Química Geral e Inorgânica

Licenciatura em Farmácia.
Unidade Curricular: Química Geral e Inorgânica.
1ºAno – 1º Semestre.

Relatório de Trabalho nº2

Atividade Laboratorial: “Editar e Visualizar Moléculas com
Software Avogadro”

Docente Responsável: Prof. Wenli Wang

Efetuado por:
Miguel Filipe Cabrita Monteiro nº7236
Data de Realização: 29/10/2021

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I. Método e técnicas:
1. Instalação do programa: Site: https://avogadro.cc/
2. Utilização do programa: • Abrir e notar a estrutura de menus, tool &
display settings. • Verificar procedimentos usuais: editar moléculas,
optimizar a geometria, exportar imagens. • Explorar as técnicas para
navegar, manipular, selecionar, rodar (autorrotação), centrar.
3. Procedimento para editar uma molécula:
1) Escreva a estrutura de Lewis da molécula para saber i) os átomos
envolvidos; ii)tipos das ligações entre os átomos; iii) geometria prevista
com RPEV.
2) Em modo de “Draw Tool”, escolha “Ball and Stick” e “Label” na opção
de “Display Types” e desactive a opção de “Adjust Hydrogens”.
3) Adicione o átomo central.
4) Adicione os átomos periféricos com a opção correcta de “Bond Order”
(sem considerar a geometria final).
5) Em modo “Auto Optimization Tool”, escolha a opção UFF para “Force
Field” (para uma molécula orgânica, MMFF94s é a melhor opção).
Carregue no botão “Start” para optimizar a geometria. Carregue “Stop”
quando não há mais movimentos nos átomos.
6) No menu principal, escolha “View” → “Properties” → “Bond
Properties”. Registe os valores dos comprimentos da ligação.
7) No menu principal, escolha “View” → “Properties” → “Angle
Properties”. Registe os valores dos ângulos formados entre as ligações.
8) No modo “Nevagation Tool”, mexa e gire a molécula para ter uma
imagem que melhor revela a geometria da molécula.
9) No menu principal, escolhe “File” → “Export” → “Graphics…”. E salve
a imagem da molécula em formato adequado.

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II. Procedimento Laboratorial:

a) 3 átomos):
Uma molécula da geometria “Linear” (com

CO2:
1. Imagem da Molécula com Geometria Otimizada:

2. Distância da ligação: (O-C) R=1,196Å

3. Ângulo entre as ligações: (O-C-O) Ang.¿ 180 °

4. Estrutura de Lewis:

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5. Pela Teoria da Ligação de Valência:

Formam-se duas ligações do tipo σ entre o átomo de Carbono
(C) e os dois átomos de Oxigénio (O). A ligação 𝜎 é formada
pela sobreposição de uma orbital com sp do átomo de Carbono
e uma orbital p do átomo de Oxigénio.

b) Uma molécula da geometria

“Angular” (com 3 átomos):

H2O:
1. Imagem da Molécula com Geometria Otimizada:

2. Distância da ligação: (O-H) R= 0,990 Å

3. Ângulo entre as ligações: (H-O-H) Ang.= 104,5°

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4. Estrutura de Lewis:

5. Pela Teoria da Ligação de Valência:

Formam-se duas ligações do tipo 𝜎 entre o Oxigénio (O) e o
Hidrogénio (H). A ligação 𝜎 forma-se pela sobreposição de
uma orbital p do átomo de Oxigénio e uma orbital s do átomo
de Hidrogénio

c) Uma molécula da geometria “Trigonal

Plana” (com 4 átomos):

CH2O:

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1. Imagem da Molécula com Geometria Otimizada:

2. Distância da ligação: (O-C) R=1,219 Å; (H-C) R=1,08 Å

3. Ângulo entre as ligações: (O=C-H) Ang.= 120° ; (H-C-H)

Ang.= 120° .

