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Projeto de mestrado:
Integrao de modelos dinmicos espaciais para
ecologia do vetor Aedes aegypti
Sumrio
1 Introduo ...................................................................................................................................... 4
1.1 Modelos de dinmica populacional ......................................................................................... 5
1.2 Modelos de disperso da doena ............................................................................................. 6
2 Objetivo ........................................................................................................................................... 8
3 Justificativa ..................................................................................................................................... 9
4 Metodologia .................................................................................................................................. 10
4.1 Materiais ............................................................................................................................... 10
4.1.1 Softwares ....................................................................................................................... 11
4.1.2 Modelos ........................................................................................................................ 11
4.1.3 Dados ............................................................................................................................. 12
4.2 Mtodos ................................................................................................................................. 12
4.3 Atribuies de responsabilidades .......................................................................................... 13
5 Cronograma ................................................................................................................................... 13
6 Referncias Bibliogrficas: ........................................................................................................... 14
Resumo
Sistemas de Informao Geogrfica (SIG) vm sendo utilizados para armazenar, recuperar,
visualizar e analisar informaes a respeito de fenmenos que ocorrem no espao geogrfico
(Cmara et al., 1996, Bogorny et al., 2002, Muller et al., 2002, Cmara et al., 2004, Paula e Deppe,
2005). Na Sade Pblica, SIGs so utilizados principalmente como uma ferramenta
para
espacializao de dados epidemiolgicos (Muller et al., 2002). O uso dessa ferramenta permitiu que
os trabalhos fossem realizados em larga escala, para a avaliao da dinmica de populaes e para
identificar motivos que justificassem o padro espacial de uma determinada doena (Carvalho e
Santos, 2005). Nosso principal objetivo analisar de forma integrada submodelos para dengue que
englobem tanto variveis abiticas quanto biticas e determinar como a adio de complexidade aos
modelos existentes afetam o desempenho dos mesmos e do modelo integrado. Assim, este trabalho
se prope a exercitar o ambiente EpiTerra, que fruto da integrao dos frameworks TerraME e
EpiGrass,
comportamento da dengue e a posterior aplicao desse modelo cidade do Rio de Janeiro, RJ.
Introduo
A aplicao de tcnicas e mtodos computacionais em cincias como a Ecologia,
vetorial depende da interao ideal entre os vetores infectados e os hospedeiros suscetveis (Focks
et al., 2000, Riley, 2007) e do estabelecimento de uma vizinhana, na qual suas aes so
percebidas. Por isso, o movimento do vetor e do hospedeiro esto intimamente associados durao
e rea de abrangncia de uma epidemia (Riley, 2007). Condies ambientais favorveis tambm
influenciam a dinmica de disperso de doenas, sendo um fator determinante no estabelecimento
do vetor (Watts et al., 1987, Smith et al., 2004). A partir de dados sobre o comportamento passado
de um fenmeno geogrfico, modelos computacionais podem ser utilizados para a elaborao de
prognsticos a respeito do seu comportamento. O uso desses modelos na construo de diferentes
cenrios alternativos e hipotticos como, por exemplo, a chegada de um indivduo infectado na
rodoviria de uma cidade ou vacinao a priori de toda populao de hospedeiros, uma ferramenta
importante no apoio tomada de deciso dos gestores do sistema pblico de sade.
