Aula 1: O que é um vírus?

Fabrício S. Campos
camposvet@gmail.com

Equipe de Virologia –
UFRGS & IPVDF
Site:
www.ufrgs.br/labvir

1
 A árvore da vida

• Onde estão vírus?

• Por que eles “não fazem” parte da árvore da

vida?

2
Fonte: Pepper et al., 2011
Vivemos em uma “nuvem” de vírus

3
Infectam todas as formas de vida

4
Nós comemos e

respiramos vírus

5
Nós carreamos genomas virais como
parte do nosso próprio genoma

6
 Cada uma de nossas células está
infectada por vírus
• Retrovírus endógenos: elementos virais
derivados de retrovírus

• Traços de infecções virais ocorridas a milhares de

anos integrados no genoma humano

Dewannieux et al., 2006

7
Surto de ebola na África

8
Surto de ebola na África

9
 Todos os vírus causam danos?
Colonizada
Vírus da
Curvularia
tolerância
Thermal
termal da
Tolerance
Temperatura Curvularia
Virus
55oC
Não
colonizada

Curvularia
protuberata

10
 Tulip breaking virus (TBV)
 Pétalas “anormais”
 Quebras de cor
 Não forma pigmento em
partes da flor

11
 O quão infectados estamos?
• HSV‐1, HSV‐2, VZV, EBV, HCMV, HHV‐6, HHV‐7,
HHV‐8
• Permanecem no organismo por toda a vida

12
 Objetivo da aula

• Apresentar a denominação, a classificação,

os tipos de genomas e um pouco do que se

conhece sobre a estrutura e a replicação viral

13
 Escopo da aula

• Uma breve introdução a classificação e a

estrutura viral

• Etapas da replicação viral

• Tipos de genoma

14
Definição Classificação Estrutura

Replicação Viral Tipos de genoma

15
Definição Classificação Estrutura

Replicação Viral Tipos de genoma

16
 O que é um vírus?
• Muito pequenos, infecciosos

• Parasita intracelular obrigatório

• “Partículas químicas” que não podem se

reproduzir sozinhas

• Necessitam de um hospedeiro celular

17
 Os vírus são muito pequenos
Átomo de carbono

Ribossomos
HIV-1 Fago
TMV

E. coli Poliovírus

Miosina Actina
1.000.000 X
100.000 X

18
 Os vírus gigantes
• Mimivírus, mamavírus

• Megavírus, pandoravírus

• Infectam amebas

• Genomas de 1,2 a 2,8 Mb

• Sputnik: virófago

• Alterando o conceito sobre vírus!!!

Raoult et al., 2004; La Scola et al., 2008; Philippe et al., 2013
19
 Descoberto vírus gigante congelado
há mais de 30 mil anos na Sibéria

Pithovirus sibericum Fonte: PNAS: Legendre, M. & Bartolia, J. et al., 2014 20

 Pithovirus sibericum
• 30 metros de profundidade solo congelado

da tundra ártica, Chukotka na Sibéria, Rússia

• Temperatura média anual -13,4oC

• Datação por radiocarbono (carbono 14)

• 30 mil anos (mamutes e neandertais)

21
 Pithovirus sibericum
• Vírus com grande nucleocitoplasmatico

• Vírus DNA, 610 Kb

 467 proteínas diferentes

• 1,5 µm (microscópio óptico)

• Hospedeiro: Acanthamoeba

22
Definição Classificação Estrutura

Replicação Viral Tipos de genoma

23
 Classificação dos vírus

• Natureza e sequencia de ácido nucleio

• Simetria ou forma do capsídeo
• Presença ou ausência de envelope
• Dimensão do virion ou capsídeo

24
 Classificação dos vírus
• ICTV: Comitê Internacional de Taxonomia de
Vírus
• + de 40.000 vírus isolados de bactérias,
plantas, animais e alocados em 7 ordens, 96
famílias, 420 gêneros e 2618 espécies
• No oceano há cerca de 1030 vírus

25
26
Vírus influenciam a dinâmica das
populações de plâncton
• Os fito plâncton tem um papel importante
no ciclo de carbono
• Vírus infectam organismos marinhos,
entre eles os fito plâncton
• Esta infecção resulta em lise celular e
liberação de novas partículas
• Controlando a população, principalmente
em aumentos sazonais (“spring blooms”)
Rhodes et al., 2008
27
Biomassa dos vírus > dos elefantes

