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Introdução

Lorraine M. Pepe
Definição do NCBI
(National Center for Biotechnology Information)

Bioinformática lida com a aplicação de ferramentas


computacionais na coleta, organização, análise, manipulação,
apresentação e compartilhamento de dados biológicos,
médicos, comportamentais ou da saúde.

“Bioinformática é a ciência de usar as informações para


entender a biologia.” – Cynthia Gibas e Per Jambeck [1]

Lorraine M. Pepe
Linha do tempo

• 1665 – Robert Hooke descobre a divisão dos organismo em células.

• Século XIX – Teoria Celular por Schleiden e Schwann: Os seres são constituídos de
células que são unidades morfológicas e funcionais e toda célula se origina de uma
pré-existente

• 1866 – Hereditariedade por Gregor Mendel com o cruzamento de ervilhas.


Demonstrou que as características dependiam de “fatores”.

• 1902 – Boveri e Sutton descobriram que o padrão de herança desses fatores


acompanhavam a separação dos cromossomos da divisão celular

• 1909 – Johannsen denominou tal fator de GENE

• 1915 – Thomas Morgan conclui que os genes são alocados de maneira


Lorraine M. Pepe linear nos
Linha do tempo
• 1944 - Avery, MacLeod e McCarty comprovam que o DNA é o material
genético hereditário, ao invés das proteínas, como se pensava na época.

• 1950 - Descoberta de Erwin Chagaff : Composição das bases nitrogenadas variavam


entre espécies. E porcentagem de timina igual a de adenina e citosina igual a guanina
em uma mesma espécie ((púricas) A+G = T+C (pirimídicas)). Uso do método de
cromatografia.

• 1953 – Rosalind Franklin através de experimentos com raio X e busca por padrões de
difração em moléculas de
DNA, tomando como base outros
experimentos, sugere a organização
em forma helicoidal.
Modelo de dupla hélice do DNA com
pares de bases nitrogenadas, por
Watson e Crick e apoio de Wilkins;
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• 1958 – Dogma Central da Biologia Molecular foi postulado por Crick

• 1961 – Brenner, Jacob e Meselson verificam que mRNA transporta as informações do


núcleo para a produção de proteínas.

• 1966 – Nirenberg, Khorana e Ochoa mostram que um códon determina a sequência de


aminoácidos de uma proteína.

• 1970 – Criação do PDB (Protein Data Bank, armazena estrutura de macromoléculas);

• 1974 – Abertura do EMBL (European Molecular Biology Laboratory);

• 1982 – GenBank (Banco de sequências de ácidos nucleicos);

• 1985 – FASTA (pacote de software para alinhamento de sequências);

• 1987 – SwissProt;

Lorraine
• 1988 – Criação da HUGO (Human Genome Organization) para M. Projeto
início do Pepe
Margaret Dayhoff Watson e Crick
Figura 3:
Watson e Crick e o modelo de DNA proposto
Figura 1:
Retrato de Margaret Dayhoff

Figura 4:
Retrato de Rosalind
Franklin
e raio X de seu
experimento

Figura 2: Exemplo de PAM.


Lorraine M. Pepe
Conceitos básicos sobre Biologia:
DNA – Ácido Desoxirribonucleico
(em inglês deoxyribonucleic acid (ADN))

- Molécula formada por uma dupla hélice polinucleotídica girando para a


direita;
- Cada hélice ligada a outra por pontes de hidrogênio formadas de pares de
bases nitrogenadas : Adenina (A) com Timina (T) e Guanina (G) com
Citosina (C). Logo, são complementares entre si;
- Possui pentose (desoxirribose, açúcar com 5 átomos de C) e fosfato (radical
do ácido fosfórico);

- Uma fita de DNA e sua complementar são antiparalelas, isto é, com


polaridades opostas;
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- As ligações fosfodiester (ligam os nucleotídeos covalentes com pontes de
fosfato) de uma fita possuem orientação do carbono 3′ de um nucleotídeo ao
carbono 5′ do nucleotídeo adjacente, já na fita complementar a ordem é inversa.
“Os estudos de difração de raios-X haviam revelado que o
diâmetro externo da dupla hélice é de cerca de 2 nm,
enquanto que a distância entre os açúcares é de 1,1 nm.
Assim, os pares de bases A-T e C-G têm o diâmetro exato
para caber dentro da dupla hélice. Isso indicou que uma
purina sempre se emparelha com uma pirimidina, porque o
emparelhamento purina-purina ou pirimidina-pirimidina
não tem diâmetros que se ajustem ao diâmetro interno da
dupla hélice.
A hélice dá uma volta completa a cada 3,4 nm, que
corresponde a cerca de 10 pares de bases. Assim, a distância
entre dois pares de bases vizinhos é de 0,34 nm. As bases
timina e adenina são emparelhadas por duas pontes de
hidrogênio, enquanto que a guanina com a citosina são
emparelhadas por três pontes de hidrogênio, como podemos
ver na figura 3 acima.” [2]

Figura 5: Pontes de hidrogênio e fosfato no DNA. Lorraine M. Pepe


Para que serve? Funciona como uma “receita”,
isto é, regendo os processos vitais das células. Além
de ser responsável pela hereditariedade.

