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volume I
Tecnologia de Bioprocessos
P 436 t
Pereira Jr., Nei. (editor-autor)
Tecnologia de bioprocessos / Nei Pereira Jr., Elba
Pinto da Silva Bon, Maria Antonieta Ferrara. Rio de
Janeiro: Escola de Qumica/UFRJ, 2008.
62 p.: il. (Sries em Biotecnologia, v. 1)
ISBN 978-85-903967-2-7
Inclui bibliografia.
Biblioteca Nacional
2
BREVE NOTA BIBLIOGRFICA SOBRE OS AUTORES
3
APRESENTAO
Tpico Pgina
1. A Biotecnologia Microbiana: Conceitos e Aplicaes 7
Biotecnologia de Bactrias 10
Biotecnologia de Leveduras e Fungos Filamentosos 12
Tecnologia do DNA Recombinante 14
2. Bioprocessos 18
3. Agente Biolgico: Caractersticas 21
4. Nutrio dos Microrganismos 23
Fontes de Energia 23
Fontes de Carbono 23
Fontes de Nitrognio 24
Fontes de Minerais 24
Fatores de crescimento 25
5. Matrias-Primas Glicdicas 25
6. Meio de Cultivo 27
Otimizao do meio de cultivo 29
Formulao de meio de cultivo com base na composio 31
centesimal de microrganismos
7. Esterilizao de Meios e Equipamentos 33
8. Biorreator 35
9. Modos de Operao de Bioprocessos 41
Quanto conduo 41
Quanto ao desenvolvimento do agente microbiano 45
Quanto ao suprimento de oxignio 47
10. Processos de Separao e Purificao de Produto 50
11. Extrapolao de Escala 50
12. Tratamento Biolgico de Resduos e Efluentes 53
13. Consideraes Gerais 57
14. Referncias Bibliogrficas Recomendadas 58
5
TECNOLOGIA DE BIOPROCESSOS
Nei Pereira Jr.1; Elba Pinto da Silva Bon2& Maria Antonieta Ferrara3
1
Laboratrios de Desenvolvimento de Bioprocessos
Escola de Qumica - CT/UFRJ nei@eq.ufrj.br
2
Laboratrio de Tecnologia Enzimtica
Instituto de Qumica CCMN/UFRJ
3
Instituto de Tecnologia em Frmacos
Farmanguinhos/FIOCRUZ
DEFINIO REFERNCIA
Conjunto de processos microbianos e outros
processos bioqumicos desenvolvidos em escala Stenesh (1989)
industrial
Uso de organismos vivos para produzir produtos Glazer & Nikaido (1995)
benficos para a espcie humana
Integrao de cincias naturais e de cincias da
engenharia visando aplicao de organismos, Smith-Doerr et al. (1997)
clulas, derivados celulares e anlogos moleculares
para produtos e servios
toda tecnologia de processo ou produto que
lance mo, em pelo menos uma de suas etapas, da
ao de microrganismos, clulas animais ou
vegetais, ou de substncias produzidas por estes Rehn & Reed (1993)
agentes biolgicos, sendo caracterizada por sua
multidisciplinaridade
agropecurio
qumico txtil
alimentcio energtico
mdico-farmacutico
7
Todos os microrganismos produzem uma variedade muito grande de enzimas
intracelulares em pequenas quantidades, para a catlise das suas reaes
metablicas. As enzimas, tambm denominadas de biocatalisadores, so
catalisadores proticos com caractersticas particulares pela sua alta eficincia em
condies fisiolgicas e alta especificidade, sendo inclusive capazes de catalisar
reaes estereoespecficas. Este potencial cataltico utilizado industrialmente
no s nos clssicos processos fermentativos, mas tambm em processos de
biotransformaes microbianas para a catlise de reaes qumicas de difcil
ocorrncia e de grande importncia na indstria farmacutica. Um exemplo tpico
refere-se produo de esterides utilizando-se Rhizopus nigricans. O fungo ,
inicialmente, cultivado em biorreatores em condies otimizadas para se atingir
altas concentraes celulares. Finda a fase de crescimento celular, o substrato a
ser transformado, a progesterona, adicionado ao biorreator e, aps um perodo
de incubao determinado, o produto da biotransformao, a 11-
hidroprogesterona, extrado com solvente orgnico. Este composto pode ser
subseqentemente transformado, por via qumica, para a produo industrial de
um outro esteride, a cortisona (Madigan et al., 2000 e Atlas, 1997).
Enquanto nas biotransformaes os sistemas enzimticos de interesse no so
extrados das clulas, a catlise enzimtica industrial usa enzimas microbianas
excretadas ou extradas de microrganismos e com diferentes graus de
purificao. As enzimas microbianas excretadas so produzidas em maiores
quantidades do que as intracelulares e tm a funo principal de degradar
macromolculas presentes no meio ambiente, como a celulose, o amido, a lignina
e protenas, para que seus componentes possam ser absorvidos como nutrientes
pelos microrganismos.
As enzimas so utilizadas em muitos segmentos industriais, como o de alimentos
e bebidas, de detergentes, txtil, couro, celulose e papel, qumica fina,
medicamentos e cosmticos e, ainda, em metodologia analtica e em biologia
molecular. Amilases, glicose oxidase, pectinases, invertase, renina, naraginase,
lipases, proteases, celulases e peroxidases so os biocatalisadores mais utilizados
(Atlas, 1997 e Bon & Pereira Jr., 1999). Enzimas so tambm empregadas como
medicamento, como por exemplo, a asparaginase utilizada no tratamento de
leucemia. O mercado mundial de biocatalisadores, atualmente avaliado, em US$
1,5 bilhes tem previses de crescimento continuado em resposta s demandas
por processos industriais com menor impacto ambiental e menor consumo
energtico e tambm por produtos de melhor qualidade (Godfrey, 2003).
O desenvolvimento da Biotecnologia tem importncia mpar para o Brasil, devido
ao seu baixo impacto ambiental, sendo possvel conciliar o desenvolvimento
industrial com a preservao de ecossistemas. Sabemos que o Brasil apresenta
uma das maiores biodiversidades do planeta e que seu territrio possui recursos
hdricos correspondentes a 12% da gua doce do planeta, incluindo o Aqfero
Guarani, que o maior do mundo. So esses os recursos naturais mais
importantes para a humanidade a partir deste sculo, representando um ativo de
valor incalculvel. Essas riquezas, patrimnio da sociedade brasileira, devem ser
preservadas da poluio ambiental provocada por prticas inadequadas de
diferentes setores industriais e agro-industriais.
