A síntese proteica consome mais energia da célula do que qualquer outro

processo metabólico. Por sua vez, as proteínas representam mais massa do que
qualquer outro componente de organismos vivos (com exceção da água) e as
proteínas desempenham praticamente todas as funções de uma célula. O
processo de tradução, ou síntese proteica, envolve a decodificação de uma
mensagem de mRNA para um produto polipeptídico. Os aminoácidos são
covalentemente encadernados entre si por interligação de ligações peptídicas
em comprimentos variando de aproximadamente 50 resíduos de aminoácidos
a mais de 1.000. Cada aminoácido indivíduo tem um grupo amino (NH2 ) e
um grupo carboxilo (COOH). Os polipéptidos são formados quando o grupo
amino de um aminoácido forma uma ligação amida (isto é, péptido) com o
grupo carboxilo de outro aminoácido. Esta reação é catalisada por ribossomos
e gera uma molécula de água.
Uma ligação peptídica liga a extremidade carboxilo de um aminoácido com a
extremidade amino de outro, expulsando uma molécula de água. Para
simplificar nesta imagem, apenas os grupos funcionais envolvidos na ligação
peptídica são mostrados. As designações R e R referem-se ao resto de cada
estrutura de aminoácidos.
Uma máquina de sintetizar proteína
Além do modelo de mRNA, muitas moléculas e macromoléculas contribuem
para o processo de tradução. A composição de cada componente pode variar
entre as espécies; por exemplo, os ribossomos podem consistir em diferentes
números de rRNAs e polipéptidos dependendo do organismo. No entanto, as
estruturas e funções gerais da maquinaria de síntese proteica são comparáveis
de bactérias a células humanas. A tradução requer a entrada de um modelo de
mRNA, ribossomos, tRNAs e vários fatores enzimáticos.
Ribossomos
Mesmo antes de um mRNA ser traduzido, uma célula deve investir energia
para construir cada um dos seus ribossomos. Em E. coli , existem entre 10.000
e 70.000 ribossomos presentes em cada célula em qualquer momento. Um
ribossomo é uma macromolécula complexa composta por rRNA estruturais e
catalíticos e muitos polipéptidos distintos. Em eucariotas, o nucléolo é
completamente especializado para a síntese e montagem de rRNAs.
 Ribossomo-é-composto-por-
duas-subunidades
Os ribossomos existem no citoplasma nos procariotos e no citoplasma e
retículo endoplasmático áspero em eucariotas. As mitocôndrias e os
cloroplastos também possuem seus próprios ribossomos na matriz e no
estroma, que parecem mais parecidos com os ribossomos procarióticos (e têm
sensibilidade similar aos fármacos) do que os ribossomos que se encontram
fora das suas membranas externas no citoplasma. Os ribossomos se dissociam
em subunidades grandes e pequenas quando não estão sintetizando proteínas e
se associam durante o início da tradução. Em E. coli, a subunidade pequena é
descrita como 30S, e a subunidade grande é 50S, para um total de 70S
(lembre-se de que as unidades Svedberg não são aditivos). Os ribossomos de
mamíferos têm uma pequena subunidade 40S e uma grande subunidade 60S,
para um total de 80S. A subunidade pequena é responsável por ligar o modelo
de mRNA, enquanto a subunidade grande se liga sequencialmente o tRNAs.
Cada molécula de mRNA é traduzida simultaneamente por muitos
ribossomos, todas as proteínas de síntese na mesma direção: leitura do mRNA
de 5 ‘a 3’ e síntese do polipéptido do terminal N ao terminal C. A estrutura
completa de mRNA / poli-ribossomos é chamada de polissomo como na
imagem abaixo.

tRNAs
Os RNAt são moléculas de RNA estrutural que foram transcritas a partir de
genes pela RNA polimerase III. Dependendo da espécie, existem 40 a 60 tipos
de RNAt no citoplasma. Servindo como adaptadores, tRNAs específicos se
ligam a seqüências no modelo de mRNA e adicionam o aminoácido
correspondente à cadeia polipeptídica. Portanto, os tRNAs são as moléculas
que realmente “traduzem” a linguagem do RNA na linguagem das proteínas.
Dos 64 codões de mRNA possíveis – ou as combinações de três nucleotídeos
de A, U, G e C-3 especificam o término da síntese proteica e 61 especificam a
adição de aminoácidos à cadeia de polipéptidos. Destes 61, um codão (AUG)
também codifica o início da tradução. Cada anticódon do tRNA pode basear
par com um dos codões de mRNA e adicionar uma tradução de aminoácidos
ou terminar, de acordo com o código genético. Por exemplo, se a seqüência
CUA ocorreu em um modelo de mRNA no quadro de leitura apropriado, ele
iria ligar um tRNA que expressa a sequência complementar, GAU, que seria
ligada ao aminoácido leucina.
