Questionrio de Bioqumica

A gua e seus efeitos sobre as biomolculas em soluo 1. Uma grande coeso interna gua lquida conferida pelo grande nmero de pontes de hidrognio entre as suas molculas . O que permite gua a formao de tantas pontes de hidognio ? 2. Por que as biomolculas polares , mas no carregadas , como os acares , por exemplo , dissolvem-se facilmente em gua ? 3. Estruturalmente como podem ser caracterizadas uma micela e uma bolha de sabo ? 4. A importncia da manuteno de pH em alguns sistemas biolgicos enorme. Como conseguida essa constncia de pH na natureza 5. Por qu a molcula de gua um dipolo? 6. Por qu em uma soluo de gua + soluto apolar, formam-se micelas? 7. O que significa dizer que o pH uma escala logartmica? 8. Carboidratos 1. Como se diferencia aldoses e cetoses ? Qual a nomenclatura para cada um? 2. O que so centros quirais e qual a consequncia imediata de sua presena na molcula de carboidrato ? 3. Conceitue :

furanose; piranose; hemicetal ; hemiacetal; carbono anomrico.

1. O que so centros quirais ? 2. O que caracteriza a estrutura tridimencional do amido ? Quais os dois principais componentes que formam este polissacardeo? 3. Qual a importncia da extremidade redutora na ligao glicosdica ?

4. Comente sobre os mais importantes polissacardeos de reserva : amido e glicognio . 5. Faa um comentrio sobre os mais importantes polissacardeos estruturais : celulose e quitina. 6. O que confere aos carboidratos seu poder redutor? Por que a sacarose um carboidrato no redutor? 7. O que torna a celulose insolvel? Lipdeos 1. Quais so as vantagens dos lipdeos sobre os carboidratos como substncias de reserva ? Quais as desvantagens? 2. Relacione triacilgliceris e sabo . 3. Diferencie glicerofosfolipdeos , triacilgliceris e esfingolipdeos realando seus constituintes . 4. Explique a importncia dos esteris para a estrutura das membranas das clulas eucariticas. 5. Relacione PF com insaturao. Aminocidos , peptdeos e protenas 1. Quais so as caractersticas comuns a todos os aminocidos ? 2. O que so "zwitterions"? 3. Que parte dos aminocidos podem liberar H+ para a ao tamponante dos aminocidos? 4. O que representa o ponto isoeltrico da curva de titulao dos aminocidos ? 5. Quais so as partes dos aminocidos envolvidos nas ligaes peptdicas ? Por que os aminocidos envolvidos em tais ligaes so chamados de resduos? 6. As protenas tm muitas funes biolgicas diferentes . Cite algumas dessas funes e exemplifique se possvel ? 7. Embora as ligaes covalentes sejam claramente muito mais fortes , as interaes fracas predominam como foras estabilizadoras da estrutura protica . Por que ? 8. Por -hliceque a conformao forma-se mais facilmente do que muitas outras conformaes possveis ? 9. Quais -hliceso as restries que afetam a estabilidade de uma ?

10. Como se classificam os aminocidos e em que se baseia essa classificao se todos so polares? 11. Relacione o tipo de ligao presente em cada nvel estrutural das protenas. 12. De que forma a estrutura primria define a estrutura terciria? Enzimas 1. Quais so as vantagens das enzimas em relao aos catalisadores nabiolgicos ? 2. Cite a importncia das enzimas regulatrias nos sistemas enzimticos . 3. Por que as estruturas primria , secundria, terciria e quaternria das enzimas so essenciais para o exerccio das atividades catalticas ? 4. O que energia de ativao de uma reao ? de que maneira os catalisadores aumentam a velocidade da reao ? 5. O que aconteceria se a energia de ativao de uma reao fosse nula ? 6. O tradicional modelo chave-fechadura apresenta uma incoerncia . Explique e corrija-o. 7. Como os vrios tipos de inibio influenciam os valores de Km e Vmax? 8. Qual a vantagem de se utilizar um inibidor suicina na produo farmacutica? 9. Por que o melhor lugar para se inibir uma via glicoltica o incio ? 10. O grfico da cintica de uma enzima alostrica tem forma sigmide . Neste grfico , h um valor de [S]em que Vo = 1/2 Vmx. este valor pode ser considerado Km ? Por que ? 11. Por que a curva obtida para a cintica alostrica sigmide , e no hiperblica ? 12. Graficamente qual a diferena entre uma enzima com efetor e outra com inibidor alostrico ? 13. O que e qual a importncia da canalizao de enzimas? 14. Descreva as vantagens das enzimas serem protenas 15. Diferencie graficamente inibio competitiva de no-competitiva Nucleotdeos e cidos nuclicos . 1. A importncia dos nucleotdeos algo indiscutvel. Analise suas funes e explique por qu so importantes . 2. Diferencie bases nitrogenadas de nucleosdeos e nucleotdeos.