>

28
Definição Classificação Estrutura

Replicação Viral Tipos de genoma

29
 Estrutura de um vírus
• Ácido nucleico: DNA ou RNA
• Capsídeo: do latim “capsa” significa caixa
• Nucleocapsideo: ác nucleio + capsídeo
• Matrix: proteína que preenche o espaço
entre o capsideo e o envelope
• Envelope: membrana viral
 Derivado da membrana do hospedeiro

30
 Estrutura de um vírus

• Virion: partícula viral infecciosa

31
 Os capsídeos são metaestáveis
• Devem proteger o genoma (estável)
• E liberá-lo rapidamente durante a infecção
viral (instável)

32
 Simetria do nucleocapsídeo
• Icosaédrica, cúbica ou helicoidal

Adenovírus Influenza Vírus da Raiva

DNA, ñ envelopado RNA, envelopado RNA, envelopado

33
Simetria do nucleocapsídeo - ebola

34
 “Entendendo” os vírus
• Vírus dependem de seus hospedeiros
para sobreviver
Se são muito bem sucedidos e matam
seus hospedeiros, eles podem ser
eliminados
Se eles forem muito passivos e a defesa
do hospedeiro impedir o seu crescimento,
eles podem ser eliminados

35
Definição Classificação Estrutura

Replicação Viral Tipos de genoma

36
 Replicação
• Replicação em biologia
– Síntese de moléculas
de ácidos nucléicos

X
• Em virologia
– Todo o processo de
multiplicação viral

37
Vírus replicam num ambiente hostil
• Qual o objetivo da replicação?
• Produzir progênie viral viável
• Consequências
– “Nenhuma” (maioria dos vírus)

– Doença (Hepatites virais)

– Morte do hospedeiro (HIV)

38
 Alguns conceitos
• Infecção produtiva
– Produção de progênie viral viável
• Infecção abortiva
– Ciclo replicativo interrompido
• Susceptibilidade (receptor)
– Capacidade das células de serem infectadas
• Permissividade (enzimas)
– Ocorrência de multiplicação viral

39
 Aplicação prática
Tabela 1 - Consequências da infecção de espécies de ruminantes com BoHV-1.

Fonte: J. Thiry et al., 2006.

 Veados e renas: células são apenas suscetíveis

 Não permitem a replicação viral: não permissivas

 Receptores: conferem a características aos vírus de

serem espécie-específicos

40
 Mais conceitos
• Espectro de hospedeiro
– Conjunto de espécies animais ou de
diferentes células
• Tropismo
– Predileção por células ou tecidos
• Presença de receptores
• Ex.: H5N1 se liga aos receptores de ác siálico-
galactose

41
 Ácido siálico: receptor influenza

Memb
celular

Ligação α-2,3 (aves)

• Humanos: ligação α-2,6

• Suínos: possuem ambas as ligações

42
 Etapas da replicação
1. Adsorção
2. Penetração
3. Desnudamento
4. Expressão gênica
5. Replicação do genoma
6. Montagem
7. Liberação

43
Fases de infecção vírus lítico

44
Vírus lítico

45
Vírus lítico

46
 1. Adsorção
• Ligação específica das partículas víricas
na superfície das células hospedeiras

Proteínas de superfície
dos vírions (VAPs) Receptores celulares
Vírus nú: proteínas do Proteínas
capsídeo (glicoproteínas)
Vírus envelopados: Carboidratos
glicoproteínas

47
1. Adsorção

48
 1. Adsorção
• Vírus que utilizam receptores específicos
– Rinovírus, poliovírus, FMDV
• Vírus que utilizam receptores alternativos
– Herpesvírus, togavírus (rubéola)
– Vantagem evolutiva ?!?
• Receptores virais
– Ác siálico (Influenza), CD4 (HIV)

49
 1. Adsorção
• Co-receptores: auxiliam na interação
– HIV: o complexo gp120 – gp41 vai se ligar
ao receptor CD4

– E os receptores de citocinas vão atuar

como co-receptores celulares (CXCR4,
CCR5)

50
Co-receptores (HIV: CXCR4, CCR5)

51
 2. Penetração
Passagem do vírus pela
membrana plasmática

A) Fusão com a memb. plasmática

B) Fusão após endocitose mediada

por clatrina

C) Fusão após endocitose mediada

por caveolina

D-E) Penetração após endocitose

mediada por lipídios

52
2. Penetração

53
 3. Desnudamento
• Série de eventos que ocorre após a
penetração
• Exposição do genoma para transcrição /
tradução
• Estar acessível as enzimas
• Vírus DNA: penetração do genoma nos
poros nucleares

