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M
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F
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n
a
l
S
i
t
u
a
o
Adaiton Francisco 7,0 7,0 7,0
2,0 4,0 7,0
Adriano Inacio 10,0 10,0 8,0
8,0 9,0 8,0
Aline Alves 8,0 7,0 8,0
7,5 8,0 8,0
Alisson Fernando 8,0 8,0 7,0
8,0 7,0 8,0
Ana Lucia da Silva 9,0 9,0 8,0
3,0 3,0 8,5
Ana Rodrigues 9,5 8,5 8,0
8,0 7,5 7,5
Benevaldo Pereira 10,0 8,0 7,0
9,5 9,0 9,0
Chales de Arajo 8,0 10,0 8,0
9,9 9,0 9,0
Danielle de Araujo 9,0 9,0 10,0
9,0 8,5 9,0
Digo Juvencio 7,0 7,0 5,0
5,0 5,0 4,0
Edson de Oliveira 4,0 6,0 7,0
6,0 7,5 6,0
Eduardo Barbosa 8,0 7,5 10,0
8,0 7,0 8,0
Erenilda Pontes 8,0 9,5 8,0
5,0 8,0 7,0
Eliano Nascimento 7,0 5,0 5,5
5,0 5,5 8,0
Jefferson Melo 5,0 3,0 5,0
5,0 7,0 6,0
Jos Pereira 8,0 7,0 9,0
8,0 8,0 7,5
Joseiton Silva 9,0 9,0 8,0
8,5 7,5 8,0
Josenilda Batista 8,0 8,5 7,0
8,0 7,5 7,5
Josilene Silva 8,5 8,0 8,0
7,0 7,5 7,5
MDIA DA
TURMA
NDE ALUNOS
APROVADOS
NDE ALUNOS
REPROVADOS
54 DQ/CCEN/UFPB
5.5 Desafios
5.5.1 Ajuste de funes
Abra uma planilha e entre com seguintes dados:
Planilha 12
1. Formate a coluna A para 2 casas decimais, formate as colunas B e C para 4
casas decimais.
2. N clula D1,digite Temp C. Entre com a frmula para converter temperatura
em Fahrenheit para Temp C. C=(F-32)*5/9. Formate a coluna D para 4
casas decimais.
3. Na clula E1, escreva densidade. Entre com uma funo na clula E2 para
calcular a densidade.
4. Crie um grfico densidade x Temp C s pontos, coloque a legenda dos eixos e
o titulo do grfico.
5. Exclua a linha referente ao ponto que est fora da linha principal. (copie a linha
5 para linha 10 e depois delete a linha 5)
6. Na clula G1, escreva Inclinao. Entre com uma funo na clula G2 para
calcular a inclinao da linha que melhor se ajustou aos dados. Funo-
estatstica - inclinao
7. Na clula H1, escreva Interseo. Entre com um a funo na clula H2 para
calcular a interseo da linha que melhor ajusta aos dados. Funo-estatstica
interseo ou Intercepo.
8. Na clula I1, escreva Valores preditos para y. Entre com uma funo na clula
I2 para calcular todos os valores Y dos pontos ao longo da linha de melhor
ajuste.
9. Lembre voc necessita da inclinao (coeficiente angular a) e da interseo
com Y (coeficiente linear b), para obter o valor predito de y (y=ax+b).
10. Faa o grfico densidade x valor predito de y x temp C. Grfico usando 3
colunas de dados. Compare os grficos.
55 Computao para Qumica
5.5.2 Construo de Orbitais Atmicos
A compreenso dos orbitais atmicos crucial para a qumica moderna, pois a
caracterstica dos elementos depende intimamente de como os eltrons esto
distribudos nos orbitais. A qumica de um elemento e de seus compostos
determinada principalmente pelos eltrons que tm o maior valor de n, frequentemente
denominados de eltrons de valncia.