O equilbrio natural dos ecossistemas, to antigo quanto a vida na Terra, pode ser
considerado como uma importante rea da Biotecnologia Microbiana. Os
microrganismos habitam praticamente todos os ambientes terrestres, sendo
8
transportados por correntes de ar para a atmosfera e de continente para
continente. Esses seres microscpios tambm habitam todos os ambientes
marinhos, das superfcies aquticas ao fundo dos oceanos. Por causa desta
caracterstica de crescimento nos mais variados ambientes, os microrganismos,
atravs de suas vias metablicas intracelulares e de molculas bioativas
excretadas para o meio externo, atuam na manuteno do ciclo biolgico de
elementos qumicos, no controle populacional, na descontaminao de ambientes
aquticos e terrestres e na disponibilizao de nutrientes para diferentes formas
de vida. Estas tarefas gigantescas, inestimveis e insubstituveis no so
facilmente perceptveis, correndo o risco de no serem adequadamente
protegidas. Embora a ao antropognica venha interferindo de forma negativa
no modus operandi dos ecossistemas e, portanto, no seu equilbrio, as
populaes microbianas que habitam o nosso planeta continuam alicerando a
manuteno da vida na Terra.
O fantstico potencial metablico envolvido na sntese e degradao das mais
variadas estruturas qumicas por bactrias, fungos, algas e protozorios est
distribudo em microrganismos com caractersticas fisiolgicas muitas vezes
peculiares. As bactrias, por exemplo, so encontradas nos mais diferentes
climas e microambientes do planeta, alguns considerados inspitos. Bactrias
haloflicas vivem em ambientes aquticos com alto teor salino, como o Mar Morto,
as termoflicas, em fontes termais, em temperaturas entre 800C e 1000C e as
baroflicas se adaptaram s enormes presses das profundezas do mar.
Adicionalmente, algumas bactrias so parasitas de tecidos animais e vegetais e
algumas vivem em consrcio com outros microrganismos, plantas e animais.
Biotecnologia de Bactrias
Embora as bactrias sejam mais conhecidas como microrganismos
patognicos, a grande maioria inofensiva e inclusive benfica a outros seres
vivos. Como exemplo, a tarefa fundamental da fixao do nitrognio atmosfrico
molecular levada a efeito por bactrias dos gneros Rhizobium, Bradyrhizobium
e Frankia, que vivem em associaes simbiticas com plantas leguminosas, como
o feijo e a soja. Estas bactrias, que so encontradas no solo, infectam
naturalmente plantas hospedeiras formando ndulos nas razes onde proliferam.
Este mecanismo natural de infeco tem sido utilizado, h quase cem anos, para
aumentar a fertilidade do solo atravs da sua inoculao com bactrias fixadoras
de nitrognio produzidas industrialmente por processos fermentativos (Glazer &
Nikaido, 1995).
So tambm de grande importncia biotecnolgica cepas selvagens ou
modificadas geneticamente de bactrias dos gneros Corynebacterium, Bacillus e
Microbacterium pela capacidade de excretar produtos do seu metabolismo
primrio, como aminocidos. A constatao de que Corynebacterium glutamicum
era capaz de produzir grandes quantidades de cido glutmico, quando crescida
em glicose, reportada em 1957, resultou na seleo e desenvolvimento de
bactrias para a produo de acido L-glutmico, L-arginina, L-isoleucina, L-
histidina, L-leucina, L-lisina, L-ornitina, L-fenilalanina, L-prolina, L-treonina, L-
triptofano e L-tirosina, alm de vitaminas e nucleotdeos. Fermentaes com
concentraes de L-tirosina e L-fenilalanina em torno de 25g/L esto descritas na
literatura (Piepersberg, 1993). A produo anual de aminocidos utilizados na
indstria de alimentos estimada em 530 toneladas (Madigan et al., 2000).
9
Ainda entre as bactrias, encontramos os estreptomicetos, que tambm
apresentam o genoma organizado em um nico cromossomo circular. Os
estreptomicetos, que so aerbios, vivem no solo e multiplicam-se formando
filamentos ramificados, tm grande importncia biotecnolgica por produzirem
compostos com diferentes atividades biolgicas. Assim, esses microrganismos
sintetizam molculas que atuam como antibiticos, antitumorais,
imunomoduladores, antiinflamatrios, vasoconstritores e vasodilatadores, alm
de terem aplicao no tratamento da diabete e como herbicidas. Algumas foram
ainda identificadas como inibidores enzimticos. Estes compostos, que
apresentam baixa massa molecular, so excretados em condies de
metabolismo secundrio, isto , aps a fase de crescimento celular, j tendo sido
identificados mais de 10.000 substncias diferentes (Piepersberg, 1993). Os
antibiticos, substncias que mesmo em baixas concentraes inibem o
crescimento de microrganismos patognicos, so os representantes mais
conhecidos deste grupo. Considerando o seu mercado, avaliado em 8 bilhes de
dlares (Glazer & Nikaido, 1995), os antibiticos so os produtos mais
importantes da biotecnologia microbiana, excetuando-se bebidas alcolicas e
queijos.
O primeiro depoimento oficial sobre a ao do antibitico penicilina foi feito por
Alexander Fleming em 1928, quando relatou a eficincia do filtrado de uma
cultura do fungo Penicillium notatum como um teraputico local em uma infeco
provocada por Staphylococcus. O grande sucesso dos antibiticos no tratamento
de infeces bacterianas em comparao aos quimioterpicos, que comearam a
ser disponibilizados na mesma poca, deveu-se sua eficincia em comparao
apresentada por drogas como as sulfas. Assim, enquanto concentraes
inibitrias mnimas (CIMs) de sulfonamidas nos pacientes esto na faixa de 10 a
100 g/mL, o antibitico penicilina mata bactrias sensveis como Streptococcus
pneumoniae com CMIs em torno de 0,01 g/mL (Glazer & Nikaido, 1995).
Os antibiticos podem ser classificados quanto ao espectro de atividade,
antifngicos, antibacterianos, antivirais, antiprotozorios e antitumorais; quanto
a seu mecanismo de ao, interferindo na sntese da parede celular, na sntese
de cidos nuclicos, na sntese de protenas e nas funes da membrana
citoplasmtica; e quanto sua estrutura qumica, lactonas macrocclicos,
quinonas e relacionados, derivados de aminocidos e peptdicos, entre outras
estruturas.
