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Estimação da Variabilidade Genética em Genótipos de Inhame (Discorea alata).

RESUMO

O Inhame (Discorea alata) é tido de forma positiva e significativa com


como uma fonte de alimentação para os diâmetro do tubérculo e com o comprimento
pequenos produtores de município de do caule. A massa do tubérculo foi a
Lichinga, entretanto poucos estudos característica que mais contribuiu para a
genéticos têm sido realizados com esta divergência genética. O método UPGMA -
cultura. Foram coletados 20 genótipos na Unweighted Pair Group Method with
zona de Mutapassa e Micoco no distrito de Arithmetic Mean dividiu os 20 genótipos em
Lichinga. Estes foram estimados com base quatro grupos, sendo que o quarto,
em seis descritores quantitativos (masssa do apresentou maior número de genótipos para
tubérculo, comprimento do tubérculo, as características de produção. Os três
diâmetro do tubérculo, comprimento do primeiros componentes principais
caule, largura da folha e comprimento da conseguiram explicar 83,85% da variação
folha), através das quais foram total acumulada e o gráfico da dispersão
determinadas as estatísticas descritivas, a apresentou-se desigualmente em
correlação de Paearson e a contribuição conformidade com o método UPGMA. Esta
relativa dos caracteres para a divergência pesquisa mostrou a presença de
pelo método de Singh. Os genótipos foram variabilidade genética do Inhame, que pode
submetidos a análise de agrupamento ser explorada em futuros programas de
através do método de Unweighted Pair melhoramento genético.
Group Method with Arithmetic Mean, análise
de componentes principais e a dispersão Palavras-chave: Dioscorea alata L.;
gráfica. Os resultados apontaram que a
massa do tubérculo apresentou maior Métodos multivariados; Melhoramento
coeficiente de variação e correlacionou-se
genético.

ABSTRACT

Yam (Discorea alata) is considered Paearson correlation, and leaf length were
a source of food for small producers in the determined. relative contribution of
municipality of Lichinga, however few characters to divergence by the Singh
genetic studies have been carried out with method. The genotypes were subjected to
this crop. However, the objective of this work cluster analysis using the Unweighted Pair
was to estimate the genetic variability in yam Group Method with Arithmetic Mean,
(Discorea alata) genotypes, based on principal component analysis and graphical
quantitative descriptors, using multivariate dispersion. The results showed that the
methods. This time, 20 genotypes were tubercle mass had the highest coefficient of
collected in the area of Mutapassa and variation and was positively and significantly
Micoco in Lichinga district. These were correlated with tubercle diameter and stem
estimated based on six quantitative length. Tuber mass was the feature that
descriptors (tuber mass, tuber length, tuber most contributed to genetic divergence. The
diameter, stem length, leaf width and leaf UPGMA - Unweighted Pair Group Method
length), through which descriptive statistics, with Arithmetic Mean method divided the 20

Autora: Belmira Correia


Supervisor: Msc. Virgilio Cossa
genotypes into four groups, and the fourth variability in yam, which can be exploited in
one had a greater number of genotypes for future breeding programs.
the production traits. The first three main
components were able to explain 83.85% of Keywords: Dioscorea alata L.;
the total accumulated variation and the
dispersion graph was presented unevenly in Multivariate methods; Genetical
accordance with the UPGMA method. This
enhancement.
research showed the presence of genetic

INTRODUÇÃO

O inhame (Dioscórea sp.) é uma Aliado ao desconhecimento das


planta tuberculosa que pertence à variabilidades genético disponível da
família Dioscoreaceae, na qual o gênero espécie, pode dificultar o
Dioscorea apresenta mais de 600 estabelecimento de estratégias eficazes
espécies, cultivadas na África, Ásia, para a sua conservação, bem como do
América do Sul e no Caribe (Velasco- seu melhoramento genético.
ramírez et al., 2014). Esta cultura
Nesta óptica, a realização desta
constitui uma fonte de alimentos,
pesquisa mostra-se relevante, pois
medicinal e de rendimento em muitos
estudos desta natureza são escassos na
países africanos (Norman,Tongoona &
literatura nacional, o que tem provocado
Shanahan, 2011) e garante a
a perda de culturas que detém um
sustentabilidade de milhões de pessoas
grande potencial alimentar, económico e
nas zonas tropicais e subtropicais do
medicinal. Por esta razão, a pesquisa
mundo (Wu et al. 2019; Rao, Kapadia,
tem como finalidade estimar a
Desai & Murthy, 2020).
variabilidade genética em genótipos de
Em Moçambique, o inhame inhame (D. alata), visando sua
(Dioscorea alata L.) é uma cultura conservação.
negligenciada, pois é praticada de forma
esporádica, não existindo sua
exploração comercial. Esta situação
pode a longo prazo ocasionar a erosão
genética dos recursos genéticos do
germoplasma existente.
Autora: Belmira Correia
Supervisor: Msc. Virgilio Cossa
METODOLOGIA cidade de Lichinga. Os genótipos foram
georreferenciados nos pontos de colecta
Material e Métodos
(Tabela 1), para facilitar, futuras ações
de pesquisa e conservação dos
20 Genótipos de inhame foram
genótipos.
colectados em duas propriedades rurais
dos povoados Mutapassa e Micoco da Tabela 1: Procedência dos 20 genótipos de
inhame (D. alata), analisados na pesquisa.