54
 Vírus
RNA

Vírus
DNA 55
Definição Classificação Estrutura

Replicação Viral Tipos de genoma

56
 4. Expressão gênica
• Os genomas virais de DNA ou RNA são
estruturalmente diversos
– linear
– circular
– segmentado
– Fita única de polaridade (+)
– Fita única de polaridade (-)
– Fita dupla
– Fita dupla parcial

57
 4. Expressão gênica
Classificação de Baltimore (1975)

Vírus de DNA fs

Síntese da outra fita

Vírus de DNA fd (±) Intermediário
de DNA fd

Transcrição
Transcrição reversa

Transcrição fita (-) Retrovírus

mRNA RNA fs (+)
Pode ser usado (sentido +)
diretamente
Transcrição fita (-)

Vírus de
Vírus RNA fs (+) Vírus RNA fs (-) RNA fd (±)
58
Fonte: Madigan, 2004.
Qual informação é codificada em um genoma
viral?
• Produtos de genes e sinais de regulação para:

 A replicação do genoma viral

 Montagem e empacotamento do genoma

 Regulação do ciclo de replicação

 Modulação de defesas do hospedeiro

 Disseminação para outras células e hospedeiros

59
 Qual informação NÃO é codificada em um
genoma viral?
• Não possuem genes que codificam a síntese
completa de proteína
– dependem da maquinaria celular

• Não possuem genes que codificam proteínas

envolvidas na produção de energia ou na
síntese de membrana

• Não possuem genes que codificam centrômeros

ou telômeros encontrados nos cromossomos

60
 5.1. Replicação vírus DNA
• Replicação no núcleo
– Exceção: poxvírus (replicam no citoplasma)

• DNA fita dupla: dsDNA (Classe I) maioria

• DNA fita simples: ssDNA (Classe II)
• DNA parcialmente dupla: pdsDNA (Classe
VII)

61
 Genomas dsDNA: DNA fita dupla
Traduzido

Transcrito Transcrito

Replicado

• Genoma copiado pela DNA polimerase do hospedeiro ou pela

DNA polimerase viral
• Genes iniciais: codificam proteínas não estruturais
• Genes tardios: codificam proteínas estruturais
• Ex.: Poliomavírus, papilomavírus, adenovírus, herpesvírus

62
 Genomas ssDNA: DNA fita simples
Traduzido

Transcrito

Replicado
Replicado

• NÃO codificam a DNA polimerase

• Toda replicação é realizada pela polimerase do hospedeiro
• Tb codificam proteínas estruturais e ñ estruturais
• Ex.: Circovírus (TT vírus), parvovírus (Parvivírus B19)

63
 Genomas pdsDNA – fita parcialmente dupla
Traduzido

Transcrito

Replicado Replicado
Replicado
Transcrito

Transcriptase reversa

• Replicação parte núcleo e parte no citoplasma

• Expressão gênica: inicial, intermediaria e tardia

• Quebra do dogma da biologia: DNA => RNA =>

X Proteínas
• Ex.: Vírus da Hepatite B

64
 5.2. Replicação vírus RNA
• Replicação no citoplasma RNA fita simples
Maioria
– * Ortomixovírus: no núcleo
• As células não possuem a RNA polimerase
dependente de RNA viral
• Enzima é codificada pelo genoma viral
• Vai sintetizar o genoma de RNA e o mRNA
viral
• mRNA será lido pelos ribossomos da célula

65
 Vírus RNA
• Vírus RNA (+): genoma “infeccioso”
– Vírus RNA (+) = mRNA
• Vírus RNA (-): não “infeccioso”
• RNA fita simples (+): ssRNA (+) (Classe IV)
• RNA fita simples (-): ssRNA (-) (Classe V)
• RNA fita dupla: dsRNA (Classe III)
• RNA fita simples (+) com DNA intermediário:
ssRNA-RT (+) (Classe VI)

66
 Genomas ssRNA (+): RNA fita simples (+)
Traduzido

Replicado Replicado

• Genoma com ORF única e longa

• Origina uma poliproteína (clivada por proteases celulares e
virais)
• RNA polimerase viral: replicação do genoma num
intermediário de RNA (-)
• Ex.: Coronavírus (SARS); Flavivírus (febre amarela, dengue,
BDVD, hepatite C); Picornavírus (febre aftosa, rinovírus,
enterovírus); Togavírus (rubéola, Encefalite equina)
67
 Genomas ssRNA (-): RNA fita simples (-)
Replicado Traduzido