Os problemas de sade pblica no ltimo sculo diminuram muito com a evoluo da
medicina e descoberta de vacinas e frmacos, mas de tempos em tempos assistimos nos jornais que
um surto de malria, de dengue ou de febre maculosa ocorreu em alguma localidade. A vacina para
algumas doenas como a dengue, ainda no existem, por isso, estratgias de preveno e combate
deveriam ser reforadas, como acontece em poucos municpios (FUNASA, 2001, Tran e Raffy,
2006). Um remdio prprio tambm no se encontra, obrigando o enfermo esperar que a doena
acabe seu ciclo. At o incio da dcada de 80, poucos modelos para o estudo da dengue tinham sido
elaborados (Dye, 1984). Hoje, trabalhos importantes foram publicados e abordam tanto variveis
biticas como abiticas. Muitos consideram variveis como temperatura, umidade, pluviosidade
(Watts et al., 1987 , Schreiber, 2001, Ferreira & Yang, 2003), como, tambm, variveis relacionadas
ao vetor e ao hospedeiro (Massad et al., 2002, Smith et al., 2004, Coutinho et al., 2004, Favier et al,
2005). Todas as variveis citadas so importantes, entretanto, considerar todas essas variveis em
um nico modelo implicaria em um significativo aumento de complexidade do modelo sem a
garantia de ganho de desempenho. Alm de dificultar as anlises dos resultados apresentados. O
pesquisador se perderia numa infinidade de variveis e parmetros (Hestenes, 1987). Portanto,
nossa idia integrar os principais modelos descritos na literatura e realizar a anlise de
sensibilidade do modelo integrado para um melhor entendimento da relevncia de cada um dos
submodelos componentes.
1.1
diferentes estgios de vida, no qual no foram consideradas variveis climticas, Yang et al. (2003)
apontaram que a taxa de oviposio e a taxa mdia de descendentes fmeas de uma populao so
fatores determinantes para sua dinmica. Outro modelo onde foi considerada a dependncia
temporal entre os diferentes fatores determinam a dinmica populacional desse vetor. Ferreira e
Yang (2003) modelaram os estgios do ciclo de vida do mosquito influenciados por perodos
favorveis e desfavorveis, e evidenciaram que a temperatura do ambiente fator determinante da
dinmica da populao do vetor, uma vez que, esta varivel climtica controla o tempo de
desenvolvimento do mosquito. O uso de larvicida e de adulticida levaram a resultados semelhantes
para o controle populacional. Entretanto, para um melhor desempenho do controle, a primeira
estratgia deve ser utilizada no incio do perodo favorvel, quando a temperatura alta. O controle
mecnico foi aquele de melhor desempenho. Fato que ressalta a importncia dos programas de
conscientizao das comunidades para o controle da doena.
1.2
Objetivo
Nosso projeto se insere no contexto do projeto SAUDAVEL, coordenado pelo Instituto
Nacional de Pesquisas Espaciais (INPE), que tem como objetivo encontrar as respostas e produzir
os instrumentos de Tecnologia de Informao Espacial, mtodos, algoritmos e produtos de
software, para dotar os sistemas de vigilncia epidemiolgica, e de controle de endemias, de
capacidade de antecipao, a partir da possibilidade de tratar grandes bases de dados espaotemporais, com dados dos Sistema de Informao em Sade [...] (Monteiro, acessado em
12/julho/2007, Carvalho & Santos, 2005)
Nosso principal objetivo analisar de forma integrada submodelos para dengue que
englobem tanto variveis abiticas quanto biticas e determinar como a adio de complexidade aos
modelos existentes afetam o desempenho dos mesmos e do modelo integrado. Muitos modelos
conceituais sobre a dengue foram simplificados por seus autores devido dificuldade de sua
implementao computacional. Desta maneira, questes tecnolgicas limitaram o conhecimento
cientfico sobre o comportamento desta doena. O framework TerraME desenvolvido pela parceria
entre o Laboratrio para Modelagem e Simulao de Sistemas Terrestres TerraLAB / DECOM /
UFOP e o Instituto Nacional de Pesquisas Espaciais (INPE) fornece uma linguagem de modelagem
de alto nvel que facilita e torna eficiente a descrio de modelos dinmicos espacialmente
explcitos integrado a um banco de dados geogrficos . Vrias abstraes como os conceitos de
escala, trajetria, autmatos celulares aninhados, matriz de vizinhana generalizadas, agentes e
autmatos situados ainda no foram explorados para o estudo da dengue. O sistema EpiGrass,
desenvolvido pelo Programa de Computao Cientfica (PROCC) da Fiocruz fornece estruturas de
dados e algoritmos que permitem a eficiente modelagem e simulao de redes de contato entre os
indivduos de uma populao. Este fato facilita sobremaneira o estudo de diferentes formas de
transmisso da doena, onde diferentes padres de mobilidade dos indivduos podem ser
considerados.