A representao grfica das probabilidades de se encontrar um eltron em
funo da posio num tomo definida como um orbital. Para tornar o conceito de
orbital mais significativo, til examinarmos as funes de onda que so as solues
da equao de Schrdinger de um tomo monoeletrnico. As funes de onda podem
ser expressas como o produto de duas funes, uma das quais depende dos ngulos
e (parte angular ), enquanto a outra uma funo apenas da distncia eletro-
ncleo r (parte radial R). Ento, temos que
(r, , ) = R(r) (, )
De um ponto de vista matemtico, cada soluo da Equao de Schroedinger
(ou funo de onda) corresponde a um orbital eletrnico, que define as energias
permitidas (nveis e sub-nveis) de um eltron em um orbital.
Neste exerccio vamos construir a parte angular das funes de onda (orbitais)
s, p
x
e d
x
2
-
y
2
no plano x,y. Para isso precisaremos das coordenadas polares.
A componente angular das funes de onda no plano x,y so:
d
x2-y2
=> = (15/16)
1/2
Cos(2)
p
x
=> = |(3/4)
1/2
Cos()|
s => = (1/4)
1/2
y
x
x=p cos
y=p sen
p
r
y
x
z
56 DQ/CCEN/UFPB
Para a transformao das coordenadas cartesianas em polares utilizaremos
p= e varia de 0a 360.
Atividades:
a. Construir uma tabela de acordo com modelo a seguir
Modelo de planilha para funo angular do orbital p
x
.
Planilha 13
A B C D E
1
2
3 ngulo () ngulo (rad.)
x (coord.) y (coord.)
4 0 =RADIANOS(A4) =ABS(RAIZ(3/(4*PI()))*COS(B4)) =C4*COS(B4) =C4*SEN(B4)
5 2 0,03491 0,4883 0,4880 0,0170
* Modo de exibio das frmulas
b. Em uma planilha eletrnica coloque uma sequncia de nmeros de 0 a 360
(variando de 2 em 2);
c. Numa coluna ao lado faa a transformao de graus () para radianos (rad.).
d. Na coluna seguinte calcule os valores de r = utilizando as frmulas acima.
e. Em seguida, construa os valores das coordenadas x e y em polares, utilizando
as equaes de transformao.
f. e por fim plote as coordenadas x e y nos programas Origin ou Qtiplot.
g. Repita o procedimento para as demais funes de onda angular.
Voc deve gerar os seguintes grficos:
57 Computao para Qumica
5.5.3 Cintica Clculo da velocidade mdia
Considerando a reao:
C
4
H
9
Cl (aq) + H
2
O (l) C
4
H
9
OH (aq) + HCl (aq)
Planilha 14
Tempo (s) Concentrao C
4
H
9
Cl
mol/L
0 0,1
50 0,0905
100 0,082
150 0,0741
200 0,0671
300 0,0549
400 0,0448
500 0,0368
800 0,02
1000 0,015
a) Construa o grfico: Concentrao x Tempo
b) Calcule a velocidade mdia da reao para o intervalo de tempo entre cada medida.
Usar notao cientfica para velocidade.
c) Considerando que seja uma reao de 1 ordem, encontre a constante de
velocidade.
Dados:
[A] = concentrao molar do reagente A
Velocidade mdia da reao = -[A]/t
Velocidade de Reao = - k [A]
1
a
ordem => ln[A] = ln[A
0
] - k t
58 DQ/CCEN/UFPB
5.5.4 Clculo de absorbncias e concentraes
Considerando o seguinte procedimento experimental realizado. Numere 12
bales volumtricos de 50 mL de 1 a 12 e coloque em cada um deles 15,00 mL de
NH
4
OH 4,0M. Adicione com aos doze bales exatamente os volumes de CuSO4
0,50M apresentados abaixo. Complete as solues at a marca de 50 mL com gua
destilada.
Planilha 15
Amostra CuSO4 mL Amostra CuSO4 mL
1 0,50 7 3,50
2 1,00 8 4,00
3 1,50 9 4,50
4 2,00 10 5,00
5 2,50 11 5,50
6 3,00 12 6,00
No comprimento de onda escolhido (580 nm) foi determinado sucessivamente
a transmitncia das solues, fazendo ao menos trs leituras para cada amostra.
Tambm foi realizada a leitura da transmitncia para uma soluo com concentrao
desconhecida (soluo X).
