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Amino
Amino

cidos e Pept
cidos e Pept

deos
deos
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Aminocidos
Estrutura Geral
cido carboxlico com amina primria (-NH
2
) no carbono .
Isomeria
Ao carbono esto ligados 4 grupos substituintes diferentes: grupo carboxila, grupo
amino, grupo R (ou cadeia lateral) e um tomo de hidrognio.
O carbono um carbono assimtrico
Com exceo da glicina (R=H) todos os demais aminocidos so oticamente ativos.
Os estereoismeros so designados por D e L.
Na natureza os aminocidos so encontrados na forma L.
Classificao dos aminocidos
Polaridade do grupo R
Grupamento funcional do grupo R
Essencial

R
COO
-
H
3
+
N C H
Exceo:
Prolina: amina secundria (-NH-)
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Quanto polaridade do grupo R
Grupo R no polar: aqueles onde R um hidrocarboneto aliftico ou aromtico.
glicina (Gly ou G) metionina (Met ou M)
alanina (Ala ou A) fenilalanina (Phe ou F)
valina (Val ou V) prolina (Pro ou P)
leucina (Leu ou L) triptofano (Trp ou W)
isoleucina (Ile ou I)
Grupo R polar no carregado: aqueles onde R apresenta grupamento polar no dissociado
em pH fisiolgico (pH = 7,0).
serina (Ser ou S) asparagina (Asn ou N)
treonina (Thr ou T) glutamina (Gln ou Q)
cistena (Cys ou C) tirosina (Tyr ou Y)
Grupo R carregado positivamente: aqueles onde R apresenta carga positiva em pH
fisiolgico (pH = 7,0).
histidina (His ou H)
lisina (Lys ou K)
arginina (Arg ou R)
Grupo R carregado negativamente: aqueles onde R apresenta carga negativa em pH
fisiolgico (pH = 7,0).
cido asprtico (Asp ou D)
cido glutmico (Glu ou E)
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Quanto natureza do grupamento R
Aliftico: Gly, Ala, Val, Leu, Ile
Aromtico: Phe, Trp, Tyr
Sulfonado: Cys, Met
Bsico: Lys, Arg, His
Hidroxilado: Ser, Thr
Dicarboxlico: Asp, Glu
Amida de cido dicarboxlico: Asn, Glu
Amina secundria: Pro
Essenciais
So aqueles que no podem ser sintetizados pelo organismo, devendo ser administrados
pr-formados na dieta.
Cada espcie tem seus aminocidos essenciais.
Espcie humana: Arg, Phe, His, Ile, Leu, Lys, Met, Trp, Val
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Estrutura dos Aminocidos
Grupo R no polar, aliftico ou aromtico
H
C
-
COO
H
3
N
+
H
Glicina
Glicina
C
-
COO
H
3
N
+
H
CH
3
Alanina
Alanina
-
C
COO
H
3
N
+
H
CH
CH
3
CH
3
CH
2
Leucina
Leucina
Isoleucina
Isoleucina
C
-
COO
H
3
N
+
H
CH
3
C
H
2
H
C
CH
3
Valina
Valina
3
-
C
COO
H
3
N
+
H
CH
CH CH
3
3
Prolina
Prolina
CH
2
C H
2
H
C
-
COO
CH
2 N
+
H
2
C
-
COO
H
3
N
+
H
CH
2
Fenilalanina
Fenilalanina
CH
2
CH
2
CH
3
S
C
-
COO
H
3
N
+
H
Metionina
Metionina
-
C
COO
H
3
N
+
H
NH
C
CH
2
CH
Triptofano
Triptofano
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Aminocidos com cadeias laterais apolares
Estes aminocidos possuem cadeia lateral que no apresenta a capacidade de receber ou
doar eltrons, de participar de ligaes inicas ou de formar pontes de hidrognio.
