Genética de Populações

e Saúde
Carlos Eduardo Guerra Amorim
Objetivos
• Compreender as causas da variação
genética humana
g
• Introduzir conceitos básicos de genética
de populações
• Relacionar os conhecimentos de
genética populacional à prática clínica
• Indicar algumas novidades
relacionadas à área
Estruturação
• Bases teóricas da genética de
p p ç
populações

• Genética de p
populações,
p ç , ancestralidade
e saúde – exemplos no Brasil

• Novas abordagens
Bibliografia
• Stearns & Koella. Evolution in health
and disease
• Templeton. Population genetics and
microevolutionary
i l ti th
theory
• Hedrick. Genetics of populations
• Pasternak. Uma introdução à
genética
é i molecular
l l humana.
h
Genética de Populações
• Base de toda a nova síntese evolutiva

• Área da ciência que procura descrever a

variação
i ã genética
éi no nível
í l
populacional, associando às suas
causas e conseqüências
Possíveis perguntas
• Por que comunidades descendentes de
escravos p possuem alta incidência de
anemia falciforme?
• Como posso calcular a probabilidade
de uma mulher desenvolver câncer de
mama no RS?
• Em que medida um teste de
paternidade é confiável?
• Por
P que ficamos
fi d
doentes?
t ?
 Evolução

Genética  Acons. 
Forense Genético

Estudos de  Genética de  Genética da 

Associação e
Associação e 
Populações Conservação
Ligação

Genética 
Médica  ...
Populacional

Melhora/ 
Genético
Um Breve Histórico
• Em 1859, já existia a idéia de
ç
transmutação das espécies
p pelo
p
acúmulo e substituição de pequenas
variantes.
variantes

• Quem propôs essa idéia?

Charles Darwin
Um Breve Histórico
• Publicação chave para a GP
– Hardy
y GH. Mendelian p proportions
p in a
mixed population. Section: "Discussion
and Correspondence".
p Science ((1908)) 28:
49–50.
• No mesmo ano,
ano Weinberg propôs a
mesma idéia aplicada ao estudo da
gemelaridade.
l id d
• Teorema de Hardy-Weinberg
y g
Alguns conceitos
conceitos...
• Alelo = variante genética
– Ex.: Alelo A do sistema ABO. Hb*S.
DXS998*12. CCR5Δ32.
• Marcador genético = locus gênico que
apresenta variação entre dois
i di íd
indivíduos (
(cromossomos) )
• Locus ppolimórfico = freqüência
q do alelo
mais raro não é <1%
Dinâmica dos Genes
• Após 2 gerações o que se espera com
ç às freqüências
relação q alélicas?
Dinâmica dos Genes
• E após 1.000.000.000.000 gerações?
Dinâmica dos Genes
• E após 1.000.000.000.000 gerações?

?
Dinâmica dos Genes
• E após 1.000.000.000.000 gerações?

?
Teorema de Hardy-Weinberg
Hardy Weinberg

• Em uma população em equilíbrio

genético,, as freqüências
g q alélicas e
genotípicas se mantêm constante ao
longo do tempo
• E as freqüências genotípicas podem ser
previstas por:

p2+2pq+q2=1
 p2+2pq+q2=1

AA Aa ou aA aa
Teorema de Hardy-Weinberg
Hardy Weinberg

• Em uma população em equilíbrio

genético,, as freqüências
g q alélicas e
genotípicas se mantém constante ao
longo do tempo
• E as freqüências genotípicas podem ser
previstas por:

p2+2pq+q2=1
Equilíbrio Genético
• Ausência de:
– Mutação
ç
– Deriva Genética Fatores 
– Casamentos Preferenciais Evolutivos
– Fluxo Gênico
– Seleção Natural
Deduzindo o Teorema
p q
• F (A) = p
• F (a) = q q
q
• p+q=100%

p p

p q
Deduzindo o Teorema
p q
• F (A) = p
• F (a) = q pq q2 q
q
• p+q=100%

p2 pq
p p

p q
Deduzindo o Teorema
p q
• F (A) = p
• F (a) = q pq q2 q
q
• p+q=100%

p2 pq
p p

p q
Equilíbrio Genético
• Ausência de:
– Mutação
ç
– Deriva Genética Mecanismos
– Casamentos Preferenciais Evolutivos
– Fluxo Gênico
– Seleção Natural
Há equilíbrio genético em 
Há ilíb i éti
populações naturais!?!?
populações naturais!?!?
Deduzindo o Teorema
p q
• F (A) = p
• F (a) = q pq λ q2 q
q
• p+q=100%

p2 pq
p p

p q
Equilíbrio Genético!?!?
• Todas as populações naturais estão
j
sujeitas a p
pelo menos um desses
fatores!!!