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4. Estrutura de Lewis:

5. Pela Teoria da Ligação de Valência:

São três ligações tipo σ entre o átomo C e os dois átomos de H
e um de O. As ligações σ são formadas pela sobreposição de
uma orbital sp2 do átomo C e uma orbital 1s de cada átomo de
H e pela sobreposição de uma orbital sp2 do átomo C e uma
orbital 2p do átomo de O. Existe ainda uma ligação tipo π
entre o átomo C e o átomo O. A ligação π é formada pela
sobreposição de uma orbital 2p do átomo C e uma orbital 2p
do átomo de O.

d) Uma molécula da geometria

“Pirâmide Trigonal” (com 4 átomos):

NH3:

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1. Imagem da Molécula com Geometria Otimizada:

2. Distância da ligação: (H-N) R= 1,04 Å

3. Ângulo entre as ligações: (H-N-H) Ang.= 108°

4. Estrutura de Lewis:

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5. Pela Teoria da Ligação de Valência:

Formam-se três ligações tipo 𝜎 entre o Azoto (N) e os três
átomos de Hidrogénio (H). A ligação 𝜎 é formada pela
sobreposição de uma orbital sp3 do átomo Azoto e uma orbital
s do átomo Hidrogénio.

e) Uma molécula da geometria “Forma de T”

(molécula com 4 átomos):

BrF3:
1. Imagem da Molécula com Geometria Otimizada:

2. Distância da ligação: (F-Br) R= 1,848 Å

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3. Ângulo entre as ligações: (F1-Br-F2) Ang.= 180° ; (F1-Br-F3

e F2-Br-F3) Ang=90°

4. Estrutura de Lewis:

5. Pela Teoria da Ligação de Valência:

Formam-se três ligações do tipo σ entre cada átomo de Bromo
e cada átomo de Flúor. Cada ligação σ entre Br – F é formada
pela sobreposição da orbital sp3 do átomo de Bromo (Br) e
pela orbital sp3 do átomo de Flúor (F).

f) Uma molécula da geometria “Tetraédrico”

(molécula com 5 átomos):

CH4:

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1. Imagem da Molécula com Geometria Otimizada:

2. Distância da ligação: (H-C) R=1,109 Å

3. Ângulo entre as ligações: (H-C-H) Ang.= 109,5°

4. Estrutura de Lewis:

5. Pela Teoria da Ligação de Valência:

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Formam-se quatro ligações do tipo 𝜎 entre o Carbono (C) e os

quatro átomos de Hidrogénio (H). A ligação 𝜎 é formada pela
sobreposição de uma orbital sp3 de Carbono e uma orbital 1s
de Hidrogénio.

g) Uma molécula da geometria “Quadrado

Plana” (molécula com 5 átomos):

XeF4:
1. Imagem da Molécula com Geometria Otimizada:

2. Distância da ligação: (F-Xe) R=1,92 Å

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3. Ângulo entre as ligações (F1-Xe-F3,F1-Xe-F4,F2-Xe-F3,F2-

Xe-F4) Ang.= 90° ; (F1-Xe-F2 e F3-Xe-F4) Ang.= 180°

4. Estrutura de Lewis:

5. Pela Teoria da Ligação de Valência:

Formam-se quatro ligações do tipo σ entre um átomo de
Xénon (Xe) e os quatro átomos de Flúor (F). A ligação σ é
formada pela sobreposição de uma orbital sp3d2 do Xénon e
um orbital p de Flúor.

h) Uma molécula da geometria

“Tetraedro Distorcido” (molécula com 5 átomos):

SF4:
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1. Imagem da Molécula com Geometria Otimizada:

2. Distância da ligação: (F-S) R=1,71 Å

3. Ângulo entre as ligações: (F1-S-F2) Ang.= 95,0° ; (F1-S-F3 e

F2SF4) Ang.= 178,4° ; (F1SF4 E F2SF3) Ang.= 83,5° ;
(F3SF4) Ang.=98,0° .

