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Para realizar o calculo do nmero aproximado de aminocidos em uma protena dividimos o peso molecular da mesma por 110, que o peso mdio de um aminocido para efeito de clculos. N de aminocidos = Peso Molecular/110 700 = Peso Molecular/110 Peso Molecular = 700 X 110 Peso Molecular = 77000 Da ou 70kDa
O que so L e D aminocidos e qual a forma presente nas protenas? Explique o que so formas primrias, secundrias, tercirias e quaternrias de protenas.
Excetuando-se a glicina, todos os aminocidos so opticamente ativos, pois o tomo de carbono um centro quiral, tambm chamado de centro assimtrico. Os aminocidos com tomos quirais podem existir como estereoismeros, ou seja, podem existir em duas disposies espaciais distintas, sendo imagens especulares que no podem se sobrepor. Estas duas disposies so chamadas de enantimeros designados ismeros L ou D. Os prefixos L e D correspondem a configurao absoluta dos constituintes em torno do carbono quiral. A forma presente nas protenas sempre a forma L. Estrutura Primria: so as seqncias de aminocidos que compem as cadeias polipeptdicas. As ligaes peptdicas entre estes aminocidos da seqncia primria so ligaes covalentes e levam a restries conformacionais. A ligao peptdica tem um carter de dupla ligao, e no pode ser rotacionada. Os quatro tomos dos grupamentos ficam dispostos em um plano rgido Estrutura Secundria: so as estruturas bidimensionais formadas pelos resduos de aminocidos. Estes que vo determinar o padro de dobramento da molcula, As hices e folhas- so elementos de estrutura secundria de protenas, assim como as voltas e estruturas desordenadas. O que determina sua formao so as seqncias de resduos com valores repetidos dos ngulos e .
Estrutura Terciria: o dobramento tridimensional da cadeia polipeptdica, ou seja, a posio de cada tomo na protena. O correto enovelamento da estrutura terciria que vai garantir o funcionamento da molcula. Estrutura Quaternria: o arranjo tridimensional de mais de uma subunidade de uma protena com mais cadeias polipeptdicas idnticas ou no. Algumas protenas possuem subunidades unidas de modo no covalente. Estas so chamadas de protmeros quando formadas por subunidades idnticas e oligmeros quando so diferentes.