1) Utilizando a relao A = log(I
0
/I) = bC, explique qual a forma do grfico que
voc espera ao representar A em funo da concentrao C. A partir deste
grfico, como voc poderia determinar o valor de se a espessura do caminho
ptico for 1 cm?
2) A transmitncia de uma determinada soluo 85%. Qual a sua
absorbncia?
Transmitncia: T=I/I
0
; Absorbncia (A) = log (I
0
/I) = log (1/T).
3) Construa a planilha 16 no Excel e complete-a com os clculos de absorbncias
A
1
, A
2
e A
3
; absorbncia mdia e transmitncia mdia.
4) Faa os clculos para concentrao.
5) Faa os grficos:
a. Grfico 1: Transmitncia percentual mdia (T) em funo da
concentrao (C) da soluo do complexo.
b. Grfico 2: Absorbncia (A) em funo da concentrao (C) da soluo
do complexo.
6) Calcule o valor da concentrao da soluo X lido diretamente do grfico e usando
o valor da tabela e do coeficiente angular (determinado no grfico 2).
59 Computao para Qumica
Planilha 16 - Transmitncias (em %), Absorbncias e Concentraes (em 10
-3
mol.L
-1
) no
comprimento de onda de 580 nm
Soluo
1
a
Leitura
2
a
Leitura
3
a
Leitura
Transmitncia
% mdia
Absorbncia
Mdia
mol/L
T
1
A
1
T
2
A
2
T
3
A
3
1 77,5 77,5 77,5
2 52,5 52,0 52,5
3 44,0 44,0 44,5
4 34,5 34,5 34,5
5 27,5 27,5 27,5
6 15,5 15,5 15,5
7 12,0 12,0 12,0
8 9,5 9,5 9,5
9 7,5 7,5 7,5
10 6,0 6,0 6,0
11 5,5 5,5 5,5
12 5,0 5,0 5,0
Soluo
X
53,5 53,5 53,5
60 DQ/CCEN/UFPB
6. - Modelagem Molecular
O HyperChem um sofisticado ambiente de modelagem molecular
caracterizado pela qualidade, flexibilidade e facilidade de utilizao. Unindo
visualizao 3D e animao qumica com clculos qunticos, mecnica e dinmica
molecular. O HyperChem coloca ao seu alcance vrios recursos que podem ajudar o
entendimento da qumica, atravs de mtodos computacionais como o da mecnica
molecular, dinmica molecular, semi-empricos e mtodos
moleculares.
A verso mais recente, HyperChem Release 8.0,
uma aplicao 32-bit, desenvolvida para o Windows 95,
98, NT, ME, 2000, XP, Vista e outros sistemas
operacionais. HyperChem Release 8.0 incorpora vrias
ferramentas computacionais como simulaes com
protenas e molculas em campos magnticos.
6
Em nosso curso utilizaremos a verso 7.0. Ela
conta com a grande maioria dos recursos presente na
verso mais nova. Todas as verses to HyperChem
necessitam de registros que so pagos.
6.1 Abrindo o HyperChem
Ao abrir o Hyper uma janela similar a
apresentada ao lado mostrada.
O modo de se trabalhar com
este programa muito semelhante
ao j visto ChemSketch (mostrado
anteriormente) principalmente no
que diz respeito ao desenho de
estruturas.
6
HyperChem <WWW.hyperchem.com>
Figura 80 HyperChem
Figura 81 - Janela HyperChem
61 Computao para Qumica
Barra de Ferramentas
Em relao aos programas j vistos, o Hyper um dos que tem a mais simples
barra de ferramentas. Os aplicativos esto inseridos dentro dos menus em sua
respectiva barra. Desta forma, vamos conhecer a barra de ferramentas do Hyper que
concentra seus botes na criao de estruturas e em alguns recursos de desenho
adicionais.
1 Draw (Desenho): Boto usado para desenhar estruturas. Como apenas um boto
da barra pode ser ativado por vez, sempre que desejar criar molculas ser
necessrio ativar este.
Obs. Quando este boto est ativo o boto esquerdo do mouse serve para desenhar e
o direito para apagar (borracha).