A grande maioria dos antibiticos com importncia comercial produzida por
fungos ou bactrias. Dentre os bacterianos, a maior variedade em estruturas e o
maior nmero de antibiticos so encontrados na classe Actinomycetales,
especialmente no gnero Streptomyces. Uma relao de alguns antibiticos
produzidos por Streptomyces est apresentada na tabela 2.
Segundo o Index ABIQUIF 2002, publicado pela Associao Brasileira da Indstria
Farmoqumica, so produzidos no Brasil apenas nove antibiticos, a saber:
Ampicilina, Anfotericina B, Cefalexina, Cefalotina, Ceftadizina, Eritromicina,
Nistatina, Oxacilina e Penicilina G, de um elenco de trinta e nove considerados
essenciais segundo a edio de 2002 da Relao Nacional de Medicamentos
Essenciais publicada pelo Ministrio da Sade. Entre os antibiticos produzidos no
Brasil, trs (Cefalexina, Cefalotina e Ceftazidna) so produzidos pela empresa
multinacional Eli Lilly do Brasil Ltda e seis (Ampicilina, Anfotericina B,
Eritromicina, Nistatina, Oxaciclina e Penicilina G), por outra multinacional, o
10
Grupo Prodotti. Esta relao no inclui a paromomicina, fundamental para o
tratamento de doenas negligenciadas de grande ocorrncia no Brasil, como a
leishmaniose e a tuberculose. O Brasil no produz e nem importa paromomicina,
no estando esta droga disponvel no mercado nacional. Considerando o acima
exposto, o abastecimento de antibiticos para uso humano no Brasil depende
integralmente de companhias farmacuticas internacionais. Em relao
produo de antibiticos para uso animal, o pas encontra-se em posio mais
confortvel, pois existem empresas brasileiras, como a Valle, ativas no setor.
Antibitico Microrganismo
Aminosidina Streptomyces rimosus
Cicloheximida Streptomyces griseus
Cicloserina Streptomyces orchidaceus
Cloranfenicol Streptomyces venezuelae
Eritromicina Streptomyces erithreus
Espectinomicina Streptomyces spectabilis
Estreptomicina Streptomyces griseus
Kanamicina Streptomyces kanamyceticus
Lincomicina Streptomyces lincolnnensis
Neomicina Streptomyces fradiae
Nistatina Streptomyces noursei
Ribostamicina Streptomyces ribosidificus
Tetraciclina Streptomyces rimosus
12
Tabela 3: Medicamentos produzidos com metablitos fngicos
e microrganismos produtores.
15
Tabela 4: Espcies microbianas usadas na manufatura de produtos comerciais.
16
2. Bioprocessos
17
Tratamento da matria-prima
Preparo de meio; Esterilizao
upstream process
BIORREATOR
Fenmenos
qumicos
Meio de cultivo
Fenmenos
fsicos Agente biolgico:
clulas microbianas,
animais, vegetais ou
enzimas
Fenmenos
biolgicos
Separao de clulas
Separao/purificao de produto
downstream process
ESTERILIZAO
BIORREATOR
DE
PRODUO
BIORREATOR
DE MEIO
PROPAGAO ISENTO DE
SEPARAO CLULAS
DE CLULAS
INOCULAO
FILTRAO PURIFICAO
DO AR DA
BIOMASSA BIOMOLCULA
BANCO DE EXTRACELULAR
CLULAS
AERAO
ROMPIMENTO
CELULAR
BIOMOLCULA BIOMOLCULA
COM ALTO GRAU COM ALTO GRAU
DE PUREZA PURIFICAO DA DE PUREZA
BIOMOLCULA
INTRACELULAR
1
Biologia Molecular aplicada: Ramo da Biologia que estuda a origem, transformao e interao dos
genes e seus produtos de expresso no indivduo, populao ou espcie, possibilitando o controle a
nvel gentico, a construo de agentes biolgicos timos e combinaes timas clula-biorreator.
2
Engenharia Metablica: combinao de mtodos analticos e mtodos matemticos para quantificar
fluxos in vivo com o auxlio de tcnicas da Biologia molecular, objetivando programar modificaes
genticas dirigidas a fim de melhorar propriedades celulares.
20
como cultura pura. Atravs de diferentes tcnicas possvel manter todas as
caractersticas da populao microbiana de interesse e, dessa forma, sempre que
uma nova produo iniciada a qualidade do produto tambm mantida. Assim,
a manuteno e a preservao de microrganismos so etapas de extrema
importncia para assegurar a sua viabilidade e atividade, bem como prevenir
mudanas genticas que podem levar reduo ou perda das propriedades
fenotpicas desejadas. Tcnicas de manuteno e preservao de microrganismos
incluem: repiques peridicos, conservao em parafina, em glicerol, liofilizao,
criopreservao etc. Estas tcnicas esto amplamente descritas na literatura (ver
referncias bibliogrficas recomendadas).
Aps procedimento de inoculao, a clula desenvolve seu metabolismo, a fim de
produzir energia para suportar suas reaes biossintticas e de manuteno
energtica. As molculas-combustveis (carbohidratos, lipdios, protenas)
utilizadas pela clula contm elevado nvel de energia qumica, devido ao seu alto
grau de ordem estrutural, apresentando, relativamente, baixa entropia. Durante
o catabolismo, essas substncias so degradadas a molculas menores, como
dixido de carbono, gua, lcoois etc. Como resultado dessa transformao, a
molcula-combustvel sofre uma perda do seu contedo de energia livre (forma
de energia capaz de realizar trabalho a temperatura e presso constantes). A
energia livre liberada durante as reaes do catabolismo, e por isso chamadas de
exoergnicas, conservada na forma de energia qumica nas ligaes covalentes
de certos compostos, como o ATP.
Os processos biossintticos (anabolismo), transporte ativo atravs da membrana
e mobilidade celular envolvem reaes endoergnicas (carentes de energia). As
clulas tm suas necessidades atendidas atravs da energia produzida durante o
catabolismo (Figura 4).
Nutrientes
Produtos
Energia
Crescimento
Energia
ANABOLISMO Movimento,
(Biossntese) Transporte,
CATABOLISMO etc.
