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Apresentao:
So Carlos SP
abril - 2016
Cintica enzimtica
De um modo geral, enzimas so definidas como sendo estruturas proticas,
formadas por sequncias de aminocidos e que tm a funo de catalisar
(acelerar) reaes bioqumicas.
Exemplos: Duas enzimas da gliclise
Fosfohexose isomerase
(simples)
Fosfofrutocinase-1
(complexa, alostrica)
10000
9000
8000
7000
6000
5000
4000
3000
2000
1000
0
2000 2001 2002 2003 2004 2005 2006 2007 2008 2009 2010 2011 2012 2013 2014 2015
Ano
S P
-dS dP
dt
dt
Mistura reacional:
Soluo aq uosa: substrato + enzim
realizados
em
reatores
bem
misturados
visando
uma
dP
dt
t 0
dS
V t 0
dt t 0
Onde E = Eo , S = So , P = 0 principalmente de
P
9
medida de velocidade
eita em t=o.
de-se utilizar suavizao dos dados com polinmios. H vrios softwares que faze
10
A Cintica de Michaelis-Menten
Imagine-se como um qumico precisando de informaes cinticas de uma
reao enzimtica para poder projetar um sistema de produo utilizando
uma matria prima (substrato) que pode ser transformado enzimaticamente
num produto de interesse a custo baixo e ambientalmente correta. As
informaes cinticas, como comumente acontece na prtica, estariam
dadas como se mostra na Figura a seguir. Quais seriam suas primeiras
dedues com relao :
1. Velocidade de reao (V) a baixas concentraes de substrato. V
aumenta quase linearmente com o aumento de S?
12
13
Vmax S
Km S
(1)
(2)
15
k1
S+E
ES
ES
k-1
k2
Hiptese:
Equilbrio
(3)
P +Reao
E
lenta (controladora)(4)
V k 2 ES
(5)
um
difcil de medir
Henri,
k ou kMichaelis e Menten assumiram que a primeira reao
p
cat
k1
ES
(6)
E S
ES
Km
(7)
Km
16
obtem-se:
onde:
Eo = concentrao total de enzima (ou inicial)
E = concentrao de enzima livre
ES = concentrao de enzima complexada
V
k ES
2
Eo
E ES
(8)
E S
V
Km
Eo E E S
Km
k2
(9)
V
k S
2
Eo K m S
(10)
Equao de
S
S
Michaelis-MentenV k 2 E o K S Vmax K S
m
m
(11)
17
Assim:
Velocidade de formao de P V
dP
S
Vmax
dt
Km S
(12)
18
19
S+E
ES
ES
(3)
P+E
(4)
k-1
k2
(5)
dES
Hiptese:
Estado estacionrio
dt
k 1E S k 1ES k 2 ES 0 (6)
k1 E S
E S
ES
k 1 k 2
K BH
Note que:
K BH
k k
1 2
k1
(7)
20
E E 0 ES
E S
k2
V
K BH
Eo E E S
K BH
Simplificando fica assim:
V
S
k2
Eo
K BH S
21
Arrumando a equao:
V k 2 Eo
S
K BH S
V Vmax
Modelo de Briggs-Haldan
K BH S
22
d ES
0
de fato,
dt
23
Hiptese:
Michaelis-Menten
Briggs-Haldane
k1 E S k 1 S
d[ES]/dt
0
Vm S
Equao: V
Km S
Velocidade
mxima de
reao:
Constante:
Vm k 2 E o
k
K m 1
k1
Vm S
V '
K BH S
Vm k 2 E o
K
'
BH
k 1 k 2
k1
K m K BH '
24
25
Vm S
V
Km S
1
1
Km 1
V
Vm
Vm S
26
Coordenadas de Lineweaver-Burk
S Km
1
S
V Vm Vm
Coordenadas de Eadie-Hofstee
V Vm K m
v
S
29
Inibidores reversveis
30
Etapa lenta:
ES
KS
EI
Ki
ES E +P
E + ES + EI = Eo
31
Inibio competitiva:
32
Vmax S
S K s 1 I K i
K app
K
1
m
s
K
i
Inibio no competitiva
Ks
Ki
(i)
(j)
33
Inibio no competitiva:
34
E + S
ES
KS
E + I
EI
Ki
EI + S EIS
ES + I EIS
Ks
Ki
Vmax
S
I
(1
)
Ki
V
S Ks
Fazer este exerccio em casa
35
Lineweaver-Burk
Hanes-Woolf
Eadie-Hofstee
36
Resultado
Descrio
Ia
IIb
Totalmente
Inibidor
adsorve
competitivo
ligao do substrato
aparente de Km
Parcialmente
Aumento no valor
competitivo
aparente de Km
inibidor
afeta
no
stio
ligao
de
Aumento no valor
do
substrato.
