UNIVERSIDADE FEDERAL DO RIO GRANDE DO SUL

INSTITUTO DE INFORMTICA
CURSO DE CINCIA DA COMPUTAO

GUSTAVO JANDT FELLER

Visualizao de Resultados de Simulao de Processos Diagenticos

Monografia apresentada como requisito parcial para

a obteno do grau de Bacharel em Cincia da
Computao.

Orientadora: Profa. Dra. Carla M. D. S. Freitas

Co-orientador: Marcos Antnio Klunk

Porto Alegre, Dezembro de 2014

UNIVERSIDADE FEDERAL DO RIO GRANDE DO SUL

Reitor: Prof. Carlos Alexandre Netto
Vice-Reitor: Prof. Rui Vicente Oppermann
Pr-Reitor de Graduao: Prof. Srgio Roberto Kieling Franco
Diretor do Instituto de Informtica: Prof. Lus da Cunha Lamb
Coordenador do Curso de Cincia da Computao: Prof. Raul Fernando Weber
Bibliotecria-Chefe do Instituto de Informtica: Beatriz Regina Bastos Haro

AGRADECIMENTOS

Primeiramente, agradeo a Deus por recompensar todo o meu esforo.

Agradeo minha famlia por toda a base tica, psicolgica e financeira necessrios
para que eu apresente este trabalho.
Agradeo aos meus amigos por todos os momentos que me ajudaram a esquecer as
aflies da vida acadmica.
Agradeo aos meus colegas de curso por me ajudarem sempre quando precisei.
Agradeo aos meus orientadores, Prof. Dr. Carla Maria Dal Sasso Freitas e Marcos
Antnio Klunk, por, mesmo sendo muito ocupados, sempre tentaram dispender um tempo
para me ajudar a realizar este trabalho. Alm deles, tambm quero agradecer a todos os
professores e colegas do projeto de Modelagem Diagentica por toda a ajuda.
Agradeo a UFRGS e ao Instituto de Informtica pela excelente infraestrutura e pelo
ensino de alta qualidade oferecidos.
E agradeo PETROBRAS e ao PRH PB-217 por toda a ajuda e investimento em meu
trabalho.

RESUMO
Diagnese definida como o conjunto de mudanas qumicas, fsicas e biolgicas pelas quais
passam os sedimentos de rochas, desde a sua deposio, durante e aps a sua litificao e
antes das condies de metamorfismo. Os processos diagenticos so controlados por fatores
como temperatura, presso, minerais, atividade dos ons dissolvidos na gua e de sistemas
orgnicos. Esses processos correspondem formao das rochas atuais e ocorreram ao longo
de milhes de anos.
A modelagem geoqumica de processos diagenticos baseia-se na utilizao das propriedades
qumicas dos minerais e de suas interaes com fluidos de diferentes composies e regimes
de fluxo para simular as reaes diagenticas e definir os parmetros fsico-qumicos e fsicos
(com pH, temperatura, salinidade das solues, porosidade) e os ambientes em que tais
reaes ocorreram. Tais simulaes geram conjuntos de dados relativamente complexos, mas
volumosos, j que correspondem modelagem dos processos de formao das rochas
reservatrio ao longo de milhes de anos. Os dados gerados permitem avaliar a composio
das rochas e seus parmetros geoqumicos, tais como porosidade, permeabilidade,
tortuosidade, etc.
O presente trabalho de graduao tem como objetivo desenvolver tcnicas de visualizao
desses resultados que permitam aos gelogos a avaliao da modelagem do ponto de vista de
fidelidade em relao a eventuais amostras geolgicas coletadas dos reservatrios atuais.
Utilizamos dados de um modelo hipottico resultantes de simulaes realizadas utilizando um
software desenvolvido no contexto de um projeto em andamento no Instituto de Informtica.
O visualizador parte integrante do software e foi desenvolvido com base em grficos 2D e
3D, com acompanhamento e interveno de especialistas em geologia e geoqumica.
Palavras-chave: Visualizao de dados. Diagnese. Modelagem geoqumica.

Visualization of Diagenetic Processes Simulation Results

ABSTRACT

Diagenesis is defined as the set of chemical, physical and biological changes through which
pass the rocks sediments since its deposition, during and after lithification and before the
metamorphic conditions. The diagenetic processes are controlled by factors such as
temperature, pressure, minerals, activity of the ions dissolved in water and organic systems.
These processes correspond to the formation of the current rocks and they occurred over
millions of years.
Geochemical modeling of diagenetic processes are based on the use of chemical properties of
minerals and their interactions with fluids of different compositions and flow rate to simulate
diagenetic reactions and define physical chemical and physical (such as pH, temperature,
salinity solutions, porosity) and the environments in which these reactions occur. Such
simulations generate sets of relatively complex data, but voluminous, as it corresponds to
modeling the processes of formation of reservoir rocks over millions of years. The data
generated to evaluate the composition of the rocks and their geochemical parameters such as
porosity, permeability, tortuosity, etc.
This work aims to develop visualization techniques of these results that allow geologists to
evaluate the modeling loyalty point of view in relation to possible geological samples
collected from present reservoirs. We use data from a hypothetical model resulting from
simulations using a software developed in the context of an ongoing project in the Instituto de
Informtica. The visualizer is part of the software and was developed based on 2D and 3D
graphics, with monitoring and intervention of geology and geochemistry experts.

Keywords: Data visualization. Diagenesis. Geochemical modeling.