Componentes(Degradao)
Celulares
Fonte de
Energia
Figura 4: Esquema simplificado do metabolismo celular.
Muitas clulas vivas necessitam de oxignio para manuteno de seu
metabolismo. Em Bioprocessos conduzidos com microrganismos aerbios, o
oxignio suprido ao biorreator, via de regra, com bolhas de ar, atravs de um
compressor, como ser visto mais adiante. J em Bioprocessos anaerbicos, os
microrganismos obtm o oxignio metablico atravs de substncias que contm
21
oxignio ligado molecularmente. Nos primeiros, o adequado suprimento de
oxignio para atender a demanda da clula imperativo, assim como a
manuteno de condies anaerbicas estritas no segundo caso. Se essas
exigncias no forem atendidas o processo encontra-se com seu potencial
limitado, podendo haver desvios no metabolismo celular ou mesmo sua
interrupo, com a conseqente perda da viabilidade celular.
Dentro da concepo de processo integrado, a associao de determinadas
caractersticas do agente biolgico (clulas ou enzimas), bem como das
particularidades do sistema reacional, com os processos de downstream tem sido
tambm uma tendncia no desenvolvimento e melhoria da operacionalidade de
Bioprocessos. Assim, se o agente biolgico do processo for um microrganismo
portador de propriedades agregativas (floculao), poder-se-o suprimir
equipamentos onerosos de separao de clulas, e utilizar novas configuraes
de biorreatores mais compactos e menos intensivos em energia, tornando o
processo, conseqentemente, mais econmico. Associaes de sistemas
reacionais com separao simultnea de produto(s) podem, tambm, ser
desenvolvidas (imobilizao de enzimas em suportes de colunas cromatogrficas,
sistemas de fermentao acoplados a mdulos de membrana e outros
destilao a vcuo), com os conseqentes benefcios tcnicos e econmicos para
a operao e a viabilidade dos Bioprocessos.
22
quimiorganotrficos satisfazem a maior parte de suas necessidades de carbono
pela incorporao de metablitos obtidos pela degradao de substratos
orgnicos, os quais tambm fornecem energia. Os autotrficos, por outro lado,
so capazes de induzir a fotlise da gua, que permite a fixao de dixido de
carbono e sua utilizao como nica fonte de carbono.
Desta forma, o potencial para utilizar fontes de carbono para o metabolismo varia
enormemente entre os microrganismos. Desde os chamados compostos C1 (CO,
CO2, formaldedo, metanol, metilamina), at macromolculas complexas
(glicognio, amido, protenas, celulose, cidos nuclicos), praticamente todos os
compostos orgnicos da natureza podem ser utilizados como fonte de carbono
e/ou energia por microrganismos, desde que estes possuam os sistemas
enzimticos e de transporte adequados a cada fonte. Compostos orgnicos que
contm carbono e nitrognio, tais como aminocidos e protenas, podem servir
tanto como fonte de carbono, como de nitrognio.
As macromolculas so inicialmente convertidas extracelularmente a subunidades
menores, oligmeros ou monmeros, por enzimas despolimerizantes. Caminhos
metablicos perifricos so, ento, utilizados para transformar estes compostos
em metablitos capazes de ser catabolizados por vias metablicas centrais. Os di
e oligossacardeos de baixas massas moleculares (sacarose, maltose e outros),
assim como oligopeptdeos e oligonucleotdeos podem ser hidrolisados
extracelularmente ou primeiramente transportados para o interior da clula e
ento hidrolisados (Krmer & Sprenger, 1993).
Os carboidratos so as principais fontes de carbono e energia para os
microrganismos, sendo a glicose a mais fcil e amplamente utilizada, seguida por
frutose, manose e galactose (Gadd, 1988).
23
nquel, cobalto e boro e so, em geral, necessrios em quantidades relativamente
baixas (Rhodes & Fletcher, 1963; Madigan et al., 2000).
Por sua vez, a gua essencial para a ao enzimtica, dissoluo de materiais
orgnicos e inorgnicos e como reagente em muitos processos metablicos.
Seu teor nas clulas situa-se na faixa de 70-90%.
Os nutrientes inorgnicos podem agir de quatro formas no interior da clula:
entrar no metabolismo levando sntese de compostos necessrios ao
funcionamento da clula; estimular o metabolismo como co-fator para reaes
enzimticas; inibir o metabolismo e, finalmente, contribuir para as propriedades
osmticas (Jennings, 1988).
5. Matrias-Primas Glicdicas
A viabilidade tcnica, os balanos mssicos e energticos e a
economicidade so aspectos relevantes que devem ser considerados na escolha
da matria-prima. Em geral, esta deve apresentar as seguintes caractersticas:
composio adequada ao crescimento do agente biolgico e formao do
produto de interesse;
baixo custo de obteno, beneficiamento, transporte e estocagem;
elevada disponibilidade e facilidade de padronizao dos componentes;
no contribuir para dificultar os processos de separao do produto.
Uma grande variedade de matrias-primas, geralmente provenientes da agro-
indstria, utilizada como fonte(s) de substrato/carbono/energia e outros
nutrientes. De uma forma geral, as matrias-primas para Bioprocessos podem
ser agrupadas em funo da estrutura e complexidade molecular dos substratos3.
Em algumas, os substratos encontram-se na forma polimrica, e sua hidrlise
prvia ser necessria, caso o agente biolgico no seja capaz de sintetizar
enzimas que catalisam a despolimerizao desses substratos. Assim, estas
matrias-primas podem conter:
substratos solveis que podem ser facilmente extrados e convertidos
prontamente a produto(s), como por exemplo: sacarose, glicose, frutose e
lactose, de cana de acar, beterraba, melao, soro de leite etc;
polissacardeos insolveis, que precisam de tratamento moderado para
solubilizao e hidrlise, antes da converso a produto(s) como por exemplo:
amido de milho, mandioca, trigo, cevada, batata etc;
polissacardeos insolveis altamente resistentes, que necessitam de pr-
tratamento fsico, seguido de hidrlise qumica ou enzimtica para produzir
3
Substrato o reagente primrio do qual o produto obtido.
24
substratos na forma monomrica, que sero convertidos a produto(s), como
por exemplo: celulose e hemicelulose de matrias-primas lignocelulsicas.
GALACTOSE XILOSE
GLICOSE MANOSE
FRUTOSE
GALACTOSE
ARABINOSE
25
repressoras como o glicerol e a induo do gene de interesse com metanol
(Cereghino & Cregg, 2000; Gelissen, 2000).
