Universidade Tiradentes Mestrado em Biotecnologia Industrial Biologia Molecular I

Prof. Odir Dellagostin

Woese 1978 3 domnios

O QUE UM GENE?
Toda sequncia nucleotdica necessria

e suficiente para a sntese de um polipeptdeo ou de uma molcula de RNA estvel.

DNA BACTERIANO

ESTRUTURA DE UM GENE DE PROCARIOTO

Promotor

Regio Codificadora

Terminador

Promotor

Regies Codificadoras

Terminador

OPERON

ESTRUTURA DE UM GENE DE PROCARIOTO

Fita Codificadora: orientao 5 3 Fita Molde: orientao 3 5

ESTRUTURA DE UM GENE DE EUCARIOTO

DNA

Promotor

Regio Codificadora

Stio de PoliA

hnRNA

Intron
AAAAAAAAAA

RNA

Exon
mRNA
AAAAAAAAAA

ESTRUTURA DE UM GENE DE EUCARIOTO

GENES CPIAS, PARLOGOS OU ORTLOGOS

30% de identidade ao longo de 60% de sua seqncia

O QUE GENOMA?
o conjunto de genes de um

organismo

CARACTERSTICAS DE GENOMAS DE PROCARIOTOS

Ausncia de um complemento diplide de genes (mutaes) Uso de quase todo o genoma na codificao e na regulao (superposio) Colinearidade dos genes e seus produtos proticos Tendncia de apresentar genes codificando funes relacionadas agrupados (operons) Existncia de elementos genticos mveis (plasmdios, bacterifagos e transposons)

Uso de quase todo o genoma na codificao e na regulao

COLIARIDADE DOS GENES E SEUS PRODUTOS PROTICOS

ORGANIZAO DOS GENES EM OPERONS

- Nmero varivel de regies codificadoras - Regies intercistrnicas variam de 1 a 40 pb - Aproximadamente 20 a 30% dos genes esto em operons

Promotor

Regies Codificadoras

Terminador

OPERON

ELEMENTOS GENTICOS MVEIS

ELEMENTOS GENTICOS MVEIS

Plasmdios Molcula de DNA circular, extracromossomal, autorreplicativa encontrada em bactrias Bacterifagos Vrus de bactrias

Transposons Genes mveis

TRANSPOSONS BACTERIOFAGO

PLASMDIO

VETORES PLASMIDIAIS PLASMDIOS

Molcula

de DNA circular, fita dupla, extracromossomal, que ocorre naturalmente em bactrias e algumas leveduras

Tamanho: 1 a 1000 kb

PLASMDIOS

Nmero de cpias
-Plasmdios multicpia; - Plasmdios cpia nica (baixo nmero de cpias)

REGULAO Nmero de cpias; Segregao da diviso celular

PLASMDIOS
Funes

codificadas por plasmdios

Toxinas (Ex. Shigella) Adesinas (Ex. E. coli) Bacteriocinas Bacteriocinognicos Resistncia a antibiticos Plasmdios R

INTEGRATIVO

REPLICATIVO

PLASMDIOS

PLASMDIOS CONJUGATIVOS

Plasmdio F

Conjugao entre cepa F+ e FConjugao entre cepa Hfr e F

Hfr = High Frequency of Recombination

PLASMDIOS

PLASMDIOS - CONJUGAO

BACTERIFAGO
Vrus que infectam bactrias

BACTERIFAGOS

Virulentos (ciclo ltico) infeco, replicao e liberao das partculas virais aps lise celular Temperados (ciclo lisognico) integrao do fago ao cromossomo da clula hospedeira (pr-fago)

Ciclo Ltico e Ciclo Lisognico

TRANSDUO

Mecanismo de transferncia de genes de uma clula bacteriana para outra mediada por um bacterifago.

