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GENÉTICA MOLECULAR

a
Prof . Elisângela Düsman
UTFPR-FB
GENÉTICA MOLECULAR
ROTINA e PLANO
- Postarei as atividades (slides, textos, vídeos) no início
da semana no google classroom.

- No dia da aula síncrona gravarei e postarei no google


classroom.

- No dia do atendimento ao aluno (terça-feira das 09:10


às 10:00) estarei disponível via e-mail ou chat do
google classroom. Caso preciso, abrirei uma chamada
de vídeo pelo google meeting. Dúvidas também podem
ser postadas fora do horário de atendimento e serão
respondidas quando possível.
AVALIAÇÕES
• Avaliação 1 (26/10) – Conteúdo: DNA, Duplicação. Valor:
10.

• Avaliação 2 (07/12) – Conteúdo: Gene, Transcrição,


Tradução, Processamento RNAs. Valor: 10.

Recuperação dos conteúdos (14/12) - Prova escrita


de todo o conteúdo.
Média entre nota semestre + prova de recuperação >
6,0 para aprovação.
- Nota (média) mínima de 6,0 para aprovação na disciplina.
- Os critérios para a aprovação na disciplina são determinados pelo Regulamento
Didático-Pedagógico dos cursos de graduação da UTFPR.
- O aluno deve zelar pelo seu bom desenvolvimento na disciplina, comparecendo às
aulas com pontualidade e evitando se ausentar da sala, realizando as atividades com
dedicação e entregando nos prazos.
- O bom aproveitamento da disciplina exige estudos também fora do horário das
aulas.
- O horário de atendimento do professor será na terça-feira das 09:10 às 10:00
via e-mail, chat ou chamada de vídeo do google classroom. Dúvidas também
podem ser postadas fora do horário de atendimento e serão respondidas
quando possível.
- A nota de cada avaliação será disponibilizada por e-mail, com prazo mínimo de 3
dias úteis da data marcada para a próxima avaliação.
- O aluno que faltar a alguma avaliação somente terá direito a refazê-la mediante
apresentação de atestado.
- Aulas síncronas: gravarei e postarei no google classroom.

E-mail: edusman@utfpr.edu.br
Tipo celular x Cromossomos
• Existem fundamentalmente duas classes de
células:
Eucariontes: com um
Procariontes: cujos
núcleo bem
cromossomos não são
individualizado e
separados do citoplasma
delimitado pelo envoltório
por membrana.
nuclear.
DNA EM PROCARIONTES
• No citoplasma encontra-se o
cromossomo

Uma molécula circular de DNA desnudo,


bem pregueado dentro do nucleóide e,
muitas vezes, presos a pontos diferentes
da membrana plasmática.
DNA EM
EUCARIONTES
• As células eucariontes
possuem uma quantidade
muito maior de DNA que
as células procariontes.

• O DNA (polímeros longos)


está compactado em
vários cromossomos, e
cada cromossomo está
presente em uma
(haplóide) ou duas
(diploides) cópias.
DNA EM EUCARIONTES
• O DNA eucarionte está associado a diversas
proteínas, como as histonas.
DNA - Função

• Responsável pelo armazenamento e transmissão


da informação genética.
ATIVIDADE ASSÍNCRONA
• Veja o vídeo: Genética e Biologia Molecular –
Aula 01 – O DNA: uma sinopse histórica.

• Disponível em: https://youtu.be/uEEbKokBt6o.


ATIVIDADE ASSÍNCRONA
Leia o texto: HERSHEY E
CHASE RESOLVERAM A
QUESTÃO: O DNA É O
MATERIAL GENÉTICO.

Pg. 58 do livro: COX, M.M.;


DOUDNA, J.A.; O´DONNELL,
M. Biologia Molecular. Porto
Alegre: Editora Artmed,
2012.
DNA
• O DNA (ácido desoxirribonucleico) é constituído pela
polimerização (união) de unidades menores
chamadas nucleotídeos.