Procedência
Genótpos Povoado Latitude (S) Longetude (E) Altitude (m)
G1 Micoco 13 09ʹ.668ʺ
o
35o 24ʹ.134ʺ 1095
G2 Micoco 13o 09ʹ.628ʺ 35o 24ʹ.223ʺ 1091
G3 Micoco 13o 09ʹ.653ʺ 35o 24ʹ.188ʺ 1094
G4 Micoco 13 09ʹ.661ʺ
o
35o 24ʹ. 176ʺ 1091
G5 Micoco 13o 09ʹ.668ʺ 35o 24ʹ. 188ʺ 1096
G6 Micoco 13o 09ʹ.667ʺ 35o 24ʹ. 180ʺ 1092
G7 Micoco 13o 09ʹ.664ʺ 35o 24ʹ. 181ʺ 1093
G8 Micoco 13 09ʹ. 659ʺ
o
35o 24ʹ. 178ʺ 1098
G9 Micoco 13o 09ʹ. 656ʺ 35o 24ʹ. 173ʺ 1095
G10 Micoco 13o 09ʹ. 662ʺ 35o 24ʹ. 170ʺ 1090
G11 Micoco 13o 09ʹ. 652ʺ 35o 24ʹ. 172ʺ 1092
G12 Mutapassa 13 30ʹ.444ʺ
o
35o13ʹ.338ʺ 1063
G13 Mutapassa 13o 30ʹ. 443ʺ 35o13ʹ.346ʺ 1064
G14 Mutapassa 13o 30ʹ. 440ʺ 35o13ʹ.347ʺ 1066
G15 Mutapassa 13o 30ʹ. 442ʺ 35o13ʹ.377ʺ 1253
G16 Mutapassa 13o 30ʹ. 437ʺ 35o13ʹ.372ʺ 1067
G17 Mutapassa 13o 30ʹ.439ʺ 35o13ʹ.335ʺ 1064
G18 Mutapassa 13o 30ʹ. 435ʺ 35o13ʹ.374ʺ 1069
G19 Mutapassa 13o 30ʹ.438ʺ 35o13ʹ.375ʺ 1068
G20 Mutapassa 13 30ʹ.441ʺ
o
35o13ʹ.346ʺ 1070

Quantificação da Variabilidade Genética

A análise da variabilidade genética em fita métrica cerca de 9 e 11 genótipos


genótipos de inhame foi realizada em respectivamente. Posteriormente, foram
duas etapas em que, a primeira etapa determinados o comprimento do caule a
decorreu no mês de Maio de 2020 onde, largura da folha e o comprimento da
foram identificados e marcados com uma folha.

