08/09/2010

Aminocidos, Peptdeos e Protenas

Os assuntos abordados nessa aula sero: INTRODUO PROTENAS (PTN): Conceito Classificao Estruturas: 1., 2., 3. e/ou 4. (conformao nativa) Desnaturao protica Ionizao e funo tamponante AMINOCIDOS (aa): Propriedades gerais Classificao de acordo com a cadeia lateral Ionizao e funo tamponante

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Aminocidos, Peptdeos e Protenas

Protenas
Protenas protos (a primeira; mais importante)
Macromolculas + abundantes nas clulas vivas (50% da massa seca) So instrumentos moleculares por meio dos quais a informao gentica se expressa. So macromolculas resultantes da polimerizao de aminocidos, unidos por uma ligao chamada ligao peptdica. Possuem grande MM e diversidade ----- CLASSIFICAO

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Transcrio
Transcrito primrio Processamento ps-transcricional mRNA maduro
Processamento ps-traduo

Traduo

Dobramento

Modificaes covalentes nos aminocidos

Protena (inativa) Protena ativa

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Alteraes no DNA podem levar a produo de protenas que causam doenas

Anemia falciforme
(...... CCT GAG GAG......) NVal His Leu Thr Pro

Glu

Glu......

Hemoglobina A1

NVal His Leu Thr Pro Val Glu...... (...... CCT CTG GAG......)

Hemoglobina S

Glu Val

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Classificao de protenas quanto a:

1. Funo
Defesa Nutritiva Estrutural Regulatria Cataltica Transporte

2. Localizao
Intracelular Extracelular De Membrana

Classificao de protenas quanto a:

3. Composio Simples ...................... Ex.: ribonuclease A / quimiotripsinognio

Complexas ou conjugadas

(gr. prosttico)

Exemplos: Metaloprotenas ...................on metlico............................ Hemoglobina (Fe, Zn, Ca, Cu) Lipoprotenas ........................... Lipdios ................. 1- lipoprotena do sangue Glicoprotenas .......................... Carboidratos .................... Imunoglobulina G Fosfoprotenas .......................... Gr. Fosfatos ...................Casena do leite Hemoprotenas ........................ Gr. Heme ....................... Hemoglobina Flavoprotenas ..............Nucleotdio de flavina .........Desidrogenase succnica

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Classificao de protenas quanto a:

4. Forma
Fibrosas:
forma alongada --- geralmente insolveis --- funo estrutural

Ex.: -queratina do cabelo, penas e unhas colgeno dos tendes e matriz dos ossos

Globulares: forma esfrica

--- geralmente solveis --- funes dinmicas

Ex.: Lisozima, ribonuclease, canais de Na+, imunoglobulinas, miosina

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Os aa podem se aglomerar em oligo ou polipepptdeos.

Peptdios

Peptdios e Protenas so formados pela unio de aminocidos:

2 aa ........................................... Dipeptdios 3 aa ............................................Tripeptdios 4 aa ............................................Tetrapeptdios at 100 ........................................ Peptdios + de 100 aa ................................. Polipeptdios ou Protena

Protena (polmero)
Aminocido 1 Aminocido 2

(monmero) aminocido

COO + H3N C H R

um dipeptdeo

At 100 aminocidos (10 kDa) Mais de 100 aminocidos

peptdeo protena

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PEPTDEOS BIOLOGICAMENTE IMPORTANTES Aspartame: Asp-Phe

Glutationa: -Glu-Cys-Gly Vasopressina e ocitocina

Cys-Tyr-Phe-Gln-Asn-Cys-Pro-Arg(Lys)-Gly Cys-Tyr-Ile-Gln-Asn-Cys-Pro-Arg-Gly Hormnios insulina (51 aa), hormnios hipotalmicos e hipofisrios

Aminocidos
Menor parte que forma os peptdeos e as protenas.

