R (linguagem de programao)

R uma linguagem e tambm um ambiente de desenvolvimento integrado para clculos estatsticos e grcos.

2 Recursos estatsticos

Foi criada originalmente por Ross Ihaka e por Robert

Gentleman no departamento de Estatstica da universidade de Auckland, Nova Zelndia, e foi desenvolvido em
um esforo colaborativo de pessoas em vrios locais do
mundo[3] .

A R disponibiliza uma ampla variedade de tcnicas estatsticas e grcas, incluindo modelao linear e no linear, testes estatsticos clssicos, anlise de sries temporais (time-series analysis), classicao, agrupamento
e outras. A R facilmente extensvel atravs de funes
e extenses, e a comunidade R reconhecida pelos seus
contributos ativos em termos de pacotes. Existem diferenas importantes, mas muito cdigo escrito para S corre
inalterado. Muitas das funes padro do R so escritas
no prprio R, o que torna fcil para os usurios seguir as
escolhas algortmicas feitas. Para tarefas computacionais
intensivas, os cdigos C, C++, e Fortran podem ser ligados e chamados durante a execuo. Usurios experientes podem escrever cdigo C ou Java[12] para manipular
diretamente objetos R.

O nome R provm em parte das iniciais dos criadores[4] e

tambm de um jogo gurado com a linguagem S (da Bell
Laboratories, antiga AT&T).
R uma linguagem e um ambiente similar ao S - podendo
ser considerado uma implementao distinta do S embora
com algumas diferenas importantes. Muitos cdigos escritos para o S podem ser executados inalterados no R. A
implementao comercial de S S-PLUS.

O cdigo fonte do R est disponvel sob a licena

GNU[5][6] GPL e as verses binrias pr-compiladas so O R fortemente extensvel atravs do uso de pacotes enfornecidas para Windows, Macintosh, e muitos sistemas viados pelo utilizador para funes especcas ou reas
operacionais Unix/Linux.
especcas de estudo. Devido sua herana do S, o R
R tambm altamente expansvel com o uso dos pacotes, possui fortes recursos de programao orientada por obque so bibliotecas para funes especcas ou reas de jetos, mais que a maioria das linguagens de computao
estatstica. Ampliar o R tambm facilitado pelas suas
estudo especcas.
regras de contexto lexical.[13]
Um conjunto de pacotes includo com a instalao de
R, com muito outros disponveis na rede de distribuio Outra fora do R so os grcos estticos, que podem produzir imagens com qualidade para publicado R (em ingls CRAN).
o, incluindo smbolos matemticos. Grcos dinA linguagem R largamente usada entre estatsti- micos e interativos esto disponveis atravs de pacotes
cos e analistas de dados para desenvolver software de adicionais.[14]
estatstica[7][8] e anlise de dados.[8] Pesquisas e levantamentos com prossionais da rea mostram que a po- O R tem a sua prpria documentao em formato LaTeX,
pularidade do R aumentou substancialmente nos ltimos a qual usada para fornecer documentao de fcil compreenso, simultaneamente on-line em diversos formatos
anos.[9][10][11]
e em papel.

Ferramentas de produtividade

3 Recursos de programao

Existem diversas GUI para R, incluindo JGR, RKWard,

SciViews-R, Rcmdr e, mais recentemente, RStudio.
A R uma linguagem interpretada tipicamente utilizada
Muitos editores oferecem recursos que facilitam o tra- atravs de um Interpretador de comandos. Se um usurio
balho com o R: Emacs, Vim, jEdit, Kate, Tinn-R escreve 2+2 no comando de insero e pressiona enGUI/Editor, entre outros. Existem plug-ins para uso com ter, o computador responde com 4, conforme se mostra
abaixo:
a IDE Eclipse e Vim.
> 2+2 [1] 4

Software construdo de modo colaborativo, com novos

pacotes e GUIs includos a cada intervalo de tempo,
antecipando-se at a alguns outros pacotes proprietrios,
como o complemento com o teste de Scott-Knott para a
Anlise de Varincias ANOVA.

