Escolar Documentos
Profissional Documentos
Cultura Documentos
Florianópolis
2011
Catalogação na fonte pela Biblioteca Universitária da
Universidade Federal de Santa Catarina
Inclui referências
________________________
Prof. Patrick Kuo-Peng, Dr.
Coordenador do Programa de Pós-graduação em Engenharia Elétrica
Banca Examinadora:
________________________
Prof. Dr. José Marino Neto,
Orientador
Universidade Federal de Santa Catarina
________________________
Prof. Dr. Fernando Mendes de Azevedo,
Co-Orientador
Universidade Federal de Santa Catarina
________________________
Profa. Dra. Cinthia Itiki,
Universidade de São Paulo
________________________
Prof. Dr. Renato Garcia Ojeda,
Universidade Federal de Santa Catarina
________________________
Prof. Dr. Eros Comunello
Universidade do Vale do Itajaí
________________________
Prof. Dr. Jefferson Luiz Brum Marques
Universidade Federal de Santa Catarina
A todos aqueles que contribuíram para
o nascimento dessa fagulha de saber
que habita em meu peito.
AGRADECIMENTOS
SUMÁRIO ......................................................................................... 25
1. INTRODUÇÃO ................................................................. 27
1.1. JUSTIFICATIVA ......................................................................... 30
1.2. OBJETIVOS ................................................................................. 31
1.2.1. Objetivos Específicos .................................................................. 31
2. FUNDAMENTAÇÃO TEÓRICA ................................... 33
2.1. INTRODUÇÃO ............................................................................ 33
2.2. MÉTODOS DE ETOGRAFIA ..................................................... 37
2.3. PROCESSAMENTO DE IMAGENS ........................................... 42
2.4. DESCRITORES MORFOLÓGICOS E CINEMÁTICOS ............ 45
2.5. REDES NEURAIS ARTIFICIAIS ............................................... 48
2.6. AVALIAÇÃO DA GENERALIZAÇÃO ...................................... 50
2.7. AVALIAÇÃO DO DESEMPENHO DE IDENTIFICAÇÃO ....... 52
2.8. PRÉ-SELEÇÃO DOS PARÂMETROS DE ENTRADA ............. 57
3. MATERIAIS E MÉTODOS ...................................................... 59
3.1. PROTOCOLO EXPERIMENTAL ............................................... 59
3.1.1. Ambiente Experimental .............................................................. 59
3.1.2. Animais ........................................................................................ 60
3.1.3. Soluções e doses administradas .................................................. 60
3.1.4. Administração das Drogas ......................................................... 61
3.1.5. Catálogo de Comportamentos .................................................... 62
3.2. ETHOWATCHER® ..................................................................... 64
3.3. DESCRITORES COMPORTAMENTAIS ................................... 68
3.4. ATRIBUTOS DE ESTATÍSTICA DESCRITIVA ....................... 72
3.5. TREINAMENTO E AVALIAÇÃO DAS REDES NEURAIS
ARTIFICIAIS ................................................................................................. 75
3.6. VALIDAÇÃO DA PRÉ-SELEÇÃO DOS DESCRITORES
COMPORTAMENTAIS ................................................................................ 78
3.6.1. Grupo de atributos pré-selecionados ......................................... 81
3.6.2. Grupos de atributos de controle ................................................ 83
3.7. AVALIAÇÃO DOS DESCRITORES .......................................... 85
4. RESULTADOS ................................................................. 89
4.1. INTRODUÇÃO ............................................................................ 89
4.2. PRÉ-SELEÇÃO DE PARÂMETROS .......................................... 89
4.3. IDENTIFICAÇÃO DOS COMPORTAMENTOS ....................... 92
4.4. AVALIAÇÃO DOS ÍNDICES DE DESEMPENHO ................... 98
5. DISCUSSÃO ................................................................... 101
6. CONCLUSÕES ............................................................... 109
7. DESENVOLVIMENTOS FUTUROS ........................... 111
APÊNDICE A – ETHOWATCHER® .......................................... 113
APÊNDICE B – VALIDAÇÃO DOS DESCRITORES ............... 121
TESTE 01 – ESTABILIDADE DOS DESCRITORES EM OBJETOS
PARADOS ................................................................................................... 122
TESTE 02 – DISTÂNCIA PERCORRIDA REAL E ESPERADA ............. 124
TESTE 03 – ORIENTAÇÃO DO OBJETO E VARIAÇÃO ANGULAR ... 127
CONCLUSÕES ............................................................................................ 128
REFERÊNCIAS .............................................................................. 129
1. INTRODUÇÃO
1.1. JUSTIFICATIVA
1.2. OBJETIVOS
2.1. INTRODUÇÃO
A B
Figura 4. Modelos animais usados no estudo da emoção e ansiedade: Campo
Aberto (A) e Labirinto Elevado em Cruz (B) [35]
35
A B
Figura 6. Imagens do rastreamento da atividade de dois ratos na arena de
campo aberto. A imagem A ilustra o animal ingênuo ao tratamento,
enquanto a imagem B ilustra o animal tratado com uma droga
estimulante (cafeína)
A B
Figura 7. ACTIMOTIL (A) e PAS (B).
Fonte: Imagens obtidas dos catálogos de seus fabricantes [9][10].