2 Select (Selecionar): Serve para selecionar tomos ou estruturas segundo o que se
encontra marcado no menu Select na barra de menus. Assim como o boto Draw este
tambm tem no boto direito do mouse a funo oposta, ou seja, apagar a seleo.
3 Routate out of plane (Rotao fora do plano): Com esse boto possvel girar as
estruturas nas trs dimenses conforme o desejado.
4 Routate in Plane (Rotacionar no plano): Serve para girar a molcula apenas no
plano do monitor.
5 Translate (mover): Mover a estrutura ou o conjunto de estruturas no plano da tela.
6 Z-Translate (Mover no eixo Z): Serve para (quando possvel) mover a estrutura no
plano perpendicular ao da tela (Z).
7 Magnify/Shrink (Aumentar/Encolher): Com este boto pode se ajustar o zoom da
visibilidade das estruturas. Para aumetar basta selecionar este boto clicar/segurar
sobre qualquer parte da rea de trabalho e arrastar para baixo. Para reduzir o zoom
executar o mesmo processo s que desta vez arrastando para cima.
8 Z-Clipping Planes (Ver interior no eixo z): Serve para ver o interior de uma fatia da
molcula.
9 Text Anotation (Texto): Adiciona anotaes a rea de trabalho. Basta clicar sobre o
boto e a janela de anotao se abrir. Seleciona-se o estilo, tamanho, tipo e cor da
fonte desejados e insere-se o texto na parte inferior da janela.
10 Line/Circle/Rectangle Anotation (Linha, Crculo e Retngulo): Serve para inserir
essas forma a rea de trabalho.
11 Botes Novo, Abrir e Salvar arquivo.
12 Botes Recortar, Copiar e Colar.
13 Botes Imprimir e Ajuda.
Figura 82 - Barra de Ferramentas do HyperChem
62 DQ/CCEN/UFPB
6.2 Utilizando modelos prontos do Hyper
Assim como a grande maioria dos programas da rea qumica, esse tambm
conta com um banco de dados onde so encontrados arquivos de molculas j
prontas que podem ser utilizadas. No caso do HyperChem, existem desde molculas
simples (desenhadas em segundos) at estruturas extremamente complexas que
levariam dias para serem desenhadas manualmente. Vamos iniciar vendo alguns
exemplos.
O banco de dados do programa instalado junto com os demais aplicativos,
logo se encontra dentro da pasta do programa no disco rgido. Geralmente este
diretrio est em:
C: (ou outra unidade do PC) > Hyper 75 > Samples
Para abrir um arquivo, clique em File > Open... e encontre o diretrio do banco de
dados do Hyper (mostrado anteriormente). Nele voc encontra os arquivos separados
segundo os tipos de estrutura. Ao selecionar um arquivo, logo abaixo do tipo de
arquivo (nos comentrios) so apresentadas algumas informaes sobre a estrutura.
Por exemplo, para abrir a estrutura da cafena v em:
... > Hyper 75 > Simples > Organics e clique sobre o arquivo CAFFEINE
Logo aps abrir uma estrutura no canto inferior esquerdo aparece o nmero de
tomos contidos nela.
Inicialmente as estruturas so mostradas na forma
de linhas (Sticks) para visualiz-los de outra maneira
clique na barra de menus em Display > Rendering... na
guia Rendering Method na parte Atom Rendering
(mostrada abaixo) possvel escolher o modo como so
apresentadas. Escolha preferencialmente o estilo Balls
and Cylinders. Nas demais guias podem se fazer ajustes
como tamanho das esferas e espessura dos cilindros.
Veja outros exemplos de molculas:
... > Samples > Organic > ASPIRIN
... > Samples > Organic > VITAMINC
... > Samples > Organic > NICOTINE
... > Samples > Aromatic > NAPHTHAL
... > Samples > Aromatic > PYRENE
... > Samples > Aromatic > C60
... > Samples > NMR > ALLENE
Figura 83
Figura 84
63 Computao para Qumica
Se ao abrir uma pasta no encontrar nenhum arquivo, pode ser que a seleo
de tipo de arquivo esteja diferente. Por exemplo, para ver a estrutura da
Imunoglobulina v em:
File > Open... > ... > Samples > PDB Provavelmente no ser mostrado
nenhum arquivo. Na mesma janela, na parte inferior onde mostrado o Tipo: do
arquivo modifique para Brookhaven PDB (*.ENT) e na janela acima selecione a
PDB1F19.ENT.
