PROTENAS: So compostos orgnicos de alto peso molecular, so formadas pelo encadeamento de aminocidos.

Representam cerca de 50 a 80% do peso seco da clula sendo, portanto, o composto orgnico mais abundante de matria viva. A importncia das protenas, entretanto, est relacionada com suas funes no organismo, e no com sua quantidade. Todas as enzimas conhecidas, por exemplo, so protenas; muitas vezes, as enzimas existem em pores muito pequenas. Mesmo assim, estas substncias catalisam todas as reaes metablicas e capacitam aos organismos a construo de outras molculas - protenas, cidos nuclicos, carboidratos e lipdios - que so necessrias para a vida. Todas as protenas contm carbono, hidrognio, nitrognio e oxignio, e quase todas contm enxofre. Algumas protenas contm elementos adicionais, particularmente fsforo, ferro, zinco e cobre. Seu peso molecular extremamente elevado. Todas as protenas, independentemente de sua funo ou espcie de origem, so construdas a partir de um conjunto bsico de vinte aminocidos, arranjados em vrias seqncias especficas. Elas exercem funes diversas, como: - Catalisadores; - Elementos estruturais (colgeno) e sistemas contrteis; - Armazenamento (ferritina); - Veculos de transporte (hemoglobina); - Hormnios; - Anti-infecciosas (imunoglobulina); - Enzimticas (lpases); - Nutricional (casena); - Agentes protetores. Devido as protenas exercerem uma grande variedade de funes na clula, estas podem ser divididas em dois grandes grupos: - Dinmicas: Transporte, defesa, catlise de reaes, controle do metabolismo e contrao, por exemplo; - Estruturais: Protenas como o colgeno e elastina, por exemplo, que promovem a sustentao estrutural da clula e dos tecidos. Exemplos de protenas: Enzimas que transformam nosso alimento em nutrientes bsicos a serem utilizados pelas nossas clulas. Anticorpos que nos protegem de doenas. Hormnios peptdeos que enviam mensagens coordenando a atividade contnua do organismo. Elas guiam nosso crescimento durante a infncia e ento mantm nosso organismo atravs da fase adulta. Asseguram nosso bom estado nutricional.OBJETIVOS Dados da Aula O que o aluno poder aprender com esta aula Esta aula destaca a importncia das protenas para a vida, descrevendo sua estrutura e funes, inclusive o seu papel no controle da produo e expresso do material gentico. Nesse contexto, tambm destacado o termo autopoiese. Durao das atividades 1 aula de 50 min Conhecimentos prvios trabalhados pelo professor com o aluno Estratgias e recursos da aula ## Professor, voc pode comear essa aula indagando quais so as molculas orgnicas ou nutrientes necessrios para a sobrevivncia dos seres vivos. Surgindo o comentrio das protenas, pode-se perguntar por que tais molculas so importantes. Deve-se tomar o cuidado para que os alunos no pensem que as protenas ingeridas executam as funes determinadas pelo organismo que as ingeriu. Diga-lhes que as protenas so digeridas em aminocidos que so utilizados pelo organismo para formar novas protena ## Geralmente, ao se ensinar molculas orgnicas aos alunos, protenas, carboidratos e lipdeos so abordados em um mesmo grupo de molculas: aquele que desempenha as funes programadas pelo cdigo gentico ou que necessrio para a execuo dessas funes. Por isso, muitas vezes consideramos as protenas apenas como "tijolinhos da vida", focando na sua funo constitutiva. Porm, as protenas esto mais interligadas ao DNA que s demais molculas, pois tambm regulam a produo e expresso desse. ## Para que isso fique claro aos alunos, liste na lousa todas as funes das protenas que eles falaram e depois acrescente, se necessrio, a funo de regulao e produo do DNA, dando-lhe um destaque (seja por meio de cores diferentes, tamanho da letra, etc) ## ## Se preferir, antes de acrescentar essa funo, pode perguntar como surgem tantas clulas com funes distintas em um organismo que se iniciou a partir de uma nica clula. Se o DNA o mesmo em todas as clulas, como elas so diferentes? ## PROTENAS PRODUZEM DNA

Para compreender essa aula, necessrio primeiro entender o que " autopoiese". Esse termo foi concebido para designar a capacidade dos seres vivos de produzirem a si prprios. Segundo essa teoria, um ser vivo um sistema autopoitico, caracterizado como uma rede fechada de produes moleculares (processos), onde as molculas produzidas geram com suas interaes a mesma rede de molculas que as produziu. E dessa forma que as protenas se relacionam com o material gentico. Os cidos nuclicos participam da formao das protenas que, por sua vez, participam da formao de cidos nuclicos. Essa a circularidade dos processos biolgicos. importante notar a importncia do citoplasma (que contm as protenas) no processo de regulao da expresso gnica.

Figura 1: Circularidade da produo de DNA e protenas ## Para que os alunos compreendam autopoiese, antes de defini-la pergunte-lhes qual ou quais molculas so importantes para a manuteno e diversidade da vida. provvel que eles respondam DNA e RNA e se esqueam das protenas. Ento, mostre-lhes que sem as protenas no h produo de DNA e que sem DNA no h produo de protenas. Utilize a figura acima para isso ##

Como as protenas regulam a produo e a expresso do DNA? A replicao do DNA no est isenta de protenas. Na molcula de DNA existem stios de reconhecimento de protenas envolvidas na iniciao e no trmino da replicao. O nmero de cpias do DNA ajustado pela ao das protenas. Em relao expresso gnica, as protenas a controlam em nvel de transcrio, traduo e pstraduo. Em nvel de transcrio, protenas reguladoras inibem ou ativam a transcrio do mRNA. Posteriormente, pode ocorrer o controle da traduo. Quando essa inibida, no h a formao da protena codificada na seqncia de bases do mRNA. s vezes, a traduo s se inicia na presena de outras protenas, que ativam esse processo. E por fim, mesmo aps a sntese da protena, a atividade dessa pode ser regulada por meio do controle do transporte, do processamento e da degradao da mesma. Dessa forma, os genes podem se expressar de formas diferentes ou em tempos distintos, dependendo de quais fatores controladores esto presentes. Portanto, isso possibilita o surgimento de uma maior diversidade de clulas, tecidos e formas de vida. importante notar que a regulao da expresso gnica ocorre tanto em procariotos quanto em eucariotos. Porm, existe uma diferena fundamental entre esses dois grupos. Em eucariotos, a membrana nuclear proporciona a separao fsica de dois ambientes, sendo que os ribossomos, responsveis pela traduo, esto de um lado do envoltrio nuclear e o DNA e as RNA polimerases, necessrias para a transcrio, esto no outro lado. Entre a transcrio e a traduo, o RNA transcrito precisa ser processado de modo que possa passar atravs do envoltrio nuclear. Regulando quais mRNAs podem passar para o citoplasma, a clula capaz de selecionar as mensagens recm sintetizadas que sero traduzidas. Isso permitiu que houvesse uma maior diferenciao celular, j que os tempos de transcrio e traduo tambm podem ser controlados. J nos procariotos, a transcrio e

a traduo ocorrem simultaneamente (Para mais informaes, veja a aula "A origem da clula eucaritica"). ## Exemplifique a importncia do citoplasma e das protenas na regulao da expresso do DNA com a diferenciao celular durante do desenvolvimento embrionrio. Aproveite o momento para falar que fatores externos, como poluio, uso de cigarros e outras drogas, exposio a condies ambientais distintas influenciam no citoplasma, que por consequncia interfere nas protenas, interferindo na regulao da expresso gnica ## O papel das protenas na regulao da expresso gnica pode ser evidenciado na diferenciao de clulas totipotentes durante o desenvolvimento embrionrio. Embora as clulas apresentem o mesmo material gentico, diferentes genes se expressam de acordo com os sinais de induo que recebem.

Diviso e diferenciao celular TAMANHO DAS PROTENAS As protenas so molculas grandes, porm quando comparadas a outras molculas, como a gua ou uma molcula de glicose. No entanto, quando comparadas s clulas, so estruturas bem pequenas. Para se ter noo, a bactria Escherchia coli , tem comprimento igual a 2 m, uma clula muscular (micito) tem dimetro igual a 50 m e uma protena, como a actina, tem dimetro de 3,6 nm, que equivalente a 0,0036 m. A bactria E.coli apresenta um volume de aproximadamente 1m3, e nesse volume cabem, aproximadamente, 5 bilhes de molculas de actina. J uma clula muscular apresenta um volume

aproximado de 65416 m3, sendo capaz de comportar cerca de 335 trilhes de molculas de actina. Ou seja, as protenas so pequenas quando comparadas a clulas tanto procariticas como eucariticas. ## importante conferir a dimenso desses tamanhos aos alunos para que esses no pensem que as protenas (diante do tamanho da sua cadeia, da sua forma e complexidade de funes) so maiores que uma clula, mesmo sendo essa uma clula procaritica. Alm disso, ao se ter uma noo da dimenso das estruturas, possvel entender que dentro de uma clula (mesmo que seja a menor) ocorrem vrias reaes bioqumicas mediadas por molculas orgnicas, como protenas, lipdeos e carboidratos. Para isso, pode-se mostrar a figura de um mapa metablico e dizer que todas aquelas molculas e reaes esto presentes dentro de uma clula (por menor que seja) ##

DO QUE AS PROTENAS SO FORMADAS? Todas as protenas, sejam das mais antigas linhagens de bactrias ou das formas de vida mais complexas, so construdas com o mesmo conjunto de 20 aminocidos, unidos covalentemente em sequncias caractersticas. Os aminocidos so molculas orgnicas formadas por um carbono ligado a um grupo amino, a um grupo carboxila, a um tomo de hidrognio e a uma cadeia lateral, ou radical R. Um aminocido se diferencia um do outro devido esse radical, que varivel.

Aminocidos 1: propriedades

Como os aminocidos se ligam?

Os aminocidos se ligam por meio da ligao peptdica. A ligao peptdica uma ligao qumica que ocorre entre duas molculas quando o grupo carboxilo de uma molcula reage com o grupo amina de outra molcula, liberando uma molcula de gua.

Figura 2: Reao qumica para a formao da ligao peptdica

ESTRUTURA DAS PROTENAS

## ATIVIDADE: Utilize bolinhas de isopor (aminocidos) e palitos de dentes (ligaes entre os aminocidos) para que se possa representar a estrutura primria. Para isso, encaixe as bolinhas e os palitos de forma linear. Depois, para representar a estrutura secundria, mostre que os aminocidos podem se dispor em planos distintos, inclinando os palitos (cada um para um lado), ou seja, dando uma nova conformao s ligaes. Dessa forma, a protena formada por aminocidos com ligaes entre si (bolinhas e palitos) no mais apresentar uma forma linear. Utilize tambm a animao abaixo para mostrar todas as estruturas, incluindo a terciria e a quaternria. Ao finalizar a apresentao dessa complexidade, lembre-se de falar de novo da escala de protenas (quantas podem estar dentro de uma bactria?) ##

Conhecer a estrutura das protenas importante no apenas para entender como elas so formadas quimicamente, mas sim porque sua estrutura confere sua funo. A sua atividade biolgica depende de sua forma. Muitas vezes, quando as protenas so aquecidas a elevadas temperaturas, algumas interaes qumicas so rompidas e essas molculas perdem sua forma. Dessa forma, tambm deixam de desempenhar sua funo. Esse processo chamado de desnaturao. Primria: dada pela sequncia de aminocidos que se ligam por meio das ligaes peptdicas, havendo uma extremidade aminoterminal e outra carboxi terminal. Essa sequncia determinada geneticamente. Secundria: dada pelo arranjo espacial de aminocidos prximos entre si na seqncia primria da protena. Existem dois tipos principais de arranjos secundrios: folha-beta e alfa-hlice. Terciria: resulta do enrolamento da hlice ou da folha pregueada, sendo mantido por pontes de hidrognio e dissulfeto. Esta estrutura confere a actividade biolgica s protenas. Quaternria: a estrutura tridimensional de protenas que possuem duas ou mais cadeias polipeptdicas.

Estrutura das protenas

OUTRAS FUNES DAS PROTENAS ## Retome, nesse momento, as respostas dos alunos pergunta inicial (Para que as protenas so importantes?) e aproveite para detalhar melhor cada funo e novamente reforar a relao com o DNA, antes dos lipdeos e carboidratos, costumeiramente associados a elas ## As protenas podem desempenhar diversas funes, sendo uma delas a j mencionada regulao da expresso gnica. Outras de suas funes importantes esto listadas abaixo. Enzimtica: algumas protenas funcionam como catalisadores biolgicos, que so molculas que aumentam a velocidade de uma reao, diminuindo a energia de ativao. Outra caracterstica dos catalisadores que eles no so consumidos durante a reao. As enzimas so altamente especficas, havendo uma regio de reconhecimento do substrato envolvido na reao qual ela participa. Transporte: essas protenas se ligam e transportam especificamente molculas ou ons de um rgo para o outro. Exemplo: hemoglobina. H tambm protenas transportadoras na membrana celular, que transportam glicose, aminocidos e outros nutrientes para dentro das clulas atravs da membrana. Protenas nutrientes e de reserva: so protenas com alto teor nutritivo. Exemplos: ovoalbumina, presente na clara do ovo; casena, no leite. Estrutural: muitas protenas servem como filamentos, cabos ou lminas para dar firmeza ou proteo a estruturas biolgicas. Exemplos: colgeno nas cartilagens e tendes; queratina nos cabelos.

Defesa: defendem os organismos da invaso de outras espcies ou contra leses. Exemplo: imunoglobulinas ou anticorpos. Hormonal: ajudam a regular a atividade celular ou fisiolgica. Exemplo: insulina, hormnio do crescimento e hormnio paratireideo.

DIVERSIDADE DAS PROTENAS Assim como existem milhares de genes no ncleo celular, cada um especificando uma caracterstica distintiva do organismo, existem, correspondentemente, milhares de protenas diferentes na clula, cada uma executando uma funo especfica. Com isso, podemos perceber que existe uma diversidade muito grande de protenas (veja figuras a seguir para exemplificar). No entanto, existem protenas, que mesmo em espcies diferentes, apresentam uma mesma funo, apresentando pequenas diferenas estruturais entre si. Essas protenas so chamadas de homlogas e evidenciam o parentesco evolutivo entre as distintas espcies, indicando a presena de um ancestral comum.

Figura 3: Estrutura de uma imunoglobulina suas quatro cadeias

Figura 4: Estrutura de uma hemoglobina, com

Figura 5: Estrutura fibrosa do colgeno, com sua tripla hlice

Recursos Educacionais Nome Tipo

Estrutura das protenas

Animao/simula

Aminocidos 1: propriedades

Animao/simula

Diviso e diferenciao celular Avaliao Essa aula pode ser avaliada por meio de um questionrio, com perguntas a respeito das funes das protenas. importante observar se o aluno, ao redigir as respostas, enfatizam a funo de regulao da produo e expresso do DNA.

Animao/simula