GUIDOS e FRAGSTATS

Para analisar uma imagem pelos programas Guidos e Fragstats é necessário

que esta seja transformada em geotiff no ArcGis.
Vc deve ter no Penn drive (é mais fácil trabalhar fora do PC) todos os arquivos.
shp (mais .dbf .sbn .sbx .shx) da área a ser analisada.

1. Preparar a imagem no Arc Gis:

Abrir o ArcMap
Deixar o default A new empty map
Carregar os arquivos
Vc precisa estar com as duas janelas laterais abertas – o ArcTool box e a Table
of Contents – procure por elas em Window na barra se elas estiverem
desativadas.
Add (o ícone da cruzinha) - procure no penn drive e carregue, um de cada vez,
os shapes de interesse – p.ex. limites_parque.shp e florestapevv.shp) – se
aparecer uma janelinha falando que os dados não tem referência espacial, não
importa, dê OK.

Para unir os dois shapes:

Clique em Index na janela Arc Tool Box e selecione union (analysis) Clicando
duas vezes sobre ele.
Abre a janela Union para carregar os shapes:
Na linha Input features selecione na setinha da barra de rolagem o arquivo
limites_parque.shp – demora um pouco mas ele aparece dentro do quadrado
Features.
Selecione agora o arquivo florestapevv.shp.
Quando este também aparecer em features, cheque qual é o nome e o drive de
saída Output feature Class e dê OK
Abre uma janela que mostra a progressão de execução e que fecha quando a
união estiver pronta.

Para criar as tabelas:

Desabilite no display todos os layers, deixe só limites_parque_union.shp
Clique com o botão direito do mouse sobre o nome deste arquivo e clique Open
Attribute Table
Abre a tabela de atributos que o ArcView criou. Para que eu crie mais uma
coluna, clico em Options
E depois Add Field
Na janela que se abre digite `guidos`, verifique se está em short integer, e dê
OK.
A tabela possui agora uma coluna ‘guidos’, toda ocupada por 0. Clique com o
botão direito do mouse sobre a palavra ‘guidos”
Clique em Field calculator
Procure e selecione guidos
Digite 9999 e dê OK
Na tabela, a coluna classe agora só tem 9999
Clique em Options
Depois em Switched selection – a tabela fica toda azul
Volte à tabela e clique novamente com o botão direito do mouse sobre a
palavra ‘guidos”
Novamente Field calculator
Retire o 9999, digite 1 e dê OK.
A tabela continua azul, mas a coluna guidos agora só tem valor 1
Clique em Options
Depois Clear selection – a tabela fica branca
Selecione a primeira linha clicando com o mouse na extremidade esquerda
Selecione também a coluna guidos
Com ambos selecionados (a primeira linha da tabela e a coluna inteira de
guidos), clica com o botão direito na palavra ‘guidos’
Clique Field calculator
Retira o 1, digite 0 e dê OK.
Tudo permanece igual, apenas a primeira linha, aquela que tem valores
negativos, fica com 0 no guidos também (o resto da coluna tem de permanecer
com 1)
Clique em Options
Depois Clear selection
Feche a tabela.
No display, clica com o botão direito do mouse no limites_parque_union.shp
Selecione Properties
Abre a janela Layer Properties
Selecione Categories e depois Unique values
No value Field digita ou seleciona ‘guidos”
Clica Add all values – tem de aparecer dois quadradinhos coloridos, um
valendo 0 e outro valendo 1
Clique Aplicar e OK (a janela fecha e o mapa fica aparecendo em duas cores).

Para transferir o shape em imagem:

Clique em Index na janela Arc Tool Box e selecione Feature to raster
(conversion). Clique duas vezes sobre ele.
Abre a janela Feature to raster
Na linha Input features selecione o arquivo union
Na linha Field selecione ‘guidos’
Em Output raster – digite o nome do arquivo de saída com a extensão .tif ex.
pevvrose.tif
Em Output cell size – digite 5
Dê Ok (abre uma janela que mostra a progressão da conversão)
Aqui você já tem o arquivo para trabalhar no Guidos (veja mais a frente como).