6.3 Adicionando mais de uma estrutura
Ao utilizar o comando Open > File s possvel adicionar uma estrutura por
vez rea de trabalho. Desta forma torna-se importante um comando que permita
adicionar uma molcula do banco de dados a uma estrutura j aberta ou desenhada.
Para fazer isso se utiliza o comando File>Merge, ele permite que uma estrutura seja
adicionada. Por exemplo, pretendemos relacionar a estrutura da cafena com a da
progesterona. Assim, com a cafena j na rea de trabalho, clique em File>Merge e v
em Samples>Organic>PROGESTE. As duas estruturas aparecero lado a lado.
6.4 Desenhando Estruturas
O modo como as estruturas so criadas no HyperChem muito semelhante ao
do desenho de estruturas no ChemSketch, a principal diferena est em onde os
elementos qumicos se encontram. No ChemSketch esto logo na barra lateral no
Hyper os elementos esto na tabela peridica que se encontra no menu Build>Default
Element, v at ele e a tabela peridica se abrir. Basta selecionar o elemento
desejado e em seguida clicar uma vez sobre uma parte no utilizada da rea de
trabalho dar outro clique para iniciar o desenho, se perceber que vai precisar utilizar a
tabela brevemente no necessrio fech-la, basta afastar quando no estiver
usando e reativ-la quando necessrio.
Lembre-se que para desenhar necessrio que o boto desenho na barra de
ferramentas esteja ativo. Da basta clicar sobre um ponto da rea de trabalho e
arrastar para criar uma ligao simples entre tomos selecionados.
Assim como no ChemSketch o Hyper melhora as estruturas desenhadas de
forma imperfeita. Para isto clique em Build > Add H & Model Build. O programa ir
completar a valncia com H e aperfeioar a geometria com mtodo de mecnica
molecular (MM).
Distncia de ligao, ngulo de Ligao e ngulo de Torso
Para visualizar essas informaes em uma estrutura temos que: Uma vez
desenhada e melhorada, basta ativar o boto de seleo e selecionar dois elementos
caso queira observar a distncia de ligao, selecionar trs elementos para saber o
seu ngulo interno e por fim selecionar quatro elementos para ver o ngulo de torso.
Os dados so mostrados na parte inferior esquerda da janela (Linha de Status).
64 DQ/CCEN/UFPB
Exerccios
Desenhe as seguintes estruturas no HyperChem. Observando alguns de seus
ngulos e distncias de ligao.
Figura 85
65 Computao para Qumica
6.5 Otimizao de Geometria Escolha do Mtodo
O HyperChem possui vrios mtodos indexados, so estes: mecnica
molecular, semi-emprico, ab initio e funcional de densidade, cada um destes com
diferentes mtodos, bases ou funcionais, desde os mais rpidos e simples at os mais
complexos. A escolha de um mtodo extremamente importante, pois quanto mais
robusto for o mtodo escolhido, obviamente, mais tempo ser gasto e mais esforo da
central de processamento do computador ser exigido (existindo casos at em que o
clculo no possvel sem um bom processador). O detalhamento sobre mtodos
computacionais, no est previsto para este mdulo do curso.
No Hyper para escolher um mtodo de clculo, v ao menu Setup. L as quatro
primeiras opes referem-se a modos de clculo cada um com seu nvel de
complexidade. Na grande maioria dos clculos realizados por ns utilizaremos o modo
AM1, que um mtodo bastante eficiente para otimizao de geometria e rpido. Para
selecionar esse modo v ao menu Setup > Semi Empirical e marque AM1.