6. Meios de Cultivo
Os meios de propagao e produo devem conter os nutrientes (fonte
de carbono/energia/substrato, fonte de nitrognio, co-fatores4, precursores5 e
elementos traos) em concentraes tais que resultem em atividade mxima do
agente biolgico, no sendo as condies timas para o crescimento celular,
necessariamente, as mesmas para o processo produtivo.
A escolha dos nutrientes adequados gerao do produto de interesse est
relacionada atividade metablica desenvolvida pelo agente biolgico. Nesse
ponto destaca-se, ento, a importncia das informaes obtidas sobre as
exigncias nutricionais da populao microbiana envolvida no processo. Buscam-
se, ento, as fontes adequadas que possuam os componentes necessrios ao
bom desempenho da clula. Assim, h que se fortificar a matria-prima com
componentes que faltam, retirar aqueles que inibem, de modo a permitir uma
rpida e eficiente converso do substrato em produto com o rendimento
desejado.
evidente que quanto maior o atendimento s exigncias nutricionais, mais apta
estar o clula viva a responder aos estmulos externos. Conseqentemente,
mais eficiente ser a converso do produto de interesse e maior a produtividade.
Satisfazer as exigncias nutricionais das clulas ou compor adequadamente o
meio de cultivo em laboratrio, cujas dimenses dos biorreatores so pequenas,
pode ser fcil, empregando-se nutrientes puros e caros. No entanto, para compor
o meio industrial do Bioprocesso, alguns nutrientes devero ser selecionados de
acordo com suas caractersticas no s nutricionais, mas tambm econmicas,
no podendo ser esquecidas as particularidades inerentes ao agente da
transformao, quanto ao que ser aproveitado para suas reaes metablicas ou
a algum efeito de inibio sobre essas reaes ou mesmo sobre a sntese do
produto final.
A escolha da fonte de carbono muito importante devido ao fato de a sntese de
diversas biomolculas estar sujeita represso catablica6. A glicose, por
exemplo, apesar de ser, em geral, excelente fonte para o crescimento celular,
tem sido reportada como repressora para a sntese de diversas substncias, em
particular na produo de enzimas e antibiticos (Lambert & Meers, 1983).
4
Cofatores: so componentes essenciais, orgnicos ou inorgnicos, necessrios em pequenas
quantidades para a atividade mxima dos sistemas enzimticos. Ex: metais, vitaminas e substncias
qumicas complexas.
5
Precursor: um reagente especfico, cuja adio ao meio resulta na incorporao de um
determinado grupo estrutural molcula do produto. No obtenvel pela reao de fermentao,
tendo que ser fornecido pr-formado. Ex: cido fenil-actico (produo de penicilina) e on cobalto
na produo de cianocobalamina (vitamina B12).
6
Represso catablica: sistema coordenado que determina preferncia por glicose, inibindo a
expresso de perons que codificam enzimas de rotas metablicas alternativas. A represso
catablica resulta da reduo nos nveis de cAMP na clula pela presena de glicose, ocasionando na
inatividade de CAP (catabolic activator protein).
26
Da mesma forma, a fonte de nitrognio deve ser escolhida com bastante critrio.
conhecido que fontes de nitrognio chamadas de preferenciais, ricas ou de fcil
metabolismo, como o on amnio, a glutamina, a asparagina e a mistura de
aminocidos e peptdeos presentes na peptona e outros concentrados proticos
comerciais, so repressoras da produo de diversas enzimas. Ao contrrio,
prolina e uria, ornitina e alantoina, entre outros, denominadas fontes no
preferenciais, pobres ou de assimilao mais lenta, so fontes de nitrognio no
repressoras e, portanto, o seu uso em geral favorece a produo de biomolculas
sensveis represso por nitrognio (Adrio, 2003; Walker, 1998; Magasanik &
Kaiser, 2002).
Entre as fontes de nitrognio inorgnicas, o sulfato de amnio o sal mais
utilizado devido ao seu baixo custo, sendo tambm empregado o nitrato de sdio.
Adicionalmente, existe uma grande disponibilidade de fontes de nitrognio
orgnico de grande aplicao em Bioprocessos industriais, como a uria. As
principais fontes de nitrognio complexas empregadas so: extrato de levedura
(rico em vitaminas do complexo B e aminocidos); licor da macerao do milho
(subproduto da industrializao do milho, fonte bem balanceada em carbono,
nitrognio, enxofre e sais minerais, contendo ainda vitaminas, como riboflavina,
niacina, cido pantotnico, biotina e piridoxina); farinha de soja (resduo da
indstria de produo de leo de soja, rico em nitrognio, o qual , entretanto,
mais complexo e de mais difcil assimilao do que o nitrognio do licor da
macerao do milho) (European Comission, 2002).
O valor do pH do meio de cultura parmetro de fundamental importncia e
tambm deve ser otimizado, de forma a proporcionar um bom crescimento
celular e elevados rendimentos em produto. H que se ressaltar que quando o
agente biolgico for enzimas, ou mesmo quando estas biomolculas so os
produtos do Bioprocesso, a atividade e a estabilidade enzimticas so fortemente
dependentes da fora inica do meio, temperatura, pH e da relao entre a
concentrao de substrato e de enzima. Estas variveis bsicas influenciam o
desempenho cataltico das enzimas por afetarem suas conformaes, estejam
elas livres ou imobilizadas. Estudos devem ser conduzidos previamente a fim de
se eleger as condies timas para a catlise enzimtica.
Os meios de cultivo podem ser complexos ou quimicamente definidos. Os meios
complexos so formulados com base em subprodutos industriais e extratos
naturais, tais como: melao, milhocina, extrato de levedura e outros. Sua
composio complexa e varivel e contm vrias fontes de cada elemento.
Estes meios podem requerer suplementao com compostos que proporcionem
quantidades adicionais de alguns elementos, tais como: N, Mg e P. Os meios
complexos so extensamente utilizados em Microbiologia bsica (taxionomia,
fiosiologia e gentica), Microbiologia de guas e de alimentos e em Fermentaes
industriais. Exemplos de componentes de meios complexos encontram-se na
Tabela 6.
