Introdução à bioestatística com R

Cursista: Albaro Ramon Paiva Sanz

Curso: Introdução á Bioestatística com R
Introdução

Bioestatística é uma disciplina que fornece as ferramentas necessárias para a gestão de dados biológicos,
na sua edição e análise. Uma boa gestão da bioestatística é essencial para poder responder às questões
biológicas ou ecológicas, utilizando os dados adequados, as análises necessárias e expressando os
resultados de forma concisa e clara para facilitar a sua interpretação.

Hoje, há maior acesso a grandes quantidades de dados biológicos e ambientais de boa qualidade, o que
apresenta grandes oportunidades para melhor compreender nosso frágil ambiente biológico e ecológico
em constante mudança. Porém, a correta análise desses dados continua sendo um grande desafio, e o
constante aprimoramento das técnicas torna o treinamento básico em bioestatística imprescindível para
estudantes e profissionais, a fim de se chegar às melhores conclusões possíveis baseado em dados.

R é um programa estatístico gratuito e de acesso aberto, que é continuamente atualizado e melhorado

pelos próprios usuários (ambiente colaborativo), por meio da criação e manutenção de novas bibliotecas
funcionais.

R se tornou um item obrigatório para qualquer cientista das ciências da vida e da terra, atraindo milhares
de usuários em todo o mundo. Usar R pode ser difícil no início devido à sua estrutura plana e pouco
interativa, bem como à necessidade de navegar no programa com scripts de comando. No entanto, com o
tempo, o uso de R torna-se mais fácil e repetitivo, e o programa pode oferecer a seus usuários uma ampla
gama de aplicativos. Devido à sua complexidade inicial, o R é pouco ensinado na graduação, pois os
alunos dificilmente têm familiaridade com a estatística. Em nível de graduação e profissional, R se
destaca por permitir que a estatística avançada seja tratada em um ambiente relativamente simples. Muitas
revistas científicas indexadas hoje reconhecem o R como um programa chave e preferem ou mesmo
exigem seu uso em manuscritos para publicação. Este curso é destinado a profissionais e alunos de
graduação ou pós-graduação que desejam desenvolver seus conhecimentos em bioestatística e aprender a
administrar o programa R

Assim apresenta-se a linha orientadora das e-atividades a realizar no decorrer do módulo de formação.
Constará referências a objetivos, metodologias de trabalho, atividades, recursos e avaliação.  

Objetivos e Competências

O principal objetivo do curso é fornecer aos alunos as ferramentas para editar e analisar dados biológicos
em R. Espera-se que, após a conclusão do curso, os alunos sejam capazes de:

 Gerenciar o programa R, scripts de comando, gráficos e análises.

 Edite bancos de dados biológicos (observações e variáveis).
 Conhecer a teoria da bioestatística e aplicações em R de análises descritivas e univariadas.
 Realize representação numérica e gráfica de dados e resultados.

Ambiente de Aprendizagem

A formação desenvolver-se-á no ambiente de aprendizagem suportado pela plataforma moodle, ou num

espaço virtual. O foco será centrado nesse ambiente assim como as atividades de ensino-aprendizagem.
No entanto, serão promovidas outras atividades suportadas pelas mais variadas ferramentas e ambientes
virtuais.

A interação entre professor e todos os alunos será feita, de forma assíncrona, através dos fóruns criados
para as atividades.

Por conseguinte, recomenda-se a presença dos estudantes para acompanharem suas participações nas
atividades.
Metodología

A formação terá a duração de 2 semanas (de 16 a 22 de dezembro), está organizado por temáticas. A
interação entre professor e estudantes e entre estes são efetuadas através da forma assíncrona com uso dos
fóruns partilhados na plataforma.

As atividades podem ser de natureza individual (leitura, reflexão, produção), ou em grupo (discussão)
assim sendo, neste caso concreto a comunicação é suportada pelos fóruns acedidos através da plataforma.