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A segunda etapa foi realizada no mês de Foram realizadas análises
Julho de 2021, em que foram colectados multivariadas por meio de técnicas de
os rizóforos dos genótipos, análise de agrupamento e análise de
antecipadamente e marcados ensacados componentes principais. Para análise de
e transportados, para o laboratório de agrupamento foi utilizada a distância
Biologia da Universidade Rovuma - euclidiana média como medida de
Extensão de Niassa, onde foram dissimilaridade a partir dos dados
caracterizados. padronizados. A contribuição relativa dos
caracteres foi determinada pelo método
A massa do tubérculo (MassT), foi
de Singh (1981).
determinada com o auxílio de uma
balança comercial em kg e Os agrupamentos hierárquicos a
posteriormente, convertida em gramas partir da matriz de distância foram
(g); O comprimento do Tubérculo obtidos pelo método UPGMA –
(CompT) foi determinado através de uma Unweighted Pair Group Method with
fita métrica graduada em (cm). Arithmetic Mean (Sneath; Sokal, 1973).
E por fim, com o auxílio de um A validação dos agrupamentos foi
paquímetro digital graduado mediu-se o determinada por meio do coeficiente de
diâmetro do tubérculo (DimT) em correlação cofenético (Sokal; Rohlf,
milímetro (mm). 1962). A significância do coeficiente de
correlação cofenético foi calculada pelo
Análise Estatística de Dados teste de Mantel (1967) com 1000
permutações.
A variabilidade genética entre os
genótipos de inhame foi quantificada
O critério para definição do número
através das estatísticas descritivas:
de grupos baseou-se no índice Pseudo-
valores mínimos e máximo, média,
t2 do pacote “NbClust” do programa R
desvio padrão e coeficiente de variação.
(Charrad et al., 2014). As análises foram
Os dados foram submetidos ao teste de
realizadas com auxílio dos programas
Shapiro-Wilks, a 5% de probabilidade,
estatísticos Genes (Cruz, 2014).
para verificação da normalidade dos
dados.

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RESULTADOS E DISCUSSÃO Na Tabela 2 estão apresentadas as
estatísticas descritivas das variáveis
Quantificação a Variabilidade
analisadas na pesquisa. Os
Genética Entre Genótipos de
coeficientes de variação oscilaram
Inhame D. alata
de 15,68 para 75,32%, indicando que
existe variabilidade genética entre os
genótipos que pode ser explorada em
futuros programas genéticos da cultura.
Tabela 2: Estatísticas descritivas e
teste de normalidade das variáveis
analisadas em 20 genótipos de inhame.

Descritores
Genótipos Massa CompT Diam CompC Larf CompF
G1 5000,00 82,00 140,52 6,90 8,28 15,33
G2 9500,00 105,00 154,84 8,70 13,25 23,96
G3 5000,00 75,00 137,90 7,20 10,66 23,41
G4 2500,00 96,00 100,18 6,70 10,87 20,00
G5 5000,00 104,00 142,15 6,80 10,40 20,57
G6 2400,00 90,00 124,16 3,74 10,40 17,53
G7 2500,00 47,00 113,38 5,15 8,33 17,16
G8 2800,00 65,00 103,45 4,86 6,83 17,85
G9 1500,00 57,00 100,98 3,80 8,00 17,90
G10 4100,00 81,00 99,47 6,30 11,70 18,30
G11 2300,00 54,00 93,00 5,10 11,78 18,07
G12 2500,00 45,00 129,41 8,72 11,00 23,00
G13 500,00 35,00 75,10 4,50 13,00 22,00
G14 2400,00 31,00 154,84 5,30 10,50 19,88
G15 500,00 30,00 85,99 3,69 10,50 18,00
G16 2000,00 40,00 139,51 5,15 8,12 19,94
G17 1500,00 29,00 148,88 5,25 7,66 18,81
G18 2500,00 57,00 96,47 7,35 9,18 12,11
G19 1100,00 37,00 53,70 5,80 7,78 15,00
G20 500,00 22,00 10,33 4,50 10,50 21,75
Mínimo 500,00 22,00 10,33 3,69 6,83 12,11
Máximo 9500,00 105,00 154,84 8,72 13,25 23,96
Media 2805,00 59,10 110,21 5,78 9,94 19,03
Desvio Padrão 2112,74 26,62 36,59 1,51 1,82 2,98
CV (%) 75,32 45,04 33,2 26,17 18,36 15,68

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Teste de
0,82** 0,93ns 0,91ns 0,94ns 0,94ns 0,97ns
Normalidade
** e * significativo a 1% e 5% de probabilidade, ns não significativo a 5% de probabilidade pelo teste
de Shapiro-Wilks. MassT – Massa do tubérculo, CompT - comprimento do tubérculo, DiamT -
diâmetro do tubérculo, CompC - Comprimento do caule, Larf - largura da folha, CompF -
Comprimento da folha.

