21/03/2016

Reviso Aminocidos e Protenas

Aminocidos
Funo mista
Classificao (polaridade Cadeia lateral)
Curvas de titulao:

Capacidade tamponante
Zona de tamponamento
pKs
pI- ponto isoeltrico

Anlise de aminocidos
Eletroforese (escolha de tampo de eletroforese)

Protenas
Classificao
Quanto a forma
Quanto a composio

Funes
Ligao peptdica
caractersticas

Organizao estrutural
Interaes envolvidas na estabilizao da
conformao protica
Pontes de H, eletrostticas, inicas, hidrofbicas e
covalentes (ex)

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Hierarquia estrutural das protenas:

Diferentes nveis de organizao estrutural:
Estrutura primria: interaes envolvidas
Estrutura secundria:
Alfa-hlice: caractersticas e interaes envolvidas
Beta-estrutura: caractersticas e interaes envolvidas
Estrutura supersecundria:
Motivos
domnios

Estrutura terciria: (efeito hidrofbico) conceito e

interaes envolvidas (pontes S-S)
Estrutura quaternria: conceito interaes
envolvidas na estabilizao

Nveis de Estruturas
Proticas

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Nveis de organizao estrutural

Estrutura primria
Ligaes covalentes entre os resduos
Ligao peptdica

Estrutura secundria
Pontes de hidrognio entre tomos da cadeia principal
Estrutura terciria
Ligaes no-covalentes entre tomos da cadeia lateral com outros tomos da cadeia
lateral ou cadeia principal
Interaes hidrofbicas
Interaes eletrostticas
Pontes de hidrognio
Pontes salina
Pontes dissulfeto

Estrutura quaternria
Ligaes no-covalentes entre tomos de cadeias distintas em multmeros

Estrutura primria de protenas

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Nveis de organizao estrutural

ESTRUTURA PRIMRIA
Seqncia de aminocidos na cadeia
Ligaes covalentes entre os resduos
Ligao peptdica

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2005 Elsevier

CARACTERSTICAS DA LIGAO
PEPTDICA
Ligao simples ()
Restrio de rotao
Distncia menor entre C-N do que outras
ligaes entre carbono e nitrognio
CARTER DE DUPLA LIGAO
DEVIDO A RESSONNCIA!

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+
H3

Ressonncia da ligao peptdica

H3

Configurao cis
trans

Estrutura secundria de protenas

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ESTRUTURA SECUNDRIA

As caractersticas particulares da ligao

peptdica vo impor determinadas restries
na disposio dos grupamentos ligados na
cadeia o que ir induzir um arranjo espacial
determinado!
Ocorre uma toro da cadeia polipeptdica

ESTRUTURA SECUNDRIA
Pontes de hidrognio entre tomos da cadeia
principal

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2005 Elsevier

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Estrutura secundria
Descreve o arranjo
espacial dos tomos na
cadeia principal
Tipos

Hlices
Conformaes
Voltas
Indefinida (ou ao acaso
loops, coils, turns)

Alfa-hlices
O arranjo mais simples que as protenas podem
assumir um arranjo helicoidal
Esqueleto polipeptdico fica
enrolado em torno de um eixo
imaginrio
Cada volta contm 3,6 resduos
= -57; = -47

Grupos R se voltam para fora

do eixo
Em mdia, 25% dos aminocidos de qualquer protena esto
em hlices

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- Estrutura ou Folhas -
Interaes por pontes de hidrognio
intra-cadeia e inter-cadeias

Conformao
(beta)
Esqueleto estendido em
forma de zigue-zague
Folhas paralelas e antiparalelas
Paralela: = -119; = 113
Anti-par: = -139; = 135

Quanto as folhas so
prximas, os grupos R
devem ser pequenos
Teias e queratinas... Gly e Ala

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LE 5-20b

b pleated sheet
Amino acid
subunits

helix

Estrutura super secundria

Motivos:
Pequenos grupos de elementos de estrutura
secundria que formam um padro estrutural
especfico
Encontrados em diferentes protenas com
diferentes funes e diferente sequncia
Funo pode estar associada a um padro
estrutural sequencial especfico

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Estrutura super secundria

Domnios
Unidade compacta dentro da estrutura
protica (estrutura terciria)
Pode ter uma funo especfica
Possui um padro estrutural caracterstico

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Estrutura terciria de protenas

Protenas em soluo

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Ligaes que mantm a Estrutura

Terciria

Ligaes inicas ou salinas

Ligaes hidrofbicas
Pontes de hidrognio
Ligaes covalentes
Foras de Van der Waals

Estrutura Terciria das Protenas

interaes de van
der Waals e
hidrofbicas

ligao de
hidrognio

ligao
dissulfeto

esqueleto
polipeptdico
ligao
inica

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Importancia estrutural da cistena consiste na

posibilidade desta formar Pontes de dissulfeto
com outro residuo de cistena

Estrutura quaternria de protenas

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ESTRUTURA QUATERNRIA
Protena constituda por mais do que
uma cadeia polipeptdica
Interaes envolvidas:

Hidrofbicas
Pontes H
Inicas
Van der Walls
Pontes S-S

Cadeia Lateral dos Aas

Entre as cadeias
polipeptdicas

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Modificaes ps-traducionais
(modificaes covalentes)
Identificar aminocidos que sofrem a
modificao, funo da modificao
(estabilizao de estrutura, modulao da
atividade etc...) exemplos
Tipos:

Hidroxilao
Acetilao
Fosforilao
Glicosilao
Protelise

Desnaturao protica:
Conceito
Agentes desnaturantes
reversibilidade

Propriedades das protenas

Solubilidade
pI
Efeito de sais

Protenas fibrosas
Conceito
Alfa-queratina; beta-queratina
Elastina
Colgeno
Enfatizar as diferenas estruturais e funcionais destas
protenas

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Protenas globulares
Conceito
Mioglobina:
Caractersticas estruturais:
Monomrica, um grupamento heme, alta afinidade pelo
oxignio

Hemoglobina:
Caractersticas estruturais:
Oligomrica (4cadeias), 4 grupamentos heme, portena
alostrica

Caractersticas funcionais: (transporte de O2)

Ligao cooperativa com o oxignio
Efeito do 2,3 difosfoglicerato
Efeito da variao do pH e do CO2 (Ef. Bohr)

Ressaltar as diferenas estruturais e funcionais

entre estas duas protenas

Anlise de protenas
Mtodos de separao:
Dilise
Cromatogrficos:
Troca inica
Peneira molecular
Afinidade

Eletroforticos:
Unidimensional (SDS-PAGE)
Bidimencional

Mtodos de anlise da seqncia de

aminocidos

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Anlise de protenas
Mtodos de anlise da seqncia de
aminocidos:
Anlise do grupo amino terminal: o que . E
princpio do mtodo
Sanger DNFB
Edman fenilisotiocianato de sdio

Anlise do grupo carbxi-terminal

carboxipeptidase

Anlise da seqncia:
Fragmentao da cadeia (finalidade)
Enzimtico: tripsina, protease V8
Qumico:brometo de cianognio

Degradao de Edman: princpio, vantagem

limitao
Degradao de Edman nos fragmentos
Ordenao de determinao da seqncia

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Doenas relacionadas estrutura

protica
Fenilcetonria
Anemia Falciforme
Hipercolesterolemia Familiar
Quais as alteraes moleculares, quais as
consequncias que levam patologias

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