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ELETROFORESE
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robertoroca@fca.unesp.br
ELETROFORESE
1- INTRODUO
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glutmico (Glu) e cido asprtico (Asp) exercem carga negativa. Sendo substncias
anflitas, as protenas adquirem carga positiva ou negativa em funo do pH. ,
portanto, conveniente manter o pH do meio estvel durante a eletroforese, mediante
o uso de solues-tampo. O sistema-tampo consiste de duas partes: o tampo do
gel, usado no preparo do gel, e o tampo dos eletrodos (catodo/anodo), usado nos
respectivos tanques.
Em virtude do contato eltrico dos plos com as solues-tampo dos
tanques haver participao dos componentes dos respectivos tanques na
neutralizao da base formada no catodo e do cido formado no anoda. As
solues-tampo estabilizam o pH do meio e permitem o fluxo da corrente eltrica,
mas geralmente elas so inertes no processo eletrofortico.
O tampo deve, portanto , Ter acentuada condutividade eltrica.
costume serem aplicados, para este propsito, eletrlitos de 0,05 e 0,5 M.
Em geral, solues-tampo mais concentradas fornecem melhor resoluo, embora
o tempo de separao seja maior.
Quando uma molcula com carga lquida Q colocada em um campo
eltrico S, sofre efeito de uma fora de campo F que depende do campo eltrico
e da carga da molcula.
F=S*Q
O campo eltrico S a relao entre voltagem (V) e a distncia entre os
eletrodos (d).
F = V/d*Q
A velocidade de migrao de uma molcula carregada pode ser alterada,
portanto, mudando a distncia entre os eletrodos bem como alterando a voltagem do
sistema.
Na ausncia de uma fora de resist6encia, a molcula acelera at encontrar o
eletrodo. Entretanto, isso no ocorre devido resistncia resultante da frico com o
suporte. A fora de frico F uma funo do tamanho e da forma da molcula,
viscosidade da soluo e velocidade de migrao como mostra a equao de
STOKES.
RNv
F = 6
F = Fora de frico
R = Raio da molcula
N = Viscosidade do meio
2
v = Velocidade de migrao
Quando a fora de resistncia excede a fora de propulso da molcula, no
ocorre a migrao. Quando a fora de propulso excede a fora de resistncia,
ocorre a migrao da molcula carregada. Os fatores que afetam a velocidade de
migrao de uma molcula carregada podem ser obtidos quando a fora de
propulso e a fora de resistncia so iguais:
RNv
F = V/d*Q e F = 6
Igualando as foras:
RNv
V/d*Q = 6
Isolando a velocidade:
RNv
V = V*Q/6
A velocidade de migrao de uma molcula carregada em um campo eltrico,
diretamente proporcional a carga da molcula e a viscosidade da soluo. Quando
o suporte utilizado for um gel de poliacrilamida, o efeito do tamanho dos poros
devem ser considerados.
Como cada molcula devem possuir carga e tamanho especficos, devem
migrar para uma nica posio em um campo eltrico, em um dado intervalo de
tempo. Em uma mistura de ions (protenas por exemplo), cada um deve posicionar
em um lugar nico dentro do campo eltrico.
Submetendo-se extratos proticos ao efeito da corrente eltrica, os seus
componentes ionizados migraro com velocidades individuais.
Com vistas a uma definida enzima, em virtude de sua posio no gel depois
da corrida, essa enzima pode ser revelada, permitindo, em consequncia,
identificaes qualitativas (por sua posio) e quantitativas (pela intensidade de sua
banda).
A eletroforese pode ser conduzida ora sob voltagem, ora sob amperagem
(corrente) ou, ento, wattagem (potncia) constantes reguladas pela fonte eltrica.
medida que as molculas migram no campo eltrico, a resistncia geralmente
aumenta. Ento, a amperagem diminui sob voltagem constante, ou esta aumenta
sob amperagem constante. As variaes na intensidade da corrente ou na voltagem
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podem ser detectadas na fonte de energia, anotando-se os respectivos valores no
incio e no final da corrida eletrofortica.
A escolha da voltagem, amperagem ou wattagem feita empiricamente.
A temperatura elevada tende a desnaturar molculas como as protenas, o
que acarreta, no raro, alguma perda de atividade enzimtica. Quanto mais alta a
voltagem ou a intensidade da corrente, maior ser tambm o calor emanado.
Visando manter a temperatura baixa durante a eletroforese, o gel resfriado com o
auxlio de uma coluna de gua fria em dispositivo apropriado inserido na cuba ou
efetuando-se a corrida em geladeira.
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dos componentes da soluo-tampo e de seu valor de pH. Aps a secagem, esses
gis tornam-se comparavelmente translcidos aos gis de poliacrilamida.
