Relatrio da Aula Prtica 2

Disciplina de Qumica Farmacutica II

Energia Alunas: Camila Salim (6787698)

Diedr Acetilcoli Metacoli Juliana Prado (6787430)
o () na na
0 19,810925 21,1425
30 17,650728 20,327843
60 15,106766 20,27387 Diedro x Energia
90 15,021276 21,91769
30
120 16,47489 27,082577
28
150 15,104807 22,893017
180 13,833596 19,311544 26
210 15,083631 17,896547 24 Acetilcolina
240 16,477793 18,003403 22 Metacolina
270 15,050628 15,790755 20
300 15,117792 15,805648 18
330 17,650761 18,752548 16
360 19,810925 21,1425 14
12
0 50 100 150 200 250 300 350

Questo 1.) O objetivo desta prtica foi realizar uma anlise conformacional das molculas
de Acetilcolina e Metacolina. Para tal utilizamos o software HyperChem. Primeiramente a
molcula foi construda com uma geometria aleatria, com uma energia global qualquer, em
seguida foi feita uma otimizao da estrutura molecular de modo que a nova geometria
garantia uma conformao de mnima energia. Com a molcula otimizada, iniciamos a anlise
da barreira rotacional referente ao diedro N-C-C-O: diferentes angulaes (0, 30, 60, 90, 120,
150, 180, 210, 240, 270, 300 e 330 graus) foram atribudas ao diedro e para cada ngulo a
molcula foi otimizada e teve sua energia global registrada. Os valores de Energia para cada
ngulo das duas molculas esto disponveis no grfico acima.

Questo 2.) A Mecnica Molecular um dos mtodos que tem sido mais utilizados para
modelar estruturas moleculares e energias conformacionais na elucidao de problemas
experimentais em Qumica e Bioqumica. Ela caracterizada por considerar os movimentos
nucleares e por tratar os eltrons indiretamente, diferindo dos mtodos qunticos de orbitais
moleculares, caracterizados por estudar a estrutura eletrnica, para uma posio nuclear fixa.
Na Mecnica Molecular suposto que a densidade eletrnica pode ajustar-se
instantaneamente a qualquer alterao na configurao geomtrica dos ncleos, assumindo
que os ncleos possuem movimentos livres e que todas as interaes nucleares so aditivas.
A superfcie de Born-Oppenheimer (superfcie de energia potencial) multidimensional e
descreve a energia de uma molcula em termos de posies nucleares. Esta superfcie possui
mnimos locais em relao a uma ou algumas conformaes moleculares estveis, e em uma
primeira aproximao, a molcula descrita pela estrutura correspondente ao mnimo global
da superfcie potencial.
Clculos de mecnica molecular utilizam uma srie de equaes derivadas empiricamente
para a superfcie de Born-Oppenheimer, cujo formalismo matemtico est baseado num
modelo de mecnica clssica de estrutura molecular.
O modelo da mecnica molecular considera as molculas como uma coleo de tomos
ligados entre si por foras elsticas ou harmnicas. Estas foras so descritas pelas funes
de energia potencial das contribuies estruturais, e.g. comprimentos de ligao (r), ngulos
de ligao (q), ngulos diedros (f) e interaes no ligadas (d). O conjunto destas funes
conhecido como campo de fora emprico. O campo de fora representa a energia potencial
molecular em relao a uma geometria de referncia, em um determinado sistema de
coordenadas:

U = S U(r) + S U(q) + S U(f) + S U(d) + ...

A energia, U, de uma molcula, dentro do campo de fora, a soma de todas as contribuies

de energia, onde U , algumas vezes, conhecido como energia estrica da molcula e
considerada como a diferena entre a energia da molcula real e a energia da molcula
hipottica. Nesta ltima todos os parmetros estruturais so exatamente os valores ideais ou
"naturais", definidos para uma situao hipottica onde no existem quaisquer tenses entre
as coordenadas internas do sistema molecular. Outras interaes intramoleculares que
afetam a energia, como as interaes eletrostticas ou ligaes hidrognio, tambm podem
ser adicionadas ao campo de fora, assim como as interaes cruzadas, representadas pelos
chamados termos cruzados, as quais consideram um certo nmero de interaes entre
comprimentos de ligao, ngulos de ligao, ngulos diedros, interaes carga-carga e
interaes dipolo-dipolo.
No existem regras rgidas acerca do nmero ou tipos de funes de energia potencial a
serem empregados. Esta escolha feita de acordo com as propriedades moleculares
selecionadas reproduzir. Dependendo da funo de energia potencial so permitidas as
seguintes opes:
a) clculos das propriedades geomtricas;
b) clculos das propriedades geomtricas e vibracionais;
c) clculos das propriedades geomtricas e termodinmicas;
d) clculos das propriedades geomtricas, vibracionais e termodinmicas.
As expresses da energia potencial desenvolvidas para clculos de mecnica molecular so
todas descendentes de trs tipos bsicos de campo de fora:
Campo de Fora Central - considera apenas distncias interatmicas (inclusive comprimentos
de ligao).
Campo de Fora de Valncia Geral - considera comprimentos e ngulos de ligao, ngulos
diedros, coordenadas de deformao fora do plano e adicionam os termos cruzados.
Campo de Fora de Urey-Bradley - considera comprimentos e ngulos de ligao, ngulos
diedros, coordenadas de deformao fora do plano e as interaes entre tomos ligados por
um centro comum.
Enquanto propriedades como geometrias moleculares de energias mnimas, alturas de
barreiras de rotao interna, entalpias de formao e funes termodinmicas so bem
reproduzidas por um campo de fora de valncia simples (campo de fora central, incluindo
os ngulos de ligao, ngulos diedros e coordenadas de deformao fora do plano), o mesmo
no acontece com as propriedades vibracionais, principalmente nmeros de onda, os quais
normalmente para serem bem reproduzidos necessitam da incluso das interaes entre
tomos ligados por um centro comum, interaes entre tomos no ligados e/ou das
interaes cruzadas.

Questo 3.) Se todos os tomos ficassem livres (o diedro no fosse fixado), no momento de
otimizao, a molcula adquiriria a conformao de menor energia possvel, ou seja, o
mnimo global. No seria possvel a verificao da energia da molcula na conformao com
os graus sugeridos na rotao dos substituintes, pois at mesmo o diedro atingiria a sua
conformao de mais baixa energia, que seria sempre a mesma. Sendo assim, ao invs de
obtermos variaes de energias para cada ngulo, obteramos sempre o mesmo valor de
energia, no sendo possvel medir a energia a cada variao angular.

Questo 4.) Conforme observado no grfico acima, a molcula que apresentou pico de mais
alta energia foi a metacolina, com ngulo didrico de 120. Isso ocorreu devido a grande
aproximao de dois grupos volumosos (os grupos metilas), o que acarretou uma alta
repulso estrica entre eles, promovendo uma conformao de energia desfavorvel (alta
energia).

Questo 5.) O ngulo do diedro N-C-C-O da acetilcolina com menor energia do grfico o
180, no entanto ele no corresponde ao mnimo global de energia e sim ao mnimo local de
energia. Esta anlise foi feita com um intervalo de 30 para os valores de diedro, sendo assim
o valor de mnimo global de energia no necessariamente corresponde ao diedro de 180,
podendo ser referente a algum valor entre 150 e 180 ou entre 180 e 210, por exemplo. O
valor de mnimo global de energia foi obtido na primeira vez em que a molcula foi otimizada,
sem que fosse fixada nenhuma ligao.