O teste de Shapiro – Wilks revelou as variáveis com os menores


que o comprimento dos tubérculos, coeficientes de variação (15,68 e
diâmetro do tubérculo, comprimento do 18,36%), provavelmente por serem
caule, largura e comprimento da folha características que são governados por
foram não significativas a 5% de poucos genes.
probabilidade, indicando que seguem a
1.1 Determinação da Contribuição
distribuição normal, facto não observado
Relativa das Variáveis para a
para a massa do tubérculo.
Variabilidade Genética
A massa do tubérculo foi a variável
com maior variabilidade 75,32%, sendo
O gráfico 1 mostra a coeficientes
que o valor máximo (9500 g) foi
de correlação de Pearson entre as
observado no genótipo 2 e o mínimo
variáveis. A massa do tubérculo mostrou
(500 g) foi observado nos genótipos 13,
uma correlação altamente significativa e
15 e 20.
positiva com o diâmetro do tubérculo (r =
O comprimento do tubérculo teve
0,77**), e com o comprimento do caule (r
uma média de 59,1 cm e oscilou de 22
= 0,70**) e moderada (r = 0,59**) com o
cm (G20) a 105 cm (G2). O mesmo
diâmetro do tubérculo. O comprimento
comportamento foi observado para o
da folha teve correlação também
diâmetro do tubérculo, sendo que o G20
altamente significativa, porém de
teve 10,33 mm enquanto um o G2
magnitude moderada com a largura da
apresentou 154,84 mm, com uma média
folha (r = 0.58**). As demais correlações
de 110,21 mm.
podem ser consideradas desprezíveis. A
Em relação ao comprimento do
correlação altamente significativa entre
caule, os valores mínimo (3,69 cm) e
caracteres indica a possibilidade de
máximo (8,72 cm) foram observados nos
melhoramento genético simultâneo entre
genótipos 13 e 2, respectivamente. O
estes (Ousagwu et al., 2014), pois o
comprimento e a largura da folha, foram
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aumento de uma variável condiciona o aumento da outra, possibilitando a
seleção indireta.

Gráfico 1: Matrizes de correlação de Pearson entre as seis variáveis analisadas na pesquisa.

Massa do tubérculo – MassaT, Comprimento do Tubérculo – CompT, Diâmetro do Tubérculo


– DiamT, Comprimento do caule – CompC, Largura da folha – Larf e Comprimento da folha – CompF.

A massa do tubérculo foi a genótipos, enquanto as demais variáveis


variável que mais contribuiu para a contribuíram conjuntamente com
dissimilaridade genética entre os 0,0463% (Gráfico 2)

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0
CompF

Larf 0
Variáveis
0
CompC
0.0300000000
DiamT 000003
0.0200000000
CompT 000001 99.95

massa

Contribuição relativa de Singh (%)

Gráfico 2: Contribuição relativa dos caracteres para diversidade segundo Singh (1981).
Massa T- massa do tubérculo, CompT – comprimento do tubérculo, DiamT - diâmetro do
tubérculo, CompC- comprimento do caule, Larf – largura da folha e CompF – comprimento
da folha.

Eficácia dos Métodos de Análise


Multivariada na Discriminação da
Este resultado diverge com os
Variabilidade Genética
obtidos por Cossa, Cerqueira-Pereira,
Almeida, Ledo & Moreira (2019), que A Tabela 4 apresenta os dados
verificaram que o comprimento do dos autovalores, as variâncias totais e
tubérculo foi a variável que mais acumuladas associadas a cada variável
contribuiu para a dissimilaridade analisada. Os três primeiros
genética, por outro lado, Afonso, componentes principais conseguiram
Moreira, Conceição e Silva (2014), explicar 83,85% da variação total
constataram que o diâmetro do tubérculo acumulada. O primeiro componente
foi a variável com a maior contribuição, principal explicou 49,46% da variação
essas diferenças devem-se total, que esta diretamente ligado com a
provavelmente as condições de maneio massa do tubérculo
que estes genótipos foram submetidos.

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O segundo expôs 22,55%
associado com o comprimento do
Tabela 3: Estimativas dos
tubérculo e o terceiro componente
autovalores associados a cada variável e
principal, apresentou-se com 11,84% da
suas variâncias totais e acumulada,
variação total, estando coligado com o
obtidas na análise de componentes
diâmetro do tubérculo. Cossa et al.
principais de 20 genótipos de inhame.
(2019) verificaram que os três primeiros
componentes explicaram 69,49% da
variância total, por outro lado, Tiama et
al. (2016) observaram que os dois
primeiros componentes explicaram
78,83% da variância total.