LISTA DE FIGURAS
Figura 2.1 Diviso das etapas da diagnese em regies, adaptado de Mazzulo (2004) .................. 13
Figura 2.2 Fluxograma das etapas de um processo de simulao ................................................ 16
Figura 3.1 Grfico feito depois de rodar uma simulao exemplo no PhreeqcI ............................ 18
Figura 3.2 Alguns exemplos de grficos disponveis para o GWB .............................................. 19
Figura 3.3 Exemplos de grficos disponveis pelo PetraSim ....................................................... 20
Figura 4.1 Exemplo de um arquivo de cabealho ...................................................................... 23
Figura 4.2 esquerda, um exemplo de arquivo de dados de uma simulao em modo Batch e
direita um exemplo de arquivo de dados de uma simulao em 1D ................................................. 24
Figura 4.3 Tela da interface grfica, o retngulo vermelho representa a opo, em menu, para
selecionar os resultados da simulao no disco, e o retngulo azul representa a lista de simulaes,
dispostas em uma Combo Box ..................................................................................................... 25
Figura 4.4 Tela da interface grfica mostrando, esquerda a opo pensando em analisar uma
espcie, e direita pensando em analisar uma varivel ................................................................... 26
Figura 4.5 Tela da interface grfica mostrando a seleo dos eixos, onde no mnimo tem que ser
selecionados dois eixos ................................................................................................................ 28
Figura 4.6 Tela da interface grfica, utilizando um exemplo de simulao em 2D, mostrando a
necessidade do usurio selecionar a clula (podendo selecionar tambm o tempo, que no o caso
desse exemplo) que o usurio quer visualizar os resultados ............................................................ 29
Figura 4.7 Tela da interface grfica e da janela de opes avanadas, mostrando o que o usurio
pode editar para visualizar ........................................................................................................... 30
Figura 4.8 Demonstrao do grfico criado aps cumprir todos os passos ................................... 31
Figura 4.9 Grfico de linha da frao de volume de quartzo ....................................................... 32
Figura 4.10 Grfico de linha com dois eixos, comparando frao de volume de quartzo com seu
ndice de saturao ...................................................................................................................... 32
Figura 4.11 Grfico de pontos comparando a concentrao de Ca++ com a frao de volume da
Calcita ........................................................................................................................................ 33
Figura 4.12 Grfico de superfcie de uma simulao 1D visualizando a frao de volume de
Quartzo em relao ao tempo e a distncia .................................................................................... 34
Figura 4.13 Grfico 3D sendo animado .................................................................................... 35
Figura 4.14 Grfico de linha 2D sendo animado ....................................................................... 35
Figura 5.1 Grfico da temperatura da simulao batch, mostrando que a temperatura, durante a
simulao, permaneceu constante ................................................................................................. 37
Figura 5.2 Grfico da porosidade da simulao batch, mostrando que a porosidade diminuiu, mas
em uma escala muito pequena ...................................................................................................... 38
Figura 5.3 Grfico da taxa de mudana de porosidade da simulao batch .................................. 39
Figura 5.4 Grfico do ndice de saturao de todos os minerais presentes na simulao batch ...... 40
Figura 5.5 Grfico da frao de volume de todos os minerais presentes na simulao batch ......... 41
Figura 5.6 Grfico da frao de volume de alguns minerais presentes na simulao batch,
mostrando que h variao de frao de volume, mas em uma escala muito pequena ....................... 41
Figura 5.7 Grfico do ndice de saturao de todos os minerais presentes na simulao 1D em
relao ao tempo ......................................................................................................................... 42
Figura 5.8 Grfico do ndice de saturao de todos os minerais presentes na simulao 1D em
relao distncia ....................................................................................................................... 43
Figura 5.9 Grfico 3D do ndice de saturao do quartzo em relao ao tempo e distncia na
simulao 1D .............................................................................................................................. 44
Figura 5.10 Grfico 3D da velocidade de fluxo da gua em relao ao tempo e distncia na
simulao 1D .............................................................................................................................. 44

Figura 5.11 Grfico 3D da permeabilidade do domnio de simulao em relao ao tempo e

distncia, nesse caso, a permeabilidade est em zero ...................................................................... 45
Figura 5.12 Grfico da frao de volume da dolomita em relao distncia em um dos sentidos
em um certo tempo de simulao e em uma coluna de clulas ........................................................ 46
Figura 5.13 Grficos de frao de volume da dolomita em dois tempos de simulao em relao
distncia em um dos sentidos, mostrando o uso da animao .......................................................... 47
Figura 5.14 Grfico 3D da frao de volume de dolomita em relao distncia nos dois sentidos
em um tempo de simulao .......................................................................................................... 48
Figura 5.15 Grficos 3D da frao de volume de dolomita em relao distncia nos dois sentidos
em dois tempos de simulao, mostrando o uso da animao.......................................................... 49
Figura 5.16 Grficos 3D da densidade do volume total do domnio de simulao em relao
distncia nos dois sentidos em dois tempos de simulao, mostrando o uso da animao

.................................................................................................................................................. 50
Figura 5.17 Grficos 3D da permeabilidade do domnio de simulao em relao distncia nos
dois sentidos em dois tempos de simulao, mostrando o uso da animao ...................................... 51
Figura 5.18 Grficos 3D da velocidade de fluxo em cada sentido no domnio de simulao em
relao distncia nos dois sentidos em dois tempos de simulao, mostrando o uso da animao

.................................................................................................................................................. 52

LISTA DE ABREVIATURAS E SIGLAS

1D

Uma dimenso

2D

Duas dimenses

GWB

The Geochemist's Workbench

SUMRIO
1 INTRODUO ................................................................................................................... 10
1.1 Motivao .......................................................................................................................... 10
1.2 Objetivo do Trabalho ....................................................................................................... 11
1.3 Organizao do Texto ...................................................................................................... 11
2 FUNDAMENTAO ......................................................................................................... 12
2.1 Diagnese ........................................................................................................................... 12
2.2 Modelagem Geoqumica................................................................................................... 13
2.3 Modelos de Atividade ....................................................................................................... 14
2.4 ndice de Saturao .......................................................................................................... 14
2.5 Processo de Simulao ..................................................................................................... 15
3 ESTADO DA ARTE ............................................................................................................ 17
3.1 PhreeqcI ............................................................................................................................. 17
3.2 GWB .................................................................................................................................. 18
3.3 PetraSim ............................................................................................................................ 19
4 VISUALIZAO DE DADOS .......................................................................................... 21
4.1 Organizao e Descrio dos Dados ............................................................................... 21
4.2 Tcnicas de Visualizao .................................................................................................. 25
4.2.1 Interface para configurao das visualizaes................................................................. 25
4.2.2 Tcnicas de Visualizao ................................................................................................ 31
5 ESTUDOS DE CASOS........................................................................................................ 36
5.1 Simulao Batch ............................................................................................................... 37
5.2 Simulao 1D .................................................................................................................... 42
5.3 Simulao 2D .................................................................................................................... 46
6 DISCUSSO E CONCLUSES ........................................................................................ 54
REFERNCIAS ..................................................................................................................... 55
GLOSSRIO .......................................................................................................................... 57