3. Qual a estrutura bsica de um nucleotdeo ? 4. Quais so as partes dos nucleotdeos envolvidas em uma ligao fosfodister? 5. Que fatores permitem que o DNA funcione bem como reservatrio de informao gentica? 6. Compare a renaturao protica com a renaturao de um cido nucleico. 7. Entre os principais nucleotdeos , encontra-se a ATP (e tambm GTP , UTP e CTP) . Qual a sua funo ? Por que consegue desempenh-la to eficientemente ? 8. A estabilizao da estrutura tridimensional dos cidos nuclicos feita pelo pareamento especfico de bases. Qual a dupla mais estvel e por qu? Que outro tipo de interao h entre bases nitrogenadas e que papel exercem na estrutura? 9. Levando em conta a composio do DNA e RNA, como vc explicaria que oRNA seja o cido nuclico mais dinmico na clula, atuando no citoplasma? Bioenergtica: 1. Explique e justifique a falta de equilbrio nas reaes metablicas. 2. Descreva o termo: fosforilao no nvel do substrato 3. Explique a razo pela qual a produo biolgica de energia se faz por etapas Gliclise 1. Descreva o processo por que uma molcula de amido ou glicognio entra na via glicoltica . 2. De que modo a presena de Acetil-CoA ou cido graxo inibem a ao da piruvato quinase ? 1. Por que no se podem empregar integralmente as enzimas de uma via catablica em sua correspondente via anablica ? 2. Como se d o aproveitamento da frutose e da galactose como fontes de energia. 3. Qual a importncia dos intermedirios fosforilados para as vias metablicas ? 4. Quais os principais pontos de regulao da gliclise ? 5. Quais podem ser os destinos tomados pelo piruvato que produzido na gliclise ? Qual a importncia biolgica da entrada deste na mitocndria? 6. Agrupe as enzimas da via quanto funo. Explique. 7. Como as pentoses podem ser aproveitadas como fonte de energia? Que fatores controlam a interconverso entre estas e a glicose?

8. Explique quais so as vias de reoxidao do NADH, em condies de aerobiose e anaerobiose relativas Ciclo do cido Ctrico 1. Qual a contribuio do CAC na produo de energia , uma vez que cada volta s produz uma ATP ? 2. Alm da oxidao do acetato , qual a outra funo do CAC ? 3. O que so e como agem o NADH e o FADH ? 4. O que so reaes anaplerticas ? 5. Relacione a piruvato carboxilase com a presena ou no de Acetil-CoA. 6. Como ocorre a regulao do ciclo a partir do cdomplexo piruvato desidrogenase ? 1. Explique a regulao do ciclo por cada enzima citada abaixo :

citrato sintase; isocitrato desidrogenase; -cetoglutarato desidrogenase .

8. Por que o CAC deve ficar inibido na ausncia de O2 se esta via no utiliza esta molcula? Por que a gliclise no fica? 1. Em inalteradas quantidades dos componentes do CAC, o aumento na concentrao de Acetil-CoA pode aumentar o nmero de ciclos funcionantes? Por qu? 2. Descreva o rendimento em ATP, CO2 produzidos e O2 consumidos quando do ciclo de krebs 3. Interprete: O ciclo de krebs uma via metablica anfiblica e anaplertica Fosforilao oxidativa 1. No que se resume a fosforilao oxidativa , qual a importncia e onde ocorre este processo ? 2. Que caractersticas da membrana mitocondrial interna possibilita o processo citado acima ? 3. Alm do NAD e das flavoprotenas , quais outros transportadores de eltrons esto envolvidos no processo de fosforilao oxidativa ? 4. Identifique e caracterize a ao dos complexos I ,II , III e IV participantes deste processo.

