3.

Modelos de ocupao: uma espcie, uma estao

3. Modelos de ocorrncia:
uma espcie, uma estao

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3. Modelos de ocupao: uma espcie, uma estao

Resumo 1. Introduo
Motivaes
Deteco imperfeita
Histrico de deteces

2. Modelo de uma estao e uma

espcie
Parmetros estimados
Premissas
Covariveis
Outros modelos

3. Desenho Amostral
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1. Introduo

Monitoramentos de larga escala

- North American Amphibian Monitoring Program

- North American Breeding Bird Survey

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Monitoramentos de larga escala

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Monitoramentos de larga escala

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Monitoramentos de larga escala

R-touro americana
Lithobates catesbeianus

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Relaes entre espcies e habitats

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Meta-populaes

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Ocupao

Proporo/frao de stios (ou unidades

amostrais) de uma paisagem onde uma
determinada espcie est presente

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Meta-populaes

Funes de incidncia (Diamond, 1975; Hanski, 1992)

Probabilidade de ocupao de uma mancha em funo

de caractersticas da mancha (e.g., rea)

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Modelos de ocupao

Natureza dos dados

Presncia ou ausncia

Deteco ou no deteco

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Ocupao

Proporo/frao de stios (ou unidades

amostrais) de uma paisagem onde uma
determinada espcie est presente

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3. Modelos de ocupao: uma espcie, uma estao

Deteco imperfeita

ou
probabilidade de deteco menor que 1

Probabilidade de deteo condicionada

probabilidade da presena da espcie em um stio

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Amostragem

K visitas a s stios em uma estao

Unidades amostrais

Perodo fechado

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O que um stio?

Definio natural: por exemplo lago, mancha

de habitat, topo de morro;
Definio arbitrria: bloco de 1 km2,
transeco de 1 km, ponto de escuta;

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Evidncias

Registros visuais
Rastros
Vocalizaes
Fezes
Ninhos
Mtodos passivos
Armadilhas

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Armadilha fotogrfica
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Modelo com uma estao

Parmetros estimados (Mackenzie et al., 2002):

= probabilidade da espcie estar presente

em um stio ou proporo de stios ocupados

p = probabilidade de deteco

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Histrico de deteces

0 no deteco

1 deteco

Matriz de deteces
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Histrico de deteces

101

Descrio verbal: espcie estava presente no stio, foi

detectada na primeira e terceira visita, e no foi
detectada na segunda.
Descrio matemtica:
Pr 101 = 1 1 2 3

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Obtendo as probabilidades
Histrico de Histricos observados Probabilidade
deteces (i) (Xi) (Pi)
100 X100 p1 (1 p2)(1 - p3)
010 X010 (1 - p1) p2 (1 - p3)
001 X001 (1 - p1)(1 p2) p3
110 X110 p1 p2 (1 - p3)
101 X101 p1 (1 p2) p3
011 X011 (1 - p1) p2 p3
111 X111 p1 p2 p3
000 X000 (1 - p1)(1 p2)(1 - p3)
000 X000 1-

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Funo de verossimilhana

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Histrico de deteces incompleto

Permite que alguns stios no tenham sido

visitados em determinadas ocasies

1011.0.10

* Com perda de preciso.

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3. Modelos de ocupao: uma espcie, uma estao

Construo e seleo de modelos

Mackenzie et al. (2002)

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Premissas

1) no muda com o tempo ou mudanas so

aleatrias

* Perodo fechado a extines e colonizaes

denominado de estao de captura

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3. Modelos de ocupao: uma espcie, uma estao

Premissas

2) Deteces so independentes

3) Probabilidade de deteco de um animal

constante entre stios (ausncia de
heterogenidade)

4) Espcie no detectada erroneamente quando

ausente

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3. Modelos de ocupao: uma espcie, uma estao

Covariveis
TEMPO-ESPECFICAS EM p

STIO-ESPECFICAS EM p E
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3. Modelos de ocupao: uma espcie, uma estao

Covariveis

Exemplos de covariveis:

Habitat (elevao, tipo de habitat)

Climticas (temperatura, precipitao)
Tamanho ou isolamento da mancha (patch)
Et cetera

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3. Modelos de ocupao: uma espcie, uma estao

Covariveis
Covariveis so includas no modelo atravs de
uma funo de ligao (como a logit) que
restringe a varivel resposta (probabilidade de
ocupao ou deteco) entre 0 e 1.

