Metabolismo Microbiano

Produo de Energia e Biossntese

Pelczar, Caps. 11 e 12, pginas 290 - 330

1. Conceitos bsicos 2. Classes microbianas 3. Quimiotrofia 4. Fototrofia 5. Quimiolitotrficos 6. Integrao metablica

1. Introduo

Metabolismo:
toda a atividade qumica realizada por um organismo e seu maquinrio.

So de 2 tipos:
aquelas que liberam E = exergnicas - catablicas aquelas que utilizam E = endergnicas - anablicas

E = capacidade de realizar trabalho

qumica luminosa

2. Produo de Energia (E)

Requerimentos de energia:

Crescimento celular, reproduo, manuteno e movimento

Componentes celulares como protenas (enzimas), DNA, RNA, carboidratos, lipdeos, etc.

Sntese
Compostos e estruturas

Degradao
E requerida
Sistema de armazenamento e transferncia de E

E liberada
Quebra de substratos ou nutrientes

Produtos da degradao servem como unidades para a produo de compostos celulares

Tipos de energia

Energia qumica energia contida em ligaes

qumicas das molculas

Energia radiante (energia da luz) deve ser

convertida em energia qumica

Classificao dos microrganismos de acordo com a fonte de energia e carbono

(utilizam substncias qumicas como fonte de energia)

Quimiotrficos

Quimiolitotrficos
C= CO2

Quimiorganotrficos
C=orgnico

Classificao dos microrganismos de acordo com a fonte de energia e carbono

Classificao dos microrganismos de acordo com a fonte de energia e carbono

Tipo fisiolgico Foto Quimio Fonte de Energia Luz Qumica Fonte de Carbono

Organotrfico/heterotrfico
Autotrfico/litotrfico

Molculas orgnicas
Molculas inorgnicas

Fotoautotrfico = plantas, cianobactrias, algas verdes Fotoorganotrfico/hetero = bactrias prpuras, exceto as abaixo Fotolitotrficas = bactrias prpuras metabolizantes do S Quimioautotrfico = Archaea metanognicas Quimiorganotrfico/hetero = maioria bactrias e fungos Quimiolitotrfico = bactrias nitrificadoras

Enzimas
Catalisadores das reaes Aumentam as velocidades de reao de 108 a 1020 vezes Tem stios ativos de ligao do substrato Podem conter outras molculas acopladas Grupos prostticos grupo heme dos citocromos um exemplo Coenzimas derivadas de vitaminas (NAD+/NADH) Terminao ase ao seu substrato Celulase: degradam celulose Glicose-oxidase: catalisa a oxidao da glicose Ribonuclease: decompe acido ribonucleico Lisozima: cliva o peptideoglicano

Catalise e enzimas

Reao exergnica

COMPLEXO ENZIMA-SUBSTRATO

Compostos ricos em energia: armazenamento e transferncia de energia (imediata)

ATP = adenosina trifosfato ADP = adenosina difosfato Fosfoenolpiruvato Glicose-6-fosfato

Coenzimas: Acetil CoA, NAD, NADH, NADPH

Armazenamento de energia

Ligacoes tioster

(Madigan et al., 2010)

O ATP o composto de alta energia mais importante nos seres vivos.

Apesar disso, sua concentrao nas clulas relativamente baixa.
Para o armazenamento de energia por perodos longos, os microrganismos produzem polmeros insolveis.

Ex.: polmeros de glicose (amido e glicognio), polmeros lipdicos, PHAs (biopolister).

Ralstonia eutropha

Compostos ricos em energia: armazenamento e transferncia de energia (a longo prazo)

Procariotos:
Glicogenio Poli--hidroxibutirato

Poli-idroxialcanoatos
S (elementar)

Eucariotos
Poliglicose na forma de amido Lipdeos na forma de gorduras

4. Gerao de ATP por microrganismos

Ausncia de aceptores exgenos de eltrons Menos E

Fermentao
Sntese de ATP acoplada a reaes de xido-reduo

Respirao
O2 ou outro composto como aceptor exgeno de eltrons
Mais E

Oxidao = perda de e- (liberam energia)

Reduo = ganho de e- (requerem energia)

As reaes de oxi-reduo (redox)

- Um composto se torna oxidado quando: 1. Perde eltrons 2. Se liga a um tomo mais eletronegativo 3. Isto geralmente ocorre quando se liga ao oxignio - Um composto se torna reduzido quando: 1. Ganha eltrons 2. Se liga a um tomo menos eletronegativo 3. E geralmente isto ocorre quando se liga ao hidrognio Formas reduzidas de C (carboidratos, metano, lipdios, lcoois) so importantes estoques de energia em suas ligaes.

Formas oxidadas de C (cetonas, aldedos, cidos carboxlicos e CO2) dispem de pequeno potencial energtico em suas ligaes.

Mecanismos para conservao de energia

(Sntese de ATP) Os quimiotrficos apresentam dois mecanismos conhecidos:
1. Respirao: atuam aceptores externos de eltrons (fosforilao oxidativa) Podendo ser: a) Aerbia: o aceptor externo o oxignio b) Anaerbia: aceptores diferentes do oxignio (nitrato, sulfato, carbonato, ...) 2. Fermentao: ocorre na ausncia de aceptores externos de eltrons (fosforilao a nvel de substrato)

1a) Respirao aerbia

o procedimento mais comum s clulas e compreende 3 etapas:

1) Piruvato (gliclise quando o substrato a glicose) 2) Ciclo do cido ctrico (ciclo de Krebs) 3) Cadeia respiratria

1 etapa: Piruvato (via glicoltica)

considerada a via metablica mais primitiva, presente em todas as formas de vida atuais. Ocorre no citoplasma das clulas.

Caractersticas: 1. Oxidao parcial da glicose a piruvato 2. Pequena quantidade de ATP gerada (produo lquida de 2 ATP) 3. Pequena quantidade de NAD reduzida a NADH

2 etapa: Ciclo de Krebs

Ocorre no citoplasma (procariotos) e nas mitocndrias (eucariotos).

Reaes preparatrias: formao de composto chave do processo

Produo direta de 1 GTP guanosina trifosfato (equivalente ao ATP)

Alm do papel-chave nas reaes catablicas, importante nas reaes biossintticas. Os intermedirios so desviados para vias biossintticas quando necessrio:

Exemplos: Oxalacetato: precursor de aminocidos Succinil-CoA: formao de citocromos e da clorofila, entre outros Acetil-CoA: biossntese de cidos graxos

3 etapa: Cadeia respiratria (sistema de transporte de eltrons)

Ocorre ao nvel da membrana das mitocndrias (eucariotos) e na membrana citoplasmtica (procariotos)

Os prtons e eltrons recolhidos na gliclise pelo NAD e no Ciclo de Krebs pelo NAD e FAD so transportados ao longo de uma cadeia de citocromos em nveis sucessivamente mais baixos de energia de modo que seja melhor aproveitada na formao de ATP.

Fosforilao oxidativa
Gerao da fora protomotiva

As 3 etapas da via respiratria

Sntese da respirao aerbia

Reaes de oxidao e reduo em presena de um aceptor de eltrons externo, o O2 A molcula inteira do substrato oxidada at CO2 Alto potencial de energia Grande quantidade de ATP pode ser gerada: teoricamente at 38 ATPs

Produo de ATP:

Na cadeia respiratria:
4 NADH formados na gliclise geram 6 NADH formados no ciclo de Krebs geram 2 FADH formados no ciclo de Krebs geram Formao direta na Gliclise Formao direta no Ciclo de Krebs 12 ATP 18 ATP 4 ATP 2 ATP 2 GTP

Total de at .................................................... 38 ATP

1b) Respirao anaerbia

uma variao alternativa da respirao aerbia: o aceptor de eltrons no o

oxignio. Uma implicao o rendimento energtico inferior: nenhum aceptor alternativo apresenta potencial to oxidante quanto O2. O uso de aceptores alternativos permitem os microrganismos respirarem em ambientes sem oxignio, sendo de extrema importncia ecolgica. Oxidao de substratos orgnicos ou inorgnicos:

C6H12O6 + 12 NO3- 6CO2 + 6H2O + 12NO22 lactato + SO4= + 4H+ 2 acetato + 2CO2 + S= + H2O Quantidade de energia produzida menor

2. Fermentao (tambm uma forma de respirao anaerbia. Ocorre no citossol)

Reao de oxidao-reduo internamente balanceada. Ausncia de aceptores externos.

A concentrao de NAD+ nas clulas baixo, precisando ser reoxidado para no cessar a via glicoltica. A reduo do piruvato a etanol ou outros produtos restabelece o NAD e permite a continuidade da gliclise .

Produo lquida de apenas

2 ATP.

Caractersticas da Fermentao:

cido pirvico reduzido a cidos orgnicos e lcoois NADH oxidado a forma NAD: essencial para operao continuada da via glicoltica

O2 no necessrio
No h obteno adicional de ATP.

Gases (CO2 e/ou H2) podem ser produzidos

Produtos da fermentao
Espcie microbiana Principal produto da fermentao

Acetivibrio cellulolyticus
Actinomyces bovis

cido actico
cidos actico, frmico, lctico, etc.

Clostridium acetobutylicum Acetona, butanol, etanol, cido frmico, etc. Enterobacter aerogenes Escherichia coli Lactobacillus brevis Streptococcus lactis Succinimonas amylolytica Etanol, cido frmico, CO2, etc. Etanol, cidos lctico, actico, frmico, succnico, etc. Etanol, glicerol, CO2, cidos lctico, actico, etc. cido lctico cidos actico e succnico

Fototropia
A utilizao da energia da luz - Fotossntese

a) Fotossntese oxignica

Presente nas cianobactrias e nos cloroplastos dos

Cloroplasto de eucariotos

eucariontes (algas por ex.)

Doador de eltrons H2O: sua oxidao gera o O2

Dois fotossistemas: PSI e PSII Maior funo produzir ATP e NADPH para a

fixao de carbono.

Cianobactrias
Fotossistemas em lamelas

Fotossntese oxignica

Cianobactrias

Fotofosforilao
A energia da luz utilizada para a sntese de ATP

O NADPH utilizado para reduzir o CO2 no processo de fixao do carbono

b) Fotossntese anoxignica

Doadores de eltrons variam: H2S or So nas bactrias verdes e prpuras sulfurosas H2 ou compostos orgnicos em bactrias verdes e prpuras no sulfurosas Apenas um fotossistema Bactrias verdes tem foto-sistema semelhante ao PSI Bactrias prpuras tem foto-sistema semelhante ao PSII Principal funo produzir ATP via fotofosforilao

Biossntese

Energia para sntese de compostos celulares: cidos nuclicos (DNA, RNA), substncias nitrogenadas (aa, enzimas, protenas), carboidratos (peptidoglicano), lipdeos, etc. ATP para processos como diviso celular, mobilidade, transporte ativo de nutrientes, etc.

Utilizao de energia

Biossntese de Compostos Nitrogenados

N2 N inorgnico (NH3+)

Aminocidos

Arranjo de aminocidos

Protenas/enzimas

Purinas e pirimidinas Nucleotdeos

cidos nuclicos (DNA, RNA)

Fornecimento de precursores de aminocidos

(Madigan et al., 2004)

Biossntese de nucleotdeos e cidos nuclicos

Nucleotdeo = base nitrogenada-pentose-fosfato

ribose = ribonucleotdeos (RNA)

desoxirribose = desoxirribonucleotdeos (DNA)

Ativao dos nucleotdeos (ATP) Sntese de cidos nuclicos a partir de nucleotdeos ativados

Biossntese de nucleotdeos e cidos nuclicos

(Madigan et al., 2004)

Biossntese de carboidratos
CO2

Triose

Pentoses e hexoses

Nucleotdeos

(peptidoglicano, celulose, amido, etc.)

Polissacardeos

RNA e DNA

Biossntese de cidos graxos

Glicose Gliclise cido pirvico

Acetil CoA e Malonil CoA

cidos graxos de cadeia longa

Fosfolipdios

Glicerol fosfato

Outras utilizaes de energia

Transporte Motilidade Reparos Produo de estruturas de resistncia (endosporos)