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Gis naturais so de natureza qumica bem variada: protenas como gelatina
e casena, e polissacardeos como amido, gar e pectina. A gua se difunde em gis
pela populao de macromolculas, rendendo porosidade uniforme do gel, o que
garante sua morfologia. Gis apresentam o fenmeno da desidratao, a qual
geralmente lenta. Trata-se de uma forma de intemperismo, a sinerese. O gel,
entretanto, mantm sua morfologia, apesar de se encolher. Por esse motivo, gis
apropriados para eletroforese no se conservam bem por muitos dias.
A porosidade do gel de amido varia conforme sua origem e seu preparo. O
amido em seu estado nativo, constitudo de -amilose e amilopectina. A -amilose
formada por longas cadeias (em torno de 300 unidades) no ramificadas de D-
glucose, cujas unidades so interligadas por ligaes - 1, 4. Em gua, a amilose
forma micelas hidratadas, cujas cadeias polissacardicas assumen a forma
helicoidal. J a amilopectina, embora apresente esqueleto similar ao da amilose,
altamente ramificada, cujos pontos de ramificao so ligaes - 1, 6. Em gua, a
amilopectina forma solues coloidais ou micelares.
Sob aquecimento, a suspenso aquosa de amido torna-se viscosa.
Sua viscosidade aumenta acentuadamente a 65C, ponto em que os grnulos
de amido se desfazem; a partir daqui, medida que a temperatura aumenta, a
viscosidade diminui abruptamente e atinge um valor mnimo e uniforme a 95C.
Neste ponto, a suspenso deve ser desgaseificada e vertida para as molduras
prprias. Aps resfriamento, a suspenso geleifica-se, formando uma rede
tridimensional de polmeros de glucose com ligaes glicosdicas - 1, 6, originrias
da amilopectina. Quando frio, o gel est preparado para receber o extrato protico e
ser submetido eletroforese. A concentrao de gel define a sua consist6encia e
porosidade. Seu preparo relativamente emprico, o que requer habilidade do
pesquisador. Na eletroforese em gel de amido, as molculas, ao migrarem entre as
malhas do gel, esto sujeitas ao efeito de frico e peneiramento molecular,
proporcionando o fracionamento das amostras.
Conforme mencionado anteriormente, a eletroforese em gel de amido
menos onerosa do que a em gel de poliacrilamida, mas suas lminas no
apresentam porosidade controlada, no permitem preparo de gradientes de pH e
sua resoluo inferior. Por ser um polmero natural, a composio do amido pode
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variar de lote para lote, o que pode afetar suas propriedades de geleificao e
resoluo, tornando-se necessrio, muitas vezes, recalibrar o sistema ao utilizar
diferentes lotes de produtos. Em pH alcalino, o gel de amido exibe ligeiro efeito
eletroendosmtico em direo oposta a da migrao das protenas.
Amido hidrolizado de alta qualidade, prprio para eletroforese,
imprescindvel e encontra-se, atualmente, disponvel no mercado.
Todavia se necessrio, a hidrlise do amido pode ser conduzida no
laboratrio. Para isso, 300g de amido solvel so suspensos em 600mL de soluo
de acetona: HCl concentrado (100:1) a 38,5C.
Cuidados especiais devem ser tomados para impedir a volatilizao da
soluo em hidrlise. Aps 45 minutos de repouso nesta temperatura, interrompe-se
a hidrlise pela adio de 150 mL de soluo aquosa de acetato de sdio 1M. A
seguir. A suspenso filtrada em funil de Buchner e lavada, cuidadosamente, com
gua destilada. Para remover possveis traos remanescentes de acetato,
resuspende-se o amido em gua destilada e, aps 12 horas de repouso, filtra-se a
suspenso em funil de Buchner, lava-se novamente com gua destilada e, por
ultimo, com acetona. A seguir, seca-se o amido a 45-50C. Durante a hidrlise, a
temperatura deve ser rigorosamente controlada.
Preparo Do Gel
1- Suspenda 39g de amido em 150mL de soluo-tampo do gel (gel 13-14%),
temperatura ambiente, em frasco Kitazato, sob agitao constante. A soluo-
tampo do gel varia de acordo com a espcie estudada. Existem vrias
composies que podem ser encontradas em livros de bioqumica ou biologia.
2- Adicione suspenso 150 mL da mesma soluo, procurando lavar as paredes
do frasco.
3- Cozinhe a suspenso em forno de microondas, agitando-a fortemente a cada 40
segundos no incio e a cada 10 segundos aps o aquecimento, antes de atingir a
fervura, para que o cozimento seja homogneo. Aps o cozimento, a suspenso
torna-se viscosa e transparente.
