Na aula passada...

Protenas so organizadas em nveis

Protenas adotam forma tridimensional

caracterstica sua forma nativa
Uma cadeia polipetdica com uma certa
sequncia de aminocidos sempre se dobra da
mesma maneira

Cadeia polipetdica na conformao estendida

Esqueleto ou backbone o nome que se d aos

tomos N-C()-C encadeados (nao inclui os R)

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 A ligao peptdica pode existir em Protenas precisam ser extensamente
duas conformaes dobradas para atingir conformao nativa

TRANS CIS

A estrutura da quimotripsina Difrao de raios-X permite a elucidao da

estrutura de protenas

Arquivo PDB:
representao de arame 2cha
(wireframe) representao de preenchimento (spacefill)

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 Pontes de hidrognio
Foras que mantm estrutura das protenas

1) Pontes de hidrognio -

2) Interaes inicas (pontes salinas) +

3) Interaes hidrofbicas

4) Interaes de Van der Waals

Foras fracas! Pontes H

Ponte H : 20kJ/mol so direcionais:
Covalente (C-C) : 348 kJ/mol

Pontes de hidrognio em protenas Interaes Inicas

3
Interaes Hidrofbicas Foras de van der Waals

molcula apolar

+ - dipolo momentneo

+ - + -

atrao entre dipolos momentneos

Ligaes Dissulfeto Estruturas secundrias

1) Regulares

2) Repetitivas

3) Mantidas por pontes H entre grupos peptdicos

Alfa-hlices

Folhas beta

Voltas beta
So covalentes !!!
No so obrigatrias !!!

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Estrutura 2a: alfa-hlice Estrutura 2a: alfa-hlice

Hlice para a direita

3.6 resduos por volta
ngulo de 100o entre resduos
Esqueleto compactado
Grupos R externos
Pontes H entre AAs n e n+4
AAs proibidos

Estrutura 2a: folha beta Estrutura 2a: folha beta

Esqueleto estendido
Grupos R acima e abaixo da folha
Pontes H entre AAs distantes
Paralelas ou antiparalelas

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Prolinas rompem estrutura 2a Estrutura 2a: Voltas

Estrutura 3a a forma Efeito hidrofbico o principal responsvel

tridimensional da protena pelo dobramento compacto de protenas

http://webhost.bridgew.edu/fgorga/proteins/hydrophobic.htm

Quimotripsina (PDB 2cha)

combinao de elementos 2os

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 O que leva a que a protena adquira Interaes Inicas
exatamente um certo dobramento?

Focando em um segmento
da quimotripsina

Gly-Asp-Ser-Gly-Gly-Pro-Leu-Val-Cys-Lys-Lys-Asn
193 204

Arquivo PDB: 2cha

Pontes de hidrognio Interaes Hidrofbicas

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 Pontes dissulfeto Estrutura 3a pode ser dividida em domnios

Domnios so domnio regulador

pores de uma
cadeia
polipeptdica que
se enovelam de
maneira
independente do
resto da cadeia
domnio cataltico

Fosfofrutoquinase (E. coli)

Estrutura Quaternria
Estrutura de Protenas de Membrana
Protenas que, na sua forma nativa ou funcional, possuem mais
de uma cadeia polipeptdica exibem estrutura 4.

Desoxihemoglobina
(tetrmero 2 alfa-globinas, 2 beta-globinas) http://www2.warwick.ac.uk/fac/sci/chemistry/research/dixon/dixongroup/members/msrhar/research/background/

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 Protenas fibrosas: queratina Protenas fibrosas: colgeno
Sequncia primria: Gly-Pro-4Hyp

Coiled coil = super-hlice Superhlice formada por 3 hlices

que se enrolam como uma trana Hlice diferente da alfa-hlice !

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 Desnaturao de protenas Desnaturao por pH:
H+ H+
H+
H+ H+
H+ H+
H+ CCOO
OOH- +
H
H+ 3N

H+ H+

CO
H+

OH HH3N
- ++ 3N
H+ H+
H+
N H+
3N
+HH3
-H+
OO
Alterao da estrutura 3 : mudana de propriedades CCOO
H+

N
33 N
HH
++
perda de funo H+ O
-H

Causada por: pH CO
H+ H+ H+ H+
temperatura Como agem ?
fora inica H+
H+
neutro
cido
detergente

Desnaturao por pH: O enovelamento de protenas

H
O H+ H+
CO
H+ H+ H+
H+
OH
CO
H+ H+
H+ H+
OH

H+ Pode ser espontneo.

H+
CO

Informao presente
H+ + H+ na sequncia primria.
H+ H CO
N 3N OH H+
+ H3
+H
3N

H+
3N

H+
H
+

H+ H+ H+ H+
H+
H+
cido

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Algumas protenas precisam de ajuda
para se enovelar

Diversas patologias tem origem em

alteraes na estrutura de protenas

Anemia falciforme causada por

alterao da Hb

HbS = Glu 6 Val (cadeia )

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 Doena da Vaca Louca Alterao na estrutura da protena
Encefalopatia espongiforme bovina (BSE)
cria forma patolgica
Scrapie
Doena de Creutzfeld-Jacob
Kuru

Prion Protein (PrP)

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