Componentes Autovectore Variância Variância


principais s Total (%) Acumulada (%)
Comp.1 1,72 49,46 49,46
Comp.2 1,16 22,55 72,01 O
Comp.3 0,84 11,84 83,85
Comp.4 0,73 8,82 92,67
Comp.5 0,55 5,03 97,7
Comp.6 0,37 2,3 100
grupo I alocou o genótipo 2, que se
A Figura 5 apresenta o
destacou dos demais genótipos por
dendrograma de dissimilaridade, que
apresentar os maiores valores em todas
possibilitou a distribuição dos 20
variáveis, podendo ser considerado o
genótipos em quatro grupos. O
mais promissor, para a propagação
coeficiente de correlação cofenética
pelos produtores da cultura, bem como
(CCC) foi de 0,87**, refletindo bom
para a sua incorporação em programas
ajuste da matriz de agrupamento com a
de melhoramento genético da cultura.
matriz fenética (Vaz Patto, Satovic,
Pêgo, Fevereiro, 2004).

Autora: Belmira Correia


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Segundo Jatasra & Paroda (1983), melhoramento de inhame também nas
a informação precisa sobre a divergência zonas rurais do municipio de Lichinga.
genética é decisiva para o sucesso de O grupo II reuniu os genótipos 1, 3, 4, 5,
um programa de melhoramento, uma 10 e 12. Este grupo caracterizou-se por
vez que plantas geneticamente apresentar genótipos com tubérculos
divergentes produzem alto efeito cuja massa média foi de 4016,67g,
heterótico e, consequentemente, comprimento foi de 80,5 cm, o diâmetro
segregantes desejáveis para os foi de 124,94 mm, o comprimento do
propósitos do programa. Neste caso, caule teve uma média de 7,1 cm, a
este pode auxiliar nos programas de largura e o comprimento da folha, com
10,49 e 20,1 cm, respectivamente.

O grupo III foi composto pelos Por sua vez, o grupo IV englobou
genótipos 13 e 20 que apresentaram os demais genótipos 6, 7, 8, 9, 11, 14,
tubérculos cuja massa foi de 500 g, 15, 16, 17, 18 e 19 que apresentaram as
comprimento médio de 28,5 cm, seguintes médias (massa do tubérculo
diâmetro de 42,72 mm, comprimento do 1954,5 g, comprimento do tubérculo 48,8
caule médio de 4,5 cm, largura da folha cm, diâmetro do tubérculo 110,4 mm,
médio de 11,75 cm e comprimento da comprimento do caule 5 cm, largura da
folha de 21,88 cm. folha 9 cm e comprimento da folha 17,5.

Autora: Belmira Correia


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Figura 1: Dendrograma de dissimilaridade genética entre os 20 genótipos de inhame obtido pelo
método UPGMA, utilizando a distancia euclidiana média como medida de dissimilaridade.

A Figura 6 apresenta o gráfico de Em conformidade com as análises


dispersão dos genótipos, obtido pela dos métodos utilizados pode-se observar
análise de componentes principais. que quanto no método de UPGMA
Pode-se verificar que os grupos (Figura 5), e Análise de Componentes
formados por esta análise são similares Principais, o genótipo 2 permanece no
aos obtidos pela análise de mesmo grupo tal como se pode observar
componentes principais. na figura 6. Os genótipos 1, 3, 4, 5, 10 e
12 também persistem no mesmo grupo
Analisando a dispersão gráfica
na análise destes métodos. Para os
fundamentada nos três primeiros
genótipos 13 e 20 ide continuam no
componentes principais (Figura 4), é
mesmo grupo, tanto no método de
exequível visualizar a relação entre os
UPGMA e na dispersão gráfica gerada
20 genótipos de inhame. O gráfico
na Análise de Componentes Principais
apresenta a disposição de quatro grupos
(Figura 6), igualmente para os genótipos
distintos, o primeiro grupo com um
6, 7, 8, 9, 11, 14, 15, 16, 17, 18 e 19
genótipo (G2), o segundo grupo com
sugerindo que, estes genótipos
seis genótipos (G1, G3, G4, G5, G10, e
apresentam maior similaridade entre os
G12), o terceiro grupo com dois
caracteres morfológicos avaliados.
genótipos (G13 e G20) e o quarto grupo
com onze genótipos (G6, G7, G8, G9,
G11, G14, G15, G16, G17, G18 e G19).

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Figura 6: Diagrama de dispersão de 20 genótipos de inhame através da análise de
componentes principais.

Este resultado indica há eficácia nos através da análise de agrupamento e da


métodos de agrupamento dos genótipos análise de componentes principais.

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