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TAXONOMIA E IDENTIFICAÇÃO DE
MICRORGANISMOS
Sónia Mendo
Qual das seguintes moléculas
surgiu primeiro?
Sónia Mendo
Hipótese do “Mundo do RNA”
Molécula autoreplicativa
Sónia Mendo
Relações evolutivas entre os diferentes organismos só foi possível por comparação
de seq. nt e de aa.
Componentes de
fluxo de informação
Genes comuns
Genes em comun
Hi
p. ATPase
da
fu
sã Paredes sem peptidoglucano
o
de Lípidos da memb. com ligações éter
ge
no
m tRNA sem timina
as
RNA pol. diferentes
Ribossomas de composição e forma
diferentes
1 RNase simples, DNA dependente
mRNA policistrónico Ramo Bacteria
Archae
Sónia Mendo
Divergência evolutiva
16S 5S 23S
V6
EUCARIOTAS
18S 5.8S 25/28S
ITS2 D2
Sónia Mendo
TAXONOMIA MICROBIANA
S. Flexneri serotipo 2a estirpe 2457T
S. flexneri S. dysenteriae
Enterobacteriaceae
, β, γ, δ, ε -Proteobacteria
Proteobacteria
Bacteria
Sónia Mendo
TAXONOMIA
Sónia Mendo
CLASSIFICAÇÃO/Identificação
DE
MICRORGANISMOS
FENÉTICA FILOGENÉTICA
GENOTÍPICA
Genomas >70% homologia: mesma espécie
Sónia Mendo
MÉTODOS FENOTÍPICOS (características expressas pelos
microrganismos) ?
Morfologia
?
Sónia Mendo
Sónia Mendo
Sónia Mendo
VITEK® 2
Sónia Mendo
MÉTODOS GENOTÍPICOS (envolvem a análise de
ácidos nucleícos)
Permitem um elevado índice de descriminação e fiabilidade na diferenciação de
estirpes
Análise de plamídeos
Perfil de restrição de DNA genómico
Análise por hibridação
Sónia Mendo
TAXONOMIA CONVENCIONAL DE MO
Conteúdo G+C
• G+C/A+T+C+G x100%
– Varia entre 20-80% entre procariotas
Hibridação DNA:DNA
Sónia Mendo
OUTRAS METODOLOGIAS: DNA “fingerprinting”
Ribotipagem
PFGE
Sónia Mendo
Análise de ácidos gordos
Identificação do MO
Derivatizar para formar
Ésteres de metilo
Comparar o padrão
Gromatografia dos picos com padrões
gasosa das bases de dados
Sónia Mendo
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Sónia Mendo
Análise molecular de comunidades
METAGENÓMICA
Comunidade
microbiana
Extracção de DNA
Sónia Mendo
Identificação de microrganismos
Identificação do MO
Sónia Mendo
Sónia Mendo
MANUAL BERGEY´S DE BACTERIOLOGIA
1ª ed.1984 ...9ª ed.
Sónia Mendo