Como muitas outras linguagens, a R suporta matrizes aritmticas. A estrutura de dados da R inclui escalares, vetores, matrizes, quadros de dados (similares a tabelas numa
1

4 EXEMPLOS

base de dados relacional) e listas.[15] O sistema de objetos da R extensvel e inclui objectos para, entre outros,
modelos de regresso, sries temporais e coordenadas geoespaciais.
A R suporta programao processual com funes e,
para algumas funes, programao orientada a objetos com funes genricas. Uma funo genrica atua
de forma diferente dependendo do tipo de argumentos que passado. Por outras palavras a funo genrica determina (dispatches) a funo (mtodo) especca para aquele tipo de objeto. Por exemplo, a R tem
uma funo genrica print() que pode imprimir quase
qualquer tipo de objeto em R com uma simples sintaxe
print(nomedoobjeto)".
Enquanto a R maioritariamente usada por estatsticos e
outros utilizadores que requerem um ambiente para computao estatstica e desenvolvimento de software, pode
ser igualmente usada como uma caixa de ferramentas
para clculo matricial geral com benchmarks de desempenho comparveis ao GNU Octave ou ao MATLAB.[16]

4
4.1

Exemplos
Exemplo 1

Os seguintes exemplos ilustram a sintaxe bsica da lngua

e o uso do interface de linha de comando.
Na R, o largamente preferido[17][18][19][20] operador de
atribuio uma seta formada por dois carateres "",
embora "=" possa ser usado em sua vez.[21]
> x c(1,2,3,4,5,6) # Create ordered collection (vector)
> y x^2 # Square the elements of x > print(y) # print
(vector) y [1] 1 4 9 16 25 36 > mean(y) # Calculate
average (arithmetic mean) of (vector) y; result is scalar
[1] 15.16667 > var(y) # Calculate sample variance [1]
178.9667 > lm_1 lm(y ~ x) # Fit a linear regression
model y = f(x)" or y = B0 + (B1 * x)" # store the
results as lm_1 > print(lm_1) # Print the model from
the (linear model object) lm_1 Call: lm(formula =
y ~ x) Coecients: (Intercept) x 9.333 7.000 >
summary(lm_1) # Compute and print statistics for the t
# of the (linear model object) lm_1 Call: lm(formula =
y ~ x) Residuals: 1 2 3 4 5 6 3.3333 0.6667 2.6667
2.6667 0.6667 3.3333 Coecients:
Estimate
Std. Error t value Pr(>|t|) (Intercept) 9.3333 2.8441
3.282 0.030453 * x 7.0000 0.7303 9.585 0.000662
*** --- Signif. codes: 0 *** 0.001 ** 0.01 * 0.05
. 0.1 1 Residual standard error: 3.055 on 4 degrees
of freedom Multiple R-squared: 0.9583, Adjusted
R-squared: 0.9478 F-statistic: 91.88 on 1 and 4 DF,
p-value: 0.000662 > par(mfrow=c(2, 2)) # Request 2x2
plot layout > plot(lm_1) # Diagnostic plot of regression
model

4.2 Exemplo 2
Cdigo R curto calcula o conjunto de Mandelbrot atravs
das primeiras 20 iteraes da equao z = z + c mapeados para diferentes constantes complexas c. Este exemplo
demonstra:
O uso de bibliotecas externas (chamadas pacotes)
desenvolvidas pela comunidade, neste caso, o pacote
caTools
Manipulao de nmero complexo.
Matrizes multidimensionais de nmeros usados
como tipos de dados bsicos, ver variveis C, Z e
X.
library(caTools) # external package providing write.gif
function jet.colors colorRampPalette(c("#00007F,
blue, "#007FFF, cyan, # "#7FFF7F, yellow,
"#FF7F00, red, # "#7F0000)) m 1200 #
dene size C complex( real=rep(seq(1.8,0.6,
length.out=m), each=m ), imag=rep(seq(1.2,1.2,

3
length.out=m), m ) ) C matrix(C,m,m) # reshape as
square matrix of complex numbers Z 0 # initialize
Z to zero X array(0, c(m,m,50)) # initialize output
3D array for (k in 1:50) { # loop with 50 iterations Z
Z^2+C # the central dierence equation X[,,k]
exp(-abs(Z)) # capture results } write.gif(X, Mandelbrot.gif, col=jet.colors, delay=100)

5 Pacotes
As capacidades da R so estendidas atravs de pacotes
criados pelo usurio, que permitem tcnicas estatsticas
especializadas, dispositivos grcos, capacidades de importao/exportao, ferramentas de relatrios, etc. Estes pacotes so primeiro desenvolvidos em R, e por vezes em Java, C e Fortran. Um conjunto bsico de pacotes so includos com a instalao do R, com 5300 pacotes adicionais (a partir de abril 2012) disponveis em
Comprehensive R Archive Network (CRAN), Bioconductor, e outros repositrios.[22]
A pgina Task Views (lista de assuntos) no website da
CRAN lista a vasta gama de aplicaes (Finana, gentica, aprendizagem de mquinas, imagiologia mdica, cincias sociais e estatsticas espaciais) nos quais R tem
sido aplicada e para que pacotes est disponvel.
Outros recursos do pacote R incluem Crantastic, um site
comunitrio para avaliao e reviso de todos os pacotes
CRAN, e tambm R-Forge, uma plataforma central para
o desenvolvimento colaborativo de pacotes R, software
relacionado com R, e projetos. Tem muitos documentos no publicados, pacotes beta e verses de desenvolvimento de pacotes CRAN.
O projeto Bioconductor disponibiliza pacotes R para
a anlise de dados genmicos, tais como Aymetrix e
cDNA de anlise e manipulao de dados orientadas
a objetos, e comeou disponibilizar ferramentas para a
anlise de dados da prxima gerao de mtodos de alto
rendimento de sequenciao.