(1)
(2)
54
(3)
(4)
(5)
56
Onde:
(6)
3.1.2. Animais
3.2. ETHOWATCHER®
(7)
70
Comportamentos
Descritores
usados Exploração Limpeza
Locomoção Imobilidade
Vertical corporal
Mediana, Mediana, e Desvio -
Área do
Coeficiente de Erro padrão da padrão
Animal variação média
Mediana, Média, e Desvio Erro
Comprimento
Desvio padrão Erro padrão da padrão padrão da
do animal média média
Mediana, e Média, e Média, e Média, e
Distância
Desvio padrão Erro padrão da Desvio Desvio
Percorrida
média padrão padrão
Mediana, e Mediana, e Média, e Mediana,
Número de Desvio padrão Erro padrão da Erro padrão e
pixels média da média Erro
alterados padrão da
média
Quadro 4. Atributos estatísticos de cada descritor morfológico/
cinemáticos selecionados pela prova estatística para a diferenciação
entre as categorias comportamentais
Descritores Comportamentos
usados Exploração Limpeza
Locomoção Imobilidade
Vertical Corporal
Ângulo Média, Mediana, Assimetria -
Coeficiente Assimetria
de variação
Área Curtose Média, Mediana Média
Curtose
Comprimento Curtose Assimetria Mediana Assimetria
do animal
Distância Assimetria Mediana Curtose Assimetria
percorrida
Número de Curtose Média Curtose Curtose
pixels alterados geométrica
Variação Média, Assimetria Assimetria Média
Angular Desvio
padrão
Quadro 5. Grupo de Controle II - Complemento da Pré-seleção
4. RESULTADOS
4.1. INTRODUÇÃO
Figura 26. Índices AUC dos classificadores nas 10 dobras da validação cruzada
estratificada do comportamento de Imobilidade, por grupo de atributos usado
91
Figura 27. Índices AUC dos classificadores nas 10 dobras da validação cruzada
estratificada do comportamento de Limpeza Corporal, por grupo de atributos
usado para treinar as RNAs. (*) p < 0,05 indica diferenças significantes em
comparação com o grupo de atributos selecionados (Teste de Mann-Whitney).
Média e desvio
Locomoção 97,3 ± 2,0 90,9 ± 8,0 95,6 ± 8,0
padrão
Média e desvio
Imobilidade 95,7 ± 2,0 91,8 ± 4,0 97,3 ± 2,0
padrão
Exploração Média e desvio
94,6 ± 3,0 86,4 ± 7,0 94,6 ± 3,0
Vertical padrão
Limpeza corporal Pré-seleção 96,1 ± 0,0 75,4 ± 2,0 83,6 ± 16,0
A B
Figura 39. Imagens do rastreamento da atividade de dois ratos na arena de
campo aberto. A imagem A ilustra o animal ingênuo ao tratamento, enquanto a
imagem B ilustra o animal tratado com uma droga estimulante (cafeína)
Figura 40. Referências dos pontos da arena de campo aberto nos quais
foi medido o iluminamento
Figura 41. A distância entre o ponto em que a régua estava afixada sobre
o motor até o início do quadrado branco era de 17 cm, e a distância até o
fim da régua (fim do quadrado branco) era de aproximadamente 20 cm.
A régua foi coberta com papel preto fosco para evitar reflexões de
iluminação. Para controlar o motor foi utilizada uma fonte de tensão
regulável. Testaram-se três níveis de velocidades: 212,59 graus/segundo
(0,74 m/s); 469,56 graus/segundo (1,67 m/s), e 739,73 graus/segundo
(2,61 m/s). Uma marca foi adicionada ao fundo da arena para simbolizar
o ponto de contagem do início e fim de cada volta, destacado por um
circulo pontilhado da Figura 41.
CONCLUSÕES
WEB: http://www.statsoft.com/textbook/.
[89] FREUND, J. E.; SIMON, A. G. Estatística aplicada:
economia, administração e contabilidade. Tradução de
Alfredo A Farias. 9. ed. Porto Alegre: Bookman, 2000.
[90] KAZMIER, L. J. Estatística aplicada à administração e
economia. Tradução de Adriano Silva Vale Cardoso. 4.
edição. ed. Porto Alegre: Bookman, 2007, p. 392.
[91] KOHAVI, R. A study of cross-validation and bootstrap for
accuracy estimation and model selection. Proceedings of the
14th international joint conference on Artificial intelligence -
Volume 2. Montreal - Canada: International Joint Conference
On Artificial Intelligence. 1995. p. 1137-1143.
[92] GONZALEZ, L. P.; ARNALDO, C. M. Classification of
drug-induced behaviors using a multi-layer feed-forward
neural network. Comput Methods Programs Biomed, v. 40, n.
3, Jul 1993, p. 167-73.
[93] SIEGEL, S. Estatística não-paramétrica para as ciências do
comportamento. Tradução de Alfredo Alves Farias e Eva
Nick. Sao Paulo: McGraw-Hill do Brasil, 1981.
[94] SHAPIRO, S. S.; WILK, M. B. An Analysis of Variance Test
for Normality (CompleteSamples). Biometrika, v. 52,
Dezembro 1965, p. 591-611.
[95] ROYSTON, P. Remark AS R94: A Remark on Algorithm AS
181: The W-test for Normality. Journal of the Royal
Statistical Society, v. 44, 1995, p. 547-551. Series C (Applied
Statistics).
[96] LILLIEFOR, H. W. On the Kolmogorov-Smirnov Test for
Normality with Mean and Variance Unknown. Journal of the
American Statistical Association, v. 62, n. 318, Junho 1967,
p. 399-402.
[97] GARCIA, V. A.; CRISPIM-JUNIOR, C. F.; MARINO-
NETO, J. Assessment of observers' stability and reliability - a
tool for evaluation of intra- and inter-concordance in animal
behavioral recordings. Proceedings of 32nd Annual
International Conference on the IEEE EMBS. Buenos Aires:
IEEE, 2010, p. 6603-6606.