CAPTULO 4 GRIFFTS: MAPEAMENTO DE CROMOSSOMOS ECARITICOS POR

RECOMBINAO

Genes ligados: os loci desses genes esto no mesmo cromossomo.

Frequncia de recombinantes menor que 50% - genes esto ligados.
Conformao cis adjacente
Conformao tans opostos
Quanto mais distantes esto os genes, ais proximamente suas frequncias de
recombinao se aproximam de 50%, e, em tais casos, no podemos decidir se os
genes esto ligados ou em cromossomos diferentes.
Pontos quentes de recombinao: locais no genoma onde ocorrem crossing over
mais frequentemente que o usual.
A variao fenotpica baseada em alelos apenas uma parte da variao geral
entre membros individuais de uma populao.
As sequencias de DNA de indivduos diferentes de uma mesma espcie revela uma
variao considervel.
- parte dessa variao afeta o fentipo. Ex: mutaes nulas dentro dos genes
- uma proporo maior da variao de sequencias parece no estar relacionada ao
fentipo. Ex: variao silenciosa.
As variaes so to comuns que muitos indivduos so heterozigotos moleculares
em vrios loci diferentes.
Marcadores moleculares: so loci de heterozigose molecular ou marcadores
genticos: qualquer caracterstica localizada na mesma posio num par de
cromossomos homlogos que nos permite distinguir um cromossomo homlogo do
outro.
Marcadores moleculares diferentes podem ser mapeados um em relao, criando
um mapa que pode agir como uma srie de degraus no caminho para um gene
com um fentipo de interesse.
Os dois tipos principais de marcadores moleculares usados no mapeamento so
polimorfismos de um s nucleotdeo e polimorfismos de tamanho de sequencia
simples.
Polimorfismos de um s nucleotdeo (SNP): as sequencias de pessoas diferentes
so 99,9% idnticas e 0,1% diferentes. Quase toda a diferena baseada em
diferenas de um nico nucleotdeo, por isso tais diferenas so chamadas de
polimorfismos de nucleotdeo nico. Acredita-se que em humanos existam 3
milhes de SNP, dando um conjunto til de marcadores para mapeamento.
- SNP silenciosos dentro de genes: no possuem efeito aparente no fentipo, mas
so uteis como marcadores de alelos em particular.
- SNP nos quais um alelo de SNP causa um fentipo mutante mostrando herana
monognica.
- SNP em poligenes: teis em descobrir poligenes.
- RFLP: so SNP localizados no sitio ativo de uma enzima de restrio.
Hapltipo: um segmento cromossmico definido por um arranjo especfico de
alelos SNP que ele leva. So ilhas de baixa frequncia de recombinao separadas
por pontos quentes de recombinao.
- a nvel populacional os hapltipos so herdados por geraes como blocos.
- com o passar do tempo o crossing dever romper os hapltipos.
- por isso, os alelos SNP de um hapltipo so ditos como tendo desequilbrio de
ligao.
- devido ao desequilbrio de ligao, os hapltipos podem ser usados para revelar
a posio de um mapa de um gene de interesse. O mecanismo baseado no

princpio de que para loci proximamente ligados, as combinaes allicas tendem

a ser herdadas juntas.
-os hapltipos podem ser usados para rastrear segmentos genmicos atravs de
geraes e correlacionar esses segmentos a caractersticas com limiar.
- as similaridades de hapltipos em famlias ou populaes podem ser usadas em
analise estatsticas para detectar poligenes.
SNP e analise de ligao de hapltipo so muito promissores para encontrar
poligenes, possuem grande potencial para encontrar genes subjacentes tanto a
variao contnua quanto a caractersticas com limiar.
- modelo polignico: condio que no se expressa at que a dose de poligenes
ultrapasse um limiar.
Polimorfismos de comprimento de sequencias simples (SSLP) ou repeties em
tandem de nmero varivel ou VNTR: a maioria dos genomas contem uma grande
quantidade de DNA repetitivo. A caracterstica que as torna teis que em
indivduos diferentes, existem geralmente nmeros diferentes de cpias.
- dois tipos de SSLP so uteis no mapeamento e em outra anlise do genoma:
minissatlite e marcadores microssatlite.
- SSLP comumente tm alelos mltiplos
Marcadores minissatlites:
- fingeprints de DNA: fragmentos de tamanhos diferentes so altamente
individualistas: valor forense.
- se os genitores diferem em determinada banda, ento essa diferena torna-se
um stio heterozigoto que pode ser usado no mapeamento de um gene ligado de
interesse.
Marcadores microssatlites: baseado em nmeros de repeties em tandem de
uma sequencia mais simples, geralmente um dinucleotdeo.
- CA o tipo mais comum.
- os alelos microssatlites so revelados pela sntese de uma rplica da regio
repetitiva com o uso de uma tcnica chamada PCR.
- uso de primers direcionais - sntese entre os primers.
CAPTULO 17: GENTICA DE POPULAES

Gentica de populaes envolve perguntas como sobre o que determina a

composio gentica das populaes e como se espera que essa composio
possa mudar com o tempo em decorrncia das vrias foras que nela operam
Composio gentica de uma populao a coleo de gentipos diferentes nessa
populao.
Foras:
- padres de reproduo aleatria ou endogamica;
-migraes;
- mutaes;
- recombinaes;
- seleo natural;
- flutuaes aleatrias -> deriva gentica.

CAPTULO 15 - GRIFFTITHS: MUTAO REPARO E RECOMBINAO

Dois processos importantes so responsveis pela variao gentica: mutao e
recombinao.

