Enzimas I e II
↪ BioQuímica I PLE (Isabela Ramos)
Enzimas são catalisadores das reações químicas
em sistemas biológicos.
● Elas têm um alto grau de especificidade
pelos seus substratos;
● Aceleram as reações químicas;
● Funcionam em soluções aquosas em
condições de temperatura e pH
apropriados;
● Atuam em pequena quantidade e são
recicláveis.
O conceito geral de uma enzima é acelerar
bastante reações químicas.
Toda enzima é uma proteína, mas nem toda
proteína é uma enzima. Com exceção da ribozimas
(que são formadas por RNA catalisadores).
Elas são classificadas pelas reações que
catalisam: Oxidoreductases, transferases, liases,
isomerases, ligases. Majoritariamente quando
tem ...ASE, é uma enzima.
Das ~ 40 mil proteínas, ~25 mil delas são
enzimas, que são formadas pelos mesmos 20
aminoácidos.
Algumas enzimas necessitam de um co-fator
(um ou mais íons inorgânicos) ou coenzimas
(complexo orgânico ou molécula metalorgânica, ou
seja, qualquer molécula não proteica).
Tudo que é verdade para proteína, continua
sendo verdade para a enzima. Elas seguem as
mesmas particularidades.
Assim como as proteínas, elas também estão
sujeitas a modificações de cargas e afinidades
diferentes de acordo com o meio em que se
encontram (pH, temperatura, etc), concentração
de ligante reversível, etc.
Existem enzimas que apresentam estrutura
quaternária.
Alosteria por definição é quando a interação com
o ligante reversível em um determinada sítio de
uma subunidade gera um mudança conformacional
desta outra subunidade (vizinha) e faz com que
agora ela tenha maior afinidade ao ligante.
A hemoglobina não é uma enzima, pois ela não
tem o poder de acelerar uma reação.
Uma enzima é uma proteína que oferece um sítio,
um ambiente específico dentro da estrutura
tridimensional dela na qual uma certa reação
química consegue acontecer mais rapidamente.
Variação da quantidade de energia em
reações químicas
O reagente agora passa a se chamar substrato.
 Quando um determinado substrato, ou um
conjunto, é convertido a um conjunto de produtos,
dependendo das moléculas que eram no começo e
q vão se formar no final, a quantidade de energia
presentes nos reagentes é diferente da dos
produtos.

Pode gerar produtos menos energéticos do que

os reagentes eram, nesse caso a molécula que foi
formada nos produtos provavelmente tem menos
ligações químicas.
Estado de Transição
O que é ter energia?

É o momento molecular transitório no qual

Nas ligações químicas, há energia. A energia
eventos como a quebra de ligações e formação de
química.
novas ligações para formar o produto ocorrem.

Uma molécula (ou até objetos grandes mesmo)

É um estado instável, com alta energia livre.
tem mais ou menos energia de acordo com a
quantidade e a força das ligações químicas que ela
O processo de transição é muito mais energético
tem.
que o início e o fim.

Quanto maior a molécula, mais energia, mais

átomos, mais ligações químicas, mais tudo.
Funcionamento enzimático
Essa alta energia livre cria o estado de
transição, o pico energético daquela reação. Ele é
só um momento molecular, ele não existe
fisicamente.

Delta é quanto tem no final menos quanto tem no
inicio.
DeltaG quantidade de energia dos produtos -
do substrato.
A enzima consegue estabilizar o estado de
transição para que ele seja menos energético.
Diminui a energia de ativação, pois fornece
condições estabilizadadoras para o estado de
transição.

