BioquimicaREED

Bioqumica
Bioqumica
Maria Risoleta Freire Marques
1 edio e 1 reimpresso.
Florianpolis, 2010.
Elaborado por Rodrigo de Sales, supervisionado pelo Setor Tcnico da
Biblioteca Universitria da Universidade Federal de Santa Catarina
Copyright 2010 Universidade Federal de Santa Catarina. Biologia/EaD/UFSC
Nenhuma parte deste material poder ser reproduzida, transmitida e gravada sem a
prvia autorizao, por escrito, da Universidade Federal de Santa Catarina.
M357b Marques, Maria Risoleta Freire
Bioqumica / Maria Risoleta Freire Marques. 1. ed. e
1. reimpr. Florianpolis : BIOLOGIA/EAD/UFSC, 2010.
178 p.
ISBN 978-85-61485-07-8
1. Bioqumica. 2. Biomolculas. 3. Metabolismo. I. Ttulo.
CDU 577.1
Comisso Editorial Viviane Mara Woehl, Alexandre
Verzani Nogueira, Milton Muniz
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Curso de Licenciatura em Cincias Biolgicas
na Modalidade a Distncia
Diretora Unidade de Ensino Sonia Gonalves Carobrez
Coordenador de Curso Maria Mrcia Imenes Ishida
Coordenador de Tutoria Zenilda Laurita Bouzon
Coordenao Pedaggica LANTEC/CED
Coordenao de Ambiente Virtual Alice Cybis Pereira
Sumrio
Apresentao ....................................................................................... 7
UNIDADE A - Introduo Bioqumica
1. A Importncia Biolgica da gua ................................................ 15
1.1 Introduo ...................................................................................................................17
1.2 Ponte de Hidrognio ............................................................................................... 18
1.3 Qual o Signifcado de Hidroflico e Hidrofbico? .............................................. 20
Resumo .............................................................................................................................. 22
Bibliografa ....................................................................................................................... 23
Bibliografa Comentada................................................................................................. 23
2. Os tomos Presentes nas Biomolculas ..................................... 25
Resumo .............................................................................................................................. 29
Bibliografa ....................................................................................................................... 29
UNIDADE B - Biomolculas ............................................................... 31
3. Protenas ........................................................................................ 35
3.1 Caractersticas Gerais ............................................................................................... 37
3.2 Aminocidos .............................................................................................................. 40
3.3 Como os Aminocidos se Ligam para Formar as Protenas? .......................... 45
3.4 Nveis de Organizao Estrutural em Protenas ................................................ 46
3.4.1 Estrutura Primria ....................................................................................... 46
3.4.2 Estrutura Secundria ...................................................................................47
3.4.3 Estrutura Terciria ........................................................................................50
3.4.4 Estrutura Quaternria .................................................................................51
3.5 Foras Moleculares que Atuam na Manuteno
da Estrutura de Protenas ..................................................................................... 54
3.6 O que Desnaturao de Protenas? ................................................................... 56
3.7 A Importncia da Estrutura Primria ................................................................... 58
Resumo .............................................................................................................................. 60
Bibliografa ....................................................................................................................... 60
Bibliografa Comentada................................................................................................. 61
4. Lipdeos .......................................................................................... 63
4.1 Lipdeos: Propriedades Gerais ............................................................................... 65
4.2 cidos Graxos ............................................................................................................ 66
4.3 Principais Classes de Lipdeos ............................................................................... 69
4.3.1 Triacilgliceris ................................................................................................69
4.3.2 Ceras ...............................................................................................................72
4.3.3 Fosfoacilgliceris (ou Glicerofosfolipdeos) ............................................73
4.3.4 Esgingolipdeos ............................................................................................74
4.3.5 Esterides .......................................................................................................75
4.4 Lipdeos e prostaglandinas .................................................................................... 77
4.5 Membranas biolgicas ............................................................................................ 77
Resumo .............................................................................................................................. 82
Bibliografa ....................................................................................................................... 83
5. Carboidratos .................................................................................. 85
5.1 Caractersticas Estruturais dos Carboidratos ...................................................... 87
5.2 Viso Geral das Funes Biolgicas dos Carboidratos .................................... 88
5.3 Classifcao dos Carboidratos .............................................................................. 89
5.3.1 Monossacardeos .........................................................................................89
5.3.2 Oligossacardeos ..........................................................................................93
5.3.3 Polissacardeos ............................................................................................ 96
5.3.4 Amido .............................................................................................................97
5.3.5 Glicognio ......................................................................................................97
5.3.6 Celulose ......................................................................................................... 99
5.3.7 Quitina ......................................................................................................... 100
5.4 Derivados de Carboidratos................................................................................... 101
5.5 Peptideoglicana ...................................................................................................... 103
Resumo ............................................................................................................................ 104
Bibliografa ..................................................................................................................... 104
6. cidos Nuclicos Estrutura e Funo .....................................105
6.1 O que so os cidos Nuclicos? ........................................................................... 107
6.2 Unidades Fundamentais dos cidos Nuclicos ............................................... 108
6.3 Polimerizao de Nucleotdeos ...........................................................................111
6.4 Nveis Estruturais dos cidos Nuclicos .............................................................113
6.4.1 Estrutura primria ...................................................................................... 113
6.4.2 Estrutura secundria ................................................................................. 114
6.4.3 Estrutura terciria ......................................................................................120
6.5 Tipos de RNA ........................................................................................................... 122
6.6 Outras Funes dos Nucleotdeos ...................................................................... 123
Resumo ............................................................................................................................ 124
Bibliografa Comentada............................................................................................... 124
UNIDADE C - Metabolismo .............................................................125
7. Catlise .........................................................................................127
7.1 Breve Histrico ......................................................................................................... 130
7.2 Catlise Enzimtica ................................................................................................. 132
7.3 Nomenclatura e Classifcao das Enzimas ...................................................... 136
7.4 Cintica Enzimtica ................................................................................................ 138
7.5 Enzimas Alostricas ................................................................................................ 143
7.6 Inibio da Atividade Enzimtica ........................................................................ 146
7.7 Regulao Enzimtica por Modifcao Covalente ......................................... 153
7.8 Enzimas na Indstria .............................................................................................. 153
Resumo ............................................................................................................................ 156
Bibliografa ..................................................................................................................... 156
8. Vias Metablicas e Energia Celular ............................................159
8.1 Metabolismo: Vias Catablicas e Vias Anablicas........................................... 162
8.1.1 Catabolismo ................................................................................................ 164
8.1.2 Anabolismo................................................................................................. 166
8.1.3 Via Anfblica ............................................................................................. 166
8.2 O ATP Transporta Energia das Reaes Catablicas
at as Reaes Anablicas .................................................................................. 167
8.2.1 Onde e Quando o ATP Formado? ....................................................... 168
8.2.2 O NADPH Transporta Energia na Forma de Fora Redutora............171
8.3 Energia a Partir de Carboidratos ......................................................................... 172
8.4 Energia a Partir de Lipdeos ..................................................................................174
8.5 Energia a Partir de Protenas ............................................................................... 175
Resumo ............................................................................................................................ 177
Bibliografa ..................................................................................................................... 178
Apresentao
Bem-vindo Bioqumica!
Provavelmente, a palavra Bioqumica no lhe de todo estranha.
Alm disso, voc, mesmo no tendo possivelmente se dado conta, tem con-
tato freqente com a Bioqumica no seu dia a dia.
Mesmo assim, no muito fcil apresentar uma defnio simples da Bio-
qumica. Uma delas, a qual lhe pode soar bastante familiar, que a Bioqumica
a qumica da vida. Isto porque o estudo da Bioqumica nos leva a investigar a
base molecular da vida, procurando entender vrios processos intracelulares e
varias relaes entre os organismos e o meio que os circunda.
Quais os tomos que formam as molculas presentes nos organismos vi-
vos? Quais as molculas e os processos primordiais que foram fundamentais
para a origem da vida? Quais as semelhanas e as diferenas moleculares en-
tre as diversas formas de vida? Como os organismos armazenam e transferem
a informao necessria para a sua reproduo? Como os alimentos so dige-
ridos ou processados para fornecer a energia celular?
A pesquisa em Bioqumica tem avanado em um ritmo bastante acelerado,
particularmente a partir de meados do sculo passado. Conseqentemente,
os resultados decorrentes tm trazido muitos avanos no nosso conhecimen-
to sobre as questes formuladas acima, bem como sobre outras que esto na
fronteira do nosso conhecimento em Biologia.
A Bioqumica tem uma infuncia profunda na nossa sade, nutrio, bem
como nas nossas relaes com o meio ambiente. Estudos bioqumicos permitiram
entender a base molecular de vrias doenas, como a diabete, a anemia falcifor-
me, a fenilcetonria e a fbrose cstica. Mais recentemente, outras doenas tm
sido alvo de estudos bioqumicos intensos, tais como a AIDS, o cncer, a esquizo-
frenia e as doenas degenerativas, como a doena de Alzheimer, por exemplo.
Apresentao
A manipulao do DNA abriu novas perspectivas para o diagnstico e o
tratamento de muitas destas doenas. O estudo da catlise biolgica (realiza-
da pelas enzimas) e do metabolismo fornece uma base importante e concreta
para o desenho racional de novas drogas.
A Biotecnologia uma outra rea multidisciplinar que tem se benefciado
cada vez mais dos avanos da Bioqumica. Enzimas so utilizadas na indstria
farmacutica para sintetizar novas drogas e o conhecimento de vrias rotas
do metabolismo de microorganismos tem possibilitado a sua seleo para a
produo de diferentes compostos como o lcool combustvel, alm da aplica-
o na minerao e na biorremediao ambiental.
Mas, no pense que a presena da Bioqumica no nosso cotidiano coisa
recente. Pelo contrrio!
As civilizaes antigas, como no Egito e tambm na China, j faziam uso
da Bioqumica, mesmo no entendendo os princpios bioqumicos por trs da
fabricao de po ou de bebidas, como o vinho ou a cerveja.
A Bioqumica j estava presente no antigo Egito. Pinturas registram a fabricao e o
consumo de vinho e cerveja.
Assim, apesar destes registros da utilizao das leveduras a milhares de
anos, o processo pelo qual o amido e outros acares so quebrados ou me-
tabolizados a etanol permaneceu um mistrio durante muito tempo. Foi so-

Os egpcios apreciavam
po e cerveja, de acordo
com os registros pictri-
cos e escritos da poca.
Mas, referncias ao modo
pelo qual estes itens
eram produzidos so va-
gas, mesmo tendo sido
possvel obter algumas
pistas nas tumbas dos fa-
ras, nas quais os mes-
mos eram colocados para
a vida aps a morte. Em
1996, uma arqueloga
inglesa relatou ter encon-
trado resduos de cerve-
ja e migalhas secas pre-
servadas neste ambiente
e os examinou utilizando
microscopia eletrnica. A
partir destas anlises e da
comparao com o mes-
mo tipo de material ob-
tido pelos atuais mto-
dos de processamento,
ela sugeriu, por exemplo,
que o po no Egito anti-
go era produzido a partir
no s de farinha, como
s vezes tambm a partir
de malte e levedura. (Sa-
muel, D. Investigation of
Ancient Egyptian Baking
and Brewing Methods by
Correlative Microscopy.
Science 26 (273): 488,
1996)
mente na metade do sculo XIX que Louis Pasteur mostrou que este processo,
denominado fermentao, no ocorria se as clulas de levedura fossem mor-
tas pelo calor. Assim, acreditou-se que a fermentao era um processo que s
poderia ser realizado pelas clulas vivas ntegras. Posteriormente, em 1897,
os irmos Eduard e Hans Bchner usaram extratos de levedura para realizar
este processo com sucesso, mostrando desta forma que a fermentao podia
ocorrer independente de clulas intactas. Muitos consideram este um marco
importante que deu incio Bioqumica moderna. Mas, difcil estabelecer o
ponto ou evento que possa defnir este momento de forma exata. Outros his-
toriadores da Cincia destacam um estudo anterior a este, quando, em 1828,
Friedrich Wohler sintetizou in vitro (sem ou independente de uma clula) uria,
uma molcula orgnica encontrada comumente na clula.
Independentemente desta discusso, esperamos que voc se sinta bastante
motivado e curioso para entender e olhar a Biologia do ponto de vista mole-
cular. Esperamos ainda que ao longo do seu estudo voc descubra o quanto a
Bioqumica faz parte da sua vida!
Maria Risoleta Freire Marques
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Unidade A
Introduo
Bioqumica
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1
A Importncia Biolgica da gua
Neste captulo estudaremos a organizao da H
2
O e a
formao das pontes de hidrognio, bem como as suas pro-
priedades importantes para os organismos vivos. Estes con-
tedos requerem que voc retome os conhecimentos de Qu-
mica, especialmente os relacionados ionizao da gua e
a escala de pH.
17 A Importncia Biolgica da gua
1.1 Introduo
A gua foi fundamental para o inicio da vida. E hoje, trs quar-
tos da superfcie do nosso planeta so cobertos por gua. Alm
de a gua ser abundante na Terra, na maior parte dos organismos
vivos a gua perfaz aproximadamente 70% da sua massa. Em al-
guns organismos aquticos, como por exemplo, na gua viva, 95%
da massa corporal so compostos por gua. No corpo humano,
excludo o tecido sseo, a gua perfaz aproximadamente 85% da
massa corporal.
percentual de gua por peso em
alguns rgos do corpo humano
a
Tecido ou rgo
Percentual de gua
por pessoa
Msculo esqueltico 79
b
Corao 83
b
Fgado 71
Rim 81
Pulmo 79
Crebro 77
a
em um individuo adulto;
b
considerando o tecido sem gordura.
Tabela 1.1 Percentual de gua por peso em alguns rgos do corpo humano
18 Bioqumica
Alm de sua abundncia, a importncia da gua pode ser tam-
bm destacada em funo de que praticamente todas as interaes
e as reaes que ocorrem nas clulas tm lugar em uma ambiente
aquoso. Assim, a gua o solvente biolgico fundamental para a
vida, de modo que, onde ela escassa, os organismos apresentam
formas elaboradas para ret-la.
Apesar de a gua ser aparentemente uma molcula bastan-
te simples, na verdade quando comparada com outros lquidos,
como alguns solventes orgnicos, descobrimos que se trata de uma
molcula com propriedades extraordinrias.
Um dos parmetros utilizados para a comparao entre solven-
tes comuns o ponto de ebulio. Enquanto o ponto de ebulio
do etanol igual a 78C, do metanol igual a 65C e da acetona
igual a 56C, e o da gua igual a 100C. Esta e muitas outras
propriedades especiais da gua tm sua origem no fato de que as
molculas de gua tendem a formar interaes entre si. Estas inte-
raes intermoleculares so denominadas pontes de hidrognio.
As pontes de hidrognio do gua uma srie de propriedades
importantes que permeiam a base da vida como ns conhecemos.
1.2 Ponte de Hidrognio
A ocorrncia das pontes de hidrognio conseqncia do com-
portamento da gua como um dipolo, ou seja, conseqncia da
diferena de eletronegatividade entre os tomos de hidrognio e
oxignio presentes na molcula.
Eletronegatividade de Alguns Elementos Qumicos
Elemento Eletronegatividade*
F 4.0
O 3.5
Cl 3.0
N 3.0
Br 2.8
S 2.5
C 2.5
I 2.5
Se 2.4
P 2.1
H 2.1
Cu 1.9
Fe 1.8
Co 1.8
Ni 1.8
Mo 1.8
Zn 1.6
Mn 1.5
Mg 1.2
Ca 1.0
Li 1.0
Na 0.9
K 0.8
*Quanto maior o nmero, maior a eletronegatividade (maior a
afnidade por eletrons) do elemento qumico.
Tabela 1.2 - Eletronegatividade de alguns elementos qumicos
As pontes de hidrognio entre as molculas de gua so for-
madas porque o tomo de oxignio na gua tende a atrair mais os
eltrons do que os tomos de hidrognio. Conseqentemente, os
tomos de oxignio tendem a ser levemente mais eletronegativos,
enquanto os tomos de hidrognio tendem a ser levemente po-
sitivos. Assim, dado que cargas opostas se atraem, os tomos de
hidrognio de uma molcula de gua tendem as ser atrados pelos
tomos de oxignio de uma outra molcula de gua, de modo a for-
mar a chamada ponte de hidrognio, uma ligao no-covalente.
Apesar de uma nica ponte de hidrognio ser uma ligao fraca,
o conjunto de milhares delas torna a gua mais coesiva do que
outros solventes ou mesmo molculas aparentemente semelhan-
tes, como por exemplo o H
2
S, e a base das propriedades e do
comportamento da gua.
20 Bioqumica
1.3 Qual o Signifcado de Hidroflico e
Hidrofbico?
As pontes de hidrognio so fracas e tendem, constantemente,
a se desmancharem e se formarem novamente. Assim, a estrutura
da gua complicada e ao mesmo tempo muito fuida. Quanto
maior a temperatura, esta alternncia ocorre com uma freqncia
maior. Uma conseqncia disso que outras molculas capazes de
formar pontes de hidrognio podem, por sua vez, interagir com a
gua, formando elas mesmas suas prprias pontes de hidrognio
Figura 1.1
H
O
+
H
Natureza dipolar da gua
(dipolo)
Hidrognio
Ponte de Hidrognio
0.177 nm
104.5
Ligao covalente
0.0965 nm
Carbono
Pontes de hidrognio entre vrias molculas de gua
Figura 1.2
Figura 1.3
com as molculas de gua. Isto o que chamamos de dissoluo
na gua, ou seja, existem molculas que se dissolvem facilmente
na gua.
Por outro lado, observamos facilmente que muitas substncias
no se dissolvem na gua. O exemplo clssico, o qual todos ns
j observamos, representado pelos leos, molculas que os bio-
qumicos chamam de lipdeos, assim como um vasto conjunto de
molculas orgnicas, tais como o benzeno e o tolueno, e os hi-
drocarbonetos, como o propano e o butano. Estas substncias so
incapazes de formar pontes de hidrognio e desta forma no se
dispersam na gua de forma espontnea.
Voc j deve ter observado isto quando azeite de oliva mistu-
rado com vinagre. Esta observao cotidiana simples a base de
uma classifcao fundamental das molculas, inclusive das bio-
molculas importantes para os organismos vivos.
Assim, alguns compostos so chamados de hidroflicos, ou po-
lares, ou seja, so aqueles que tm afnidade pela gua. Esta afni-
dade pode ser explicada pela sua capacidade de formar pontes de
hidrognio com a gua. Alguns exemplos entre estes compostos
de natureza polar so o etanol (lcool comum) e o cloreto de sdio
(sal de cozinha), entre outros. Por outro lado, alguns compostos
so chamados de hidrofbicos ou apolares, ou seja, literalmente,
compostos que tm medo da gua, como por exemplo, o azeite
e o benzeno.
Este conceito geral de fundamental importncia quando fa-
lamos de biomolculas. Principalmente porque devemos lembrar
que estas biomolculas no interior da clula esto em um meio
aquoso. Na verdade, muitas vezes, no caso das biomolculas, mui-
tas delas podem apresentar uma regio polar ou hidroflica e outra
apolar ou hidrofbica. Estas molculas so denominadas molcu-
las anfpticas. Isto faz com que as molculas se orientem no s
em relao gua, como tambm em relao umas s outras: as
regies hidroflicas se atraem, enquanto o mesmo pode ser obser-
vado com as regies hidrofbicas.
Quando as molculas se organizam em uma dada orientao,
estruturas biolgicas complexas e altamente organizadas podem
22 Bioqumica
ser formadas, como, por exemplo, as membranas celulares. Alm
disso, este fenmeno est na base do reconhecimento e da intera-
o entre biomolculas. Assim, podemos concluir que estas inte-
raes so fundamentais para os processos vitais.
Molcula
polar
Molcula
anfptica
polar
apolar
Figura 1.4
Resumo
A gua, uma molcula polar, tem, pelo menos, trs papis im-
portantes na clula: um solvente efciente, participa de diversas
reaes e contribui para a estabilidade da temperatura. Como sol-
vente, a gua interage com biomolculas inicas e polares. Assim,
as propriedades da gua tm efeito direto no comportamento das
biomolculas.
Uma ponte de hidrognio (ou ligao de hidrognio) um caso
especial de interao dipolo-dipolo. Tanto no estado lquido, como
no slido, as molculas de gua so amplamente ligadas entre si por
hidrognio. As pontes de hidrognio entre a gua e solutos polares
ocorrem em solues aquosas. As pontes de hidrognio tambm
so importantes para estabilizar as estruturas tridimensionais de
diversas biomolculas, como, por exemplo, os cidos nuclicos.
Bibliografa
CAMPBELL, M. K. & FARRELL, S.O. Bioqumica: Vol 1 Bio-
qumica bsica. 5. ed. So Paulo: Tomson Learning, 2007.
THORTON, R. M. Te chemistry of life [CD-ROM]. New York:
Benjamim Cummings, 1999.
Bibliografa Comentada
The chemistry of life
R. M. Torton
Este CD-ROM oferece um material complementar bastante in-
teressante sobre as propriedades da gua e sua interao com as
biomolculas. O material inclui algumas animaes e exerccios
que facilitam a compreenso do tema e possibilitam a fxao de
conceitos atravs de exerccios e questionrios. Uma seo com
as perguntas e dvidas mais comuns sobre o assunto particular-
mente interessante.
THORTON, R. M. Te chemistry of life [CD-ROM]. New York: Benjamim
Cummings, 1999.
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2
Os tomos Presentes nas
Biomolculas
Neste captulo estudaremos os tomos encontrados nas
biomolculas.
27 Os tomos Presentes nas Biomolculas
A vida na Terra baseada no tomo de carbono. Devido a sua
estrutura atmica nica, o carbono pode se combinar com outros
elementos, especialmente o hidrognio, oxignio, nitrognio e en-
xofre. Mas, tambm pode se combinar com outro(s) tomo(s) de
carbono. E esta segunda propriedade a base da enorme gama de
biomolculas que so encontradas nos organismos vivos.
Uma grande parte da Bioqumica envolve o estudo das biomol-
culas: sua estrutura, suas propriedades e a relao destas com sua
funo biolgica. Alm disso, o estudo de como elas so forma-
das, como interagem umas com as outras e tambm com outras
molculas pequenas um foco importante para o entendimento
da lgica molecular da vida. O conceito de interao molecular
muito importante em Bioqumica e permite entender as estruturas
celulares e o reconhecimento entre molculas, fundamentais para
os processos vitais.
Existem aproximadamente cem elementos qumicos presentes
na crosta terrestre, mas somente aproximadamente 31 (28%) deles
ocorrem naturalmente em plantas e animais, ou seja, so essen-
ciais vida, e somente quatro deles, ou seja, carbono, hidrognio,
oxignio e nitrognio perfazem 95% da toda a matria viva.
Certamente, a proporo desses elementos nos organismos no
encontra paralelo na sua abundncia na biosfera. O alumnio, por
exemplo, bastante abundante, mas no tem relevncia signifca-
tiva na qumica da vida. Provavelmente, o fator mais importante
a habilidade do carbono de formar ligaes com ele mesmo e com
28 Bioqumica
os tomos mencionados acima (H, O, S e N). O carbono nico
nesta propriedade.
Quando analisamos a composio qumica dos organismos vi-
vos, descobrimos que no somente eles so formados dos mesmos
elementos os quatro mencionados acima , como ainda encon-
tramos o fsforo e o enxofre, alm de alguns elementos metlicos.
Entre estes elementos metlicos, tambm denominados elemen-
tos-trao, podem ser destacados o ferro e o cobre, alm do zin-
co, magnsio, mangans e selnio, entre outros. Outros elementos
presentes nas clulas so o clcio, o potssio, o sdio e o cloro.
De modo geral, os elementos encontrados nos organismos vi-
vos podem ser divididos em trs categorias:
1. Elementos essenciais para a vida: carbono, hidrognio, oxi-
gnio, nitrognio, fsforo e enxofre, que perfazem aproxi-
madamente 92% do peso seco dos organismos;
2. Elementos necessrios em quantidades-trao na maior parte
dos organismos e da mesma forma essenciais para a vida,
como por exemplo, clcio, mangans, ferro e iodo;
3. Elementos-trao que esto presentes em alguns organismos e
podem ser essenciais para a vida, como o molibdnio.
Alm disso, descobrimos que os organismos vivos apresentam
os mesmos tipos ou classes de biomolculas.
Ao comparamos uma bactria com uma clula vegetal e uma
clula humana, descobrimos uma unidade comum, ou seja, todas
so formadas por aproximadamente 70% de gua e dos mesmos
tipos de biomolculas.
verdade que cada organismo possui um conjunto prprio de
um dado tipo de biomolcula, mas o desenho molecular bsico
em todos os seres vivos idntico, ou seja, se ns entendermos a
estrutura, as propriedades e como as biomolculas (como as pro-
tenas, por exemplo) funcionam nas clulas, ns seremos capazes
de entender os processos vitais em todos os organismos.
29 Os tomos Presentes nas Biomolculas
Resumo
A Bioqumica um campo multidisciplinar que investiga e es-
tuda a natureza molecular de processos vitais. H semelhanas
bioqumicas fundamentais entre os organismos vivos, as quais
fornecem subsdios para uma conexo comum com a origem da
vida. Tanto a Qumica Orgnica como a Bioqumica estudam mo-
lculas que contm carbono, bem como a relao entre elas. Alm
do carbono, as biomolculas apresentam hidrognio (H), oxignio
(O), alm de nitrognio (N), enxofre (S) e fsforo (P). Para ambas
as disciplinas, o comportamento de grupos funcionais presentes
nas molculas so um ponto importante, mas a nfase distinta
em cada uma delas, isso porque alguns grupos funcionais ou mo-
lculas importantes para a Qumica Orgnica no tm a mesma
relevncia para a Bioqumica e vice-versa.
Outros elementos so ainda importantes para os organismos vi-
vos, sendo necessrios em quantidades reduzidas (microelemen-
tos essenciais). Entre eles esto o ferro (Fe), cobre (Cu), zinco (Zn)
e vandio (Vn), os quais esto presentes na estrutura de biomol-
culas, como as protenas, por exemplo.
Bibliografa
THORTON, R. M. Te chemistry of life [CD-ROM]. New York:
Benjamim Cummings, 1999.
U
N
I
D
A
D
E

B
Unidade B
Biomolculas
33
Biomolculas: Aspectos Gerais
Muitas das molculas importantes presentes nas clulas so mo-
lculas grandes, ou seja, macromolculas. Mesmo as clulas mais
simples contm milhares de diferentes tipos de macromolculas,
cuja massa molecular relativa varia de alguns milhares a alguns
milhes de daltons.
Da mesma forma como vrios materiais comuns utilizados no
nosso cotidiano, como plsticos, por exemplo, as macromolculas
biolgicas so polmeros, ou seja, molculas grandes, complexas,
formadas pela repetio de molculas simples e pequenas, as quais
so denominadas unidades fundamentais (tambm chamadas de
blocos constitutivos). Assim sendo, as macromolculas podem ser
vistas como polmeros biolgicos.
As unidades fundamentais que se repetem milhares de vezes na
formao das macromolculas biolgicas so ligadas entre si co-
valentemente, de uma forma seqencial ordenada. Esta ordem ou
seqncia caracterstica de um dado polmero e fundamental
para a sua funo biolgica.
As ligaes covalentes entre as unidades fundamentais presen-
tes nas macromolculas so quase sempre formadas atravs de
uma reao que leva a remoo de uma molcula de gua. Este
tipo de reao chamado de reao de condensao, acompanha-
da pela eliminao de uma molcula de gua, ou seja, acompa-
nhada de uma reao de desidratao. Assim sendo, as unidades
Dalton
Unidade de massa
aproximadamente igual a
um tomo de hidrognio
(igual a 1.0000 na escala
de massa atmica). A
denominao foi dada em
honra a John Dalton (1766-
1844), que desenvolveu a
teoria atmica da matria.
34 Bioqumica
fundamentais agora ligadas covalentemente no polmero no esto
mais ntegras e, por isso, passam a ser denominadas de resduos.
O processo inverso, ou seja, a quebra da ligao covalente entre
as unidades fundamentais de um polmero, pode ocorrer, sendo
a reao neste caso denominada hidrlise. Esta reao tambm
importante para os organismos vivos, pois a base do processo da
digesto.
As ligaes entre as unidades fundamentais nas diferentes classes
ou diferentes tipos de macromolculas, apesar de serem igualmen-
te formadas atravs de uma reao de condensao, so distintas,
envolvendo diferentes grupos presentes nas unidades fundamen-
tais em cada caso.
Um outro aspecto que devemos salientar est relacionado ao
fato de que ao ser formado, um polmero (imagine um polmero
linear), em funo da estrutura das unidades fundamentais, apre-
senta polaridade. Isto signifca que ao se examinar cada uma das
extremidades do polmero resultante, observamos que elas so di-
ferentes. Cada extremidade apresenta um grupo qumico distinto.
Do ponto de vista biolgico, isto pode ser entendido como a
existncia de uma direo ou um sentido no polmero. Veremos
que esta direo determina, por exemplo, reconhecer o primeiro
resduo (o resduo nmero um) da seqncia do polmero. Este
reconhecimento fundamental nos processos biolgicos dentro
da clula, como por exemplo, no fuxo de informao gnica.
Se por um lado, a complexidade das macromolculas funda-
mental para a sua funo biolgica, por outro, ela difculta o estu-
do da sua estrutura. Mas, recentemente, novas estratgias e meto-
dologias da Bioqumica Moderna possibilitaram a determinao
da estrutura de centenas destas macromolculas, fornecendo uma
base slida para o entendimento da sua funo biolgica, particu-
larmente das protenas.
Nesta unidade ns vamos estudar os diversos tipos de macro-
molculas encontrados nas clulas, sob a tica dos princpios ge-
rais apresentados acima. Desta forma, vamos buscar entender os
princpios que regem a arquitetura das biomolculas e sua relao
com suas propriedades e funo biolgica.
c
A
p
t
U
l
o