Replicado
Replicado

• Trazem a replicase viral (RNA polimerase)

• mRNA sem CAP e cauda de poli A (ir no núcleo)
• Proteínas estruturais e não estruturais
Ex: Ortomixovírus (influenzavírus); Paramixovírus (parainfluenza,
sarampo, hRSV, pneumo e metapneumovpirus); Rhabidovírus
(vírus da raiva)

68
 Genomas dsRNA (+/-): RNA fita dupla (+/-)
Replicado Traduzido

Replicado

• Muitos vírus com dsRNA são segmentados

• Carregam a polimerase viral / produção de mRNA
• Transcrição primária: proteínas não estruturais
• Transcrição secundária: proteínas estruturais
• Ex.: Reoviridae: 10 a 12 segmentos (Rotavírus)

69
Genomas ssRNA (+) com DNA intermediário
Traduzido
Transcrito
Replicado Replicado

Transcriptase
reversa provírus

• Replicação no citoplasma e núcleo

• Carregam: RT, integrase, protease
• Única família: Retroviridae
• Ex.: HIV e HTLV (vírus T-linfotrófico humano)

70
Definição Classificação Estrutura

Tipos de genoma Replicação Viral

71
 6. Montagem
• Ocorre no final do ciclo replicativo

• O vírus adquiri a capacidade infectiva, ou

seja, ocorre a maturação

• Nos vírus envelopados ocorre a aquisição

do envelope

72
 7. Liberação (vírus nú)
• Vírus nú já sai pronto do citoplasma (RNA) ou núcleo
(DNA)
• Liberados quando ocorre a destruição das células
infectadas

73
 7. Liberação (vírus envelopado)
• Envelope é derivado da membrana plasmática
(bi-camada fosfolipídica)
 Genoma viral não codifica lipídios
• Envelope é formado durante o brotamento do
nucleocapsídeo através da membrana

74
 7. Liberação (vírus envelopado)
• Envelope adquirido das membranas celulares internas

75
Vídeo exemplificando a replicação do HIV

76
 Mensagens principais
• Os vírus são parasitas intracelulares
obrigatórios
• Maioria não causa dano a célula
• São muito pequenos (não visíveis ao
microscópico óptico)
• Estrutura: ácido nucleico, capsídeo e
envelope

77
 Mensagens principais
• São espécie-específicos
 afinidade pelo receptor celular

• Etapas da replicação:
 1) adsorção, 2) penetração, 3) replicação,
4) montagem e 5) liberação

• Vírion = partícula viral infecciosa

78
 Mensagens principais
• Vírus DNA: maioria fita dupla / replicação
no núcleo

• Vírus RNA: maioria fita simples /

replicação no citoplasma

• mRNA: molécula comum a todos os tipos

de vírus
79
 Mensagens principais
• Vírus de RNA polaridade positiva: genoma
infeccioso

• Envelope: adquirido da membrana plasmática

• Transciptase reversa: RNA polimerase viral

dependente de RNA viral

• Provírus: retrovírus integrado no genoma

80
Sugestões de leitura

81
 Sugestões de leitura
• Livros:
– Virologia Veterinária: Virologia Geral e Doenças Víricas. Flores, E. F.
(org.). 2a ed. Santa Maria: UFSM, 2012.
– Principles of Virology. Flint, S.J.; Enquist, L.W.; Racaniello, V.R. 3rd
ed. ASM Press, 2009.
• Artigos:
– Legendre, M. and Bartolia, J. et al. Thirty-thousand-year-old distant
relative of giant icosahedral DNA viruses with a pandoravirus
morphology. PNAS, March 3: 1-6, 2014.
– Thiry, J.; Keuser, V.; Muylkens, B.; Meurens, F.; Gogev, S.;
Vanderplasschen, A.; Thiry, E. Ruminant alphaherpesviruses related
to bovine herpesvirus 1. Vet. Res. 37:169-190, 2006.
• Blog:
– Virology blog (http://www.virology.ws/)

82
Grato pela atenção!!!

camposvet@gmail.com
Fonte: http://www.stanford.edu/group/virus/mimi/2005/Origin.htm