Otimizao de Geometria
Vamos agora ver a diferena entre uma estrutura apenas desenhada no Hyper
manualmente e uma que passou por processos de otimizao. Utilizaremos aqui, a
molcula da gua. Desenhe-a no Hyper e faa uma tabela semelhante a seguinte:
Planilha 17
Dado Modo 1
(Manual)
Modo 2
(Model Build)
Modo 3
(AM1)
Literatura
Distncia O-H
1
Distncia O-H
2
ngulo H-O-H
Uma vez desenhada a estrutura, rotacione-a de modo que no seja necessrio
modificar sua posio para calcular as distncias e ngulo. Calcule os valores a anote
na coluna Modo 1.
Agora apague a molcula e adicione rea de trabalho apenas um tomo de O
(oxignio). V ao menu Build>Add H & Model Build. O programa transformar o
oxignio em uma molcula de gua. Calcule e anote os valores no Modo 2.
Agora faa uma melhora na estrutura aplicando o modo de calculo AM1. Para
isso, v ao menu Setup > Semi empirical > AM1. Observe se AM1 aparece no canto
inferior direito da janela. Agora v ao menu Compute>Geometry Optimization e
aguarde at que a mensagem abaixo aparea na linha de status. Conv=YES indica
que o calculo foi efetuado com sucesso anote os valores de distancia e ngulo na
coluna Modo 3.
Finalmente, procure na literatura os parmetros geomtricos da gua e
compare-os com os determinados nos trs modos. O que voc conclui?
66 DQ/CCEN/UFPB
6.6 Ligaes Qumicas e Estrutura Molecular
Molculas possuem formatos tridimensionais que so determinados pelas
orientaes relativas de suas ligaes covalentes, e esta estrutura mantida, no
importando se a substncia est no estado slido, lquido ou gasoso. Nessa seo
iremos explorar a geometria molecular, utilizando a Teoria VSPER (teoria da repulso
do par eletrnico da camada de valncia).
Os modelos encontram-se em File > Open > ...>Hyper 75 > Samples > VSEPR
1. Utilize os modelos de estruturas disponveis no Hyper, complete a tabela a
seguir e compare com a literatura (Brady et al., 2002).
Planilha 18
Utilize os dados obtidos acima como referncia para encontrar a geometria das
seguintes molculas: BCl
3
, BeCl
2
, CCl
4
e H
2
S. Lembre-se de melhorar as estruturas
aps desenh-las. Faa a otimizao de geometria com AM1.
Planilha 19
Molcula Nmero de Pares
Eletrnicos
N
o
de Pares
Isolados
ngulo de
ligao
Estrutura
BF
3
3 0 120
Triangular
planar
CH
4
ClNO
H
2
O
I
3
-
IF
5
NH
3
PF
5
SF
4
SF
6
XeF
4
Molcula Nmero de
Pares
Eletrnicos
Nmero de
Pares Isolados
ngulo de
ligao
Estrutura
BCl
3
BeCl
2
CCl
4
H
2
S
67 Computao para Qumica
6.7 Espectroscopia molecular: espectros de vibrao
A absoro de radiaes electromagnticas por tomos ou molculas exige
que elas tenham energia apropriada e que haja um mecanismo de interao que
permita a transferencia de energia. O mecanismo apropriado excitao vibracional
proporcionado pela variao peridica de dipolos eltricos na molcula durante as
vibraes; a transferencia de energia ocorre, ento, por interao destes dipolos
oscilatrios com o campo eltrico oscilatrio da luz (radiao infravermelha) desde que
a freqncia com que ambos variam seja a mesma.
7
Denomina-se espectroscopia vibracional a tcnica de anlise na qual se utiliza
radiao eletromagntica para testar o comportamento vibracional de molculas
observando-se a absoro ou espalhamento dessa radiao. Uma vez que as
energias vibracionais das molculas encontram-se na faixa de 0 a 60 kJ/mol, a
absoro da radiao ocorre na faixa do infravermelho, entre 0 e 5000 cm
-1
, em uma
das autofreqncias dos grupos moleculares, se o modo vibracional modifica o
comprimento do dipolo eltrico correspondente. A observao direta da absoro de
radiao por vibraes moleculares , portanto, um experimento de espectroscopia de
infravermelho.
8
A tcnica do infravermelho prximo um mtodo altamente eficiente
para anlises quantitativas e qualitativas.