3
Protenas
Neste captulo estudaremos a estrutura e as principais pro-
priedades de aminocidos, relacionando os 20 aminocidos
primrios como unidades fundamentais da formao de pro-
tenas, bem como as suas propriedades e funes biolgicas.
Tambm estudaremos o nvel de organizao das protenas,
suas funes biolgicas e a sua relao com a estrutura tridi-
mensional das mesmas.
37 Protenas
3.1 Caractersticas Gerais
As protenas so macromolculas extremamente versteis. Elas
desempenham uma ampla gama de funes biolgicas e apresen-
tam uma grande variedade em termos de arquitetura molecular.
Alguns exemplos de protenas e de suas respectivas funes biol-
gicas podem ser vistos na Tabela 3.1.
Algumas protenas e suas Funes Biolgicas
Transporte e Armazenamento
Casena Protena encontrada no leite; fonte de aminocidos
Ferritina
Protena largamente distribuda e
que armazena ferro
Contrao Muscular
Actina Componente do msculo esqueltico
Miosina Componente do msculo esqueltico
Defesa
Anticorpos
Produzidas pelo sistema imune de animais
superiores, participam da destruio de invasores
biolgicos (patgenos)
Interferons
Produzidas pelos animais superiores,
interferem com a replicao viral
38 Bioqumica
Enzimas
Tripsina
Enzima digestiva dos vertebrados que catalisa a
hidrlise de protenas
RNA Polimerase
Enzima que catalisa a sntese de RNA dependente de
DNA
Estrutura
Elastina
Protena fbrosa presente no tecido conectivo:
pulmes e em vasos sanguneos (aorta)
Queratina
Protena fbrosa mecanicamente resistente dos
vertebrados (cabelo, unha, penas, cascos)
Tabela 3.1 - Algumas protenas e suas funes biolgicas
Muitas protenas, como a hemoglobina (envolvida no transporte
de gases) ou as imunoglobulinas (tambm denominadas anticor-
pos), so molculas hidroflicas, enquanto outras so molculas
insolveis em gua ou hidrofbicas, alm de extremamente resis-
tentes, como por exemplo, as queratinas. Esta diferena em termos
de solubilidade em gua e conseqncia de caractersticas distintas
da arquitetura molecular destas protenas refete a funo biolgi-
ca associada a cada uma delas.
As protenas com carter hidroflico apresentam uma estrutu-
ra mais compacta e globular, enquanto as hidrofbicas tendem a
apresentar uma estrutura fbrilar, na forma de um cordo. Assim,
genericamente podemos distinguir dois tipos de protenas quanto
a sua forma: globulares e fbrosas. As protenas globulares exercem
funes biolgicas mais dinmicas, tal como o transporte de gases,
como no caso da hemoglobina, por exemplo. Por outro lado, as
protenas fbrosas podem ser mais freqentemente associadas s
funes de natureza estrutural, tal como na formao de tecidos,
como no caso do colgeno presente na derme, ossos e tendes de
animais vertebrados.
Uma outra caracterstica das protenas tambm refete sua di-
versidade estrutural: seu tamanho. As protenas apresentam uma
gama ampla de tamanhos, refexo do nmero de unidades funda-
mentais presentes em cada uma delas (Tabela 3.2).
39 Protenas
Alguns dados sobre a composio de algumas protenas
Massa
molecular
Nmero de
resduos de
aminocidos
Nmero de
cadeias
polipeptidicas
Citocromo c
(humano)
13.000 104 1
Ribonuclease A
(pncreas bovino)
13.700 124 1
Lisozima
(clara do ovo)
13.930 129 1
Mioglobina
(corao equneo)
16.890 153 1
Quimotripsina
(pncreas bovino)
21.600 241 3
Quimotripsinognio
(bovino)
22.000 245 1
Hemoglobina
(humana)
64.500 574 4
Soroalbumina
(humana)
68.500 609 1
Hexoquinase
(levedura)
102.000 972 2
RNA polimerase
(E.coli)
450.000 4.158 5
Apolipoprotena B
(humana)
513.000 4.536 1
Glutamina sintase
(E. coli)
619.000 5.628 12
Tabela 3.2 - Dados sobre a composio de algumas protenas
Algumas protenas apresentam ainda em sua estrutura uma
parte de natureza distinta das unidades fundamentais que as cons-
tituem. Neste caso, podemos encontrar associado ao polmero um
on metlico, como por exemplo, selnio ou cobre, ou ainda uma
molcula orgnica, relativamente pequena em relao ao tamanho
da protena, como por exemplo, um carboidrato.
Protenas que apresentam esta caracterstica so classifcadas
como protenas conjugadas. Por sua vez, os tipos de protenas
40 Bioqumica
conjugadas so defnidos com base na natureza molecular do gru-
po presente na sua estrutura polimrica. Assim, os exemplos acima
defnem dois tipos de protenas conjugadas: as metaloprotenas e
as glicoprotenas, respectivamente.
3.2 Aminocidos
Apesar de algumas diferenas entre as protenas, conforme des-
tacado anteriormente, como por exemplo, o seu tamanho ou sua
forma, podemos afrmar que estas biomolculas tm uma caracte-
rstica fundamental em comum que as identifca. As protenas so
macromolculas ou polmeros formados a partir de unidades mais
simples, ou seja, unidades fundamentais.
Ento, afnal, do que so constitudas as protenas?
Quando analisamos a composio dos milhares de tipos dife-
rentes de protenas presentes nos organismos vivos, observamos
que elas so formadas a partir da seleo de um conjunto determi-
nado de blocos constitutivos, os aminocidos.

Aminocidos essenciais
Os aminocidos tm tambm importncia nutri-
cional, uma vez que so a matria-prima para a for-
mao das protenas celulares. No entanto, os or-
ganismos vivos no sintetizam todos os 20 amino-
cidos padro.
Alguns destes aminocidos (em torno de dez) de-
vem vir da dieta ou do turnover (reaproveitamen-
to) dos aminocidos presentes na clula, oriundos,
por exemplo, da degradao de protenas celula-
res. Estes aminocidos so chamados de amino-
cidos essenciais.
No conjunto, os aminocidos essenciais podem
variar de espcie para espcie, ou mesmo, com a
fase de desenvolvimento. Uma boa alimentao
deve incluir protenas de boa qualidade, ou seja,
que apresentem aminocidos essenciais em sua
composio e em uma boa quantidade. Estas ca-
ractersticas defnem o valor nutricional de uma
protena (VNP). As protenas do leite, por exemplo,
so ricas em triptofano. Por outro lado, os gros de
arroz e milho normalmente so pobres em lisina,
enquanto as leguminosas, como o feijo, so po-
bres em aminocidos sulfurados, como a metioni-
na. Assim, os vegetarianos devem consumir cere-
ais e feijo juntos em uma refeio. Deste modo,
as protenas complementares representam uma
mistura que fornece todos os aminocidos essen-
ciais. No entanto, no basta que uma protena te-
nha somente um bom contedo de aminocidos
essenciais. A protena deve ter tambm uma boa
digestibilidade. Estas duas caractersticas so am-
bas desejveis e defnem o valor biolgico de uma
protena (VBP).
41 Protenas
Cada aminocido, conforme j fca claro a partir de sua deno-
minao, apresenta em sua estrutura um grupo amina e um grupo
carboxila (cido carboxlico), ambos ligados a um mesmo carbono,
o qual denominado carbono alfa (carbono ). Assim, de modo
mais preciso, podemos dizer que as protenas so constitudas por
-aminocidos. Observe a representao da frmula geral de um
-aminocido na Figura 3.1.
HN H
R
C
COOH
Figura 3.1
Observando a frmula geral dos aminocidos, podemos perceber
que, se por um lado, h uma identidade molecular comum entre eles,
devido a presena do grupo amina, grupo carboxila e um tomo de
hidrognio, todos ligados ao carbono , por outro lado, cada amino-
cido tem uma identidade estrutural particular devido a presena de
um grupo denominado grupo R ou cadeia lateral. O grupo R no
s diferencia estruturalmente os -aminocidos entre si, mas confe-
re propriedades distintas a eles, como veremos logo a seguir.
Note que de acordo com a frmula geral, o carbono um car-
bono assimtrico ou centro quiral, o que implica na existncia de
duas formas espaciais ou tridimensionais para os aminocidos, ou
seja, duas formas de imagem especular no-superpostas ou este-
reoismeros. Os estereoismeros da srie L (do latim laevus, signi-
fcando esquerda), de acordo com o padro do composto gliceral-
dedo, so os que ocorrem nas protenas. Embora os aminocidos
D (do latim dexter, signifcando direita) ocorram na natureza, eles
so encontrados nas paredes de clulas bacterianas e em alguns
antibiticos, mas no em protenas.
Neste ponto podemos trabalhar um pouco com a estrutura
dos -aminocidos. Voc pode tentar representar os seguintes
-aminocidos:
um -aminocido cujo grupo R ou cadeia lateral um tomo 1.
de hidrognio (o aminocido mais simples);
42 Bioqumica
um -aminocido cujo grupo R ou cadeia lateral um grupo 2.
metil;
um -aminocido cujo grupo R ou cadeia lateral apresenta uma 3.
hidroxila ligada ao carbono ;
um -aminocido cujo grupo R ou cadeia lateral apresenta um 4.
grupo carboxila, ligado ao carbono ;
um -aminocido cujo grupo R ou cadeia lateral apresenta um 5.
grupo amina, ligado ao carbono .
CH

1
CH CH CH CH COOH
6 5 4 3 2
Figura 3.2
Observe agora a Figura 3.4 e identifque os aminocidos que
voc representou. Os exemplos que voc representou mostram
apenas parte da diversidade encontrada nos -aminocidos que
formam as protenas, pois outros grupos R apresentam enxofre ou,
ainda, anis aromticos, por exemplo.
Na Figura 3.4 esto representados todos os -aminocidos co-
mumente encontrados nas protenas. Estes aminocidos, em um
total de 20, so tambm chamados de aminocidos primrios ou
aminocidos padro, ou ainda, aminocidos padro.
Os 20 -aminocidos que constituem as protenas podem ser
classifcados levando-se em conta a estrutura do grupo R. Com
base nesta classifcao estrutural, os aminocidos primrios po-
dem ser classifcados, por exemplo, em aminocidos alifticos, sul-
furados ou aromticos, como leucina, metionina ou fenilalanina,
respectivamente (Figura 3.4).
Apesar desta classifcao ser til, ela apresenta algumas limita-
es. Uma destas limitaes que nesta classifcao no levado
em considerao o comportamento dos aminocidos em um meio
aquoso, ou seja, em contato com a gua, no pH intracelular. Estas
caractersticas presentes no meio intracelular so relevantes para
o entendimento do comportamento e das interaes dos prprios
43 Protenas
aminocidos, mas, principalmente, para a compreenso das prote-
nas formadas por eles.
Devemos salientar que a frmula geral dos -aminocidos no
uma representao fel de como eles se apresentam no interior
da clula, considerando o pH neutro (pH 7,0). Na verdade, dado
o comportamento do grupo carboxila e do grupo amina em fun-
o do pH, nos -aminocidos o grupo carboxila pode perder um
prton, apresentando-se ionizado ou carregado negativamente,
enquanto o grupo amina apresenta-se protonado ou carregado po-
sitivamente em pH neutro ou perto dele. Assim, os -aminocidos
existem como zwitterions no interior da clula, como mostrado na
Figura 3.3.
H
R
C
COO
HN
+
Figura 3.3
Assim sendo, a classifcao dos aminocidos utilizada em Bio-
qumica leva em considerao o comportamento do grupo R (a
parte que diferencia os aminocidos entre si) sob dois critrios
principais: na presena de gua e no pH 7,0. Assim, alm da po-
laridade (o carter hidrofbico ou hidroflico) do grupo R, a pre-
sena de um grupo ionizado ou protonado no pH 7,0 tambm
levada em considerao.
De acordo com estes critrios, os 20 -aminocidos mostrados
na Figura 3.4 podem ser divididos em quatro grupos distintos: 1.
aminocidos apolares (ou hidrofbicos); 2. aminocidos polares
neutros (ou hidroflicos neutros); 3. aminocidos polares carrega-
dos negativamente; e, 4. aminocidos polares carregados positiva-
mente. O agrupamento dos 20 -aminocidos primrios de acor-
do com esta classifcao pode ser visto na Figura 3.4.
44 Bioqumica
HN C
COO
-
H
H
+
HN C
COO
-
CH
CH
CH CH
H
+
HN C
COO
-
CH
H
+
HN C
S
COO
-
CH
CH
CH
H
+
HN C
COO
-
CH
CH CH
H
+
HN C
COO
-
C H
CH
CH
CH
H
+
Apolar grupos R alifticos
HN C
COO
-
CH
H
+
HN C
COO
-
CH
H
+
OH
HN C
COO
-
CH
C
H
CH
NH
+
Fenilalanina Tirosina Triptofano Fenilalanina Fenilalanina Fenilalanina
Glicina Glicina Glicina Alanina Alanina Alanina Valina Valina Valina
Leucina Leucina Leucina Metionina Metionina Metionina Isoleucina Isoleucina Isoleucina
Tirosina Tirosina Tirosina Triptofano Triptofano
Grupos R aromticos
HN C
COO
-
CHOH
H
+
C
COO
-
CH
CH
H
HN
+
HC
HN C
COO
-
C
CH
H
+
H OH
HN C
COO
-
CH
SH
H
+
HN C
COO
-
CH
C
HN O
H
+ HN C
COO
-
CH
C
HN O
H
+
CH
Serina Serina Serina Serina Treonina Treonina Treonina Cistena Cistena Cistena Glutamina Glutamina Glutamina Asparagina Asparagina Asparagina Prolina Prolina Prolina
Polar grupo R neutro
HN C
COO
-
CH
CH
H
+
NH
+
CH
CH
Lisina Lisina Lisina
HN C
C
COO
-
CH
CH
H
+
NH
CH
NH
NH
+
Arginina Arginina Arginina
HN C
COO
-
CH
C
C
H
H
NH
N
CH
+
Histidina Histidina Histidina
Grupos R carregados positivamente
HN C
COO
-
CH
COO
-
H
+
HN C
COO
-
CH
COO
-
H
+
CH
Aspartato Aspartato Glutamato Glutamato Glutamato
Grupos R carregados negativamente
Figura 3.4
45 Protenas
3.3 Como os Aminocidos se Ligam para
Formar as Protenas?
Um conjunto formado pelos 20 aminocidos primrios pode
ser utilizado como matria-prima pela clula para formar suas
protenas. Uma analogia simples poderia ser utilizada aqui com o
objetivo de melhor compreendermos a formao de um polme-
ro de aminocidos, ou seja, uma protena. Podemos imaginar que
dispomos de 20 tipos diferentes de contas para confeccionarmos
um colar, ou seja, contas de diferentes tamanhos, formas e textu-
ras. Assim, o tipo do colar a ser produzido vai depender de quais
contas forem escolhidas e da ordem em que elas forem colocadas.
Este um principio fundamental no s na formao de protenas,
como tambm de outros polmeros biolgicos.
Na formao de uma protena, os aminocidos so unidos
atravs de ligaes covalentes. Esta ligao covalente formada
a partir de uma reao de condensao que ocorre entre o grupo

Aminocidos e neurotransmissores
Dois aminocidos primrios, a tirosina (TYR) e o
triptofano (TRP), so precursores de duas classes
de neurotransmissores. Os produtos ativos forma-
dos a partir destes aminocidos so derivados mo-
noaminados, ou seja, so formados a partir da des-
carboxilao destes aminocidos. Estes derivados
so degradados ou desativados por enzimas, de-
nominadas monoamina oxidases (MAOs).
O TRP um precursor da serotonina, a qual tem
um efeito sedativo, provocando uma sensao de
bem-estar. Nveis muito baixos de serotonina esto
associados com a depresso, enquanto que nveis
extremante altos esto associados com o transtor-
no bipolar.
A TYR, derivada de um outro aminocido, a feni-
lalanina (PHE), convertida em epinefrina, mais
conhecida pelo nome de adrenalina. A adrenali-
na tambm conhecida como hormnio de fuga.
Seu efeito est associado com a liberao de glico-
se na corrente sangnea, alm de estimular a fun-
o cerebral.
Aminocidos incomuns
Os aminocidos chamados incomuns so na ver-
dade aminocidos modifcados, pois so derivados
dos aminocidos comuns (ou padro) e so pro-
duzidos por modifcao destes, depois da prote-
na ter sido sintetizada pela clula. Este processo de
modifcao de aminocidos na protena se chama
modifcao ps-traduo. Estes aminocidos mo-
difcados ocorrem somente em algumas protenas.
Um exemplo a hidroxilisina (HLYS), diferente do
aminocido parental lisina (LYS) (a partir do qual
foi originada), por possuir um grupo hidroxila em
sua cadeia lateral. A HLYS encontrada somente
em algumas protenas do tecido conjuntivo, como
o colgeno, e importante para a manuteno da
estrutura desta protena.
46 Bioqumica
-carboxila de um aminocido e o grupo -amina de outro amino-
cido. Uma molcula de gua eliminada nesta reao e resduos
de aminocidos permanecem ligados covalentemente. A ligao
formada desta maneira denominada de ligao peptdica (tam-
bm chamada de amida) (Figura 3.5).
HN
+
+
CH
R R
H N CH
H
OH
O
C COO
HN
+
CH
R R
N CH
H
O
C COO
HO HO
Figura 3.5
Assim, os peptdeos so formados pela ligao de um peque-
no nmero de aminocidos que pode variar de um mnimo de
dois, formando um dipeptdeo, a algumas dzias. Muitos peptde-
os apresentam atividade biolgica, podendo, por exemplo, atuar
como hormnios.
Em uma protena, muitos aminocidos, normalmente acima de
cem, so ligados por ligaes peptdicas, dando origem a um pol-
mero, ou seja, a uma cadeia polipeptdica.
3.4 Nveis de Organizao Estrutural
em Protenas
3.4.1 Estrutura Primria
A ordem dos resduos de aminocidos na cadeia polipeptdica
fundamental para o seu arranjo no espao e, conseqentemente,
para a sua funo biolgica. Este o nvel mais simples a ser con-
siderado na organizao estrutural de uma protena, mas, nem
por isso, o menos importante. A ordem ou a seqncia dos res-
47 Protenas
duos de aminocidos na cadeia polipeptdica denominada de
estrutura primria.
Muito esforo foi despendido no desenvolvimento de estrat-
gias que permitissem a determinao da estrutura primria ou o
seqenciamento de polipeptdeos. Hoje, um nmero considervel
de seqncias conhecido (aproximadamente mais de 100.000).
A primeira seqncia de aminocidos a ser determinada foi para
uma pequena protena, a insulina. Atualmente, o seqenciamento
de polipeptdeos tornou-se comparativamente muito mais fcil e
normalmente efetuado de forma automatizada em seqenciadores
automticos, requerendo apenas pequenas quantidades da prote-
na purifcada.
As seqncias de aminocidos de milhares de protenas com-
pem hoje bancos de dados internacionais bastante extensos,
como por exemplo, o Protein Data Bank (PDB), os quais podem
ser facilmente acessados e consultados.
Apesar disso, podemos ainda dizer que prever a estrutura tridi-
mensional ou a forma de uma protena a partir da estrutura prim-
ria ainda uma tarefa bastante difcil. Com base no conhecimento
de partes da estrutura primria, podem-se fazer tentativas ou pre-
vises, mas a taxa de sucesso nestes casos no mximo igual a ou
em torno de 60%. Isto conseqncia do fato de que muitas das
leis que regem o dobramento de uma protena ou a sua estrutu-
ra tridimensional, de modo que ela apresente atividade biolgica,
ainda no so totalmente conhecidas.
Um outro mtodo de seqenciamento est baseado no fato de
que a seqncia de aminocidos de uma protena refete a seqn-
cia de bases do DNA do gene que a codifca, como veremos pos-
teriormente. Desta forma, utilizando mtodos disponveis para o
seqenciamento de DNA, possvel deduzir a seqncia de ami-
nocidos em uma dada cadeia polipeptdica.
3.4.2 Estrutura Secundria
A cadeia polipeptdica linear, como a descrevemos at agora,
sofre um empacotamento no espao aquoso intracelular, o qual
apresenta vrios nveis de complexidade.
Esta seqncia foi obtida por
Frederick Sanger, que recebeu
o Prmio Nobel de Qumica em
1958 por este trabalho.
48 Bioqumica
A partir do incio dos anos 50 do sculo XX, Linus Pauling e
seus colaboradores, trabalhando principalmente com modelos
moleculares e tambm com um conjunto de princpios qumicos,
analisaram as formas possveis ou conformaes possveis que uma
cadeia polipeptdica poderia adotar no espao. Uma das regras era
ditada pela prpria ligao peptdica, a qual se apresentava planar
em funo da ligao amida, o que restringia a rotao livre do es-
queleto polipeptdico. Esta restrio mostrou que somente poucas
conformaes seriam compatveis com esta limitao, bem como
outras regras qumicas, e ao mesmo tempo possibilitariam a for-
mao de uma estrutura molecular estvel.
Uma delas a -hlice, a qual ocorre em funo da formao de
uma espiral ou estrutura helicoidal, voltada para a direita, com um
padro determinado (3.6 resduos de aminocidos por volta da
hlice). Este tubo formado pelo esqueleto das ligaes peptdi-
cas e os radicais laterais dos resduos de aminocidos se projetam
para fora do mesmo (Figura 3.6).
R
O
N
H
C
C
C
C
C
C
C
C
C
C
C
C
C
C
C
C
C
C
C
C
C
C
R
R
R
R
R
R
R
R
R
R
N
N
N
N
N
N
N
N
N
N
N
O
O
O
O
O
O
O
O
O
O
Uma volta
da hlice
Ponte de
Hidrognio
3,6 resduos
por volta
Carbono
Cadeia
lateral
Figura 3.6
49 Protenas
As protenas com este arranjo so chamadas de protenas f-
brosas. Estas protenas so insolveis e rgidas, desempenhando
funo estrutural. Um exemplo clssico a queratina, a protena
do cabelo, das penas e dos cascos dos animais.
As protenas podem apresentar quantidades variveis de
-hlice, desde uma percentagem baixa at 100%, pois alguns fa-
tores podem desestabilizar este arranjo, como por exemplo, a pre-
sena de resduos de aminocidos com forte repulso eletrostti-
ca, causada pela proximidade de grupos laterais carregados com a
mesma carga eltrica.
Um outro tipo de arranjo de estrutura secundria encontrado
em protenas denominado de estrutura em ou folha preguea-
da (Figura 3.7).
Conformao em
(folha pregueada)
Cadeia lateral da Ala
(Alanina) (Glicina)
Cadeia lateral da Gly
3.5
5.7
Figura 3.7
Neste caso, o esqueleto polipeptdico apresenta-se mais estendi-
do, formando um zigue-zague relativamente frouxo e malevel.
Um exemplo clssico de uma protena onde este arranjo predomi-
na totalmente a fbroina, a protena da seda. Comparativamente,
esta protena no s mais malevel como mais fexvel quando
comparada com a queratina.
50 Bioqumica
3.4.3 Estrutura Terciria
As estruturas secundrias em -hlice e folhas pregueadas so
combinadas de diversas maneiras, conforme a cadeia polipeptdi-
ca de uma dada protena comea a dobra-se sobre si mesma, for-
mando uma estrutura mais compacta. Este enovelamento que leva
formao de uma estrutura globular chamado de estrutura ter-
ciria (Figura 3.8).
Figura 3.8
O enovelamento da cadeia polipeptdica, de modo geral, permi-
te que resduos de aminocidos apolares possam evitar o contato
com a gua que cerca a protena, permanecendo preferencialmente
posicionados na parte mais interna da estrutura globular. Assim,
este arranjo globular possibilita que a protena exiba um carter
mais polar ou solvel, compatvel com funes biolgicas mais di-
nmicas, como por exemplo, transporte de gases.
51 Protenas
Uma estratgia para se determinar a estrutura tridimensional
de uma protena envolve a anlise por cristalografa de raio X.
Atualmente, alm da cristalografa de raio X, outra metodologia, a
Ressonncia Magntica Nucelar (RMN), pode ser empregada para
molculas consideradas pequenas (PM at 20.000 daltons). A cris-
talografa de raio X ainda hoje demanda um grande esforo, apesar
do uso de programas computacionais cada vez mais efcientes em
lidar com a elaborao de imagens e a complexidade dos clcu-
los matemticos necessrios. Entretanto, seu emprego depende da
obteno de cristais da protena de interesse, o que no possvel
para algumas protenas.
Devemos lembrar que a informao para a montagem de uma
cadeia polipeptdica, na sua seqncia correta, mantida de ge-
rao em gerao. A hemoglobina humana apresenta sempre a
mesma estrutura primria, a qual apresenta diferenas em rela-
o, por exemplo, a hemoglobina de cavalo. Esta informao para
a montagem correta da ordem dos resduos de aminocidos est
armazenada no gene que codifca esta protena, presente no DNA
encontrado no ncleo de cada clula do corpo humano. Caso esta
informao seja corrompida ou alterada, uma protena defeituo-
sa passa a ser produzida, a qual no pode realizar a sua funo
biolgica de forma correta. Pode haver um ou mais resduos de
aminocidos errados na seqncia e dizemos que uma mutao
ocorreu. Este o caso da hemoglobina presente nos indivduos
que apresentam anemia falciforme, na qual um nico resduo de
aminocido em uma cadeia de 146 resduos (na cadeia , uma das
duas cadeias que compem a protena) foi alterado.
3.4.4 Estrutura Quaternria
Algumas protenas, como por exemplo, a hemoglobina ou os
anticorpos, apresentam um nvel estrutural superior aos descri-
tos at aqui. Este nvel de organizao estrutural mais complexo
envolve a participao de pelo menos duas cadeias polipeptdicas
na formao da protena. Este nvel estrutural denominado de
estrutura quaternria.
52 Bioqumica
As protenas formadas por duas ou mais cadeias polipeptdicas
so denominadas de protenas oligomricas e cada cadeia polipep-
tdica que forma a sua estrutura molecular, por sua vez, denomi-
nada de uma subunidade ou um oligmero (Figura 3.9). As subu-
nidades podem ser idnticas ou diferentes entre si.
Figura 3.9
Um exemplo clssico e bem estudado de uma protena com es-
trutura quaternria o da hemoglobina, citado acima. Esta pro-
tena oligomrica um tetrmero, ou seja, formada por quatro
cadeias, sendo duas cadeias e duas cadeias . As duas cadeias
so idnticas entre si, assim como as cadeias , sendo a estrutura
completa da hemoglobina representada como
2
2
. Esta hemo-
globina denominada de Hemoglobina A (Hb A). Na Hb A, as
cadeias so formadas por um total de 141 resduos de amino-
cidos, enquanto as cadeias apresentam 146 resduos. A hemo-
globina uma protena conjugada, conforme pode ser visto nas
Figuras 3.9 e 3.10.
53 Protenas
C
H
H
C
C
NH
C
N
C
N
C
HN
C
COO
- -
OOC
C C
HC
C C
H
CH
C
C
H
CH
CH
CH
CH
CH
C
C
C
C
C
HC
HC
HC
HC
HC
C C
C
H
H
C
C
N
C
N
C
N
C
N
C
COO
- -
OOC
C C
HC
C C
H
CH
C
C
H
CH
CH
CH
CH
CH
C
C
C
C
C
HC
HC
HC
HC
HC
C C
Fe (II)
N
H
Protoporfrina IX
Heme
(Fe-Protoporfrina IX)
Pirrol
Protoporfrina IX Protoporfrina IX
Heme Heme
(Fe-Protoporfrina IX) (Fe-Protoporfrina IX)
Pirrol Pirrol
Grupo Heme
His = Histidina
His F8
His E7
Stio de
ligao do
oxignio
Fe
Figura 3.10
54 Bioqumica
3.5 Foras Moleculares que Atuam na
Manuteno da Estrutura de Protenas
Assim como as ligaes peptdicas mantm a estrutura prim-
ria, como vimos anteriormente, a estrutura secundria das prote-
nas mantida por pontes de hidrognio (Figura 3.6). Apesar de
uma ponte de hidrognio ser, individualmente, uma ligao no
covalente fraca, muitas delas, formando um conjunto de centenas
ou milhares delas, acabam sendo responsveis por um efeito con-
sidervel na manuteno da estrutura molecular onde esto pre-
sentes. No caso da queratina, um outro tipo de ligao tambm
responsvel pela manuteno da -hlice. Esta ligao uma liga-
o covalente formada entre as cadeias laterais de duas cistenas,
sendo denominada de ponte dissulfeto (Figura 3.11).
HN
+
Cistena
Cistena
Cistina
Oxidao
Reduo
NH
+
CH
CH
CH
CH
SH
SH
COO
COO
HN
+
NH
+
CH
CH
CH
CH
S
S
COO
COO

2H + 2e
2H + 2e
+
+
-
-
Figura 3.11
Por outro lado, na manuteno da estrutura terciria, ou seja, da
estrutura enovelada da cadeia polipeptdica, diversos tipos de foras
moleculares podem atuar. Aqui devemos lembrar que as cadeias la-
terais ou grupos R dos resduos de aminocidos presentes nas pro-
tenas so distintas em termos de estrutura e propriedade, como
em relao ao carter hidrofbico ou hidroflico, por exemplo.
Com o enovelamento da cadeia polipeptdica, resduos distantes
na estrutura primria podem fcar bastante prximos na estrutura
terciria. Assim, h vrias formas dos grupos R interagirem dada
55 Protenas
esta proximidade espacial no ambiente aquoso e em pH neutro
(condies do meio intracelular). Resduos com cadeias laterais
hidrofbicas (contendo um grupo -CH
3
, por exemplo) podem in-
teragir entre si, evitando o contato com a gua circundante. Este
tipo de interao denominado interao hidrofbica. Por ou-
tro lado, resduos carregados positivamente (contendo um grupo
NH
3
+
, por exemplo) podem ser atrados por resduos cujas ca-
deias laterais estejam carregadas negativamente (-COO
-
), em uma
interao inica ou eletrosttica. Nas regies hidroflicas, pontes
de hidrognio podem ser formadas entre -OH, -NH
2
, etc.
Alm destas interaes no covalentes, ligaes covalentes do
tipo ponte dissulfeto podem ocorrer em algumas protenas: pon-
tes dissulfeto intracadeia ou pontes disssulfeto intercadeia (neste
ltimo caso, presentes em protenas com estrutura quaternria).
A fgura 3.12 mostra parte de uma cadeia polipeptdica, na qual
foras responsveis pela manuteno da sua estrutura molecular
podem ser visualizadas.
O
-
C
O
H
O
NH
3
M
2-
C
N
COO
-
Leu
CH
2
S
S
CH
2
Val
Ile
-Hlice
Ponte de
Hidrognio
Conformao
on Metlico
(coordenado)
Interaes
Hidrofbicas
Ponte Dissulfeto
Interao
Eletroesttica
Ponte de
Hidrognio
(cadeia lateral)
Agora voc pode entender como as subunidades da hemoglo-
bina, por exemplo, podem permanecer frmemente juntas, apenas
atravs de interaes fracas (no covalentes) intercadeias. As su-
Figura 3.12
56 Bioqumica
perfcies opostas se encaixam de modo muito preciso e estvel.
Na verdade, nas condies biolgicas normais (temperatura est-
vel e pH prximo do neutro) a separao das subunidades da he-
moglobina no ocorre facilmente.