10

1 INTRODUO
H vrias definies para a expresso visualizao de dados no contexto da cincia
da computao, mas a ideia comum a todas elas que a visualizao serve para o usurio
obter um insight sobre dados sendo observados atravs de tcnicas de computao grfica.
Outra ideia comum a da amplificao da cognio que permitiria um entendimento mais
rpido dos dados apresentados. Essas duas ideias esto presentes nas definies dadas por
Card et al. (1999), quando diz que visualizao o uso de representaes visuais interativas
de dados baseados em computador que amplificam a cognio, e em Telea (2008) para quem
o objetivo da visualizao adquirir insight por meio de grficos interativos em vrios
aspectos relacionados a alguns processos que estamos interessados, como simulao cientfica
ou alguns processos do mundo real.
Pela abrangncia que tem, a definio que ser utilizada no trabalho que visualizao
um estudo da transformao de dados para representaes visuais a fim de facilitar
processos cognitivos eficazes e eficientes na execuo de tarefas que envolvem dados (Chen
et al., 2013).

1.1 Motivao
Para qualificarmos a importncia do presente trabalho, precisamos primeiro da
definio de diagnese. Diagnese definida como o conjunto de mudanas qumicas, fsicas
e biolgicas pelas quais passam os sedimentos de rochas, desde a sua deposio, durante e
aps a sua litificao e antes das condies de metamorfismo. Os processos diagenticos so
controlados pelos seguintes fatores: temperatura, presso, minerais, atividade dos ons
dissolvidos na gua e de sistemas orgnicos (De Ros, 1996). O trabalho importante pois
prope-se a ajudar na compreenso (i) dos processos que ocorreram durante milhes de anos,
e (ii) dos fatores que podem influenciar a qualidade do petrleo na regio simulada.
Atualmente, no existem simuladores comerciais especficos para simular processos
diagenticos. So utilizados softwares desenvolvidos para outros propsitos, como o
PHREEQC1, o GWB2, e o TOUGHREACT3. Desses, s o GWB possui uma interface grfica
1

http://wwwbrr.cr.usgs.gov/projects/GWC_coupled/phreeqc/

http://www.gwb.com/

http://esd.lbl.gov/research/projects/tough/software/toughreact.html

11

nativa; os outros dois tm outros softwares que atuam como suas interfaces grficas e, em
geral, seus mdulos de visualizao so bem limitados para o contexto da diagnese. Na
literatura, existem alguns poucos trabalhos que relatam simulao de processos diagenticos,
como Bourdreau (1996) e Park e Ortoleva (2003). Porm, nenhum dos dois apresenta
qualquer visualizao dos resultados de suas simulaes.
1.2 Objetivo do Trabalho
O objetivo do trabalho desenvolver um conjunto tcnicas de visualizao, atravs da
construo fcil de grficos, para que os gelogos possam observar os resultados de suas
simulaes, as quais so executadas para testar hipteses sobre como ocorreu a formao dos
reservatrios de petrleo para determinar a qualidade do leo existente.

1.3 Organizao do Texto

Esse trabalho est estruturado da seguinte maneira. No captulo 2 ser apresentada a
fundamentao geolgica e geoqumica necessria ao trabalho. O captulo 3 abordar os
softwares comerciais que oferecem visualizao de resultados de simulaes geoqumicas. O
captulo 4 tratar da organizao dos dados empregados no trabalho e as tcnicas de
visualizao utilizadas. O captulo 5 trar um estudo de caso para verificar a utilidade das
tcnicas de visualizao utilizadas. E o captulo 6 so feitas as consideraes finais e o que
pode ser explorado no futuro sobre o assunto.

12

2 FUNDAMENTAO

Essa seo tratar de assuntos necessrios para a compreenso do trabalho. Na seo

2.1 ser tratada mais a fundo a diagnese. A seo 2.2, uma introduo modelagem
geoqumica. Na seo 2.3 apresentamos uma breve explicao sobre os modelos de atividade.
A seo 2.4 apresenta a definio de ndice de saturao. E a seo 2.5 introduz o processo de
simulao para explicar como so obtidos os dados de sada a serem visualizados.

2.1 Diagnese

Como definido na seo 1, diagnese o conjunto de mudanas qumicas, fsicas e

biolgicas pelas quais passam os sedimentos de rochas, desde a sua deposio, durante e aps
a sua litificao e antes das condies de metamorfismo. Essas mudanas so controladas
pelos seguintes fatores: temperatura, presso, minerais, atividade dos ons dissolvidos na gua
e de sistemas orgnicos. A passagem da fase de diagnese para metamorfismo difcil de se
definir, porque, de acordo com Sujkowski (1958), esse limite no preciso em termos de
presso e temperatura, e nem h uma fronteira ntida entre diagnese e intemperismo.
Diagnese compreende todos os processos que convertem o sedimento bruto em uma
rocha sedimentria (Worden e Burley, 2003). um processo ativo pelo qual o mineral
sedimentrio reage para recuperar equilbrio em um ambiente cuja presso, temperatura e
qumica esto mudando. Essas reaes podem aumentar, modificar ou destruir porosidade e
permeabilidade.
Uma classificao muito popular entre os gelogos para classificao das etapas da
diagnese dividir em trs etapas (Figura 2.1): Eodiagnese, Mesodiagnese e Telodiagnese.
A Eodiagnese o estgio da diagnese, em que seus processos deposicionais so
significativamente afetados por sua proximidade da surperfcie, assim, as reaes ocorrem em
temperaturas e profundidades baixas. Mesodiagnese o estgio que os sedimentos e rochas
so soterrados para tais profundidades que no mais dominado por processos diretamente
relativos a superfcie, sob condies de temperatura e profundidade mais elevadas. Por
ltimo, a Telodiagnese o estgio que as rochas so afetadas por processos associados com
soerguimentos e eroso (Ali et al., 2010).

