ARIADNY AVELINO FARIAS DE ARAUJO AULA PRÁTICA: INTRODUÇÃO À

BIOINFORMÁTICA – NCBI Relatório acadêmico apresentado como requisito parcial para

obtenç ão de aprovação na disciplina Genética Geral para o curso de Engenharia
Florestal na Universidade Feder al Rural de Pernambuco, UFRPE Profª. Dr ª. Luiza Semen
RECIFE – PE 2018

Sumário 1. INTRODUÇÃO 2. OBJETIVO 3. MATERIAIS E METODOS 4. CONCLUSÃO 5.

REFERÊNCIAS

1. INTRODUÇÃO A Bioinformática surgiu da junção da Biolo gia Molecular com a

Informática a partir da necessidade de recursos compu tacionais mais eficientes para o
armazenamento, interpretação e o processamento de dados devido ao aumento
considerável na quantidade d e sequências nucleotídicas (aumento gerado pelo
desenvolvimento dos seqüenciadores automáticos de DNA). O site denominado NCBI
((National Center for Biotechnolog y Information ) apresenta dados provenientes do
sequenciamento de diversos projetos Genoma no seu GenBank, além disso também
recolhe, trat a e dispon ibiliza múltiplos outros ti pos de informação rel evantes para o
desenvolvimento d a Biotecnologia e possui um elevado índice de artigos de investigação
na área biomédica. 2. OBJETIVO O objetivo dessa aula prática foi apresentar e explorar
alguns dos mais populares recursos presentes no site do NCBI.

3. MATERIAIS E MÉTODOS a) Materiais: A aula foi realizada no Laboratório de Informática

do Departamento de Biologia da UFRPE, onde utilizou-se dos computadores disponíveis
e/ou computadores pessoais dos alunos além do acesso a internet. B) Métodos 1) Acessar o
site do NCBI. » http://www.ncbi.nlm.nih.gov/ Ao entrar no site podemos observar alguns
recursos disponíveis como: Submit (para submissão de dados ou manuscritos em algum
banco de dados do NCBI ), Download (transferir dados fornecido p elo site para o seu
computador), Analyse (identificar uma ferramento do NCBI p ara su a a tividade de
análise de dados), PubMed, Blast e Nucleotide. 2) Explorar a ferramenta PubMed.»
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/ Digitou-se palavras-chave (por ex., nome de um or
ganismo + nome d e uma proteína/gene). Utilizou-se: sugarcane + aquaporin e clicou-se no
link de um dos artigos apresentados. 3) Explorar o BLAST. »
https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi  Selecionou-se a op ção Nucleotide BLAST e na
caixa de texto, colamos a sequência abaixo e clicamos no botão BLAST.
GGTCTGGGCCTGGGCCTGGATTCTGGTGTGGTGTAGGGTAGGCGTAGATAGATGAGTG
GTCTAGGGTAGATACAGGGTAGCCAGAAGTCTGGTATATAGTATGGGGGTATAGGGTA
GGTCTGGACACCGTTTTCCACTTCGCCCTTCCCTTTCGTCGAGGGAGGACGATCTTGGC
TGGGACGGAGGTGTAGGGTAGGCTTAATTTACGATTACATGATCTGTGTCACTCTAGG
GTAGGTGAAAATCCCATATATATCTGATCACATTTGGTGAAGAGGTGGTTTGGCTGGC
GAGATGGACAAAAGTGCAATGTAGAATTATATGTGATTTTGCAAAAGTGGATGTGAAA
TTGGAAAGTCGGTTTTCCCGCACAGATGAGAGCACGTTTGAGGTGCCATGAGATGCAC
CTCTCCGAGATGACCTCAACGGTACCACCCATGTGTTGGTCGGGCTCCTGTGCGGCCGT
CCAGGGCGGGATAAGTAGAGAATGTGGTGGTGTAGGGTAGGTGACCAGGTCCAGGGT