Modelos Generalizados Lineares

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Covariveis

= 0 + 1 1 + 2 2 + ... +

= ln
1

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3. Modelos de ocupao: uma espcie, uma estao

Relao entre abundncia-ocupao

Quanto maior a
abundncia/densidade
maior a chance da
espcie estar presente
em um stio (Gaston et
al., 2000)

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Modelo de Royle & Nichols (2003)

Assume a proporcionalidade entre abundncia e

a detectabilidade, modelando esta fonte de
heterogeneidade.
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3. Modelos de ocupao: uma espcie, uma estao

3. Desenho amostral

Potenciais objetivos:
Selecionar uma amostra representativa
extrapolvel
Obter uma estimativa mais precisa possvel dado
uma intensidade amostral
Obter um determinado grau de preciso com o
mnimo esforo

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3. Modelos de ocupao: uma espcie, uma estao

Desenho amostral

Importncia de estudo piloto para uma

estimativa preliminar dos parmetros de
interesse
Estes valores iniciais podem dar ideia se a
deteco e a ocupao da espcie alta ou
baixa
Valores podem ser usados em simulaes para
determinar o nmero de stios e visitas

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3. Modelos de ocupao: uma espcie, uma estao

Desenho amostral

Tipos de desenho amostral:

Standard: todos os stios so amostrados um
nmero vezes igual
Dupla amostragem: uma parcela dos stios
amostrada k vezes e outra parcela amostrada
uma nica vez
Remoo: stios so amostrados at um mximo
de k vezes, mas aps a deteco da espcie em
um stio a amostragem deste cessa

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3. Modelos de ocupao: uma espcie, uma estao

Estratificao
Diviso da rea de estudo por regies ou habitats

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3. Modelos de ocupao: uma espcie, uma estao

Desenho amostral
Definio do:
Tamanho do stio
Localizao dos stios
Estao de captura
Intervalo entre visitas

Depende de: territorialidade, rea de vida,

movimentos, densidade, demografia
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3. Modelos de ocupao: uma espcie, uma estao

Desenho amostral
Como definir o perodo da estao?

Analogia com a velocidade do obturador de uma mquina

fotogrfica.

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Desenho amostral

Como definir o tamanho do stio?

Analogia com o zoom de uma mquina fotogrfica.

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3. Modelos de ocupao: uma espcie, uma estao

Tamanho da amostra

Aumentando nmero de visitas e nmero de stios

amostrados, aumenta-se a preciso e acurcia do
modelo

Geralmente 2-3 visitas suficiente

Ideal entre 5-10 visitas ao stio
Mais visitas com ocupao alta ou deteco baixa

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3. Modelos de ocupao: uma espcie, uma estao

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3. Modelos de ocupao: uma espcie, uma estao

Tamanho da amostra

Mais stios ou mais visitas?

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Tamanho da amostra

Espcies raras:
mais stios, menos visitas

Espcies comuns:
menos stios, mais visitas

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Desenho amostral

Heterogeneidade deve ser reduzida no desenho

amostral ou incorporada na modelagem

(e.g., abundncia, habitat, observadores, perodo

relativo de amostragem dos stios)

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Programas

MARK

PRESENCE e GENPRES

R (pacote unmarked)

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Leituras adicionais

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Leituras adicionais

Mackenzie et al. (2005). Occupancy

Estimation and Modeling: Inferring
Patterns and dynamics of Species
Occurrence. Academic Press,
Amsterdam.

Captulos 1 a 6.

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