Desoxirribose= Sem OH no
carbono 2.
Não é facilmente
hidrolisado em condições
alcalinas.
O torna mais estável se
comparado ao RNA.
DNA
• As bases púricas (dois anéis) mais encontradas são a
adenina e a guanina e as pirimídicas (um anel) a
timina e citosina.
DNA
• As bases nitrogenadas estão ligadas ao carbono
1’ do açúcar (ligação glicosídica) e o grupamento
fosfato ao carbono 5’ do açúcar (ligação
covalente).

H
DNA
• Cada molécula de DNA
contém 2 cadeias de
nucleotídeos dispostas em
hélice em torno de um eixo.
• O passo dessas hélices é
dirigido da esquerda para a
direita.
DNA
• Cada cadeia de
nucleotídeos é formada
por ligações fosfodiéster
entre os carbonos 3’ e 5’
da pentose.
DNA
• A direção das ligações fosfodiéster de uma cadeia
é inversa em relação à outra cadeia, sendo
chamadas de antiparalelas.
Não sofreu as ligações fosfodiéster
Antiparalelas: é mais
favorável
energeticamente, por
conta da geometria das
bases componentes.
DNA
• As bases púricas e pirimídicas situam-
se dentro da hélice dupla
(hidrofóbicas), como se fossem
degraus de uma escada.

• A base de uma cadeia


forma par com a da
outra cadeia,
complementarmente
sendo adenina=timina e
citosina=guanina.
DNA
• As ligações entre
as bases se fazem
por pontes de
hidrogênio, sendo
que entre A e T
são duas ligações
e entre C e G três
ligações.
DNA

• O empilhamento das bases no centro


da molécula de DNA, através de
ligações hidrofóbicas e forças de Van
der Walls entre os pares de bases
adjacentes, confere mais estabilidade
ao DNA, eliminado as moléculas de
água do espaço entre as bases.
EXEMPLO 1
• Se um determinado segmento de DNA tem a
seguinte sequência de nucleotídeos em um
filamento:

3’ CGTAGTTAAAAGC 5’
5` GCATCAATTTTCG 3`
Qual deve ser a sequência e orientação do outro
filamento?
EXEMPLO 2
Um filamento de DNA na região codificante do gene
HBB humano (que codifica a b‐globina) começa com
a sequência nucleotídica
5´‐ATGGTGCATCTGACTT‐3´, onde 5´ e 3´ designam
os átomos de carbono nos grupos da desoxirribose
nas extremidades do filamento. Portanto, esse
filamento de DNA tem polaridade química 5´ 3´,
com leitura da esquerda para a direita. Qual é a
orientação e a sequência nucleotídica do filamento
de DNA complementar nessa região do gene HBB?
DNA
• Regras de Erwin Chargaff:
- na molécula de DNA se tem a mesma
quantidade de A=T e C=G.
DNA
• Regras de Erwin Chargaff:
- a soma das A+G (púricas) é
igual a soma das T+C
(pirimídicas).
- a soma das A+T pode ser
igual ou diferente da soma
das C+G.
- Essa proporção varia entre
organismos diferentes, mas é
praticamente a mesma em
tecidos diferentes do mesmo
organismo.
ERWIN CHARGAFF
EXEMPLO 3
• Se a timina constitui 15% das bases em uma
molécula específica de DNA, qual porcentagem
das bases é de citosina?
EXEMPLO 4
• Se o conteúdo de GC de uma molécula de DNA é
de 56%, quais são as porcentagens das quatro
bases (A, T, C e G) nessa molécula?
EXEMPLO 5
O DNA genômico bifilamentar foi isolado da
bactéria Mycobacterium tuberculosis, e a análise
química mostrou que 33% das bases no DNA
eram resíduos guanina. Dada essa informação, é
possível determinar que porcentagem das bases
no DNA de M. tuberculosis correspondia a
resíduos de adenina? Em caso afirmativo, qual é
a porcentagem?
DNA
• Os resíduos de
desoxirribose
(hidrofílicos) e
grupamento fosfato
(ionizado e
hidrofílico)
localizam-se na
periferia, em
contato com a água
intracelular.
DNA
• Ao longo da molécula de
DNA a distância entre as
bases é de 0,34nm e cada
volta da hélice contém 10
nucleotídeos (10,5 em
solução aquosa).
DNA

• A hélice apresenta um sulco


maior e um menor.

• Essa característica é
importante na interação
entre a dupla hélice e as
proteínas envolvidas na
replicação do DNA e na
expressão da informação
genética.
DIFERENTES ESTRUTURAS DO DNA
DNA A DNA Z
‐ Ausência de água. - Alta concentração de sal ou
‐ Mais compacto. em sequências ricas em C=G.
- Mais alongado.
- Aparência zigue-zague (Z).

FORMA DIREÇÃO PARES DE DISTÂNCIA DIÂMETRO


DA BASE ENTRE OS DA HÉLICE
HÉLICE POR PARES DE (Å)
GIRO BASES (Å)
A Giro para 11 2,6 23
a direita

B Giro para 10 3,4 20


a direita

Z Giro para 12 3,7 18


a
esquerda
ATIVIDADE ASSÍNCRONA

Leia o texto: O DNA É UMA HÉLICE DUPLA.

Pg. 209 do livro: COX, M.M.; DOUDNA, J.A.;


O´DONNELL, M. Biologia Molecular. Porto
Alegre: Editora Artmed, 2012.
MODELO DO DNA DE WATSON E CRICK
1953
ROSALIND FRANKLIN e MAURICE WILKINS
1952
Watson e Crick,
junto com Maurice
Wilkins, receberam
o Prêmio Nobel em
1962. Franklin não
recebeu o prêmio
pois havia morrido
de câncer em 1957.
IMPORTÂNCIA

1. A estrutura em dupla hélice sugere como o


material genético pode determinar a estrutura
das proteínas. Código genético.

2. É possível a existência de mutações nas bases.

3. Possibilidade de duplicação do material


genético.
ATIVIDADES ASSÍNCRONAS
• Veja os vídeos:
1. Genética e Biologia Molecular – Aula 02 –
Estrutura e Função do DNA e RNA. Disponível
em: https://youtu.be/jTj4Rw5-Qhs.

2. Curso Técnicas em Biologia Molecular I -


Módulo 9 - Extracao de DNA. Disponível em:
https://youtu.be/lYgVH6LmGd0.
Semana 2
MULTIPLICAÇÃO CELULAR x
DUPLICAÇÃO DNA

• Independente de ser uma célula/organismo


procarionte ou eucarionte, cada vez que uma
célula se multiplica ela precisa fazer uma cópia
completa de todos os seus genes.

