Seminário de Brenda Honda baseado no artigo "Refinamento da segmentação do ventrículo cardíaco esquerdo em imagens de ressonância magnética baseado em simulated annealing" (http://www.rbeb.org.br/articles/view/id/4ecbe68cb1d8f10277000004)
Título original
Refinamento da segmentação do ventrículo cardíaco esquerdo em imagens de ressonância magnética baseado em simulated annealing
Seminário de Brenda Honda baseado no artigo "Refinamento da segmentação do ventrículo cardíaco esquerdo em imagens de ressonância magnética baseado em simulated annealing" (http://www.rbeb.org.br/articles/view/id/4ecbe68cb1d8f10277000004)
Seminário de Brenda Honda baseado no artigo "Refinamento da segmentação do ventrículo cardíaco esquerdo em imagens de ressonância magnética baseado em simulated annealing" (http://www.rbeb.org.br/articles/view/id/4ecbe68cb1d8f10277000004)
Revista Brasileira de Engenharia Biomdica Incluses e excluses de pixels na borda da segmentao ativa, obtm a segmentao desejada.
Segmentao atual e uma candidata.
Critrios determinsticos ou estocsticos
Funo de energia: mede contraste na borda, a varincia da intensidade do sinal e a forma.
Phantoms numricos e tcnica aplicada com sucesso em imagens de ressonncia magntica.
Segmentao: quantificao e anlise de estruturas dinmicas.
Segmentaes precisas so necessrias em muitas tarefas crticas (evoluo de tumores).
Manipular estruturas N-dimensionais, ser pouco dependentes das modalidades de imagens e incorporar informao a priori sobre o objeto de interesse. Segmentao 2D, fcil extenso para 3D.
Os algoritmos de refinamento da segmentao nas bordas partem de uma segmentao inicial e, atravs da adio e eliminao de pixels, so escolhidos aleatoriamente e com igual probabilidade no contorno da segmentao, realizam o ajuste local do contorno.
Qualidade: funo de energia (o contraste nas bordas, a varincia do sinal e a forma da segmentao). Segmentao inicial geram segmentaes sucessivas
Na k-sima iterao, a escolha entre a segmentao atual e a segmentao candidata realizada atravs da minimizao de uma funo de energia, formada por valores normalizados (0 e 1).
Critrios determinsticos ou estocsticos
A escolha entre os dois algoritmos implica em um compromisso entre o tempo e a qualidade da segmentao. Funo de energia:
Na k-sima iterao, a energia da segmentao formada pela soma da varincia do sinal, a forma e o contraste da segmentao em considerao:
Execuo do algoritmo bem sucedida:
Varincia do sinal:
Esta mtrica mede a disperso dos pixels com relao mdia amostral ; portanto, esta medida explica a fidelidade dos dados de S (k) em relao a S (r) .
Situao ideal, sem rudo, o valor mnimo para zero.
Forma:
De maneira a garantir a similaridade com um padro determinado, no caso com relao a uma segmentao inicial aproximada S (0) , propese uma definio de forma que seja invariante translao.
Segmentao tende a crescer: Disparidade da distncia de S(k) com relao a S(0). (a) Segmentao inicial elptica e (b) Mapa das distncias Contraste de Bordas:
uma mdia normalizada dos contrastes sobre cada pixel i do contorno C (K) . Ser mximo quando todos os pixels estiverem totalmente dentro ou fora de S(n). Algoritmo de refinamento nas bordas por tcnica hbrida:
Parte de uma segmentao inicial S (0) que utilizada como segmental atual S (a) , no incio do algoritmo.
A cada passo obtida uma segmentao S (k) , que definido como o conjunto de todas as segmentaes que podem ser obtidas a partir de S (a) , mediante a eliminao de um pixel do contorno, ou da adio de um pixel da vizinhana. Metodologia Cdigo de refinamento de bordas Tcnica Hbrida Algoritmo de refinamento nas bordas utilizando simulated annealing:
Esta tcnica anloga tcnica anterior, diferindo no processo de aceitao e no controle de convergncia, que so feitos de acordo com o mtodo simulated annealing.
Esta tcnica baseia-se nos seguintes fundamentos fsicos: (1) um slido submetido a uma temperatura elevada; (2) o sistema resfriado lentamente; (3) a cada estgio de temperatura, o sistema alcana o equilbrio correspondente; (4) se o resfriamento for suficientemente lento, a estrutura resultante ser perfeita (mnimo global), caso contrrio, a estrutura resultante conter defeitos (mnimo local). Permite ao sistema escapar de mnimos locais, atravs da aceitao de configuraes com energia maior do que a atual. Metodologia
Na primeira, foi analisada a convergncia, tanto de forma independente como conjunta, dos termos da funo de energia, de forma e de varincia do sinal.
Na segunda, foram obtidos valores quantitativos do desempenho dos algoritmos de refinamento e outras tcnicas de segmentao. Os testes de convergncia foram realizados utilizando- se apenas os termos forma e varincia do sinal da funo de energia.
A avaliao foi realizada utilizando o algoritmo de refinamento nas bordas por tcnicas hbrida.
Os resultados so extensveis tcnica com simulated annealing, por validarem apenas o comportamento da funo de energia. (a) Imagem original (b) Segmentao procurada S(r) (a-c) Segmentaes iniciais e (d-f) segmentaes de busca Resultados da segmentao utilizando forma (a-c) Varincia do sinal (d-f) Forma e Varincia do sinal (g-i)
Este resultado correto, pois, qualquer segmentao dentro da segmentao real zera o valor da varincia do sinal, minimizando assim a funo de energia.
A avaliao de resultados foi feita sobre phantoms numricos gerados com as dimenses e contrastes tpicos encontrados em imagens de RM.
Relao sinal-rudo do phantom:
Foram consideradas sete tcnicas para a avaliao de resultados:
1) Limiarizao tima 2) Limiarizao tima de imagem filtrada (mediana 3x3) 3) Limiarizao tima de imagem filtrada (mediana 3x3) com restrio de conectividade 4) Expanso do balo 5) Expanso do balo aplicada sobre imagem filtrada (mediana 3x3) 6) Refinamento nas bordas por tcnica hbrida 7) Refinamento utilizando simulated annealing Imagens de RM podem apresentar um considervel nmero de estruturas ou artefatos que dificultam o reconhecimento do objeto de interesse. Os testes de convergncia realizados mostram que a forma e a varincia do sinal da funo de energia convergem tanto individualmente como em conjunto, independentemente da segmentao inicial utilizada.
Observa-se que o desvio padro pequeno para as duas tcnicas de refinamento: 6) Refinamento nas bordas por tcnica hbrida 7) Refinamento utilizando simulated annealing
A lentido no processamento justifica a utilizao do refinamento como uma metodologia para a segmentao precisa do ventrculo esquerdo cardaco, porm no em tempo real.
Segmentaes precisas so fundamentais para comparaes entre metodologias, atravs da avaliao objetiva de algoritmos de segmentao e quantificao em imagens mdicas. A simples utilizao de medidas baseadas nos atributos de intensidade da imagem no suficiente para obteno de resultados satisfatrios, principalmente na presena de artefatos de imagem.
As mtricas propostas podem facilmente ser estendidas para 3 D.
A avaliao da metodologia pode ser aplicada a outras modalidades de imagens mdicas, tais como Ultrassom e Medicina Nuclear, nas quais o elevado nvel de rudo um fator importante.