a. O que entendemos por transferncia lateral de genes? Transferncia horizontal de genes ou Transferncia lateral de genes, um processo em que um organismo transfere material gentico para outra clula que no sua. Hoje acredita-se que a transferncia horizontal ocorra tanto em animais como em plantas superiores, entrando com menor frequncia quando comparado com o que ocorre em bactrias. A engenharia gentica uma forma artificial de Transferncia horizontal de genes.
b. Explique a importncia dos mecanismos de transferncia lateral de genes para a evoluo natural das espcies. A Transferncia horizontal um forte mecanismo que molda os processos evolutivos. A transferncia horizontal no um processo passvel, como a seleo natural, por exemplo, j que ela ocorre graas a processos que dependem apenas dos organismos, como a Conjugao,Transduo, Transformao e em alguns casos tambm por agentes de transferncia. A transferncia horizontal de genes (HGT) tambm pode ser evolutivamente importante por que disseminaria a diversidade gentica, movendo genes atravs das fronteiras entre as espcies e mesmo entre grupos taxonmicos mais amplos e afastados, mesmo que isso ocorra bem mais raramente. De acordo com alguns cientistas, com a introduo de novos genes j evoludos em genomas preexistentes, este processo queimaria as etapas iniciais, geralmente, muito lentas da evoluo de um novo gene no novo hospedeiro que, por sinal, em seus momentos iniciais em que ainda no existiriam vantagens claras em termos de sobrevivncia e sucesso reprodutivo conferidas pelo gene, seria bastante sensvel a fatores estocsticos e, portanto, a possibilidade de perda por deriva gentica do novo gene em evoluo. Sendo assim, a transferncia lateral poderia acelerar em muito a inovao genmica. Porm, ainda existe bastante controvrsia sobre o papel real e a importncia relativa deste fenmeno como mecanismo incrementador da evoluo.
2. Pesquise: como a competncia pode ser induzida em bactrias? Algumas bactrias so capazes de captar DNA naturalmente. Entretanto, essas bactrias somente captam o DNA durante um momento especfico do seu ciclo de crescimento, quando elas produzem uma protena especial chamada de fator de competncia. Nesse estgio a bactria conhecida como competente. Outras bactrias no so capazes de captar DNA naturalmente. Entretanto, a competncia pode ser induzida in vitro nessas bactrias pelo tratamento com agentes qumicos (ex. CaCl2).
3. Considerando o mecanismo de conjugao, como o processo de conjugao pode contribuir para a transferncia de genes (que no compe o plasmdeo original) entre microrganismos de espcies diferentes? A conjugao est associada presena de plasmdeos F. Estes plasmdeos contm genes que permitem a transferncia do DNA plasmidial de uma clula para outra. Quando a clula porta um plasmdeo de natureza F denominada F+, doadora, ou macho, enquanto clulas desprovidas de tais plasmdeos so denominadas F-, receptoras, ou fmeas. A capacidade conjugativa est associada presena de determinados genes localizados em um operon denominado tra. Estes genes conferem uma srie de caractersticas envolvidas na conjugao tais como a sntese do pilus F, responsvel pelo reconhecimento e contato entre as clulas, assim como a transferncia do DNA plasmidial. Eventualmente, os plasmdeos podem ser integrados no cromossomo, sendo este processo mediado por pequenas seqncias de DNA denominadas IS (insertion sequences). As clulas apresentados tais plasmdeos integrados so denominadas Hfr (do ingls High Frequency of Recombination). Quando integrados, esses plasmdeos podem mobilizar a transferncia de genes cromossomais tambm. 4. Explique dois mecanismos de transferncia do DNA durante o processo de conjugao. Em gram negativos, a conjugao pode ser de dois tipos: entre clulas F+ e F-, resultando em duas clulas F+ e entre clulas Hfr e F-, resultando em uma clula Hfr e outra F-. Nos dois processos, acredita-se que o mecanismo provvel de transferncia do DNA seja pelo crculo rolante, onde apenas uma das fitas transferida, sendo a fita complementar sintetizada pela clula receptora. Provavelmente, o estmulo para o disparo do processo seja o contato das clulas. Assim, a conjugao envolve a passagem de DNA de uma clula F+ para outra F- , que torna-se ento F+ tambm. Quando o plasmdeo encontra-se incorporado ao cromosso, a conjugao passa a envolver a transferncia de genes cromossomais, sendo que nestes casos, a clula receptora permanece F- , porque a regio tra a ltima a ser transferida, o que raramente ocorre na natureza. Nestes casos, passam grandes blocos de DNA da clula Hfr para a receptora, promovendo extensas recombinaes. 5. Sobre o processo de mobilizao plasmidial, explique: a. Diferencie plasmdeos conjugativos, no-conjugativos, e mobilizveis. Plasmdeos conjugativos so aqueles que so capazes de atingir a transferncia para outra clula, e so capazes de promover a transferncia de um segundo plasmdeo no conjugativo da mesma clula doadora. J os plasmdeos no conjugativos, no podem fazer a conjugao pois no possuem genes necessrios. Os plasmdeos mobilizveis contm genes mob e so capazes de transferir cpias de si prprios (por conjugao) para outras clulas.