5. Como o transporte de eltrons pode gerar energia ? 6. Como o mecanismo de produo de energia pelo ATP sintase? 7. Diferencie os caminhos seguidos pelos eltrons provenientes do NAD e do FAD. 8. Como os eltrons do NADH citoslico so aproveitados pela fosforilao oxidativa , uma vez que este processo ocorre na membrana mitocondrial interna ?Explique o processo. 9. Como ocorre a regulao da fosforilao oxidativa ? 10. A queda no transporte de eltrons diminu a sntese de ATP e VIVE-VERSA. Explique como se d essa influncia nos dois sentidos. 11. Quais as formas de transferncia de eltrons utilizadas na CTE? Qual transportador utiliza cada forma? 12. Por que o Complexo II no tem a mesma capacidade de gerar gradiente de prtons que o I? 13. Se a CTE NO produz ATP, por que to comum afirmarem isso? 14. Por que o ATP produzido no armazenado na mitocndria? Como ele transportado para fora dela? 15. De que modo o ciclo de krebs e a cadeia respiratria se inter-relacionam para a produo de energia para a clula? Oxidao de cidos Graxos 1. As mesmas propriedades que fazem dos triacilgliceris excelentes combustveis e bons compostos de armazenamento representam problemas quando os mesmos atuam como combustveis . Explique . 2. O que so quilomcrons ? Qual a funo das protenas na sua estrutura? Por que os lipdios ingeridos no so transportados, a exemplo da mobilizao destes no organismo, por protenas plasmticas? 3. Explique detalhadamente o mecanismo de absoro de gorduras pelo organismo. Qual o papel dos sais biliares? 4. Como o mecanismo de mobilizao de triacilgliceris armazenados para funcionarem como combustvel ? O que acontece como o glicerol da molcula ? 5. Como se d o processo de entrada do acil-CoA-graxo na matriz mitocondrial? Qual a importncia da formao deste composto? 6. Por que este mecanismo de entrada tem que separar a CoA citoslica da mitocondrial ?

7. O que acontece com o remanescente do quilomcrom aps a absoro da maioria dos cidos graxos ? 8. Cite e explique os 4 passos do processo de -oxidao dos cidos graxos saturados ? 9. Quantos ATPs so formados pela remoo de cada unidade de dois carbonos do acil-CoA-graxo inicial ? Explique . 10. Diferencie a -oxidao que ocorre num cido graxo saturado com nmero par de carbono , num monoinsaturado , num poliinsaturado e em uma saturado com nmero mpar de carbonos . 11. Quais so as diferenas entre a -oxidao mitocondrial e a peroxossomal? 12. De que maneiras a disponibilidade de oxaloacetado determina a via metablica que ser tomada pelo acetil-CoA na mitocndria Heptica ? 13. Como a produo de corpos cetnicos pelo fgado permite a oxidao de continuada de cidos graxos , mesmo com uma oxidao mnima de acetilCoA ? 14. Qual o papel do resduo mpar da degradao de cidos graxos tambm mpares na produo de energia, uma vez que os primeiros no ersultam na formao de acetil-coa? 15. D o saldo final de ATPs produzidos na -OXIDAO, a partir do palmitol (cido graxo saturado) 16. Qual o papel do quilomcrox na absoro dos triacilgliceris? 17. Como os cidos graxos conseguem atravessar do espao intermembrana mitocondrial, para a matriz mitocndrial (descreva todo o mecanismo de transporte) 18. Como se d o mecanismo de oxidao de uma cido graxo insaturado com duas duplas ligaes? 19. Quais as diferenas entre a oxidao de cidos graxos pares e mpares? 20. Porque, mesmo com o acmulo de copos atmicos no organismo, a oxidao dos cidos graxos continuada? 21. O que so reaes aneplurticas a at alguns compostos envolvidos? 22. D o saldo final de ATPs produzidos na -OXIDAO, a partir do palmitol (cido graxo saturado) 23. Qual o papel do quilomcrox na absoro dos triacilgliceris?

24. Como os cidos graxos conseguem atravessar do espao intermembrana mitocondrial, para a matriz mitocndrial (descreva todo o mecanismo de transporte) 25. Como se d o mecanismo de oxidao de uma cido graxo insaturado com duas duplas ligaes? 26. Quais as diferenas entre a oxidao de cidos graxos pares e mpares? 27. Porque, mesmo com o acmulo de copos atmicos no organismo, a oxidao dos cidos graxos continuada? 28. O que so reaes aneplurticas a at alguns compostos envolvidos? 29. Indique quais as principais vantagens do organismo armazenar lipdeos em vez de glicose? 30. Explique como a converso do piruvato em Acetil-CoA regulada. 31. possvel se obter glicose a partir do acetil-COA originado pela beta-oxidao dos cidos graxos? Por qu? 32. Qual a principal funo intracelular da carnitina? No caso desta estar diminuda, o que ocorre? E quando aumentada? 33. Como os triacilgliceris so absorvidos e transportados? Oxidao de aminocidos e produo de uria : 1. Quais so as trs circunstncias metablicas em que os aminocidos podem sofrer degradao oxidativa ? 2. Qual o palpel do glutamato no catabolismo dos grupos amino dos aminocidos no fgado ? Qual a importncia da sua formao? 3. Como o pH do contedo estomacal aumentado quando este mesmo passa para o intestino delgado ? 4. Como o pncres se protege da autodigesto , uma vez que suas enzimas so proteolticas ? 5. Qual o efeito das reaes de transaminao ? 6. Explique a importncia da vitamina B6 nas transaminaes demonstrando como ocorre o processo . 7. Como os grupos amino so removidos do grupo glutamato para prepar-los para a excreo ? 8. O que transdesaminao ?

