Slide 02 - Introdução A Bioinformática - Biologia Molecular - Visão Geral

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Universidade Federal Rural da Amazônia

Campus Paragominas

INTRODUÇÃO A BIOINFORMÁTICA
Prof. Marcus Braga

Bacharelado em Sistemas de informação


BIOLOGIA MOLECULAR
VISÃO GERAL

Introdução a Bioinformática
BIOLOGIA MOLECULAR: VISÃO GERAL
A Biologia Molecular ...

• É um ramo da Biologia que explora o estudo da vida em escalas moleculares.

• Estuda as interações, a função e a estrutura dos genes em nível molecular.

• Está intimamente envolvida com a bioquímica, pois as interações genéticas


ocorrem em níveis de átomos e moléculas.

• Visa o estudo dos processos de replicação, transcrição, tradução, suas regulações e


seus possíveis erros e características.

Introdução a Bioinformática
BIOLOGIA MOLECULAR: VISÃO GERAL
Contexto Histórico. O Início – Descoberta da molécula de DNA

Introdução a Bioinformática
BIOLOGIA MOLECULAR: VISÃO GERAL
Contexto Histórico. Cientistas conheciam a composição do DNA mas não sua função

Introdução a Bioinformática
BIOLOGIA MOLECULAR: VISÃO GERAL
Contexto Histórico. A molécula do DNA tem a estrutura de uma dupla

Introdução a Bioinformática
BIOLOGIA MOLECULAR: VISÃO GERAL
Por que aprender Biologia Molecular ?

• É a base comum de todos os seres vivos do planeta.

http://magazine.ufl.edu/2011/02/web-of-life/ Introdução a Bioinformática


BIOLOGIA MOLECULAR: VISÃO GERAL
O Mundo das Moléculas

• Qual é a escala ?

• Quais são as forças dominantes ?

• Qual é a consistência dos objetos ?

• Como se dá o movimento dos objetos ?

• Quantos desses objetos existem ?

Introdução a Bioinformática
BIOLOGIA MOLECULAR: VISÃO GERAL
O Mundo das Moléculas. Noções da escala do mundo molecular

Uma montanha é ~1000 vezes maior do que uma pessoa

Vista lateral do maciço do Pico do Marins--Foto: Jurandir Lima/ Trilhas &Trilhas


Introdução a Bioinformática
BIOLOGIA MOLECULAR: VISÃO GERAL
O Mundo das Moléculas. Noções da escala do mundo molecular

A Terra é ~1000 vezes maior do que uma montanha

Introdução a Bioinformática
BIOLOGIA MOLECULAR: VISÃO GERAL
O Mundo das Moléculas. Noções da escala do mundo molecular

Portanto, uma pessoa é ~1 milhão de vezes menor que a Terra

Introdução a Bioinformática
BIOLOGIA MOLECULAR: VISÃO GERAL
O Mundo das Moléculas. Noções da escala do mundo molecular

Células e Moléculas:

• Uma célula é ~1000 vezes menor do que uma pessoa.

• Uma molécula é ~1000 vezes menor do que uma célula.

• Portanto …

Nós estamos para a Terra assim como as moléculas estão para nós !

Introdução a Bioinformática
BIOLOGIA MOLECULAR: VISÃO GERAL
O Mundo das Moléculas. Forças dominantes

• As forças que operam numa escala molecular são diferentes das que operam na
nossa escala.

• Nossa escala: Gravidade, atrito, etc.

• Escala molecular: Atração e repulsão entre átomos.

Introdução a Bioinformática
BIOLOGIA MOLECULAR: VISÃO GERAL
O Mundo das Moléculas. Consistência

• Podemos tratar as moléculas como se fossem objetos sólidos, tais como blocos e
esferas sólidos.

• Propriedade importante: Moléculas podem se encaixar umas nas outras como


chaves em fechaduras.

Introdução a Bioinformática
BIOLOGIA MOLECULAR: VISÃO GERAL
O Mundo das Moléculas. Movimento molecular

• É predominantemente aleatório (sujeito às forças já mencionadas).

• Não há “controle central” e muito menos “vontade própria”.

• As moléculas dentro de uma célula estão continuamente colidindo umas nas


outras.

Introdução a Bioinformática
BIOLOGIA MOLECULAR: VISÃO GERAL
O Mundo das Moléculas. Movimento molecular

• Apesar de aleatório, o movimento é rápido (frações de segundo).