Como as moléculas adaptadoras da tradução, é surpreendente que os tRNAs
possam caber tanto especificidade em um pacote tão pequeno. Considere que
os tRNAs precisam interagir com três fatores:
1.  devem ser reconhecidos pela aminoacilo sintetase correta;
2. devem ser reconhecidos pelos ribossomos; e
3.  devem se ligar à sequência correta no mRNA.
O aminoacil tRNA sintetase
O processo de síntese tRNA pela RNA polimerase III apenas cria uma porção
de RNA da molécula adaptadora. O aminoácido correspondente deve ser
adicionado mais tarde, uma vez que o tRNA é processado e exportado para o
citoplasma. Através do processo de tRNA “carregar”, cada molécula de tRNA
está ligada ao seu aminoácido correto por um grupo de enzimas chamadas
aminoacil tRNA sintetase . Pelo menos um tipo de aminoacil tRNA sintetase
existe para cada um dos 20 aminoácidos; o número exato de aminoácidos
tRNA sintetases varia de acordo com as espécies.
Estas enzimas primeiro se ligam e hidrolisam ATP para catalisar uma ligação
de alta energia entre um aminoácido e monofosfato de adenosina (AMP); uma
molécula de pirofosfato é expulso nesta reação. O aminoácido ativado é então
transferido para o RNAt, e o AMP é liberado.
O Mecanismo de síntese proteica
Tal como acontece com a síntese de mRNA, a síntese proteica pode ser
dividida em três fases: iniciação, alongamento e término. O processo de
tradução é semelhante em procariotas e eucariotas. Aqui vamos explorar como
ocorre a tradução em E. coli , um procarioto representativo e especificar
quaisquer diferenças entre a tradução procariótica e eucariótica.
Iniciação da Tradução
A síntese de proteínas começa com a formação de um complexo de iniciação.
Em E. coli , este complexo envolve o pequeno ribossomo 30S, o modelo de
mRNA, três fatores de iniciação (IFs, IF-1, IF-2 e IF-3), e um iniciador
especial tRNA chamado tRNA. O iniciador tRNA interage com o códon de
início AUG (ou raramente, GUG), liga-se a uma metionina chamada fMet e
também pode ligar IF-2.
No mRNA de E. coli , uma seqüência a montante do primeiro codão AUG,
chamado de sequência Shine-Dalgarno (AGGAGG), interage com as
moléculas de rRNA que compõem o ribossomo. Essa interação âncora a
subunidade ribossômica 30S no local correto no modelo de mRNA. O
trifosfato de guanosina (GTP), que é um trifosfato de nucleótido de purina,
atua como fonte de energia durante a tradução – tanto no início do
alongamento quanto durante a translocação do ribossomo.
Em eucariotas, um complexo de iniciação semelhante forma, compreendendo
mRNA, a subunidade ribossômica pequena 40S, IFs e nucleósidos trifosfatos
(GTP e ATP). O iniciador carregado tRNA, chamado Met-tRNA i , não liga
fMet em eucariotas, mas é distinto de outros Met-tRNAs na medida em que
pode ligar FIs.
Tradução de proteínas
Nos procariotas e eucariotas, os fundamentos do alongamento são os mesmos,
então analisaremos o alongamento na perspectiva de E. coli . A subunidade
ribossomal 50S de E. coli consiste em três compartimentos: o sítio A
(aminoacil) liga os tRNAs aminoácidos carregados recebidos. O sítio P
(peptidil) liga os tRNAs carregados que transportam aminoácidos que formam
ligações peptídicas com a cadeia polipeptídica em crescimento, mas ainda não
se dissociaram do seu tRNA correspondente. O site E (saída) libera tRNAs
dissociados para que possam ser recarregados com aminoácidos livres. Existe
uma exceção a esta linha de montagem de tRNA.
Durante o alongamento da tradução, o modelo mRNA fornece especificidade.
À medida que o ribossomo se move ao longo do mRNA, cada codão do
mRNA entra em registro e é assegurada a ligação específica com o
correspondente tRNA anticódon carregado. Se o mRNA não estivesse
presente no complexo de alongamento, o ribossomo ligaria os RNAt de forma
não específica.
