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Aminocidos e Protenas

Funes Ligao peptdica Estrutura primria e secundria Estrutura terciria e quaternria

O primeiro aminocido
Em 1806 , foi descoberto na Frana o primeiro aminocido, extrado dos talos de aspargos, e foi chamado de asparagina.

Louis Nicolas Vauquelin

Glutamato foi isolado do glten, que uma protena da farinha de trigo em 1866.

Um aminocido
Carboxila

Amino

Carbono a

Cadeia lateral

Forma no inica desprotonada

Forma inica on dipolar Zwitterion

Propriedades fisicoqumicas das cadeias laterais de aminocidos


Polaridade/Carga/Hidrofobicidade L ou D aminocidos?

Aminocidos apolares
Somente os grupamentos R esto representados

Glicina Alanina (Gly, G) (Ala, A)

Metionina (Met, M)

Prolina (Pro, P)

Valina (Val, V)

Leucina (Leu, L)

Isoleucina (Ile, I)

CH3
+H N 3

Aumento de hidrofobicidade
COO-

C H

Aminocidos aromticos

Aumento de hidrofobicidade
+H N 3

C
H

COO-

Absorbncia 280 nm

Aminocidos polares

Aumento de hidrofilicidade

+H N 3

C
H

COO-

Oxidao formao de ponte dissulfeto

2e- + 2H+

Aminocidos carregados

+H N 3

C
H

COO-

9 aminocidos essenciais

Ruminantes: sintetizam todos os aas que necessitam devido simbiose com as bactrias ruminais

Modificaes pstraducionais

Diferena entre L- e Daminocidos

Ligao vs interao
Interaes fracas so responsveis por manter a estrutura protica enovelada

1-Interao de hidrognio
Interao que ocorre com o hidrognio quando ligado a elementos qumicos eletronegativos

Gelo mantido por interaes de hidrognio

Exemplos de pontes de hidrognio em molculas biolgicas

2- Interao inica

3- Interaes hidrofbicas
O aumento da concentrao de molculas apolares na gua produz estruturas organizadas com excluso da gua

4- Interao de Van der Waals


Interao de van der Waals entre duas molculas de CH4

Densidade de eltrons transitoriamente polarizada

Como formar uma protena?

Ligao peptdica

Planaridade da ligao peptdica

Proteus em grego: de
importncia primordial
1830

Sobre a composio de substncias animais

Gerardus Johannes Mulder

Jacob Berzelius

Funes
Estrutural Contrtil Transporte Armazenamento Hormonal Enzimtica Proteo
Colgeno

Cabelo

Clula muscular cardaca

Clula muscular esqueltica

Clula muscular lisa

Protenas: estrutura

Estrutura primria

Estrutura secundria: -hlice

Interao de hidrognio

Folheto antiparalelo

Folheto paralelo

Estrutura secundria: folheto e -hlice

Loops

Estrutura terciria

Hierarquia

Filme1

Interaes que mantm a estrutura terciria

Paradigma de Anfisen - 1960

Toda a informao para o enovelamento correto de uma protena est contida em sua estrutura primria

O paradoxo de Levinthal
Quanto tempo levaria para uma protena achar a sua conformao terciria? No aleatrio! Filme2

Efeito hidrofbico

Grupo hidrofbico

Interao de hidrognio

Molcula de gua

Desnaturao
Guanidina Ureia

NH II H2N NH2

O II

H2N NH2

Rompimento de interaes fracas (pontes de hidrognio, interaes inicas, Foras de Van de Waals e interaes hidrofbicas)

Dithiothreitol -DTT

Como uma protena se estrutura?

Enovelamento

Protena no enovelada
Desordenada (alta entropia) Poucas ligaes no-covalentes (baixa entalpia)

Protena enovelada
Ordenada (baixa entropia) Muitas ligaes no-covalentes

Interao de hidrognio com a gua

Interao de hidrognio

Interao inica

Interaes hidrofbicas

.... ....

Ponto isoeltrico
O ponto isoeltrico representa o valor de pH no qual a soma das cargas positivas e negativas de um aminocido igual a 0