Desnaturao de protenas do ponto de vista da queratina
Quando o cabelo molhado, notamos facilmente que os fos fcam mais
longos, ou seja, esticam. Isto porque a estrutura helicoidal da queratina
(-queratina), neste caso, apresenta-se menos espiralada, mais frouxa, ten-
do as pontes de hidrognio sido desmanchadas. A estrutura molecular do
cabelo esticado semelhante estrutura estendida de um polipeptdio
com estrutura em (ou estrutura em folha pregueada). As pontes dissulfe-
to, no entanto, permanecem intactas e contribuem para a restaurao do
arranjo helicoidal original quando os fos secam. Para a obteno de ondas
ou permanente, os fos midos devem ser enrolados e inicialmente trata-
dos com uma soluo de amnia que faz com que os fos inchem. Em se-
guida, um agente redutor adicionado para quebrar as pontes dissulfeto.
Esta combinao causa a extenso da -hlice, desmanchando as pontes
de hidrognio e as pontes dissulfeto. Aps a retirada do agente redutor por
enxge, um agente oxidante adicionado para possibilitar a formao de
pontes dissulfeto entre novos pares de resduos de cistena.
3.6 O que Desnaturao de Protenas?
Justamente por sua estrutura tri-
dimensional depender das interaes
entre as cadeias laterais dos resduos
de aminocidos que as constituem, as
protenas globulares so bastante sus-
ceptveis a mudanas no meio onde se
encontram. Estas mudanas interferem
com as interaes entre as cadeias late-
rais, o que leva a desestabilizao da es-
trutura globular. Esta desestabilizao
desmancha o enovelamento da cadeia
polipeptdica, conforme esquematiza-
do na Figura 3.13.
Protena
Nativa
Protena
Desnaturada
Figura 3.13
57 Protenas
O desenovelamento da cadeia polipeptdica denominado des-
naturao. A desnaturao acompanhada pela diminuio da
solubilidade da protena, em virtude da exposio dos resduos hi-
drofbicos. Em alguns casos esta diminuio da solubilidade pode
ser bastante drstica, acarretando a precipitao da protena.
Uma coisa importante a ser destacada que a desnaturao afe-
ta no somente a solubilidade, mas tambm a atividade biolgica
de uma dada protena. A protena desnaturada perde poder com-
pletamente a sua atividade biolgica.
Podemos no nos dar conta, mas um exemplo de desnaturao
que nos bastante familiar e que observamos freqentemente no
nosso cotidiano o que ocorre ao prepararmos um ovo cozido
ou frito. A mudana que ocorre com a albumina da clara do ovo
durante o cozimento ou a fritura conseqncia da desnaturao.
Neste exemplo, o processo de desnaturao irreversvel. No en-
tanto, em alguns casos, a desnaturao tem um carter reversvel e
a protena pode voltar a apresentar a sua conformao nativa, ou
seja, a sua estrutura globular original e, conseqentemente, ativi-
dade biolgica.
Com base no exemplo da principal protena da clara do ovo, a
ovoalbumina, voc j pode identifcar um agente desnaturante:
a temperatura. O aumento da temperatura causa a desnaturao
das protenas, sendo que a termolabilidade varia entre elas. Raras
protenas apresentam-se como sendo termoresistentes, como o
caso das protenas isoladas de bactrias extremflas, mais espe-
cifcamente, das bactrias termacidflas, as quais so adaptadas
a altas temperaturas e condies cidas para desenvolverem-se; as
condies tpicas so 80C a 90C e pH 2. Tais exigncias podem
ser resultado de adaptaes a condies adversas encontradas na
Terra primitiva. Uma vez que estes microorganismos esto adap-
tados a este tipo de hbitat, suas protenas devem ser estveis e
biologicamente ativas nestas condies.
Alm da temperatura, entre os outros agentes desnaturantes po-
demos citar as alteraes de pH, a presena de detergentes e de
metais-trao, como o Hg e o Pb.
58 Bioqumica
As pontes dissulfeto (ligaes covalentes) no so afetadas pelos
agentes desnaturantes citados at agora. Para a desnaturao com-
pleta de uma protena que apresente pontes dissulfeto, a mesma
deve ser tratada por um agente desnaturante denominado agente
redutor, como por exemplo, o -mercaptoetanol, que reduz as li-
gaes S-S (Figura 3.11).
3.7 A Importncia da Estrutura Primria
A seqncia de aminocidos (estrutura primria) de uma pro-
tena determina sua estrutura tridimensional, a qual por sua vez
determina suas propriedades, sendo, assim, fundamental para sua
funo biolgica. Nas enzimas, por exemplo, a complexa estrutura
tridimensional serve para colocar os aminocidos essenciais dire-
tamente envolvidos na catalisao da reao pertos uns dos outros.
Em todas as protenas, a correta estrutura tridimensional neces-
sria para a correta funcionalidade.
Um dos mais surpreendentes exemplos da importncia da es-
trutura primria encontrada na hemoglobina associada anemia
falciforme. Nesta doena, de origem gentica, as clulas vermelhas
do sangue so incapazes de fxar o oxignio de forma efciente. As
clulas vermelhas tambm assumem a forma de uma foice, que d
o nome doena.
As clulas em foice tendem a fxar-se em pequenos vasos san-
guneos, cortando a circulao e causando danos aos rgos. A
mudana em um nico aminocido na seqncia da estrutura pri-
mria causa todas essas drsticas conseqncias.
A diferena entre as hemoglobinas da anemia falciforme (he-
moglobina S) e as hemoglobinas normais (hemoglobinas A) se
torna aparente quando as duas protenas so clivadas em peque-
nos peptdeos pela enzima tripsina e os peptdeos so separados
pela tcnica de fngerprint. A tripsina cliva a hemoglobina nos re-
sduos de lisina e arginina. Quando a digesto da hemoglobina
S submetida mesma tcnica fngerprint, os resultados diferem
da hemoglobina A em apenas um peptdeo. As quatro cadeias de
aminocidos da hemoglobina consistem em dois pares de cadeias
59 Protenas
idnticas, chamadas e , respectivamente. A fm de determinar
se o peptdeo anormal da cadeia ou , necessria a separao
das duas cadeias. Isso pode ser feito atravs de cromatografa de
troca-inica. Aps a separao, a tcnica de fngerprint pode ser
feita novamente. No padro obtido a partir das cadeias separadas,
o peptdeo anormal encontrado na cadeia .
O peptdeo anormal obtido, formado por oito resduos, apre-
senta uma substituio de aminocido. Este peptdeo encontra-
do na regio N-terminal da cadeia . A seqncia mostra que, na
hemoglobina S, uma valina ocorre na posio 6 da cadeia , em
lugar de um cido glutmico que encontrado nessa posio na
hemoglobina A.
Hemoglobina A Val His Leu Thr Pro Glu Glu Lys
Hemoglobina S His Leu Thr Glu Lys Val Pro Val
Cadeia 2 3 4 7 8 6 5 1
Figura 3.14
A cadeia lateral muito polar do cido glutmico, contendo um
grupo carboxila ionizvel, foi substituda por um grupo no-po-
lar, o grupo isopropil da valina. Na estrutura tridimensional da
hemoglobina, esse resduo da posio 6 fca no exterior
da molcula. Uma molcula de hemoglobina S pode se
envolver em interaes hidrofbicas com outras mol-
culas de hemoglobina por causa da presena do resduo
no-polar. Essa interao no ocorre entre molculas de
hemoglobina A, a qual possui o resduo polar na mesma
posio. Como resultado, molculas de hemoglobinas S
agregam-se e essa agregao distorce a forma normal das
clulas vermelhas do sangue, causando os sintomas da
doena na forma de episdios cclicos.
Figura 3.15 - (a) Hemoglobina normal.
(b) Hemoglobina falciforme.
60 Bioqumica
Resumo
As protenas representam um grupo de biomolculas extrema-
mente verstil, considerando a gama das funes biolgicas que
desempenham. Protenas so biopolmeros de tamanho variado,
formados a partir de um conjunto de 20 -L-aminocidos, deno-
minados, genericamente, de aminocidos primrios ou aminoci-
dos padro.
Estes aminocidos apresentam uma estrutura geral comum,
composta de um carbono, ao qual esto ligados um tomo de hi-
drognio, um grupo carboxlico, um grupo amino e uma cadeia
lateral ou grupo R. O grupo R diferente para cada um os ami-
nocidos primrios. No ambiente aquoso intracelular, pH 7,0, os
aminocidos existem como ons dipolares, denominados zwitte-
rions. O comportamento da cadeia lateral, em termos de polari-
dade e ionizao no meio intracelular, defne a classifcao dos
aminocidos.
A ligao entre os aminocidos denominada de ligao pept-
dica e a base para a formao de peptdeos e protenas.
A arquitetura das protenas pode ser defnida com base em dife-
rentes nveis de organizao estrutural: primria, secundria, ter-
ciria e quaternria.
As protenas globulares podem ser desestabilizadas por diferen-
tes fatores, o que causa o seu desenovelamento. Este processo de-
nominado de desnaturao e tem conseqncias importantes para
a atividade biolgica de uma protena.
Bibliografa
BERG, J. M.; TYMOCZKO, J. L.; STRYER, L. Bioqumica. 5. ed.
Rio de Janeiro: Guanabara-Koogan, 2004.
NELSON, D. L.; COX, M. M. L. Princpios de Bioqumica. So
Paulo: Savier, 2005.
61 Protenas
Estes trs livros so referncias fundamentais para o estudo de
Bioqumica, enfocando tanto as biomolculas como o metabolis-
mo. So livros fartamente ilustrados, que oferecem fguras e exer-
ccios com respostas que podero ser utilizados como um comple-
mento importante para fxar os conceitos discutidos.
O livro de Campbell & Farrell traz um captulo especfco sobre
tcnicas de purifcao de protenas com uma abordagem concisa,
mas apresentando de forma clara e bem fundamentada um pa-
norama das vrias estratgias utilizadas na caracterizao destas
biomolculas.
Para saber (e ver) mais sobre estrutura de protenas consulte os
sites:
< www.whfreeman.com/biochem5>.
Selecione o captulo Structural Insights.
< www.rscb.org/pdb>.
Selecione determinadas protenas e procure as informaes dis-
ponveis sobre sua estrutura e sua funo biolgica.
Para saber mais sobre hemoglobinopatias, consulte o site:
<www.hemoglobinopatias.com.br>.
c
A
p
t
U
l
o

4
Lipdeos
Neste captulo estudaremos a estrutura das principais clas-
ses de lipdeos, bem como suas propriedades e funes bio-
lgicas. Alm disso, atravs dos contedos, procuraremos
entender a importncia e a organizao dos lipdeos consti-
tuintes das membranas celulares.
65 Lipdeos
4.1 Lipdeos: Propriedades Gerais
Ao contrrio de outras classes de biomolculas, como por exem-
plo, as protenas, os lipdeos no so caracterizados por apresenta-
rem um grupo funcional comum. Na verdade, o que caracteriza os
lipdeos como uma classe de biomolculas uma propriedade co-
mum que defne o seu comportamento. Esta propriedade comum
a baixa solubilidade dos lipdeos em gua, ou seja, o seu grau de
hidrofobicidade.
Os lipdeos so molculas hidrofbicas ou apolares, mas apre-
sentam solubilidade em solventes orgnicos, como por exemplo,
o clorofrmio e o benzeno. Em nosso cotidiano, freqentemente
deparamo-nos com o comportamento apolar dos lipdeos, quan-
do, por exemplo, misturamos azeite e vinagre para temperar uma
salada.
Ao contrrio das demais classes de biomolculas, o conceito de
polmeros no se aplica para os lipdeos, pois eles no so consti-
tudos por repeties de unidades fundamentais comuns. No en-
tanto, ao observamos vrios representantes desta classe de biomo-
lculas, veremos que a maioria dos lipdeos apresenta um ou mais
cidos graxos em sua estrutura.
As funes biolgicas dos lipdeos so diversas, sendo impor-
tantes como molculas de reserva, como constituintes das mem-
branas celulares, como vitaminas lipossolveis, alm de apresentar
atividade biolgica e exercerem o papel de hormnios.
66 Bioqumica
Os lipdeos podem ocorrer, ainda, combinados, seja covalente-
mente ou atravs de ligaes fracas, com outras biomolculas de
natureza distinta. Desta forma, constituem os glicolipdeos, os
quais contm tanto carboidratos como lipdeos em sua estrutura,
e as lipoprotenas, as quais so consti-
tudas de lipdeos e protenas. Em tais
biomolculas hbridas, as propriedades
qumicas de seus componentes esto
combinadas de modo a preencher fun-
es biolgicas especializadas.
4.2 cidos Graxos
Os cidos graxos esto presentes na
maioria das classes de lipdeos e con-
tribuem para o comportamento apolar
destas biomolculas.
Como pode ser observado na Figura
4.1, os cidos graxos so constitudos
por uma cadeia de hidrocarboneto (fre-
qentemente aliftica), a qual apresenta
um grupo carboxila terminal (-COOH).
Conseqentemente, os cidos graxos
apresentam ao mesmo tempo um car-
ter apolar (devido natureza da cadeia
de hidrocarboneto) e uma cabea po-
lar, ionizada no pH 7,0 (devido ioniza-
o do grupo carboxila, da a denomina-
o cido). Desta forma, cidos graxos
livres so considerados como molculas
anfpticas, ou seja, molculas que apre-
sentam tanto carter polar como apolar.
Os cidos graxos se distinguem entre
si por duas caractersticas. A primeira
est relacionada ao nmero de carbo-
nos na cadeia (comprimento da cadeia),
Grupo Carboxlico
Cadeia Hidrocarbonada
cido graxo (saturado)
[pH 7,0]
O O
C
Figura 4.1
cido graxo (insaturado)
[pH 7,0]
Grupo Carboxlico
Cadeia Hidrocarbonada
O O
C
Figura 4.2
67 Lipdeos
sendo as cadeias de nmero par de carbonos mais importantes do
ponto de vista biolgico, como os cidos graxos constitudos de
16 e 18 carbonos, por exemplo. A segunda caracterstica envolve a
ocorrncia ou no de uma ou mais ligaes duplas entre os carbo-
nos da cadeia aliftica (Figura 4.2).
Os cidos graxos que apresentam somente ligaes simples so
denominados de cidos graxos saturados, enquanto aqueles que
apresentam uma ou mais ligaes duplas so denominados de ci-
dos graxos insaturados. Na Tabela 4.1 so mostrados alguns ci-
dos graxos de ocorrncia natural.
principais cidos Graxos de ocorrncia Natural
No. de
Carbonos
Nome
Comum
Nome
Sistemtico
Estrutura
Saturados
4
cidos
Butrico
cido butanico CH
3
(CH
2
)
2
COOH
6
cido
Caprico
cido hexanico CH
3
(CH
2
)
4
COOH
8
cido
Caprlico
cido octanico CH
3
(CH
2
)
6
COOH
10 cido Cprico cido decanico CH
3
(CH
2
)
8
COOH
12 cido Lurico
cido
dodecanico
CH
3
(CH
2
)
10
COOH
14
cido
Mirstico
cido
tetradecanico
CH
3
(CH
2
)
12
COOH
16
cido
Palmtico
cido
hexadecanico
CH
3
(CH
2
)
14
COOH
18
cido
Esterico
cido
octadecanico
CH
3
(CH
2
)
16
COOH
20
cido
Araqudico
cido
eicosanico
CH
3
(CH
2
)
18
COOH
22 cido Benico
cido
docosanico
CH
3
(CH
2
)
20
COOH
24
cido
Lignocrico
cido
tetracosanico
CH
3
(CH
2
)
22
COOH
68 Bioqumica
Insaturados
16 (16:1*)
cido
Palmitolico
CH
3
(CH
2
)
5
CH=CH(CH
2
)
7
COOH
18 (18:1*) cido Olico CH
3
(CH
2
)
7
CH=CH(CH
2
)
7
COOH
18 (18:2*)
cido
Linolico
CH
3
(CH
2
)
4
(CH=CHCH
2
)
2
(CH
2
)
6
COOH
18 (18:3*)
cido
Linolnico
CH
3
CH
2
(CH=CHCH
2
)
3
(CH
2
)
6
COOH
20 (20:4*)
cido
Araquidnico
CH
3
(CH
2
)
4
(CH=CHCH
2
)
4
(CH
2
)
2
COOH
Em parnteses, o primeiro nmero refere-se ao numero de carbonos
na cadeia e o segundo (*) ao nmero de duplas ligaes.
Tabela 4.1
Em alguns cidos graxos podem ocorrer mais de uma ligao
dupla e, neste caso, eles so denominados de cidos graxos poilin-
saturados (muitas vezes chamados de PUFAs, do ingls, polyun-
saturated fatty acids).
cidos Graxos - AG
Essenciais
cidos graxos poliinsaturados que no podem ser
completamente sintetizados
Classes:
mega-6 (-6)
mega-3 (-3)
CH
3
-CH
2
-.- CH
2
-COOH
Sistema 2 1
Sistema 1 2
Tabela 4.2
O comprimento e o grau de insaturao de um cido graxo tm
conseqncias importantes no seu ponto de fuso, determinando,
assim, se o mesmo apresenta-se no estado slido ou lquido a tem-
peratura ambiente. Dado o seu carter apolar, quando em uma so-
luo aquosa, os cidos graxos tendem a se aproximar e a se organi-
zar de modo ordenado, formando interaes hidrofbicas entre si e
expulsando as molculas de gua (na verdade, poucas molculas
69 Lipdeos
de gua se reorganizam para formar ligaes ou pontes de hidrog-
nio entre si). Quando este pacote de cidos graxos constitudo
por cidos graxos saturados, existe maior rigidez devido ao alinha-
mento extremamente ordenado de suas cadeias alifticas (Figura
4.3). Ao contrrio, pelo fato das duplas ligaes presentes nos ci-
dos graxos insaturados causarem uma dobra na cadeia, este alinha-
mento acaba sendo menos rgido, ou seja, menos ordenado (Figura
4.4). Estes arranjos, somados s diferenas no ponto de fuso, so
muito importantes biologicamente, como veremos mais adiante.
4.3 Principais Classes de Lipdeos
Os cidos graxos raramente so livres na natureza, mas apresen-
tam-se combinados com outras molculas, fazendo parte de muitos
lipdeos que ocorrem naturalmente. As molculas s quais os cidos
graxos esto ligados, em ultima instncia, determinam e diferenciam
as diferentes classes de lipdeos presentes nos organismos vivos.
4.3.1 Triacilgliceris
Os triacilgliceris (TAGs) so formados a partir da esterifca-
o de trs cidos graxos ao lcool glicerol, conforme mostrado
na Figura 4.5, da a sua denominao. Os cidos graxos ligados ao
cidos graxos
saturados
Mistura de cidos graxos
saturados e insaturados
Figura 4.3 Figura 4.4
70 Bioqumica
glicerol podem ser distintos entre si, inclusive em relao ao grau
de insaturao.
Os TAGs so os lipdeos que comumente denominamos de le-
os e gorduras. A sua composio de cidos graxos refete o fato
dos primeiros serem lquidos a temperatura ambiente, enquanto
os outros se apresentam no estado slido, como o caso dos leos
vegetais e das gorduras animais, respectivamente.
Ainda em relao estrutura dos TAGs, note que a esterifcao
dos cidos graxos ao glicerol elimina a polaridade do acido graxo.
Desta forma, os TAGs so lipdeos no-polares neutros, ou seja, li-
pdeos que no apresentam carga no pH fsiolgico, isto , pH 7,0.

leos e Gorduras
As gorduras animais e os leos vegetais apre-
sentam natureza distinta em relao ao seu pon-
to de fuso. A temperatura ambiente, enquanto
as gorduras tm natureza slida, os leos apre-
sentam-se fuidos. A principal diferena entre
gorduras e leos a porcentagem de cidos gra-
xos insaturados. Esta diferena ainda mais im-
portante do que o fato de o comprimento da ca-
deia de cido graxo poder afetar seu ponto de fu-
so (a manteiga uma exceo: ela tem uma alta
proporo de cidos graxos de cadeia curta e, as-
sim, pode derreter na boca).
As membranas de rgos internos de mamfe-
ros homeotrmicos tm uma percentagem mais
alta de cidos saturados que aquela dos tecidos
da pele, o que ajuda a manter a membrana mais
slida a temperatura mais alta do rgo interno.
Um outro exemplo pode ser dado quando bac-
trias so cultivadas em diferentes temperaturas.
Assim, a composio de cidos graxos das mem-
branas destes microorganismos muda, sendo en-
contrados mais cidos graxos insaturados a tem-
peraturas mais baixas e mais cidos graxos satu-
rados a temperaturas mais altas.
Como as doenas cardiovasculares esto corre-
lacionadas a dietas ricas em gorduras saturadas,
uma dieta com mais gorduras insaturadas pode
reduzir o risco de ataques cardacos e derrames.
Mesmo entre os leos vegetais encontramos,
comparativamente, variaes quanto ao teor de
insaturao. O leo de canola uma opo ali-
mentar atraente por ter uma alta proporo de
cidos graxos insaturados em relao aos ci-
dos graxos saturados. Sendo os alimentos mais
ricos em gorduras poliinsaturadas mais saud-
veis, as empresas alimentcias comearam a co-
mercializar substitutos da manteiga, os quais se-
riam mais ricos em cidos graxos insaturados e,
ao mesmo tempo, teriam as caractersticas fsicas
da manteiga, como a solidez a temperatura am-
biente. Eles atingiram essa meta ao hidrogenar
parcialmente as ligaes duplas dos cidos gra-
xos insaturados que compem os leos vegetais.
No entanto, ao hidrogenar os leos poliinsatura-
dos, a remoo de algumas das ligaes duplas
tornou-os, assim, mais saturados. Alm disso, no
processo de hidrogenao, algumas ligaes du-
plas so convertidas para a forma trans. Estudos
recentes mostram que os cidos graxos trans au-
mentam a proporo de colesterol LDL (lipopro-
tena de baixa densidade), em comparao com
HDL (lipoprotena de alta densidade), um co-re-
lator positivo para as doenas cardiovasculares.
Assim, os efeitos dos cidos graxos trans so se-
melhantes aos dos cidos graxos saturados.
71 Lipdeos
Esta propriedade refete o papel biolgico dos TAGs, lipdeos de
reserva por excelncia, os quais se acumulam nas clulas do teci-
do adiposo, ocupando praticamente todo o citoplasma, conforme
mostra a micrografa eletrnica na Figura 4.6. Os TAGs constituem
uma reserva energtica importante, uma vez que sua metaboliza-
o gera um equivalente calrico por quilograma muito superior
em comparao com o carboidratos (Tabela 4.3).
Figura 4.6
combustvel metabolicamente disponvel em um homem normal (70 kg)
Kcal Peso Combustvel (kg) Equivalente calrico
Triagliceris 15 141.000*
Protena (msculo) 6 24.000
Glicognio(msculo) 0.15 600
Glicognio(fgado) 0.675 300
Combustveis em circulao 0.023 100
166.000
* 6 x mais energia armazenada que carboidratos
* Reservas: carboidrato ~1 dia; Lipdeos ~1-2 meses
Glicerol
Triacilglicerol
(no-polar, neutro)
Triacilglicerol misto: com 3 AGs
diferentes, C-2 o centro quiral
HO
CH CH
OH CH
OH
O
O
C
CH CH
CH
O
C
O
O
O
C
1
2
3
Figura 4.5
Tabela 4.3
72 Bioqumica
Alm do papel principal como reserva energtica, os TAGs so
importantes tambm no isolamento trmico e na proteo contra
choques mecnicos.
4.3.2 Ceras
As ceras, uma outra classe de lipdeos, so steres de cidos
graxos de cadeia longa (C-14-36), saturados ou insaturados, com
alcois de cadeia longa (C-16-30). Seu ponto de fuso est na fai-
xa de 60-100C, geralmente mais alto que os registrados para os
triacilgliceris.
O papel biolgico desta classe de lipdeos est relacionado ao
armazenamento de energia nos organismos do plncton, alm de
servir como uma camada protetora e impermeabilizante nas pe-
nas das aves, na l do carneiro e na superfcie de folhas e frutos.
Entre os exemplos mais conhecidos, esto a cera das abelhas, a
cera da carnaba, a cera da jojoba e a cera presente no leo da ca-
chalote (Figura 4.7).
CACHALOTE
Espermacete
90% do peso da cabea
~18.000 kg de leo
(mistura de triacilgliceris e ceras:
mais cidos graxos insaturados)
CONVENTO DO CARMO, Angra dos Reis, RJ (1617-1623)
Pedra, cal (conchas), areia e leo de baleia.
Figura 4.7 - As ceras tm inmeras aplicaes na indstria farmacutica e de cosmticos.
O leo de baleia foi largamente empregado na construo no Brasil colonial.
73 Lipdeos
4.3.3 Fosfoacilgliceris (ou Glicerofosfolipdeos)
Como o nome indica, os fosfoacilgliceris (FAGs) apresentam
um grupo fosfato na sua estrutura, ou seja, so fosfolipdeos. A
esterifcao do acido fosfrico ao carbono 3 (C-3) do lcool gli-
cerol forma o cido fosfatdico (Figura 4.8), o composto a partir
do qual se originam os FAGs. Ou seja, diferentes AGs podem, por
sua vez, ser esterifcados aos carbonos 1 (C-1) e 2 (C-2) do cido
fosfatdico, como o cido palmtico (saturado, 16:0) e o cido oli-
co (insaturado, 18:1). O que distingue os FAGs entre si no s os
AGs presentes na molcula, mas tambm o tipo de molcula que
se liga ao grupo fosfato, a qual designada como substituinte X. A
natureza do substituinte X varia, podendo ser, por exemplo, um
aminolcool, como a serina (aminocido) e a colina (Figura 4.9),
o qual est protonado no pH intracelular. Desta forma, em funo
do grupo fosfato (ionizado) e do aminolcool (protonado) no pH
7,0, os FAGs so lipdeos polares.
Um dos exemplos de FAG mais conhecido a fosfatidilcolina,
tambm chamada de lecitina, a qual pode ser encontrada na soja e
na gema do ovo, por exemplo.
G
L
GG
I
LL
E
R
EE
O
RR
L
OO
C
II
EE
cido Graxo
cido Graxo
G
L
I
C
E
R
O
L
Fosfato lcool
Exemplo de Aminolcool:
serina, etanolamina, colina, inositol
CHOH
CH
OH
O P O
O
O
C H
Glicerol
Representao no pH 7,0
Fosfato
Figura 4.8
Figura 4.9
74 Bioqumica
Esta propriedade faz com que os FAGs possam formar micelas
quando em uma soluo aquosa, contribuindo, assim, para a so-
lubilizao de molculas apolares, uma vez que as mesmas po-
dem fcar alojadas no interior dessas micelas. Esta base do que
descrevemos como emulsifcao. Uma aplicao deste princpio
em nosso cotidiano pode ser exemplifcada na culinria durante a
preparao de maionese (lembre-se que a receita utiliza gema de
ovo, rica em lecitina, e azeite de oliva, ou seja, um triacilglicerol, o
qual emulsifcado no fosfolipdeo).
As caractersticas desta classe de lipdeos refetem o seu papel
biolgico, ou seja, os FAGs so os principais componentes das
membranas celulares.
4.3.4 Esgingolipdeos
Os AGs podem ainda ocorrer
esterifcados a um outro lcool,
diferente do glicerol. Neste caso,
eles formam um ster com um
aminolcool, a esfngosina. Esta
classe de lipdeos denominada
de esfngolipdeos.
Alm de um AG, os esfngoli-
pdeos podem ou no apresentar
um grupo fosfato em sua estru-
tura. Quando presente, o grupo
fosfato apresenta-se ligado a um
aminolcool, como por exemplo,
a colina. Neste caso, este tipo de
esfngolipdeo muitas vezes de-
nominado esfngofosfolipdeo.
Um exemplo deste tipo de lipdeo
a esfngomielina (Figura 4.10).
Outros esfngolipdeos, alm
de um AG, apresentam um carboidrato na sua estrutura, seja um
carboidrato simples (um monossacardeo) ou uma pequena cadeia
de monossacardeos (um oligossacardeo) (estudaremos os carboi-
CH
CH
CH
CH
CH
N
+
O
O
O O
C
C
P
NH
OH
CH
CH
H
O
-
Esfngomielina
Figura 4.10
75 Lipdeos
dratos a seguir). Neste caso, este tipo de esfngolipdeo chaman-
do de esfngoglicolipdeo ou, simplesmente, glicolipdeo.
Os esfngolipdeos so componentes das membranas celulares,
sendo particularmente abundantes nas membranas do sistema
nervoso. Os esfngoglicolipdeos so tambm importantes como
determinantes dos diferentes grupos sanguneos do sistema ABO.
4.3.5 Esterides
Muitos compostos com funes diferentes so classifcados
como esterides. O que eles tm em comum a presena de um
anel esteride, ou seja, um sistema de anis fundidos, constitudo
por trs anis com seis tomos de carbono (anis A, B e C) e um
anel com cinco tomos de carbono (anel D). Um importante repre-
sentante deste grupo, o colesterol, est mostrado na Figura 4.11.

