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Universidade Federal de Pelotas

Instituto de Química e Geociências


Departamento de Bioquímica
04

BÁSICA EM IMAGENS
- um guia para a sala de aula

Aminoácidos, peptídeos e
proteínas

© Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4


1. Introdução

• Generalidades
• AAs x Proteínas

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Hierarquia estrutural na organização molecular das células

Nível 4: Nível 3: Nível 2: Nível 1:


Célula e Complexos Macromoléculas Unidades
organelas Supramoleculares Monoméricas

Cromossomos Nucleotídeos
DNA

Membrana
Plasmática Aminoácidos

Proteínas

’Lipídios

Celulose

Glicídios
Parede Celular
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2. Aminoácidos

• Conceito
Grupo
Grupo carboxila
amino

• Fórmula geral
Cadeia

lateral

Atividade
Atividade química
química dos
dos AA
AA

•• Livres:
Livres: NH
NH22 ee COOH
COOH

•• Proteínas:
Proteínas: grupos
grupos reativos
reativos da
da cadeia
cadeia lateral
lateral

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aminoácidos

• ID, exemplos e nomenclatura

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Glicina (Gly – G ) Alanina (Ala – A ) Ácido aspártico (Asp –D )

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Lisina (Lys – K) Metionina (Met – M) Tirosina (Tyr – Y)

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©
Cisteína (Cys – C) Serina (Ser – S) Prolina* (Pro – P)

* R forma um anel com o NH2,


deixando livre apenas um NH
aminoácidos

• Características
metionina
• Sólidos
• Cristalizáveis
• Incolores
• Hidrossolúveis
• ↑ PF (↑ 200° C)
tirosina

prolina
• Funções
• Monômeros das proteínas e peptídeos
• Precursores hormonais (tiroxina, serotonina, auxinas)
• Intermediários do metabolismo
• Precursores de nucleotídeos e porfirinas

protoporfirina IX
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aminoácidos
2.1. Isomeria

• Atividade ótica

• Séries D e L
L-gliceraldeído D-gliceraldeído

L-alanina D-alanina

Série LL →
Série → organismos
organismos superiores
superiores

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aminoácidos
2.2. Classificação

b) Quanto às propriedades do grupo R


a) Quanto à ocorrência
• Apolares alifáticos
• Protéicos, primários, padrão aromáticos
• Derivados dos protéicos (raros)
• Polares neutros (sem carga)
• Não protéicos carga + (básicos)
carga – (ácidos)

d) Quanto à síntese
c) Quanto à carga elétrica
• Essenciais: necessidade de ingestão;
• Neutros: 1 COOH e 1 NH2 varia de sp. para sp;
• Ácidos: 2 COOH e 1 NH2 humanos - 8 essenciais
• Básicos: 1 COOH e 2 NH2
• Não- essenciais: produzidos pelo org.

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aminoácidos
a) quanto à ocorrência - AAs protéicos
Aminoácido Abreviatura de três letras Abreviatura de uma letra

Alanina Ala A
Arginina Arg R
Asparagina Asn N
Ácido aspártico Asp D
Ácido glutâmico Glu E
Cisteína Cys C
Glicina Gly G
Glutamina Gln Q
Histidina His H
Isoleucina Ile I
Leucina Leu L
Lisina Lys K
Metionina Met M
Fenilalanina Phe F
Prolina Pro P
Serina Ser S
Tirosina Tyr Y
Treonina Thr T
Triptofano Trp W
Valina Val V

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aminoácidos
a) quanto à ocorrência - AAs protéicos

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aminoácidos
a) quanto à ocorrência - AAs protéicos

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aminoácidos

a) quanto à ocorrência – derivados dos protéicos (raros)

cisteína
cisteína cisteína

AAs derivados dos protéicos (raros)

oxidação redução

cistina

ponte
S-S cisteína cistina

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aminoácidos

a) quanto à ocorrência – derivados dos protéicos (raros)

