenas pirimidinas (ou purinas).
RNA
A molcula de RNA tem uma muito maior variedade de funes e conformaes do que o DNA,
fazendo com que no exista uma estrutura secundria que sirva de base, tal como a dupla hlice era para o
DNA. Dos diferentes tipos de RNA destacamos: RNA mensageiro, que transcreve a informao gentica do
DNA e a transporta para o citoplasma; RNA ribossomal, que parte integrante do esqueleto dos ribossomas,
que so o local de sntese proteica; RNA de transferncia, que funciona como descodificador do cdigo
gentico, funcionando como ponte entre informao gentica e sntese proteica; RNAs especiais tais como as
ribozimas, catalizando reaces.
O RNA ao ser transcrito existe sempre em cadeia simples, adquirindo uma estrutura helicoidal de mo
direita, sempre que no existem sequncias auto-complementares ao longo da cadeia polinucleotdica. No
caso de existirem essas sequncias, ocorre a formao dos tais ganchos de cabelo falados anteriormente, e no
caso de haver falhas na complementaridade de base, podem ocorrer arcos internos, protuberncias. de
referir que as estruturas ganchos de cabelo no so estruturas planares, adquirindo tambm uma estrutura
helicoidal de mo direita.