13

Figura 2.1: Diviso das etapas da diagnese em regies, adaptado de Mazzulo (2004)

2.2 Modelagem Geoqumica

Um modelo geoqumico s realmente til como uma ferramenta de previso se

existe a possibilidade de validao dos resultados. Na realidade, este um objetivo que na
maioria das vezes se torna inatingvel pela complexidade dos sistemas naturais, dados de
campo insuficientes e as incertezas relativas forma de como o sistema ir mudar ao longo do
tempo. Um modelo deve ser tratado como uma simplificao da realidade e como uma
ferramenta capaz de estimar a probabilidade de que uma previso possa ser considerada
verdadeira ou falsa (Nordstrom, 1994).
Os modelos geoqumicos so baseados no princpio de conservao de massa. Estes
modelos podem ser classificados em duas categorias distintas: (1) modelos que no
consideram o processo de transporte referindo-se apenas ao modelo de reao geoqumica ou
simplesmente batch models. (2) modelos que consideram os processos de transporte e
reaes geoqumicas so chamados de modelos de transporte acoplado e de reaes. Estes
modelos geoqumicos so ferramentas que tem como objetivo caracterizar os processos

14

geoqumicos ocorrentes em um determinado ambiente. Esses modelos podem ser usados para
uma grande variedade de propsitos, incluindo determinao de reaes geoqumicas que
predominam em um determinado sistema, a quantificao da extenso em que essas reaes
ocorrem, alm de estimar as taxas de fluxo de gua subterrnea (Parkhurst e Plummer, 1993).
Muitos softwares, que utilizam as reaes geoqumicas, so baseados na conservao
da concentrao total dos componentes combinado com o equilbrio qumico. Equilbrio
qumico pode ser calculado pela energia livre de Gibbs ou pela equao da ao das massas
que envolvem equilbrio constante. O mtodo que utiliza a energia livre de Gibbs
considerado mais robusto, matematicamente, do que o mtodo que utiliza as constantes de
equilbrio, embora esta (constante de equilbrio) seja mais utilizada pelos geoqumicos.

2.3 Modelos de Atividade

A atividade, tambm conhecida como concentrao efetiva ou real, corrige o efeito das
interaes entre ons de uma soluo. A frmula da atividade representada pela equao:
ax = [X] x
onde ax representa a atividade do on X, [X] representa a concentrao do on X e x
representa o coeficiente de atividade do on X.
O coeficiente de atividade uma funo da quantidade de material dissolvido em
soluo. Para o clculo do precisamos da fora inica da soluo.
Os compostos inicos, quando dissolvidos na gua, dissociam-se em ons. Por isso a
fora inica funo da concentrao de todos os ons presentes naquela soluo.

2.4 ndice de Saturao

A determinao dos ndices de saturao nos revela quais espcies minerais esto
presentes no meio geolgico.
Utiliza-se a seguinte frmula para calcular o ndice de saturao:

IS

Q
Kps

15

onde IS o ndice de saturao, Q representa o produto das atividades de todos os ons

do soluto e Kps representa o produto de solubilidade do soluto (tabelado). Assim, temos as
seguintes relaes:

log IS = 0, a soluo est saturada;

log IS > 0, a soluo est supersaturada;

log IS < 0, a soluo est subsaturada.

ndices de saturao zero indicam que o mineral atingiu o estado estacionrio com a

gua presente na formao geolgica. Um ndice de saturao negativo implica que os

minerais esto subsaturados na fase aquosa. Nestas condies, os minerais esto dissolvidos.
Para um ndice de saturao positivo, onde os minerais esto supersaturados, temos a
precipitao de fase mineral.

2.5 Processo de Simulao

Os processos de simulao geoqumica so divididos em trs grandes etapas: entrada

de dados, execuo da simulao e sada de dados (Figura 2.2).
A entrada dos dados pode ser via script (mais comum) ou via interface grfica,
consistindo na coleta de informaes referentes ao meio geolgico de interesse, por meio de
anlises qumicas realizadas em laboratrios e por dados estratigrficos da bacia sedimentar.
Dados como:
a) concentrao de solutos presentes na gua;
b) composio mineral da rocha;
c) reaes cinticas e termodinmicas;
d) histria de soterramento (profundidade da formao rochosa, tempo estimado que
ocorreram as transformaes litolgicas, presso e temperatura do meio reacional);
e) domnio espacial (classificado quanto s suas dimenses: Batch como sendo uma
nica clula, 1D - horizontal ou vertical, 2D - horizontal ou vertical e 3D).

Aps definir as configuraes de simulao, mtodos numricos so utilizados para

resolver as equaes geoqumicas decorrentes da interao do fluido com a rocha no ambiente
geolgico definido nas condies inicias. medida que o processo de simulao vai

16

evoluindo, os dados so atualizados a cada passo de simulao. Esse processo ocorre at o

sistema atingir o estado estacionrio ou chegar no tempo mximo definido pelo usurio.
A sada de dados o ltimo estgio de cada passo de simulao. Os dados so
armazenados em um novo arquivo, geralmente texto, permitindo visualizar o comportamento
da simulao. Cada simulador possui um padro diferente de arquivo de entrada e de sada.

Figura 2.2: Fluxograma das etapas de um processo de simulao

17

3 ESTADO DA ARTE

Mesmo sendo um problema importante para gelogos, no temos nenhum software ou

relato na literatura que trate especificamente de simulao diagentica e/ou da visualizao
desses resultados. Ento, so usados softwares de simulao geoqumica, feitos para outros
propsitos, mas que podem ser usados para algumas anlises. No caso da visualizao de
resultados, podemos destacar trs softwares que tratam dos resultados de tais simulaes:
PhreeqcI, GWB e PetraSim.

3.1 PhreeqcI

O PhreeqcI um programa de interface grfica baseado em janelas para o programa

geoqumico PHREEQC (Parkhust e Appelo, 1999). Ele usado interativamente para
especificar todas as modelagens possveis do PHREEQC, como especiao, reaes em modo
batch, transporte reativo unidimensional e modelagem inversa.
Depois de realizada a modelagem, o usurio executa a simulao no PHREEQC, que
produz resultados de sada, e o PhreeqcI mostra esses resultados. A visualizao dos dados de
resultado da simulao feita atravs de grficos de linha de duas dimenses (Figura 3.1),
com possibilidade de zooming e translao de grfico.

18

Figura 3.1: Grfico obtido no PhreeqcI depois de uma simulao exemplo no PHREEQC.