4.3

Exemplo 3

## Leitura do conjunto de dados. Tambm pode-se usar

read.csv() quando os dados estiverem em arquivos .csv
dados read.table(escreva a localizao do arquivo...,
header=TRUE) %colunas com tratamentos (tratam
c/ titulo) e n-linhas (repet). ## Preparao de dados
dados.vetor c(dados$trat1, dados$trat2, dados$trat3,
dados$trat4) %pode ser com qualquer quantidade de
tratamentos. N gl(trat, repeticoes) %escreva o nmero
de tratamentos e o tratamento com maior nmero de
repeties. dados.vert data.frame(N, dados.vetor)
fator factor(Loc) % fatores so variveis tratadas
como variveis categricas no R. ## Cculo da tabela
ANOVA pre_anova aov(dados.vetor~fator) ANOVA
summary(pre_anova) ## Fazendo teste de Tukey,
teremos:
TukeyHSD(pre_anova, ordered=TRUE)
plot(TukeyHSD(bruto.aov,
ordered=TRUE))
sk5
SK(x=dados, y=dados.vert$dados.vetor, model="y~fator,
which="fator,sig.level=0.05) summary(sk5)

A pesquisa reprodutvel e gerao automtica de relatrios pode ser realizada com pacotes que suportam a execuo de cdigo R incorporado em
LaTeX, OpenDocument format e outros marcadores
(markups).[23]

5.1 Acelerador e ecincia de memria

Teste um pacote jit que disponibiliza compilao JIT, e
outro pacote compilador que oferece um compilador de
byte-code para o R.[24]
Existem diversos pacotes (snow, multicore, parallel) que
disponibilizam paralelismo para o R[25] .
O pacote economiza memria arquivando dados no
disco. As estruturas de dados comportam-se como se estivessem na RAM. O pacote base disponibiliza funes
estatsticas bsicas para o ''.

6 Verses
A lista completa de alteraes mantida no arquivo R
News no site CRAN.[26] Alguns destaques para algumas
das principais verses esto listados abaixo.[carece de fontes?]

9 COMPARAO COM SAS, SPSS E STATA

Interfaces

7.3 Linguagens de Script

As funcionalidades do R foram tornadas acessveis a

partir de diversas linguagens de script como a Python
de interface do RPy[41] ), Perl(pelo mdulo
RGUI vem com uma verso pr-compilada do R (pelo pacote[42]
Statistics::R ), e Ruby (com o rsruby[43] rubygem).
para Microsoft Windows.
PL/R pode ser usado juntamente, ou em vez da lingua Tinn-R Um ambiente de desenvolvimento de c- gem de script PL/pgSQL no sistema de gesto de bases
digo aberto altamente capaz e integrado, com desta- de dados PostgreSQL e Greenplum. Scripts no prprio R
que para a sintaxe semelhante do MATLAB. Dis- so possveis via littler[44] bem como via Rscript.
ponvel apenas para Windows

7.1

Interfaces de usurio grcas

Java Gui for R Editor baseado em Java, multiplataforma e independente de terminais R (tambm
conhecido como JGR).

8 useR! conferncias

Deducer Interface grca para anlise de da- useR!" o nome dado reunio anual ocial dos usuo useR! 2004 em
dos orientado ao uso de menus (similar ao rios do R. O primeiro destes eventos foi
[45]
maio
de
2004,
em
Viena
de
ustria.
Depois de saltar
SPSS/JMP/Minitab).
2005, a conferncia useR tem tido lugar anualmente, al Rattle GUI Interface grca multi-plataforma ba- ternando habitualmente entre localizaes na Europa e na
seada no RGtk2 e criada especicamente para data Amrica do Norte.[46]
mining.
Esta lista das conferncias useR!:
R Commander multi-plataforma baseada em menus orientados sobre interface de usrio grca baseada no tcltk (vrios plug-ins para Rcmdr tambm
esto disponveis).
RapidMiner[31][32]
RExcel usando R e Rcmdr a partir do Microsoft
Excel.
RKWard Interface de usrio grca extensvel e
IDE para R.
RStudio multi-plataforma de fonte aberta IDE
(que tambm pode ser corrida num servidor remoto
linux).
RTVS - Suporte para a linguagem R no Visual Studio da Microsoft fornecido pela Revolution Analytics.
Weka[33] permite a utilizao de recursos de minerao de dados em Weka e anlise estatstica em R.
Existe um nmero especial do Journal of Statistical
Software (de junho de 2012) que discute as interfaces de usurio grcas para o R.