2. Para continuar a tratar a imagem para trabalhar com Fragstats deixe

apenas este novo arquivo pevvrose.tif selecionado no display.
Para transferir a imagem para texto (asc):
Clique em Index na janela Arc Tool Box e selecione Raster to AscII
(conversion). Clique duas vezes sobre ele.
Abre a janela Input raster
Selecione o arquivo pevvrose.tif
Em Output AscII digite pevvrose.asc (o default dele é .txt)
Dê Ok (abre uma janela que mostra a progressão da conversão).

Para criar as tabelas a serem usadas no Fragstats:

Vá no penn drive e abra pevvrose.asc no bloco de notas (demora um pouco)
Recorte as 6 primeiras linhas (ncols, nrows, xll corner, yll corner, cellsize e
nodata) e cole num arquivo de notas novo chamado pevv_cabecalho.txt (isto
servirá apenas para você saber quantas colunas e quantas linhas tem; pode
apenas anotar num papel a parte e optar por não salvar em bloco de notas). ex.
no PEVV são ncols=6670, nrows=4019.
No arquivo que ficou (só tem -9999), delete a primeira linha, que ficou em
branco, e salve como pevv_semcabecalho.txt (demora um pouco) e feche.
Crie um arquivo de notas novo, com a seguinte redação (sem deixar espaços):
1,floresta,true,false
9999,matriz,false,false
Salve como legendapevv.txt e feche.

3. Para rodar o Fragstats:

Para carregar arquivos no Fragstats:
Abra o Fragstats
Para carregar os parâmetros, clique no ícone do homenzinho correndo com um
p vermelho
Abre a tela Run parameters
Clicar AscII file name e no Penn drive localizar o arquivo
pevv_semcabecalho.txt
Clicar Output file name – abre uma janela para o penn drive mas você deve
digitar nela o nome do arquivo de saída ex. pevvfragrose (assim mesmo, sem
extensão). Clicar em abrir.
Em Cellsize digite 5
Number of rows (y) – digita o número que vc anotou do bloco de notas ex.
4019*
Number of cols (x) – digita o número que vc anotou do bloco de notas ex. 6670*
*Como no PEVV estes números estavam invertidos (o foreground era 0
e o background era 255) tem de inverter colunas e linhas no Fragstats
também, senão ele não roda.
Clicar em Class propertie file - no Penn drive localizar o legendapevv.txt
(provavelmente ele estará selecionando apenas arquivos *fdc, mude para
buscar por arquivos .txt). Clicar em abrir.
Output statistics – vc pode selecionar métricas de fragmentos (Patch metrics),
e/ou classe (Class metrics) e/ou de paisagem (Landscape metrics). Sugiro
começar apenas com Patch para fazer um teste.
Ok
A janela do Fragstats mostra ‘Getting user options’ - quando terminar ele dirá
‘checking finished’
Clicar no ícone P para selecionar que métricas de fragmento executar (ou no C,
se vc quis métricas de classe; ou no L, se foi métricas de paisagem)
Para Area/Perimeter, Shape e Fract não é necessário nenhuma transformação
adicional.
Para core, pode-se usar um o edge depth fixo (p. ex, 10 metros) ou criar no
bloco de notas um arquivo de class properties para a imagem em análise,
como no ex.
1,agri,true,false
2,água,true,false
3,ref,true,false
4,urb,true,false
5,campo,true,false
6,mata,true,false
7,fundo,false,true

Depois, criar um arquivo de profundidade de borda

FTABLE,1,2,3,4,5,6
1,0,30,30,30,30,60
2,30,0,30,30,30,30
3,30,30,0,30,30,10
4,30,30,30,0,30,90
5,30,30,30,30,0,5
6,60,30,10,90,5,0