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4. Estrutura de Lewis:

5. Pela Teoria da Ligação de Valência:

São quatro ligações do tipo σ entre o átomo de S e os quatro
átomos de F. A ligação σ é formada pela sobreposição de uma
orbital sp3d do átomo S e uma orbital 2p de cada átomo de F.

i) Uma molécula da geometria “Pirâmide de base

quadrada” (molécula com 6 átomos):

IF5:
1. Imagem da Molécula com Geometria Otimizada:

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2. Distância da ligação: (F-I) R=2,024 Å

3. Ângulo entre as ligações: (F1-I-F2) Ang.= 95,80° ; (F1-I-

F3,F2-I-F5) Ang.=83,28° ; (F1-I-F4,F2-I-F4) Ang.= 85,03;
(F1-I-F5,F2-I-F3) Ang=170,82° ; (F3-I-F4,F4-I-F5) Ang.=
103,94° .

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4. Estrutura de Lewis:

5. Pela Teoria da Ligação de Valência:

Formam-se cinco ligações do tipo σ entre o átomo de Iodo (I)
e os átomos de Flúor (F). A ligação σ é formada pela
sobreposição da orbital sp2d2 do Iodo com as orbitais 2p de
cada átomo de Flúor.

j) Uma molécula da geometria “Bipirâmide

Trigonal” (molécula com 6 átomos):

PCl5:
1. Imagem da Molécula com Geometria Otimizada:

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2. Distância da ligação: (Cl-P) R= 2.074 Å

3. Ângulo entre as ligações: (Cl1-P-Cl2) Ang.= 180° ; (Cl1-P-

Cl2,Cl1-P-Cl3,Cl1-P-CL4,Cl1-P-Cl5,Cl2-P-Cl4,Cl2-PCl5)
Ang.=90° ; (Cl3-P-Cl4,Cl3-P-Cl5,Cl4-P-Cl5) Ang.=120° .

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4. Estrutura de Lewis:

5. Pela Teoria da Ligação de Valência:

Formam-se cinco ligações do tipo 𝜎 entre o átomo de Fósforo
(P) e os cinco átomos de Cloro (Cl). A ligação 𝜎 é formada
pela sobreposição de uma orbital p do átomo de Cloro e uma
orbital sp3d do átomo de Fósforo.

k) Uma molécula da geometria

“Octaédrico” (molécula com 7 átomos):

SF6:

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1. Imagem da Molécula com Geometria Otimizada:

2. Distância da ligação: (F-S) R=1,71 Å

3. Ângulo entre as ligações: (F1-S-F2,F1-S-F4,F1-S-F4-

F1SF5,F1-S-F6,F2-S-F3,F2-S-F4,F2-S-F5,F3-S-F4,F3-S-
F5,F3-S-F6,F4-S-F6,F5-S-F6) Ang.=90° ; (F1-S-F3,F2-S-
F6,F4-S-F5) Ang.=180° .

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4. Estrutura de Lewis:

5. Pela Teoria da Ligação de Valência:

Formam-se seis ligações do tipo 𝜎 entre o átomo de Enxofre
(S) e os átomos de Flúor (F). A ligação 𝜎 é formada pela
sobreposição de uma orbital sp3d2 de Enxofre e uma orbital p
de Flúor. As orbitais sp3d2 estão orientadas ao longo dos
vértices de um octaedro.

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l)
O2:
Uma molécula com ligação dupla:

1. Imagem da Molécula com Geometria Otimizada:

2. Distância da ligação: (O-O) R= 1,15 Å

3. Ângulo entre as ligações: (O=O) Ang.= 180° .

4. Estrutura de Lewis:

5. Pela Teoria da Ligação de Valência:

Forma-se uma ligação σ e uma ligação π entre os dois átomos
de Oxigénio (O).

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m)
tripla:
Uma molecula com ligação

N2:
1. Imagem da Molécula com Geometria Otimizada:

2. Distância da ligação: (N-N) R=1,12 Å

3. Ângulo entre as ligações: (N≡N) Ang.= 180° .

4. Estrutura de Lewis:

5. Pela Teoria da Ligação de Valência:

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Existe uma ligação tipo σ entre os dois átomos N. A ligação σ

é formada pela sobreposição de uma orbital sp por cada átomo
N. São duas ligações tipo π entre os dois átomos N. As
ligações π são formadas pela sobreposição de uma orbital 2px
de cada átomo N e pela sobreposição de uma orbital 2py de
cada átomo N.

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