Quando uma reação gera produtos menos Essa energia de ativação é a barreira que
energéticos que seus reagentes/substratos precisa ser ultrapassada para que a reação
eram, o delta G vai ser negativo. Independente do aconteça.
que acontece no meio do caminho.
Ex.: Eu sexta feira a noite em casa é o substrato;
Eu sexta feira a noite no bar é o produto;
Até você chegar lá dá trabalho, gasta muita
energia;
A enzima nesse caso seria seu amigo falar que ta
te mandando um uber. Ela diminui os obstáculos
no seu caminho.
Constante de equilíbrio Keq
As Keq de uma reação estão ligadas à variação
da energia livre de Gibbs (G).
Toda vez que Kep me da um numero menor que 1
o delta G da reação é positivo (reação com
produtos mais energéticos que os
reagentes/substratos). E o contrário também.
Quanto maior a constante de equilíbrio, maior
que 1, significa dizer que quando a reação chega
no equilíbrio a balança pesa paras produtos, gera
mais produtos. Esse delta G é negativo. Esses
muitos produtos que ela gerou são menos
energéticos do que os reagentes eram.
Quanto mais produtos ela gera, mais alta a
quantidade de equilíbrio e produtos menos
energéticos que os reagentes.
Pode gerar muitas quantidades mas não
necessariamente muita energia!
As reações mais comuns são reações que geram
coisas menos energéticos. Pq tudo q gera coisa
mt energética tende a ir para os reagentes, tende
a voltar, é uma reação desfavorável, não é
espontânea.
Delta G e Entropia (Delta S)
Entropia é um conceito químico que descreve a
variação de aleatoriedade no sistema, o quanto
bagunçado um determinado sistema é.
Entropia está associada a Delta G.
Toda reação que tem o delta G negativo,
constante de equilíbrio alta, gerando + produtos
há o aumento de entropia. Esses produtos além
de serem menos energéticos contribuem para a
aleatoriedade no sistema.
Sair do arrumado para bagunçado é muito
espontâneo, acontece facilmente. Sair do
bagunçado para o arrumado, gasta muita energia,
você tem que dar energia.
Bagunçado = Delta G negativo = Entropia alta =
Menos energia nos produtos.
Quimicamente falando, todo o universo/
natureza tendem a desordem, tendem a entropia.
Reações quimicas tendem a gerar coisas menos
energéticas.
 Se jogar qualquer coisa pro alto ela vai cair
bagunçada no chão, se quiser transformar em
algo arrumado é preciso dar energia!
Uma semente tem muito menos energia do que
uma planta inteira. Tudo que é vivo vai contra a
tendência do universo ir em direção a desordem.
As enzimas aumentam a velocidade de reação,
seja lá para que lado ela já ia acontecer. Ou seja,
ela não altera o equilíbrio da reação.
A velocidade da reação está relacionada a
energia de ativação. Quanto menor a energia de
ativação, menor a velocidade exponencialmente.
OU SEJA, as enzimas aumentam a velocidade
das reações, diminuindo a energia de ativação,
sem alterar seu equilíbrio.
Mas como fazem isso?
Funcionamento Enzimático
Substrato: a molécula/ligante que se liga no
sítio ativo;
Sítio ativo: um local confinado no interior da
enzima, onde o substrato se liga. Possuem
cadeias laterais que são importantes para
estabelecer tipos de ligações com eles. Ele é
completamente complementar ao estado de
transição, fornecendo uma forma perfeita a ele, o
estabilizando.
As enzimas fornecem sítios perfeitamente
complementares ao estado de transição do
substrato.
A enzima fornece um sítio de ligação com grupos
funcionais para interações iônicas, ligações de
hidrogênio e interações hidrofóbicas posicionados
precisamente para que o estado de transição seja
estabilizado!
As enzimas aceleram as reações pois
estabilizam o estado de transição, e isso também
dá a elas sua especificidade.
Modelo de encaixe induzido: o sítio ativo
estabiliza e induz a forma do estado de transição.
(slide testando) Ser favorável é a constante de
equilíbrio ser maior que 1 , alta, delG negativo.
4- não!
Cinética Enzimática
 Estudar a dinâmica que uma enzima consegue
converter substratos em produtos em diferentes
condições.
Em quais condições ela consegue acelerar mais
as reações?
1. Concentração de substrato;
Um fator chave que afeta a velocidade de uma
reação. Ela se altera durante o curso de uma
reação.
Logo, aumenta a quantidade dos produtos.
Deve-se medir a velocidade inicial (V0) quando o
substrato [S] é muito maior que o [E].
V0 é proporcional a [S].
Quando mais concentração de substrato, mais
velocidade da enzima no processo de
transformação do substrato em produto.
Substrato se liga no sítio ativo
(mais rápido)
↓ Controlar o pH e a [L] em diferentes tecidos e
Substrato vira produto e solta do sítio ativo.
(mais lenta)
No começo da reação, existe muita enzima livre,
ou seja, ela está na sua forma não combinada, com
seus sítios ainda não ocupados. Conforme é
adicionado substrato, a quantidade de sítios
ocupados aumenta o que aumenta cada vez mais a
velocidade de conversão em produtos.
Mas existe um momento que não adianta colocar
mais substratos, pois todos os sítios ativos já se
ocuparam, houve uma saturação. É nesse
momento que se atingiu a velocidade máxima da
enzima na conversão de substratos em produtos,