Para molculas diatmicas s h um modo de vibrao, aquele em que a
ligao se alonga e se contrai. Nas molculas poliatmicas, so vrios os modos de
vibrao, pois todos os comprimentos de ligao e todos os ngulos podem se alterar.
Para uma molcula no linear, constituda por N tomos, existem 3N-6 modos
independentes de vibrao. Se a molcula for linear, o nmero de modos de vibrao
independentes 3N-5. Os principais modos vibracionais so:
7
http://www.angelfire.com/ab/prvs/infrav.html
8
Costa, J. A. T.B, 2002.
Figura 86 - Modos Vibracionais
68 DQ/CCEN/UFPB
Calculando o espectro vibracional
O Hyperchem calcula e gera o espectro vibracional de uma molcula, e permite
a animao correspondente ao modo vibracional mostrado no espectro.
Para calcular o espectro vibracional de uma molcula necessrio inicialmente
otimizar a geometria (Compute > Geometry Optimization...) aplicando o mtodo de
calculo adequado as necessidades do usurio. Em seguida, o programa j
disponibiliza a opo de calculo de espectro vibracional. Utilizaremos como exemplo a
molcula da gua.
Uma vez desenhada e
otimizada (AM1), clique sobre
o menu:
Compute > Vibrations e o
programa calcular o
espectro.
Note que a opo
Vibrational Spectrum (abaixo
de Orbitals...) ainda no est
disponvel no menu. Ela s
ficar acessvel quando o
clculo estiver encerrado.
Quando a mensagem ao lado
aparecer na linha de status verifique
se o menu Vibrational Spectrum j est disponvel caso sim, clique sobre ele.
Uma janela similar a mostrada abaixo ser exibida:
Figura 87
Figura 88
69 Computao para Qumica
Perceba que a gua, H
2
O, uma molcula triatmica no-linear e tem trs
modos de vibrao (e trs modos de rotao).
ATENO: Observe se a caixa de seleo (destacada acima com um crculo
vermelho) est marcada. Caso no esteja marque-a, pois s assim ser possvel ver
as animaes diretamente na estrutura.
Cada linha (neste caso verde) do espectro corresponde a um modo vibracional.
Para visualiz-lo bata clicar sobre ele e em seguida sobre o boto Apply e a molcula
se movimentar conforme esse modo. Ou ainda pode-se digitar um numero de modo
no campo Normal Mode e tambm clicar sobre Apply para que o modo correspondente
seja mostrado
Exerccio:
Planilha 20
Simule os espectros
vibracionais do O
2
, SO
2
, NH
3
.
Em seguida crie uma tabela
como a do lado, identificando
os modos vibracionais.
6.8 Desafio: Aquecimento Global
9
Parte da energia solar incidente sobre a Terra absorvida e reemitida na forma
de radiao, sendo esta de maior intensidade na regio do infravermelho, 200 a 2500
cm
-1
(4-5 m). A temperatura mdia da Terra mantida por um balano de energia
entre a radiao solar absorvida pela Terra e a radiao emitida pela Terra.
O aprisionamento da radiao infravermelha por certos gases na atmosfera
conhecido como efeito estufa. O resultado desse efeito natural a elevao da
temperatura mdia da superfcie acima do ponto de congelamento da gua permitindo
a existncia de vida. Os principais componentes da atmosfera so o O
2
e o N
2
, que
no contribuem para o efeito estufa, pois so molculas diatmicas homonucleares
que no podem absorver radiao na regio do infravermelho. Entretanto, os gases
atmosfricos em menor quantidade, vapor dgua e CO
2
, absorvem no infravermelho.
As concentraes de vapor dgua tem se mantido estveis ao longo do tempo,
no entanto as concentraes de CO
2
e de outros gases, como o CH
4
, vem
aumentando consideravelmente, e com isto a temperatura mdia da Terra vem se
elevando, e vrias catstrofes ambientais vem sendo atribudas a esse fenmeno.
Utilizando o programa HyperChem, simule o espectro vibracional do CO
2
e do
CH
4
e justifique porque estes gases so denominados de gases de efeito estufa?
9
Atkins,P., p. 418, 2008.