Roteiro de Conteúdos.

Tema 1.

✓ Introdução às estatísticas com R .

 Termos estatísticos. Estatísticas e software estatístico.

 Sobre R. Baixe R.
 A linha de comando.
 Objetos e funções.
 Criar arquivo de dados.
 Importar arquivos de dados.

Tema 2.

✓ Estatística descritiva.

 Gerenciamento de variáveis de dados.

 Estatística descritiva: resumo estatístico, geração de tabelas de frequência simples, agrupadas.
 Gerar gráficos.

Tema 3.

✓Análise de tabelas de contingência.

 Análise de regressão e correlação. Teste do qui quadrado.

 Cálculo de RR e OR. Regressão e correlação linear simples.
 Diagramas de dispersão.

Tema 4.

✓ Estatística inferencial com R.

 Estimativa de médias e proporções.

 Avaliação da normalidade.
 Testes paramétricos: t de Student para amostras independentes e relacionadas;
 Teste F para ANOVA.
 Testes não paramétricos: sinal de classificação e soma de classificação.
Sequência de e-Atividades
Introdução às estatísticas com R
Duração 16 de dezembro 2021 (2hs)
Competência - Aceder e conhecer o funcionamento do Ambiente R.
s 1ª Fase - Baixando e instalando R
2ª Fase - Funções básicas em R.  Discussão no Fórum Disponibilizado para o efeito.
Descrição
Textos:
SILVA, JF, JEAN DINIZ, and MATIAS AMÉRICO BORTOLUZZI. "Minicurso de Estatística Básica:
Introdução ao software R. 2009." (2019).
Recurso http://www.uft.edu.br/engambiental/prof/catalunha/arquivos/r/r_bruno.pdf

BATTISTI, Iara Denise Endruweit; DA SILVA SMOLSKI, Felipe Micail. Software R: Análise
estatística de dados utilizando um programa livre.
http://www.editorafaith.com.br/ebooks/grat/978-85-68221-44-0.pdf

Video
Instalação R
https://www.youtube.com/watch?v=8HQHf5XCS7g
https://www.youtube.com/playlist?list=PLqzoL9-eJTNARFXxgwbqGo56NtbJnB37A
R para iniciantes
https://www.youtube.com/watch?v=tfPsmDzS74c&list=PLyqOvdQmGdTQ5dE6hSD7ZGBu8bud70wYf

Participação da discussão em grupo.

Avaliação

Estatística descritiva.
Duração 17 de dezembro 2021 (2hs)
Competência -Resumo estatístico, geração de tabelas de frequência simples, agrupadas.
Gerar gráficos em ambiente R
s .
1ª Fase – Trabalho Individual – Leitura dos textos e visionamento dos vídeos disponibilizados na
Descrição plataforma. Reflexão sobre os conteúdos.

2ª Fase – Trabalho de Grupo – Discussão no Fórum Disponibilizado para o efeito.

Recurso Textos:
SILVA, JF, JEAN DINIZ, and MATIAS AMÉRICO BORTOLUZZI. "Minicurso de Estatística Básica:
Introdução ao software R. 2009." (2019).
http://www.uft.edu.br/engambiental/prof/catalunha/arquivos/r/r_bruno.pdf

BATTISTI, Iara Denise Endruweit; DA SILVA SMOLSKI, Felipe Micail. Software R: Análise
estatística de dados utilizando um programa livre.
http://www.editorafaith.com.br/ebooks/grat/978-85-68221-44-0.pdf

Video
Estatística descritiva
https://www.youtube.com/playlist?list=PLqzoL9-eJTNCzF2A6223SQm0rLYtw6hJE

Gráficos R
Avaliação https://www.youtube.com/playlist?list=PLqzoL9-eJTNDsdghuYR70d01YVGIBs29N

Participação da discussão em grupo.