Os meios quimicamente definidos so formulados com compostos puros, tais
como: glicose, sulfato de amnio, fosfato mono ou di cido de potssio etc. Sua
composio qumica conhecida e reproduzvel, contendo fontes de cada
elemento e dos nutrientes essenciais requeridos. Estes meios so usados
preferencialmente em pesquisa e desenvolvimento de Bioprocessos. Uma classe
especial de meio quimicamente definido o meio mnimo, que se pode definir
como aquele formado por uma fonte nica de cada elemento ou componente.
27
Os meios complexos so adequados em nvel industrial por serem mais baratos e
porque, em certos casos, se obtm melhores rendimentos e produtividades
volumtricas. Isto se deve a uma variedade de molculas orgnicas, em sua
constituio, que evitam que a clula necessite sintetiz-las a partir de glicose e
compostos inorgnicos. Por outro lado, os meios quimicamente definidos
permitem um melhor controle das condies ambientais para o crescimento e
para a produo, sendo fcil excluir substncias txicas ou inibidoras e incluir
precursores e/ou indutores nos nveis adequados. Por esta razo, certas
fermentaes que requerem um controle estrito das condies ambientais,
resultam mais produtivas quando se utilizam meios quimicamente definidos. A
Tabela 7 mostra, a ttulo de exemplo, a composio de um meio quimicamente
definido para o cultivo de clulas de Saccharomyces cerevisiae.
Componente Origem
Melao Indstria aucareira
Milhocina Subproduto do processamento de milho
Licor sulftico Efluente da indstria de polpa e papel
Soro/permeado de soro de leite Subproduto do processamento de queijo
Vinhoto Subproduto da produo de etanol
Farinha de soja e pescado Industrializao da soja e pescado
Extrato de levedura Indstria de levedura de panificao
Nvel
Fator Superior Central Inferior
Temperatura de cultivo 37C 35C 33C
Concentrao de nutriente 5% 3% 1%
29
Tabela 9: Matriz de Planejamento Experimental.
Temperatura de Concentrao de
Experimento crescimento nutrientes
1 +1 (37C) +1 (5%)
2 +1 (37C) 0 (3%)
3 +1 (37C) -1 (1%)
4 0 (35C) +1 (5%)
5 (C) 0 (35C) 0 (3%)
6 0 (35C) -1 (1%)
7 -1 (33C) +1 (5%)
8 -1 (33C) 0 (3%)
9 -1 (33C) -1 (1%)
Observe que nesta matriz um importante fator foi ignorado: o tempo de cultivo
do microrganismo. Caso utilizssemos tambm este fator, teramos uma nova
matriz com 33 experimentos, compreendendo 27 condies experimentais
diferentes.
importante comentar que rplicas so muito importantes para o Planejamento
experimental, pois permitem que analisemos o erro intrnseco ao Bioprocesso,
chamado de erro experimental. O tipo de rplica mais importante a do ponto
central de experimentos, marcado com (C) na Tabela 9. Anlises estatsticas
demonstram que a utilizao de um nmero superior a 5 rplicas para o ponto
central dispensa duplicatas dos outros pontos experimentais.
matria
CLULA
energia CLULA
produto
informao
31
anaerobiose apenas 10-20%, pode-se estimar a concentrao dos nutrientes que
iro compor o meio de cultivo.
33
8. Biorreator
7
Biorreator: tanque/recipiente no qual clulas ou enzimas realizam uma reao biolgica.
34
biorreatores do tipo STB (at 4:1), os biorreatores agitados pneumaticamente
possibilitam a operao contnua de bioprocessos com altas densidades celulares
(clulas imobilizadas ou floculantes), resultando em altos valores de
produtividade volumtrica. H registros na literatura de processos que tiveram
seus tempos de converso de substrato em produto reduzidos de dias para horas,
pelo emprego deste tipo de biorreator. As altas relaes H/DT so necessrias a
fim de se alcanarem elevadas retenes das bolhas gasosas no seio do lquido e
de gerar altas presses hidrostticas na regio prxima distribuio do ar (na
base do biorreator), que induziro o movimento do lquido.
Mtodos de Imobilizao
Envolvimento Floculao
36
pectina ou polmero sinttico como a poliacrilamida. Neste ltimo caso h
necessidade de agente funcional para formao de ligaes cruzadas, o que pode
conferir certa toxicidade s clulas.
Na tcnica da ligao covalente, os suportes so especialmente funcionalizados
para conter um grupamento qumico que ser responsvel pela imobilizao do
material biolgico ao suporte. Dentre os materiais suportes, as esferas de vidro
(dimetro variando de 100 a 500 m) tratadas com -aminopropil-trietoxisilano
so bastante empregadas. Posteriormente, o grupamento amina resultante reage
com glutaraldedo (agente bifuncional), de forma a se produzir uma estrutura
especial que possui um grupamento carbonila (-HC=O) altamente reativo. A
interao da clula/enzima com o suporte se d pela ligao da carbonila do
suporte funcionalizado com os grupamentos aminas das enzimas ou das protenas
da parede celular. Sua limitao est associada a potencial toxicidade do sistema,
conferida pela presena do glutaraldedo (Pradella, 2001).
(A) (B)
39
9. Modos de Operao de Bioprocessos
40
automtico, levando a menores gastos com mo de obra; maior uniformidade do
produto; e as condies ambientais so constantes, o que possibilita o estudo das
vrias influncias sobre o agente do bioprocesso. No entanto, riscos de
contaminao e problemas ligados degenerescncia do agente (mutao e
variao) so citados como desvantagens da conduo contnua.
Ressalta-se que esta forma de conduo do processo particularmente adequada
para a escolha das fontes de carbono e nitrognio e tambm de outros
nutrientes. Sumariamente, se uma cultura contnua em estado permanente
submetida a pulsos contendo componentes individuais e se a concentrao
celular ou do produto de interesse mostrar um aumento transiente, ento aquele
componente particular limitante para o crescimento ou para a produo e sua
concentrao no meio dever ser aumentada para maximizar os rendimentos.
Indutores e repressores podem ser identificados a partir do aumento ou da
diminuio transiente do rendimento, em funo da adio de tais molculas.
Portanto, os componentes-chaves de um meio podem ser rapidamente
identificados sem a necessidade de um grande nmero de experimentos em
frascos agitados, como mencionado anteriormente.