Grupo polar
Cadeia lateral
Colesterol
Ncleo esteride
HO
CH
CH
CH
CH
CH
1
2
3
4
5
6
7
8 10
11
12
9 14
13
17
16
15
18
20
22
23
24
25
26
27
21
19
CH
CH
CH
CH
CH
A B
C
D
Figura 4.11
O nico grupo hidroflico na estrutura do colesterol a hidroxi-
la. Assim sendo, o colesterol altamente hidrofbico. O colesterol
76 Bioqumica
bastante abundante nas membranas celulares animais. A presena
do colesterol nas membranas celulares contribui para uma maior
rigidez das mesmas.
O colesterol no ocorre nas membranas celulares de procario-
tos. Em vegetais, podemos encontrar o ftocolesterol, que difere do
colesterol em relao aos substituintes e cadeia lateral, ligados ao
ncleo esteride.
O colesterol importante ainda como precursor de hormnios
esterides sexuais e do crtex da adrenal (Figura 4.12). O coleste-
rol precursor tambm de cidos biliares e de uma vitamina lipos-
solvel, a vitamina D
3
, importante para o metabolismo sseo.
Hormnios sexuais
Hormnios do crtex
da adrenal
(metabolismo de glicose
e excreo de sais)
Agentes anti-infamatrios
Testosterona
O
HC
HC
OH
Estradiol
HO
HC
OH
Cortisol
O
O
HO
HC
HC OH
C
CHOH
Prednisolona
O
O
OH
HC
HC OH
C
CHOH
Prednisona
O
O
HC
HC OH
C
CHOH
O
Aldosterona
O
O
HO
HC
C
H
C
CHOH
O
Figura 4.12
77 Lipdeos
No entanto, o colesterol mais conhecido por seus efeitos no-
civos sade, quando presente em altas concentraes no sangue.
Ele est associado ao desenvolvimento da aterosclerose, que a
ocorrncia de depsitos de lipdeos nos vasos sanguneos, provo-
cando doenas cardiovasculares.
4.4 Lipdeos e prostaglandinas
Um grupo de compostos derivados de cidos graxos apresenta
atividade biolgica e inclui as chamadas prostaglandinas (PGAs).
As PGAs foram inicialmente detectadas no fuido seminal, pro-
duzido pela prstata, da a sua denominao. Mas, na verdade,
as PGAs so amplamente distribudas em diversos tecidos, onde
apresentam uma ampla variedade de efeitos fsiolgicos.
As PGAs so derivadas do cido araquidnico, um cido gra-
xo poliinsaturado, com 20 tomos de carbono e quatro ligaes
duplas (C-20:4). A produo de PGAs a partir do seu precursor
envolve varias etapas, as quais so catalisadas por enzimas espe-
cifcas. Cada PGA apresenta uma estrutura cclica, sendo que o
nmero e a posio das ligaes duplas e dos grupos que contm
oxignio so diferentes entre elas.
Algumas funes das PGAs envolvem a participao no contro-
le da presso sangunea, na estimulao da contrao do msculo
liso e na induo da resposta infamatria.
A aspirina inibe a sntese das PGAs, especialmente em plaque-
tas sanguneas, o que explica seus efeitos antiinfamatrios e anti-
trmicos. Alguns esterides, como a cortisona, tambm tm efeito
antiinfamatrio por inibir a sntese de PGAs.
4.5 Membranas biolgicas
As clulas esto envolvidas por uma membrana celular (ou
membrana plasmtica). As clulas eucariticas tambm apresen-
tam as suas organelas envolvidas por membranas, como o ncleo e
a mitocndria, por exemplo. As membranas no apenas delimitam
78 Bioqumica
as clulas e as separam do ambiente externo, mas tambm tm pa-
pel importante no transporte de ons e molculas especfcas para
dentro e para fora delas.
A base molecular da estrutura da membrana celular a bica-
mada lipdica (Figura 4.13). Os principais lipdeos que formam a
bicamada so os fosfoacilgliceris, cujo carter anfptico explica o
seu arranjo na estrutura da mesma. Outras classes de lipdeos tam-
bm so encontradas na membrana, como j discutimos anterior-
mente, que so os esfngofosfolipdeos e os esfngoglicolipdeos.
Nas membranas dos organismos eucariotos, os esterides tam-
bm so encontrados, sendo o colesterol nos animais e o ftocoles-
terol nos vegetais.
O arranjo das molculas anfpticas na membrana respeita esta
propriedade, uma vez que as cabeas polares entram em contato
com a gua (do meio externo e do meio intracelular), enquanto as
caudas apolares fcam na parte interna da membrana. Esta organiza-
o depende de interaes no-covalentes entre estes lipdeos, como
as interaes hidrofbicas da parte apolar das molculas. Assim, a
superfcie da bicamada polar e contm grupos carregados. Por ou-
tro lado, o interior de hidrocarboneto apolar da bicamada consiste
em cadeias saturadas e insaturadas de AGs, alm do anel esteride
(sistema de anis fundidos) do colesterol (quando for o caso).
A camada externa e a camada interna da bicamada lipdica con-
tm misturas de lipdeos, mas sua composio diferente, o que
pode ser utilizado para distingui-las. As molculas maiores como
os gangliosdeos tendem a ocorrer na camada externa, enquanto
as menores, como os fosfoacigliceris, so mais abundantes na ca-
mada interna (Tabela 4.5).
Alguns Fosfoacilgliceris
Nome lcool
Carga lquida
pH 7,0
Fosfatidiletanolamina Fosfatidiletanolamina -CH
2
-CH
3
-NH3 0
Fosfatidilcolina ou Lecitina Colina -CH
2
-CH
2
-N(CH
3
)
3
0
Fosfatidilserina Serina -CH
2
-CH-NH
3
- 1
Tabela 4.5
Figura 4.13
Tente identifcar aqui
quais seriam esses grupos
carregados, com base no que
estudamos sobre os lipdeos.
79 Lipdeos
Os hidrocarbonetos localizados na parte interior da bicamada
so importantes para determinar se esta parte da bicamada pode
ser organizada e rgida ou, ao contrrio, mais desorganizada e fui-
da. A fuidez uma propriedade importante da membrana celular
e depende de sua composio, ou seja, depende da composio de
cidos graxos.
cidos graxos saturados apresentam uma organizao linear
das suas cadeias de hidrocarboneto, o que leva a uma maior com-
pactao das molculas na bicamada e, conseqentemente, a uma
maior rigidez. J os cidos graxos insaturados, devido presena
de duplas ligaes, apresentam uma dobra na sua cadeia de hidro-
carboneto (ausente nos cidos graxos saturados). As dobras que-
bram o ordenamento linear frme, ocasionando uma desordem
estrutural, ou seja, o arranjo das molculas, uma ao lado da outra,
fca mais aberto ou menos compacto do que seria possvel se so-
mente cadeias retas ou lineares saturadas estivessem presentes. As-
sim, essa estrutura mais desorganizada, causada pela presena de
cidos graxos insaturados com ligaes duplas (posio cis, por-
tanto dobras), permite uma maior fuidez na bicamada. Esta fui-
dez importante para, por exemplo, o trnsito de compostos via
membrana plasmtica. Os lipdeos na bicamada esto sempre em
movimento, apresentando maior mobilidade nas bicamadas com
maior fuidez do que naquelas mais rgidas.
O colesterol pode contribuir para o aumento da ordem ou do
grau de compactao e, conseqentemente, da rigidez. As mem-
branas vegetais apresentam mais cidos graxos poliinsaturados,
por exemplo.
Nas membranas celulares encontramos ainda protenas. Ambos
os componentes, lipdico e protico, contribuem para as proprie-
dades das membranas.
As protenas esto distribudas (ou embebidas) ao longo da bi-
camada lipdica. O contedo protico nas membranas celulares
pode corresponder de 20 a 80% de seu peso. As protenas podem
estar associadas bicamada lipdica de duas formas diferentes:
como protenas perifricas (na superfcie da membrana celular)
ou como protenas integrais (inseridas dentro da bicamada) (Fi-
gura 4.14).
80 Bioqumica
G
l
i
c
o
l
i
p
d
e
o
P
r
o
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n
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x
o
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C
a
b
e
a

p
o
l
a
r
{
{
Figura 4.14
81 Lipdeos
As protenas perifricas normalmente esto ligadas com as ca-
beas carregadas (grupos carregados) da bicamada lipdica por
interaes polares e eletrostticas ou, ainda, ambas. Podem ser re-
movidas por tratamentos relativamente suaves, como pelo aumen-
to da fora inica do meio.
As protenas integrais, como esto embebidas na bicamada lip-
dica, tm sua remoo mais difcil, exigindo condies drsticas,
como tratamento com detergentes ou exposio a vibraes ultra-
snicas (sonicao). Neste caso, o estudo destas protenas acaba
sendo mais difcil, pois estes tratamentos freqentemente desna-
turam as protenas que, mesmo assim, permanecem ainda ligadas
aos lipdeos.
O modo de insero das protenas integrais na bicamada lip-
dica varia. Esta insero pode ocorrer por interao hidrofbica
entre uma regio em -hlice da molcula protica e as caudas de
hidrocarbonetos dos cidos graxos, presentes na parte interna da
bicamada. Desta forma, a protena fca mergulhada na bicama-
da. Uma segunda forma de insero das protenas integrais se d
atravs do seu ancoramento aos lipdeos da bicamada, atravs de
ligaes covalentes entre resduos de cistenas ou grupos amino
livres na protena e uma das vrias ncoras lipdicas.
Alem da funo estrutural como fronteira e envoltrio de todas
as clulas e das organelas de eucariotos, as membranas so bar-
reiras semipermeveis ao fuxo de substncias para dentro e para
fora das clulas e das organelas. Assim, as protenas presentes na
membrana podem atuar como protenas transportadoras.
Alem disso, as protenas de membrana podem atuar como pro-
tenas receptoras (receptores), transferindo sinais extracelulares,
como aqueles transportados por hormnios ou neurotransmissores,
para as clulas. Algumas enzimas so frmemente ligadas mem-
brana, como aquelas envolvidas nas reaes de oxidao aerbica,
encontradas junto membrana mitocondrial. Neste ultimo caso,
estas enzimas ou protenas esto associadas funo de catlise.
A distribuio das protenas nas camadas interna e externa va-
ria bastante, ou seja, assimtrica, assim como a distribuio dos
lipdeos nestas camadas.
82 Bioqumica
O modelo do mosaico fuido o modelo mais aceito para des-
crever a organizao das membranas celulares. O termo mosaico
refere-se a dois componentes que existem lado a lado de forma in-
dependente, sem formar uma outra substncia de natureza inter-
mediria ou diversa. O termo fuido se refere fuidez que permite
o movimento lateral dos lipdeos dentro de uma mesma camada.
As protenas futuam na bicamada lipdica, movendo-se ao longo
do plano da membrana.
A organizao das membranas celulares pode ser evidenciada
atravs de micrografas eletrnicas. Ainda na tcnica de congela-
mento e fratura, possvel visualizar a bicamada lipdica separada
paralelamente superfcie da membrana. Esta separao ao longo
da interface das duas camadas lipdicas expe o interior da mem-
brana, permitindo visualizar a insero das protenas integrais, as
quais podem ser vistas como montanhas em uma camada, en-
quanto observamos vales na outra camada.
Resumo
Os lipdeos so biomolculas que so extradas das clulas, utili-
zando-se solventes apolares, como hexano e metanol.
Os constituintes mais abundantes dos lipdeos so os cidos
graxos. A maior parte dos cidos graxos contm entre 12 e 24 car-
bonos, podendo ser saturados ou insaturados.
Os cidos graxos que ocorrem como steres ligados ao glicerol
so apolares e so aqueles utilizados primariamente como reserva
e, conseqentemente, como combustvel metablico.
Os lipdeos polares, incluindo os fosfoacilgliceris e os esfngo-
fosfolipideos, podem combinar-se com protenas na constituio
das membranas biolgicas.
Todas as clulas so delimitadas por uma membrana. A mem-
brana celular constituda de uma bicamada de lipdeos polares, na
qual esto embebidas protenas, as quais esto associadas com as
atividades dinmicas, como os processos de transporte. O modelo
do mosaico fuido descreve este arranjo da membrana celular.
83 Lipdeos
Os esterides tm uma estrutura caracterstica. O mais conhe-
cido o colesterol, o qual est presente nas membranas das clu-
las eucariticas animais, alm de ser um importante precursor de
hormnios esterides, sais biliares e outras biomolculas.
Bibliografa
WOOD, E. J.; SMITH, C. A.; PICKERING, W. R. Life chemistry
and molecular biology. London: Portland Press, 1997.
c
A
p
t
U
l
o

5
Carboidratos
Neste captulo estudaremos a estrutura bsica das prin-
cipais classes de carboidratos, suas propriedades e funes
biolgicas.
87 Carboidratos
5.1 Caractersticas Estruturais dos Carboidratos
Ambos, tanto o termo carboidrato, como a sua sinonmia, hi-
dratos de carbono, j nos dizem alguma coisa sobre a estrutura
deste grupo de biomolculas. Voc facilmente associar esta deno-
minao com a frmula geral dos carboidratos: C
n
(H
2
O)
n
.

O car-
boidrato mais comumente representado com esta frmula geral
a glicose C
6
H
12
O
6
.
Ao se observar a estrutura de uma molcula de carboidrato fca
mais fcil entender esta frmula geral representativa, dado que
praticamente todos os carbonos presentes na molcula esto liga-
dos a uma hidroxila e a um hidrognio. Por isso os carboidratos
tendem a ser hidroflicos, a no ser quando polimerizados.
No entanto, a frmula geral nos fornece uma informao limi-
tada sobre a estrutura destas molculas, mesmo porque nem todos
os carboidratos importantes biologicamente se encaixam perfei-
tamente nesta representao geral. Muitos carboidratos presentes
nos organismos vivos apresentam, por exemplo,
nitrognio na molcula.
A Figura 5.1 mostra a estrutura de dois car-
boidratos simples. Note que um dos carbonos (o
carbono 1) apresenta um grupo aldedo em uma
das molculas representadas, enquanto a outra
apresenta um grupo cetona em um dos carbonos
(carbono 2). Assim, os carboidratos so mais
bem defnidos como polihidroxialdedos ou
polihidroxicetonas.
Gliceraldedo,
uma aldotriose
Dihidroxicetona,
uma cetotriose
H
C
O
C OH H
H C OH
H
H
C OH H
H C OH
H
C O
Figura 5.1
88 Bioqumica
5.2 Viso Geral das Funes Biolgicas
dos Carboidratos
Atualmente, o termo carboidrato quase sempre associado
idia de que exageros so freqentemente cometidos na nossa
alimentao cotidiana. Do ponto de vista de uma dieta balancea-
da, a ingesto exagerada de carboidratos no pode ser vista como
saudvel. No entanto, devemos lembrar que os carboidratos cons-
tituem uma fonte de alimento abundante e relativamente barata
para grande parte da populao mundial, na forma, por exemplo,
de amido, presente em gros, razes e tubrculos. Alm disso, de-
vemos lembrar que o principal carboidrato do nosso corpo, a gli-
cose, constitui a base do metabolismo energtico, a qual pron-
tamente usada por todas as clulas e distribuda a todo o corpo
atravs da circulao sangnea.
Alm do seu papel como fonte de energia para o metabolismo
celular, os carboidratos podem ocorrer na forma de polmeros com
funo estrutural. Um exemplo de carboidrato que tem este tipo
de funo a celulose, constituinte da parede da clula vegetal.
Mais da metade de todo o carbono orgnico no nosso planeta
est armazenado na forma de carboidrato, mais especifcamente
em apenas duas molculas de carboidrato: o amido e a celulose,
ambos polmeros de um acar simples que j mencionamos, a
glicose.
Os carboidratos so ainda encontrados na composio de nu-
cleotdeos, os quais so constituintes dos cidos nuclicos. Alem
disso, os nucleotdeos participam da estrutura de formas ativas de
vitaminas hidrossolveis.
A Figura 5.2 mostra exemplos de carboidratos importantes bio-
logicamente e onde podem ser mais freqentemente encontrados.
Os carboidratos podem ainda ocorrer freqentemente ligados a
protenas ou a lipdeos. Neste caso, eles participam do reconheci-
mento e da interao entre clulas.
89 Carboidratos
5.3 Classifcao dos Carboidratos
5.3.1 Monossacardeos
Os acares simples so chamados de monossacardeos ou
oses. Eles se diferenciam entre si pelo nmero de carbonos na ca-
deia e pela presena ou de um grupo aldedo ou de um grupo ce-
tona. Assim, conforme mencionamos acima, os monossacardeos
podem ser polihidroxialdedos ou polihidroxicetonas. Uma for-
ma mais simples de os designarmos como aldoses ou cetoses,
respectivamente.
Os monossacardeos mais simples encontrados na natureza
apresentam trs tomos de carbono e so, conseqentemente, de-
Lactose
Sacarose
Maltose
Dissacardeos
Cadeias de 6 a 12
monossacardeos
Ribose
Desoxiribose
Ribulose 1,5 bifosfato
(aceptor de CO na fotossntese)
Constituintes das molculas
transportadoras de eltrons (ex. FAD)
e de energia qumica (ex. ATP)
Glicose
Frutose
Glicoprotenas
Glicolipdeos
Amido (20% amilose/80% amilopectina): reserva em plantas
Glicognio: reserva em mamferos, fungos, ostras e moluscos
Celulose: componente estrutural de plantas
Quitina: constituinte do exoesqueleto de artrpodes
e parede celular de fungos
POLISSACARDEOS
Pentoses (C) Hexoses (C)
MONOSSACARDEOS
OLIGOSSACARDEOS
Figura 5.2
90 Bioqumica
nominados de trioses. A aldotriose (aldose com trs tomos de
carbono) o gliceraldedo e a cetotriose (cetose com trs tomos
de carbono) correspondente a dihidroxicetona (Figura 5.1). A
Figura 5.3 mostra as aldoses com seis carbonos, denominadas
aldohexoses.
A cetose correspondente mais importante est mostrada na Fi-
gura 5.4. O carbono mais altamente oxidado, aquele envolvido no
grupo aldedo, e por conveno designado como carbono 1 (C-1).
Nas cetoses, o grupo cetona torna-se o carbono 2 (C-2). Os mo-
nossacardeos mais comuns so as aldoses.
Ao observar a estrutura do gliceraldedo, aldose mais simples,
note que ele apresenta um carbono quiral, o qual fonte de isome-
ria tica, como no caso dos aminocidos. Assim, o gliceraldedo
pode existir em duas formas isomricas, sendo o ismero na forma
D, o D-gliceraldedo, o mais importante do ponto de vista biolgi-
co. A isomeria uma caracterstica comum dos monossacardeos.
A designao da confgurao como L ou D depende do arranjo
do carbono quiral com o nmero mais alto, a partir do carbono 1.
No caso da glicose e da frutose, esse o carbono 5 (C-5). Muitas

Cetose
Seis carbonos
D-Cetose
O
CHOH
C
C H HO
H C OH
C OH H
CHOH
D-Frutose
Figura 5.4
D-Aldoses
Seis carbonos

D-Glicose
H
C
O
C OH H
HO C H
C OH H
H C OH
CHOH
D-Manose
H
C
O
C H HO
HO C H
C OH H
H C OH
CHOH
H
C
O
C OH H
HO C H
C H HO
H C OH
CHOH
D-Galactose
Figura 5.3
91 Carboidratos
vezes uma aldose se diferencia da outra somente na confgurao
em um carbono quiral. Neste caso, elas so chamadas de epme-
ros. Um exemplo a galactose, uma hexose epmero da glicose no
carbono 2 (Figura 5.5).

CHO
C OH H
HO C H
C H HO
H C OH
CHOH
D-Glicose D-Galactose D-Manose
(epmero no C-2) (epmero no C-4)
CHO
C OH H
HO C H
C OH H
H C OH
CHOH
CHO
C H HO
HO C H
C OH H
H C OH
CHOH
3
4
5
6
2
1
3
4
5
6
2
1
3
4
5
6
2
1
Figura 5.5
Os monossacardeos, em particular aqueles com cinco ou seis
tomos de carbono, existem normalmente como molculas ccli-
cas, em vez de apresentar a forma de cadeia aberta. A formao
desta estrutura cclica resultado de uma reao intramolecular
entre os grupos funcionais de carbonos distintos. Em uma aldo-
hexose, esta reao ocorre entre o grupo aldedo do carbono 1 e a
hidroxila do carbono 5 (formando um hemiacetal cclico) (Figura
5.6). Uma conseqncia desta reao que o carbono carbonlico
(carbono 1, C-1) torna-se um novo centro quiral, ou seja, torna-se
um carbono anomrico.

Carbono anomrico
A maior parte dos monossacardeos existe na forma cclica, ou seja, como
anis de cinco ou seis elementos. A reao intramolecular que leva cicli-
zao da molcula envolve o grupo carbonila e d origem a um outro cen-
tro quiral, alm daqueles j presentes na molcula. Os dois ismeros cclicos
possveis, denominados de anmeros, so designados ou , de acordo com
as duas confguraes possveis no tomo de carbono que era o carbono car-
bonlico na forma de cadeia aberta (como o carbono 1 de uma aldohexose).
92 Bioqumica

D-Glicose
-D-Glicopiranose -D-Glicopiranose
3
4
5
6
1
H
C
O
C OH H
HO C H
C OH H
H C OH
CHOH
3 2
2
1
4
5
OH
OH
OH
O
HO
H
H
H
H H
C
C C
C
C
6
CHOH
3 2
1
4
5
OH
O
OH
O
HO
H
H
H
H H
C
C C
C
C
6
CHOH
3 2
1
4
5
OH
O
OH
H
HO
H
H
H
H OH
C
C C
C
C
6
CHOH
Figura 5.6
Assim, a forma cclica da aldohexose pode existir em duas for-
mas distintas, em relao ao arranjo espacial dos substituintes li-
vres do carbono 1 (C-1).
Como uma forma de melhor compreender este arranjo, pode-
mos imaginar estes grupos se projetando em relao ao plano do
anel. Por conveno, quando a hidroxila estiver escrita acima do
plano do anel, como se projetada para fora do plano de representa-
93 Carboidratos
o da molcula, esta a forma . Na posio oposta, designamos
a forma da aldohexose como sendo (Figura 5.6).
5.3.2 Oligossacardeos
Os monossacardeos podem ligar-se entre si para formar mo-
lculas contendo algumas unidades de monossacardeos unidas
covalentemente, os oligossacardeos (oligo = alguns).
Este tipo de ligao covalente entre monossacardeos ocorre
quando o grupo hidroxila (ROH) ligado ao carbono anomrico de
um deles reage com outra hidroxila (R-OH) do outro monossaca-
rdeo. Esta ligao denominada de ligao glicosdica (Figura
5.7). Este tipo de ligao glicosdica chamada de O-glicosdicas,
uma vez que um acar est ligado a um tomo de oxignio da
outra molcula de acar.

-D-Glicose
-D-Glicopiranosil-(1 4)-D-glicopiranose
Maltose
-D-Glicose
hidrlise condensao
lcool
hemiacetal
HO
OH
OH
OH
H H
H
H
H
O
CHOH
HO
OH
H
OH
H OH
H
H
H
O
CHOH
HO
OH
OH
H H
H
H
H
O
CHOH
OH
H
OH
H OH
H
H
H
O
O
CHOH
+
hemiacetal
acetal
HO HO
5
4
3
2
1
6
5
4
3
2
1
6
Figura 5.7
94 Bioqumica
As ligaes glicosdicas podem assumir varias formas, uma vez
que o carbono anomrico de um monossacardeo pode estar na
confgurao ou . Alm disso, a ligao pode envolver um gru-
po OH ligado a qualquer um dos carbonos do segundo monos-
sacardeo, como por exemplo, o carbono 4 (C-4) ou o carbono 6
(C-6). Vrias combinaes diferentes so encontradas na natureza.
Por isso, os grupos OH so enumerados de modo que possam ser
distinguidos (este sistema de enumerao segue aquele dos car-
bonos aos quais os grupos OH esto ligados) e a notao do tipo
de confgurao do carbono anomrico tambm deve ser mencio-
nada aos se especifcar a ligao glicosdica entre os monossacar-
deos. Assim, podemos ter, por exemplo, uma ligao glicosdica
entre duas molculas de monossacardeos na forma (14) ou
na forma (16).
Os dissacardeos, formados a partir da unio de duas molcu-
las de monossacardeos, so os oligossacardeos mais simples que
ocorrem na natureza. Na Figura 5.8 esto mostrados alguns exem-
plos, observe suas unidades componentes e as ligaes glicosdicas
entre eles.
HO
OH
OH
OH
O
CHOH
HO-CH
H
OH
O
O
TREALOSE
(Glicose + Glicose)
Dissacardeos
1 1
HO
OH
OH
OH
OH
O O
CHOH CHOH
OH
O
1
2 3
4
5
6
1
2 3
4
5
6
LACTOSE
(Galactose + Glicose)
Presente na hemolinfa de
insetos e crustceos
Presente no leite
Figura 5.8
95 Carboidratos
Oligossacardeos formados de mais de duas unidades de mo-
nossacardeos tambm ocorrem na natureza. Alguns exemplos so
os oligossacardeos formados em mdia por seis a oito resduos
de monossacardeos, que ocorrem ligados a protenas (glicopro-
tenas) e a lipdeos (glicolipdeos) e so importantes na defnio
de tipos celulares e no reconhecimento e comunicao entre as
clulas.
Quando oligossacardeos (e principalmente polissacardeos,
como veremos a seguir) so formados como resultado da forma-
o de uma ligao glicosdica, sua natureza qumica depende dos
monossacardeos constituintes e tambm da ligao glicosdica
formada (ou seja, quais tomos de carbono esto envolvidos na
ligao).

Intolerncia lactose
A lactose geralmente conhecida como o acar do leite, por ocorrer
nele. Os seres humanos podem ser intolerantes ao leite ou seus deriva-
dos por vrias razes. Em alguns adultos, a defcincia da enzima lacta-
se (que degrada a lactose em galactose e glicose) causa um aumento
no nvel deste dissacardeo quando da ingesto de leite ou seu deriva-
dos. Sem a enzima, a lactose no degradada nos seus monossacardeos
componentes, de modo a permitir sua absoro nas vilosidades intesti-
nais. A lactose acumulada pode ser degradada pela lactase de bactrias
intestinais, produzindo gs hidrognio, dixido de carbono e cidos or-
gnicos. Esses produtos da ao da lactase bacteriana causam problemas
digestivos como inchao e diarria, assim como a presena da lactose
no-degradada. Essa doena afeta um dcimo da populao branca dos
EUA, mas mais comum em asiticos, africano-americanos, latino-ame-
ricanos e hispnicos. Os indivduos com intolerncia lactose devem evi-
tar sua ingesto. Alguns aditivos base de lactase esto disponveis co-
mercialmente nos EUA, podendo, por exemplo, ser adicionados ao leite.
Em alguns casos, mesmo que a lactose possa ser degradada, outros pro-
blemas podem ocorrer. Um deles envolve o metabolismo da galactose.
Se a enzima que catalisa uma reao subseqente da via de metaboliza-
o no estiver presente, a galactose pode ser acumulada. Se houver um
aumento no nvel de galactose, a condio conhecida como galactose-
mia pode acontecer. Esse problema especialmente srio em crianas e
pode causar retardamento mental.
96 Bioqumica
5.3.3 Polissacardeos
Quando vrios monossacardeos so ligados entre si, o pol-
mero resultante denominado polissacardeo. Os polissacardeos
podem ser formados a partir de unidades repetitivas de um nico
tipo de monossacardeo (ou monmero) e, neste caso, este tipo de
polissacardeo denominado de homoplissacardeo. Se o pol-
mero formado a partir de mais de um tipo de monossacardeo,
ele denominado de heteropolissacardeo.
Quando h mais de um tipo de monmero, freqentemente so-
mente dois tipos de monossacardeos ocorrem em uma seqncia
repetitiva. Assim, a caracterizao completa de um dado polissa-
cardeo inclui a especifcao dos monmeros constituintes e, se
necessrio, a seqncia dos mesmos, alm do tipo da ligao gli-
cosdica presente. Veremos que o tipo da ligao glicosdica uma
caracterstica fundamental para a funo biolgica dos polissaca-
rdeos, os quais podem ter um papel estrutural ou como reserva
energtica.
Ainda quanto sua estrutura, os polissacardeos podem ser li-
neares ou ramifcados (Figura 5.9).
Homopolissacardeos Heteropolissacardeos
Linear Ramifcado Linear Ramifcado
Figura 5.9
97 Carboidratos
5.3.4 Amido
O amido um homopolissacardeo formado de -D-glicose,
presente em clulas vegetais, armazenado geralmente como
grnulos.
O amido possui uma poro linear, onde os resduos de glicose
esto unidos atravs de ligaes (1 4). Esta poro do pol-
mero, denominada amilose, bastante hidroflica e pode formar
hlices com seis resduos de glicose por volta. Esta a base de um
teste simples utilizado para a deteco de amido em alimentos,
por exemplo, o qual est baseado na reao com lugol. O iodo (I
2
)
do reagente forma um complexo amido-iodo, alojando-se entre
essas espirais, produzindo a cor azul-escuro intensa caracterstica
do complexo.
Os tipos de amido podem ser distinguidos um do outro com
base em uma outra poro do polmero, a amilopectina. A amilo-
pectina a poro ramifcada do polmero, com ramifcaes for-
madas por ligaes (1 6) ao longo da cadeia no-ramifcada
de ligaes (1 4) (Figura 5.10). O grau de ramifcao o que
distingue os tipos de amido.
5.3.5 Glicognio
Assim como o amido nos vegetais, existe um polissacardeo de
armazenamento ou reserva nos animais. O glicognio um pol-
mero de cadeia ramifcada, formado de unidades de -D-glicose,
sendo, sob este aspecto, semelhante poro ramifcada do amido,

Digesto do amido
Sendo o amido uma forma de armazenamento de glicose, a glicose deve
ser liberada quando houver necessidade. Esta liberao depende de en-
zimas que hidrolisam o amido (quebram as ligaes glicosdicas entre as
unidades de glicose). Estas enzimas so as -amilases e as -amilases que
hidrolisam as ligaes (1 4). A digesto da amilopectina, por sua vez,
requer mais uma enzima, a enzima desramifcadora, que hidrolisa as liga-
es (1 6) das ramifcaes. Esta ao combinada de enzimas leva
digesto completa do amido.
98 Bioqumica
a amilopectina. Assim sendo, o glicognio consiste em uma cadeia
de glicoses unidas por ligao (1 4), com pontos de ramif-
cao em (1 6). A diferena que o glicognio muito mais
ramifcado, com pontos de ramifcao ocorrendo aproximada-
mente a cada dez resduos (no amido estes pontos ocorrem apro-
ximadamente a cada 25 resduos). Um nmero maior de ramifca-
es importante para a funo biolgica do glicognio, uma vez
que torna a molcula mais solvel em gua (aumenta o seu carter
hidroflico) e fornece potencialmente mais alvos para a ao da

AMILOSE
Poro linear do Amido: (1 4)
Extremidade
no-redutora
Extremidade
redutora
OH
OH
H H
H
H
H
O
O
CHOH
H
O
5
4
3
2
1
6
OH
OH
H
H
H
O
CHOH
4 1
H H
O
OH
OH
H
H
H
O
CHOH
4 1
H H
O
H
O
OH
OH
H
H
H
O
CHOH
4 1
(1 6)
Ponto de
ramifcao
Cadeia principal
H
O
OH
OH
H
H
H
O
CHOH
4 1
H
H
O
H
O
OH
OH
H
H
H
O
O
CH
4
6
6
1
Cadeia ramifcada
AMILOPECTINA
Figura 5.10
99 Carboidratos
enzima que degrada o glicognio (a glicognio-fosforilase), em
caso de necessidade de uma mobilizao rpida de glicose.
Nas clulas animais, o glicognio encontrado em grnulos nas
clulas musculares e hepticas, semelhantes aos grnulos do ami-
do nas clulas vegetais. Alguns atletas, especialmente aqueles que
correm grandes distncias, procuram aumentar sua reserva de gli-
cognio antes de uma corrida ingerindo grandes quantidades de
carboidratos.
5.3.6 Celulose
A celulose o principal componente estrutural dos vegetais.
um homopolissacardeo linear formado de glicoses unidas atra-
vs de ligaes glicosdicas (1 4). As cadeias lineares assim
formadas so ligadas entre si atravs de pontes ou ligaes de hi-
drognio, o que contribui ainda mais para a fora mecnica dessas
fbras vegetais.
As ligaes nesta confgurao so comuns tambm em outros
polmeros com papel estrutural. No caso da celulose, as enzimas
chamadas de celulases hidrolisam as ligaes entre as glicoses.
Os animais so incapazes de utilizar a glicose contida na celulose
por no possurem estas enzimas. Assim, a celulose para os ani-
mais no tem valor energtico, mas somente como fbra alimentar,
contribuindo, por exemplo, para estimular o movimento peristl-
tico no intestino.
As celulases so alvo de estudo em bactria e fungos, devido ao
seu potencial de aplicao biotecnolgica. Microorganismos (bac-
trias e fungos) que habitam o trato digestivo de insetos, como os
cupins, e de ruminantes, como o boi, sintetizam celulases e podem,
conseqentemente, hidrolisar a celulose. Isto explica os danos cau-
sados madeira pelos cupins e a alimentao quase que exclusiva
de pasto, no caso do gado.
Apesar das paredes celulares serem constitudas basicamente
por celulose, um outro importante componente polissacardeo
tambm encontrado, a pectina. A pectina um polmero for-
mado basicamente de cido D-galacturnico, um derivado cido
da galactose, no qual o grupo hidroxila no carbono 6 (C-6) foi
100 Bioqumica
oxidado ao grupo carboxila. A pectina tem importncia comer-
cial na indstria de alimentos, como agente gelifcante em gelias
e iogurtes.
5.3.7 Quitina
A quitina um outro exemplo de polissacardeo com funo
estrutural, com considervel fora mecnica. A quitina forma o
exoesqueleto de invertebrados, como insetos e crustceos, estando
ainda presente na parede celular de fungos.
A quitina um homoplissacardeo linear formado da unio de
molculas de N-acetil-D-glicosamina (Figura 5.11), atravs de liga-
es glicosdicas (1 4). A quitina apresenta ainda uma quan-
tidade considervel de pontes de hidrognio, unindo os seus fla-
mentos lineares, o que contribui para a sua resistncia.
QUITINA

H
O
H H
O
NH
C
CH
O
OH
H
H
H
O
CHOH
4
6
5
3 2
1
H
NH
C
CH
H
OH
H
O
H
O
CHOH
6
3
4
2
5
1
H
O
H
H H
O
NH
C
CH
O
OH
H
H
H
O
CHOH
NH
C
CH
H
OH
H
O
H
O
CHOH
Figura 5.11
101 Carboidratos
5.4 Derivados de Carboidratos
Alguns compostos derivados de carboidratos podem ser simples
ou complexos. Os derivados mais simples so formados a partir de
um monossacardeo, como por exemplo, alguns alcois, como o
glicerol e o sorbitol.
Um outro exemplo o cido ascrbico, ou seja, a vitamina C,
uma importante vitamina hidrossolvel.

Vitamina C
Quando na forma cclica, a oxidao de um aldose leva produo de uma
lactona (um ster cclico, ligando o grupo carboxila e um dos grupos alco-
licos do acar). Uma lactona importante a vitamina C, ou cido ascr-
bico. A maioria dos animais pode sintetizar a vitamina C, com exceo de
cobaias e primatas, incluindo os seres humanos. Para estes, o cido ascr-
bico uma vitamina e deve ser adquirida da dieta. Sua carncia pode levar
a uma doena conhecida como escorbuto. Ela est relacionada a defeitos
na estrutura do colgeno, o que traz fragilidade nos capilares e leses na
pele. O cido ascrbico essencial para a atividade da enzima que hidroxi-
la a prolina (enzima prolina hidroxilase). Esta doena era comumente rela-
tada no sculo XVIII pela marinha inglesa como decorrncia da ausncia de
alimentos frescos durante as longas viagens martimas, antes da introdu-
o de frutas ctricas na dieta doa marinheiros. Uma boa fonte de vitamina
C a acerola. A vitamina C lbil, ela pode ser facilmente oxidada pelo ar,
o que seguido pela hidrlise ou quebra da ligao ster e pela perda da
atividade como vitamina.
Derivados mais complexos envolvem a formao de cadeias
contendo aminoacares e derivados cidos ou sulfatados de mo-
nossacardeos. Estes derivados complexos so denominados de
glicosaminoglicanas (anteriormente denominadas de mucoplis-
sacarides) e constituem um tipo de polissacardeo baseado em um
dissacardeo repetitivo, sendo um deles um aminoacar e o outro
carregado (em funo do grupo cido ou sulfatado) no pH 7,0. Os
resduos sulfatados das glicosaminoglicanas, sendo hidroflicos e
carregados, atraem gua e ons de carga oposta. As glicosamino-
glicanas, cuja estrutura pode ser vista na Figura 5.12, esto envol-
vidas em uma ampla variedade de funes, estando presentes em
102 Bioqumica
diversos tecidos celulares. As glicosaminoglicanas so importantes
componentes do tecido conectivo, do fuido sinovial (fuido lubri-
fcante das juntas), da cartilagem e do tecido sseo. A heparina,
um polissacardeo complexo sulfatado, um outro exemplo de gli-
cosaminoglicana. A heparina atua como anticoagulante natural e,
desta forma, tem funo de proteo, uma vez que atua prevenin-
do a formao de cogulos de sangue.
H
H
OH
OH
H
H
H
O
COO
-
NH
HO
H
H
H
H
O
O
H
C
CH
O
(14)
(13)
CHOH
O
~25
~50,000
GlcA
GlcA
GlcNAc
GalNAc4SO
GlcNAc6SO Gal
Dissacardeos
repetitivos
Nmero de
dissacardeos
por cadeia
Hialuronato
Glicosaminoglicanas
Condroitina
4-sulfato
Queratana
sulfato
20-60
H
H
OH
OH
H
H
H
O
COO
-
-
OSO
NH
H
H
H
H
O
O
H
C
CH
O
(1-4)
(1-3)
CHOH
O
H
H
OH
OH
HO
H
H
H
O
NH
H
H
H
H
O
H
C
CH
O
(1-4)
(1-3)
CHOSO,
CHOH
O
O
heteropolissacardeos
unidades dissacardicas
(uma delas: N-acetilGlicN
ou N-acetilGalN)
viscosidade; gel
carga negativa
Matriz extracelular
(polissacardeos e protenas)
GLICOSAMINOGLICANAS
-
Figura 5.12
103 Carboidratos
5.5 Peptideoglicana
Uma caracterstica da parede celular bacteriana que seu prin-
cipal componente so os heteropolissacardeos. O polissacardeo
presente formado por uma unidade repetitiva, constituda de
dois resduos de monossacardeos unidos por ligaes glicosdi-
cas (1 4). Um dos monmeros a N-acetil-D-glicosamina
e o outro o cido N-acetilmurmico. A estrutura deste ltimo
difere da N-acetil-D-glicosamina pela substituio do grupo hi-
droxila (-OH) no carbono 3 pela cadeia lateral de acido lctico
[-O-CH(CH3)-COOH]. O cido N-acetilmurmico encontrado
somente em paredes celulares de procariotos.
Cadeias deste heteropolissacardeo so mantidas unidas atravs
de ligaes cruzadas, formadas por pequenos peptdeos. Esta estru-
tura, resultante das ligaes cruzadas do polissacardeo por pept-
deos, a peptideoglicana, nome dado porque contm componen-
tes tanto de natureza peptdica, como tambm de carboidratos.
Um esquema do arranjo estrutural de uma peptideoglicana est
ilustrado na Figura 5.13. Note que nos peptdeos envolvidos nas
ligaes cruzadas da peptideoglicana ocorrem D-aminocidos.
Peptdeoglicana
Stio de clivagem
pela lisozima
Extremidade
redutora
(1 4)
Pentaglicina
L-Ala
D-Glu
L-Lys
D-Ala
cido N-Acetilmurmico
(Mur2Ac)
N-Acetilglicosamina
(GlcNAc)
Figura 5.13
104 Bioqumica
Resumo
Os carboidratos so compostos que ocorrem naturalmente,
cujos grupos funcionais so aldedos ou cetonas, alm de mlti-
plas hidroxilas.
Os carboidratos tm diferentes funes biolgicas, entre elas,
papel estrutural, reserva energtica, reconhecimento e comunica-
o celular.
Em soluo aquosa, os carboidratos, a partir de reaes intra-
moleculares de um grupo aldedo ou cetona com um grupo hidro-
xila, formam uma estrutura cclica de cinco ou seis elementos.
A ligao entre monossacardeos para formar oligo ou polissa-
cardeos a ligao O-glicosdica.
Os carboidratos mais abundantes na natureza so os polissaca-
rdeos amido, glicognio e celulose.
Nas glicoprotenas, os carboidratos aparecem ligados covalen-
temente s protenas, atravs de resduos de serina, treonina ou
asparagina. As glicoprotenas esto envolvidas em muitas funes
biolgicas, incluindo proteo imunolgica, reconhecimento clu-
la-clula e interao hospedeiro-patgeno.
Bibliografa
c
A
p
t
U
l
o

6
cidos Nuclicos Estrutura e
Funo
Neste captulo estudaremos a estrutura do DNA e do RNA,
destacando suas semelhanas e suas diferenas, bem como as
caractersticas e funes biolgicas deste ltimo. Alm disso,
vamos estudar os nveis de organizao estrutural dos cidos
nuclicos.
107 cidos Nuclicos - Estrutura e Funo
6.1 O que so os cidos Nuclicos?
Os cidos nuclicos encontrados nos organismos vivos so o
cido ribonuclico (ARN, ou RNA, do ingls, ribonucleic acid) e
o cido desoxirribonuclico (ADN, ou DNA, do ingls, deoxyribo-
nucleic acid). Eles so cidos porque, por exemplo, so carregados
negativamente no pH 7,0 e podem formar sais de sdio.
Sua estrutura e real importncia ou papel biolgico s emergi-
ram no incio dos anos cinqenta do sculo passado, particular-
mente a partir dos estudos sobre o DNA realizados por Watson
e Crick. Estes estudos, que elucidaram a estrutura da molcula,
tambm forneceram evidncias de que o DNA era capaz de rea-
lizar duas funes fundamentais para qualquer organismo vivo:
uma delas ser portador da informao molecular que defne as
caractersticas de um dado ser vivo; a outra ser capaz de duplicar
esta informao de forma precisa, de modo que, ao ocorrer a di-
viso de uma clula, cada uma das clulas-flhas conter a mesma
informao presente na clula parental que a originou.
A compreenso do carter informacional dos cidos nuclicos
representou um marco de grande impacto na Biologia, onde novas
fronteiras foram estabelecidas na investigao dos processos mo-
leculares vitais dos seres vivos. A partir dos anos oitenta do sculo
passado, vrias metodologias foram sendo desenvolvidas, de for-
ma a permitir a manipulao da informao contida nestas ma-
cromolculas, entre elas a engenharia gentica e a terapia gnica.
Esta parte da Bioqumica denominada de Biologia Molecular.
108 Bioqumica
6.2 Unidades Fundamentais dos
cidos Nuclicos
A anlise qumica da composio dos cidos nuclicos revela
que estas macromolculas so formadas por fosfato, dois tipos de
monossacardeos (ribose ou desoxirribose) e quatro tipos diferen-
tes de bases orgnicas nitrogenadas.
Estes componentes esto ligados covalentemente de modo a
constituir as unidades fundamentais que do origem aos cidos
nuclicos. Assim, tanto o DNA como o RNA so polmeros forma-
dos por milhares de unidades fundamentais, denominadas nucle-
otdeos, ou seja, os cidos nuclicos so polinucleotdeos.
Assim sendo, um nucleotdeo contm um monossacardeo, uma
base nitrogenada e um grupo fosfato.
Quando nos referimos aos cidos nuclicos, o termo base no
se refere a um composto alcalino, como o NaOH, mas a um com-
posto aromtico nitrogenado que apresenta um ou dois anis
(anis heterocclicos).
Os nucleotdeos podem ser separados em duas famlias: os ribo-
nucleotdeos e os desoxirribonucleotdeos, dependendo se apresen-
tam, respectivamente, ribose ou desoxiribose na sua composio
(aproveite para recordar a estrutura destes monossacardeos que,
nos cidos nuclicos, ocorrem como -D-pentoses) (Figura 6.1).

C
O H
C OH H
H C OH
C OH H
CHOH
C
O H
CH
H C OH
C OH H
CHOH
D-Ribose,
uma aldopentose
2-Desoxi-D-ribose,
uma aldopentose
C O
H
C OH H
H C OH
C OH H
CHOH
1
2
3
4
5
Aldopentose -Furanose
1
2
3
4
5
CH
OH
OH OH
OH
O
H
H
H
H
Figura 6.1
Assim, o tipo de monossacardeo diferencia os dois tipos de ci-
dos nuclicos, sendo o RNA constitudo por ribonucleotdeos e o
DNA por desoxirribonucleotdeos. Note que esta diferena estru-
tural est diretamente relacionada nomenclatura utilizada para
designar os dois tipos de cidos nuclicos.
As bases nitrogenadas presentes nos cidos nuclicos (tambm
chamadas de nucleobases) so de dois tipos: as bases pricas (de-
rivadas da purina, composto aromtico de dois anis) e as bases
pirimdicas (derivadas da pirimidina, composto aromtico de um
nico anel). Os substituintes presentes nos anis de purina e de
pirimidina distinguem as bases nitrogenadas entre si (Figura 6.2).

Pirimidina
2
1
3
4
5
6
N
C
CH
CH
N
HC
H
Citosina
(no DNA & RNA)
2
1
3
4
5
6
N
C
CH
CH
N
C
O
H
NH
Timina
(no DNA & alguns RNAs)
2
1
3
4
5
6
HN
C
C
CH
N
C
O
H
O
CH
Adenina
(no DNA & RNA)
NH
H
2
3
1
6
5
7
8
9
4
N
N
N
C
C
C
N
HC
CH
Purina
H
H
2
3
1
6
5
7
8
9
4
N
N
N
C
C
C
N
HC
CH
Guanina
(no DNA & RNA)
H
2
3
1
6
5
7
8
9
4
HN
N
N
C
C
C
N
C
CH
O
HN
Uracila
(no RNA)
2
1
3
4
5
6
HN
C
CH
CH
N
C
O
H
O
Figura 6.2
110 Bioqumica
Alm disso, a ocorrncia das bases nitrogenadas responsvel
pela segunda diferena estrutural entre o DNA e o RNA. Como
pode ser visto na mesma fgura anterior, no caso das nucleoba-
ses pirimdicas, a citosina encontrada tanto no RNA quanto no
DNA, enquanto a uracila ocorre apenas no RNA. No DNA, a ura-
cila substituda pela timina. Em poucos casos, no entanto, a timi-
na pode ser encontrada em alguns tipos de RNAs. Alm das cinco
bases nitrogenadas comumente encontradas nos cidos nuclicos,
algumas bases no-usuais podem ser encontradas. Entre elas esto
as bases modifcadas por metilao, como a 5-metilcitosina. Ba-
ses modifcadas so freqentemente encontradas em um tipo de
RNA, o RNA transportador (tRNA).
Neste ponto, ainda nos resta uma questo central a ser respon-
dida: como um monossacardeo, uma base nitrogenada e um
fosfato esto covalentemente ligados entre si para formar um
nucleotdeo? Aqui podemos usar uma breve analogia para faci-
litar nossa compreenso. Imagine que um nucleotdeo seja uma
balana de dois pratos. A parte central desta balana represen-
tada pelo monossacardeo. Deste monossacardeo partem dois
braos, equivalentes s ligaes covalentes, para sustentar dois
pratos, sendo um deles equivalente base nitrogenada e o outro
ao fosfato, respectivamente.
Conforme mostrado na Figura 6.3, o monossacardeo, no caso
uma -D-ribose, est ligado base nitrogenada (prica ou piri-
mdica) atravs de uma ligao glicosdica.
A ligao glicosdica envolve o carbono 1
(C1) da pentose e um nitrognio (N) da
bases nitrogenada. Por isso, esta ligao
denominada N-glicosdica e envolve ou o
nitrognio N-1 de uma piridina ou o nitro-
gnio N-9 de uma purina. Por outro lado, o
cido fosfrico esterifcado com o grupo
hidroxila do carbono 5 do monossacardeo,
carbono 5, sendo esta ligao denomina-
da fosfoster. Esta estrutura aqui descrita e
mostrada na Figura 6.2 a de um nucleot-
deo monofosfato.
1
2
3
4
5
CH O
-
O P
O
-
O
OH OH OH
O
H
H
H
H
Base
Prica ou
Pirimdica
Fosfato
Pentose
Figura 6.3
Nos nucleotdeos, aos nmeros dos carbonos do monossaca-
rdeo adicionado o sinal de aspas simples ( ). Assim, temos
os carbonos 1, 2 , 3, 4 e 5. Este formato particular da numera-
o tem por objetivo deixar claro a que carbono nos referimos na
estrutura do nucleotdeo, permitindo diferenciar os carbonos do
monossacardeo daqueles da base nitrogenada.
6.3 Polimerizao de Nucleotdeos
A polimerizao dos nucleotdeos d origem a cadeias poli-
nucleotdicas, ou seja, aos cidos nuclicos. A ligao entre os
nucleotdeos envolve a formao de duas ligaes ster pelo ci-
do fosfrico. De outra forma podemos dizer que o cido fosfrio
faz a ponte, ou seja, a ligao covalente entre dois nucleotdeos
adjacentes, atravs do carbono 5 de um nucleotdeo e o carbono
3 do outro. Ou seja, os grupos hidroxila para os quais o cido
fosfrico esterifcado so aqueles do carbono 5 e do carbono 3
de nucleotdeos adjacentes.
Na Figura 6.4 pode ser observado um fragmento de uma ca-
deia de RNA. Note o esqueleto acar-fosfato ao longo da cadeia
e a seqncia das bases nitrogenadas. Formando uma cadeia a
partir de ligaes monossacardeo-fosfato, uma seqncia linear
de bases ligadas ao monossacardeo (ribose ou desoxirribose)
criada. Esta seqncia de bases carrega a mensagem gentica em
um alfabeto de quatro letras. Este nmero pode parecer inicial-
mente limitado, mas ao fazermos uma comparao com o cdi-
go binrio de informao utilizado na linguagem computacional
fca mais fcil percebermos o alcance deste cdigo molecular de
informao (Figura 6.5).
A seqncia no DNA de uma clula humana possui milhes de
bases. Um gene estrutural parte de tal seqncia e codifca (ou
seja, possui a informao para produzir) uma cadeia polipeptdica
com uma seqncia determinada.
112 Bioqumica
OCH
O
O
OH
O P
O
-
O
-
NH
N
N
N
N
OCH
O
O
OH
O P
O
-
NH
N
N
O
OCH
O
O
OH
O P
O
-
O
N
N
N
N
H
NH
OCH
O
-
O
OH
O P
O
-
O
H
N
N
O
5
5
5
3
3
3
5
3
Adenina
Extremidade 5-P
Citosina
Guanina
Uracila
Ligao -Glicosdica
entre a ribose e cada
uma das bases
Estrutura abreviada
A C
P
P
P P
G U
OH
Extremidade 3-OH
5
5
3
3
Figura 6.4
a) 110100100110110101010
00101010010101011010110
01011001010100010111111
010001
b) GAGTAGCTAAATCCCAGAT
GCGTTAATCACCGGGGAAAT
TCGGCGCAATTACAGC
Armazenamento de informao em: [a] um sistema binrio (a ordem
de 0 e 1 representa um pulso ou uma ausncia de pulso) em computadores
e [b] na molcula de DNA (em um cdigo de quatro letras equivalentes
s nucleobases dos nucleotdeos).
Figura 6.5
O DNA e o RNA so polmeros de nucleotdeos unidos por liga-
es fosfodister, de modo a formar um esqueleto acar-fosfato.
O acar ou pentose presente no RNA a ribose e no DNA a
desoxirribose. Dois tipos de nucleobases nitrogenadas, purinas e
pirimidinas, esto ligadas ao esqueleto acar-fosfato. A seqncia
de bases a caracterstica fundamental da estrutura primria dos
cidos nuclicos. Esta seqncia no DNA a informao (infor-
mao gentica) responsvel pela seqncia dos aminocidos em
uma dada cadeia polipepdica.
6.4 Nveis Estruturais dos cidos Nuclicos
A descrio dos cidos nuclicos como polmeros de nucleot-
deos limitada, pois no considera a sua estrutura tridimensional.
Assim, para que possamos melhor compreender a relao estrutu-
ra, propriedades e funo, devemos nos familiarizar com todos os
nveis de organizao estrutural dessas molculas.
6.4.1 Estrutura primria
Este nvel de organizao dos cidos nuclicos se refere ordem
ou seqncia dos nucleotdeos na cadeia polinucleotdica, isto ,
a caracterstica fundamental deste nvel de organizao do polme-
ro a seqncia de bases, tanto para o DNA quanto para o RNA.
114 Bioqumica
Podemos fazer aqui uma analogia, comparando as bases nitro-
genadas a letras do alfabeto, s que, neste caso, temos somente
quatro letras ao invs de vinte e trs. Pode parecer um nmero
pequeno, ou at mesmo limitado. No entanto, podemos aqui fazer
uma outra analogia e lembrar como uma vasta quantidade de in-
formao pode ser armazenada atravs de um sistema binrio (de
0 e 1) nos computadores modernos (Figura 6.5).
A ligao responsvel pela manuteno deste nvel estrutural
a ligao fosfodister entre os nucleotdeos. A cadeia polinucle-
otdica, seja formada de desoxirribonucleotdeos ou ribonucle-
otdeos, apresenta polaridade. Em outras palavras, as suas extre-
midades so distintas: uma delas apresenta um grupo 5 fosfato
(5P) livre, enquanto na outra o grupo terminal uma hidroxi-
la 3 (3OH). Esta polaridade relevante para a decodifcao da
mensagem contida na cadeia, ou seja, a mensagem (a ordem ou a
seqncia das bases) tem um sentido: ela lida a partir de uma
extremidade da cadeia.
6.4.2 Estrutura secundria
A estrutura secundria da molcula de DNA, denominada es-
trutura de dupla-hlice, pode ser considerada como a estrutura
molecular mais representada na mdia e, conseqentemente, mais
conhecida entre aquelas de diferentes biomolculas.
Desde que foi proposta por James Watson e Francis Crick em
1953, uma srie de pesquisas foi desencadeada, levando a avanos
sem precedentes na Bioqumica, Biologia Molecular e Gentica.
A histria (inclusive os bastidores) da proposio deste mo-
delo representa tambm um dos captulos mais interessantes da
Biologia Molecular, envolvendo no s aspectos cientfcos, como
outros de natureza distinta, todos relacionados no que podemos
chamar como corrida para elucidar esta estrutura. Esta corrida
teve, inclusive, a participao de Linus Pauling, eminente estudio-
so da estrutura secundria de protenas.
A determinao da estrutura da dupla hlice envolveu a cons-
truo de um modelo molecular (Figura 6.6) com base em padres
de difrao de raios X, obtidas por Rosalind Franklin e Maurice
James Watson
Francis Crick
Wilkins. Alm destas informaes dos padres de difrao de
raios X, outros dados importantes foram aqueles obtidos das an-
lises qumicas da molcula de DNA de vrias espcies realizadas
por Erwin Chargaf e colaboradores. Estas anlises demonstraram
que em uma molcula de DNA a quantidade de adenina (A) era
sempre igual de timina (T), e que a quantidade de guanina (G)
era sempre igual de citosina (C).
Figura 6.6
Todas estas informaes, acrescidas da informao sobre as ca-
ractersticas polares/apolares dos componentes presentes nos nu-
cleotdeos, foram usadas para concluir que a molcula de DNA
formada de duas cadeias de polinucleotdeos enroladas em tor-
no de um eixo, formando uma dupla hlice voltada para a direita
(Figura 6.7). Este modelo foi alvo da publicao de apenas uma
pgina em um dos peridicos de maior impacto (at hoje) nas di-
ferentes reas da Cincia (Figura 6.8).
Linus Pauling
Maurice Wilkins
Rosalind Franklin
116 Bioqumica
T
A
A
A
A
A
A
A
A
A
A T
T
T
T
T
T
T
T
T
C
C
C
C
C
C
C
C G
G
G
G
G
G
G
G
T
A
A
A
Sulco menor na
ta dupla (~12 )

Sulco maior na
ta dupla (~22 )
~20 dimetro
3 5
34
Comprimento de
uma volta completa
As duas tas tm
polaridade oposta
(so antiparalelas)
Eixo central
5 3
Figura 6.7

Estrutura Molecular de cidos Nucleicos
Uma estrutura para o cido desoxiribonucleico
J. D. Watson e F. H. Crick
Nature, 1953.
Gostaramos de sugerir uma estrutura para
a molcula do cido desoxiribonucleico, DNA,
com novidades que so de considervel
interesse para a Biologia
A combinao das evidncias obtidas nos estudos mencionados
permitiu que se conclusse que o esqueleto acar-fosfato a parte
externa da hlice e que as bases nitrogenadas esto voltadas para
o interior da dupla hlice. Este posicionamento interno das bases
nitrogenadas permite o pareamento entre elas, de modo que seja
complementar, ou seja, A pareia com T e G pareia com C. Como
este pareamento ocorre ao longo de toda a dupla-hlice, as duas
cadeias da dupla hlice so chamadas de ftas complementares.
A fora ou ligao responsvel pela manuteno da estrutura
secundria do DNA a ponte de hidrognio (ou ligao de hidro-
gnio) que se forma entre as bases nitrogenadas ao longo da dupla
hlice. Entre um par de adenina-timina (A-T) so formadas duas
pontes de hidrognio, enquanto que entre um par de guanina-ci-
tosina (C-G) so formadas trs (Figura 6.9).
Figura 6.8
118 Bioqumica
Figura 6.9
Assim, o nmero de pares A-T e C-G presentes em uma
dada molcula de DNA est diretamente relacionado a uma
maior ou menor susceptibilidade da molcula desnatu-
rao. Este comportamento distinto de molculas de DNA
frente desnaturao tem vrias aplicaes prticas na sua
manipulao em laboratrio, como por exemplo, na ampli-
fcao de seqncias gnicas especfcas atravs da Reao
em Cadeia da Polimerase (PCR).
Note, ainda, que as pontes ou ligaes de hidrognio for-
madas na estrutura da dupla hlice so intercadeias.
Outros aspectos ainda devem ser destacados em relao
a dupla hlice. Um deles que as cadeias estendem-se em
direes antiparalelas, ou seja, uma de 3 para 5 e a outra de
5 para 3. Outro aspecto est relacionado ao fato de que os
tomos que compem as duas cadeias da dupla hlice no
preenchem totalmente o cilindro que podemos imaginar ao
3
1
2
3
4
N
CH
2
o
o
o
P
o
5
1
2
3
4
o
o
P
o
CH
2
o
o
o
P
o
1
2
3
4
CH
2
o
o
P
o
1
2
3
4
CH
2
o
5
1 2
3
4 5
6 T
CH
3
o
o
N N
N
7
8
9
2
3
4
5
6
G 1
o
N
N
N
N
o
1
2 3
4
5 6
A
7
8
9
N
N
C
1
2
3
4
5
6
7
8
9
2
3
4
5
6
A 1
N
o
N
N
N
1
2
3
4
5
6
C
o
N
N
o
N
7
8
9
1
2
3
4
5
6
G
1
2
3
4
5
6
T
o
5
1
2 3
4
CH
2
o
o
P
o
o
CH
2
1
2 3
4
o
o
P
o
o
CH
2
1
2 3
4
o
o
P
o
o
CH
2
1
2 3
4
o
P
o
o
3
5
DNA
Detalhe da estrutura
secundria
Pareamento = complementar
Ponte de Hidrognio
5 3
5 3
C
C
C
T
T
T
T
T
A
A
A
A
A
G
C
G
G
G
redor e ao longo dela. Isto deixa alguns espaos vazios ao longo da
face externa da hlice (Figura 6.7). Estes espaos so denominados
de sulcos: um sulco maior e um sulco menor. A importncia destes
sulcos que se repetem ao longo de toda a dupla hlice tem sido
cada vez mais investigada, uma vez que drogas ou polipeptdeos
podem se ligar a estes stios, o que tem contribudo para o estudo
da expresso de genes e para o desenvolvimento de frmacos. Alm
disso, devemos lembrar que em pH fsiolgico os grupos fosfato do
esqueleto acar-fosfato esto carregados negativamente. Assim,
ons com carga positiva, como o Mg
2+
, bem como polipeptdeos,
podem estar freqentemente associados molcula de DNA.
A estrutura secundria do DNA
que discutimos a chamada DNA-B.
Acredita-se que esta seja a sua forma
predominante na natureza. No entan-
to, existem variaes conformacio-
nais da estrutura secundria do DNA,
dependendo da seqncia de bases
especfcas, bem como das condies
do meio, como concentrao salina e
o on positivo associado molcula.
O RNA tambm pode apresentar
estrutura secundria. Neste caso, este
nvel de organizao ocorre quando a
cadeia do RNA dobra-se sobre si mes-
ma. Em determinadas regies ao lon-
go deste dobramento, pontes de hidro-
gnio podem ser formadas em funo
do pareamento complementar entre as
bases nitrogenadas. Em algumas re-
gies da molcula, no entanto, devido
ocorrncia de bases nitrogenadas modifcadas, este pareamento
complementar no ocorre, e estes trechos da molcula apresentam-
se como fta simples. Este tipo de arranjo particularmente freqen-
te e caracterstico do RNA transportador (tRNA) (Figura 6.10).
Note que no RNA as pontes ou ligaes de hidrognio formadas
so intracadeia.
3
5
Brao D
Brao TC
Brao Anticdon
Posio
Wobble
pG
Brao Extra
Tamanho varivel,
ausente em alguns tRNAs
Brao de ligao
com Aminocido
Pu
Pu
Py
A
A
U
A
C
C
Pu
U
T