Entretanto, podem promover interaes hidrofbicas (*).
(*) Associao de grupos no polares, tais como cadeias de hidrocarbonetos, em meio aquoso.
Em sistemas vivos, estas interaes contribuem para a estabilidade das molculas de protenas,
das membranas e de vrias outras estruturas subcelulares.
Os valores de pK dos grupos -carboxila (pK
1
2,3) e -amino (pK
2
9,6) so semelhantes
para todos os aminocidos deste grupo.
A cadeia lateral da prolina e o seu grupo -amino formam um anel, de forma que, este
aminocido difere dos demais pelo fato de conter um grupo imino ao invs de um grupo
amino.
A glicina (cadeia lateral = H) o nico aminocido que no possui carbono assimtrico.
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Grupo R polar, no carregado
C
-
COO
H
3
N
+
H
CH
2
OH
Serina
Serina
C
-
COO
H
3
N
+
H
H
CH
3
C OH
Treonina
Treonina
SH
CH
2
C
-
COO
H
3
N
+
H
Cistena
Cistena
C
-
COO
H
3
N
+
H
CH
2
C
H
2
N O
Asparagina
Asparagina
C
-
COO
H
3
N
+
H
CH
2
C
H
2
N
O
CH
2
Glutamina
Glutamina
C
-
COO
H
3
N
+
H
CH
2
OH
Tirosina
Tirosina
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Aminocidos com cadeias laterais polares (desprovidos de carga eltrica)
Estes aminocidos apresentam carga lquida igual zero em pH neutro, embora as
cadeias laterais de cistena e tirosina possam perder um prton em pH alcalino.
Os aminocidos serina, treonina e tirosina contm grupos hidroxila que podem participar
da formao de pontes de hidrognio (*).
(*) Resultam da atrao eletrosttica entre um tomo eletronegativo (normalmente O ou N)
e um tomo de hidrognio ligado covalentemente a um segundo tomo eletronegativo. O
tomo de hidrognio, desta forma, compartilhado entre dois tomos eletronegativo.
As cadeias laterais da asparagina e da glutamina contem, cada uma, um grupo carbonila e
um grupo amida que podem participar tambm de pontes de hidrognio.
A cadeia lateral da cistena contm um grupamento sulfidrila (-SH).
Nas protenas os grupos sulfidrilas de duas cistenas podem se tornar oxidados e formar
um dmero cistina que contm uma ligao denominada ponte dissulfeto (*).
(*) A ponte dissulfeto (-S-S-) uma ligao covalente formada pelos grupos sulfidrila (-SH)
de dois resduos de cistena para produzir um resduo de cistina.
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Grupo R carregado
positivamente
C
-
COO
H
3
N
+
H
CH
2
CH
2
CH
2
CH
2
NH
3
+
Lisina
Lisina
C
-
COO
H
3
N
+
H
C
+
NH
2
NH
2
CH
2
CH
2
CH
2
NH
Arginina
Arginina
C
-
COO
H
3
N
+
H
NH
+
NH
C
CH
2
C
C
H
Histidina
Histidina
C
-
COO
H
3
N
+
H
COO
-
CH
2
cido Asprtico
cido Asprtico
C
-
COO
H
3
N
+
H
CH
2
CH
2
COO
-
cido Glutmico
cido Glutmico
Grupo R carregado
negativamente
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Aminocidos com cadeias laterais bsicas
As cadeias laterais dos aminocidos bsicos so aceptoras de prtons.
Em pH fisiolgico, as cadeias laterais da lisina e da arginina se encontram completamente
ionizadas, com carga positiva.
J a histidina fracamente bsica e o aminocido livre, em geral, no apresenta carga
eltrica em pH fisiolgico. Entretanto quando a histidina se encontra incorporada em
uma protena, a sua cadeia lateral pode se apresentar com carga positiva ou neutra,
dependendo do ambiente inico fornecido pela cadeia polipeptdica da protena.
Aminocidos com cadeias laterais cidas
Os aminocidos cido asprtico e cido glutmico so doadores de prtons.
Em pH neutro, as cadeias laterais desses aminocidos se encontram completamente
ionizadas, contendo um grupo carboxilato carregado negativamente (-COO
-
).
Esses aminocidos so, portanto, denominados aspartato e glutamato, para enfatizar o
fato de estarem carregados negativamente em pH fisiolgico.
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Estrutura e classificao dos aminocidos
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(a) em solues muito cidas os dois grupos se apresentam protonados
(b) em solues muito alcalinas os dois grupos se apresentam desprotonados
(c) em solues neutras os aminocidos se apresentam como um on dipolar
H C H
3
+
N
R
COOH
H C H
3
+
N
COO
-
R
H C H
2
N
COO
-
R
(a )
(b) (c)
A converso entre as formas a, b e c em funo do pH do meio pode ser evidenciada
atravs da curva de titulao do aminocido.
Carga eltrica dos aminocidos varia com o pH
Grupos ionizveis
forma protonada: -COOH e NH
3
+
forma desprotonada: -COO
-
e NH
2
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Curva de titulao de aminocido
Clculo do
ponto isoeltrico
pI = pH=
pK
1
pK
2
+
2
2
pI = pH=
2,34 + 9,69
= 6,02
Curva de Titulao da Alanina
Equivalentes de NaOH adicionados
pH
0,5 1,0 1,5 2,0
pI = 6,02
(forma dipolar isoeltrica)
Etapa 1:
titulao do
grupo -COOH
Etapa 2:
titulao do
grupo -NH
3
+
pK
1
= 2,34
pK
2
= 9,69
b
c
d
(a)
+
NH
3
CHRCOOH
3
+
NH CHRCOOH
3
+
NH CHRCOO
-
(b)
3
+
NH CHRCOO
-
(c)
3
+
NH CHRCOO
-
NH
2
CHRCOO
-
(d)
NH
2
CHRCOO
-
(e)
e
2
4
6
8
10
12
14
a
C
COOH
H
3
+
N
H
CH
3
Alanina
(em meio cido)
No ponto isoeltrico no h migrao, em meio eltrico, nem para o eletrodo positivo (nodo), nem
para o eletrodo negativo (ctodo).
Ponto isoeltrico o pH da soluo para o qual a carga absoluta do aminocido nula.
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Valores de pK
dos grupos
ionizveis de
aminocidos
3,22 4,25 9,67 2,19 Glu cido glutmico
2,77 3,65 9,60 1,88 Asp cido asprtico
Grupo R carregado negativamente
5,65 9,13 2,17 Gln Glutamina
5,41 8,80 2,02 Asn Asparagina
5,74 9,21 2,28 Met Metionina
5,07 10,28 8,18 1,96 Cys Cistena
5,87 13,60 9,62 2,11 Thr Treonina
5,68 13,60 9,15 2,21 Ser Serina
Grupo R polar, no carregado
5,89 9,39
2,38
Trp Triptofano
5,66 10,07 9,11 2,20 Tyr Tirosina
5,48 9,13 1,83 Phe Fenilalanina
Grupo R aromtico
6,48 10,96 1,99 Pro Prolina
6,02 9,68 2,36 Ile Isoleucina
5,98 9,60 2,36 Leu Leucina
5,97 9,62 2,32 Val Valina
6,01 9,69 2,34 Ala Alanina
5,97 9,60 2,34 Gly Glicina
Grupo R no polar, aliftico
Grupo R carregado positivamente
10,76 12,48 9,04 2,17 Arg Arginina
9,74 10,53 8,95 2,18 Lys Lisina
7,59 6,0 9,17 1,82 His Histidina
pI pK

3
(Grupo R)
pK

2
(-NH
3
+
)
pK

1
(-COOH)
Abreviao Aminocido
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Reaes qumicas dos aminocidos
Reaes comuns da qumica orgnica relativa aos grupos -COOH e -NH
2
Grupamento carboxila
Esterificao por lcoois
Utilizada no isolamento de aminocidos
Formao de amidas
Ligao peptdica
H
C
NH
2
R COOH + OH R'
+ H
2
O
COOR' R
NH
2
C
H
2
+ H
2
O + NH
2
R'
H
C
NH
R COOH
H
C
NH
2
R CONH R'
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Grupamento amino
Resistente hidrlise
Pode ser removido por oxidao. Agentes oxidantes: H
2
O
2
, KMnO
4
, etc.
Grupo R
Reaes decorrentes da reatividade do grupo R.
Assim, a cistena apresenta reaes caracterstica do grupamento sulfidrila (SH),
a tirosina as do grupamento fenlico, etc.
As reaes qumicas dos aminocidos so utilizadas para:
Identificao e anlise de aminocidos
Identificao e sequenciamento de aminocidos em protenas
Identificao de resduos especficos necessrios para a atividade biolgica de
protenas nativas
Modificaes qumicas de resduos de aminocidos capazes de alterar a atividade
biolgica da protena
Sntese qumica de peptdeos
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Reaes qumicas caractersticas de aminocidos
Duas reaes so amplamente utilizadas para a deteco, medida e identificao de
aminocidos
Reao da ninidrina
Resulta na desaminao oxidativa de -aminocidos produzindo CO
2
; NH
3
; um aldedo
com um carbono a menos e a ninidrina reduzida.
A ninidrina reduzida ou hidridantina reage com o NH
3
e com outra molcula de ninidrina
formando um complexo arroxeado ( = 570 nm)
Observao
Nos aminocidos com grupo
amina secundria, como o caso
da prolina, o produto da reao
diferente e origina uma cor
amarela ( = 440 nm).
Neste caso no h a liberao
de NH
3
, porm, h a produo
de teores quantitativos de CO
2
.
ninidrina
O
||
H
C
C
OH
C
||
C
O
||
C
O
||
O
C
C
_
O
N =
C
C
||
COOH R
H
C
NH
2
aminocido
O
CO
2
R C +
H
C
O
||
C
OH
OH
C
||
O
+
O
NH
3
O
C
OH
OH
C
||
C
O
||
hidridantina
ninidrina
complexo arroxeado
+
3 H
2
O + H
+
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Reao com 1-flor-2,4-dinitrobenzeno (FDNB)
Em soluo levemente alcalina, o FDNB reage com os -aminocidos para produzir
derivado do 2,4-dinitrofenil de cor amarela.
HF
+
NO
2
NO
2
F
COOH R
NH
2
C
H
NO
2
NO
2
H C
NH
R
COOH
FDNB
- aminocido
2,4-dinitrofenil-aminocido
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Ligao peptdica (ou ligao amida)
O polmero formado pelo encadeamento de aminocidos constitudo por unidades
planares - unidades peptdicas - unidas entre si por uma articulao flexvel o carbono .
Os oligmeros de aminocidos so denominados peptdeos
2 resduos de aminocidos: dipeptdeo
3 resduos de aminocidos: tripeptdeo
4 resduos de aminocidos: tetrapeptdeo, etc.
Os carbonos de dois aminocidos adjacentes e os tomos dos
grupamentos que participam da ligao peptdica - a unidade
peptdica - esto todos em um mesmo plano.
O

