CFX96 Touch
Deep Well
Análise PCR
em
Tempo Real
• Desnaturação
(96°C): Aquece fortemente a reação para separar, ou desnaturar, as
fitas de DNA. Isso proporciona um molde de fita simples para a
próxima etapa.
• Anelamento
(55C° - 65°): Resfria a reação para que os primers possam se ligar às
suas sequências complementares no DNA molde de fita simples.
• Extensão
(72°C) Eleva a temperatura da reação para que a Taq polimerase
estenda os primers, sintetizando novas fitas de DNA.
Equipamentos para análise PCR
•E.coli Entero-hemorrágica (EHEC): essa bactéria possui fímbrias aderentes que produzem
um toxina. Os sintomas iniciais envolvem diarreia aquosa e podem evoluir para anemia,
trombocitopenia e insuficiência renal aguda.
•E.coli Enteroagregativa (EAEC): também possui fímbrias e produz toxinas que são
parecidas com as da ETEC. Os sintomas mais comuns da infecção por EAEC são diarreia
aquosa e/ou hemorrágica em crianças.
Escherichia coli O157:H7 e as demais
produtoras de toxina Shiga (STEC)
• Escherichia coliO157:H7A Escherichia coli é uma bactéria em forma de
bastonete, com cerca de 0,5μm de diâmetro de base por 2,0 μm de
comprimento. É uma bactéria Gram-negativa comumente presente no
intestino dos animais.
• Dentre as diversas classes de E. coli reconhecidas, está a cepa de E.
coliO157:H7, que pertence ao grupo de EHEC ou produtora de
verotoxina.
• A combinação de letras e números utilizada na classificação da
bactériase refere aos marcadores específicos encontrados em sua
superfície: O157 é referente ao antígeno somático e H7 é referente
ao antígeno flagelar.
Escherichia coli O157:H7 e as demais
produtoras de toxina Shiga (STEC)
Listeria monocytogenes
AOAC-RI 010802
NF- Afnor 07/10-04/05
E. ColiO157:H7
AOAC-RI020801
SerO
AOAC-RI121203
Resumo
do
Procedimento
• Primeiro passo: enriquecimento e incubação de acordo com cada validação.
• Segundo passo: pipetar 100µL do reagente lise de cada kit e 100µL da amostra enriquecida após
incubação de acordo com a validação escolhida nos poços profundos (placa Deepwell) e selar com selo
pré-perfurado.
• Terceiro passo: Incubar no termomixer entre 95-100°C por 10-15 minutos a 1300rpm.
• Quarto passo: aguardar resfriar por 10 minutos.
• Quinto passo: Preparar o mix PCR de acordo com a quantidade de amostras de acordo com tabela do
guia rápido. (Utilizar o Mix PCR imediatamente ou então manter estável por até 1 hora em temperatura
de 2°C a 8°C)
• Sexto passo: Distribuir o Mix PCR nas placas de PCR, Sendo 45µL/poço para os Kit de Listeria
monocytogenes, Salmonella spp e E.coli O157:H7 e 20µL/poço para o Kit de Stec Virx.
• Sétimo passo: Adicionar 5µL do sobrenadante de cada amostra em seu respectivo poço, assim como os
controles negativo e positivo.
• Oitavo passo: selar a microplaca PCR com a tampa óptica.
• Nono passo: Programar as reações no equipamento CFX96.
• Décimo passo: Inserir a microplaca com as amostras já pipetadas no equipamento e iniciar a
amplificação clicando em “Run”(Correr).
Thermomixer
Responsável pela etapa de
extração do DNA é um
Termo bloco que aquece e
agita a amostra.
Checagem de Sistema Resultado
Ligue por 15 minutos antes de iniciar a medição.
Preencha a posição E6 da placa Deep Well com 200uL de óleo mineral,
permita que a placa aqueça por 10 e 15 minutos e anote as temperaturas:
- Após 10 minutos (resultado deve ser >85ºC) ___._ºC
- Após 15 minutos (resultado deve ser >90ºC) ___._ºC
Preencha os poços A1, A12, H1 e H12 da placa Deep Well com 200ul de óleo
mineral. Permita que a placa aqueça por 15 minutos e anote as
temperaturas:
___._ºC
A1 ___._ºC
A12 ___._ºC
H1 ___._ºC
H12
Termômetro utilizado:
Sonda utilizada:
The CFX Manager™
Software
• Fácil utilização apenas uma tela para programar as
análises
• É possível personalizar de acordo com as preferências do
usuário
• Protocolos compatíveis podem ser corridos
simultaneamente
Validações
•Kit I-Check STEC Virx (E.coli Produtora de Shiga Toxina (E.coli O157:H7,
E.coli 026, E.coli 045, E.coli 0103, E.coli 0111, E.coli 0121, E.coli 0145)
VALIDAÇÃO: AOAC RI certificado n° 121203
MLG-5C.00.USDA