• Apesar disso, estatisticamente, é

possível observar aderência das
freqüências genotípicas ao esperado.
Teorema de Hardy-Weinberg
Hardy Weinberg
• Qual é a sua utilidade??

• Se λ puder ser quantificado, é possível

avaliar
li a açãoã d
de um dosd cinco
i
mecanismos evolutivos (deriva
genética, fluxo gênico, casamentos
preferenciais, seleção natural e
mutação)
Deriva Genética
• Variações nas freqüências genotípicas
ao acaso.
• Erro amostral.
• Acidentes.
A id
Casamentos Preferenciais
• A estrutura de casamentos pode causar
ç
variações no número de homozigotos.
g

• A endogamia,
d i por exemplo,
l l
leva ao
aumento de homozigotos.
Fluxo Gênico
• Sinônimo de migração.
• Deve ser seguido de cruzamento.
• Seu impacto dependerá do fluxo
migratório
i ó i e das
d dif
diferenças entre as
populações.
• A longo prazo, leva a homogeneização
das populações.
populações
Seleção Natural
• Diferença estatística entre a
p
sobrevivência e reprodução ç de duas
entidades em decorrência de suas
características herdáveis.
herdáveis
• Difere da deriva genética.
• Pode atuar em diversos níveis: gene,
organismo, grupo etc.
Mutação
• Alterações entre as seqüências de dois
cromossomos
• Pode ser do tipo
– Substituição
S b tit i ã
– Inserção/Deleção
• Repetições
• Fonte de variação
Ferramentas Populacionais
• Identificação
– PCR + eletroforese
– PCR em tempo real
– Enzima de restrição
– Seqüenciamento...
• Marcadores genéticos
– Microssatélites
– Indels
– SNPs
SNP
Microssatélites
• Também chamados STR
• Pequenas repetições em tandem.
• Exemplo:
– ....CAAACAAACAAACAAACAAA (5rep.)
– ....GCTGCTGCTGCTGCT (5rep.)
p
– ...ATACATACATACATAC (4rep.)
Microssatélites
Microssatélites
• A mutação num STR gera aumento ou
ç do número de repetições
diminuição p ç
• A estrutura repetida gera instabilidade
nessa região,
região o que faz com que a taxa
de mutação seja muito alta.
• Ideal para localização de genes, na
genética forense e da conservação e em
estudos microevolutivos e de ligação
Microssatélites e Doenças
• Distúrbios associados à expansão de
trinucleotídeos:
– Huntington
– Atrofia Dentatorubral-palidoluisiana
Dentatorubral palidoluisiana
– Doença de Kennedy
– Ataxia espinocerebelar tipos 1, 2, 6 e 7
– Machado-Josephp
– Síndrome do X-frágil
Indels
• Inserções – Deleções
• Na saúde, está relacionada a alguns
erros inatos do metabolismo como
também à resistência à infecção por
patógenos virais.
• Exemplo: mutações no gene da Fibrose
Cística e a CCR5Δ32 (resistência ao
HIV).
SNPs
• Do inglês, polimorfismo de nucleotídeo
único.
• Ex.: AAA AAA AAA
AAA GAA AAA
• Mutação
ç do tipo
p substituição
ç
• Podem ser os causadores de doenças
o podem estar ligados a ela
ou
Genética de Populações
Humanas e Saúde

• Entendimento da susceptibilidade e
resistência de certas populações a
doenças e a tratamentos.
tratamentos

• Identificação de genes associados a

doenças comuns ou doenças
monogênicas
Relembrando...
Relembrando

• Genética de populações
– Causas e conseqüências da variação
genética populacional
Variação Genética
• Variação entre indivíduos
• Variação
V i ã entre
t populações
l õ
• Cada população tem porções únicas e
compartilhadas de suas histórias
• Essas diferenças entre populações e
i di íd
indivíduos são
ã resultados
lt d dad evolução
l ã
Variação Genética
• Apenas 1,2% de divergência entre
p
humanos e chimpanzés
• Dois humanos apresentam apenas 0,1%
de divergência entre seus genomas
• Isso significa dizer que somos 99,9%
idênticos!
• Mais de 3 milhões de bases no genoma
humano
Partição da Diversidade