Onde se encontra? No núcleo celular, possuindo


cerca de 2 m de comprimento, porém altamente
espiralizado.
GENE
Segmento do DNA com informação para a
montagem de aminoácidos.

GENOMA
Conjunto de genes responsável por todas as
informações genéticas de um ser. O genoma
humano possui de 30.000 a 50.000 genes,
Figura 6: Estrutura do DNA. englobando 2.825 milhões de pares de bases.
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ALELO
• Segmentos homólogos que afetam uma mesma característica porém de formas
diferentes. Pode ser dominante ou recessivo.

PURINAS E PIRIMIDINAS

• São bases nitrogenadas. Adenina e Guanina são Purinas e Timina, Uracila e


Citosina são pirimidinas.

CÓDONS E ANTICÓDONS

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ÉXONS x ÍNTRONS

• Éxons são partes do DNA que podem ser codificadas em mRNA a partir
do processo de transcrição;

• Já os íntrons são partes que não conseguem ser codificadas para proteínas;

• Nem todos os seres possuem íntrons. Esses são comuns em eucariotos


multicelulares como nós;

• Quando ocorre a transcrição inicialmente ainda temos os íntrons no pré-


mRNA formado. Este passa por um processo chamado splicing cuja
finalidade é remover os íntrons precisamente e emendar os éxons, tendo
como produto final o mRNA maduro (conhecido apenas por mRNA);

Lorraine M. Pepe
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GenBank:

Figura 3: Crescimento do GenBank.

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Figuras
Figura 0: Logo do primeiro slide. Disponível em:
http://meioambiente.culturamix.com/blog/wp-content/gallery/bioinformatica-caracteristicas-gerais1/bioinformat
ica-caracteristicas-gerais-8.png
. Último acesso: 03 de Maio de 2017.
Figura 1: “Retrato de Margaret Dayhoff”. Disponível em: https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/
thumb/d/d5/Margaret_Oakley_Dayhoff_cropped.jpg/220px-Margaret_Oakley_Dayhoff_cropped.jpg. Último
acesso: 19 de Maio de 2017.

Figura 2: “Exemplo de PAM”. Disponível em:


https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/5/52/BLOSUM62.gif. Último acesso: 19 de Maio de 2017.

Figura 3: “Watson e Crick e o modelo de DNA proposto”. Disponível em:


https://cdn2.hubspot.net/hub/237126/file-660502209-jpg/watson_crick.jpg. Último acesso: 03 de Maio de 2017.
Figura 4: Retrato de Rosalind Franklin e raio X de seu experimento”. Disponível em:
https://upload.wikimedia.org/wikipedia/pt/9/97/Rosalind_Franklin.jpg e
http://www.bbc.co.uk/staticarchive/213e5d8dc417eee9e7fcfce53c100857ee96eed7.jpg .
Último acesso: 03 de Maio de 2017.
Figura 5: Pontes de hidrogênio e fosfato no DNA. Disponível em:
http://www.biomol.org/historia/propduplahelice.shtml. Último acesso: 03 de Maio de 2017.
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Figura 6 : “Estrutura do DNA”. Disponível em:
http://www.infoescola.com/wp-content/uploads/2007/10/DNA.jpg. Último acesso: 19 de Maio de 2017

Figura : “Crescimento do GenBank”. Disponível em: http://1.bp.blogspot.com/-PZiPS-6fnPI/Tmupm4YDv0I/


AAAAAAAAAog/A5mVSIAi1x0/w1200-h630-p-k-no-nu/genbankgrowth.jpg.
Último acesso: 19 de Maio de 2017.

Figura : Disponível em:


. Último acesso: 19 de Maio de 2017

Figura : Disponível em:


. Último acesso: 19 de Maio de 2017

Figura : Disponível em:


. Último acesso: 19 de Maio de 2017

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http://educacao.estadao.com.br/noticias/geral,bioinformatica-transforma-dados-em-conhecimento,1716455

https://www.portaleducacao.com.br/conteudo/artigos/biologia/historico-da-bioinformatica/36390

https://www.youtube.com/watch?v=ljd6Mn0IuFg

http://www.biomol.org/historia/propduplahelice.shtml [2]

https://edisciplinas.usp.br/pluginfile.php/3154502/mod_resource/content/3/Que-sao-introns-e-exons.pdf

http://www.news-medical.net/life-sciences/What-are-introns-and-exons-(Portuguese).aspx

http://mundoeducacao.bol.uol.com.br/biologia/dogma-central-biologia-molecular.htm

http://www.jvasconcellos.com.br/fat/wp-content/uploads/2012/08/Aula-092.pdf

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