TP53) envolvendo uma população do Nordeste brasileiro Dêivis, Douglas, Vinícius e Victor - Bioinformática Introdução
▪ Os cânceres de mama e ovário estão entre os cânceres mais comuns
em países desenvolvidos e em desenvolvimento; ▪ Um número significativo dos casos é devido a mutações da linha germinal em genes de suscetibilidade, como BRCA1, BRCA2, CHEK2 e TP53, genes estes que tem papeis fundamentais no controle do ciclo celular, apoptose e reparo do DNA; ▪ Os genes BRCA1 e BRCA2 estão associados com a síndrome hereditária de câncer de mama e ovário – HBOC; ▪ Pacientes com HBOC tem histórico familiar de câncer nos órgãos: mama, ovário, próstata e pâncreas. População do estudo
▪ A população brasileira é uma das mais heterogêneas do mundo, e até
o momento nenhum estudo fora realizado com a população da região Nordeste, no qual foi o objetivo desta pesquisa;
▪ Objetivo: verificar a frequência de mutações de significância clínica
em BRCA1, BRCA2, CHEK2 e TP53 em pacientes com alto risco de HBOC da região Nordeste do Brasil. Critérios de Seleção
▪ Um total de 106 pacientes brasileiros não relacionados com alto risco
para HBOC foram incluídos no estudo.
▪ Durante o aconselhamento genético, foram obtidos dados clínicos e
epidemiológicos e foram oferecidos testes genéticos aos indivíduos afetados que preenchessem pelo menos um dos critérios a seguir: Critérios de Seleção
• (a) dois ou mais familiares afetados por câncer de mama;
• (b) um membro da família afetado por câncer de mama e outro afetado pelo câncer de ovário; • (c) três ou mais membros da família afetados por câncer de mama ou de ovário, com pelo menos um afetado com câncer de ovário; • (d) câncer de mama diagnosticado antes da idade de 45 anos; • (e) câncer de ovário diagnosticado antes da idade de 50 anos; • (f) câncer de mama bilateral; • (g) câncer de mama masculino em qualquer idade; • (h) câncer em múltiplos órgãos, incluindo câncer de mama. Metodologia
O DNA foi extraído do sangue periférico. O rastreio de mutações
no BRCA1 foi realizado em duas etapas:
• (a) Reação em cadeia da polimerase (PCR) de cada exão seguida de análise de
polimorfismo de conformação de uma única linha e eletroforese de DNA; • (b) Então todos os fragmentos de PCR que apresentaram um padrão de migração diferente no gel foram analisados por sequenciamento direto. Metodologia
A triagem inicial para as mutações BRCA2 (c.5946_5946delT e
c.156_157insAlu), CHEK2 (c.1100delC, c.444 + 1G> A e p.I157T) e TP53 (p.R337H) foi realizada por AS-PCR seguido por eletroforese em géis de agarose ou PCR / RFLP, que consistiu nas seguintes etapas: ▪ (a) reação de PCR; ▪ (b) verificação de amplificação por eletroforese em géis de agarose; ▪ (c) digestão com a restrição apropriada enzima; ▪ (d) pontuação de outros eletroforese em géis de agarose. Metodologia
▪ Os resultados positivos foram verificados por duas reações de
sequenciamento. ▪ As sequências de referência de genes foram NG_005905.2, NG_012772.3, NG_008150.1 e NG_017013.2, que estão disponíveis no GenBank. Resultados
▪ Todos os participantes selecionados eram do sexo feminino, e a
maioria teve câncer antes dos 50 anos. ▪ Cerca de 91,4% dos casos foram de câncer de mama, e 4,7% foram casos de câncer de ovário. ▪ A maioria das pacientes (83,02%) tinha histórico de câncer na família, e a frequência dos cânceres associados ao HBOC foi significativa entre o primeiro (81,82%), segundo (87,83%) e terceiro (78,71%) graus de parentesco. Resultados
▪ Dez pacientes não relacionados foram identificados com mutações
de significância clínica; ▪ A mutação mais frequente foi BRCA1 c.211A>G(4,71%; 5/10), seguido por BRCA1 c.3331_3334delCAAG (3,77%; 4/10) e TP53 p.R337H(0,94%; 1/10) . ▪ Seis desses pacientes eram das regiões rurais do estado da Bahia e quatro eram de Salvador, a capital da Bahia. Resultados
Fragmentos de sequenciamento das mutações identificadas
Resultados
▪ Todos os portadores de mutação tiveram histórico familiar de câncer
de mama e ovário envolvendo parentes de primeiro, segundo e / ou terceiro grau (80,00%), exceto dois portadores que não apresentaram histórico sugestiva de câncer (pacientes nº 21.1 e 106.1, Tabela 1). Os quadros de três sujeitos que são portadores de cada mutação são mostrados na Figura 2, que apresenta a segregação dessas mutações entre parentes de primeiro e segundo grau, com exceção do portador de mutação TP53 p.R337H (Paciente nº 97.1) para quem nenhum membro da família estava disponível para testes. Resultados Resultados – Linhagem familiares que abrigam as mutações BRCA1 p.R71G, BRCA1 3450del4 e TP53 p.R337H
▪ Todos os portadores de mutação tiveram histórico familiar de câncer
de mama e ovário envolvendo parentes de primeiro, segundo e / ou terceiro grau (80,00%), exceto dois portadores que não apresentaram histórico sugestiva de câncer (pacientes nº 21.1 e 106.1, Tabela 1). Os quadros de três sujeitos que são portadores de cada mutação são mostrados na Figura 2, que apresenta a segregação dessas mutações entre parentes de primeiro e segundo grau, com exceção do portador de mutação TP53 p.R337H (Paciente nº 97.1) para quem nenhum membro da família estava disponível para testes. Resultados – Linhagem familiares que abrigam as mutações BRCA1 p.R71G, BRCA1 3450del4 e TP53 p.R337H