’Protrombina

’Parede celular γ - Carboxiglutamato


4- Hidroxiprolina ’Colágeno

5-Hidroxilisina ’Colágeno

’Elastina

6-N-Metilisina Desmosina

’Miosina ’Glutationa PO
’outras proteínas
Selenocisteína

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aminoácidos

a) quanto à ocorrência – não protéicos

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Nome Fórmula Fonte bioquímica / função
β- Alanina ácido pantotênico (vitamina) e em petídios
naturais importantes
D- Alanina Polipeptídios em paredes celulares de
algumas bactérias

γ- ácido Cérebro e outros tecs. anim.; neurotransmissor

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aminobutírico
D- ácido Polipeptídios em paredes celul. de algs. bactérias
glutâmico

L- Homoserina Vários tecidos; intermediário no

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metabolismo de AA

L- ornitina Vários tecidos; intermediário na síntese


de arginina

©
Sarcosina Vários tecidos; intermediário na síntese de AA

L- Tiroxina Glândula tireóide ; é hormônio


tireoidiano
(I = iodo)
a) quanto à ocorrência – não protéicos

Citrulina

Ornitina

’Metabolismo de AA (ciclo da uréia)

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aminoácidos
2.2. Classificação

b) Quanto às propriedades do grupo R


a) Quanto à ocorrência
• Apolares alifáticos
• Protéicos, primários, padrão aromáticos
• Derivados dos protéicos (raros)
• Polares neutros (sem carga)
• Não protéicos carga + (básicos)
carga – (ácidos)

d) Quanto à síntese
c) Quanto à carga elétrica
• Essenciais: necessidade de ingestão;
• Neutros: 1 COOH e 1 NH2 varia de sp. para sp;
• Ácidos: 2 COOH e 1 NH2 humanos - 8 essenciais
• Básicos: 1 COOH e 2 NH2
• Não- essenciais: produzidos pelo org.

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aminoácidos
b) Quanto às propriedades do grupo R - Apolares

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Apolares
Apolaresalifáticos
alifáticos

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©
Apolaresaromáticos
Apolares aromáticos
aminoácidos

b) Quanto às propriedades do grupo R - Polares

Polares sem carga (neutros)

Polares com carga (ácidos) Polares com carga (básicos)

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aminoácidos

• Classificação - Lehninger

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Apolares alifáticos
Carregados positivamente

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Polares sem carga

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Aromáticos
Carregados negativamente

©
aminoácidos
2.2. Classificação

b) Quanto às propriedades do grupo R


a) Quanto à ocorrência
• Apolares alifáticos
• Protéicos, primários, padrão aromáticos
• Derivados dos protéicos (raros)
• Polares neutros (sem carga)
• Não protéicos carga + (básicos)
carga – (ácidos)

d) Quanto à síntese
c) Quanto à carga elétrica
• Essenciais: necessidade de ingestão;
• Neutros: 1 COOH e 1 NH2 varia de sp. para sp;
• Ácidos: 2 COOH e 1 NH2 humanos - 8 essenciais
• Básicos: 1 COOH e 2 NH2
• Não- essenciais: produzidos pelo org.

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aminoácidos
d) Quanto à síntese - Essenciais e não-essenciais



www.ajinomoto.com.br





• Essenciais
Essenciais (humanos)
(humanos)

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aminoácidos
d) Quanto à síntese - Essenciais e não-essenciais

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aminoácidos
2.3. Comportamento em meio aquoso
Meio
Meio aquoso
aquoso AAs
AAs ionizados
ionizados agem
agem como
como ácidos
ácidos ou
ou bases
bases

Comportamento
Anfótero

Forma não iônica


íon dipolar ou anfótero Moléculas
zwitterion
ionizadas

H
H++ H
H++
forma forma
protonada desprotonada

meio
meio ácido
ácido meio
meio alcalino
alcalino
1 pH 14

A
A carga
carga elétrica
elétrica dos
dos AAs
AAs varia
varia em
em função
função do
do pH
pH do
do meio
meio