A eleio da forma de conduo ser funo da cintica do Bioprocesso, tendo-se
que avaliar o momento em que a sntese do produto se inicia. Desta forma, em
que pesem as complexidades dos bioprocessos, estes podem apresentar a sntese
do produto de forma associada, semi-associada e no associada ao crescimento
microbiano. Pelo estudo cintico, pode-se orientar no projeto do processo que
melhor convm ao bioprocesso. Assim que, os produtos que se formam
associadamente ao crescimento podem ter ser processos conduzidos
continuamente. J no caso de produtos que tm a sua sntese de forma no
associada ao crescimento, a distino de duas fases orienta no sentido de
realizar-se a produo do agente separadamente, tendo at um meio de
composio diferente ao de produo. O processo dever, portanto, ser operado
em duas fases e, desta forma, passvel de ser conduzido continuamente.
Concluses anlogas anterior, aplicam-se aos processos que apresentam
cintica mista (semi-associada).
A seguir, esto ilustradas as diferentes formas de conduo de bioprocessos para
uma melhor compreenso dos possveis arranjos produtivos (Figuras 13 a 20).
Obviamente, que a escolha de um desses arranjos est ligada, como mencionado
anteriormente, cintica do processo, mas tambm aos aspectos tcnicos e
econmicos do bioprocesso em desenvolvimento. Por exemplo, a reutilizao de
clulas traz benefcios econmicos, no que concerne a utilizao mais efetiva do
substrato para a sntese do produto propriamente dita, minimizando o consumo
deste reagente primrio para a plasticidade celular. Da mesma forma, o reciclo
de clulas na conduo contnua permite que se trabalhe com os biorreatores
com altas densidades celulares, resultando em aumentos na produtividade
volumtrica e especfica do bioprocesso. Estas estratgias so particularmente
interessantes no caso do produto ser uma substncia de baixo valor agregado.
Por outro lado, substncias de alto valor agregado (como antibiticos, vitaminas
e protenas teraputicas) que, via de regra, apresentam cinticas de produo
mais lentas, devem ter seus processos de produo atendendo aos mais altos
padres de qualidade. Neste sentido, alto rigor estril requerido e a adoo da
reutilizao de clulas no se mostra como uma alternativa interessante para a
conduo desses bioprocessos, pelos riscos inerentes de contaminao.
41
B1
Inculo
recentemente
preparado
Meio fermentado encaminhado
Seo de separao de clulas e
B2 recuperao de produto
Inculo
recentemente
preparado
Meio fermentado encaminhado
Seo de separao de clulas e
recuperao de produto
......
Figura 13: Batelada com um inculo para cada biorreator .
B1 Seo de
Meio fermentado
Inculo recuperao
sem clulas
recentemente de produto
Separao
preparado
de clulas
Suspenso concentrada
de clulas
Tratamento
das clulas
seguido de
B2 inoculao
Meio fermentado
Seo de
recuperao
sem clulas de produto
Separao
de clulas
Suspenso concentrada
de clulas
......
Figura 14: Batelada com recuperao do inculo.
.
Inculo recentemente
preparado
MN MT
F=cte
F=F(f linear)
F=F(f exponencial)
Vf
Vi
Figura 16: Batelada alimentada com diferentes formas de alimentao.
Vi: volume inicial; Vf: volume final.
F (L/h) F (L/h)
So S1
Xo=0 X1
Po=0 P1
F (L/h) F (L/h)
So S1
Xo=0 X2
Po=0 F+F (L/h) P1
S1; X1; P1
F
CfX1
Figura 18: Processo Contnuo com um nico biorreator e com reciclo de clulas.
F: vazo de alimentao e de meio transformado; S: concentrao de substrato; X: concentrao de
clulas e P: concentrao de produto (o ndice o refere-se condio inicial; o ndice 1 s
concentraes na corrente que sai do biorreator e o ndice 2 s concentraes que saem do
separador). : razo de reciclo e Cf: fator de concentrao de clulas. Note que no separador as
concentraes de substrato e produto so as mesmas que saem do biorreator, admitindo-se que no
haja transformao na seo de separao de clulas.
43
F0 (L/h)
Fn=F0
S0
X0=0
P0=0
S1 S2 S3 Sn
X1 X2 X3 Xn
P1 P2 P3
...... Pn
= K L a (CS CL ) qO2 X
dCL
dt
47
onde:
dCL/dt: taxa de transferncia de O2 ou taxa de absoro de O2, moles de O2 /m3.h
KL: coeficiente global de transferncia de massa de O2 na fase lquida, m/h
a: rea especfica da superfcie de interface, m-1
CS : concentrao de saturao de O2 dissolvido, moles/m3
CL: concentrao de O2 dissolvido no seio do meio em fermentao, moles/m3
qO2: demanda especfica de oxignio, moles de O2/g clulas.h
X: concentrao de clulas no meio em fermentao, g/m3
O projeto dos equipamentos que iro compor esta seo ser funo da
localizao do produto (intracelular ou extracelular), do seu tamanho molecular,
concentrao, solubilidade, polaridade, volatilidade e de outras propriedades
fsico-qumicas do meio de fermentao, como viscosidade, densidade, impurezas
e partculas indesejveis. A opo pela(s) operao(es) de separao ser
influenciada pelo tamanho do prprio bioprocesso e do valor do produto. Os
arranjos devero ser em srie a fim de se atingir o grau de pureza requerida (ex.
extratos enzimticos brutos ou enzima purificada) e a forma final exigida para um
dado produto (produto cristalizado, liofilizado, lquido concentrado, prensado). A
seqncia de operaes, atravs da qual o meio contendo a biomolcula a ser
separada deve passar para a obteno de um produto de alta pureza, constitui-se
basicamente de quatro etapas (Abraho Neto, 2001).
1. Remoo de material insolvel (particulado). Operaes comuns: filtrao,
centrifugao, decantao ou sedimentao.
2. Isolamento primrio. Durante esta etapa a concentrao de produto aumenta
consideravelmente e substncias com diferentes polaridades so separadas
do produto. Operaes tpicas: extrao por solvente, precipitao e
ultrafiltrao.
3. Purificao. Destina-se remoo de impurezas como tambm concentrao
de produto. Exemplos so: a precipitao fracionada e muitos tipos de
cromatografia lquida de alto desempenho.
4. Isolamento final do produto: Esta ltima etapa deve fornecer o produto
desejado em uma forma adequada para formulao final ou comercializao
direta. As operaes aqui incluem: centrifugao e subseqente secagem de
um produto cristalizado (liofilizado ou seco por spray drying).