ela se mantém constante, é o estado estacionário
da reação, a enzima se encontra combinada (ES).
Todo sítio ocupado gera a transformação de
substrato em produtos.
Km = concentração substrato que precisa
adicionar para que a enzima atinja metade da sua
velocidade máxima.
Quanto menor Km maior afinidade da enzima e
pelo seu substrato, melhor o encaixe. Ou seja
quanto menos substrato eu precisar adicionar
para que a enzima atinja metade da sua
velocidade máxima, mais afinidade ela vai ter com
ele.
É a mesma coisa do Kd (aula passada)!
2. Presença/ concentração de inibidores
enzimáticos;
3. pH (por motivos óbvios).
diferentes compartimentos celulares faz com que
organismos multicelulares consigam modular que
reações químicas acontecem em cada
compartimento.
Inibidores Enzimáticos
Molécula qualquer que quando tá ali no sistema
atrapalha o que a enzima tem que fazer.
Interferem na catálise, diminuindo ou
interrompendo reações enzimáticas. Tem alguma
tipo de afinidade com
1. Inibidores reversíveis
 Como se fossem ligantes, eles se ligam em uma
região na proteína e atrapalham sua função. São
os fármacos, por exemplo. Existem dois tipos:
competitivos e não competitivos.
Inibição Competitiva: Compete com o substrato
pelo sítio ativo.
O inibidor tem afinidade pelo mesmo sítio de
ligação do substrato, competindo assim com a
ligação com a enzima. Ligada ao inibidor, a enzima
não efetua seu papel biológico.
Essa competição acontece por causa da
concentração da quantidade dessas duas coisas,
pois tudo está se chocando aleatoriamente.
Quanto mais inibidores, em mais sítios ativos
eles vão se ligar, impedindo que os substratos
façam o mesmo.
Na presença do inibidor, mais substrato é
preciso ser colocado para que a enzima atinja
metade da velocidade máxima.
Aumenta o Km (menos afinidade com o
substrato), mas não altera a velocidade máxima.
Inibição Não-Competitiva: o inibidor liga-se a um
sítio ativo da enzima distinto do sítio ativo de um
substrato, podendo se ligar SOMENTE ao
complexo ES, ou seja, somente quando o
substrato já se ligou ao sítio ativo da enzima,
quando ele está combinado à enzima.
Não se prende no mesmo sítio, mas próximo o
suficiente para que atrapalhe a ação do substrato
na sua conversão para produto, pois atrapalha a
estabilização do estado de transição.
Reduz a velocidade máxima (conversão de
substrato para produto), mas não altera o Km
(não altera a afinidade da enzima pelo substrato).
Inibição mista: muito parecida com a inibição não
competitiva, a diferença é que o inibidor pode se
ligar a enzima na ausência do substrato, ou seja,
sem que ele precise estar ligado antes. Por isso,
ele também interfere na afinidade ao substrato.
Aumenta o Km e reduz a velocidade máxima
(atrapalha a estabilização do estado de transição,
pois altera a afinidade da enzima pelo substrato e
atrapalha a catálise - conversão de substrato
para produto).
2. Inibidores Irreversíveis
Como se fossem os grupos prostéticos, mas
nesse caso acontece que quando eles se
penduram em algum lugar na proteína, só
atrapalham. São venenos e substâncias tóxicas
que tem sua ação muito rápida. E fármacos em
doses altas.
São inibidores que se ligam de forma covalente
ou destroem o grupo funcional de uma enzima que
é essencial para a atividade enzimática.
Regulação enzimática em sistemas
biológicos
A presença de uma enzima em um lugar ou não
vai interferir diretamente em quais reações vão
acontecer ou não.
1. Modificação covalente: fosforilação (uma
enzima recebe um grupo fosforil em
algum lugar).
É o tipo de modificação mais comum em
proteínas (enzimas) em células eucarióticas.
 A fosforilação de proteínas são catalisadas por
proteínas quinases (kinase, cinase…).
A desforilação de proteínas sao catalizadas por
proteinas fosfatasas.
A adição dos grupos fosforil ocorrem nos
resíduos de aminoácidos (Ser, Thr e tyr) introduz
um grupo carregado volumosos (polares
carregados) e isso altera a estrutura
tridimensional da proteína. É muito mais comum
em enzimas do que em proteínas que não são
enzimas.
2. Regulação alostérica: feedback positivo
ou negativo.
Via metabólica ou rota metabólica é
uma série de reações químicas que
acontecem em cadeia / uma atrás da
outra, porque o produto de uma reação
catalisada por uma enzima é o
substrato de outra enzima.
Cada via inclui uma ou mais enzimas que
influenciam muito a velocidade da sequência de
rações como um todo. Essas, as chamadas
enzimas regulatórias, apresentam atividade
catalítica aumentada e diminuída em resposta a
certos sinais. Essa enzima regulatória,
geralmente são enzimas maiores, quaternárias e
mais complexas.

Uma proteína alostérica é aquela que possui

conformações diferentes, induzidas pela ligação
de ligantes que podem modular sua função.

Sítio ativo + sítio modulador

No geral, são quaternárias.

Subunidade catalitica (sitio ativo presente), vai

estabilizar o estado de transição.

Subunidade regulatória, regula a atividade do

sítio ativo na subunidade vizinha.

3. Controle de síntese e degradação da

enzima: proteínas constitutivas x
proteínas induzidas. Controle da
regulação gênica.