Molcula/
N modos
Modo
Normal
Nmero de
onda cm
-1
Tipo do Modo
Normal
H
2
O (3) 1 Tesoura
2 Estiramento
Assimtrico
3 Estiramento
simtrico
70 DQ/CCEN/UFPB
6.9 Anlise Conformacional
A rotao em torno da ligao simples carbono-carbono, em uma molcula de
cadeia aberta, como o etano, ocorre livremente mudando constantemente a relao
geomtrica dos hidrognios sobre um carbono com aqueles sobre o outro carbono. Os
diferentes arranjos de tomos que resultam dessa rotao so chamados
conformaes, e uma conformao especfica denominada confmero (ismero
conformacional). Experimentos mostram que h uma pequena (2,9 kcal mol
-1
) barreira
de rotao e que algumas conformaes so mais estveis que as outras. A
conformao mais estvel, de energia mais baixa aquela na qual todas as seis
ligaes C-H esto to distantes quanto possveis uma das outras conformao
estrela. A conformao menos estvel, de energia mais alta, aquela na qual as seis
ligaes C-H esto to prximas quanto possveis conformao eclipsada.
10
Como
est ilustrado na figura abaixo.
Figura 89 - Energia potencial como funo do ngulo de rotao para o etano
10
11
10
McMurry, J., p. 100, 2006.
11
Carey, F. A.& Sundberg, R. J. 2007.
71 Computao para Qumica
Exerccio
Utilizando o HyperChem possvel simular um grfico de energia
potencial versus rotao da ligao.
1. Construa a molcula C
2
H
5
F, otimize a geometria com o mtodo MM. Qual a
conformao gerada? a mais estvel?
Figura 90
2. Selecione o ngulo de toro;
3. Calcule a curva de energia potencial: computepotentialpotential plot (0 a
360) OK!
Figura 91
72 DQ/CCEN/UFPB
4. A partir do grfico gerado, identifique as conformaes eclipsadas ou estreladas,
com os respectivos ngulos de toro, que correspondem aos confrmeros de
maior e menor energia.
Figura 92
5. Faa um grfico de energia potencial versus rotao do ngulo de ligao para o
propano.
73 Computao para Qumica
7. - Referncias
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<http://www.idepac.org.br/apostilas/apostilaHardware.pdf Acesso em: mar. 2009.
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traduo - 8 ed.- Rio de Janeiro: LTC, 2008.
Billo, E. J. Excel for Chemists: A Comprehensive Guide. Copyright by John Wiley &
Sons, Electrnico, 2001.
Brady, J. E.; Russell, J. W.; Holum, J. R. Qumica A Matria e Suas Transformaes.
v. 1, cap. 9, 3 Ed. - Rio de Janeiro:LTC, 2002.
Carey, F. A.; Sundberg, R. J. Advanced Organic Chemistry. 5 Ed. Part A: Structure
and Mechanisms, Virginia, 2007.
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de computadores instituio dos mecanismos de governana [Rio de Janeiro] 2006.
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msavio-v1.2.pdf Acesso em: mar. 2009.
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Costa, J. A. T. B. Espectroscopia vibracional. Disponvel em:
<http://w3.ufsm.br/juca/espectroscopia.htm> set. 2002. Acesso em: mar. 2009.
Disponvel em: <http://pt.wikipedia.org/wiki/Espectroscopia_de_infravermelho> Acesso
em: Dez. 2008.
EDTA. Disponvel em: <http://pt.wikipedia.org/wiki/EDTA> Acesso em: Nov. 2008
Excel. Disponvel em: <http://www.cm-braganca.pt/document/448112/505257.pdf>
Acesso em: Out. 2008.
Histria da Internet. Disponvel em:
<http://pt.wikipedia.org/wiki/Hist%C3%B3ria_da_Internet> Acesso em: Set. 2008
McMurry, J. Qumica Orgnica, v. 1/ John McMurry; traduo tcnica Nogueira, A. F. e
Bagatin, I. A., So Paulo: Pioneira Thomsom Learning, 2006.
Santos, A. R.; Firme, C. L.; Barros. J. C. A internet como fonte de informao
bibliogrfica em qumica. Quim. Nova, v. 31 (2), p. 445-451, 2008.