Para isolation/proximity, depois de clicar quais índices quer, selecionar o

search radius (p. ex, 100 metros).
Para similaridade, deve-se criar no bloco de notas um arquivo para carregar no
Sim.wgt.File, como no ex:
FTABLE,1,2,3,4,5,6
1,1,0,0,0,0.5,0
2,0,1,0,0,0,0
3,0,0,1,0,0,0.2
4,0,0,0,1,0,0
5,0.3,0,0,0,1,0.7
6,0,0,0.2,0,0.7,1

Para o contraste entre classes, deve-se criar no bloco de notas um arquivo com
valores complementares ao de similaridade, para carregar no Sim.wgt.File,
como no ex:
FTABLE,1,2,3,4,5,6
1,0,1,1,1,0.5,1
2,1,0,1,1,1,1
3,1,1,0,1,1,0.8
4,1,1,1,0,1,1
5,0.7,1,1,1,0,0.3
6,1,1,0.8,1,0.3,0

Depois que selecionar tudo que se deseja, dar OK.

Para executar o Fragstats:

Clique no ícone do homenzinho verde correndo com um x vermelho. Pode
demorar bastante executando, mas quando termina ele dá um aviso sonoro, e
fornece data e hora da análise.
Para ver o resultado, clique no ícone com um livro e um R verde.
Save run as resultadosfrag (não escolhe a extensão) para abrir no bloco de
notas. Pode passar para a tabela de atributos do ArcMap.
Para passar os resultados do Fragstats (bloco de notas) para o Excel:
Abra o Excel e na barra de ferramentas, clique em `importar dados`
Selecione no diretório o arquivo bloco de notas resultadosfrag PATCH (ou
CLASS, ou LAND, se vc calculou estes Tb)
Abre uma janela de importação em 3 etapas - nesta primeira, clique em
delimitado avançar
Na segunda tela selecione o separador (em geral virgula)– desabilite tabulação
- avançar.
Na terceira tela selecione geral – concluir OK
Delete a Coluna A e salve a tabela.

4. Para rodar o Guidos

Clique duas vezes no ícone da vaquinha
Clique para continuar.
Abrirá uma janela par você escolher em que diretório (ou pasta) está o arquivo
tiff que será carregado. Não selecionar o arquivo agora, apenas clicar em
cima de onde ele está.
Clicar em File depois Read Image e Geotiff – daí sim, selecionar o arquivo. Ex.
pevvrose.tif
Abre uma imagem com o recorte a analisar todo em preto.
Conferir as configurações:
FGConn deve estar em 8/4
Edge Width – digitar o número de pixels que formará a borda. Ex. 10 (equivale
a 50m numa resolução de 5m).
Transition – On/off ligado
Intext – on/off ligado
Passe o mouse pela parte preta para ver se varia de 0 a 1 (background e
foreground)
Passe o mouse pela parte branca (ou missing, fora do recorte) – se estiver com
128 bytes, talvez tenha que subtrair:
Clique General tools, depois MSPA input
Subtract 1b
A matriz (background) deve ficar branca e, se vc passar o mouse sobre ela,
estará indicando 255 bytes; Na imagem UACJ só aparecia 2, então
adicionaram 1 byte para aparecer 255
Os fragmentos (foreground) estão em preto e valendo 0 bytes
Por fora do recorte, a área cinza (missing) estará valendo 127 bytes

Clique General tools, depois MSPA input

X-FG/BG/missing
Abre a janela com foreground valendo 0, clique accept.
Clique General tools, depois MSPA input
X-FG/BG/missing
Abre a janela com background – procure e selecione 255 (o 2), clique accept.
Clique General tools, depois MSPA input
X-FG/BG/missing
Abre a janela com missing – procure e selecione 127, clique accept.
Clique Pattern Analysis, depois MSPA
Pode demorar um pouco analisando
Aparece a imagem da classificação – clique no quadrinho Calculate MSPA
Statistics para obter a tabela com a freqüência dos parâmetros calculados –
também pode demorar um pouco.
Salve a imagem como geotiff. UACJ salvou como generic c/ extensão png Ex.
pevvroseGuidos.tif. A tabela será salva automaticamente como bloco de notas.
Ex. pevvroseGuidos_stat.txt.