Scale up
Scale down
50
Tabela 9: Escala de produo de Bioprocessos.
51
Outro aspecto que se altera necessariamente com a escala a presso
hidrosttica. Em biorreatores industriais, a presso no fundo do tanque pode
assumir vrias atmosferas, enquanto que em biorreatores de laboratrio ou
piloto, a diferena de presso entre a superfcie e o fundo do tanque mnima.
Isto afeta significativamente a solubilidade do oxignio e mesmo de gases do
metabolismo celular, como o CO2.
Outra razo para a dificuldade que se impe em relao dificuldade de
manuteno das condies ambientais com o aumento de escala, deve-se a
problemas ligados homogeneidade do sistema. Os biorreatores pequenos, em
geral, podem ser considerados bem misturados, sendo as condies operacionais
medidas com sensores, e representativas do que ocorre em todo o equipamento,
no sendo o caso de biorreatores industriais, incluindo aqueles de menor
tamanho que operam fluidos viscosos e no Newtonianos.
Os aspectos de natureza fsica das condies ambientais (transferncia de massa
e calor, caractersticas do escoamento, grau de mistura, cisalhamento etc)
dependem do tamanho do biorreator, podendo ser grande as variaes quando a
geometria da escala ampliada for diferente daquela menor, onde foi otimizado o
Bioprocesso. Por outro lado, ao se aplicar a similaridade geomtrica plena,
verifica-se que a relao entre a rea superficial (proporcional ao quadrado do
dimetro) e o volume (proporcional ao cubo do dimetro) de um biorreator
decresce acentuadamente com o aumento da escala. Isto tem implicaes diretas
na transferncia de calor para esterilizao do equipamento e meio, bem como
para o controle da temperatura de fermentao.
Um outro exemplo que impede que a similaridade geomtrica plena seja adotada
em biorreatores de mistura completa est ligado velocidade perifrica, definida
como vp=DN (onde: D=dimetro do impelidor e N=velocidade de agitao). Ao
se ampliar a escala, mantendo-se a velocidade de agitao constante, ter-se-o
diferentes valores para este parmetro, refletindo diretamente sobre a reologia
do sistema. Adicionalmente, cultivos com microrganismos filamentosos ou
suscetveis a foras cisalhantes podero ter sua morfologia alterada, resultando
em diferentes respostas metablicas ou perda de sua viabilidade.
A recomendao que se identifique a varivel-chave do processo, isto , a mais
sensvel ao escalonamento. Os critrios mais usados so parmetros fsicos
relacionados com as variveis de operao. Avaliando os critrios mais
comumente empregados na extrapolao de escala de fermentadores, Belmar
(1984) destaca como mais importantes: o coeficiente volumtrico de
transferncia de oxignio (KLa), a potncia por unidade de volume (Pg/V) e a
velocidade perifrica (ND). Desta forma, o sistema projetado, mantendo este
critrio de ampliao de escala, enquanto que os outros parmetros, menos
importantes, variaro.
53
Dentre os processos biolgicos tradicionais destacam-se: os Lodos ativados
(processo contnuo e aerado, com reciclo da microbiota floculante); a Digesto
anaerbica, que alm de reduzir a carga orgnica produz metano; a Nitrificao,
processo que possibilita a oxidao de amnia a nitrito e, posteriormente, a
nitrato, produzindo um efluente final com baixa demanda bioqumica de oxignio.
Outros tipos de processo incluem: lagoas aeradas, biodiscos, filtros percoladores,
reatores seqenciais descontnuos. Ressalta-se que muitas vezes faz-se
necessria a combinao de processos biolgicos para efetiva degradao do
material orgnico e inorgnico. A figura, a seguir, ilustra uma concepo tpica de
um processo de tratamento biolgico de efluentes.
55
Qualquer que seja a soluo adotada para o lanamento dos efluentes oriundos
do processo produtivo ou na limpeza das instalaes, fundamental que a
indstria disponha de sistema para o tratamento ou o condicionamento desses
materiais residuais.
58
Piepersberg, W. (1993) Streptomyces and Corynebacteria. In: Biotechnology Volume
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Practical Biochemistry. Edward Arnold, London, UK.
59
Os Laboratrios de Desenvolvimento de Bioprocessos
(LADEBIO) da Escola de Qumica da
Universidade Federal do Rio de Janeiro
O conjunto de nossas atividades tem gerado resultados que hoje alimentam consrcios de
pesquisa entre nossos laboratrios e Universidades e Centros de pesquisa nacionais e
internacionais, tendo sido os Laboratrios de Bioprocessos da EQ/UFRJ credenciados pelo
Programa Ibero-Americano de Cincia e Tecnologia para o Desenvolvimento (IBEROEKA-
CYTED/Espanha). Tem propiciado, tambm, interaes entre a Universidade e a Indstria,
como o caso de projetos que vem desenvolvidos em parcerias com a PETROBRAS,
ARACRUZ CELULOSE, BIONASA e OXITENO. Estas parcerias tm se constitudo em um
excelente exerccio, no s para a busca de solues para as empresas, mas tambm para a
gerao de conhecimento e formao de recursos humanos altamente capacitados para o
desenvolvimento tecnolgico em nosso pas.
Contato:
Prof. Nei Pereira Jr.
Escola de Qumica CT/UFRJ
Departamento de Engenharia Bioqumica
LADEBIO sala E 121
Cidade Universitria - Ilha do Fundo - Rio de Janeiro RJ
Cep: 21949-900
Tels: 0XX.21.2562 7644/7645/7646
Fax: 0XX.21.2562 7616
e-mail: nei@eq.ufrj.br
60
LINHAS DE PESQUISA
Biotecnologia de Materiais
Lignocelulsicos
Agregao de Clulas:
Tecnologia da Fenomenologia e
Produo de Aplicao
Antibiticos
Novas Bebidas
Fermentadas e Alimentos
Funcionais de Frutos da
Biodiversidade Amaznica
INFRA-ESTRUTURA LABORATORIAL
LADEBIO
Laboratrios de Desenvolvimento de Bioprocessos
Central
Analtica
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SINFOBIO LAPROENZ
Sistema de Informao Laboratrio de Produo
de Biomassas Enzimtica
LABENGBIO LABSBIM
Laboratrio de Engenharia Laboratrio de Sistemas
Bioqumica Biolgicos Imobilizados
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