 Mutaes de ponto: alterao de um nico par de bases do DNA ou um pequeno

nmero de pares de bases adjacentes.
- dois tipos principais de mutaes de ponto so as substituies de bases, as
inseres e as delees.
as substituies de bases podem ser:
-transies: substituio por uma base da mesma categoria qumica.
- transverses: substituio por uma base de outra categoria qumica.
- as transies e a transverses podem ser:
1. mutao sinnima ou silenciosas-> h produo do mesmo aminocido;
2. mutao de sentido trocado (conservativa)-> produo de um aminocido
quimicamente semelhante;
3. mutao de sentido trocado (no-conservativa)-> produo de um
aminocido quimicamente diferente;
4. mutao sem sentido -> cdon finalizador.
Quanto mais perto a mutao sem sentido estiver da ponta 3 da matriz de leitura
aberta, mais provvel que a protena resultante possa ter alguma atividade
biolgica.
As delees e inseres, tambm chamadas de mutaes indel, provocam
mudana na matriz de leitura.
As consequncias moleculares das mutaes de ponto em uma regio nocodificante dependem se a mutao perturbar ou (criar) um stio de ligao, como
por exemplo o stio ao qual se liga a RNA polimerase.
Mutaes espontneas: so as de ocorrncia natural e ocorrem em todas as
clulas.
Mutaes induzidas: surgem pela ao de alguns agentes, chamados de
mutgenos.
Mecanismos de mutaes espontneas por erros na replicao do DNA:
- as bases do DNA possuem tautmeros a forma ceto est normalmente presente
no DNA, enquanto as formas imino e enol so raras.
- as formas imino e enol podem parear com a base errada, formando um mal
pareamento.
- os mal pareamentos tambm podem ocorrer quando uma das base torna-se
ionizada, sendo esse tipo de mal pareamento o mais frequente.
- os mal pareamentos representam mutaes de transio.
Mecanismos de mutaes espontneas por leses espontneas:
- duas das mais frequentes leses espontneas resultam de depurinao e
desaminao.
- depurinao consiste na interrupo da ligao glicosdica entre a base e a
desoxirribose, provocando a perda de uma base purina (guanina ou adenina).
- a desaminao de citosina produz uracil que no reparado ir parear com
adenina na replicao.
Mecanismos de mutagnese:
- os mutgenos induzem mutaes por pelo menos trs mecanismos diferentes:
1. Substituir uma base incorporao de anlogos de bases que mimetizam
bases normais.
2. Alterar um base agentes alquilantes (ex: EMS), agentes intercalares (ex:
proflavina e acridina laranja)
3. Danificar uma base
luz ultravioleta -> fotoprodutos (ex: fotodmero de pirimidina
ciclobutano e o fotoproduto unio de pirimidinas adjacentes no mesmo
filamento).

- radiao ionizante -> produo de espcies radioativas de oxignio,

como H2O2
-> quebra de ligaes N-glicosdicas, levando a
formao de stios apurnicos ou apirimidnicos (liberao da base) e pode
causar quebras filamentares (ex: aflatoxina B1)
Mecanismos biolgicos de reparo:
- reverso direta de DNA danificado:
-ex: CPD fotodialise repara o dmero de pirimidina ciclobutano. Esse
mecanismo denominado fotorreativao porque a enzima requer luz para
funcionar.
- ex; alquiltransferases.
- sistemas de reparo dependentes de homologia:
- importantes sistemas de reparo exploram as propriedades de
complementariedade antiparalela para restaurar segmentos danificados de DNA a
seu estado inicial no danificado(esses sistemas promovem a remoo e a
substituio de uma ou mais bases).
1. Sistemas de reparo por exciso de base:
- mecanismo mais importante para remover bases incorretas ou
danificadas;
- principal alvo o dano no-volumoso de bases que pode resultar de,
por exemplo, metilao, desaminao, oxidao ou perda espontnea.
- o reparo feito por DNA glicosidases que cortam ligaes baseaucar, liberando as bases alteradas e gerando stios apurnicos ou
apirimidnicos (AP).
- uma enzima chamada AP endonuclease ento corta o filamento
danificado antes do stio AP;
- uma terceira enzima desoxirribosefosfodiesterase remove o trecho
acar-fosfato;
- DNA polimerase pode preencher o espao com nucleotdeos
complementares ao outro filamento;
- DNA ligase une o novo nucleotdeo.
* os eventos de desaminao espontnea de citosina em uracil podem ser
reconhecidos como anormais porque a uracil no um constituinte normal do DNA.
2. Reparo por exciso de nucleotdeo.
- podem corrigir danos volumosos
- a parada da forquilha de replicao e a parada dos complexos de
transcrio ativam essa via de reparo.
- fases:
- reconhecimento das bases danificadas
- montagem de um complexo multiproteico no local;
- cortar o filamento danificado em local antecedente e remoo dos
nucleotdeos;
- uso do filamento no-danificado como molde para a DNA
polimerase seguido de ligao do filamento.
3. Reparo ps replicao: reparo de mal pareamento.
- protena MutS: reconhece o dano no DNA recm-replicado;
- MutH: corta o filamento contendo a base incorreta. Como distinguir o
filamento recm sintetizado do antigo? O recm-sintetizado ainda no

teve tempo de ser metilado pela enzima adenina metilase antes de ser
identificado pela MutH.
- MutL: promove o dobramento do DNA para possibilitar a interao da
MutS com a MutH.
CAPTULO 11- THOMPSON: FUNDAMENTOS DE DOENA MOLECULAR
Uma doena molecular aquela em que o principal evento causador uma
mutao.