3.2 GWB

GWB um simulador desenvolvido pelo departamento de Geologia da Universidade

de Illinois at Urbana-Champaign, em 1978, e comercializado pela Aqueous Solutions LLC.
Ele pode ser usado para alguns problemas comuns encontrados em modelagem geoqumica,
como especiao em solues aquosas, modelos de interao gua-rocha e mistura de fluidos
em simulaes em modo batch (Bethke, 2008), alm de outros problemas qumicos,
biolgicos

geolgicos,

como

simular

poluio

dos

aquferos,

problemas

de

geomicrobiologia, entre vrios outros.

Possui uma interface grfica para entrada de dados, na qual o usurio preenche os
dados de sua simulao, executa a simulao e, durante a simulao, so criados arquivos de
sadas, que podem ser abertos com um outro software do GWB, o Xtplot. Neste, o usurio
pode visualizar os resultados de suas simulaes atravs de vrias tcnicas de visualizao

19

2D, como grficos de linha, de pizza, radiais, mosaicos, color maps, de contorno, vetorial
entre outros mais especficos para geologia (Figura 3.2).

Figura 3.2: Alguns exemplos de grficos disponveis para o GWB

3.3 PetraSim

O software PetraSim, desenvolvido pela Thunderhead Engineering Consultants, uma

interface grfica para a famlia de simuladores TOUGH2. A famlia TOUGH2, desenvolvida
pelo Lawrence Berkeley National Laboratory, so simuladores numricos para fluxos noisotrmicos de mltiplos componentes, fluidos multifsicos em meios porosos e fraturados em
uma, duas, ou trs dimenses, e foram projetados para engenharia geotrmica de
reservatrios, eliminao de resduos nucleares, avaliao ambiental e remediao, e
saturao e insaturao de zonas hidrolgicas (Pruess et al., 1999).
O PetraSim possui uma interface para criao de modelos 3D de poos, gerao de
malhas e edio de parmetros de entrada, como, por exemplo, composio mineral e

20

composio de gua. As tcnicas de visualizao utilizadas so grficos de linha, visualizao

de iso-superfcie 3D, grficos vetoriais e de contorno (Figura 3.3).

Figura 3.3: Exemplos de grficos disponveis no PetraSim

21

4 VISUALIZAO DE DADOS

Como mostrado no captulo 3, os softwares utilizados para visualizao atualmente

no foram desenvolvidos especificamente para os processos de diagnese, mas sim para
problemas mais gerais de geoqumica.
Esse captulo est dividido em trs partes, abordando organizao e descrio dos
dados, seleo de variveis e tcnicas de visualizao. Os dados utilizados nas descries so
originados de um simulador prprio que, no presente momento, somente gera resultados para
simulaes em domnios Batch (ou uma clula, sem fluxo) e domnio 1D (somente horizontal,
com a possibilidade de fluxo). Os dados de simulao de domnio 2D foram obtidos atravs
de uma verso no-estvel, mas sero utilizados como teste para determinar se as tcnicas de
visualizao implementadas no trabalho esto adequadas s necessidades dos usurios
especialistas.

4.1 Organizao e Descrio dos Dados

Os dados a serem visualizados vm de arquivos de sada gerados pelo simulador, entre

eles, so destacados dois tipos de arquivos, o arquivo de cabealho (Figura 4.1) e o arquivo de
dados (Figura 4.2).
O arquivo de cabealho pode ser dividido em trs partes. A primeira parte contm
dados de sistema, como localizao do arquivo de entrada utilizado na simulao e diretrio
de sada. A segunda parte contm as variveis e a ordem em que elas aparecem no arquivos de
dados. A terceira parte contm informaes sobre cada passo de simulao, como informao
de quantas clulas existem em cada eixo, o nmero de variveis, o tempo da simulao em
milhes de anos e o horrio que foi gravado.
O arquivo de dados (Figura 4.2) um arquivo que escrito quando ocorre um dos
seguintes eventos: quando se passa um certo intervalo de tempo ou quando passa um certo
nmero de iteraes de simulao (ambos definidos pelo usurio na entrada dos dados para o
simulador). A cada escrita, so colocadas informaes de 3 tipos. Primeiro, colocado o
formato do arquivo, o caminho do arquivo, o tempo de simulao do passo e o tempo final de
simulao (Primeira linha da Figura 4.2). Em segundo lugar, so as informaes sobre cada
passo de simulao colocado no arquivo de dados, como informao de quantas clulas
existem em cada eixo, o nmero de variveis, o tempo da simulao em milhes de anos e o

22

horrio de gravao (Segunda linha da Figura 4.2). Em terceiro lugar, vem os dados
especficos do passo da simulao, onde os trs primeiros valores de cada linha referenciam a
posio da clula e o resto representa os valores das variveis referenciadas pelo arquivo de
cabealho na ordem l colocada.
Analisando tudo que oferecido pelos arquivos, podemos definir que tipo esse
conjunto de dados representa. Para isso, iremos usar a classificao de Munzner (2014).
O tipo de dado que encontramos o de campo, j que os dados esto associados com
as clulas. As variveis associadas s clulas, as quais esto relacionadas com a distncia ou
com o tempo, correspondem a dados contnuos.
Cada varivel a ser visualizada, que se encontra descrita no arquivo de cabealho, em
um dos eixos consiste em uma tripla, que contm a varivel (temperatura, presso, frao de
volume, entre vrias outras), espcie (Quartzo, Calcita, Ca++, etc.) e tipo de espcie. O Tipo
da Espcie pode ser quatro valores: Sedimento, que consiste em variveis fsicas em relao
ao sedimento (Temperatura, presso, fluxo, porosidade, entre outras); Minerais, que consiste
em variveis especficas dos minerais, como frao de volume, saturao, e outras; Solutos,
que compreende as variveis dos solutos presentes na gua do domnio (concentrao,
coeficiente de atividade e difusividade); e Elementos, que so as variveis dos elementos
qumicos da tabela peridica presentes na simulao que representam a distribuio dos
elementos dentro de uma clula (Poro, matriz (ou mineral) e clula).

