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<i> New York Times </ i>: "Estamos Peixe sarcopterygian:" Se voc ignorar dados contrrios - Evolution News & Views

EVOLUO NEWS 2013/02/05 11:10

New York Times : "Estamos Peixe sarcopterygian," Se voc ignorar dados contrrios
Casey Luskin 25 abr 2013 10:24 | Link permanente
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Dada a sua histria antes de empurrar Tiktaalik como um cone da evoluo ( agora completamente derrubada ), o New York Times tem um fascnio evidente com a idia de que os tetrpodes (vertebrados com quatro ramificaes semelhantes a rs, aves, vacas e seres humanos) evoluram a partir de peixes. Agora, o Nmero de seo Cincia est de volta com um artigo intitulado " DNA do peixe pode explicar como Fins Virou-se para Ps ". O artigo destaca um artigo recente na Nature , informando sobre o seqenciamento do genoma do celacanto, um peixe famoso muitas vezes chamada de "fssil vivo", que descendente da linhagem de peixes que supostamente evoluram para tetrpodes. Reprter Nicholas Wades escreve que "o celacanto mais estreitamente relacionado com as pessoas do que para outros peixes", e ele cita Axel Meyer, um bilogo evolucionrio e co-autor do estudo do genoma coelocanth, que diz: "evolutivamente falando, estamos sarcopterygian peixe ". Sarcoptergeos incluem peixes pulmonados, celacanto, e "evolutivamente falando," tetrpodes como voc e eu. Meyer certo ? De acordo com a New York Times , existem duas peas principais de evidncia relevante. Em primeiro lugar, o coelocanth tem "um gene que est relacionada com os que, em espcies animais, construir a placenta," e "[t] o gene pode ter sido desenvolvida por animais terrestres para uma forma de construo da placenta". A verdadeira histria no muito interessante. De acordo com a natureza do papel, em particular uma regio de ADN associado com um Hox aglomerado de genes no genoma coelocanth apresentou homologia de sequncia com um trecho de genes Hox de DNA do gene relacionada com tetrapodes. Hox genes so conhecidos por ser amplamente conservada entre vertebrados, de modo que o facto constatou-se que a homologia entre genes Hox de DNA do gene associado atravs destes organismos no muito surpreendente. Os autores no tem certeza exatamente o que este segmento especfico do DNA faz, mas provavelmente uma regio promotora. Nos ratinhos a correspondente regio homloga est associado com Hox genes que so importantes para a formao da placenta. Ergo, ns resolvemos o mistrio de como a placenta evoluiu. Certo? No verdade. Mais uma vez, o que se encontrou foi um pouco na regio homloga do promotor de Hox genes de DNA relacionados com a estes dois tipos de organismos. Tendo em conta que ns nem sequer entender exatamente o que estes genes fazem ou como eles funcionam, obviamente, o estudo no ofereceu nenhuma discusso sobre o que mutaes podem ter fornecido uma vantagem evolutiva. No caminho evolutivo foi proposto, ou mesmo discutido. Ento no h muita carne para esta histria, que no seja um pouco agradvel regio de homologia entre duas peas comuns, funcionais de Hox DNA-gene-related. Mas, claro, DNA funcional, compartilhada poderia ser o resultado de um projeto comum e no precisa de indicar a descendncia comum ou evoluo darwiniana. O NY Times continua, oferecendo o segundo pedao de evidncia: "Outro pr-adaptao til um trecho de DNA que aumenta a atividade dos genes que dirigem a formao dos membros no embrio." Quando inserido este potenciador em ratos, de acordo com Neil Shubin, "Ele iluminou imediatamente e fez um membro quase normal." O que que ele disse? "Pr-adaptao"? A evoluo darwiniana no suposto ter alguma meta, por isso sempre que vejo esse termo eu ficar desconfiado de que h algo no-darwiniano acontecendo. Enquanto estamos discutindo o celacanto suposto "pr-adaptao" para a vida na terra, considere o paleontlogo de vertebrados Barbara Stahl escreveu sobre anatomia celacanto: [T] ele coelocanth moderno no mostra evidncias de ter ... rgos internos pr-adaptados para uso em um ambiente terrestre. O outpocketing do intestino, o que serve como um pulmo de animais terrestres, mas est presente em vestigial Latimeria . A veia que drena a sua parede arterial no retorna para o lado esquerdo do corao, como acontece em todos os tetrapodes mas ao Sinos venoso na parte de trs do corao como o faz, directa ou indirectamente, em todos excepto osteicthyans lungfishes. O corao caracteristicamente peixe-like em mostrar qualquer