9. Qual o mecanismo presente no hepatcito utilizado para suprir a necessidade de combustvel do CAC ? 10. Descreva o mecanismo de transporte de amnia para o fgado por meio da glutamina . Por que o transporte feito pela glutamina e no pelo glutamato . 11. Descreva o mecanismo de transporte de amnia pelo ciclo alanina/glicose justificando sua grande "vantagem econmica ". 12. Duas situaes aparentemente antagnicas (dieta muito rica em protenas e desnutrio ) estimulam o ciclo da uria . Por que ? 13. Como feita a regulao da carbamil-fosfato-sintetase I ? 14. A perda de energia na converso amnia uria contrabalanceada de que maneira na vaca? 15. Como feito o tratamento de pacientes com problemas no ciclo da uria ? 16. Por que mesmo em excesso de lipdios o exerccio prolongado pode levar degradao de aminocidos? 17. O Ciclo da Uria pode ser considerado, ocmo um todo, uam via anaplertica? Justifique. 18. Como e qual a vantagem da regulao alostrica no Ciclo da Uria em relao regulao na sntese de enzimas necessrias. 19. Por que os aminocidos cuja degradao resulta na formao de acetil-coa so ditos cetognicos? Todos os demais so glicogncios? Por qu? 20. Como a amnia que est no msculo, chega at o fgado, para ser eliminada? 21. Descreva o mecanismo da bicicleta de Krebs. 22. Quais so os efeitos causados no crebro pelo excesso de amnia? 23. Em que pontos do ciclo da uria existe uma regulao e quais as substncias reguladoras? 24. Diga os mecanismos de eliminao dos seguintes aminocidos: glicina, metionina e leucina (eliminao de todos os fragmentos) 25. Quais so os destinos das cadeias carbnicas oriundas da oxidao de aminocidos? Degradao de purinas e pirimidinas 1. Em termos de produtos formados , como se diferenciam as purinas e pirimidinas ?

2. Qual a principal diferena biofsica entre os dois tipos de substncias secretadas e em que estas diferenas podem influir ? 3. Como se d a digesto/absoro desta molculas? 4. Qual a principal fonte dos nucleotdeios degradados? 5. Sabemos que animais uricotlicos so aqueles que excretam cido rico(principal forma pela qual o nitrognio do grupo amino liberado). A partir da degradao de que compostos o cido rico formado?Descreva como este formado. 6. Explique como os nucleotdeos so absorvidos pelo organismo. 7. Qual o produto final da degradao das purinas em mamferos? E nas aves?

Neoglicognese 1. Quais so os principais pontos de diferenciao entre a gliclise e neoglicognese ? Por que a necessidade de desvios nestes pontos? 2. Como outros compostos , provenientes do Ciclo dos cidos Ctricos podem associar-se sntese de glicose ? 3. Relacione a ativao da carboxiquinase citoslica ou mitocondrial com a alta concentrao de NADH dentro ou fora da matriz mitocondrial. Qual a importncia da alta concentrao de NADH no citosol? 4. Como os cidos graxos podem contribuir com a neoglicognese ? 5. Como ocorre a regulao coordenada da gliclise e da neoglicognese ? 6. Como ocorre a participao de frutose 2-6 bifosfato no fgado ? 7. O que so nucleotdeos de acares ? Qual a importncia da formao destes? 8. Como ocorre a sntese de glicognio ? Descreva a formao das ramificaes. 9. Como agem as quinases na regulao recproca da sntese e degradao do glicognio? 10. Por que/como o piruvato utilizado pode ser proveniente de gliclise? No constituiria isto um ciclo ftil? 11. Por que a ativao da neoglicognse no se d to logo o nvel total de glicose comece a baixar? Compare o comportamento das concentraes de glicose no fgado e sangue. Como o msculo se comportaria em cada situao (qual nvel acompanharia)?