C
C
G
G
G*
Anticdon
3 5
Figura 6.10
120 Bioqumica
6.4.3 Estrutura terciria
A dupla hlice do DNA que discutimos at agora pode apre-
sentar-se de uma forma mais condensada ou empacotada. Uma
analogia que podemos usar aqui para melhor compreender este
empacotamento imaginar a cadeia polinucleotdica como sendo
o fo de um telefone, j que o mesmo tem a forma de uma es-
piral. Imagine agora que as duas pontas deste fo espiralado co-
meassem a sofrer simultaneamente uma toro. Este movimento
levaria a uma maior condensao do fo espiralado, aumentando,
conseqentemente, o seu grau de empacotamento. Na molcula de
DNA isto se traduz em um superenovelamento da hlice em toda
a sua extenso. Este nvel de organizao chamado de estrutura
terciria.
O superenovelamento ou estrutura terciria de DNA facilmen-
te observado em procariotos. No s no DNA genmico, como
tambm nos plasmdeos, ou seja, pequenas molculas de DNA du-
pla fta circular, fechado que ocorrem em bactrias, independente-
mente o DNA genmico.
O superenovelmento foi observado experimentalmente em
DNAs que ocorrem naturalmente, atravs, por exemplo, de mi-
crografas eletrnicas, as quais evidenciaram a presena de DNA
circular de vrias origens, incluindo bactrias, vrus, mitocndrias
e cloroplastos.
O superenovelamento tambm ocorre no DNA nuclear dos eu-
cariotos (vegetais e animais), mas de uma forma mais complexa.
No DNA eucaritico aparece complexado com protenas, denomi-
nadas histonas. Estas protenas so ricas em resduos de aminoci-
dos bsicos (com cadeias laterais polares carregadas positivamente
em pH fsiolgico), como a lisina, e ligam-se eletrostaticamente
com as cargas negativas dos grupo fosfato da molcula de DNA.
Este complexo chamado de cromatina. Em micrografas eletr-
nicas, a cromatina tem a aparncia de um colar de contas, sendo
cada uma destas contas um nucleossomo, o qual constitudo
por DNA envolto em um ncleo de histona (Figura 6.11).
Figura 6.11
Estrutura da Cromatina
Nucleossomo
Oito molculas
de Histonas
DNA
Uma molcula de histona
mantm o DNA preso ao
ncleo octamrico
122 Bioqumica
6.5 Tipos de RNA
Seis tipos de RNA so conhecidos e exercem papis fundamen-
tais nos processos celulares que envolvem a expresso de genes.
Todos estes tipos de RNAs apresentam estrutura primria e secun-
dria (esta ltima em grau extremamente varivel).
Alm do RNA transportador (tRNA) j mencionado acima,
existem o RNA ribosmico (rRNA), o RNA mensageiro (mRNA),
o RNA nuclear pequeno (snRNA), o micro RNA (miRNA) e o
RNA curto interferente (siRNA). A Tabela 6.1 mostra algumas ca-
ractersticas destas molculas e resume seu papel biolgico na c-
lula. De modo geral, os vrios tipos de RNA participam da sntese
de protenas em uma srie de reaes controladas pela seqncia
de bases do DNA celular. Assim, as seqncias de bases de todos
os tipos de RNA so determinadas pelo DNA.
Diferentes RNAs: papel Biolgico
Tipo de RNA Tamanho Funo
RNA transportador Pequeno
Transporta a minocidos
para o local da sntese de
protena
RNA ribossomal Tamanho varivel
Combinam-se com protenas
para formar os ribossomos
(local da sntese de protenas)
RNA mensageiro Varivel
Direciona a ordem
dos a minocidos
na cadeia polipeptdica
RNA nucelar pequeno Pequeno
Processamento do
mRNA p ara a su a
forma madura em eucariotos
Micro RNA Pequeno
Afeta a expresso de
genes (im portante no
desenvolvimento e
crescimento)
RNA de interferncia Pequeno
Afeta a expresso de genes
(usado e m p esquisas
para silenciar genes)
Tabela 6.1
6.6 Outras Funes dos Nucleotdeos
Os nucleotdeos no so s importantes como matria-prima
para a sntese de cidos nuclicos.
Se grupos adicionais de fosfato formam ligaes de anidrido
com o primeiro fosfato, so gerados nucleotdeos di- e tri-fosfata-
dos. A importncia destes nucleotdeos para o metabolismo celu-
lar ser discutida ao longo da disciplina, mas aqui devemos desta-
car sua importncia no armazenamento de energia qumica, como
componentes de coenzimas (formas ativas de vitaminas hidrosso-
lveis) e, ainda, na transduo de sinal. Exemplos de nucleotdeos
associados a esta ltima funo podem ser vistos na Figura 6.12.

Molculas regulatrias (segundo mensageiros)
Funes Biolgicas de Nucleotdeos
Adenosina 3 , 5 - monofosfato cclico
(AMP cclico; cAMP)
3
5
OH
H
P
H
H H
O
Adenina
O
O O
O
CH
Guanosina 3 , 5 - monofosfato cclico
(GMP cclico; cGMP)
3
5
OH
H
P
H
H H
O
Guanina
O
O O
O
CH
Figura 6.12
124 Bioqumica
Resumo
Os cidos nuclicos, DNA e RNA, so importantes por seus pa-
pis no armazenamento e no fuxo da informao gentica, sen-
do ambos polmeros de nucleotdeos ligados covalentemente, os
desoxirribonucleotdeos ou os ribonucleotdeos, respectivamente.
Os nucleotdeos so constitudos de uma base nitrogenada, uma
pentose e um grupo fosfato (nucleotdeos monofosfato).
Em 1953, Watson e Crick propuseram o modelo de estrutura
secundria para o DNA, a dupla hlice. As duas cadeias da dupla
hlice so mantidas unidas atravs de pontes de hidrognio entre
os pares de base complementares: A-T e C-G.
A quantidade de pontes de hidrognio infuencia diretamen-
te a susceptibilidade desnaturao, o que tem vrias aplicaes
prticas.
Existem diferentes tipos de RNA, os quais realizam papis bio-
lgicos distintos.
A arquitetura molecular dos cidos nuclicos apresenta dife-
rentes nveis de organizao, os quais apresentam particularidades
distintas entre o DNA e o RNA.
Bioqumica Vol. 2 Biologia molecular
M. K. Campbell, S. O. Farrell
Nesta nova edio, este livro-texto foi dividido em trs volumes.
O volume 2 foi dedicado exclusivamente Biologia Molecular.
Alm da estrutura e funo de cidos nuclicos, h uma abordagem
abrangente sobre as principais tcnicas e a biotecnologia de cidos
nuclicos. Um captulo sobre tpicos atuais em Biologia Celular e
Molecular traz um material ricamente ilustrado e trata de algumas
aplicaes importantes, particularmente na rea de Sade.
CAMPBELL, M. K. & FARRELL, S. O. Bioqumica: Vol. 2 Biologia mole-
cular. 5. ed. So Paulo: Tomson Learning, 2008.
U
N
I
D
A
D
E

c
Unidade C
Aspectos Gerais do
Metabolismo
c
A
p
t
U
l
o

7
Catlise
Neste captulo estudaremos as bases da catlise realizada
pelas enzimas, bem como os principais parmetros cinticos
de uma reao catalisada por uma enzima. Estudaremos
tambm as principais classes de enzimas, os fundamentos da
inibio enzimtica e o comportamento cintico de enzimas
alostricas.
129 Catlise
A vasta maioria das milhares de reaes qumicas que ocorrem
nos organismos vivos so catalisadas por enzimas. Na verdade, a
maior parte destas reaes no ocorreria a uma velocidade razo-
vel e compatvel com a vida na ausncia de um catalisador.
E o que um catalisador? Bem, um catalisador pode ser um on
metlico ou uma molcula que acelera a velocidade com que uma
reao ocorre. Assim, na presena de um catalisador de natureza
metlica, como a platina e o nquel, por exemplo, a velocidade de
uma dada reao aumentada por um fator na ordem de 10
3
a 10
4
.
Por sua vez, as enzimas, denominadas de catalisadores biolgicos,
podem acelerar a velocidade de uma reao por um fator de at
10
17
. Estas consideraes esto resumidas na Tabela 7.1.
Fator de Aumento da Velocidade de
Algumas Reaes catalisadas por Enzimas
Anidrase Carbnica 10
7
Triose-Fosfato Isomerase 10
9
Carboxipeptidase A 10
11
Fosfoglicomutase 10
12
Succinil-CoA Transferase 10
13
Urease 10
14
Tabela 7.1
130 Bioqumica
Por outro lado, nem sempre todas as reaes na clula devem
proceder continuamente a uma velocidade alta. Assim, ligando
e desligando a atividade das enzimas, a velocidade das reaes
pode ser modulada e controlada de forma bastante precisa. Este
conceito pode fcar mais claro em relao s enzimas envolvidas
no metabolismo da glicose. Em uma situao de jejum, as enzimas
celulares que degradam o glicognio para liberar glicose devem es-
tar ativas. Por outro lado, logo aps uma refeio sero as enzimas
envolvidas no armazenamento de glicose na forma de glicognio
aquelas a estarem ativas. Este controle obtido atravs de diferen-
tes estratgias, as quais, no seu conjunto, modulam a velocidade
das diferentes enzimas celulares e fazem com que o metabolismo
ocorra de forma coordenada.
7.1 Breve Histrico
Apesar da utilizao das enzimas desde a Antigidade, aquele
que considerado o primeiro registro da existncia da catlise bio-
lgica foi o estudo relatado, em 1822, por um mdico canadense,
William Beaumont, sobre o efeito da secreo gstrica na digesto
da carne. Ele realizou estes estudos durante o tratamento de um
soldado, cuja parede estomacal fcara exposta no abdmen devido
a um ferimento a bala. A ferida decorrente permitiu que Beau-
mont acompanhasse o que ocorria quando pedaos de carne eram
introduzidos no estmago do paciente com o auxilio de um cor-
do. Seus experimentos mostraram que a carne era digerida pelo
suco gstrico e que nenhuma triturao era necessria.
Em 1835, Berzelius relatou que no extrato da batata havia algu-
ma coisa que hidrolisava o amido. Mas, foram os estudos de Louis
Pasteur sobre a fermentao realizada por leveduras, responsvel
pela converso de acar em lcool, um dos principais marcos da
investigao sobre enzimas. Pasteur postulou que a fermentao
era realizada por fermentos, os quais eram inseparveis da clula
viva.
131 Catlise
Esta afrmao fcou sendo considerada como verdadeira por
dcadas, at que, em 1897, Bchner trouxe um avano signifcati-
vo para o entendimento da catlise biolgica, quando demonstrou
que clulas vivas de levedura no eram, ao contrrio do estabeleci-
do at ento, essenciais para a fermentao. Ele obteve um extrato
de leveduras, o qual se mostrou capaz de fermentar a glicose, pro-
duzindo lcool.
Mais tarde, evidncias foram obtidas de que esta atividade era
destruda pelo aquecimento. Aos poucos se foi compreendendo
que as enzimas eram protenas, at que, em 1926, James Summer
purifcou a enzima urease de uma espcie de feijo, em um grau
compatvel com a sua cristalizao. Os cristais pareciam ser consti-
tudos somente por protena. Estudos semelhantes realizados pos-
teriormente com outras enzimas digestivas tornaram estabelecida
a idia de que todas as enzimas so protenas.
No entanto, em 1975 se descobriu que a urease cristalizada no
apresentava uma constituio 100% protica. Menos de 0.1% da
enzima era representado por um metal, nquel, o qual essencial
para a sua atividade. Na verdade, isto foi observado para vrias
enzimas, as quais apresentavam metais (no necessariamente o n-
quel) ou pequenas molculas orgnicas associadas a elas e necess-
rias para a sua atividade. Estes metais ou molculas associadas so
denominados cofatores ou coenzimas, respectivamente.
Mais recentemente, em 1982, Cech relatou que alguns RNAs
apresentam atividade cataltica. Estes RNAs so chamados de ribo-
zimas. Apesar disto, a grande maioria das enzimas so protenas.
Uma tpica clula bacteriana pode conter aproximadamente 3.000
tipos diferentes de protenas com atividade enzimtica, ou seja, en-
zimas, enquanto em uma clula humana poderamos estimar este
nmero como sendo na ordem de 50.000. Mas, mesmo com estes
nmeros, em funo da descoberta das ribozimas, acredita-se que
antes das protenas, a atividade cataltica era exercida por molcu-
las de RNA, ribozimas, no que chamamos mundo do RNA.
132 Bioqumica

Histrico
1822 - Foi reconhecida a existncia de Catlise bio-
lgica, atravs de estudos da digesto da carne por
secrees do estmago (William Beaumont).
1835 - Converso do amido em acar pela saliva e
extrato de plantas.
1850s - Louis Pasteur concluiu que a fermentao
do acar em lcool pelas leveduras era catalisa-
da por fermentos. Ele postulou que os fermen-
tos eram inseparveis das clulas de leveduras vi-
vas. Foi denominado vitalismo e permaneceu por
dcadas.
1897 - Eduard Buchner descobriu que extratos de
leveduras fermentavam o acar em lcool mos-
trando que este processo continuava a funcionar
mesmo aps serem removidas das clulas. Fre-
derick W. Khne (1878) denominou estas molcu-
las de Enzimas ( na levedura).
1926 - Urease foi isolada e cristalizada por James
Sumner. Sumner descobriu que os cristais de urea-
se consistiam inteiramente de protena e postulou
que todas as enzimas eram protenas.
Os estudos foram aceitos aps John Northrop e
Moses Kunitz terem cristalizada a pepsina, tripsina
e outras enzimas digestivas, concluindo que todas
eram protenas. Nesta poca J.B.S. Haldane escre-
veu um tratado intitulado Enzymes. Apesar da na-
tureza molecular das enzimas no ter sido comple-
tamente analisada, Haldane props que as intera-
es fracas entre as enzima e o substrato poderiam
ser utilizadas para catalisar a reao.
7.2 Catlise Enzimtica
Os catalisadores qumicos que mencionamos acima tendem a
ser no-especfcos, ou seja, eles catalisam uma ampla gama de re-
aes qumicas.
Os catalisadores biolgicos, por outro lado, tm um comporta-
mento diferente, ou seja, uma enzima (E) geralmente altamente
especfca para a reao que ela catalisa. Esta especifcidade est
fundamentada na interao de uma parte especfca da molcula
de enzima com a molcula envolvida na reao catalisada. Esta
molcula denominada de substrato (S). A regio da enzima que
interage com o substrato denominada de stio ativo. Esta intera-
o est representada na Figura 7.1 e pode ocorrer, por exemplo,
em funo de ligaes fracas entre o S e a E, de modo a formar um
complexo ES. Destas ligaes fracas participam determinados re-
sduos de aminocidos presentes no stio ativo da enzima, os quais
so denominados de resduos essenciais do stio ativo. O nmero
de resduos de aminocidos que formam ou participam do stio
ativo varia dependendo da enzima. Como uma idia geral, pode-
mos dizer que o equivalente a aproximadamente 6-12 resduos de
133 Catlise
aminocidos, de um total de 200-
400 resduos que formam uma
dada enzima, fazem parte do s-
tio ativo. A natureza dos resdu-
os tambm varia, dependendo
da enzima (Figuras 7.2 a e b). Na
quimotripsina, por exemplo, trs
resduos so os principais envol-
vidos na catlise: serina (SER),
histidina (HIS) e cido asprtico
(ASP). Em muitos casos, estes re-
sduos podem estar distantes na
estrutura primria da enzima e,
mesmo assim, participarem do
stio ativo, uma vez que podem
estar bastante prximos espacial-
mente, dada a estrutura terciria
da molcula.
Figura 7.2a
Figura 7.1
134 Bioqumica
Quimotripsina:
esquema da estrutura primria
16
42
His
Asp
Ser
122
136
146
149
168
58
182
191
201
220
245
S
S
S
S
S
S
S
S
S
S
Cadeia B
Cadeia C
Cadeia A
13
1
Figura 7.2b
135 Catlise
O composto resultante da atividade cataltica denominado de
produto (P). Na reao catalisada pela urease, mostrada abaixo,
podemos facilmente identifcar o S e o P, alm de observar uma
outra caracterstica fundamental da ao das enzimas como cata-
lisadores. Elas no so consumidas e permanecem inalteradas ao
trmino da reao.
Urease
Uria + H
2
O 2NH
3
+ CO
2
(S) (E) (P)
Devemos salientar aqui que as enzimas (assim como os catali-
sadores inorgnicos) catalisam a obteno do equilbrio de uma
reao. Esta idia do equilbrio de uma reao importante e de-
pende das concentraes relativas do substrato (s) e do produto
(s). As reaes tendem a ocorrer na direo do seu equilbrio. Para
que isto se d de outra forma, haveria a necessidade de energia, o
que no suprido pelo catalisador, uma vez que o mesmo perma-
nece inalterado ao fnal da reao.
As reaes ocorrem porque os produtos possuem uma energia
qumica menor que os substratos, ou seja, elas tendem a ocorrer na
direo do equilbrio, at que o mesmo seja atingido. No entanto,
evidente que, mesmo sendo capazes de reagirem, muitas substn-
cias no o fazem! Um exemplo pode ser dado pelo petrleo, o qual
contm uma grande quantidade de carbono e hidrognio, que pode
ser oxidada pelo oxignio atmosfrico, mas, mesmo assim, perma-
nece estvel e inalterado a temperatura ambiente na presena do ar,
no entrando em combusto ou exploso espontnea. A razo para
isso que os reagentes (petrleo e oxignio) no possuem energia
sufciente a temperatura ambiente para reagir entre si. Existe uma
barreira energtica entre os reagentes e os produtos desta reao.
Esta barreira energtica denominada de energia de ativao.
Quando as molculas vo reagir, elas devem formar um com-
plexo denominado estado de transio, o qual apresenta uma
energia maior que a energia mdia tanto dos reagentes quanto dos
produtos. Assim, a energia de ativao a diferena de energia en-
tre a energia dos reagentes e aquela do estado de transio.
136 Bioqumica
No laboratrio, ns podemos aumentar a temperatura para que
algumas molculas dos reagentes venam esta barreira energti-
ca. Mas, esta estratgia no aplicvel s clulas. Assim, as enzimas
representam um caminho alternativo para a reao. Em contraste
com a reao normal (no catalisada), este caminho alternativo
tem um estado de transio diferente, com uma energia de ativa-
o mais baixa (Figura 7.3).
Devemos lembrar que mesmo nesta situao o equilbrio da re-
ao no afetado, ele simplesmente atingido muito mais rapida-
mente. A diferena de energia entre aquela dos reagentes e aquela
dos produtos a mesma, independente da rota que a reao toma
(no-catalisada ou catalisada).
Energia
Livre
energia
de ativao
estado de transio
reagentes
produtos
Progresso da Reao
Figura 7.3
7.3 Nomenclatura e Classifcao das Enzimas
Para muitas enzimas digestivas ainda utilizada uma denomi-
nao mais antiga, a qual, certamente, voc j conhece. Neste gru-
po, esto includas as enzimas pepsina, tripsina, quimotripsina,
renina e ptialina, por exemplo.
Mas, a denominao mais simples e amplamente utilizada atu-
almente est baseada na descrio feita por Summer para a enzima
urease, ou seja, adicionando-se o sufxo ase ao nome da molcu-
la sobre a qual a enzima age. No entanto, o nome urease, apesar
137 Catlise
de indicar que a enzima age sobre a uria, no fornece nenhuma
informao sobre o tipo de reao que a enzima catalisa (neste
caso, uma reao de hidrlise). Assim sendo, mais recentemente,
o recomendado que o sufxo ase seja adicionado ao nome da
reao catalisada pela enzima. Assim, por exemplo, uma oxidase
catalisa uma reao de oxidao.
Mesmo com esta forma de denominar as enzimas, visando evi-
tar ambigidades, a Unio Internacional de Bioqumica, a IUBMB,
formou uma comisso especial para organizar um sistema de clas-
sifcao e nomenclatura de enzimas para ser utilizado por todos
os pesquisadores e estudiosos da rea. Esta comisso, denomina-
da de Enzyme Comission (EC), estabeleceu seis classes distintas de
enzimas, tomado por base os tipos de reaes catalisadas por elas
(Tabela 7.2 a e b).
classifcao Internacional das Enzimas
Nmero Classe Tipo de Reao Catalisada
1 Oxiredutases
Transferncia de eltrons (on
hidreto ou tomo de H)
2 Transferases Transferncia de grupos
3 Hidrolases
Reao de hidrlise (participao da
gua)
4 Liases
Adio de grupos a ligaes duplas
ou Formao de ligaes duplas por
remoo de grupos funcionais
5 Isomerases
Transferncia de grupos dentro
das molculas para formao de
ismeros
6 Ligases
Formao de ligaes covalentes
C-C, C-S, C-O, C-N por reaes de
condensao, ligadas a clivagem de
ATP
Tabela 7.2a
138 Bioqumica
Nomenclatura-2
IUBMB Unio Internacional de Bioqumica e Biologia
Molecular
Classifcao funcional sistemtica
Exemplo:
Carboxipeptidase A
Peptidil-L-Aminocido Hidrolase (nome sistemtico)
E.C.3.4.17.1 (nmero de classifcao)
(classe, sub-classe, sub-sub-classe, no. de srie)
Tabela 7.2b
Observando a Tabela 7.2a, surpreendente que, apesar da exis-
tncia de milhares de enzimas, elas possam ser classifcadas em
apenas seis classes. Este um ponto importante a ser destacado.
Mesmo com a grande e complexa variedade de seqncias de
reaes celulares, o metabolismo ocorre atravs de um nmero
ou conjunto de transformaes qumicas simples.
7.4 Cintica Enzimtica
A idia de que as enzimas aumentam a velocidade de uma dada
reao implica que, de alguma forma, isto possa ser acompanhado
em condies de laboratrio. Assim, o curso de uma da reao
(ou a sua velocidade) pode ser acompanhado. Uma forma atra-
vs da velocidade com que o substrato convertido em produ-
to, digamos, a quantidade de substrato (em moles, por exemplo)
convertida por unidade de tempo (por minuto, por exemplo) em
condies padro.
necessrio defnir as condies em que a reao est ocor-
rendo, porque, como veremos mais adiante, a velocidade varia
com a concentrao de enzima, com a temperatura e com o pH
do meio.
139 Catlise
De forma similar, em vez de se medir o desaparecimento do
substrato, uma alternativa possvel seria medir a velocidade ou
taxa de aparecimento do produto. A escolha entre estas duas es-
tratgias vai depender do que seja mais conveniente, exeqvel e
preciso.
Podemos tomar a atividade da enzima amilase salivar como
uma referncia. Esta enzima digere (ou seja, catalisa a hidrlise) o
amido em unidades menores, como a maltose, por exemplo. Con-
forme vimos anteriormente, o amido (neste caso, substrato) forma
um complexo de cor azul escuro intenso ao reagir com o lugol,
enquanto o mesmo no ocorre com a maltose (neste caso, produ-
to). Assim sendo, uma forma de avaliar esta reao seria retirar
pequenas alquotas da mistura da reao ao longo de intervalos
de tempo determinados e test-las frente reao com o lugol. Ao
longo do tempo, poderamos verifcar que o aparecimento da cor
azul iria diminuir gradativamente.
Uma vez que as reaes enzimticas ocorrem em volumes pe-
quenos, em baixas concentraes, normalmente se utiliza ou se
defne a unidade de reao em termos de 10
-6
moles (ou M) con-
vertidos por minuto. A unidade internacional (International Unit,
SI) da atividade de uma enzima defnida como a quantidade de
enzima capaz de converter 1 mol de substrato em produto em um
intervalo de 1 minuto, sob condies defnidas de pH e temperatu-
ra. O equivalente SI de atividade enzimtica, o katal, defnido
como a quantidade de enzima que catalisa a converso de 1 mole
de substrato em produto em 1 segundo. Alguns exemplos podem
ser vistos na Tabela 7.3.
Nmero de Renovao ou Turnover (K
cat
) de Algumas Enzimas
Enzima Substrato K
cat
(s
1
)
Catalase H
2
O
2
40.000.000
Acetilcolinesterase Acetilcolina 14.000
-Lactamase Benzilpenicilina 2.000
Protena Rec A (uma ATPase) ATP 0.4
Tabela 7.3

Turnover
equivalente ao nme-
ro de molculas de subs-
trato transformadas no
produto em uma dada
unidade de tempo por
uma nica molcula de
enzima, quando a mes-
ma est saturada com o
substrato.
140 Bioqumica
Em 1913, Leonor Michaelis e Maud L. Menten (Figura 7.4) pro-
puseram um modelo geral para a ao enzimtica, conforme mos-
trado a seguir:
Enzima (E) + Substrato (S) ES

Produto (P) + E
Complexo
Enzima / Substrato
A formao do complexo enzima-substrato (ES) a principal
caracterstica do modelo proposto por Michaelis e Menten. O
substrato convertido a produto, o qual , ento, liberado da en-
zima. Como todos os catalisadores, a enzima regenerada ao fnal
da reao.
O modelo proposto por Michaelis e Menten, alm de prever a
formao de um complexo enzima-substrato (ES), tambm per-
mite estabelecer a base da dinmica da reao catalisada por uma
enzima. Esta dinmica envolve alguns parmetros importantes, os
quais, no geral, defnem o que denominamos de cintica enzim-
tica.
Quando medimos a velocidade de uma reao enzimtica na
presena de concentraes variveis (crescentes) de substrato,
podemos observar que a velocidade depende da concentrao
de substrato [S]. Podemos construir um grfco que nos permita
melhor visualizar esta relao a partir da curva hiperblica obtida
(Figura 7.5).
Na parte inferior da curva, ou seja, na presena de concentra-
es baixas de substrato, a reao de primeira ordem, implicando
que a velocidade, V, depende da concentrao de substrato [S].
Por outro lado, na parte superior da curva (na presena de con-
centraes altas de substrato), a reao passa a ser de ordem zero,
ou seja, a velocidade independe da concentrao do substrato. A
reao est na sua velocidade mxima, V
mx
. Os stios ativos de to-
das as molculas de enzima esto saturados. Na presena de uma
concentrao infnitamente alta de substrato, a reao continuaria
em sua velocidade mxima.
Figura 7.5
V
mx
1/2 V
mx
K
M
Concentrao de substrato, [S] (mM)
V
e
l
o
c
i
d
a
d
e

I
n
i
c
i
a
l
,

V
0

(
M
/
m
n
)
Figuras 7.4 - Leonor Michaelis
(1875-1949) e Maud Menten
(1879-1960)
141 Catlise
A partir desta relao, o modelo de Micahelis e Menten permite
que uma outra constante possa ser estabelecida. Ela representa a
concentrao de substrato na qual a reao ocorre com a meta-
de da sua velocidade mxima. Esta constante denominada de
constante de Michaelis-Menten, K
M
. Em outras palavras, quando a
velocidade da reao igual metade do seu valor mximo, a con-
centrao de substrato igual constante de Michaelis-Menten.
Esta a base da determinao grfca de K
M
.
A constante K
M
pode ser considerada como o inverso da medida
da afnidade entre a enzima e o seu substrato. Em outras palavras,
quanto menor for o K
M
, maior a afnidade da enzima pelo subs-
trato. Assim sendo, podemos utilizar o valor de K
M
para comparar
enzimas quanto a afnidade por um substrato. Podemos utilizar
como exemplo a comparao entre duas enzimas que catalisam a
fxao de CO
2
(incorporao de CO
2
em uma biomolcula mol-
cula) na fotossntese: a ribulose 1,5 bi-fosfato carboxilase, RUBIS-
CO, e a fosfoenolpiruvato carboxilase, PEP-carboxilase. Enquan-
to o K
M
da RUBISCO 20, o da PEP-carboxilase 5. Esta ltima
apresenta uma maior afnidade pelo substrato, no caso o CO
2
.
A partir da curva que descreve a velocidade de uma reao en-
zimtica, bastante difcil estimar V
mx
porque ela uma curva
assinttica e o valor nunca atingido com qualquer concentrao
Lembre-se que a constante
K
M
expressa em unidades de
concentrao.
Em 1913, Leonor Michaelis e Maud L. Menten (Figura 7.4) pro-
puseram um modelo geral para a ao enzimtica, conforme mos-
trado a seguir:
Enzima (E) + Substrato (S) ES