Protena (polmero) (monmero) aminocido COO + H3N C H R

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COO + H3N C H R

assimtrico O que permite a existncia de compostos que possuam a mesma frmula estrutural mas diferem em configurao espacial -------ESTEREOISMEROS.
n

N de ismeros possveis = 2

COO + H3N C H R

COO + H C H3N R D-aminocido

L aminocido

ATENO: PTN naturais possuem somente L-aminocidos D-Aminocidos ocorrem em peptdeos antibiticos

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Classificao dos aminocidos:

quanto a polaridade e tipo de cadeia
Grupos R apolares e alifticos

Grupos R aromticos

Grupos R polares: no carregados

Grupos R polares: carregados +

Grupos R polares: carregados -

Aminocidos bsicos

Aminocidos cidos

Aminocidos polares neutros

cido Asprtico (Asp D) Histidina (His H)

cido Glutmico (Glu E)

Serina (Ser S)

Treonina (Thr T)

Lisina (Lys K)

Aminocidos aromticos

Arginina (Arg R)

Os 20 aminocidos
Fenilalanina (Phe F) Tirosina (Tyr Y) Triptofano (Trp W)

Asparagina (Asn N)

Glutamina (Gln Q)

Aminocidos hidrofbicos - apolares

aaaaaa aa
Alanina (Ala A) Valina (Val V) Isoleucina (Ile I) Leucina (Leu L) Metionina (Met M) Glicina (Gly G)

aaa Cistena aaa (Cys C) aa aaaaaaa aaaaa aaa

Prolina (Pro P)

aaaaaaa aaaaaaa aaaaaaa aa

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Comportamento cido-base de aa: Ionizao

Os aa apresentam vrias funes qumicas que podem se ionizar e conferir carga eltrica molcula.

Exemplo: Funo carboxila Funo amina

-COOH + -NH3

H+

-COO - NH2 H+

estado de ionizao depende do pH do meio

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Como o estado de ionizao e a carga eltrica da alanina variam em funo do pH do meio ?

pK -COOH = 2,34 pK -NH3+ = 9,69 pK R- NH3+ = -

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Curva de titulao e Poder Tamponante da alanina

Estruturas das Protenas

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Para entender a estrutura 3D das protenas, vamos dissec-la em nveis organizacionais para facilitar o estudo:
aminocido

Estrutura primria

x4

Estrutura secundria

Estrutura terciria

Estrutura quaternria

As caractersticas fsico-qumicas
da ligao peptdica: determinam como o esqueleto de uma PTN vai

se enovelar

do gr. R: determinam as interaes que iro estabilizar a estrutura da PTN.

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ESTRUTURA SECUNDRIA

-hlice

mantida por pontes de H que

se formam entre tomos de 2 ligaes peptdicas prximas.

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-pregueada:

mantida

por

pontes

de

que

se

dispem

perpendicularmente espinha dorsal.

ESTRUTURA TERCIRIA
Resulta de dobras na estrutura da protena estabilizada

por interaes entre os gr. R dos aa.

Foras que estabilizam:
1. Pontes de hidrognio 2. Interaes inicas 3. Interaes hidrofbicas 4. Ligaes Covalentes 5. Interao de Van der Walls

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ESTRUTURA TERCIRIA Conjunto de domnios -Hlice

Pontes H Interaes hidrofbicas Interaes inicas Pontes S-S

-Hlice

Pontes H

Fita pregueada

ESTRUTURA QUARTENRIA
Refere-se ao modo pelo qual 2 a 10 cadeias polipeptdicas (= ou ) se interagem para formar a PTN. Cada uma das cadeias possuem os 3 nveis estruturais anteriores. Foras que estabilizam: 1. Interaes inicas 2. Pontes de hidrognio 3. Interaes hidrofbicas

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Protenas so molculas tridimensionais. A forma da molcula determinante de sua funo.

A Lipase gstrica uma protena solvel em meio aquoso.

A Citocromo C oxidase uma protena integral da membrana interna de mitocndrias

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Desnaturao e Renaturao de Protenas

Modificao da protena sem alterao na estrutura primria. PERDA DA CONFORMAO NATIVA Fsicos: Temperatura, Radiao UV Qumicos: Extremos de pH Detergentes (ex: dodecilsulfato de sdio) Uria e hidrocloreto de guanidina Solventes orgnicos (clorofrmio, lcool, ter) Mercaptoetanol

Agentes desnaturantes

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CONSEQNCIAS DA DESNATURAO Rompimento das pontes de hidrognio Diminuio da solubilidade Dissociao das cadeias Mudana na rotao ptica Aumento de viscosidade Perda da capacidade de cristalizar

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