7.2

Editores e IDEs

Editores de texto e ambientes integrados de desenvolvimento (IDEs) com algum suporte para R incluem: Bluesh,[34] Crimson Editor, ConTEXT, Eclipse
(StatET),[35] Emacs (Emacs Speaks Statistics), LyX (mdulos para knitr e Sweave), Vim, Geany, jEdit,[36]
Kate,[37] R Productivity Environment (parte da Revolution R Enterprise),[38] RStudio,[39] TextMate, gedit,
SciTE, WinEdt (R Package RWinEdt) e Notepad++.[40]

useR! 2004, Viena, ustria

useR! 2006, Viena, ustria
useR! 2007, Ames, Iowa, Estados Unidos da Amrica
useR! 2008, Dortmund, Alemanha
useR! 2009, Rennes, Frana
useR! 2010, Gaithersburg, Maryland, Estados Unidos da Amrica
useR! 2011, Coventry, Reino Unido
useR! 2012, Nashville, Tennessee, Estados Unidos
da Amrica
useR! 2013, Albacete, Espanha
useR! 2014, Los Angeles, Califrnia, Estados Unidos da Amrica

9 Comparao com SAS, SPSS e

Stata
O consenso geral que o R se compara bem com outros populares pacotes estatsticos, tais como SAS, SPSS
e Stata.[47] Em janeiro de 2009, o New York Times publicou um artigo sobre o aumento de aceitao do R entre os
analistas de dados e apresentando uma potencial ameaa
para a quota de mercado ocupada por pacotes estatsticos
comerciais, como o SAS.[48]

10

Suporte comercial para o R

Para buscar ajuda na Internet sobre algum conceito:

Em 2007, a empresa Revolution Analytics foi fundada RSiteSearch(conceito)

para disponibilizar suporte comercial para a Revolution
R, a sua distribuio do R, que tambm inclui componentes desenvolvidos pela companhia. Os principais com- 12 Ver tambm
ponentes adicionais incluem: ParallelR, o ambiente de
produtividade IDE para o R, ScaleR[49] (para anlise de
Gretl
grandes dados), DeployR[50] , quadro de servios web, e
a capacidade para ler e escrever dados no formato de ar GNU Octave
quivos do SAS.[51] Em Abril de 2015 a empresa foi ad EViews
quirida pela Microsoft e seus produtos esto sendo gradativamente integrados a servios do Microsoft Azure, a
IGEst
plataforma de cloud computing da Microsoft.[52]
Stata
Em outubro de 2011, a Oracle anunciou o Big Data Appliance, que integra o R, o Apache Hadoop, o Oracle Enterprise Linux, e uma base de dados NoSQL com o hardware Exadata.[53][54][55] O Oracle R Enterprise[56] agora
um dos dois componentes do Oracle Advanced Analytics Option[57] (o outro componente o Oracle Data Mining).
Outros grandes sistemas de software comercial que
suportam conexes ou integrao com o R incluem:
JMP,[58] Mathematica,[59] MATLAB,[60] Spotre,[61]
SPSS,[62] STATISTICA,[63] Platform Symphony,[64] e
SAS[65] .
TIBCO, o atual proprietrio da linguagem S-Plus, est
a permitir que alguns dos seus empregados apoiem ativamente o R participando na sua lista de discusso RHelp (anteriormente mencionada), e pelo patrocnio da
srie useR das reunies de grupos de usurios. A Google
um grande utilizador interno do R e publica um guia
de estilo.[66] Patrocina os projetos R nos seus trabalhos
Summer-of-Code, e tambm suporta nanceiramente as
sries de reunies useR.
RStudio oferece software, educao e servios para a comunidade R.

11

Tutorial Rpido

Para sair do R, digitar q().

Para
procurar
qualquer
help.search(qualquer coisa).

coisa,

digitar

Normalmente, essa procura vai mencionar a biblioteca

necessria para rodar a funo. Para carregar a biblioteca, digitar library(biblioteca).