Produto (P) + E
Complexo
Enzima / Substrato
A formao do complexo enzima-substrato (ES) a principal
caracterstica do modelo proposto por Michaelis e Menten. O
substrato convertido a produto, o qual , ento, liberado da en-
zima. Como todos os catalisadores, a enzima regenerada ao fnal
da reao.
O modelo proposto por Michaelis e Menten, alm de prever a
formao de um complexo enzima-substrato (ES), tambm per-
mite estabelecer a base da dinmica da reao catalisada por uma
enzima. Esta dinmica envolve alguns parmetros importantes, os
quais, no geral, defnem o que denominamos de cintica enzim-
tica.
Quando medimos a velocidade de uma reao enzimtica na
presena de concentraes variveis (crescentes) de substrato,
podemos observar que a velocidade depende da concentrao
de substrato [S]. Podemos construir um grfco que nos permita
melhor visualizar esta relao a partir da curva hiperblica obtida
(Figura 7.5).
Na parte inferior da curva, ou seja, na presena de concentra-
es baixas de substrato, a reao de primeira ordem, implicando
que a velocidade, V, depende da concentrao de substrato [S].
Por outro lado, na parte superior da curva (na presena de con-
centraes altas de substrato), a reao passa a ser de ordem zero,
ou seja, a velocidade independe da concentrao do substrato. A
reao est na sua velocidade mxima, V
mx
. Os stios ativos de to-
das as molculas de enzima esto saturados. Na presena de uma
concentrao infnitamente alta de substrato, a reao continuaria
em sua velocidade mxima.
Figura 7.5
V
mx
1/2 V
mx
K
M
Concentrao de substrato, [S] (mM)
V
e
l
o
c
i
d
a
d
e

I
n
i
c
i
a
l
,

V
0

(
M
/
m
n
)
142 Bioqumica
fnita de substrato. Conseqentemente, isto difculta a determina-
o do K
M
da enzima. Comparativamente, mais fcil trabalhar
com uma linha reta do que com uma curva. Assim, a equao que
defne a hiprbole (Figura 7.6) pode ser transformada em uma
equao para uma linha reta, tomando-se as recprocas dos dois
lados da mesma.
V
0
= V
mx
1/2 V
mx
K
M
[S] (mM)

V
0

(
M
/
m
n
)
V
0
= V
mx
[S]
K
M
Figura 7.6
A equao passa a ser a de uma linha reta (y = ax + b), em que a
coordenada y corresponde ao inverso da velocidade, ou seja, 1/V,
enquanto 1/[S] toma o lugar da coordenada x (Figura CAT11). A
inclinao da reta, a, defnida pela relao K
M
/V
mx
e a intersec-
o, b, corresponde a 1/V
mx
. Esta representao grfca foi descrita
em 1934 por H. Lineweaver e D. Burk, da a denominao de gr-
fco de duplo-recproco de Lineweaver-Burk.
Experimentalmente, mais fcil obter uma reta passando por
um conjunto de pontos que estimar o melhor ajuste de pontos de
uma curva. Atravs de mtodos computadorizados adequados
pode-se desenhar a melhor reta com uma srie de pontos expe-
rimentais. Nesta situao, tal reta pode ser inclusive, extrapolada
para valores altos de [S]. Isto facilita em muito o estudo da cintica
de muitas enzimas, uma vez que muitas vezes pode-se esbarrar no
limite de solubilidade ou de alto custo de um dado substrato. Esta
extrapolao tambm pode ser empregada no caso da determina-
o de V
mx
.
143 Catlise
7.5 Enzimas Alostricas
Devemos destacar que a reao utilizada para gerar as constan-
tes cinticas de Michaelis-Menten foi baseada no comportamento
de uma enzima simples, isto , aquela com um nico substrato
sendo convertido em um nico produto.
Apesar do comportamento de vrias enzimas conhecidas poder
ser descrito de forma bastante adequada pelo modelo de Michae-
lis-Menten, no metabolismo celular encontramos muitas enzimas
que catalisam reaes contendo dois ou mais substratos. Para es-
tas enzimas, ao traarmos um grfco de V versus [S], poderemos
observar uma curva sigmoidal para um destes substratos (Figura
7.8). Assim, tecnicamente, o termo K
M
apropriado apenas para
as enzimas que apresentam uma curva hiperblica de velocida-
de, V versus concentrao de substrato, [S]. Para as enzimas que
apresentam um comportamento distinto daquelas que obedecem
a cintica de Michaelis-Menten, o termo K
M
substitudo por K
0,5
.
Estas enzimas so chamadas de enzimas alostricas.
Allo, do grego, quer dizer
outro.
Inclinao

=
V
mx
K
M

V
0
1

M
/
M
i
n
1
(
)
[S]
1
mM
1
( )
V
mx
1
K
M
1
-
(Lineweaver-Burk)
1 = K
M
(1) + 1
V V
mx
[S] V
mx
Figura 7.7
144 Bioqumica
V
mx
1/2 V
mx
K
0.5
[S] (mM)
V
0

(
M
/
m
n
)

Figura 7.8
O comportamento das enzimas alostricas exibe efeitos coo-
perativos, em funo de mudanas sutis na sua estrutura quater-
nria. Desta forma, essas mudanas acabam por modular a sua
atividade. Em geral, as enzimas alostricas possuem, alm do seu
stio ativo, um ou mais de um outro stio, onde outras molculas
podem se ligar. Este(s) outro(s) stio(s) so chamado(s) de stio(s)
alostrico(s).
As enzimas alostricas parecem apresentar duas conformaes
ou duas formas ligeiramente diferentes, uma ativa e outra inativa.
Algumas enzimas alostricas so normalmente ativas e a ligao
de uma dada molcula no seu stio extra (o stio alostrico) des-
liga a sua atividade. A ligao desta molcula causa uma mudana
sutil na conformao da protena e, como conseqncia, do sitio
ativo, o que leva uma maior ou menor atividade da enzima, ou
seja, o comportamento da enzima afetado. Resumindo, a ligao
do substrato, inibidores ou ativadores muda a estrutura quatern-
ria de protenas alostricas, e essas mudanas na conformao so
refetidas no seu comportamento. Uma molcula que modifca a
estrutura quaternria e, assim, o comportamento de uma protena
alostrica ao se ligar a ela chamada de efetor alostrico. O ter-
mo efetor pode ser aplicado tanto a substratos, como inibidores
145 Catlise
e ativadores. Em geral, eles podem ser classifcados como efetor
positivo ou efetor negativo, dependendo do seu efeito sobre a ati-
vidade da enzima. Este efeito pode ser acompanhando pelo des-
locamento da curva da atividade da enzima, conforme pode ser
visto na Figura 7.9. O termo modulador muitas vezes utilizado
como sinnimo de efetor.
C R
C R M S
C R M S
+ - M M
M
S
Substrato
Modulador positivo
Enzima menos ativa
Enzima mais ativa
Complexo enzima-substrato ativo
Enzimas Alostricas ou Reguladoras
Figura 7.9
Dentro desta anlise, ainda podemos classifcar os efeitos des-
tas interaes sobre a atividade da enzima em dois tipos: efeitos
homotrpicos e efeitos heterotrpicos. Os efeitos homotrpicos
so interaes alostricas que ocorrem quando diversas molculas
idnticas so ligadas a uma protena. A ligao de molculas de
substrato a stios diferentes em uma enzima um exemplo de efei-
to homotrpico. J os efeitos heterotrpicos so interaes alost-
ricas que ocorrem quando substncias diferentes (como inibidor e
substrato) se ligam protena.
Existe uma variedade de compostos que podem modular a ati-
vidade das enzimas, ligando-as ou desligando-as. Comumen-
146 Bioqumica
te, a maioria destes compostos formada por compostos interme-
dirios de uma dada via bioqumica ou via metablica (formada
por uma seqncia de reaes). Na verdade, uma forma bastante
comum de controle de uma via metablica envolve o controle de
uma enzima alostrica e chamada de retroinibico ou feed-
back negativo. Neste caso, o produto fnal de uma seqncia de
reaes metablicas catalisadas por enzimas inibe alostricamente
a primeira enzima da via, conforme mostrado na Figura 7.10. A
via somente se tornar ativa novamente quando a concentrao
do produto fnal diminuir. Neste ponto, a enzima tornar-seno-
vamente ativa. Muitos exemplos deste tipo de mecanismo so co-
nhecidos e operam na clula, o que possibilita um controle sensvel
do metabolismo celular, representado por uma mirade de reaes
enzimticas.
1/2 V
mx
K
0.5
K
0.5
K
0.5
[S] (mM)

V
0

(
M
/
m
n
)
V
mx
+
+
-
-
Figura 7.10
7.6 Inibio da Atividade Enzimtica
Com base no que discutimos at agora, podemos facilmente
considerar que qualquer alterao da estrutura tridimensional de
uma enzima e, conseqentemente, de seu stio ativo, deve afetar
147 Catlise
sua atividade cataltica. Em outras palavras, a atividade de uma
enzima pode ser inibida.
Realmente, diversas substncias podem inibir a atividade cata-
ltica das enzimas de formas distintas, como por exemplo, muitos
frmacos, toxinas, pesticidas e herbicidas. Alm de entender como
estes compostos atuam, o estudo deste efeito inibitrio permite
tambm entender a base molecular de um determinado processo
cataltico e conhecer a estrutura do stio ativo de uma dada en-
zima. O conhecimento tanto da forma do stio ativo de uma de-
terminada enzima, como dos seus respectivos inibidores pode ter
aplicaes importantes. Entre estas aplicaes podemos destacar
o desenho de frmacos mais efcientes. Um exemplo seria o dese-
nho de um frmaco que inibisse de forma efetiva a ao de uma
determinada enzima do patgeno, mas que no tivesse efeito sobre
o seu hospedeiro.
A inibio da atividade enzimtica pode ser conseqncia da
ao de inibidores reversveis. Um tipo de inibio reversvel en-
volve a ao de inibidores que apresentam uma semelhana es-
trutural com o substrato. Este tipo de inibidor denominado de
inibidor competitivo, uma vez que ele compete com o substrato
pelo stio ativo da enzima, ou seja, ele ocupa o stio ativo (Figura
7.11 a e b).
Enzima
Substrato
Figura 7.11a
148 Bioqumica
Inibidor
competitivo
Enzima
Figura 7.11b
Ao ligar-se ao stio ativo da enzima, o inibidor competitivo im-
pede a ligao do substrato e, naturalmente, a catlise no ocorre.
Em outras palavras, existe uma competio entre o substrato (S) e
o inibidor (I) pelo stio ativo da enzima (E), podendo ocorrer ou a
formao do complexo ES ou do complexo EI (Figura 7.12).
S S
I I
EI
I
E + S ES E + P
+
K
Figura 7.12
149 Catlise
O resultado desta competio depende da concentrao relativa
de substrato e inibidor. O efeito do inibidor pode ser minimiza-
do na presena de altas concentraes de substrato, ou seja, altas
concentraes de substrato podem deslocar o inibidor. Em altas
concentraes de substrato, a reao pode ainda atingir a sua V
mx
.
Este efeito pode ser avaliado estudando-se a velocidade da reao
na presena de diferentes concentraes de substrato e inibidor. A
anlise dos parmetros cinticos descritos pelo modelo de Micha-
elis-Menten fornece uma ferramenta importante para a avaliao
do efeito de um inibidor competitivo, uma vez que, na sua presen-
a, o K
M
da reao alterado, ou seja, aumenta (Figura 7.13).
E
E
K
ES
EI
K
s
K
M
-1
V
1
[S]
1
+[I]
Sem
inibidor
(-1)
+2[I]
V
mx
1
K
M
-1
[I]
K
I
( )
1 +
0
O segundo tipo de inibio reversvel denominada de inibio
no-competitiva. Neste caso, o inibidor se liga enzima em uma
regio da molcula distinta do stio ativo. Esta ligao ou impede
que o substrato tenha acesso ao stio ativo ou altera a conformao
da enzima, o que, conseqentemente, altera tambm a conforma-
o do stio ativo, impedindo a interao enzima-substrato (Figu-
ra 7.14).
Figura 7.13
150 Bioqumica
Substrato
Enzima
Inibidor
no-competitivo
Figura 7.14
Os inibidores no-competitivos no apresentam semelhana es-
trutural com o substrato e no se estabelece uma relao de com-
petio entre ambos. Tanto o inibidor pode se ligar ao complexo
ES, quanto o substrato pode potencialmente se ligar ao complexo
EI (Figura 7.15).
I
I
S
S
E + S ES E + P
+
I
ESI
K
I
S
Figura 7.15
151 Catlise
A adio de mais substrato (alta concentrao de substrato)
reao no reverte inibio, ou seja, o efeito do inibidor perma-
nece. Novamente, a cintica enzimtica pode nos auxiliar a en-
tender o efeito do inibidor, uma vez que pode ser observada uma
diminuio da V
mx
, dado que uma parte das molculas de enzima
est inibida (Figura 7.16).
13
12
11
10
9
8
7
6
5
4
3
2
1
0 5 10 15 20 25 30 35
V 1
1/[S](M)
Interseco =
Interseco =
Interseco =
-1
K
M
1
V
mx
1
V
i
1
V
1
V
mx
[I]
K
I
[ ]
1 +
K
M
V
mx
[I]
K
I
[ ]
1 +
K
M
V
MAX
Inclinao =
Inclinao =
(Inibidor
no-competitivo)
(Sem inibidor
presente)
Muitos inibidores podem se ligar covalentemente cadeia la-
teral de um resduo de aminocido essencial ao stio ativo da en-
zima. Neste caso, esta ligao covalente do inibidor ao stio ativo
da enzima causa uma inibio irreversvel. Assim sendo, a con-
formao da enzima afetada de forma permanente. Um exemplo
est mostrado na Figura 7.17, com a ligao covalente do compos-
to diisopropilfuorofosfato (DIFP) a um resduo de serina (Ser
195
)
do stio ativo de uma serino-protease, a quimotripsina. Este com-
posto pode tambm se ligar serina presente no stio ativo da en-
zima acetilcolinesterase, sendo, por isso, denominado de gs dos
nervos, extremamente txico. Muitos inseticidas, como o malation
e o paration, foram desenvolvidos a partir do DIFP. Eles matam os
insetos pelo mesmo mecanismo, ou seja, pela inibio da acetil-
colinesterase. Os insetos so bastante sensveis ao destes com-
postos, mas devemos lembrar que eles so txicos tambm para os
seres humanos.
Figura 7.16
152 Bioqumica
CH
(Ser)
CH
CH HC
CH
CH P
P
O
O
H
C
C
O
O
O F
F H
Quimotripsina
Diisopropiluorofosfato
Quimotripsina
OH +
+
+
(DIFP)
CH
CH
CH
CH
HC
H
CH
O O
Inibio Irreversvel
Figura 7.17
Entre as substncias naturais ou sintticas que podem causar
uma inibio enzimtica irreversvel podemos citar o cido ace-
til-saliclico, a aspirina. Neste caso, o composto tem propriedades
farmacolgicas, atuando como anti-infamatrio, antipirtico e
analgsico. A aspirina transfere de forma irreversvel seu grupo
acetil para o grupo OH de um resduo de serina da enzima ci-
clooxigenase, causando a inibio de sua atividade. Esta enzima
est envolvida na primeira reao da sntese de prostaglandinas
(PGAs), substncias com atividade biolgica derivadas do cido
graxo poliinsaturado, cido araquidnico (20:4) (veja o capitulo
sobre lipdeos). As PGAs tm vrios efeitos fsiolgicos, entre eles,
a induo da resposta infamatria e da febre. O efeito antiinfa-
matrio e antifebril da aspirina est relacionado inibio que ela
causa sobre a sntese das PGAs.
Um outro exemplo importante de inibio enzimtica irrever-
svel envolve a ao da penicilina, um antibitico largamente em-
pregado, cuja descoberta nos anos 1940 teve um grande impacto
na sade humana. A penicilina atua como um inibidor irreversvel
ao ligar-se, covalentemente, enzima envolvida na sntese da pa-
rede bacteriana, ou seja, da peptdeoglicana. Seu efeito inibitrio
se d sobre a formao do cross-linking ou rede de peptdeos que
153 Catlise
une as cadeias polissacardicas da peptideoglicana (veja o capitulo
sobre carboidratos).
7.7 Regulao Enzimtica por
Modifcao Covalente
A atividade de algumas enzimas tambm pode ser regulada
atravs de modifcaes covalentes. A modifcao covalente da
enzima pode resultar na ativao ou na inibio de sua atividade.
Um tipo de modifcao covalente importante envolve a adio ou
a remoo de grupos fosfato em um determinado resduo de ami-
nocido, como a serina, ou seja, envolve a fosforilao e a desfos-
forilao da enzima. A fosforilao depende da ao de enzimas
que transferem grupos fosfatos, as protenas-quinases, enquanto a
remoo destes grupos est a cargo das protenas-fosfatases. Um
exemplo bem conhecido de regulao da atividade enzimtica de-
pendente da modifcao covalente da enzima por fosforilao
a da enzima glicognio fosforilase que catalisa a hidrlise do gli-
cognio. Neste caso, a forma ativa da enzima a forma fosfori-
lada, enquanto a forma desfosforilada inativa. As duas formas
(fosforilada e desfosforilada) podem ser interconvertidas uma na
outra pela ao de quinases e fosfatases. Esta regulao da ativida-
de enzimtica e, conseqentemente, de uma dada via metablica,
atravs de modifcao covalente de uma enzima da via, envolve a
ao de hormnios.
7.8 Enzimas na Indstria
As enzimas tm vrias aplicaes industriais. Uma delas na
obteno de xarope de milho. Os animais no podem absorver a
sacarose: para ser aproveitada ela precisa sofrer a ao da enzima
sacarase, tambm chamada invertase, existente nas clulas que
recobrem o intestino delgado. Esta enzima catalisa a hidrlise da
sacarose a D- glicose e D- frutose, que so rapidamente absorvidas
e lanadas na corrente sangunea.
154 Bioqumica
Entre os trs dissacardeos comuns, a sacarose apresenta o sa-
bor mais doce. Ela tambm mais doce que a glicose (tabela 7.4).
Nos Estados Unidos, devido ao custo sempre maior do acar im-
portado, obtido quer da cana, quer da beterraba, e devido a exis-
tncia naquele pas de grandes quantidades de D- glicose obtida
pelo hidrlise do amido de milho, foi desenvolvido um novo pro-
cesso industrial de produo de um adoante mais efcaz a partir
da D- glicose. Ele consiste na hidrlise do amido com a obteno
de D- glicose na forma de xarope de milho, uma soluo neutra e
concentrada de D- glicose; esta passada por uma coluna conten-

Inibio Enzimtica no Tratamento
de Doenas
Um exemplo da utilizao prtica da inibio enzi-
mtica foi, durante muito tempo, a principal arma
no tratamento de doenas de origem bacteriana.
Os compostos denominados genericamente de sul-
fas so um potente agente antimicrobiano porque
competem com o cido -aminobenzico, o qual
necessrio para a sntese de um metablito essen-
cial para os agentes bacterianos, o cido flico. Um
outro exemplo de aplicao da base bioqumica da
inibio enzimtica pode ser encontrado no trata-
mento da sndrome da imunodefcincia adquiri-
da, ou AIDS. A estratgia utilizada tem sido desen-
volver inibidores que bloqueiam seletivamente as
aes de enzimas exclusivas do vrus da imunode-
fcincia humana (HIV), que causa a AIDS.
Umas das mais importantes enzimas-alvo para o
desenvolvimento de agentes teraputicos a HIV
protease, essencial para a produo de novas par-
tculas desse vrus. Ela catalisa o processamento de
protenas virais dentro de uma clula infectada.
Sem essas protenas, partculas viveis do vrus no
podem ser liberadas para infectar novas clulas. A
estrutura da HIV protease, incluindo seu stio ati-
vo, foi conhecida a partir de resultados de crista-
lografa por Raios X. Com essa estrutura em men-
te, foram desenvolvidos e sintetizados compostos
que se ligam ao stio ativo da enzima. Vrios destes
compostos foram aprimorados e so hoje comer-
cializados por diversas empresas farmacuticas. Es-
ses inibidores da protease do HIV incluem o Saqui-
navir da Hofman-LaRoche, o Ritonavir da Abbout
Laboratories, o Indinavir da Merck, o Viracept da
Pfzer e o Amprenavir da Vertex Pharmaceuticals.
Outros medicamentos voltados para a inibio de
proteases tm sido desenhados, sintetizados e cli-
nicamente testados para o tratamento de doen-
as neurodegenerativas, como a Doena de Alzhei-
mer (AD). Esta doena caracterizada pela presen-
a de placas cerebrais, as placas senis, formadas
pela deposio de uma protena, denominada de
-amilide (A) neste tecido. Pesquisas recentes
identifcaram a enzima responsvel pela clivagem
de uma protena denominada Protena Precursora
da -amilide APP. Esta enzima uma protease,
denominada -secretase. Ela gera, a partir da APP,
o fragmento correspondente a A, o qual forma os
depsitos ou placas no crebro dos pacientes com
AD. Molculas de A so normalmente formadas,
contendo 40 ou 42 resduos de aminocidos. Nos
indivduos com AD, a produo da segunda for-
ma, a qual gera os depsitos ou placas cerebrais,
favorecida. A inibio da enzima poderia dimi-
nuir a produo de A. Um dos primeiros compos-
tos testados como inibidor da enzima -secretase
foi o L-685, 458, desenvolvido pela Merck Research
Laboratories.
155 Catlise
do um suporte inerte ao qual a enzima glicose isomerase foi ligada
covalentemente. Mesmo imobilizada no suporte inerte, a enzima
catalisa a reao D- glicose D- frutose e obtm-se uma mis-
tura eqimolecular de D- glicose e D- frutose a partir do xarope
de milho. Como a D- frutose 2,5 vezes mais doce que a glicose,
o poder adoante do xarope de milho muito aumentado. Este
novo produto, mais barato que a sacarose e to nutritivo quanto
ela, est sendo empregado nas indstrias de alimentos, refrigeran-
tes e sorvetes. Recentemente um novo produto constitudo de 90%
de frutose, obtido tambm pelo emprego da glicose isomerase, foi
colocado no mercado como adoante domstico, mas levando-se
em conta o peso ele duas vezes mais caro. Embora mas doce que
a sacarose, e, portanto, obrigando ingesto de menor nmero de
calorias para o mesmo efeito adoante, ele no apresenta nenhuma
vantagem nutricional para justifcar seu preo muito maior.
Sabor Doce de alguns Acares e da Sacarina
Acar Sabor Doce Relativo
Sacarose 100
Glicose 70
Frutose 170
Maltose 30
Lactose 16
Sacarina 40.000
Tabela 7.4
Para uso por pacientes diabticos ou obesos foram desenvol-
vidos adoantes artifciais sem nenhum valor calrico alimentar,
pois para eles a ingesto de excesso de acar muito perigosa.
Os adoantes artifciais estimulam as mesmas estruturas linguais
estimuladas pelos acares, mas no so usados como alimentos
pelo organismo. O adoante artifcial de mais largo emprego a
sacarina (Figura 7.18), que 400 vezes mais doce que a sacarose.
Obtida de vegetais.
C C
O
C NH
C SO
C
H
H
HC
HC
Sacarina
Figura 7.18
156 Bioqumica
Resumo
Enzimas so biomolculas que catalisam e regulam as milhares
de reaes qumicas que ocorrem nos organismos. As enzimas so
majoritariamente protenas, mas algumas formas de RNA apre-
sentam atividade cataltica. A base da atividade cataltica das en-
zimas envolve a diminuio da energia de ativao da reao e a
formao de um complexo enzima-substrato.
Algumas enzimas requerem um cofator, o qual pode ser um on
metlico ou uma molcula orgnica. Neste ltimo caso, esta mol-
cula denominada de coenzima.
A cintica de uma reao catalisada por uma enzima explicada
pela equao de Michaelis-Menten, a partir da qual so defnidos
dois importantes parmetros cinticos: a constante de Michaelis-
Menten, K
M
, e a velocidade mxima, V
mx
.
A catlise enzimtica envolve a ligao do substrato ao stio ati-
vo da enzima. As enzimas apresentam uma cintica de saturao
porque existe um nmero limitado de stios ativos.
As enzimas alostricas so infuenciadas pela ligao reversvel,
no covalente, de molculas denominadas de efetores positivos ou
negativos, o que modula a atividade das mesmas.
A ao ou atividade de uma dada enzima pode ser inibida pela
presena de compostos que podem se ligar enzima. Estes com-
postos, denominados inibidores, podem causar uma inibio re-
versvel ou irreversvel. A inibio reversvel pode ser de dois ti-
pos: competitiva ou no-competitiva.
Bibliografa
157 Catlise
Bioqumica
E. Galembeck, B. B. Torres
Neste CD, o material sobre cintica enzimtica interativo e
permite trabalhar os conceitos dentro de uma simulao de um
experimento de laboratrio. Alm disso, h a possibilidade de re-
alizar algumas das atividades de modo a se avaliar a fxao e o
entendimento correto dos conceitos sobre o assunto.
GALEMBECK, E.; TORRES, B. B. Bioqumica Sofwares educacionais. Ci-
ntica Enzimtica. FUNCAMP, 2003.
c
A
p
t
U
l
o

8
Vias Metablicas e Energia Celular
Neste captulo estudaremos a classifcao e os principais
tipos de metabolismo celular, bem como entenderemos o pa-
pel do ATP e do NADPH no metabolismo celular. Descre-
veremos tambm em linhas gerais a obteno de energia a
partir de biomolculas.
161 Vias Metablicas e Energia Celular
Os organismos vivos podem ser divididos em dois grandes gru-
pos de acordo com a forma qumica do carbono que eles requerem
do meio ambiente. As clulas autotrfcas podem usar o dixido
de carbono da atmosfera como nica fonte de carbono e construir
todas as suas biomolculas a partir dele. So exemplos deste grupo
de organismos as bactrias fotossintetizantes e as clulas das folhas
verdes das plantas. Alguns organismos autotrfcos, como as cia-
nobactrias, podem usar, tambm, o nitrognio atmosfrico para
gerar seus componentes nitrogenados. Por outro lado, as clulas
heterotrfcas no podem usar o dixido de carbono atmosfrico
e necessitam obter os tomos de carbono do meio ambiente na
forma de molculas orgnicas relativamente complexas, tais como
a glicose. As clulas dos animais superiores e da maioria dos mi-
croorganismos so heterotrfcas. As clulas autotrfcas so rela-
tivamente auto-sufcientes, enquanto as clulas heterotrfcas, de-
vido as suas necessidades de carbono em formas mais elaboradas,
dependem de produtos formados por outras clulas.
Muitos organismos autotrfcos so fotossintetizantes e obtm
energia da luz solar, enquanto as clulas heterotrfcas obtm a
energia que necessitam atravs da degradao dos nutrientes or-
gnicos sintetizados pelos organismos autotrfcos. Seres autotr-
fcos e heterotrfcos vivem juntos na biosfera, participando de um
ciclo vasto e interdependente, no qual os organismos autotrfcos
empregam o CO
2
atmosfrico para constituir suas biomolculas e,
neste processo, alguns deles geram oxignio gasoso, o qual libera-
do na atmosfera. Por sua vez, os heterotrfcos utilizam os produ-
Que se alimentam por si
mesmas.
Que se alimentam de outras.
162 Bioqumica
tos orgnicos dos autotrfcos como nutrientes e devolvem o CO
2

atmosfera. Assim, o carbono e o oxignio so constantemente reci-
clados na biosfera, um processo que envolve enormes quantidades
de matria e cuja fora condutora provida pela energia solar.
Muitas clulas, como as leveduras, podem viver de forma quer
aerbica (na presena de oxignio), quer anaerbica (na ausncia
de oxignio): tais organismos so chamados facultativos. A maio-
ria das clulas heterotrfcas, particularmente
aquelas dos organismos superiores, facultativa,
entretanto, sempre que o oxignio est presente
no meio, elas utilizaro suas vias aerbicas para
oxidar os nutrientes.
Nem todas as clulas de um dado organismo
so da mesma classe. Por exemplo, nas plantas su-
periores, as clulas verdes que contm cloroflas
so clulas autotrfcas fotossintetizantes, porm
as clulas das razes, que no contm clorofla, so
heterotrfcas. Ainda mais, as clulas verdes das
folhas so autotrfcas apenas durante o perodo
luminoso do dia. No escuro elas funcionam como
heterotrfcas e obtm energia pela oxidao dos
carboidratos sintetizados luz do dia.
8.1 Metabolismo: Vias Catablicas e
Vias Anablicas
O metabolismo envolve uma srie de reaes bioqumicas que
ocorrem de forma coordenada.
Este metabolismo tem duas fases: catabolismo e anabolismo.
O catabolismo a fase degradativa do metabolismo, na qual as
molculas orgnicas, carboidratos, lipdeos e protenas prove-
nientes do meio ambiente ou dos reservatrios de nutrientes da
prpria clula so degradados por reaes que ocorrem de for-
ma consecutiva, de modo a originar produtos fnais menores e
mais simples, como por exemplo, o cido lctico, CO
2
e amnia.
Auttrofos
fotossintticos
Heterotrfos
O
CO
P
r
o
d
u
t
o
s Org
n
i
c
o
s
Figura 8.1
O catabolismo acompanhado pela liberao da energia livre
inerente estrutura complexa das grandes molculas orgnicas.
Em certos passos de uma dada via catablica, a maior parte de
energia livre conservada na forma de uma molcula transpor-
tadora de energia qumica, a adenosina trifosfato (ATP), o que
conseguido atravs do acoplamento de reaes enzimticas. Al-
guma energia tambm pode ser conservada na forma de tomos
de hidrognio ricos em energia (poder redutor), os quais so
transportados pela coenzima nicotinamida adenina dinucleot-
deo fosfato, em sua forma reduzida (NADPH).
O anabolismo tambm chamado de reaes de biossntese
ou fase biossintetizadora do metabolismo. No anabolismo, as pe-
quenas molculas precursoras, ou unidades fundamentais, so
reunidas para formar polmeros, ou seja, as grandes macromol-
culas componentes das clulas, tais como as protenas e os cidos
nuclicos. Como a biossntese resulta em uma maior complexi-
dade em termos de tamanho e de estrutura molecular, ela requer
tomos de hidrognio ricos em energia, os quais so fornecidos
pelo NADPH.
O catabolismo e o anabolismo ocorrem simultaneamente nas
clulas e a velocidade de cada um regulada independentemente.
Nutrientes ricos
em Energia
Carboidratos
Lipdeos
Protenas
Macromolculas
celulares
Proteinas
Polissacardeos
Lipdeos
cidos Nuclicos
Molculas
precursoras
Aminocidos
Monossacardeos
cidos graxos
Bases nitrogenadas
Produtos fnais
pobres em Energia
CO
HO
NH
Catabolismo
Energia
qumica
ATP
NADH
NADPH
FADH
ADP+HPO
NAD
+
NADP
+
FAD
Anabolismo
Figura 8.2
164 Bioqumica
8.1.1 Catabolismo
A degradao enzimtica de cada um dos principais tipos de
biomolculas (carboidratos, lipdios e protenas) ocorre passo a
passo, atravs de reaes enzimticas consecutivas, e libera ener-
gia. Existem trs estgios principais no catabolismo aerbico. No
estgio I, as macromolculas celulares so degradadas em suas
unidades fundamentais. Assim, por exemplo, os polissacardeos
so degradados a hexoses e pentoses, enquanto os lipdeos so de-
gradados em cidos graxos e glicerol e as protenas so hidrolisa-
das em seus 20 aminocidos primrios.
No estgio II do catabolismo, os vrios produtos formados no
estgio I so reunidos e convertidos em um nmero menor de mo-
lculas ainda mais simples. Assim, as hexoses, pentoses e o glicerol
do estgio I so degradados a um intermedirio mais simples, com
trs carbonos, o piruvato. O piruvato, por sua vez, ento conver-
tido em uma unidade de 2 carbonos (C2), o grupo acetil, o qual
transportado dentro da clula, ligado a uma coenzima, a coenzima
A, ou seja, na forma de acetil-coenzima A (acetil-CoA).
De forma similar, os cidos graxos e o esqueleto carbnico dos
aminocidos so quebrados em grupos acetil para formar o acetil-
CoA. Desta forma, o acetil-CoA o produto fnal comum do est-
gio II do catabolismo.
No estgio III, o grupo acetil do acetil-CoA
introduzido no Ciclo dos cidos Tricarboxli-
cos (TCA) ou Ciclo de Krebs (CK). O TCA pode
ser considerado como uma via fnal comum de
degradao de biomolculas, atravs da qual a
maioria das molculas fornecedoras de energia
so fnalmente oxidadas a dixido de carbono.
importante notar que as vias catablicas
convergem em direo ao TCA, o qual constitui
o estgio III do catabolismo. Por isso, as vias ca-
tablicas so chamadas de vias convergentes.
Durante o estgio I do catabolismo, cente-
nas de protenas diferentes so degradadas a