IIa
No-competitivo
No muda Km,
diminui Vmx
IIb
No-competitivo
No muda Km,
diminui Vmax
III
Inibidor misto
Afeta
Vmax
Km
e
37
38
1. O efeito do pH
As protenas, como visto anteriormente na seo 2.3 da
Unidade 2, so construdas a partir de aminocidos. Estas
unidades bioqumicas possuem grupos bsicos, neutros e
cidos.
Consequentemente, a enzima intacta pode conter ambos os
grupos carregados positiva ou negativamente a um dado pH.
Deste modo, grupos ionizveis so aparentemente, muitas
vezes parte do stio ativo, visto que a ao cataltica de
cidos e bases est ligada a vrios mecanismos
enzimticos. Alm disso, variaes do pH podem alterar a
estrutura tridimensional das enzimas.
40
41
O efeito da temperatura
A velocidade das reaes catalisadas por enzimas
cresce at um certo limite. Acima de uma determinada
temperatura, a atividade da enzima diminui devido
sua desnaturao. A Figura a seguir mostra a variao
da atividade de uma enzima com a temperatura,
mostrando um ponto timo de operao. A parte
ascendente da curva conhecida como ativao pela
temperatura, ou ativao trmica. Nesta regio, a
velocidade da reao varia de acordo com a equao
de Arrhenius: V = k2 . [E0]
onde: k2 = A . e-Ea/RT
42
dE
kd . E
dt
E E0 . e
kd t
k d Ad e
Ed
R T
Exerccio Resolvido
Um engenheiro recebeu um relatrio de laboratrio
sobre a presena de um pesticida na gua
consumida por uma indstria de uma regio suspeita
de contaminao. Sabendo que o pesticida suspeito
inibe a atividade de uma enzima conhecida, esta foi
utilizada para confirmar a presena do pesticida
obtendo-se os resultados a seguir:
V (molL-1min-1) 106
S (molL-1)
Sem inibidor
3,310-4
56
37
510-4
71
47
6,710-4
88
61
1,6510-3
129
103
2,2110-3
149
125
44
20000
f(x) = 4.32x + 5003.35
1/v
15000
Com inibidor
Linear (Com
inibidor)
10000
Sem inibidor
Linear (Sem
inibidor)
5000
0
0
500
1000
1500
2000
2500
3000
3500
1/S
45
Resposta:
Pode-se observar neste grfico que as duas
retas coincidem no eixo de inverso da
velocidade. Isto significa que as duas reaes
apresentam aproximadamente o mesmo valor
de Vmax. Como o coeficiente angular Km/vmax das
duas retas bem diferente significa que o
valor de Km das duas reaes diferente.
De acordo com o material o inibidor
totalmente competitivo Ia modifica o valor de
Km e no altera o valor de Vmax. Pode-se notar
que o valor de Vmax o mesmo para a reao
inibida e no inibida e o Km diferente, o que
caracteriza uma inibio competitiva.
46
Enzima imobilizada
Porque imobilizar enzimas?
47
Tipos de
imobilizao:
a) adsoro
b) ligao covalente
c) aprisionamento
d) confinamento com
membrana
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Reatores enzimticos
Matria de EB2
51
Reator de batelada
T=ct
e
pH=c
te
Funciona no transiente
(descontnuo)
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T=cte
pH=ct
e
Reator tubular:
Reatores ideais: hipteses?
Hiptese: Fluxo pistonado
54
55
FIM
56