1) De um ponto de vista molecular, qual é a definição de gene?
2) Explique como é a estrutura básica de um gene. 3) O que significa a expressão “homologia entre genes” e como surgem os genes homólogos? 4) Qual a diferença entre genes parálogos e ortólogos? 5) Uma característica típica dos genes procarióticos é a colinearidade existente entre cada gene e seu produto (proteína ou RNA). O que isto significa? 6) Explique o conceito de pangenoma. 7) O que é um óperon? Cite duas vantagens obtidas pela organização dos genes procarióticos em óperons. 8) Por que o tamanho do genoma é considerado um parâmetro inadequado para o estabelecimento de relações filogenéticas? 9) Diferencie cromossomos e plasmídeos. 10) Os procariotos apresentam um elevado grau de densidade gênica. Por quê? 11) As células de E. coli dividem-se a cada 20 minutos, mas a replicação completa de seu cromossomo pode durar até 1 hora. Como isso é possível e qual a principal consequência desse processo para a célula? 12) O que são ilhas genômicas e quais as vantagens que elas podem trazer para as células? 13) Qual a diferença entre um íntron e um éxon? 14) Qual o significado da expressão “transcrição disseminada” (pervasive transcription)? 15) Em relação ao tamanho dos genomas eucarióticos, o que significa a expressão “paradoxo do valor C”? 16) De maneira geral, o número total de genes tende a aumentar conforme o grau de complexidade das espécies eucarióticas. Contudo, existem contradições a essa regra, como por exemplo, o fato de o milho ter mais genes que os humanos. Então, como se explica o fato de sermos mais complexos que o milho? 17) Nos genomas eucarióticos houve um aumento no número de famílias gênicas. Descreva como estas surgiram ao longo da evolução e caracterize como são as proteínas codificadas pelos genes de uma família gênica. 18) Como a ocorrência de sequências repetidas no genoma humano pode causar uma doença. Dê um exemplo de uma doença causada devido à ocorrência de sequências repetidas. 19) O que são elementos transponíveis e por que estes foram importantes para o aumento de complexidade dos eucariotos? 20) Do ponto de vista evolutivo, os eucariotos atuais podem ser divididos, em dois grandes grupos: eucariotos unicelulares e multicelulares. Os primeiros não conseguiram ultrapassar o “limiar de complexificação” enquanto que os segundos sim. Descreva o que significa isso em termos evolutivos?