 Apresentação do trabalho

Análise de tabelas de contingência com R

Duração 21 de dezembro 2021 (2hs)
Competência - Análise de regressão e correlação. Teste do qui quadrado.Ambiente R.
Cálculo de RR e OR. Regressão e correlação linear simples.
s

Descrição 1ª Fase – Trabalho Individual – Leitura dos textos e visionamento dos vídeos disponibilizados na
plataforma. Reflexão sobre os conteúdos.

2ª Fase – Trabalho de Grupo – Discussão no Fórum Disponibilizado para o efeito.

Recurso
Textos:
SILVA, JF, JEAN DINIZ, and MATIAS AMÉRICO BORTOLUZZI. "Minicurso de Estatística Básica:
Introdução ao software R. 2009." (2019).
Obtido de:http://www.uft.edu.br/engambiental/prof/catalunha/arquivos/r/r_bruno.pdf

BATTISTI, Iara Denise Endruweit; DA SILVA SMOLSKI, Felipe Micail. Software R: Análise
estatística de dados utilizando um programa livre.
Obtido de : http://www.editorafaith.com.br/ebooks/grat/978-85-68221-44-0.pdf

Video
Instalação R
https://www.youtube.com/playlist?list=PLqzoL9-eJTNBq-C2sh46hYIlZYJ0Z1cIB

Avaliação
Participação da discussão em grupo.

Estatística inferencial com R.

Duração 22 de dezembro 2021 (2hs)
Competência - Testes paramétricos: t de Student para amostras independentes e relacionadas; no ambiente R
- Testes não paramétricos: sinal de classificação e soma de classificação
s
1ª Fase – Trabalho Individual – Leitura dos textos e visionamento dos vídeos disponibilizados na
Descrição plataforma. Reflexão sobre os conteúdos.

2ª Fase – Trabalho de Grupo – Discussão no Fórum Disponibilizado para o efeito.

Recurso Textos:
SILVA, JF, JEAN DINIZ, and MATIAS AMÉRICO BORTOLUZZI. "Minicurso de Estatística Básica:
Introdução ao software R. 2009." (2019).
http://www.uft.edu.br/engambiental/prof/catalunha/arquivos/r/r_bruno.pdf

BATTISTI, Iara Denise Endruweit; DA SILVA SMOLSKI, Felipe Micail. Software R: Análise
estatística de dados utilizando um programa livre.
http://www.editorafaith.com.br/ebooks/grat/978-85-68221-44-0.pdf

Video
Test hipotesis
https://www.youtube.com/playlist?list=PLqzoL9-eJTNBq-C2sh46hYIlZYJ0Z1cIB

Gráficos R
Avaliação https://www.youtube.com/playlist?list=PLqzoL9-eJTNDsdghuYR70d01YVGIBs29N
 Participação da discussão em grupo.
Apresentação do trabalho

Avaliação
Atividades a realizar Resultados a alcançar
Atividade 1 Participação no fórum                                                                     25%
Atividade 2 Participação na discussão                                                                25%
Atividade 3 Participação na discussão                                                                25%
Atividade 4 Apresentação do trabalho 25%

Total 100%

Referências bibliográficas
Salmon, G. (2002). E-tivities: the key to active online learning. Taylor & Francis e-Library.
Obtido de https://etutors.wikispaces.com/file/view/Etivities_Salmon.pdf
Moreira, J. A., Henriques, S., & Barros, D. M. V. (2020). Transitando de um ensino remoto
emergencial para uma educação digital em rede, em tempos de pandemia. Dialogia, 351-364.
Amante, L., & Oliveira, I. (2019). Avaliação e feedback: desafios atuais.
Armellini, A., & Aiyegbayo, O. (2010). Learning design and assessment with e‐tivities.  British
Journal of Educational Technology, 41(6), 922-935.
Wright, P. (2015). Comparing e-tivities, e-moderation and the five stage model to the
community of inquiry model for online learning design. The Online Journal of Distance
Education and e-Learning, 3(2), 17-30.