4- Mantenha a suspenso no forno de microondas at a fervura.
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5- Tampe o frasco com uma rolha de borracha e adapte sua sada lateral a uma
bomba de vcuo, para eliminao das pequenas bolhas de ar formadas durante
o cozimento.
6- Verta cuidadosamente a suspenso de amido nas molduras de acrlico. A fim de
uniformizar a superfcie do gel e evitar o excesso de evaporao, cubra o gel
com uma placa de vidro. Assim que o gel atingir a temperatura ambiente,
mantenha-o em geladeira pelo menos por 30 a 60 minutos antes de aplicar as
amostras e proceder eletroforese.
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10- Anote todos os dados da condio da corrida (V, A, W) aferidos no aparelho.
Isso importante para monitorar a anlise e diagnosticar possveis problemas
durante a eletroforese.
11- Faa uma pr-corrida eletrofortica durante 15 minutos, a fim de que o material
em estudo seja liberado das tiras de papel contendo o extrato para o gel.
12- Desligue o aparelho, desconecte o gel das cubas e remova as tiras do papel filtro
com o auxlio de uma pina cirrgica. Mediante o uso de cotonete, limpe a face
cortada do gel onde foram aplicados os extratos.
13- Apoie o suporte do gel sobre as cubas e cubra-o com um plstico, deixando livre
cerca de 2 cm em cada extremidade. Esse procedimento evita a evaporao de
gua durante a eletroforese.
14- Conecte o gel s cubas e religue o aparelho, tendo o cuidado de anotar os dados
de voltagem, potncia e corrente.
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Gel de F6orma do gel fora de nvel. Preparar um novo gel nivelando
espessura Vazamento dos lados da frma. adequadamente a frma do gel e
irregular prender firmemente os grampos.
No deteco Solues corantes misturadas Uso de corantes e solues
de bandas impropriamente. Deteriorao apropriadas e na quantidade
dos produtos qumicos ou das adequada.
solues-tampo.
Arraste de Baixa fora inica do tampo Verificar a presena de bolhas de ar
bandas a partir da amostra ou quantidade no gel. Rever as solues tampo.
da origem insuficiente do mesmo.
Presena de bolhas de ar no
gel. Presena de amilose no
extrato cru.
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Figura 1 Preparo do gel de amido. FIGURA 2 Cont. E: gel sobre as
Eletroforese e colorao. A: desgaseificao
da suspenso de amido, B: adio da cubas, F e G: laminao do gel
suspenso de amido na forma de gel, C:
corte do gel, D: aplicao da amostra. aps eletroferese, H: colorao.
Os mtodos empregados para secagem dos gis variam dos mais simples,
rpidos e baratos aos mais complexos, demorados e dispendiosos. O mtodo usado
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deve preservar a tonalidade de colorao das bandas e manter, ao mximo, a
integridade do gel, evitando rachaduras e encolhimento, que mascaram ao padres
eletroforticos. H disponveis no mercado e eficientes e sofisticados secadores de
gis que funcionam a vcuo e sob temperaturas relativamente elevadas.
Figura 4
Representao
diagramtica do aparato
utilizado para secagem
do gel de amido e
poliacrilamida
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2.1.6- DOCUMENTAO DE RESULTADOS EM GEL
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nuclicos ou transiluminador de luz branca para gis de protenas ou enzimas
coradas.
Em virtude de seu alto custo atualmente, este sistema ainda inacessvel
maioria dos laboratrios, mas suas considerveis vantagens em relao aos
mtodos convencionais de documentao de resultados em gis justificam o seu
uso.
3.1- Fundamentos
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polimerizao. A fotodecomposio da riboflavina libera radicais livres que
promovem a polimerizao.
A polimerizao ocorre pela formao de radicais livres de acrilamida obtidos
qumica ou fotoquimicamente. A polimerizao para render gis, requer ligaes
entre as cadeias de poliacrilamida geradas por molculas de Bis. Na falta de Bis, por
copolimerizao, causa reticulao entre as cadeias de poliacrilamida.
O dimetro dos poros do gel funo das concentraes de acrilamida e Bis
(T%). Para separao de molculas maiores, usam-se gis com menor teor de
acrilamida.
Para protenas desnaturadas, empregam-se, comumente, gis com gradiente
de concentrao. Analogamente a gis comuns, a concentrao do gradiente
escolhida de acordo com o peso molecular das protenas em estudo. Na prtica,
confeccionam-se gis em gradiente, na faixa de 7% a 16% de acrilamida. Na
eletroforese de protenas desnaturadas, o SDS (dodecilsulfato de sdio) e o
mercaptoetanol aniquilam o efeito de cargas das molculas proticas nativas. Neste
caso, as separaes se do segundo o peso molecular, e a migrao
consequncia to-somente das cargas negativas do SDS, causando efeito de
peneiramento molecular. Quanto maior a molcula, menor a mobilidade.
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Tabela 1 Faixa de concentrao de acrilamida (T%) em relao ao peso molecular
das protenas a serem separadas por eletroforese em gel de poliacrilamida.
Concentrao de acrilamida (T%) Faixa tima de peso molecular (kDa)
3-5 >100
5-12 20-150
10-15 10-80
>15 <15
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3.3- PROCEDIMENTO EXPERIMENTAL
Material
1- Estojo para preparo das placas do gel
2- Aparelho para controle eltrico (fonte de energia)
3- Vitrine vertical metalfrio ou geladeira comum
4- Pipetas automticas com respectivas ponteiras, bqueres e provetas.
Componentes Acrlicos
Acrilamida/Bis (30% T; 2.6% C):
a) 73 g de acrilamida;
b) 2 g de Bis;
c) 250 mL de gua deionizada.
Filtre a soluo e armazene em geladeira (a 10C), no escuro.
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c) Complete o volume para 100 mL, filtre a soluo e armazene-a temperatura
ambiente.
Soluo-Estoque de SDS
a) 10 g de SDS.
b) Complete o volume para 100 mL com gua deionizada.
Tampo da amostra
a) Para Protenas nativas
a) 5 mL de glicerol.
b) 2.5 mL de Tris-HCl 0.6173 M, pH 6.8
c) 2.5 mL de azul-de-bromofenol.
d) Complete o volume para 25 mL e armazene a soluo, em alquotas, em
congelador a 20C.
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Persulfato de Amnia
a) 0.05 g de persulfato de amnia.
b) 0.5 mL de gua desmineralizada.
Sistema PAGE
O termo PAGE representa eletroforese em gel de poliacrilamida.
usado para anlise do padro de enzimas e outras protenas nativas. A
concentrao de acrilamida do gel separador depende do peso molecular dos
componentes que se deseja analisar.
Rotineiramente, usam-se gis na faixa de 7.5 a 10%. Para variar a
concentrao de acrilamida no gel, para um mesmo volume de soluo, basta alterar
o volume da soluo estoque de acrilamida-Bis em relao ao da gua, as
quantidades dos demais componentes do gel permanecem inalteradas.
To logo sejam preparadas as solues de persulfato e TEMED, deve-se
aplicar a soluo nas molduras do gel. A geleificao se processa dentre de poucos
minutos.
Com o auxlio de uma seringa, aplique a soluo do gel separador no espao
entre as placas de vidro at a altura de 1.5 cm abaixo da extremidade inferior do
pente. Imediatamente aps, complete com gua destilada o espao entre as duas
placas para uniformizao da parte superior do gel e para sua proteo contra
oxignio, que inibe a polimerizao. Aps a polimerizao em temperatura ambiente,
remova a gua sobrenadante por decantao e uso de papel-filtro e introduza a
soluo do gel empilhador. A seguir, insira um pente de teflon nessa soluo. Em
seguida polimerizao, remova o pente e enxge as cavidades resultantes com
soluo-tampo do tanque, diluda razo de 1:10. Remova tambm o excesso de
tampo com o auxlio de papel adsorvente (papel higinico ou papel-filtro).
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Sistema SDS-PAGE
Este sistema aplicado no estudo de protenas desnaturadas por
aquecimento na presena de SDS e -mercaptoetanol ou ditiotreitol (DTT). Ele visa
determinao do peso molecular de protenas. O mtodo empregado similar a ao
anterior, PAGE, exceto que SDS adicionado s solues do gel, e aos tanques dos
eletrodos. A cada 30 mL de soluo do gel separador e 15 mL do empilhador, usam-
se respectivamente, 200 e 100 mL de SDS a 10%.
Aos tanques adicionam-se 10 mL da mesma soluo para cada 1.000 mL de
soluo-tampo diluda a 1:10. Amostras fervidas contendo SDS e -mercaptoetanol
ou DTT so aplicadas no gel.
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superior e inferior 500 e 1.000 mL dessa mesma soluo. Calibre o aparelho para
100 V.
Quando a linha frontal do azul-de-bromofenol atingir o gel separador, regule o
aparelho para 200 V.
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3.7- REVELAO, FOTOARQUIVAMENTO E SECAGEM DE GIS
CONN, E. E. & STUMPPF, P.K. Introduo Bioqumica. 4 Edio So Paulo, Edgard Blucher,
1980, 525p.
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