GENOMAS J SEQUENCIADOS

Fontes de informao GenBank www.ncbi.nlm.nih.gov/genomes

TIGR www.jcvi.org

TAMANHO ESTIMADO DO GENOMA DE DIFERENTES ORGANISMOS

Tamanho relativo dos genomas

Mapa do Genoma de Leptospira

GENOMA DE Escherichia coli K12

Tamanho: 4.639.221 pb Nmero de genes: 4.300 ORF mais longa: 7.149 pb (2.383 aa) 87% corresponde a genes ou ORFs 11,4% corresponde a regies intergnicas ou seqncias reguladoras Elementos transponveis: 10 tipos diferentes de IS

GENES X ORFs

Gene: seqncia que codifica para uma protena ou RNA conhecidos ORF = open reading frame (fase de leitura aberta): seqncia de nucleotdeos que potencialmente pode codificar para uma protena

Domnio Eukarya
Reinos
Protistas (protozorios e leveduras) Fungi (fungos) Plantae (vegetais) Animalia (animais)

Estrutura e expresso de um gene eucaritico

Tamanho mdio dos genes

E. coli 0,9 kb S. cerevisiae 1,4 kb D. melanogaster 11,3 kb H. sapiens 19,2 kb

Algumas informaes sobre ntrons

3,7 ntrons por kb de regio codificadora No homem o nmero mdio de 5 ntrons por

gene 94 % dos genes contm ntrons O tamanho mdio dos ntrons de 125 pb O tamanho mdio dos xons de 90 a 120 pb (30 a 40 aa)

Genomas Eucariticos Aspectos Gerais

Genoma nuclear (gDNA) Genoma de organelas (mtDNA e ctDNA) Geralmente diplides (2 conjuntos de cromossomos) Podem ser haplides (leveduras e alguns fungos) ou poliplides (3 ou mais cpias de cada cromossomo)
Examples of Polyploid Crops Triploid crops: banana, apple, ginger, watermelon, citrus[9] Tetraploid crops: durum or macaroni wheat, maize, cotton, potato, cabbage, leek, tobacco, peanut, kinnow, Pelargonium Hexaploid crops: chrysanthemum, bread wheat, triticale, oat, kiwifruit[10] Octaploid crops: strawberry, dahlia, pansies, sugar cane

Contedo de DNA por genoma haplide (Valor C)

Paradoxo do Valor C
a impossibilidade de correlacionar o tamanho

do genoma (valor C) com a complexidade das caractersticas morfolgicas, fisiolgicas e comportamentais do organismo.
Diferentes genomas apresentam quantidades de

seqncias repetidas

Nmero de protenas nmero de genes

Gerao de mltiplas cpias de RNA a partir de um nico gene

Gene da protena 4.1 de eritrcitos humanos

Complexidade dos genomas

Organismo Frao do Genoma ocupada pelos Genes Densidade gnica (kb/gene)

E. coli Levedura Drosophila Homem

90% 72% 13,4% 3%

1,1 2,1 9 50

Famlias gnicas
25 a 50% dos genes so de cpia nica Famlia gnica: > 40% de identidade (parlogos)
Genes que codificam tRNAs: > 1300 cpias no homem Genes que codificam rRNA (rDNA): de 100 a 200 cpias

por genoma Genes que codificam histonas: 300 a 1.000 cpias

Seqncia de DNA repetitivo

Frao de reassociao rpida
DNA de seqncia simples Seqncia curta (5 a 10 pb) repetida milhares de vezes,

em tandem. Representa 10 a 15% do DNA

Frao de reassociao intermediria

Transposons Retrotrasposons Retroposons LINES SINES

Retrotransposons (similares a retrovrus)

Possuem LTRs 500 pb Tamanho de 5 a 9 kb 8,3% do genoma Possuem o gene gag (capsdio) e o pol (polimerase)

Retroposons (similares a mRNA celular)

LINES (> 10.000 cpias, > 5 kb, codificam para

transposase, transpem com freqncia, 20% do genoma humano)

SINES (> 100.000 cpias, < 500 pb, no codificam para

transposase, transpes com freqncia, 13,6% do genoma)

TRANSPOSONS

So segmentos lineares de DNA capazes de mudar de posio dentro do genoma.

Barbara McClintock - 1948

CARACTERSTICA DE UM TRANSPOSONS

Possuem seqncias similares em ambas extremidades (repeties terminais, geralmente invertidas); Carregam genes transport-lo; que codificam enzima capaz de

Geram duplicao do stio de insero no DNA alvo.

TIPOS DE TRANSPOSONS
Seqncia de Insero (IS) Transposon simples que codifica apenas para a transposase Transposon complexo Contm outros genes alm dos genes responsveis pela transposio