Assim, este trabalho se prope a exercitar o ambiente EpiTerra, que fruto da integrao do
frameworks TerraME e EpiGrass, para o desenvolvimento de modelos integrados e de larga escala
que simulem o comportamento da dengue e a posterior aplicao desse modelo cidade do Rio de
Janeiro, RJ.
Justificativa
Atualmente, a mdia tem falado muito da mudana climtica e seus efeitos no aquecimento
simultaneamente e para diferentes processos. Da mesma forma, pouco se sabe sobre os impactos de
se utilizar um banco de dados geogrfico detalhado para a caracterizao do espao geogrfico nos
modelos de dengue. O desenvolvimento de modelos baseados em agentes que considerem
populaes de vetores e hospedeiros, formadas por indivduos de diferentes perfis (espcies), que
agem sobre o espao de forma diferenciada em cada localizao e cada instante de tempo ainda
insipiente e demanda novos estudos.
Metodologia
Ser utilizada a metodologia de desenvolvimento de modelo em espiral com prototipao de
4.1
Materiais
Ser necessria a utilizao de diferentes plataforma de software para a execuo deste
trabalho, entre elas SIGs e ambientes de modelagem. Alm disso, diferentes fontes de dados sero
utilizadas para a aquisio de dados ambientais sobre o municpio do Rio de Janeiro, RJ, e dados
estatsticos sobre epidemias anteriores ocorridas nesta localidade. Vrios modelos dinmicos para o
estudo da dengue sero avaliados e entre eles alguns sero selecionados e posteriormente integrados
4.1.1 Softwares
Entre os softwares que sero utilizados para o desenvolvimento deste trabalho destacam-se:
O SIG Spring: um SIG de domnio pblico, desenvolvido pelo INPE, que ser utilizado
para a implementao do banco de dados geogrfico contendo as variveis ambientais para o
municpio do Rio de Janeiro, RJ. Este SIG fornece funcionalidades para aquisio de mapas
digitais em diversos formatos e de imagens geradas por sensores remotos.
O SIG TerraView: um SIG de domnio pblico, tambm desenvolvido pelo INPE, que
fornece funcionalidades para os tratamentos de sries temporais de dados geogrficos. Ser
utilizado para importar o banco de dados construdo pelo uso do SIG Spring e a posterior
converso dos dados para o formato espao celular utilizado pela plataforma de
modelagem TerraME.
4.1.2 Modelos
Vrios modelos encontrados na literatura tanto para a simulao da dinmica populacional
dos hospedeiros e dos vetores da dengue quando modelos para a simulao da disperso da doena
sero avaliados. Sero privilegiados modelos que considerem tanto varveis biticas quanto
abiticas. Aps reviso bibliogrfica realizada, os seguintes modelos merecem destaque:
Modelos que considerem ambientes heterogneos (Smith et al., 2004, Favier et al., 2005)
literatura para avaliar a viabilidade de se adquirir tais dados para o municpio do Rio de Janeiro.
4.1.3 Dados
Ser necessria a aquisio de dados ambientais sobre a cidade do Rio de Janeiro, como por
exemplo, modelo digital de elevao (relevo), mapas de cobertura e uso do solo, mapa de
segregao social, arruamento, mapas de domiclios. Alm disso sero necessrios dados que
descrevam estatisticamente a populao de hospedeiro da cidade do Rio de Janeiro, RJ e seu padro
de mobilidade. Tambm sero necessrios dados estatsticos sobre epidemias de dengue ocorridas
nessa cidade. Entre as principais fontes de dados podemos citar:
SRTM: o modelo digital de elevao para a cidade do Rio de Janeiro ser obtida na
resoluo de 90x90 metros por meio do projeto Shuttle Radar Topographic Mission da
NASA. Tais dados so disponibilizados gratuitamente na Internet no endereo
http://www2.jpl.nasa.gov/srtm/.