JMulTi
PSPP
Comparao de pacotes estatsticos

13 Referncias
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Statistics Department, The University of Auckland, Auckland, New Zealand, available from the CRAN website
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[3] Contributors, site www.r-project.org
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2009-04-28. R is also the name of a popular programming language used by a growing number of data analysts
inside corporations and academia. It is becoming their
lingua franca...
[9] David Smith (2012); R Tops Data Mining Software Poll,
Java Developers Journal, May 31, 2012.

possvel escrever comandos em um arquivo e execut- [10] Karl Rexer, Heather Allen, & Paul Gearan (2011); 2011
Data Miner Survey Summary, presented at Predictive
lo, basta digitar source(arquivo).
Analytics World, Oct. 2011.

summary(variavel) d vrias informaes sobre a varivel. Outra forma de obter (ainda mais) informaes
digitando variavel.

[11] Robert A. Muenchen (2012);The Popularity of Data

Analysis Software.

getwd e setwd so usados para informar e alterar o diretrio de trabalho.

[12] Duncan Temple Lang, Calling R from Java, http://www.

nuiton.org/attachments/168/RFromJava.pdf

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[42] page on CPAN
[43] RSRuby rubyforge project
[44] littler web site
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[46] useR! International R User Conference
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[22] Robert A. Muenchen. The Popularity of Data Analysis
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[33] RWeka: An R Interface to Weka. R package version
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[48] Vance, Ashlee (2009-01-07). Data Analysts Captivated

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blogs.technet.com. Consultado em 2016-02-25.
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[55] Timothy Prickett Morgan (2011);Oracle rolls its own
NoSQL and Hadoop Oracle rolls its own NoSQL and Hadoop, The Register, October 3, 2011.
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[57] Doug Henschen (2012);Oracle Stakes Claim in R With
Advanced Analytics Launch, InformationWeek, April 4,
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[58] JMP for Analytical Application Development

[59] integration with R
[60] MATLAB R Link
[61] Integration with S+ and R
[62] RSS Matters
[63] R Language Platform | StatSoft
[64] integrated with Symphony
[65] Functions in the R Language (SAS/IML)
[66] R Style Guide

14

Ligaes externas

The R Project for Statistical ComputingPgina ocial

The CRAN (Comprehensive R Archive Network)
ProjectDownload dos arquivos
Tutorial de RLEG: Laboratrio de Estatstica e Geoinformao da UFPR
The R Reference Manual - Base Packagepara os interessados no desenvolvimento do R

15 FONTES, CONTRIBUIDORES E LICENAS DE TEXTO E IMAGEM

15
15.1

Fontes, contribuidores e licenas de texto e imagem

Texto

R (linguagem de programao) Fonte: https://pt.wikipedia.org/wiki/R_(linguagem_de_programa%C3%A7%C3%A3o)?oldid=

46731050 Contribuidores: Robbot, Alexg, Whooligan, Giro720, Adailton, YurikBot, Porantim, Moretti, Salgueiro, Fvmp, Davemustaine,
Wwwhsd, He7d3r, FSogumo, Econt, Thijs!bot, Rei-bot, Den fjttrade ankan~ptwiki, Alchimista, Albmont, CommonsDelinker, Ricvelozo, TXiKiBoT, VolkovBot, SieBot, Kaktus Kid, Mauriciocamargo68, MenoBot, RadiX, SilvonenBot, !Silent, Vitor Mazuco, Ginosbot,
Numbo3-bot, Thrasherbermensch, Luckas-bot, Ptbotgourou, Salebot, Daemorris, Xqbot, Gean, Rbaliq, RedBot, Marcoapc, MastiBot,
Tuga1143, TobeBot, Rjbot, Henrique Andrade, EmausBot, Beniltoncarvalho, T.seppelt, Nunomnog, Addbot, Afmachado, Flavio M. M.
Barros, Rodrigo Leite Valentin, Httpheaders, Contreiras45 e Annimo: 25

15.2

Imagens

Ficheiro:Heckert_GNU_white.svg Fonte: https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/2/22/Heckert_GNU_white.svg Licena:

CC BY-SA 2.0 Contribuidores: gnu.org Artista original: Aurelio A. Heckert <aurium@gmail.com>
Ficheiro:Mandelbrot_Creation_Animation.gif Fonte: https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/a/a7/Mandelbrot_Creation_
Animation.gif Licena: GFDL Contribuidores: Obra do prprio Artista original: Jarekt
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Ficheiro:Nuvola_apps_edu_mathematics-p.svg Fonte: https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/c/c2/Nuvola_apps_edu_
mathematics-p.svg Licena: GPL Contribuidores: Derivative of Image:Nuvola apps edu mathematics.png created by self Artista original:
David Vignoni (original icon); Flamurai (SVG convertion)
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Calimo
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