Diversidade Intrapopulacional

Diversidade Interpopulacional
Partição da Diversidade

Diversidade Intrapopulacional

V
Diversidade Interpopulacional
Relembrando...
Relembrando

Dois humanos apresentam apenas 0,1%

de divergência entre seus genomas!
Ancestralidade e Raça
• Existem raças humanas?
• É possível identificar a origem
geográfica ou raça de um indivíduo?
• Qual
Q l é a relação
l ã disso
di com a ocorrência
ê i
de doenças?
• Se determinada população é mais
suscetível a uma doença,
doença é correto fazer
previsões com base na cor da pele?
Algumas Definições
• Biologia Æ sinônimo de subespécie
– É necessário haver diferenciação
ç g genética
– Valor arbitrário?
• D
Dobzhansky
b h k (1937)
(1937): raças são
ã
populações de uma espécie que
diferem nas freqüências de uma ou
mais variantes g genéticas ((raça
ç =
população)
Algumas Definições
• Boas (1942): raças e etnias são
ç
construções históricas e culturais com
pouco significado biológico

• Senso comum: raças equivalem a cor;

grupos que compartilham identidade
cultural, linguística, religiosa; local de
origem ou ancestralidade
Por que tanta confusão!?
• Historicamente, a classificação humana
em ç
raças foi jjustificativa para
p
genocídio, colonialismo e escravidão

• Muitos acreditam que negar a

existência de raças humanas é ponto de
partida para eliminação do racismo.
Raças ou Ancestralidade
• Há grande confusão entre autores da
g q
área da biologia quanto a existência de
raças humanas
• A maioria afirma não haver
• Uma pequena parte, a utiliza como
sinônimo de ancestralidade
• Pensar dessa forma,
forma pode ajudar na
compreensão da dinâmica de doenças
nas populações
l õ
Ancestralidade e Saúde
• Conhecer o perfil genético de uma
população
p p ç para desenho de p
p políticas
públicas de saúde mais eficientes

• Se for possível associar um grupo

populacional à sua ancestralidade, é
possível desenhar metodologia de ação
mais específica
Exemplo no Brasil - 1
• Ações do MS para tratamento da
Anemia Falciforme

• M
Maior
i prevalência
lê i em populações
l õ
descendentes de escravos
Anemia Falciforme
• Malformação de hemácias
• Substituição de um único nucleotídeo
que altera um aminoácido (Glu6Val)
• Hb*A Æ Hb*S
• Fadiga,
g , fraqueza,
q ,
palidez, dores
intensas, AVC,
insuficiência renal etc.
Anemia Falciforme
• AA Æ normal
• AS Æ portador assintomático
• SS Æ necessita de tratamento

• Tratamento: transplante de medula,

medula
transfusão de sangue, administração de
anticoag lantes e analgésicos
anticoagulantes
Anemia Falciforme
• Freqüência do Alelo S
Anemia Falciforme
• Populações brasileiras com grande
influência africana p
(p.ex.,
remanescentes de quilombos)
apresentam alta freqüência do alelo S.
S
• Atenção redobrada deve ser
di i
direcionada
d para o diagnóstico
di ó i d
de
anemia falciforme
Anemia Falciforme
• É uma doença negra!?

• Ancestralidade difere de raça...!

• Se está sob forte seleção negativa,

negativa por
que o alelo S não desaparece?
Anemia Falciforme e Malária
Exemplo no Brasil - 2
• Câncer de mama é o segundo mais
q
freqüente em mulheres
• Países desenvolvidos conseguiram
diminuir o número de mortes com a
identificação precoce do câncer
• RS possui a segunda maior incidência
de câncer de mama no Brasil!
• +85 casos por 100.000 mulheres (2008)
Exemplo no Brasil - 2
• Em Porto Alegre: +119 casos a cada
100.000 mulheres
• Como fazer identificação precoce do
câncer??
• Grupo de estudo da UFRGS coordena
pesquisa sobre as mutaçõesTP53
• TP53 Æ associadas à síndrome de Li-
Fraumeni.
Li Fraumeni
Li-Fraumeni
• Associada a mutaçõesTP53
• 50% dos portadores com 30 anos
desenvolveram
• É caracterizada
i d por aparecimento
i
precoce de vários tipos de câncer:
– Crianças: renal, cérebro
– Adolescentes: ossos
– Adultos: câncer de mama
TP53
• Mutante (1010GÆA, Arg337His)

• Autossômico dominante

• 0,3%
0 3% no sul do país

• Alta freqüência!!
O caso do TP53
• Estudo de associação da mutação ao
q
quadro
• Bases para implementação de política
pública especial voltada para essa
população
• Oferecer acompanhamento constante
para portadores do alelo mutante
• Fazer triagem neonatal (?)
Triagem neonatal
• Em 2005, foi implementado no Paraná a
genotipagem
g p g doTP53
• É possível oferecer todos os cuidados
necessários para 0,3%
0 3% da população?
Exemplo no Brasil - 3
• Instituto Nacional de Genética Médica
p
Populacional, Coord. Dr. Roberto
Giugliani (UFRGS)
• Atenção médica a uma população ao
invés de uma família
• Gerar bases teóricas e delinear
conceitualmente a GEMEPO
• Aplicar esse conhecimento no estudo
d populações
de l õ sulamericanas
l i
 Genética  Genética de 
Epidemiológica Populações

Genética  Genética 
Comunitária Clínica

GEMEPO
INaGeMP
Comunidade Estado Condição
Monte Santo BA Mucopolissacaridose VI
Tabuleiro do Norte
Tabuleiro do Norte CE Doença de Gaucher tipo I
Doença de Gaucher tipo I
S. J. do Pantano MG Defeitos no tubo neural
Cândido Godói RS Gemelaridade
Angra dos Reis RJ Riscos da energia nucler
Hanseníase CE Embriopática por Talidomida
Monte Negro RO Malária e Leishmaniose
Patagônia ‐ Fendas orais
Triunfo RS Contaminação industrial
Contaminação industrial
Desc. de Açorianos RS Doença de Machado‐Joseph
Roda dos Tropeiros
p ‐ Câncer familiar
Gemelaridade em C.G.
CG
• 10% de gêmeos

• Normalmente: 1 a 2%

• MZ e DZ em alta incidência

• Provável causa: efeito fundador

Exemplos no mundo
• Fibrose cística Æ europeus
• Agenesia 3 3º molar Æ asiáticos e
indígenas
• Metabolizadores
M b li d á id Æ asiáticos
rápidos iá i
• Diabetes e Obesidade Æ indígenas g
norte americanos
• Alcoolismo Æ indígenas
• Rejeição
j ç de transplantes
p Æ africanos
OMIM
• Online Mendelian Inheritance in Man

• www.ncbi.nlm.nih.gov
OMIM
• Localização no genoma
• Descrição
• Aspectos clínicos
• Herança
• Diagnóstico
• Pesquisas
Ancestralidade e Saúde
• Seria possível determinar a
ancestralidade de um indivíduo e assim
avaliar sua suscetibilidade a
determinada doença ou tratamento??
Marcadores Informativos de
Ancestralidade

• Marcadores com alto grau de

diferenciação entre populações são
ideais para esses fins.
fins

• Esses são chamados de AIMs.

Raça e Ancestralidade
• Raça, cor da pele e ancestralidade
genética são a mesma coisa!?
g

• Nem
N sempre coincidem!!!
i id !!!
Cor da Pele e Ancestralidade
• No Brasil, tem-se demonstrado
exaustivamente q que a cor da ppele não
está associada à ancestralidade
• Ser negro
negro, não necessariamente
significa ter um ancestral africano
recente ou não
ã ter ancestrais
i europeus
• Atitudes de profissionais da saúde
baseadas em cor da pele podem ser
perigosas
Estudos de Associação
• Uma vez identificada a associação entre
ancestralidade e uma doença, ç como
identificar o gene responsável?

• Estudos de associação Æ associação

estatística populacional entre um
polimorfismo e uma doença
Estudos de Associação
• Doenças monogênicas
• Doenças comuns

• Genes candidatos
• Genomewide association study
• Projeto HapMap
Exemplo
• Kidd e Kidd em Stearns & Koella

• Associação do alcoolismo com um

alelo
l l em ALDH2 (Ald h d
(Aldehyde
dehydrogenase 2)

• Não faz
fa com que
q e o portador beba mais,
mais
mas faz com que ele consiga beber
mais
Associação
• Direta

• Indireta
Projeto HapMap
• Seqüenciamento de milhões de SNPs
p
em africanos, europeus e asiáticos.
• Esses SNPs cobrem todo o genoma de
nossa espécie
• Uma das mais importantes ferramentas
para estudos de associação
p ç
hapmap.org
Desequilíbrio de Ligação
AAA AAA ATA CAA AAA AAA
AAA AAA AAA AAA AAA AAA
Recombinação
ç

AAA AAA AAA AAA AAA AAA

AAA AAA ATA CAA AAA AAA