sinal de diviso entre os lados esquerdo e direito, e do intestino, com o seu intestino com vlvula espiral, de um tipo comum a todos os peixes, exceto os raiosbarbatanas mais avanados. Ao mesmo tempo, os paleontlogos pensavam que coelocanths, como tetrpodes ar de respirao, que teve passagens nasais abertas na cavidade da boca, mas a dissecao de Latimeria disroved essa idia. Apesar de suas barbatanas carnudas, as coelocanths no estavam mais perto do estoque ancestral de vertebrados terrestres do que as dipnoans, peixes em que narinas internas ou coanas, tambm foram mostrados para ser inexistente. (Barbara J. Stahl, Histria Vertebrate: Problemas em Evoluo , p 146 (Dover Publications, 1985).). Anatomia do coelocanth no faz um caso muito convincente para a "pr-adaptao" para a vida terrestre, mas o NY Times histria sobre gentica "pr-adaptao" no muito atraente tambm. Aqui est o que eles realmente encontrado. Um potenciador uma curta sequncia de ADN que ajuda a aumentar a transcrio de um gene, servindo como um ponto de fixao para as protenas que esto
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envolvidas no recrutamento de RNA polimerase II, e vrios factores de transcrio necessrios para transcrever o gene em RNA. O estudo mostrou que um potenciador para uma Hox genes envolvidos no desenvolvimento do fin-coelocanths tem homologia de sequncia com um potenciador est relacionado com um Hox genes envolvidos no desenvolvimento do membro, em ratinhos. Quando os investigadores inserido o coelocanth potenciador no rato, o rato aparentemente cresceu o que Neil Shubin chamado de "limbo quase normal." Na verdade, o documento tcnico no relataram o crescimento de nenhum dos membros - se "quase normal" ou totalmente normal - mas apenas um "bud membro." Mas isso apenas um detalhe - porque mesmo que um membro tinha crescido, isso no significaria muito para a evoluo darwiniana. Novamente, bem sabido que Hox genes so conservados ao longo maioria dos vertebrados, incluindo peixes (como o celacanto) e tetrpodes (como ratos). Neste caso, o potenciador geneticamente homloga nos dois organismos parece ter tido um similar, funo homloga bem como: em que coelacanthe reforada uma Hox genes para a construo de aletas, e em ratinhos reforada uma Hox genes de membros de construo. Esta semelhana de funo e papel gentico torna surpreendente que que estes intensificadores tinha uma sequncia de ADN similar. A similaridade de funo, o papel gentico e seqncia de DNA , portanto, interessante, mas no excessivamente surpreendente descobrir que tipo de funcionou quando inserida em um mouse. Mas a evoluo o que tem a ver com tudo isso? O experimento funcionou por causa de semelhanas funcionais e genticas entre o enchancer celacanto eo enchancer mouse. Mais uma vez, tais semelhanas de seqncia e funo pode ser explicado pelo projeto comum e no necessariamente nos dizer muito sobre a descendncia comum. Dados Imunoglobulina inconvenientes Ento o que devemos fazer com o NY Times declarao de que "o celacanto mais estreitamente relacionado com as pessoas do que para outros peixes" ou que so peixes sarcopterygian "Bem, o artigo no mencionou uma importante pea de evidncia de o genoma coelocanth que contradiz as alegaes. De acordo com o estudo na Nature , "O peixe [coelocanth] o primeiro de vertebrados encontrados para genes falta de imunoglobulina M [IgM], uma protena do sistema imunolgico quase universal." Isso um pouco estranho, mas fica muito estranho. De acordo com o documento tcnico: Genes IgM no pode ser encontrada em coelacanthe, apesar de uma procura exaustiva dos dados da sequncia de celacantos, e embora todos os outros componentes principais do sistema imune esto presentes. Em vez disso, encontramos dois genes IGW; genes de imunoglobulinas que so encontrados apenas em peixes pulmonados e os peixes cartilaginosos e acredita-se ter originado no ancestral de vertebrados com mandbula, mas posteriormente perdido em telesteos e tetrpodes. (Amemiya et al., " O genoma do celacanto Africano fornece insights sobre a evoluo dos tetrpodes ", Nature , vol. 496:311-316 (18 abr 2013) (citaes internas omitido).) Isto significa que, se fssemos para a construo de uma rvore filogentica dos vertebrados com base no gene IGW, obteramos uma rvore bizarro que dramaticamente conflitos com a rvore dos vertebrados padro. Para entender por que, em primeiro lugar vamos olhar para a filogenia dos vertebrados padro, mostrado na Nature papel:

Figura A: . Reproduzido da Figura 1, Amemiya et al, " O genoma do celacanto Africano fornece insights sobre a evoluo dos tetrpodes ", Nature , vol. 496:311316 (18 de abril de 2013). Imagem usada sob uma licena Creative Commons, Atribuio-Uso No-Comercial 2.5. Uso no se destina a implicar endosso pelos autores / criadores da imagem. Esta filogenia padro poderia ser simplificado para algo parecido com isto:

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Figura B: Uma verso simplificada da filogenia dos vertebrados padro. Mas de acordo com os dados IGW, muito grosso modo, a filogenia dos vertebrados deve ser algo parecido com isto:

Figura C: Um esboo muito aproximada do que a filogenia dos vertebrados pode parecer baseado no gene IGW. Compare Figuras B e C. Voc v a diferena? Na filogenia padro (Figura B), tetrpodes (como voc e eu) so muito mais intimamente relacionado com o coelocanth ou peixes pulmonados que estamos a pescar actinoptergeo (como o peixe). Mas em uma rvore baseado IGW (Figura C), tetrpodes deve ser muito mais intimamente relacionado com peixinho que ao coelocanth ou peixes pulmonados. Isso surpreendente e inesperado - se voc um defensor da descendncia comum. Como que a Natureza papel explicar esses dados filogeneticamente incongruentes? Na passagem que citei acima, a explicao que "genes de imunoglobulinas que so encontrados apenas em peixes pulmonados e os peixes cartilaginosos e acredita-se ter originado no ancestral de vertebrados com mandbula, mas posteriormente perdido em telesteos e tetrpodes." Claro que isso requer alguns eventos extremamente parcimonioso e improvvel. Desde IGW encontrado em vertebrados to diversos como peixes pulmonados e os peixes cartilaginosos (por exemplo, os tubares), uma viso evolucionista darwinista seria inferir que o gene para IGW estava presente no ancestral de todos os vertebrados com mandbula. Se sim, ento IGW deve ter ficado em torno de vertebrados tempo suficiente para acabar na linha sarcopterygian. Mas a teoria de alguma forma evolutiva deve explicar por que os tetrpodes e todos os telesteos no possuem este gene. Talvez a perda de IGW em tetrapodes no muito difcil de explicar - talvez IGW foi perdida nas fases iniciais da linha que ramificavam outros sarcoptergeos e levou a tetrapodes. Mas, com telesteos, esta histria muito mais difcil de acreditar. De acordo com a explicao evolucionista padro, este antigo grupo de vertebrados divergiram e comeou a diversificar antes do sarcoptergeos (peixes pulmonados, coelocanths, e, finalmente, os tetrpodes) ramificou-se. Uma vez que os peixes pulmonados e coelocanths ter IGW, de alguma forma IGW estava perdido em todos os telesteos conhecidos, independentemente , e depois a linha que levou a sarcoptergeos ramificou-se, de modo que hoje todos os telesteos no possuem este gene. Esta histria evolutiva altamente unparsimonous a nica maneira (ea forma como a Natureza papel escolhe) para explicar por que telesteos e tetrpodes falta IGW, mas os peixes pulmonados e os celacantos no. A conta mais simples e plausvel das relaes vertebrados sugeriria uma filogenia (Figura C), que totalmente incompatvel com a filogenia dos vertebrados padro. No admira que os New York Times decidiu no mencionar este ponto de dados inconveniente que surgiu a partir do genoma coeolocanth: sugere o celacanto no "mais estreitamente relacionado com as pessoas do que para outros peixes", e que "somos" - sim, grande surpresa - e no "peixe sarcopterygian". Imagem: Museu de Histria Natural de Viena, na ustria / Wikicommons.

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Texto original According to the standard evolutionary account, this ancient group of vertebrates diverged and began to diversify before the sarcopterygians (lungfish, coelocanths, and ultimately tetrapods) branched off.
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