1. Explique qualitativamente em termos de variação de entalpia ( ), entropia (
) e energia livre de Gibbs ( ) e lembrando que
: (a) a ebulição da água a uma temperatura suficientemente alta. (b) a baixa solubilidade de moléculas apolares em água. (c) a formação espontânea de micelas ou bicamadas lipídicas por moléculas anfipáticas em água. 2. Responda sucintamente as seguintes questões relacionadas à estrutura das proteínas: (a) O que são a estrura primária, secundária, terciária e quaternária de uma proteína? Todas as proteínas possuem estes quatro níveis de estrutura? Exemplifique. (b) O que é grupo prostético? (c) Quais os principais tipos de estrutura secundária? O que é estrutura super- secundária? (d) Qual é a diferença que se deve encontrar entre os resíduos externos e os internos de uma proteína globular solúvel em água? Por que? (e) Esta última regra seria também válida para uma proteína integral de uma membrana? Por que? 3.
A cadeia lateral do aminoácido lisina (Lys) possui um grupo amino ( )
em sua extremidade enquanto que a cadeia lateral do ácido glutâmico (Glu) possui uma carboxila (-COOH). Polipeptídeos formados apenas por lisina (poli- Lys) ou apenas por ácido glutâmico (poli-Glu) não apresentam estrutura secundária em pH neutro, mas a poli-Lys adota a estrutura de -hélice em pH suficientemente básico. Explique porque. Você esperaria o mesmo comportamento do poli-Glu? Por que? 4. Copie do quadro a estrutura da D-gliose na forma de projeção de Fischer. (a) Trata-se de uma aldose ou cetose? Por que? (b) O que significa a letra D ? (c) Quais são os carbonos assimétricos? (d) Qual a configaração absoluta na notação RS do carbono 2 ? (e) Desenhe a estrutura da L-glicose, do epímero da L-glicose no carbon 3 e do epímero da L-glicose no carbono 4, classificando as moléculas resultantes como D-hexoses ou L-hexoses. (f)
Desenhe as formas cíclicas -D-glicopranose e -D-glicofuranose.
5. Explique resumidamente: (a) As vantagens dos triacilglicerois sobre o glicogênio como reserva de energia de longo prazo. (b) As diferenças e semelhanças estruturais entre amilose e a celulose e a relação com suas funções. (c) O fato de que óleos vegetais são geralmente líquidos a temperatura ambiente e gorduras animais tendem a ser sólidas, apesar de ambos serem formados essencialmente por triacilglicerois. (d) Como que a margarina, sólida, é produzida a partir de óleo vegetal, líquido. 6. Explique resumidamente a diferença entre DNA e RNA a nvel de composição química, estrutura e função. 7. Para uma reação da forma
onde A e B reagem para formar C e D, temos que a variação de energia livre,
, é dada por
onde é a variação de energia livre padrão para a reação, T é a temperatura
absoluta, R é a constante dos gases e [X] significa concentração molar de X. (a) Qual o valor de quando o sistema está em equilíbrio? (b) Qual o valor de para uma reação espontânea, ou seja, que ocorre da esquerda para a direita? (c) Como é possível que reações não espontâneas termodinamicamente ocorram nos sistemas biológicos? (d) Mostre que , onde é a constante de equilbrio da reação. (e)
Se a ( ), qual será a direção da reação
(da direita para a esquerda ou vice versa) se todos os reagentes e produtos estiverem a uma concentração de 1 M a ? E se mantivermos a temperatura em e as concentraões de A e B em 1 M mas subirmos as de C e D para 10 M ? E para 100 M ? 8. Considerando uma reação bioquímica arbitrária, descreva sucintamente a relação entre direção da reação, velocidade da reação, variação de energia livre ( ), energia livre de ativação ( ), e catálise enzimática. 9. Considere a seguinte tabela contendo valores de para a hidrólise de alguns compostos fosforilados: Reação de hidrólise (kcal/mol)
fosfoenelpiruvato + H2O piruvato + Pi -14,8
ATP + H2O ADP + Pi -7,3
glicose-6-fosfato + H2O glicose + Pi -3,3
Calcule o valor de e indique a direção de cada uma das seguintes reações
quando os reagentes e produtos se encontram inicialmente em concentrações equimolares. (a)
ATP + piruvato fosfoenolpiruvato + ADP
(b)
ATP + glicose glicose-6-fosfato + ADP
10. Compare a regulação da atividade enzimática por efetores alostéricos com a regulação por modificação covalente em termos de mecanismo, facilidade de controle e velocidade de resposta a uma mudança no ambiente celular.