Introdução a Bioinformática
BIOLOGIA MOLECULAR: VISÃO GERAL
O Mundo das Moléculas. Quantas moléculas existem ?

• O número é variável conforme a molécula e conforme a situação.

• Em geral é impossível saber exatamente quantas.

• Esse número pode estar na escala de milhões, bilhões ou trilhões (dependendo da


situação).

Introdução a Bioinformática
BIOLOGIA MOLECULAR: VISÃO GERAL
O Mundo das Moléculas. Quantas moléculas existem ?

Uma estimativa recente:

• Numa célula de levedura, num dado instante, existem aproximadamente 42


milhões de proteínas. (Ho, Baryshnikova, Brown. Cell Systems, 2018).

Introdução a Bioinformática
BIOLOGIA MOLECULAR: VISÃO GERAL
Dogma Central da Biologia Molecular

Como a informação do DNA é transferida para a célula ou organismo?

Introdução a Bioinformática
BIOLOGIA MOLECULAR: VISÃO GERAL
Dogma Central da Biologia Molecular

Como a informação do DNA é transferida para a célula ou organismo?

Replicação do DNA: Processo de síntese de novas cadeias de DNA (DNA polimerase).

Transcrição (DNA ➙ RNA): Processo de síntese de RNA da célula (RNA polimerase).

Tradução: Processo de síntese de proteínas da célula (ocorre nos ribossomos).

Introdução a Bioinformática
BIOLOGIA MOLECULAR: VISÃO GERAL
Dogma Central da Biologia Molecular

Introdução a Bioinformática
BIOLOGIA MOLECULAR: VISÃO GERAL
Dogma Central da Biologia Molecular

Introdução a Bioinformática
BIOLOGIA MOLECULAR: VISÃO GERAL
Os Genes.

• Genes são segmentos funcionais de DNA: sequência de nucleotídeos que codifica


uma proteína.

• Sequência de DNA que inclui todas as sequências de nucleotídeos que levam à


síntese de um produto (mRNA para a síntese de proteína ou outros tipos de RNAs).
Inclui as regiões codificantes e as reguladoras.

• Genes estão orientados na direção 5’para 3’ (fita codificadora), cuja sequência


estará representada no mRNA. A outra fita de DNA, complementar à codificadora,
é a fita molde para a síntese do RNA.

• O RNA portanto tem a mesma orientação e sequência da fita de DNA codificadora.


Introdução a Bioinformática
BIOLOGIA MOLECULAR: VISÃO GERAL
Transcrição do DNA – Síntese do RNA.

Introdução a Bioinformática
BIOLOGIA MOLECULAR: VISÃO GERAL
Transcrição do DNA – Síntese do RNA.

Introdução a Bioinformática
BIOLOGIA MOLECULAR: VISÃO GERAL
DNA. É a substância da qual são feitos os cromossomos

Introdução a Bioinformática
BIOLOGIA MOLECULAR: VISÃO GERAL
DNA. É a substância da qual são feitos os cromossomos

Introdução a Bioinformática
BIOLOGIA MOLECULAR: VISÃO GERAL
DNA. É a substância da qual são feitos os cromossomos

Introdução a Bioinformática
BIOLOGIA MOLECULAR: VISÃO GERAL
O DNA. O que é ?

• É a molécula onde está a informação genética.


- Contém a “essência da hereditariedade”.

• Ácido desoxirribonucleico.

• Onde se encontra? Dentro do núcleo de cada célula.

• Estrutura de fita dupla. Em espiral (ou hélice).

• É uma macromolécula.

Introdução a Bioinformática
BIOLOGIA MOLECULAR: VISÃO GERAL
O DNA. Estrutura

• O DNA tem uma “espinha dorsal”


que é um açúcar (desoxiribose) + um
grupo fostato (PO4). Esse conjunto
permanece sempre o mesmo !

• O que varia ao longo da cadeia são


as bases ligadas às moléculas de açúcar.

Introdução a Bioinformática
BIOLOGIA MOLECULAR: VISÃO GERAL
O DNA. Estrutura

• O DNA tem uma “espinha dorsal”


que é um açúcar (desoxiribose) + um
grupo fostato (PO4). Esse conjunto
permanece sempre o mesmo !

• O que varia ao longo da cadeia são


as bases ligadas às moléculas de açúcar.

Introdução a Bioinformática
BIOLOGIA MOLECULAR: VISÃO GERAL
O DNA. Estrutura

Introdução a Bioinformática
BIOLOGIA MOLECULAR: VISÃO GERAL
O DNA. Estrutura

Introdução a Bioinformática
BIOLOGIA MOLECULAR: VISÃO GERAL
O DNA. Estrutura

Introdução a Bioinformática
BIOLOGIA MOLECULAR: VISÃO GERAL
O DNA. Estrutura

Introdução a Bioinformática
BIOLOGIA MOLECULAR: VISÃO GERAL
O DNA. Estrutura

Introdução a Bioinformática
BIOLOGIA MOLECULAR: VISÃO GERAL
O RNA. O que é ?

• Ácido ribonucleico.

• Desempenha variadas funções na célula

- Constituinte do ribossomo.
- Moléculas de mRNA (mensageiro).
- Moléculas de tRNA(transportador).
- Pequenos RNAs com funções regulatórias.

Introdução a Bioinformática
BIOLOGIA MOLECULAR: VISÃO GERAL
O RNA. Estrutura

• Fita simples.
• Ribose.
• A, U, C e G.
• Obtido pela Transcrição do DNA.

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BIOLOGIA MOLECULAR: VISÃO GERAL
O RNA. Estrutura

• Fita simples.
• Ribose.
• A, U, C e G.
• Obtido pela Transcrição do DNA.

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BIOLOGIA MOLECULAR: VISÃO GERAL
O RNA. Estrutura

Introdução a Bioinformática
BIOLOGIA MOLECULAR: VISÃO GERAL Exemplo de um tRNA

O RNA. Estrutura

Introdução a Bioinformática
BIOLOGIA MOLECULAR: VISÃO GERAL Exemplo de um tRNA

O RNA. Estrutura

https://www.123rf.com/photo_12988606_structure-of-a-transfer-rna-trna-iletrna-molecule.html Introdução a Bioinformática


BIOLOGIA MOLECULAR: VISÃO GERAL
As Bases ou (ribo) Nucleotídeos.

• Adenina (Purina).
• Guanina (Purina).
• Citosina (Pirimidina).
• Timina (Pirimidina).
• Uracila, no RNA (Pirimidina).

Introdução a Bioinformática
BIOLOGIA MOLECULAR: VISÃO GERAL
As Bases ou (ribo)Nucleotídeos.

• Adenina (Purina).
• Guanina (Purina).
• Citosina (Pirimidina).
• Timina (Pirimidina).
• Uracila, no RNA (Pirimidina).

Introdução a Bioinformática
BIOLOGIA MOLECULAR: VISÃO GERAL
DNA e RNA

Introdução a Bioinformática
BIOLOGIA MOLECULAR: VISÃO GERAL
DNA. Sequência de bases

• A sequência de bases do
DNA pode ser representada
como uma cadeia de caracteres.

Introdução a Bioinformática
BIOLOGIA MOLECULAR: VISÃO GERAL
DNA. Sequência de bases

• Para representar o DNA como uma cadeia de caracteres, precisamos de uma


convenção.

• Por onde começa a cadeia ?

• Em qual das fitas ?

Introdução a Bioinformática
BIOLOGIA MOLECULAR: VISÃO GERAL
DNA. Sequência de bases

Convenção

• O Conteúdo de uma das fitas do DNA deve ser representado como uma cadeia de
letras para ser lida da esquerda para a direita (5´→ 3´).

• Qual das fitas ?

• Não importa! (em geral).

• Dada uma das fitas, é possível saber a outra. Basta complementar e inverter.

Introdução a Bioinformática
BIOLOGIA MOLECULAR: VISÃO GERAL
DNA. Sequência de bases

Complemento reverso

Dada a sequência: ATGGTCTC

Qual é a outra fita ?

1. Gera a complementar: TACCAGAG

2. Inverte a complementar: GAGACCAT

Introdução a Bioinformática
BIOLOGIA MOLECULAR: VISÃO GERAL
DNA. Sequência de bases

Complemento reverso

Dada a sequência: ATGGTCTC

Qual é a outra fita ?

1. Gera a complementar: TACCAGAG

2. Inverte a complementar: GAGACCAT

Introdução a Bioinformática
ATIVIDADE ASSÍNCRONA
A atividade assíncrona dessa semana será:

1. Assistir ao vídeo “Aula de Biologia Molecular”

https://youtu.be/cmS8XMwzDXk

2. Participar do Fórum no SIGAA com seus comentários e observações sobre a aula


síncrona e/ou o vídeo.

Introdução a Bioinformática

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