O alongamento prossegue com tRNAs carregados entrando no site A e depois
deslocando para o site P seguido pelo site E com cada “passo” de códon único
do ribossomo. Os passos ribossômicos são induzidos por mudanças
conformacionais que avançam o ribossomo por três bases na direção 3 ‘. A
energia para cada passo do ribossomo é doada por um fator de alongamento
que hidrolisa GTP.
Ligações peptídicas formam-se entre o grupo amino do aminoácido ligado ao
RNAt do sítio A e o grupo carboxilo do aminoácido ligado ao tRNA do site P.
A formação de cada ligação peptídica é catalisada pela peptidil transferase,
uma enzima baseada em RNA que é integrada na subunidade ribossômica
50S. A energia para cada formação de ligação peptídica é derivada da
hidrólise de GTP, que é catalisada por um fator de alongamento separado. O
aminoácido ligado ao tRNA do site P também está ligado à cadeia
polipeptídica em crescimento. À medida que o ribossomo passa através do
mRNA, o antigo RNAt do P-site entra no site E, se destaca do aminoácido e é
expulso. Surpreendentemente, o aparelho de tradução de E. coli leva apenas
0,05 segundos para adicionar cada aminoácido, o que significa que uma
proteína de 200 aminoácidos pode ser traduzida em apenas 10 segundos.
A terminação da tradução ocorre quando um codão sem sentido (UAA, UAG
ou UGA) é encontrado. Após o alinhamento com o site A, esses códon sem
sentido são reconhecidos por fatores de liberação em procariotas e eucariotas
que indicam a peptidil transferase para adicionar uma molécula de água à
extremidade carboxílica do aminoácido do site P. Esta reação força o
aminoácido do site P para se separar do seu RNAt, e a proteína recém-
produzida é liberada. As subunidades ribossômicas pequenas e grandes se
dissociam do mRNA e umas das outras; eles são recrutados quase
imediatamente em outro complexo de iniciação da tradução. Depois que
muitos ribossomos completaram a tradução, o mRNA é degradado para que os
nucleotídeos possam ser reutilizados em outra reação de transcrição.
Enovelamento, modificação e segmentação
Durante e após a tradução, os aminoácidos individuais podem ser
quimicamente modificados, as sequências de sinal podem ser anexadas e a
nova proteína “se dobra” em uma estrutura tridimensional distinta como
resultado de interações intramoleculares. Uma sequência de sinal é uma
queda curta de aminoácidos que direciona uma proteína para um
compartimento celular específico. Essas sequências na extremidade amino ou
na extremidade carboxílica da proteína podem ser pensadas como o “bilhete
de trem” da proteína para seu destino final. Outros fatores celulares
reconhecem cada seqüência de sinal e ajudam a transportar a proteína do
citoplasma para o compartimento correto. Por exemplo, uma sequência
específica no terminal amino direciona uma proteína para as mitocôndrias ou
cloroplastos (em plantas). Uma vez que a proteína atinge seu destino celular, a
seqüência de sinal geralmente é cortada.

Muitas proteínas se dobram espontaneamente, mas algumas proteínas

requerem moléculas auxiliares, chamadas chaperonas, para evitar que elas se
agregam durante o complicado processo de dobramento. Mesmo que uma
proteína seja devidamente especificada pelo seu mRNA correspondente, pode
assumir uma forma completamente disfuncional se as condições anormais de
temperatura ou pH impedem que ele se dobre corretamente.
Resumo da aula Síntese proteica – Resumo
Os agentes durante a tradução incluem o de mRNA, ribossomos, tRNAs e
vários fatores enzimáticos. A subunidade ribossômica pequena se forma no
modelo de mRNA tanto na sequência de Shine-Dalgarno (procariotas e
eucariotas). A tradução começa no AUG iniciante no mRNA, especificando
metionina. A formação de ligações peptídicas ocorre entre os aminoácidos
sequenciais especificados pelo modelo mRNA de acordo com o código
genético. Os tRNAs carregados entram no sítio ribossômico A e os seus
aminoácidos se unem com o aminoácido no local P. O mRNA inteiro é
traduzido em “passos” de três nucleotídeos do ribossomo. Quando um códon
sem sentido é encontrado, um fator de liberação liga e dissocia os
componentes e libera a nova proteína. O dobramento da proteína ocorre
durante e após a tradução.
Deixe seus comentário do que achou da aula Síntese proteica – Resumo.
referências da aula Síntese proteica – Resumo.
https://www.youtube.com/watch?v=p3wHBLW-Yvw