B.Explique o funcionamento do sistema mob/bom no plasmdeo ColE1. A mobilizao do plasmdeo ColEI envolve o gene mob, o qual codifica uma nuclease especfica, e o gene do stio bom, onde a mob faz um corte no DNA. O ColEI tem um gene necessrio para a transferncia de DNA mas ele no carrega os genes requeridos para a formao de acasalamento. A presena de outro plasmdeo conjugativo permite ao doador formar um par de acasalamento com a clula receptora e o ColEI pode ento usar sua prpria maquinaria para executar a transferncia do DNA.
6. Sobre o uso de plasmdeo F na transferncia gnica, responda: a. Diferencie as estirpes F - , F + , Hfr. A estirpes F + carrega genes necessrios para sua replicao e transferncia do DNA. O plasmdio F pode estar ou no integrado no cromossomo da bactria hospedeira. Quando integrado, a bactria chamada de HFr (alta freqncia de recombinao) devido mobilizao de genes cromossmicos no processo de conjugao desencadeado por produtos gnicos do plasmdio. A clula F+, durante o contato com um clula F-, transfere para esta ltima uma cpia do plasmdio F, tornando-a F+. A linhagem HFr, onde o fator F encontra-se integrado no cromossomo, transfere essencialmente marcadores localizados no cromossomo, sendo que apenas muito raramente a totalidade do fator F transferida (conjuntamente com todo o cromossomo da doadora). Portanto, nesse caso a clula receptora permanece F- aps a conjugao.
7. Diferencie transduo generalizada e especializada. Qual seria o efeito da deleo do gene para a enzima dam metilase sobre a taxa de ocorrncia de transduo generalizada em E. coli? A transduo generalizada m e d i a d a p o r f a g o s q u e , o c a s i o n a l m e n t e , incorporam um fragmento de DNA cromossmico durante a maturao do vrus, ao invs de DNA viral. Quando tal partcula de fago infecta uma clula, ela introduz o segmento de DNA cromossmico de seu hospedeiro anteri or no l ocal de infeco com o DNA vi r al . Out r o t i po de t r ansduo medi ada por f agos a transduo especializada ocorre quando o DNA da clula hospedeira incorporado ao DNA do fago. Entretanto, esse evento pode ocorrer em uma posio incorreta, algum DNA de fago perdido e o DNA bacteriano includo. Desde que a permuta no elimine a poro do genoma do fago necessria propagao, o fago recombinante ainda capaz de se mul t i pl i car . No caso, quando ocor r er uma del eo do gene par a a enzima dam metilase, que faz a metilao de uma determinada seqncia ao longo de todo genoma, a taxa de ocorrncia de transduo generalizada iria diminuir. A taxa de mutaes pode aumentar, ou o DNA no se replicaria mais.
8. A recombinao gnica um processo importante para vrios processos de transferncia gnica entre bactrias. A.Diferencie recombinao homologa e recombinao especfica. Na recombinao homloga requer a presena de uma regio homloga do DNA a qual q u al de v e s e r a l t a men t e s i mi l a r ( n o ne c es s a r i a me n t e i d n t i c a ) . J n uma recombinao especfica (ou stio-especfica) um segmento definido do DNA r ear r anj ado. Ent r et ant o, no dependem de r egi o de homol ogi a ou da ao daRecA.
B.Explique o fenmeno do crossing over contextualizando sua importncia para a evoluo de espcies. Durante o pareamento entre cromossomos homlogos, durante a meiose antes da primeira diviso celular, ocorre uma permuta gentica entre os cromossomos. Essaper mut a, que um dos r esul t ados da r ecombi nao homl oga, chamada de crossing-over .Sendo assim, essa permuta aumenta a variabilidade gentica, Pois permi t e que genes ent r e cr omossomos sej am mi st ur ados, consequent ement e, fazendo com que as geraes seguintes sejam uma combinao da parental.
O que so genes mosaico? Como esses genes contribuem para a resistncia de Streptococcus pneumoniae ao antibitico penicilina? Genes mosai co s o f o r m a d o s p o r m i s t u r a e n t r e g e n e s , q u a n d o o c o r r e a transferncia de um gene de uma espcie diferente altera um segmento de genes,f a z e n d o c o m q u e e l e s e j a d i f e r e n t e d o a n t e r i o r .
As PBPs (Penicillin Binding Proteins) so enzimas envolvidas na sntese da parede celular bacteriana e servem como alvo para ao de drogas b-lactmicas. Sua inibio por essas drogas determina a formao de uma parede celular frgil que no suporta a diferena osmtica, levando lise celular bacteriana(30). S. pneumoniae, S. aureus resistente meticilina (MRSA), N. gonorrhoeae, Haemophilus influenzae so alguns exemplos de microrganismos que se tornam insensveis ao de b-lactmicos atravs de alteraes nas PBPs, diminuindo a afinidade da droga pelas enzimas. A origem desses genes de resistncia parece ser a captao de DNA bacteriano do meio. Os genes que codificam essa alterao no S. pneumoniae so chamados de genes mosaico, pois so constitudos de genes prprios misturados a segmentos de DNA de microrganismos mais resistentes penicilina, tais como os S. viridans(29).