Hans Krebs
Hans Krebs, trabalhando na Universidade de She-
feld em 1937, props a srie de reaes em um
mecanismo cclico para a oxidao completa do
piruvato, proveniente da quebra de carboidratos.
Inicialmente, ele chamou esta via cclica de Ciclo
do cido Ctrico, o primeiro intermedirio forma-
do. Mais tarde, esta via fcou conhecida como Ci-
clo dos cidos Tricarboxlicos (TCA), em funo
da natureza de vrios dos seus intermedirios.
Muitas vezes, no entanto, esta via denominada
de Ciclo de Krebs, em homenagem ao pesquisa-
dor que a descreveu.
apenas 20 aminocidos; no estgio II estes 20 aminocidos so
degradados principalmente em acetil-CoA e amnia (NH
3
); e no
estgio III os grupos acetil (do acetil-CoA formado) so oxidados
via TCA a CO
2
. De maneira semelhante, no estgio I muitos po-
lissacardeos diferentes so degradados a alguns acares simples,
e estes so convertidos em acetil-CoA no estgio II e, fnalmente,
em CO
2
no estgio III.
Ainda no estgio III do catabolismo, os eltrons gerados no
TCA (na forma de duas coenzimas reduzidas, NADH e FADH
2
)
so fnalmente oxidados na cadeia transportadora de eltrons na
mitocndria. A este fuxo de eltrons est acoplada a fosforilao
do ADP para a produo de ATP. Este fuxo de eltrons na cadeia
transportadora de eltrons reduz ao fnal o oxignio molecular (o
aceptor fnal de eltrons na cadeia), produzindo H
2
O.
Assim, ATP e H
2
O so dois produtos fnais do catabolis-
mo celular, alm do CO
2
, alm da amnia (ou outros produtos
nitrogenados).
Acetil (CoA)
Ciclo de Krebs Fosforilao Oxidativa
Fosforilao Oxidativa
CO
NADH
FADH
Energia
C
K
e
-
Lipdeos
Carboidratos
Protenas
ATP
Glicolise
Ciclo de Krebs
Alimentos/Nutrientes Biomolculas Intermedirio I Intermedirio II
Figura 8.3
166 Bioqumica
8.1.2 Anabolismo
O anabolismo (biossntese) tambm ocorre em trs estgios
e comea com molculas precursoras pequenas. Por exemplo, a
biossntese de protenas inicia-se com a formao de -cetocidos.
No estgio seguinte, os -cetocidos so aminados. No estgio f-
nal do anabolismo, estes aminocidos so reunidos de forma or-
denada em cadeias polipeptdicas, formando-se, assim, um grande
nmero de protenas diferentes.
De maneira semelhante, grupos acetil so reunidos em molculas
de cidos graxos e estes, por sua vez, ordenadamente reunidos em
molculas para a produo de lipdeos variados. O anabolismo um
processo divergente, ou seja, tem incio com poucas molculas pre-
cursoras pequenas e a partir delas constri-se uma grande variedade
de macromolculas. As vias anablicas centrais tm muitas ramif-
caes que levam formao de centenas de componentes celulares
diferentes, ou seja, as vias anablicas so ditas vias divergentes.
Cada um dos estgios principais tanto no catabolismo como no
anabolismo de uma dada biomolcula catalisado por um sistema
multienzimtico. As transformaes qumicas consecutivas que
ocorrem em cada uma das rotas metablicas centrais do metabo-
lismo so virtualmente idnticas em todas as formas de vida.
8.1.3 Via Anfblica
O Ciclo dos cidos Tricarboxlicos ou Ciclo de Krebs uma via
metablica especial.
O Ciclo dos cidos Tricarboxlicos (TCA) consiste de uma serie
de reaes, cada uma delas catalisada por uma enzima, que ocor-
re na mitocndria das clulas eucariticas e na parte interna da
membrana plasmtica de procariotos. Atravs destas reaes, uma
unidade de dois carbonos (C2) unida a uma molcula de Coenzi-
ma A, ou seja, o acetil-CoA, o qual resultante da quebra de meta-
blitos, adicionada a um composto de quatro tomos de carbono
(C4), o oxaloacetato, para produzir um composto de seis tomos
de carbono (C6), o cido ctrico (ou citrato). Posteriormente, du-
rante a evoluo do Ciclo, dois destes carbonos so sucessivamente
removidos como CO
2
, e o oxaloacetato regenerado. Alm disso,
em quatro reaes do Ciclo so gerados eltrons que, na forma de
coenzimas reduzidas (NADH e FADH
2
), so transportados para a
cadeia transportadora de eltrons.
Este conjunto de reaes fundamental para o catabolismo, pois
a porta de entrada para a oxidao completa de grupos acetil
(C2) provenientes da degradao de diferentes biomolculas. Estes
grupos acetil entram no TCA ligados a uma coenzima, a coenzima
A, ou seja, como grupos acetil-CoA. Algumas molculas, como
alguns aminocidos, podem tambm entrar na via diretamente, na
forma de intermedirios da mesma. O TCA a via fundamental
no caminho da oxidao de biomolculas em condies aerbicas,
pois fornece tambm matria-prima para a etapa fnal do catabo-
lismo, ou seja, a cadeia transportadora de eltrons. Este transporte
de eltrons, por sua vez, tem acoplado a si a produo de ATP.
Por outro lado, intermedirios do TCA podem tambm ser
desviados para reaes de biossntese, ou seja, para o anabolismo
celular. Desta forma, o TCA pode ser considerado como uma via
anfblica, atuando tanto no catabolismo como no anabolismo.
8.2 O ATP Transporta Energia das Reaes
Catablicas at as Reaes Anablicas
Molculas nutrientes complexas, como a glicose, contm muita
energia potencial devido ao seu alto grau de organizao estru-
tural. Quando a molcula de glicose degradada por oxidao a
seus produtos fnais simples e pequenos, CO
2
e H
2
O, uma grande
quantidade de energia livre torna-se disponvel. A energia livre
a forma de energia capaz de produzir trabalho sob condies de
presso e temperatura constantes. Entretanto, se no houver al-
guma forma de capturar ou conservar a energia livre liberada na
ocasio da oxidao da glicose, ela se dissipar na forma de calor.
Embora a energia calorfca seja til na manuteno da tempera-
tura corporal nos animais superiores, ela no pode ser usada para
realizar o trabalho mecnico da contrao muscular e nem o tra-
balho qumico necessrio para a biossntese de molculas.
168 Bioqumica
Desta forma, uma grande parte de energia livre liberada da gli-
cose e de outros combustveis celulares durante seu catabolismo
conservada pelo acoplamento da sntese de adenosina trifosfato
(ATP) a partir de adenosina difosfato (ADP) e fosfato inorgnico.
Essas substncias, ATP, ADP e fosfato, esto presentes em todas as
clulas vivas e atuam como sistema transmissor de energia univer-
sal. A energia qumica assim conservada na forma de ATP pode
realizar trabalho de quatro formas diferentes. Ela pode prover a
energia necessria para o trabalho qumico de biossntese. Neste
processo, o grupo, ou grupos, fosfato terminal do ATP transfe-
rido enzimaticamente para molculas ou unidades fundamentais
precursoras, que se tornam, assim, energizadas ou ativadas e
preparadas para serem reunidas em macromolculas. O ATP
tambm a fonte de energia para a motilidade celular ou para a
contrao. O ATP o fornecedor de energia para o transporte de
nutrientes atravs de membranas e contra gradientes de concen-
trao. A energia do ATP tambm usada para assegurar a trans-
ferncia de informao gentica durante a biossntese do DNA, do
RNA e de protenas.
Sempre que a energia qumica do ATP empregada para reali-
zar trabalho celular, o seu grupo fosfato terminal perdido e apa-
rece como fosfato inorgnico livre, o ADP restante a forma des-
carregada do sistema transportador de energia. O ADP pode ser
recarregado com um grupo fosfato, regenerando o ATP, em rea-
es que so acopladas quelas que liberam energia e que ocorrem
durante a degradao de biomolculas na clula. Temos assim, nas
clulas, um ciclo de energia em que o ATP serve como um elo de
transporte de energia, unindo os processos celulares que liberam
ou fornecem energia queles que a consomem. O ATP pode ser
produzido a partir de diferentes estratgias metablicas.
8.2.1 Onde e Quando o ATP Formado?
O ATP sintetizado nas clulas a partir de ADP e fosfato inor-
gnico (Pi). De longe, a maior proporo da produo de ATP
ocorre na mitocndria e nos cloroplastos, estes ltimos presen-
tes nas plantas verdes. Estas organelas, as quais apresentam uma
membrana dupla (uma membrana externa e uma interna), pos-
suem uma estrutura especial que necessria para a sntese de
ATP. Os organismos procariticos produzem ATP de forma se-
melhantes, mas, neste caso, esta produo ocorre nas dobras da
membrana plasmtica.
Em ambos os processos, a produo de ATP depende de um
fuxo ou transporte de eltrons atravs de uma cadeia transpor-
tadora de eltrons. No caso da produo de ATP na mitocndria,
durante a respirao celular, os eltrons provenientes do cata-
bolismo das biomolculas fuem por estes transportadores at
o aceptor fnal, o oxignio, o qual reduzido, formando H
2
O.
Este fuxo de eltrons atravs de uma srie de transportadores
na mitocndria denominado de cadeia respiratria. Este trans-
porte de eltrons tem a fosforilao do ADP acoplada a ele. Esta
produo de ATP, acoplada ao transporte de eltrons na cadeia
respiratria denominada de fosforilao oxidativa.
De modo semelhante, o fuxo de eltrons em uma cadeia trans-
portadora de eltrons ocorre no cloroplasto. Neste caso, os eltrons
so oriundos da excitao do pigmento clorofla pela luz solar, na fase
clara da fotossntese, o que gera tambm a produo de ATP. Esta pro-
duo de ATP dependente de luz denominada de fotofosforilao.
Uma vez que praticamente toda a vida na Terra dependente
da energia luminosa do sol, os cloroplastos das plantas verdes e as
estruturas anlogas nas cianobactrias e nas bactrias fotossinteti-
zantes so os stios-chave para a produo de ATP. Assim, esta pro-
duo de ATP esta diretamente ligada fase clara da fotossntese.
A fotossntese o processo que captura a energia luminosa solar
e a converte em energia qumica na forma de ATP e poder redutor
na forma de NADPH. A primeira parte do processo fotossinttico
envolve reaes fotoqumicas, ou seja, reaes dependentes de luz.
Estas reaes perfazem a fase clara ou fase dependente de luz da
fotossntese. A captura de ftons e a converso de energia lumino-
sa em energia qumica, na forma de ATP e NADPH, usada para a
sntese de todas as molculas orgnicas que formam a planta. Esta
sntese utiliza o CO
2
atmosfrico em uma srie de reaes, deno-
minadas de fase escura da fotossntese. Em outras palavras, o CO
2

170 Bioqumica
fxado em uma molcula orgnica, a glicose, custa do ATP e do
NADPH, gerados na fase clara. O resultado fnal da absoro da
energia luminosa que o organismo fotossintetizante pode com-
binar molculas muito simples, CO
2,
H
2
O e NH
3
, para sintetizar as
biomolculas que necessita.
Alm destes dois mecanismos principais de produo de ATP,
uma pequena quantidade de ATP produzida no citoplasma celu-
lar. Este tipo de produo de ATP ocorre normalmente em algu-
mas vias metablicas, como a via glicoltica, a partir de modifca-
es qumicas sutis em uma molcula intermediria da via. Neste
caso, a produo de ATP independe da presena de oxignio ou da
luz solar. Este mecanismo de produo de ATP e denominado de
fosforilao ao nvel do substrato. Esta produo de ATP im-
portante quando clulas, como as clula musculares, por exemplo,
esto operando em condies anaerbicas. Em condies normais
esta produo de ATP representa somente uma pequena propor-
o da energia total requerida pela clula eucaritica. O ATP pode
ser produzido a partir de diferentes estratgias metablicas, con-
forme mostrado na Figura 8.4.
ATP
GERAO DE ATP
CLOROPLASTO
Fotofosforilao
(Reao dependente de luz)
MITOCNDRIA
Fosforilaooxidativa
(Reao de oxidao)
CITOPLASMA
Fosforilaoao nvel
do substrato
(Rearranjo molecular)
Contrao muscular
Sntese de protenas
Fase escura da
fotossntese
Transporte ativo
atravs
da membrana
Bioluminescncia
Figura 8.4
8.2.2 O NADPH Transporta Energia na Forma
de Fora Redutora
Uma segunda maneira de transporte de energia qumica das re-
aes catablicas at as reaes de biossntese que requerem ener-
gia na forma de tomos de hidrognio ou, ento, de eltrons.
Quando a glicose formada a partir de CO
2
durante a fotos-
sntese, ou quando os cidos graxos so sintetizados a partir de
grupos acetil (acetato) no fgado de um animal, necessria a atu-
ao de uma fora redutora na forma de tomos de hidrognio
para a reduo das duplas ligaes a ligao simples. Para serem
efetivos como agentes redutores, os tomos de hidrognio devem
possuir uma energia livre considervel. Tais tomos de hidrognio
ricos em energia so obtidos dos compostos celulares pela ao
das desidrogenases, que catalisam a remoo de tomos de hidro-
gnio das molculas combustveis e sua transferncia para a forma
oxidada de nicotinamida adenina dinucleotdeo fosfato (NADP
+
).
Esta transferncia de eltrons, conseqentemente, reduz a NADP
+
.
A forma reduzida, ou transportadora de hidrognio, desta coenzi-
ma designada NADPH, e um transportador de eltrons rico em
energia para as reaes biossintticas que requerem esses eltrons.
Neste sentido, a atuao da NADPH semelhante quela do ATP,
como transportador de grupos fosfato ricos em energia.
H
OH OH
H
H H
O O
O
O
O
O
O
O
CH
H
OH OH
H
H H
O
CH
P
P
N
N
N
N
NH
N
H
+
C
O
NH
2e
2H
+
N
:
R
N
:
R
H
C
O
NH
C
O
NH
H H H
+ H
+
ou
lado A lado B
NADH
(reduzido)
Adenina
NAD
+
(oxidado)
No NADP
+
, esse grupo hidroxila
est esterifcado com fosfato.
Figura 8.5
172 Bioqumica
8.3 Energia a Partir de Carboidratos
O principal combustvel para muitas clulas eucariticas, seno
todas, a glicose. Nos animais, este combustvel comumente for-
necido na circulao sangunea ou encontra-se armazenado dentro
da clula, na forma de um polissacardeo de reserva, o glicognio.
A origem da glicose na dieta constituda comumente por dis-
sacardeos (como a sacarose e lactose) ou polissacardeos (como
o amido, por exemplo). Os dissacardeos e os polissacardeos so
hidrolisados pelas enzimas digestivas no intestino delgado e os
monossacardeos resultantes so absorvidos e distribudos atravs
da corrente sangunea.
No escuro (ou seja, na ausncia de luz), as clulas vegetais tam-
bm demandam energia constantemente. Neste caso, os carboi-
dratos, oriundos da fotossntese, so tambm a fonte principal de
energia celular, sejam distribudos como sacarose ou armazenados
na forma de amido.
A via metablica para a degradao da glicose denominada
de via glicoltica ou gliclise (lise = quebra). Esta via catab-
lica de fundamental importncia para todas as clulas eucari-
ticas, mas, para algumas delas, esta via constitui a principal via
de produo de energia. Este o caso das clulas musculares es-
quelticas quando elas funcionam anaerobicamente (na ausncia
de oxignio) e nas hemcias maduras (as quais no apresentam
mitocndria). A importncia desta via nestas circunstncias que
a gliclise pode produzir energia na forma de ATP em condies
anaerbicas. As leveduras, por exemplo, tambm podem utilizar
esta estratgia para a produo de energia quando elas so cresci-
das em condies anaerbicas. Este processo bioqumico sempre
teve uma importncia muito grande na historia da humanidade e
denominado de fermentao. Mais recentemente, este processo
ganhou destaque econmico com a produo de etanol em larga
escala como combustvel alternativo.
A gliclise uma via catablica que ocorre atravs de uma s-
rie de reaes sucessivas, nas quais um monossacardeo de seis
tomos de carbono (glicose) clivado em duas molculas de um
composto de trs carbonos, o piruvato. Ao longo destas reaes,
A digesto do amido pela
amilase salivar na boca
limitada.
a modifcao e a clivagem de alguns intermedirios permitem a
produo de duas molculas de ATP por molcula de glicose que
entra na via. Na verdade, esta produo de ATP requer, inicial-
mente, um gasto de ATP. Este ATP gasto utilizado para fosforilar
a glicose e um outro intermedirio da via, produzido a partir dela.
De fato, a maioria dos compostos intermedirios da via contm
grupos fosfato ligados sua estrutura molecular, ou seja, so in-
termedirios fosforilados. Mas, apesar deste gasto de ATP inicial,
uma quantidade maior do que aquela gasta produzida, de modo
que o balano lquido fnal de produo de ATP pela degradao
da glicose na via positivo.
Um problema com a gliclise que em um dos passos da via ocor-
re uma reao de oxidao, na qual, conseqentemente, um NAD
+
(forma oxidada) d origem a um NADH (forma reduzida). Isto
um evento comum em vrias reaes catalisadas por enzimas que
utilizam o NAD
+
como coenzima. Ento, qual seria o problema? O
problema est no fato de que no h muito NAD
+
no citoplasma ce-
lular e, desta forma, o NADH formado deve ser reciclado para repor
o NAD
+
e permitir deste modo que a gliclise continue a ocorrer.
Em condies aerbicas, isto no constitui um problema, pois o
NADH pode ser reciclado a NAD
+
atravs da fosforilao oxidativa
na mitocndria. Mas, na ausncia de oxignio, isto no possvel.
Assim, por outro lado, os organismos vivos desenvolveram di-
ferentes estratgias para resolver este problema quando em con-
dies anaerbicas. Alguns organismos, como muitas bactrias,
transformam o piruvato em lactato pela ao da enzima lactato de-
sidrogenase e, nesta reao, reciclam o NADH formado em NAD
+
.
Este tipo de estratgia denominado de fermentao lctica. Esta
reao explorada comercialmente na indstria alimentcia, na
produo de queijos, iogurtes, chucrute, entre outros produtos.
Este processo tambm ocorre nas clulas musculares durante um
exerccio intenso. Outros organismos, como as leveduras, realizam
esta reciclagem atravs de uma outra enzima, a lcool desidroge-
nase, com a transformao do piruvato em etanol. Este tipo de es-
tratgia denominado de fermentao alcolica. Esta reao tem
sido explorada pelo homem para a produo de bebidas alcolicas
e na panifcao.
174 Bioqumica
Para a reciclagem em condies aerbicas (mencionada acima),
o piruvato sofre uma reao de descarboxilao oxidativa (reao
irreversvel), a qual catalisada pela piruvato desidrogenase. Esta
reao produz CO
2
e acetil, o qual ligado coenzima A, forman-
do acetil-Coenzima A (acetil-CoA). O CO
2

liberado e o aceti-
CoA entra no Ciclo de Krebs. Esta reao o elo entre a gliclise
e o Ciclo de Krebs, permitindo, em condies aerbicas, ou seja,
com a fosforilao oxidativa, a produo de uma maior quantida-
de de ATP a partir de uma molcula de glicose quando comparada
com a produo em condies anaerbicas.
Resumindo, o produto fnal da gliclise realmente o piruvato
(C3):
Glicose + 2ADP + Pi + 2NAD
+
2Piruvato + 2ATP + 2NADH + 2H
2
O
Este piruvato pode ser convertido ou a lactato ou a etanol, anaero-
bicamente, ou, ainda, em condies aerbicas, a acetil-CoA (C2).
8.4 Energia a Partir de Lipdeos
Os lipdeos utilizados na produo de energia so os triacilgli-
ceris (ou triglicerdeos), os quais esto armazenados no tecido
adiposo ou so fornecidos pela dieta. Neste ltimo caso, os triacil-
gleceris so hidrolisados pela ao de lipases no intestino delga-
do, com a liberao de glicerol e cidos graxos.
O glicerol pode ser modifcado de modo a produzir um interme-
dirio da via glicoltica, na qual , ento, utilizado. Os cidos gra-
xos resultantes da hidrlise (bem como os cidos graxos liberados
dos triacilgliceris das clulas do tecido adiposo) so inicialmente
ativados custa de ATP e ligados a uma molcula de Coenzima A,
atravs da sua extremidade carboxila, formando o derivado acil-
coenzima A. Desta forma, eles podem ser degradados em uma via
catablica na qual sua cadeia vai sendo clivada sucessivamente em
unidades de dois em dois carbonos (C
2
), produzindo acetil-Coen-
zima A (acetil-CoA). Esta srie de reaes envolvidas na quebra
da cadeia de cidos graxos de dois em dois carbonos denomina-
da de -oxidao. A cada unidade de C
2
(acetil-CoA) liberada da
cadeia do cido graxo so produzidos uma molcula de NADH e
uma de FADH
2
, os quais, atravs da fosforilao oxidativa na mi-
tocndria, vo produzir o equivalente a cinco molculas de ATP.
Paralelamente, o acetil-CoA pode entrar no Ciclo de Krebs, geran-
do mais NADH e FADH
2
, os quais, tambm atravs da fosforila-
o oxidativa na mitocndria, vo dar origem a mais ATP. Conse-
qentemente, a quebra de lipdeos pode produzir uma quantidade
considervel de energia qumica na clula, na forma de ATP na
mitocndria e, comparativamente, uma quantidade muito maior
de ATP em termos de uma mesma quantidade de carboidrato. En-
tretanto, esta produo vinculada a lipdeos somente ocorre aero-
bicamente. Na ausncia de oxignio, no h liberao de energia a
partir de cidos graxos.
De modo geral, a glicose o combustvel preferencial para as
clulas. Os lipdeos so utilizados menos prontamente, apesar do
seu potencial maior de suprir a clula energeticamente, atravs da
produo de ATP. Em uma corrida de 100m (corrida rpida, de
velocidade), os atletas estaro utilizando a reserva de glicognio
muscular de forma anaerbica. Por outro lado, em uma maratona
(corrida longa) a energia necessria para o exerccio proveniente
da oxidao tanto do glicognio como dos lipdeos armazenados.
A reserva de glicognio no seria sufciente para este tipo de corri-
da e a reserva de lipdeos deve ser mobilizada.
8.5 Energia a Partir de Protenas
As protenas da dieta so digeridas pelas enzimas (proteases) no
estmago e no intestino delgado, liberando aminocidos. Assim,
os aminocidos provenientes das protenas da dieta so absorvi-
dos e podem ser utilizados para a sntese das protenas necessrias
ao organismo. Uma outra fonte de aminocidos para a sntese de
protenas pelo organismo vem da renovao das protenas celula-
res, as quais, em maior ou menor velocidade dependendo da pro-
tena, so constantemente degradadas e sintetizadas.
176 Bioqumica
Se a dieta fornece um excesso de aminocidos em relao s
necessidades do organismo, os aminocidos passam a ser catabo-
lizados para fornecer energia. Diferentemente do que ocorre para
os carboidratos e lipdeos, as protenas e os aminocidos no so
armazenados. Parte do esqueleto de alguns aminocidos pode ser
convertido em glicose. Outros aminocidos tm parte do seu es-
queleto convertido em acetil-CoA (acetil-Coenzima A), o qual
pode ser convertido em cidos graxos (lipdeos). Por outro lado,
se h necessidade de energia, o acetil-CoA proveniente da degra-
dao de aminocidos utilizado no Ciclo de Krebs. Esta no a
nica forma pela qual os aminocidos so utilizados nesta via me-
tablica. Vrios aminocidos que no so convertidos em acetil-
CoA podem tambm alimentar o Ciclo de Krebs, entrando na via
diretamente como alguns de seus intermedirios.
Em casos extremos de jejum, quando todas as reservas de glico-
gnio e lipdeos j foram consumidas, as protenas dos tecidos po-
dem ser degradadas para fornecer aminocidos que sero catabo-
lizados para o fornecimento de energia. Entretanto, esta estratgia
metablica drstica, uma vez que protenas estruturais valiosas,
como as protenas musculares, passam a ser utilizadas catabolica-
mente, situao que no pode perdurar indefnidamente sem tra-
zer prejuzos permanentes ao organismo.
Devido variedade das estruturas das cadeias laterais dos 20
aminocidos primrios ou proticos, existem diferentes vias ca-
tablicas que possibilitam a sua oxidao, envolvendo o Ciclo de
Krebs. Mas, antes que os esqueletos carbnicos dos aminocidos
sigam este destino, ocorre uma primeira etapa do processo degra-
dativo, a qual comum a todos eles. Esta etapa envolve a remoo
do grupo amino, atravs de uma reao denominada de deamina-
o ou transaminao, com a conseqente produo de amnia. A
amnia, txica para a clula, rapidamente convertida em uria,
no-txica, a qual excretada na urina. Este processo constitui a
via denominada de Ciclo da Uria. Esta via foi descrita por Krebs
e Henseleit em 1931, bem antes da descoberta do Ciclo de Krebs
ou do Ciclo dos cidos Tricarboxilicos.
Enquanto a uria a forma de excreo nitrogenada nos mam-
feros, nas aves e nos insetos, o produto de excreo nitrogenada o
acido rico. Nos peixes, a excreo nitrogenada pode ser realizada
diretamente como amnia, cujo efeito txico diludo no ambien-
te aquoso circundante.
As plantas e muitos microorganismos podem sintetizar seus
prprios aminocidos a partir de amnia ou de nitratos e dixido
de carbono, no necessitando, desta forma, de aminocidos pr-
formados. Por outro lado, os animais necessitam do fornecimento
de alguns aminocidos via dieta, ou seja, alguns aminocidos so
considerados essenciais para os animais.
Alguns microorganismos so vitais para o ciclo de nitrognio e,
conseqentemente, para a vida na Terra, uma vez que eles tm a
capacidade de fxar o nitrognio atmosfrico, ou seja, incorpor-lo
em uma molcula orgnica, a partir da qual outras biomolculas
nitrogenadas podem ser sintetizadas.
Resumo
Os organismos vivos podem ser divididos em dois grandes gru-
pos, de acordo com a forma qumica do carbono que eles reque-
rem do meio ambiente.
O carbono e o oxignio so constantemente reciclados entres os
reinos animal e vegetal, um processo que envolve enormes quantida-
des de matria e cuja fora condutora provida pela energia solar.
O metabolismo intermedirio envolve uma srie de reaes
bioqumicas que ocorrem de forma coordenada. Este metabolis-
mo tem duas fases: catabolismo e anabolismo.
A maior parte de energia livre conservada na forma de mol-
cula transportadora de energia adenosina trifosfato (ATP). Isto
conseguido atravs do acoplamento de reaes enzimticas.
O ATP pode ser produzido a partir de diferentes estratgias
metablicas.
Alguma energia tambm pode ser conservada na forma de to-
mos de hidrognio ricos em energia, transportados pela coenzima
nicotinamida adenina dinucleotdeo fosfato, sua forma reduzida
NADPH.
178 Bioqumica
O catabolismo e o anabolismo ocorrem simultaneamente nas
clulas e a velocidade de cada um regulada independentemente.
Bibliografa
CAMPBELL, M. K. & FARRELL, S.O. Bioqumica: Vol. 3 Bio-
qumica metablica. 5. ed. So Paulo: Tomson Learning, 2008.
GARRET, R. H.; GRISHAM, C. M. Biochemistry. 2. ed. Saunders
College Publishing. Harcourt Brace College Publishers. Fort Wor-
th, 1999.
A mitocndria em 3 atos
L. Meis
Neste CD, voc encontrar uma animao interessante sobre
uma via fundamental do metabolismo celular: o Ciclo de Krebs.
Este trabalho pioneiro no Brasil em termos de animao em Bio-
qumica e inclui abordagens distintas sobre a estrutura e o funcio-
namento da mitocndria.
MEIS, L. Mitocndria em 3 atos. Departamento de Bioqumica Mdica,
UFRJ.

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