23

Figura 4.1: Exemplo de um arquivo de cabealho

24

Figura 4.2: esquerda, um exemplo de arquivo de dados de uma simulao em modo Batch e direita um exemplo de arquivo de dados de
uma simulao em 1D

25

4.2 Tcnicas de Visualizao

Considerando que as visualizaes sero geradas para apresentar os dados

armazenados nos arquivos de sada, e que contm os valores de variveis atualizadas durante
a simulao, a cada passo, foi desenvolvida inicialmente uma interface para a seleo das
variveis a serem visualizadas. Esta seo, portanto, descreve inicialmente, a interface e,
depois, as visualizaes que podem ser geradas.
4.2.1 Interface para configurao das visualizaes
O processo para gerao das visualizaes pode ser descrito em passos bem definidos,
representados atravs das figuras 4.3 a 4.7.

1.

Selecionar o arquivo correspondente simulao cujos resultados deseja-se visualizar.

Figura 4.3: O retngulo vermelho representa a opo, em menu, para selecionar os resultados
da simulao em arquivo. O retngulo azul representa a lista de simulaes disponveis,
acessveis atravs de uma Combo Box

2.

Selecionar as variveis que podem ser visualizadas. Cada objeto a ser visualizado

pertencente aos grupos especificados na seo anterior. Temos, por exemplo, o Quartzo, que
um mineral, descrito (na simulao) por variveis como frao de volume, saturao, etc. Os

26

outros minerais tambm possuem essas variveis. Ento, o usurio pode optar por duas ordens
de escolha: optando pelo mineral cujo comportamento durante a simulao ele quer visualizar,
ou optando por visualizar o comportamento de um conjunto de minerais em relao a alguma
varivel.

Figura 4.4: Tela da interface grfica mostrando, esquerda, a opo para analisar uma espcie
mineral, e direita a opo por analisar uma varivel em diferentes minerais.

3. Configurar os eixos do grfico a ser gerado. Existem 4 eixos que o usurio pode
selecionar: X, Y, Z e Tempo. Os trs primeiros representam eixos no espao: o usurio deve
selecionar no mnimo dois desses trs. O eixo de Tempo um eixo que utilizado para

27

animao. O tipo de grfico a ser visualizado depender de como o usurio seleciona os eixos.
Nota-se, tambm, a necessidade de, quando selecionado Tempo ou Distncia em relao a
alguma direo, a lista de seleo referente ao que foi selecionado ser escondida (como
mostrado na Figura 4.5).

28

Figura 4.5: Tela da interface grfica mostrando a seleo de dois eixos para o grfico.

29

4. Selecionar clulas ou tempo. necessrio que o usurio especifique a quais clulas

esto associadas as variveis que ele deseja analisar. So quatro listas a serem configuradas:
X, Y, Z e Tempo. X, Y e Z representam as dimenses do domnio que est sendo simulado e
o Tempo representa os passos de simulao registrados nos arquivos de sada. Para a gerao
dos grficos, feita uma combinao dessas quatro selees.

Figura 4.6: Utilizando um exemplo de simulao em 2D. O usurio seleciona a clula no

espao cujos dados ao longo do tempo ele quer visualizar: mineralization rate do mineral
calcita ao longo do tempo, na clula selecionada (6,4).

30

5. Configurar escalas. Por padro, a escala tratada automaticamente de acordo com os

valores que sero visualizados, mas o usurio pode definir uma escala para obter vises
diferentes dos dados, assim como pode tambm utilizar escala logartmica.

Figura 4.7: Tela da interface grfica e da janela de opes avanadas.

6. Visualizar grfico. Depois de todos os passos acima efetuados, o usurio ter seu
grfico gerado na rea de desenho.

31

Figura 4.8: Visualizao do grfico resultante da configurao.

4.2.2 Tcnicas de Visualizao

Para a implementao das tcnicas, foram utilizadas duas bibliotecas: QCustomPlot e

QwtPlot3D. A QCustomPlot uma biblioteca de visualizao de grficos 2D em Qt para C++
com cdigo aberto, cuja ltima verso estvel de abril de 2014. As tcnicas de visualizao
que podem ser implementadas utilizando-a so: grficos de linhas, grficos de disperso,
mapas de cores 2D, grficos de barra (tanto simples, como empilhados) e grficos do tipo box
plots. As formas de interao abrangidas pela biblioteca so: panning, zooming, seleo de
curva e seleo de eixo. A QwtPlot3D uma biblioteca de visualizao de grficos 3D em Qt
e OpenGL para C++ com cdigo aberto, cuja ltima verso de junho de 2007. As tcnicas
de visualizao que podem ser implementadas utilizando-a so: grficos de superfcie, de
volume, de barras 3D e vetorial. As formas de interao abrangidas pela biblioteca so:
panning, zooming e rotao.
Analisando as caractersticas dos dados, o que temos no estado da arte e as inmeras
interaes com os usurios, chegamos aos seguintes tipos de grficos:
1. Grficos de linha simples. Os grficos de linha so usados quando um dos eixos
representa uma varivel contnua registrada ao longo do tempo ou em distncia.

32

Figura 4.9: Grfico de linha da frao de volume de quartzo ao longo da simulao

2. Grficos de linha com dois eixos Y. So grficos de linha que servem para realizar
comparao entre duas variveis em relao ao tempo ou distncia em algum sentido;

Figura 4.10: Grfico de linha com dois eixos verticais, comparando frao de volume de
quartzo com seu ndice de saturao ao longo do tempo de simulao.

33

3. Grficos de disperso. So usados para comparao entre variveis para vislumbrar,

inicialmente, algum tipo de relao entre elas.

Figura 4.11: Grfico de pontos comparando a concentrao de Ca++ com a frao de volume
da Calcita

4. Grficos de superfcie. So grficos em 3D com o mesmo intuito dos grficos de linha:

mostrar a variao de uma varivel em relao a tempo e espao, ou a relao entre trs
variveis.

34

Figura 4.12: Grfico de superfcie de uma simulao 1D visualizando a frao de volume de

Quartzo em relao ao tempo e a distncia

Muitas vezes, a visualizao 3D pode no ser suficiente para representar o que o

usurio quer visualizar. Por exemplo, uma visualizao de um domnio 2D, na qual o usurio
pode querer observar o comportamento de uma varivel em todo o domnio durante o tempo
(ou seja, teramos quatro dimenses). Ou o usurio pode desejar fazer uma anlise da variao
de valores de um corte de um domnio de uma simulao em 2D. Ento, para darmos suporte
a esses casos, foi usada a tcnica de animao de grficos em relao ao tempo. Dois
momentos de duas animaes desse tipo podem ser vistos nas figuras 4.13 e 4.14.