• Assim, a célula precisa fazer a duplicação ou


replicação do seu DNA.
DUPLICAÇÃO DNA em PROCARIONTES
e EUCARIONTES
• Nas células procariontes a síntese de DNA pode
ocorrer continuamente, mas em eucariotos
ocorre em uma pequena parte do ciclo celular,
denominada fase S da intérfase.
Síntese de DNA
• Devido ao pareamento de bases
(A=T e C=G) entre dois
polinucleotídeos da dupla hélice
de DNA, e a presença de
desoxirribonucleotídeos livres
no citoplasma (procariontes) ou
no nucleoplasma (eucariontes),
cada filamento de DNA atua
como molde para a síntese de
seu complemento, originando no
final, duas fitas duplas de DNA.
Síntese de DNA
Meselson-Sthal
• Essa replicação é
chamada
semiconservativa,
com uma fita
molde ou parental
e uma recém-
sintetizada.
Origem de replicação
• A separação das bases de DNA começa na origem
de replicação, e progride gradativamente ao longo
da molécula, ocorrendo a síntese de novos
polinucleotídeos, à medida que a dupla hélice se
separa.
Origem de replicação
• Em células procariontes existe somente uma origem
de replicação.
Origem de replicação
• Em células eucariontes existem várias origens de
replicação (réplicons).
Ela se dirige até encontrar
as extremidades de outra
cadeia em formação, os
réplicons.
Replicação Assincrônica
• Em eucariotos a
replicação é
assincrônica, já
que regiões
específicas do
DNA, os genes
individuais,
começam e
terminam sua
duplicação em
momentos
diferentes.
Forquilha de replicação
• A região onde os pares de bases da
molécula original são desfeitos e novos
polinucleotídeos são sintetizados é a
forquilha de replicação.
Replicação Bidirecional
• Quando iniciada a replicação ela se propaga
para os dois lados da molécula de DNA, ou seja,
ela é bidirecional. Portanto existem duas
forquilhas de replicação, em direções opostas.
DNA polimerase
• A enzima capaz de sintetizar um novo
polinucleotídeo de DNA é a DNA polimerase. Ela
atua adicionando desoxirribonucleotídeos
complementares à fita molde, no sentido 5’ para 3’.
Replicação semidescontínua
• Como as duas fitas
sintetizadas devem
crescer no sentido 5’
para 3’ e as fitas são
antiparalelas (uma está
no sentido 3’ para 5’ e
outra no sentido 5’ para
3’) a replicação é dita
semidescontínua.
Replicação semidescontínua
• A cópia da cadeia
parental 3’ para 5’
pode ser sintetizada
continuamente, é a
chamada cadeia
contínua.
Replicação semidescontínua
• A cadeia parental 5’
para 3’ precisa ser
copiada de uma
forma descontínua,
através da síntese
de uma série de
fragmentos, os
fragmentos de
Okazaki, que depois
de unidos dão
origem a uma
cadeia descontínua.
EXERCÍCIO
A sequência de nucleotídeos de uma das fitas de uma
dupla-hélice de DNA é
5´‐GGATTTTTGTCCACCAATCA‐3´
3´‐CCT..............................AGT‐5´
a) Qual a sequência e orientação da fita de DNA
complementar?
b) Baseado nesta fita de DNA, qual será a fita molde para a
duplicação do filamento contínuo? 3´‐5´
c) Baseado nesta fita de DNA, qual será a fita molde para a
duplicação do filamento descontínuo? 5´‐ 3´
d) Desenhe as duas moléculas‐filhas completas que seriam
formadas caso esta molécula de DNA passar por um
DNA polimerase
• Procariotos: DNA polimerase III

• Eucariotos:
– DNA polimerase α (alfa) – cadeia descontínua
– DNA polimerase δ (delta) – cadeia contínua
LIGAÇÃO DA DNA POLIMERASE AO DNA
PROCARIOTOS
• A DNA
polimerase III se
liga ao DNA
através de uma
cinta deslizante
em procariotos.
LIGAÇÃO DA DNA POLIMERASE AO DNA
PROCARIOTOS
LIGAÇÃO DA DNA POLIMERASE AO DNA
EUCARIOTOS
• A DNA polimerase se
liga ao DNA através de
uma proteína
chamada PCNA
(antígeno nuclear de
proliferação celular)
em eucariotos.
LIGAÇÃO DA
DNA
POLIMERASE
AO DNA
EUCARIOTOS δ

α
Primer
• A DNA-polimerase não
consegue iniciar o processo
(contínua ou descontínua,
procarioto ou eucarioto).
• Necessita de um segmento
inicial de nucleotídeos, chamado
primer (produzido pela RNA-
polimerase primase), para dar
início a cadeia.
Primer
• Acreditasse que os primers de RNA e os
fragmentos de Okazaki são mais curtos em
eucariotos que em procariotos.
• Entretanto a construção das cadeias ocorre de
forma semelhante.
HELICASES
• Inicialmente a enzima helicase desenrola as voltas
da dupla hélice de DNA e quebra as pontes de
hidrogênio entre as duas bases.
SSP
• As proteínas SSP (single
strand proteins) mantêm
as cadeias simples de
DNA separadas enquanto
ocorre a replicação.

• Impedem que as antigas


pontes de hidrogênio se
refaçam, evitam que
aquelas regiões sofram
torções e protegem da
degradação por
nucleases.
DNA TOPOISOMERASE
• A DNA topoisomerase I e a DNA-girase
(topoisomerase II) são responsáveis por impedir o
superenovelamento da cadeia antecedente de DNA,
introduzindo quebras seguidas de reuniões das ligações
fosfodiéster na molécula de DNA.
ATIVIDADE ASSÍNCRONA
Leia o Texto: Curando doenças pela inibição das
topoisomerases.

Disponível em: Pg. 318 do livro COX, M.M.; DOUDNA,


J.A.; O´DONNELL, M. Biologia Molecular. Porto Alegre:
Editora Artmed, 2012.

E responda:
1. Sobre qual etapa do mecanismo de ação das
topoisomerases os medicamentos atuam?
REMOÇÃO PRIMER
• A DNA polimerase β em eucariotos e DNA pol I em
procariotos, que possuem atividade exonuclease
(realizam a quebra dos ácidos nucleicos), removem os
primers de RNA e os substituem por
desoxirribonucleotídeos.
DNA LIGASE
• Os fragmentos de Okazaki são ligados pela DNA-
ligase.
DNAs POLIMERASES
• Tabela 1 – Procariotos.

Enzima Função
DNA polimerase I Replicação do DNA
Reparo do DNA (3´- 5´ e 5´-
3´)
Remover primer
DNA polimerase II Reparo do DNA
DNA polimerase III Replicação do DNA
DNAs POLIMERASES
• Tabela 2 – Eucariotos.
Enzima Função
DNA polimerase α (alfa) Replicação do DNA nuclear
(cadeia descontínua)
DNA polimerase β (beta) Reparo do DNA e remoção
primer
DNA polimerase γ (gama) Replicação do DNA
mitocondrial
DNA polimerase δ (delta) Replicação do DNA nuclear
(cadeia contínua)
DNA polimerase ε (épsilon) Reparo do DNA
REVISÃO
ATIVIDADES ASSÍNCRONAS
Veja o vídeo: Genética e Biologia Molecular –
Aula 03 – Replicação do DNA.

Disponível em: https://youtu.be/iUt9FdG5v7c.


Semana 3
PROCARIOTOS
• A replicação começa na origem oriC.
PROCARIOTOS
• OriC: formada uma sequencia especifica de 13 pares de
bases (repetida 3 vezes), seguida de 4 repetições de 9
pares de bases (DnaA boxe).
PROCARIOTOS
• Ocorre a ligação de uma proteína (DnaA) ao DnaA
boxe.
PROCARIOTOS
• Ocorre a deselicoidização de nucleotídeos A e T (2
pontes de hidrogênio).
• Após as helicases (Dna B) se ligam e deslizam na
direção 5´para 3´ do DNA.
PROCARIOTOS
• Após, a primase e a DNA polimerase são
recrutadas e começam a síntese das novas fitas
de DNA.
EUCARIOTOS
• O complexo de reconhecimento da origem (ORC)
(proteínas) permanece ligado às origens de
replicação, locais que possuem sequências específicas
de DNA (chamadas de autonomous replication
sequence – ARS).
EUCARIOTOS
• A ORC serve de receptor para as proteínas
regulatórias da replicação denominada Cdc6 e Cdt1,
que aumentam de concentração na fase G1.
EUCARIOTOS
• A ligação das proteínas Cdc6 e Cdt1 promovem a
ligação de outras proteínas que formam o complexo
pré-replicativo ou pré-RC.
As CDKs
(quinases)
realizam a
fosforilação
(transferem um
grupo fosfato
do ATP aos
aminoácidos
serinas ou
treoninas), e a
ciclina é uma
proteína
regulatória.
EUCARIOTOS
• O complexo S‐Cdk (CDK= quinases e ciclinas), ativado
no final da fase G1, fosforila o complexo de
reconhecimento da origem (ORC).
Origem
Procariotos Eucariotos
EUCARIOTOS
• Em eucariotos a fita de DNA está ligada a
proteínas, as histonas.
• Assim, é preciso desmontar os nucleossomos
nos filamentos parentais e os reunir nas
moléculas-filhas.
EUCARIOTOS
• Isso acontece distribuindo aleatoriamente as
histonas antigas para as moléculas-filhas e
levando novas histonas.
EUCARIOTOS
• A proteína chamada fator 1 de montagem de
cromatina (CAF-1) liga-se as histonas e as direciona
na forquilha de replicação, onde podem ser montadas
junto com o DNA recém sintetizado.
TELOMERASE
• Em eucariotos, assim que o último primer é
removido pela DNA polimerase β, resta uma
ponta unifilamentar em uma das moléculas-filhas
de DNA.
TELOMERASE
• A enzima telomerase adiciona repetições curtas às
pontas 3’ das moléculas de DNA (seqüência TTAGGG
em humanos).

• Possui uma pequena


molécula de RNA
para servir de molde.
TELÔMEROS
• Assim, nas extremidades dos cromossomos são
encontradas sequências especiais de DNA que
constituem os telômeros.
TELÔMEROS
• Impedem a erosão do material genético após cada
rodada de replicação, e a adesão dos cromossomos
entre si, mantendo assim sua estabilidade.
TELÔMEROS x CÂNCER
• Enzima telomerase: ativa
em células germinativas,
progenitoras e tumorais e
reprimida nas células
somáticas.
• As células cancerosas
mantêm seus telômeros
funcionais enquanto que
as células sadias perdem
os mesmos.
TELÔMEROS x CÂNCER

• Assim, algumas empresas farmacêuticas estão


tentando enfocar esta diferença para selecionar
drogas que têm algo seletivo as células
cancerosas inibindo a atividade da telomerase.
TRABALHO
Artigo: Telômeros, telomerase e câncer
Disponível em:
http://www.institutofatimazanetti.com/pdfs/ciencia-
biologica/telomero-telomerase-cancer.pdf
Leia o artigo e responda:
a) O que são telômeros?
b) O que é telomerase?
c) Explique como a telomerase realiza a duplicação dos
telômeros.
d) Explique a relação da telomerase com as células
cancerosas.
e) Explique a relação da telomerase com as células
somáticas normais.
TELÔMEROS x DOENÇAS
• A diminuição dos telômeros é sinal de
envelhecimento celular.

• Síndrome de Werner:
– início precoce de eventos relacionados ao
envelhecimento como rugas na pele, cataratas,
osteoporose, cabelos grisalhos e doença
cardiovascular.
– TELÔMEROS MENORES.
TELÔMEROS x ENVELHECIMENTO
• Estudos recentes relacionam o tamanho dos
telômeros com incidência de estresse, doenças
cardíacas e susceptibilidade a infecções.
• Saúde dos telômeros: exercício físico e nutrição
adequada (aumento do consumo de alimentos ricos
em enxofre, vitamina B12, ácido fólico e vitamina
B6)
TELÔMEROS x ENVELHECIMENTO
• Os telômeros são mais curtos em pessoas
sedentárias do que nas ativas.
• Estudo do tamanho dos telômeros de 2400
gêmeos, com idades de 18 a 81 anos:
– Os irmãos mais ativos chegaram a ter até 200
nucleotídeos a mais do que os inativos.
TELÔMEROS x ENVELHECIMENTO
• Estudo investigou que a telomerase poderia
prolongar a vida deixando células saudáveis tão
resistentes quanto as cancerígenas.
• No estudo, ratos com mais telomerase nas células
viveram até 50% mais do que os outros. Mas
apresentaram mais tumores ‐ acabavam
morrendo de câncer.
REFERÊNCIAS
• https://images.google.com.br
• https://www.nacientifico.com.br
• GRIFFITHS, J.F.; MILLER, J.H.; SUSUKI, D.T.; LEWONTIN, R.C.;
GELBART, W.N. Introdução à Genética. 10 ed. Rio de Janeiro:
Editora Guanabara Koogan, 2013.
• COX, M.M.; DOUDNA, J.A.; O´DONNELL, M. Biologia Molecular.
Porto Alegre: Editora Artmed, 2012.
• ALBERTS, B.; BRAY, D.; HOPKINS, K.; JOHNSON, A.; LEWIS, J.; RAFF,
M.; ROBERTS, K.; WALTER, P. Fundamentos de Biologia Celular. 3
ed. Porto Alegre: Editora Artmed, 2011.
• LODISH, H.; BERK, A.; MATSUDAIRA, O. Biologia Celular e
Molecular. 7 ed. Porto Alegre: Editora Artmed, 2014.
• ZAHA, A.; FERREIRA, H.B.; PASSAGLIA, L.M.P. Biologia Molecular
Básica. 5 ed. Porto Alegre: Editora Artmed, 2014.

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