ANÁLISE DE PEDIGREES PARA O MANEJO

POPULACIONAL

Cálculo do Coeficiente de Endogamia (F)

 Quando um indivíduo é endogâmico?

Quando seu pai e sua mãe compartilham um

ancestral comum.

A B A C

D E

X
 Qual é o efeito genético da endogamia?

Aumentar a homozigosidade média da população.

O indivíduo endogâmico possui uma probabilidade

maior de ser homozigoto para um maior número de
loci do que um indivíduo não endogâmico.

Medido pelo Coeficiente de Endogamia (F)

 Coeficiente de Endogamia (F)

É a probabilidade de que dois alelos presentes em

um determinado locus sejam
“Idênticos por Descendência”

Oriundos de um único alelo do ancestral comum

 Coeficiente de Endogamia (F)

É a probabilidade de que dois alelos presentes em

um determinado locus sejam
“Idênticos por Descendência”

A1A2 A3A4 A1A2 A5A6

1 2 1 3

A1A3 A1A6

4 5

A1A1

6
Cálculo do Coeficiente de Endogamia

“Path Analysis Technique”

A B A C

D E

X
Cálculo do Coeficiente de Endogamia - “Path Analysis Technique”
Technique”

● Passo 1: Desenhar o pedigree de forma que o ancestral comum apareça apenas

uma única vez
A B A C A

D E D E

X X
Cálculo do Coeficiente de Endogamia - “Path Analysis Technique”
Technique”

● Passo 1: Desenhar o pedigree de forma que o ancestral comum apareça apenas

uma única vez
A B A C A

D E D E

X X

● Passo 2: Determinar o coeficiente de endogamia de todos os ancestrais comuns

Cálculo do Coeficiente de Endogamia - “Path Analysis Technique”
Technique”

● Passo 1: Desenhar o pedigree de forma que o ancestral comum apareça apenas

uma única vez
A B A C A

D E D E

X X

● Passo 2: Determinar o coeficiente de endogamia de todos os ancestrais comuns

● Passo 3: Procurar por “loops” no pedigree

Cálculo do Coeficiente de Endogamia - “Path Analysis Technique”
Technique”

● Passo 1: Desenhar o pedigree de forma que o ancestral comum apareça apenas

uma única vez
A B A C A

D E D E

X X

● Passo 2: Determinar o coeficiente de endogamia de todos os ancestrais comuns

● Passo 3: Procurar por “loops” no pedigree

● Passo 4: Calcular a contribuição de cada “loop” para o coeficiente de endogamia

 Coeficiente de Endogamia

N
⎛1⎞
Fx = ∑ ⎜ ⎟
⎝ 2⎠
(1 + FCA )

• N = Número de indivíduos presentes no “loop” (excluindo o indivíduo

de interesse).

• FCA = coeficiente de endogamia do ancestral comum

Cálculo do Coeficiente de Endogamia - “Path Analysis Technique”
Technique”

● Passo 1: Desenhar o pedigree de forma que o ancestral comum apareça apenas

uma única vez
A B A C A

D E D E

X X

● Passo 2: Determinar o coeficiente de endogamia de todos os ancestrais comuns

● Passo 3: Procurar por “loops” no pedigree

● Passo 4: Calcular a contribuição de cada “loop” para o coeficiente de endogamia

Loop FCA N Contribuição para FX

DAE 0 3 (1/2)3 x (1 + 0) = 0,125
Cálculo do Coeficiente de Endogamia - “Path Analysis Technique”
Technique”

● Passo 1: Desenhar o pedigree de forma que o ancestral comum apareça apenas

uma única vez
A B A C A

D E D E

X X

● Passo 2: Determinar o coeficiente de endogamia de todos os ancestrais comuns

● Passo 3: Procurar por “loops” no pedigree

● Passo 4: Calcular a contribuição de cada “loop” para o coeficiente de endogamia

Loop FCA N Contribuição para FX

DAE 0 3 (1/2)3 x (1 + 0) = 0,125

● Passo 5: Somar a contribuição de cada “loop”

2) Calcular FX
3) Calcular FX
Exemplo 4: Calcular FX

A B B C

D E

F G H

I J

X
Cálculo do Coeficiente de Endogamia - “Path Analysis Technique”
Technique”

● Passo 1: Desenhar o pedigree de forma que o ancestral comum apareça apenas

uma única vez
B
A B B C

D E
D E

F G H G

I J
I J

X
X
Cálculo do Coeficiente de Endogamia - “Path Analysis Technique”
Technique”

● Passo 2: Determinar o coeficiente de endogamia de todos os ancestrais comuns

D E

O Ancestral Comum de K é endogâmico!

G Loop FCA N FG

DBE 0 3 (1/2)3 x (1 + 0) = 0,125

I J

X
Cálculo do Coeficiente de Endogamia - “Path Analysis Technique”
Technique”

● Passo 2: Determinar o coeficiente de endogamia de todos os ancestrais comuns

D E

O Ancestral Comum de X é endogâmico!

G Loop FCA N FG

DBE 0 3 (1/2)3 x (1 + 0) = 0,125

I J

Agora calcular FX = (1/2)N x (1 + FG)

X Loop FCA N FX

IGJ 0,125 3 (1/2)3 x (1 + 0,125) = 0,141

5) Calcular FX
Calcular F?