35

Figura 4.13: Grfico 3D sendo animado

Figura 4.14: Grfico de linha 2D sendo animado

36

5 ESTUDOS DE CASOS

Apesar das visualizaes terem sido desenvolvidas junto aos usurios, para comprovar
sua adequao, foram feitas entrevistas de modo que fosse obtida uma lista de variveis
relevantes em cada tipo de simulao (Batch, 1D e 2D). Atravs dessas entrevistas, chegou-se
seguinte lista:

Variveis necessrias em todos os casos:

o

Temperatura;

Porosidade;

Taxa de mudana de porosidade;

Saturao de minerais;

Frao de volume de minerais.

Para 1D:
o

Velocidade de fluxo de gua;

Permeabilidade.

Para 2D:
o

Permeabilidade;

Densidade do volume total;

Velocidade de fluxo em cada sentido.

Assim, a titulo de estudos de casos, foram executadas simulaes de cada caso, cujos
resultados so mostrado a seguir.
Para a simulao em modo Batch, foi utilizada a composio de gua conforme os
estudos de Nordstrom (1994) e composio litolgica segundo os trabalhos realizados por
Baccar e Fritz (1993) e Morad (1990).
Os dados utilizados no modo 1D foram adaptados das mesmas fontes do Batch. E os
dados no modo 2D so de teste, no baseados na literatura.

37

5.1 Simulao Batch

A utilizao da temperatura permite identificar em qual fase diagentica as reaes

esto ocorrendo em um ambiente geolgico. Conforme estudos realizados por Morad (1990),
a Figura 5.1 nos revela um ambiente eodiagentico com temperatura de aproximadamente
25C. Nestas condies, as reaes ocorrem com menor intensidade devido a baixa energia
cintica envolvida. A no variao de temperatura, durante o tempo de simulao, caracteriza
a baixa reatividade do sistema.

Figura 5.1: Grfico da temperatura da simulao batch, mostrando que a temperatura, durante
a simulao, permaneceu constante

A Figura 5.2 nos mostra uma pequena variao na porosidade devido baixa
reatividade do sistema geolgico. Com o passar dos anos, a formao rochosa submetida a
transformaes em sua estrutura devido ao fluido que interagiu na rocha. Alguns minerais,

38

que antes estavam dissolvidos na fase aquosa, esto precipitando na forma de cimento
preenchendo os espaos vazios, antes ocupados pela gua.

Figura 5.2: Grfico da porosidade da simulao batch, mostrando que a porosidade diminuiu,
mas em uma escala muito pequena

Na Figura 5.3 observamos a taxa de mudana de porosidade causada pela combinao

de todos os minerais envolvidos nas reaes diagenticas gerando modificaes na rocha
causando porosidade.

39

Figura 5.3: Grfico da taxa de mudana de porosidade da simulao batch

J a figura 5.4 nos mostra que, no inicio das simulaes (em torno de 4 anos), os
minerais esto em desequilbrio com a gua existente no interior da rocha. medida que o
tempo vai evoluindo estes minerais alcanam um estado estacionrio e uma estabilidade das
fases minerais. possvel observar este comportamento quanto plotamos o ndice de
Saturao dos minerais versus tempo de simulao. Esta informao de suma importncia,
pois sabemos se o mineral est dissolvido ou precipitado na formao geolgica.

40

Figura 5.4: Grfico do ndice de saturao de todos os minerais presentes na simulao batch

Conforme revelado pelo ndice de Saturao, os minerais podem aumentar (precipitar)

ou diminuir (dissolver) o seu volume. Conforme a Figura 5.5 cada mineral possui uma
quantidade volumtrica referente litologia presente na rocha. J a frao de volume,
frequentemente, tem valores numricos pequenos (10-7) (Figura 5.6) devido baixa
reatividade e baixa energia cintica, decorrentes das baixas temperaturas de simulao.

41

Figura 5.5: Grfico da frao de volume de todos os minerais presentes na simulao batch

Figura 5.6: Grfico da frao de volume de alguns minerais presentes na simulao batch,
mostrando que h variao de frao de volume, mas em uma escala muito pequena

42

5.2 Simulao 1D

As simulaes em 1D permitem o usurio prever a evoluo de uma gua dentro de

uma rocha reservatrio. Entende-se rocha reservatrio pela acumulao de gua, leo ou gs
retido nos espaos vazios (poros) de uma formao rochosa. Assim como nas simulaes em
Batch, foi utilizado o ndice de Saturao. Na Figura 5.7 observamos que minerais esto
precipitados (ndice de saturao positivo) e outros esto dissolvidos (ndice de saturao
negativo).

Figura 5.7: Grfico do ndice de saturao de todos os minerais presentes na simulao 1D em

relao ao tempo

Outro ponto importantes das simulaes em 1D a possibilidade de plotarmos ndice

de Saturao versus distncia (Figura 5.8). Isso nos revela o carter reacional do meio
geolgico na prpria rocha. Conforme observado na Figura 5.8, quando a gua atingir uma
distncia de aproximadamente 50m dentro da formao rochosa, ocorre uma mudana nas
fases minerais, reveladas pelo ndice de Saturao. Isto evidencia uma mudana de litologia,

43

pois este novo sistema reacional, a partir dos 50m, mais reativo conduzindo a novas reaes
e uma nova fase mineral existente.

Figura 5.8: Grfico do ndice de saturao de todos os minerais presentes na simulao 1D em

relao distncia

Outra forma de visualizao dos dados plotar o ndice de Saturao de minerais

versus tempo e o espao. Na Figura 5.9 est representado o ndice de Saturao do quartzo
durante 100 anos de interao gua-rocha em um meio geolgico de 100 metros de
comprimento. Observamos uma diminuio do ndice de Saturao (provvel dissoluo do
mineral) devido s reaes diagenticas no meio geolgico.