12. Por que a carboxilao do piruvato a oxaloacetato, se este ser em seguida descarboxilado a PEP? 13. De que modo o lactato, produzido no msculo, pode ser reutilizado pelo fgado para a biossntese da glicose? 14. Qual a importncia metablica da neoglicognese a partir do lactato (ciclo de Cori) ? 15. Explique o processo de neoglicognese que acontece no jejum: 16. Qual o papel do glicerol, cido ltico e aminocidos na neoglico-gnese? Biossntese de Lipdeos 1. Quais as principais diferenas entre os cofatores transportadores de eltrons e dos grupos ativadores na degradao e sntese dos cidos graxos ? 2. Como ocorre o transporte do acetil-CoA intramitocondrial para o citosol ? Que fatores determinam a via a ser utilizada para tal? 3. Como se d a regulao da sntese dos cidos graxos ? 4. Cite exemplos e explique o que so cidos graxos essenciais . 5. Como pode ser formado o glicerol-3-fosfato ? 6. Qual a importncia do colesterol? 7. Descreva o processo de sntese de colesterol. 8. Identifique e caracterize os principais tipos de lipoprotenas . O que diferencia os quilomcrons das demais? 9. Qual a funo do LCAT ? 10. Qual a importncia da carboxilao do Acetil-Coa a ser utilizado? 11. Como se d a sntese de cidos graxos maiores ou mais insaturados que o palmitato? 12. Como se d a regulao coordenada da sntese de lipdios com a gliclise/neoglicognese (hormnios e intermedirios envolvidos e o papel de cada um)? 13. Por qu para a dosagem de lipdios totais, no sangue, o paciente deve estar em jejum? 14. Diferencie: HDL, LDL e VLDL: (diferenas e semelhanas) 15. Quais os precursores da biossntese de cidos graxos? E sua localizao celular?

16. Explique como o acetil-COA que sintetizado nas mitocndrias, transferido para o citoplasma da clula? 17. Descreva os principais destinos e origens do Acetil-COA: 18. Por qu quando aumentam os nveis de Acetil-COA h uma diminuio da gliclise anaerbica? 19. Biossntese de Aminocidos 1. Qual a importncia da transformao de glutamato para glutamina na sntese de aminocidos ? 2. De onde derivam-se os aminocidos sintetizados ? 3. Identifique os grupos derivados de cada intermedirio do ciclo do cido ctrico citado:

-cetoglutarato; 3-fosfoglicerato; oxaloacetato; piruvato.

1. Como se d a regulao do metabolismo do nitrognio ? 2. O que e onde entra o PRPP na sntese de aminocidos ? 3. Como -cetoglutarato e oo succinil-CoA participam na recuperao de purinas e pirimidinas ? 4. O que a gota , como causada e como pode ser tratada ? Explique cada mecanismo . 5. Com vrias vias em comum, como se d a regulao diferenciada da biossnetse dos diferentes aminocidos?

Biossntese de Nucleotdeos
1. Quais os aminocidos envolvidos na sntese das purinas? De onde provm os carbonos adicionais? 2. Qual a diferena bsica entre a construo do anel purnico e pirimidnico das bases nitrogenadas? 3. Nesse caso, como se d a regulao das vias de sntese em comum? (Diferencie da coordenao no caso dos aminocidos).

Integrao e regulao hormonal do metabolismo dos mamferos 1. Que caminnhos pode tomar a glicose-6-fosfato do fgado ? 2. Ainda em relao glicose-6-fosfato , correlacione os caminhos tomados com em preferncia , de acordo com a oferta ou falta de glicose no sangue . 3. Qual a principal diferena , em termos de local de utilizao entre o glicognio heptico e o muscular ? 4. Quanto aos aminocidos , quais os principais caminhos tomados por eles e o que determina quais sero os caminhos seguidos ? 5. Quanto aos cidos graxos , cite tambm seus principais destinos . 6. Por que o msculo no pode exportar glicose ? 7. Explique o mecanismo do ciclo de Cori . 8. Como ocorre o mecanismo metablico no sistema nervoso ? Quais compostos podem ser por eles utilizados como fonte de energia ? 9. Como agem os principais hormnios no controle do nvel de glicose no sangue ? 10. O que acontece metabolicamente , de forma geral , em um caso grave de desnutrio ? Explique sequencialmente os processos de manuteno do organismo que ocorrem neste caso e as consequncias finais que a mxima degradao de energia pode trazer. 11. Explique a reversibilidade, ou no, das reaes catalizadas por quinases 12. Qual o fluxo preferencial da G-6-P quando a clula requer muita ribose-5-P e no requer NADPH? E qual o fluxo da G-6-P quando a clula requer muito NADPH e no requer ribose-6-P? 13. Por qu os altos nveis de glucagon aumentam os corpos cetnicos? 14. Explique por que uma dieta hiperprotica pode levar a um aumento de cido rico no sangue: