Slide 02 - Introdução A Bioinformática - Biologia Molecular - Visão Geral

Universidade Federal Rural da Amazônia
Campus Paragominas
INTRODUÇÃO A BIOINFORMÁTICA
Prof. Marcus Braga
Bacharelado em Sistemas de informação

BIOLOGIA MOLECULAR
VISÃO GERAL
Introdução a Bioinformática
BIOLOGIA MOLECULAR: VISÃO GERAL
A Biologia Molecular ...
• É um ramo da Biologia que explora o estudo da vida em escalas moleculares.
• Estuda as interações, a função e a estrutura dos genes em nível molecular.
• Está intimamente envolvida com a bioquímica, pois as interações genéticas

ocorrem em níveis de átomos e moléculas.
• Visa o estudo dos processos de replicação, transcrição, tradução, suas regulações e

seus possíveis erros e características.
Contexto Histórico. O Início – Descoberta da molécula de DNA
Contexto Histórico. Cientistas conheciam a composição do DNA mas não sua função
Contexto Histórico. A molécula do DNA tem a estrutura de uma dupla
Por que aprender Biologia Molecular ?
• É a base comum de todos os seres vivos do planeta.
http://magazine.ufl.edu/2011/02/web-of-life/ Introdução a Bioinformática

O Mundo das Moléculas
• Qual é a escala ?
• Quais são as forças dominantes ?
• Qual é a consistência dos objetos ?
• Como se dá o movimento dos objetos ?
• Quantos desses objetos existem ?
O Mundo das Moléculas. Noções da escala do mundo molecular
Uma montanha é ~1000 vezes maior do que uma pessoa
Vista lateral do maciço do Pico do Marins--Foto: Jurandir Lima/ Trilhas &Trilhas

A Terra é ~1000 vezes maior do que uma montanha
Portanto, uma pessoa é ~1 milhão de vezes menor que a Terra
Células e Moléculas:
• Uma célula é ~1000 vezes menor do que uma pessoa.
• Uma molécula é ~1000 vezes menor do que uma célula.
• Portanto …
Nós estamos para a Terra assim como as moléculas estão para nós !
O Mundo das Moléculas. Forças dominantes
• As forças que operam numa escala molecular são diferentes das que operam na
nossa escala.
• Nossa escala: Gravidade, atrito, etc.
• Escala molecular: Atração e repulsão entre átomos.
O Mundo das Moléculas. Consistência
• Podemos tratar as moléculas como se fossem objetos sólidos, tais como blocos e
esferas sólidos.
• Propriedade importante: Moléculas podem se encaixar umas nas outras como

chaves em fechaduras.
O Mundo das Moléculas. Movimento molecular
• É predominantemente aleatório (sujeito às forças já mencionadas).
• Não há “controle central” e muito menos “vontade própria”.
• As moléculas dentro de uma célula estão continuamente colidindo umas nas

outras.
O Mundo das Moléculas. Movimento molecular
• Apesar de aleatório, o movimento é rápido (frações de segundo).
O Mundo das Moléculas. Quantas moléculas existem ?
• O número é variável conforme a molécula e conforme a situação.
• Em geral é impossível saber exatamente quantas.
• Esse número pode estar na escala de milhões, bilhões ou trilhões (dependendo da

situação).
O Mundo das Moléculas. Quantas moléculas existem ?
Uma estimativa recente:
• Numa célula de levedura, num dado instante, existem aproximadamente 42

milhões de proteínas. (Ho, Baryshnikova, Brown. Cell Systems, 2018).
Dogma Central da Biologia Molecular
Como a informação do DNA é transferida para a célula ou organismo?
Como a informação do DNA é transferida para a célula ou organismo?
Replicação do DNA: Processo de síntese de novas cadeias de DNA (DNA polimerase).
Transcrição (DNA ➙ RNA): Processo de síntese de RNA da célula (RNA polimerase).
Tradução: Processo de síntese de proteínas da célula (ocorre nos ribossomos).
Os Genes.
• Genes são segmentos funcionais de DNA: sequência de nucleotídeos que codifica

uma proteína.
• Sequência de DNA que inclui todas as sequências de nucleotídeos que levam à

síntese de um produto (mRNA para a síntese de proteína ou outros tipos de RNAs).
Inclui as regiões codificantes e as reguladoras.
• Genes estão orientados na direção 5’para 3’ (fita codificadora), cuja sequência

estará representada no mRNA. A outra fita de DNA, complementar à codificadora,
é a fita molde para a síntese do RNA.
• O RNA portanto tem a mesma orientação e sequência da fita de DNA codificadora.

Transcrição do DNA – Síntese do RNA.
Transcrição do DNA – Síntese do RNA.
DNA. É a substância da qual são feitos os cromossomos
O DNA. O que é ?
• É a molécula onde está a informação genética.

- Contém a “essência da hereditariedade”.
• Ácido desoxirribonucleico.
• Onde se encontra? Dentro do núcleo de cada célula.
• Estrutura de fita dupla. Em espiral (ou hélice).
• É uma macromolécula.
O DNA. Estrutura
• O DNA tem uma “espinha dorsal”

que é um açúcar (desoxiribose) + um
grupo fostato (PO4). Esse conjunto
permanece sempre o mesmo !
• O que varia ao longo da cadeia são

as bases ligadas às moléculas de açúcar.
O DNA. Estrutura
• O DNA tem uma “espinha dorsal”

que é um açúcar (desoxiribose) + um
grupo fostato (PO4). Esse conjunto
permanece sempre o mesmo !
• O que varia ao longo da cadeia são

as bases ligadas às moléculas de açúcar.
O DNA. Estrutura
O DNA. Estrutura
O DNA. Estrutura
O DNA. Estrutura
O DNA. Estrutura
O RNA. O que é ?
• Ácido ribonucleico.
• Desempenha variadas funções na célula
- Constituinte do ribossomo.
- Moléculas de mRNA (mensageiro).
- Moléculas de tRNA(transportador).
- Pequenos RNAs com funções regulatórias.
O RNA. Estrutura
• Fita simples.
• Ribose.
• A, U, C e G.
• Obtido pela Transcrição do DNA.
O RNA. Estrutura
• Fita simples.
• Ribose.
• A, U, C e G.
• Obtido pela Transcrição do DNA.
O RNA. Estrutura
BIOLOGIA MOLECULAR: VISÃO GERAL Exemplo de um tRNA
O RNA. Estrutura
BIOLOGIA MOLECULAR: VISÃO GERAL Exemplo de um tRNA
O RNA. Estrutura
https://www.123rf.com/photo_12988606_structure-of-a-transfer-rna-trna-iletrna-molecule.html Introdução a Bioinformática

As Bases ou (ribo) Nucleotídeos.
• Adenina (Purina).
• Guanina (Purina).
• Citosina (Pirimidina).
• Timina (Pirimidina).
• Uracila, no RNA (Pirimidina).
As Bases ou (ribo)Nucleotídeos.
• Adenina (Purina).
• Guanina (Purina).
• Citosina (Pirimidina).
• Timina (Pirimidina).
• Uracila, no RNA (Pirimidina).
DNA e RNA
DNA. Sequência de bases
• A sequência de bases do
DNA pode ser representada
como uma cadeia de caracteres.
• Para representar o DNA como uma cadeia de caracteres, precisamos de uma

convenção.
• Por onde começa a cadeia ?
• Em qual das fitas ?
Convenção
• O Conteúdo de uma das fitas do DNA deve ser representado como uma cadeia de
letras para ser lida da esquerda para a direita (5´→ 3´).
• Qual das fitas ?
• Não importa! (em geral).
• Dada uma das fitas, é possível saber a outra. Basta complementar e inverter.
Complemento reverso
Dada a sequência: ATGGTCTC
Qual é a outra fita ?
1. Gera a complementar: TACCAGAG
2. Inverte a complementar: GAGACCAT
Complemento reverso
Dada a sequência: ATGGTCTC
Qual é a outra fita ?
1. Gera a complementar: TACCAGAG
2. Inverte a complementar: GAGACCAT
ATIVIDADE ASSÍNCRONA
A atividade assíncrona dessa semana será:
1. Assistir ao vídeo “Aula de Biologia Molecular”
https://youtu.be/cmS8XMwzDXk
2. Participar do Fórum no SIGAA com seus comentários e observações sobre a aula

síncrona e/ou o vídeo.

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• É um ramo da Biologia que explora o estudo da vida em escalas moleculares.

• Estuda as interações, a função e a estrutura dos genes em nível molecular.

• Está intimamente envolvida com a bioquímica, pois as interações genéticas

• Visa o estudo dos processos de replicação, transcrição, tradução, suas regulações e

• É a base comum de todos os seres vivos do planeta.

http://magazine.ufl.edu/2011/02/web-of-life/ Introdução a Bioinformática

• Quais são as forças dominantes ?

• Qual é a consistência dos objetos ?

• Como se dá o movimento dos objetos ?

• Quantos desses objetos existem ?

Uma montanha é ~1000 vezes maior do que uma pessoa

Vista lateral do maciço do Pico do Marins--Foto: Jurandir Lima/ Trilhas &Trilhas

A Terra é ~1000 vezes maior do que uma montanha

Portanto, uma pessoa é ~1 milhão de vezes menor que a Terra

• Uma célula é ~1000 vezes menor do que uma pessoa.

• Uma molécula é ~1000 vezes menor do que uma célula.

• Nossa escala: Gravidade, atrito, etc.

• Escala molecular: Atração e repulsão entre átomos.

• Propriedade importante: Moléculas podem se encaixar umas nas outras como

• É predominantemente aleatório (sujeito às forças já mencionadas).

• Não há “controle central” e muito menos “vontade própria”.

• As moléculas dentro de uma célula estão continuamente colidindo umas nas

• Apesar de aleatório, o movimento é rápido (frações de segundo).

• O número é variável conforme a molécula e conforme a situação.

• Em geral é impossível saber exatamente quantas.

• Esse número pode estar na escala de milhões, bilhões ou trilhões (dependendo da

Uma estimativa recente:

• Numa célula de levedura, num dado instante, existem aproximadamente 42

Como a informação do DNA é transferida para a célula ou organismo?

Como a informação do DNA é transferida para a célula ou organismo?

Replicação do DNA: Processo de síntese de novas cadeias de DNA (DNA polimerase).

Transcrição (DNA ➙ RNA): Processo de síntese de RNA da célula (RNA polimerase).

Tradução: Processo de síntese de proteínas da célula (ocorre nos ribossomos).

• Genes são segmentos funcionais de DNA: sequência de nucleotídeos que codifica

• Sequência de DNA que inclui todas as sequências de nucleotídeos que levam à

• Genes estão orientados na direção 5’para 3’ (fita codificadora), cuja sequência

• O RNA portanto tem a mesma orientação e sequência da fita de DNA codificadora.

• É a molécula onde está a informação genética.

• Onde se encontra? Dentro do núcleo de cada célula.

• Estrutura de fita dupla. Em espiral (ou hélice).

• O DNA tem uma “espinha dorsal”

• O que varia ao longo da cadeia são

• O DNA tem uma “espinha dorsal”

• O que varia ao longo da cadeia são

• Desempenha variadas funções na célula

https://www.123rf.com/photo_12988606_structure-of-a-transfer-rna-trna-iletrna-molecule.html Introdução a Bioinformática

• Para representar o DNA como uma cadeia de caracteres, precisamos de uma

• Por onde começa a cadeia ?

• Em qual das fitas ?

• Qual das fitas ?

• Não importa! (em geral).

Dada a sequência: ATGGTCTC

Qual é a outra fita ?

1. Gera a complementar: TACCAGAG

2. Inverte a complementar: GAGACCAT

Dada a sequência: ATGGTCTC