C C
||
C N
H

l igao peptdica
H
2
O

COOH
H
N
C
R
2
O
||
C
R
1
C N H
2
H
H

H H
COOH
H
H N C
R
2
+
OH
O
||
C
R
1
C
N H
2

Cadeia polipeptdica ou cadeia peptdica uma seqncia de mais de dois resduos de


aminocidos.
A seqncia dos aminocidos na cadeia peptdica denominada de estrutura primria.
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a) Os quatro tomos dos
grupamentos envolvidos na
ligao peptdica (em vermelho)
se dispem em um plano. A
unidade peptdica est
representada por um retngulo.
b) As unidades peptdicas podem se
movimentar umas em relao s
outras. possvel uma rotao
(indicada pelas setas) em torno
das ligaes com o carbono .
c) A cadeia polipeptdica consiste
em um arranjo flexvel de
unidades planas, as unidades
peptdicas, conectadas por uma
articulao, o carbono . As
cadeias laterais dos aminocidos
esto representadas.
Peptdeo
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4 resduos de aminocidos: tetrapeptdeo
Ligao peptdica (ou ligao amida)
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Nomenclatura de peptdeos
As cadeias peptdicas so nomeadas da extremidade amino terminal (ou N-terminal) para
a extremidade carboxila terminal (ou C-terminal).
O que diferencia um peptdeo de uma protena?
Muitos autores se baseiam na dimenso da estrutura, em termos do nmero de resduos
de aminocidos. Por exemplo:
n < 80 a 100 aminocidos cadeia peptdica
n > 80 a 100 aminocidos cadeia protica
Entretanto a distino entre peptdeo e protena deve se basear nas respectivas funes
biolgicas.
No h possibilidade de
ionizao do grupamento que
faz parte da ligao peptdica
Os grupos amina e carboxila
terminais e os grupos
ionizveis das cadeias laterais
(grupos R) so os responsveis
pelas propriedades cido-
bsicas dos peptdeos.
C-terminal N-terminal
CH
2
||
|| ||
COO
-
H
N
O
||
C
O
O O
H
N C C
N
H H
N
C
CH
2
CH
2
COO
-
CH
2
CH
2
CH
2
NH
3
C C C
C C
H H
H H
H
H
CH
2
OH
H-C OH
CH
3
+
N H
3
+
(Glutamil lisil glicil seril treonina)
GLU GLI-SER-THR -L S- Y
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Hidrlise das ligaes peptdicas
Enzimas proteolticas
Tripsina - hidrolisa apenas as ligaes peptdicas cujo grupo carboxila pertence a um
resduo de lisina ou arginina.
Quimotripsina - hidrolisa apenas ligaes peptdicas cujo grupo carboxila pertence
a um resduo de fenilalanina, triptofano ou tirosina.
Pepsina - hidrolisa apenas as ligaes peptdicas cujo grupo amino pertence a um
resduo de fenilalanina, triptofano, tirosina.
Termolisina - hidrolisa apenas as ligaes peptdicas cujo grupo amino pertence a um
resduo de leucina, isoleucina ou valina.
Hidrlise total: por fervura
com cido ou base forte ocorre
a hidrlise de todas as ligaes
peptdicas.
Hidrlise seletiva: por certas
enzimas proteolticas.
A hidrlise ocorre nas ligaes
peptdicas de aminocidos
especficos.
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Exemplo de peptdeo hidrolisado por diferentes proteases
Tyr - Lys - Glu - Met - Leu - Gly - Arg - Ala - Gly
Tripsina (3 fragmentos) Tyr Lys // Glu - Met - Leu - Gly Arg // Ala Gly
Quimotripsina (2 fragmentos) Tyr // Lys - Glu - Met - Leu - Gly - Arg - Ala Gly
Termolisina (2 fragmentos) Tyr - Lys - Glu Met // Leu - Gly - Arg - Ala - Gly
Mtodo qumico seletivo
Brometo de cianognio - hidrolisa apenas ligaes peptdicas cujo grupo carboxila
pertence a um resduo de metionina.
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Determinao da seqncia de aminocidos nos fragmentos de peptdeos
Mtodo de degradao de
Edman, conduzido em meio
levemente alcalino, marca e
remova o resduo N-terminal
de peptdeos, deixando
intactas as outras ligaes
peptdicas.
Aps a remoo e
identificao, por
cromatografia, do resduo
N-terminal, o novo resduo
N-terminal exposto pode ser
marcado e removido pela
repetio da mesma reao.
Reao com fenilisotiocianato (Reagente de Edman)
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Arranjo tridimensional das cadeias polipeptdicas
C = C
H
COOH HOOC
H
cido malico (cis)
cido fumrico (trans)
HOOC
C = C
H
H
COOH
Centro quiral: ao redor do qual os grupos substitudos esto arranjados em uma
seqncia determinada (configurao L ou D)
COOH
|
C
|
H - - NH
2
CH
3
D - alanina L - alanina
COOH
|
CH
3
C
|
- H H
2
N -
Para passar de uma configurao para a outra
necessrio que ocorra um rompimento de ligao.
Configurao
Arranjo espacial de uma molcula orgnica que conferido pela presena de:
Dupla ligao: ao redor das quais no h liberdade de rotao, o que determina as
configuraes cis-trans.
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Conformao
Arranjo espacial de grupos substitudos em molculas orgnicas que podem assumir
vrias posies espaciais, sem o rompimento de ligaes devido liberdade de rotao ao
redor de ligaes simples carbono-carbono.
Exemplo: etano
Forma eclipsada Forma escalonada
C
H
H
H
H
H
H
C
C
H
H
H
H
H
H
C
H H
H
C
C
H
H
H
H
H
H