Imagens de sensores remotos: imagens dos satlites CBERS-II e LandSat TM para a cidade
do Rio de Janeiro, RJ, foram disponibilizadas gratuitamente pelo INPE.
4.2
Mtodos
A seguintes passos sero utilizados para a realizao deste trabalho:
Passo 4: Integrao dos dados geogrficos com os dados estatsticos sobre epidemias
passadas.
Passo 8: Determinao das diferentes condies de contorno que sero utilizadas nas
anlises de sensibilidade do modelo integrado.
Passo 10: Aplicao do modelo integrado para estudo de epidemias de dengue e seu controle
para a cidade do Rio de Janeiro, RJ.
Passo 11: Documentao dos resultados obtidos. Este passo inclui a produo de artigos,
relatrios tcnicos e da dissertao de mestrado.
4.3
Atribuies de responsabilidades
Bolsista
Caber ao bolsista a realizao de todos os passos enumerado na seo 4.2.
Orientador
Caber ao orientador o treinamento do bolsista no uso das plataformas de software
necessrias execuo deste trabalho e guiar o bolsista na realizao de suas atribuies
Colaboradores
Fornecer dados necessrios realizao deste trabalho e orientar o bolsistas em questes
relativas ao estudo da dengue.
Cronograma
As tabelas abaixo apresentam o cronograma do trabalho para o perodo de 24 meses. No
primeiro ano, sero realizados trs ciclos completos de desenvolvimento, o primeiro durar seis
meses, os prximos trs meses cada. No segundo ano, sero realizados dois ciclos de
desenvolvimento, com durao de seis meses cada.
Primeiro ano:
Atividades 1 2
3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
Passo1
Passo 2
Passo 3
Passo 4
Passo 5
Passo 6
Passo 7
Passo 8
Passo 9
Passo 10
Passo 11
Segundo ano:
Atividades 1 2
3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
Passo1
Passo 2
Passo 3
Passo 4
Passo 5
Passo 6
Passo 7
Passo 8
Passo 9
Passo 10
Passo 11
Referncias Bibliogrficas:
1-Aguiar, A.P.D., Cmara, G. and Souza, R. C. M. Modeling Spatial Relations by
2-Aguiar, A.P.D., Kok, K., Escada, M.I.S., Cmara, G., Exploration of patterns of land-use
change in the Brazilian Amazon using the CLUE framework. The 6th Open Meeting of the
Human Dimensions of Global Environmental Change Research Community. 9-13 October 2005,
para
Sade
Pblica
usando
software
livre,
http://www.inf.ufrgs.br/~vbogorny/WSL2002.pdf, 2002.
5-Cmara, G. , Davis, C.
net-works,
http://precedings.nature.com/documents/378/version/1/files/npre2007378-
1.pdf, 2007.
9-Coutinho, F.A.B., Burattini, M.N., Lopez, L.F. e Massad, E., Threshold conditions for
non-autonomous epidemic systems: Application to modelling Dengue overwintering, Escola de
Medicina da Universidade de So Paulo, 23 de novembro de 2004.
13-Dye, C., Models for the Population Dynamic of the Yellow Fever Mosquito, Aedes aegypti,
The Journal of Animal Ecology, vol 53, n 1, pg 247-268, fevereiro de 1984.
vector-borne diseases: a regional analysis, Bulletin of the World Health Organization, 2000, 78
(9)
20-Herrera-Basto, E, Prevots, D R, Zarate, M L, Silva, J L e Sepulveda-Amor, J, First
reported outbreak of classical dengue fever at 1.700 meters above sea level in Guerrero State,
Mxico, June 1988, Am. J. Trop. Med. Hyg., 46(6), 1992, pp. 649-653.
26-Paula, E V,
35-Watts, D. M.,
temperature on the vector efficiency of Aedes aegypti for dengue 2 virus, Am. J. Trap. Med.
Hyg., 36(l), 1987, pp. 143-152