44

Figura 5.9: Grfico 3D do ndice de saturao do quartzo em relao ao tempo e distncia na

simulao 1D

Figura 5.10: Grfico 3D da velocidade de fluxo da gua em relao ao tempo e distncia na

simulao 1D

45

A Figura 5.10 nos mostra a mudana de fluxo quando a gua encontra uma nova
litologia. Este aumento de fluxo est relacionado com o tamanho dos gros que possibilita
uma menor resistncia na passagem da gua. Esta mudana abrupta de fluxo caracterstica
de gros maiores, quando comparados com a primeira litologia, onde a gua flua com uma
taxa de aproximadamente 4cm/ano.

Figura 5.11: Grfico 3D da permeabilidade do domnio de simulao em relao ao tempo e

distncia, nesse caso, a permeabilidade est em zero

Uma vez determinada a taxa de porosidade de uma rocha reservatrio, possvel

calcularmos a permeabilidade do meio. Isso se refere interconectividade dos poros da rocha.
Na Figura 5.11 observamos que a permeabilidade da rocha zero, ou seja, no h conexo de
um poro para outro. No existem canais interligando os poros e uma consequncia direta
deste comportamento a baixa qualidade da rocha reservatrio, pois no possuindo
conectividade entre os poros fica praticamente invivel a utilizao desta formao rochosa
para prospeco de petrleo, por exemplo.

46

5.3 Simulao 2D

A dolomitizao um fenmeno natural atravs do qual o calcrio, ou carbonato de

clcio (CaCO3), transformado em CaMg(CO3)2 ou dolomita.
A gua do mar, que naturalmente rica em magnsio (Mg), mistura-se com o
carbonato de clcio, reduzindo a composio de clcio em at 50%. Para se tornar dolomita, o
calcrio tem que passar por este processo vrias vezes ou durante um perodo longo de tempo.
A responsvel pelo processo de dolomitizao a circulao de gua carregada de sais
magnesianos. Quando chega o ponto em que o calcrio est muito enriquecido em carbonato
de magnsio, ele passa a constituir um calcrio dolomtico, ou simplesmente dolomita. As
Figuras 5.12 a 5.16 representam este aumento na frao de volume de dolomita.

Figura 5.12: Grfico da frao de volume da dolomita em relao distncia em um dos

sentidos em um determinado tempo de simulao e em uma coluna de clulas.

47

Figura 5.13: Grficos de frao de volume da dolomita em dois tempos de simulao em relao distncia em um dos sentidos, mostrando o
uso da animao

48

Figura 5.14: Grfico 3D da frao de volume de dolomita em relao distncia nos dois
sentidos em um tempo de simulao

Como o volume dos cristais de dolomita 13% menor do que o da calcita, o processo
de dolomitizao acompanhado por um aumento da porosidade e permeabilidade das rochas
(Figura 5.17).
A dolomitizao tanto pode ocorrer em ambiente de sedimentao raso em condies
de clima rido como devido diagnese em ambiente de alta profundidade de soterramento.

49

Figura 5.15: Grficos 3D da frao de volume de dolomita em relao distncia nos dois sentidos em dois tempos de simulao, mostrando o
uso da animao

50

Figura 5.16: Grficos 3D da densidade do volume total do domnio de simulao em relao distncia nos dois sentidos em dois tempos de
simulao, mostrando o uso da animao

51

Figura 5.17: Grficos 3D da permeabilidade do domnio de simulao em relao distncia nos dois sentidos em dois tempos de simulao,
mostrando o uso da animao.

52

Figura 5.18: Grficos 3D da velocidade de fluxo em cada sentido no domnio de simulao em relao distncia nos dois sentidos em dois
tempos de simulao, mostrando o uso da animao.

53

Conforme a Figura 5.18 observamos uma velocidade de fluxo constante durante a

dolomitizao medida que o tempo de simulao alcana aproximadamente 8 milhes de
anos. Uma vez que o processo de dolomitizao se inicia, as reaes diagenticas alcanam o
equilbrio qumico e em consequncia o sistema torna-se estvel.

54

6 DISCUSSO E CONCLUSES

Para a visualizao de dados escalares de simulaes Batch, 1D e 2D, as tcnicas de

visualizao implementadas mostram-se suficientes para a compreenso dos dados de
simulaes de processos diagenticos. So mais flexveis que as tcnicas implementadas por
outros softwares, assim cumprindo com a definio de Chen et al. (2013).
Entretanto, o trabalho ainda pode ser ampliado em alguns aspectos.
Um aspecto que, como pode ser notado na Figura 5.18, podemos visualizar dados
escalares da velocidade de fluxo da gua, mas no podemos visualizar a direo desse fluxo
com as tcnicas implementadas. Para isso, necessrio implementar tcnicas de visualizao
vetorial para que o usurio possa analisar como o fluxo de gua muda de acordo com o tempo.
Um outro aspecto a falta de reproduo do domnio criado pelo usurio na etapa de
entrada de dados. Essa visualizao da disposio do domnio pode trazer uma compreenso
de alguns comportamentos da simulao, porque se ele vertical, o comportamento de cada
clula pode ser diferente, devido a mudanas de presso e temperatura, que so fatores que
controlam o processo da diagnese.
Uma dificuldade encontrada no trabalho foi encontrar bibliotecas de visualizao de
dados que suprissem todas as necessidades do trabalho. As bibliotecas encontradas possuem
limitaes, como, por exemplo, a QwtPlot3D: a existncia de uma seleo para fazer um corte
transversal no grfico facilitaria a visualizao de partes do grfico 3D.
Outra limitao de biblioteca encontrada foi na QCustomPlot, que no possui
implementao de seleo de uma regio de interesse no grfico para analisar mudanas
bruscas, como no grfico da Figura 5.7. Apesar dessas dificuldades, a interface de seleo de
variveis apresenta opes para suprir essas deficincias.

55

REFERNCIAS

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57

GLOSSRIO
DEPOSIO Processo sedimentar que consiste na acumulao de matria mineral
ou orgnica, transportada pela gua, vento ou gelo.
LITIFICAO Conjunto de processos que convertem sedimentos em rochas
consolidadas devido, principalmente, pela presso exercida pelos sedimentos acumulados nos
diversos tipos de eroso.
METAMORFISMO Conjunto de processos geolgicos que levam formao de
rochas metamrficas. Esses processos envolvem transformaes fsicas e qumicas sofridas
pelas rochas, quando submetidas ao calor e presso do interior da Terra.