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aminoácidos
• Comportamento em meio aquoso
meio
meio ácido
ácido meio
meio alcalino
alcalino
1 pH 14

forma
protonada forma
desprotonada

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aminoácidos
2.4. Curvas de titulação
• Introdução
ácidos
ácidos
AAs
AAs em
em solução
solução aquosa
aquosa ionizados
ionizados

bases
bases

este
este comportamento
comportamento depende
depende exclusivamente
exclusivamente do
do pH
pH do
do
meio
meio em
em que
que oo AA
AA se
se encontra
encontra

curvas
curvas de
de titulação
titulação

representação
representação gráfica
gráfica do
do evidenciam
evidenciam aa atuação
atuação
comportamento
comportamento anfótero
anfótero dos
dos AAs
AAs como
como tampões
tampões
dos
dos AAs
AAs

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aminoácidos
• Curvas de titulação – conceitos importantes

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n Titulação (neutralização): é a adição ou remoção gradual de prótons (H+)
com base: parte-se de pH ácido até chegar a básico
com ácido: parte-se de pH básico até chegar a ácido

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Bureta
base

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Frasco

©
cônico ácido e
indicador
aminoácidos
• Curvas de titulação – conceitos importantes

o Ácidos
Ácidos ee bases
bases (Brönsted)
(Brönsted) ácido:
ácido: substância
substância próton-doadora
próton-doadora
base:
base: substância
substância próton-receptora
próton-receptora

Ácido
Ácido forte:
forte: dissociação
dissociação irreversível
irreversível HA → AA-- +
HA +HH++
Ácido
Ácido fraco:
fraco: dissociação
dissociação reversível
reversível HA
HA AA-- +
+HH++

Base
Base forte:
forte: dissociação
dissociação irreversível
irreversível BOH → BB++ +
BOH + OH
OH--
Base
Base fraco:
fraco: dissociação
dissociação reversível
reversível BOH
BOH BB++ +
+ OH
OH--

CH3COOH CH3COO- + H+
(Ácido Acético) (Acetato)

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aminoácidos
• Curvas de titulação – conceitos importantes

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p Tampão:
Tampão: toda
toda substância
substância que
que mantém
mantém inalterado
inalterado seu
seu pH
pH apesar
apesar da
da adição
adição
moderada
moderada de
de ácidos
ácidos ou
ou bases.
bases.

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q Sistema
Sistema Tampão:
Tampão: um
um bom
bom tampão
tampão éé constituído
constituído de
de um
um ácido
ácido fraco
fraco ee sua
sua base
base
conjugada
conjugada ou
ou sal
sal interno.
interno.

Copyright 2008
H+ OH-

©
HA
HA A
A-- +
+HH++ HA
HA A
A-- +
+HH++ HA
HA A
A-- +
+HH++

CH3COOH CH3COO- + H+
(Ácido Acético) (Acetato)
aminoácidos

• Sistema Tampão

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H+ OH-

HA
HA A
A-- +
+HH++ HA
HA A
A-- +
+HH++ HA
HA A
A-- +
+HH++

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A HA

©
HA A

Solução tampão: mistura


de ácido fraco com base
conjugada
aminoácidos
• Curvas de titulação – conceitos importantes

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r pH
pH (potencial
(potencial hidrogeniônico)
hidrogeniônico) :: -log[H
-log[H++]] de
de uma
uma solução
solução

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©
aminoácidos
• Curvas de titulação – conceitos importantes
s pK:
pK: -- Constante
Constante de
de equilíbrio
equilíbrio de
de ionização
ionização ou
ou dissociação
dissociação
-- ÉÉ uma
uma medida
medida da
da tendência
tendência dos
dos grupos
grupos COOH
COOH emem ceder H++ (prótons)
ceder H (prótons)
NH +
NH33+
-- Corresponde
Corresponde ao
ao pH
pH em
em que
que 50% 50% das
das moléculas
moléculas encontram-se
encontram-se dissociadas
dissociadas
50%
50% encontram-se
encontram-se não-dissociadas
não-dissociadas

pK
pK11:: COOH → 50%
COOH → 50% COO
COO-- (dissociado)
(dissociado) pK
pK22:: NH → 50%
NH33++ → 50% NH
NH33++ (não-dissociado)
(não-dissociado)
50%
50% COOH
COOH (não-dissociado)
(não-dissociado) 50%
50% NH
NH22 (dissociado)
(dissociado)

** AAs
AAs neutros
neutros (1
(1 COOH
COOH ee 11 NH
NH22))

B
meio
meio ácido
ácido meio
meio alcalino
alcalino

C
A
1 pH 14

t pI:
pI: corresponde
corresponde ao
ao pH
pH em
em que
que 100%
100% das
das moléculas
moléculas encontram-se
encontram-se com
com carga
carga neutra
neutra
COO---CHR-NH3
COO -CHR-NH3++ isoelétricas/isoiônicas.
isoelétricas/isoiônicas.
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aminoácidos
• Curvas de titulação – conceitos importantes

CH3COOH CH3COO- + H+
HA
HA A
A-- +
+HH++
(Ácido Acético) (Acetato)

[A-] . [H+] [CH3COO-] . [H+]


K= K=
[HA] [CH3COOH]

KK →
→ constante
constante de
de dissociação
dissociação ácida
ácida

Quanto
Quanto maior
maior K,
K, mais
mais forte
forte será
será oo ácido
ácido
Quanto
Quanto menor
menor oo K,
K, mais
mais fraco
fraco será
será oo ácido
ácido

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aminoácidos
• pKs dos AAs protéicos

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Valores
Valores de
de pKa
pKa dos
dos aminoácidos
aminoácidos

Aminoácido Cadeia lateral

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aminoácidos
• Curvas de titulação – conceitos importantes

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u Equação
Equação de
de Henderson
Henderson -- Hasselbach:
Hasselbach: relaciona
relaciona pH
pH ee pK
pK

HA
HA A
A-- +
+HH++ K . [HA]
[H+]=
[A-]

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[A-] . [H+]
K=
[HA] 1 1 [A-]
= .
[H+] K [HA]

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1 1 [A-]
log = log + log

©
[H+] K [HA] substituindo por
seus símbolos

[A-]
pH = pK + log Henderson- Hasselbach
[HA]
equivalentes de OH-
• Curva de titulação do ácido acético

Região de tamponamento

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aminoácidos

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aminoácidos
• Exemplo – Curva de titulação da Glicina

A C
B

pK
pK11=
= 2,34
2,34
Ponto
pK
pK22=
= 9,60
9,60 isoelétrico

Equivalentes de OH adicionados

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aminoácidos
• Exemplo – Curva de titulação da Glicina

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1 3 5
Fração da glicina

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2 4

Copyright 2008
Ao
Ao titularmos
titularmos um
um aminoácido
aminoácido monoamino
monoamino ee monocarboxílico,
monocarboxílico, temos
temos oo
seguinte
seguinte comportamento:
comportamento:

©
Ponto
Ponto 1:
1: NH3
NH3++ -- CH
CH -- R- COOH →
R- COOH → AA
AA totalmente
totalmente protonado
protonado
Ponto
Ponto 2: [NH3++ -- CH
2: [NH3 CH –– RR -- COOH]
COOH] =
= [NH3
[NH3++ -- CH COO--]] →
CH –– RR -- COO → pK
pK11
Ponto
Ponto 3:
3: NH3
NH3++ -- CH COO-- →
CH –– RR -- COO → Ponto
Ponto Isoelétrico
Isoelétrico -- pI
pI
Ponto
Ponto 4: [NH3++ -- CH
4: [NH3 CH –– RR -- COO
COO--]] =
= [NH
[NH22 –– CH COO--]] →
CH -- RR -- COO → pK
pK22
Ponto
Ponto 5:
5: NH
NH22 –– CH COO-- →
CH –– RR -- COO → AA
AA totalmente
totalmente desprotonado
desprotonado
aminoácidos

• Exemplo – Curva de titulação do Acido Glutâmico

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y

Copyright 2008
©
y
y Ponto
y isoelétrico

Equivalentes de OH- adicionados


y
y
y
y

Equivalentes de OH- adicionados


Ponto
isoelétrico
• Exemplo – Curva de titulação da Lisina

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aminoácidos

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aminoácidos

• Informações importantes fornecidas pelas


curvas de titulação

• Representação gráfica do poder tamponante dos AAs em


determinado pH

• Quantificação dos pKs

• Regiões de tamponamento

• Predição da carga elétrica do AA em função do pH do meio

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